3qlv

Crystal structure of the GluK2/GluK5 (GluR6/KA2) ATD tetramer assembly

Method: X-RAY DIFFRACTION

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Glutamate receptor, ionotropic kainate 5

Rattus norvegicus

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	Glutamate receptor, ionotropic kainate 2 × 2 （P42260）	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	Glutamate receptor, ionotropic kainate 2 × 2 （P42260）	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	Glutamate receptor, ionotropic kainate 2 × 2 （P42260）	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Glutamate receptor, ionotropic kainate 2 × 1 （P42260）	与蛋白数一致
5	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Glutamate receptor, ionotropic kainate 2 × 1 （P42260）	与蛋白数一致
6	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Glutamate receptor, ionotropic kainate 2 × 1 （P42260）	与蛋白数一致
7	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Glutamate receptor, ionotropic kainate 2 × 1 （P42260）	与蛋白数一致
8	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Glutamate receptor, ionotropic kainate 2 × 1 （P42260）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	GRIK5_RAT
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–387； UniProt 20–406 作者链 B； PDB构建体 1–387； UniProt 20–406 作者链 E； PDB构建体 1–387； UniProt 20–406 作者链 G； PDB构建体 1–387； UniProt 20–406 作者链 I； PDB构建体 1–387； UniProt 20–406

Glutamate receptor, ionotropic kainate 2

Rattus norvegicus

UniProt P42260

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	Glutamate receptor, ionotropic kainate 5 × 2 （Q63273）	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	Glutamate receptor, ionotropic kainate 5 × 2 （Q63273）	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	Glutamate receptor, ionotropic kainate 5 × 2 （Q63273）	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Glutamate receptor, ionotropic kainate 5 × 1 （Q63273）	与蛋白数一致
5	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Glutamate receptor, ionotropic kainate 5 × 1 （Q63273）	与蛋白数一致
6	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Glutamate receptor, ionotropic kainate 5 × 1 （Q63273）	与蛋白数一致
7	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Glutamate receptor, ionotropic kainate 5 × 1 （Q63273）	与蛋白数一致
8	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Glutamate receptor, ionotropic kainate 5 × 1 （Q63273）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	GRIK2_RAT
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–389； UniProt 32–420 作者链 D； PDB构建体 1–389； UniProt 32–420 作者链 F； PDB构建体 1–389； UniProt 32–420 作者链 H； PDB构建体 1–389； UniProt 32–420 作者链 J； PDB构建体 1–389； UniProt 32–420

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	3qlv
沉积日期 deposition_date	2011-02-03
结构标题 title	Crystal structure of the GluK2/GluK5 (GluR6/KA2) ATD tetramer assembly
关键词 keywords	MEMBRANE PROTEIN, Glycosylation; MEMBRANE PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

3qlv__assembly_2__model_1

Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

3qlv__assembly_2__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

3qlv__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	46.61 Å
Rg（电子密度）	46.44 Å
总 Rg	46.58 Å
原子数	23710
残基数	1504
排除体积	211580 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`3qlv__assembly_1__model_1`	tetrameric （4）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`3qlv__assembly_2__model_1`	tetrameric （4）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
3	1	`3qlv__assembly_3__model_1`	tetrameric （4）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
4	1	`3qlv__assembly_4__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
5	1	`3qlv__assembly_5__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
6	1	`3qlv__assembly_6__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
7	1	`3qlv__assembly_7__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
8	1	`3qlv__assembly_8__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Glutamate receptor, ionotropic kainate 5
分子量 formula_weight	43798.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	5

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,E,G,I
原子数 atom_count	59281

VLSSLRMAAILDDQTVCGRGERLALALAREQINGIIEVPAKARVEVDIFELQRDSQYETTDTMCQILPKGVVSVLGPSSSPASASTVSHICGEKEIPHIKVGPEETPRLQYLRFASVSLYPSNEDVSLAVSRILKSFNYPSASLICAKAECLLRLEELVRGFLISKETLSVRMLDDSRDPTPLLKEIRDDKVSTIIIDANASISHLVLRKASELGMTSAFYKYILTTMDFPILHLDGIVEDSSNILGFSMFNTSHPFYPEFVRSLNMSWRENCEASTYPGPALSAALMFDAVHVVVSAVRELNRSQEIGVKPLACTSANIWPHGTSLMNYLRMVEYDGLTGRVEFNSKGQRTNYTLRILEKSRQGHREIGVWYSNRTLAMNATTLDILELVPR

来源 Source

来源生物 organism	Rattus norvegicus
通用名 common_name	brown rat,rat,rats
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10116
宿主生物 host_organism	Homo Sapiens

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Glutamate receptor, ionotropic kainate 2
分子量 formula_weight	44750.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	5

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,D,F,H,J

TTHVLRFGGIFEYVESGPMGAEELAFRFAVNTINRNRTLLPNTTLTYDTQKINLYDSFEASKKACDQLSLGVAAIFGPSHSSSANAVQSICNALGVPHIQTRWKHQVSDNKDSFYVSLYPDFSSLSRAILDLVQFFKWKTVTVVYDDSTGLIRLQELIKAPSRYNLRLKIRQLPADTKDAKPLLKEMKRGKEFHVIFDCSHEMAAGILKQALAMGMMTEYYHYIFTTLDLFALDVEPYRYSGVNMTGFRILNTENTQVSSIIEKWSMERLQAPPKPDSGLLDGFMTTDAALMYDAVHVVSVAVQQFPQMTVSSLQCNRHKPWRFGTRFMSLIKEAHWEGLTGRITFNKTNGLRTDFDLDVISLKEEGLEKIGTWDPASGLNMTESQKGKLELVPR

来源 Source

来源生物 organism	Rattus norvegicus
通用名 common_name	brown rat,rat,rats
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10116
宿主生物 host_organism	Homo Sapiens

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 20 domains

CATH v4.4 (20 domains)

结构域编号 domain_id	3qlvA01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	2300 — Response regulator

结构域编号 domain_id	3qlvA02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	2300 — Response regulator

结构域编号 domain_id	3qlvB01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	2300 — Response regulator

结构域编号 domain_id	3qlvB02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	2300 — Response regulator

结构域编号 domain_id	3qlvC01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	2300 — Response regulator

结构域编号 domain_id	3qlvC02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	2300 — Response regulator

结构域编号 domain_id	3qlvD01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	2300 — Response regulator

结构域编号 domain_id	3qlvD02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	2300 — Response regulator

结构域编号 domain_id	3qlvE01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	2300 — Response regulator

结构域编号 domain_id	3qlvE02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	2300 — Response regulator

结构域编号 domain_id	3qlvF01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	2300 — Response regulator

结构域编号 domain_id	3qlvF02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	2300 — Response regulator

结构域编号 domain_id	3qlvG01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	2300 — Response regulator

结构域编号 domain_id	3qlvG02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	2300 — Response regulator

结构域编号 domain_id	3qlvH01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	2300 — Response regulator

结构域编号 domain_id	3qlvH02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	2300 — Response regulator

结构域编号 domain_id	3qlvI01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	2300 — Response regulator

结构域编号 domain_id	3qlvI02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	2300 — Response regulator

结构域编号 domain_id	3qlvJ01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	2300 — Response regulator

结构域编号 domain_id	3qlvJ02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	2300 — Response regulator

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晶胞边长 a length_a	366.552 Å
晶胞边长 b length_b	109.176 Å
晶胞边长 c length_c	155.469 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	97.54 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	20

空间群 space_group	C 1 2 1
空间群编号 int_tables_number	5
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.940 Å
最低分辨率 resolution_low	48.950 Å
R 因子 r_factor	0.2640
R_work r_work	0.2640
R_free r_free	0.2800

Crystal structure of the GluK2/GluK5 (GluR6/KA2) ATD tetramer assembly

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Glutamate receptor, ionotropic kainate 5

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Glutamate receptor, ionotropic kainate 2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

3qlv__assembly_2__model_1

3qlv__assembly_2__model_1 | I(q)

3qlv__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 20 domains

CATH v4.4 (20 domains)

7. 引用文献 (1)

Crystal structure of the GluK2/GluK5 (GluR6/KA2) ATD tetramer assembly

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Glutamate receptor, ionotropic kainate 5

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Glutamate receptor, ionotropic kainate 2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

3qlv__assembly_2__model_1

3qlv__assembly_2__model_1 | I(q)

3qlv__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 20 domains

CATH v4.4 (20 domains)

7. 引用文献 (1)