SAXSdb — 3tf2

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Eukaryotic translation initiation factor 4E

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白单体	单体	蛋白 1	UNKNOWN ATOM OR ION × 6 water × 1	与蛋白数一致
2	蛋白单体	单体	蛋白 1	UNKNOWN ATOM OR ION × 4 water × 1	与蛋白数一致
3	蛋白单体	单体	蛋白 1	UNKNOWN ATOM OR ION × 3 water × 1	与蛋白数一致
4	蛋白单体	单体	蛋白 1	UNKNOWN ATOM OR ION × 1 water × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	IF4E_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–217； UniProt 1–217 作者链 B； PDB构建体 1–217； UniProt 1–217 作者链 C； PDB构建体 1–217； UniProt 1–217 作者链 D； PDB构建体 1–217； UniProt 1–217

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	3tf2
沉积日期 deposition_date	2011-08-15
结构标题 title	Crystal structure of the cap free human translation initiation factor eIF4E
关键词 keywords	eIF4E, Translation, mRNA export, Structural Genomics, Structural Genomics Consortium, SGC; TRANSLATION
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

▼

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`3tf2__assembly_1__model_1`	monomeric （1）	排除	—	—
	排除原因：来源记录无法明确判定原子或离子的元素，因此不能可靠计算。
2	1	`3tf2__assembly_2__model_1`	monomeric （1）	排除	—	—
	排除原因：来源记录无法明确判定原子或离子的元素，因此不能可靠计算。
3	1	`3tf2__assembly_3__model_1`	monomeric （1）	排除	—	—
	排除原因：来源记录无法明确判定原子或离子的元素，因此不能可靠计算。
4	1	`3tf2__assembly_4__model_1`	monomeric （1）	排除	—	—
	排除原因：来源记录无法明确判定原子或离子的元素，因此不能可靠计算。

▶

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

▶

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Eukaryotic translation initiation factor 4E
分子量 formula_weight	25130.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D
原子数 atom_count	5837

MATVEPETTPTPNPPTTEEEKTESNQEVANPEHYIKHPLQNRWALWFFKNDKSKTWQANLRLISKFDTVEDFWALYNHIQLSSNLMPGCDYSLFKDGIEPMWEDEKNKRGGRWLITLNKQQRRSDLDRFWLETLLCLIGESFDDYSDDVCGAVVNVRAKGDKIAIWTTECENREAVTHIGRVYKERLGLPPKIVIGYQSHADTATKSGSTTKNRFVV

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	UNKNOWN ATOM OR ION
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	14

实体 3 Entity 3 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	169

▼

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_id	d3tf2a_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.86 — eIF4e-like
超家族 Superfamily superfamily	d.86.1 — eIF4e-like
家族 Family family	d.86.1.1 — Translation initiation factor eIF4e

结构域编号 domain_id	d3tf2b_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.86 — eIF4e-like
超家族 Superfamily superfamily	d.86.1 — eIF4e-like
家族 Family family	d.86.1.1 — Translation initiation factor eIF4e

结构域编号 domain_id	d3tf2c_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.86 — eIF4e-like
超家族 Superfamily superfamily	d.86.1 — eIF4e-like
家族 Family family	d.86.1.1 — Translation initiation factor eIF4e

结构域编号 domain_id	d3tf2d_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.86 — eIF4e-like
超家族 Superfamily superfamily	d.86.1 — eIF4e-like
家族 Family family	d.86.1.1 — Translation initiation factor eIF4e

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id	3tf2A00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	760 — RNA Cap, Translation Initiation Factor Eif4e
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — RNA Cap, Translation Initiation Factor Eif4e

结构域编号 domain_id	3tf2B00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	760 — RNA Cap, Translation Initiation Factor Eif4e
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — RNA Cap, Translation Initiation Factor Eif4e

结构域编号 domain_id	3tf2C00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	760 — RNA Cap, Translation Initiation Factor Eif4e
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — RNA Cap, Translation Initiation Factor Eif4e

结构域编号 domain_id	3tf2D00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	760 — RNA Cap, Translation Initiation Factor Eif4e
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — RNA Cap, Translation Initiation Factor Eif4e

▶

晶胞边长 a length_a	39.236 Å
晶胞边长 b length_b	56.739 Å
晶胞边长 c length_c	100.310 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	103.61 °
晶胞夹角 β angle_beta	91.36 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	110.14 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.100 Å
最低分辨率 resolution_low	30.000 Å
R 因子 r_factor	0.2170
R_work r_work	0.2154
R_free r_free	0.2598

Crystal structure of the cap free human translation initiation factor eIF4E

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Eukaryotic translation initiation factor 4E

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

CATH v4.4 (4 domains)

7. 引用文献 (1)

Crystal structure of the cap free human translation initiation factor eIF4E

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Eukaryotic translation initiation factor 4E

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

CATH v4.4 (4 domains)

7. 引用文献 (1)