3tgx

IL-21:IL21R complex

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 238.8 Å Quality: GOOD

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Interleukin-21 receptor

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	其他组合异源复合物蛋白 × 2 其他聚合物 1 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 20–232	片段：Interleukin 21 receptor extracellular domain 突变：N78Q, N85Q, N106D, N116Q	Interleukin-21 × 1 （Q9HBE4） ;alpha-D-mannopyranose-(1-6)-alpha-D-mannopyranose-(1-6)-alpha-D-mannopyranose-(1-6)-beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-[beta-L-fucopyranose-(1-6)]2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ; × 1 MAN alpha-D-mannopyranose × 1 NI NICKEL (II) ION × 1 SO4 SULFATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；291.3 K；1,8-1,9 M di-Ammonium sulphate and 0.1 M Sodium acetate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291.3K	分辨率 2.80 Å R-free 0.273
2	其他组合异源复合物蛋白 × 2 其他聚合物 1 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 20–232	片段：Interleukin 21 receptor extracellular domain 突变：N78Q, N85Q, N106D, N116Q	Interleukin-21 × 1 （Q9HBE4） ;alpha-D-mannopyranose-(1-6)-alpha-D-mannopyranose-(1-6)-alpha-D-mannopyranose-(1-6)-beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-[beta-L-fucopyranose-(1-6)]2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ; × 1 MAN alpha-D-mannopyranose × 1 SO4 SULFATE ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；291.3 K；1,8-1,9 M di-Ammonium sulphate and 0.1 M Sodium acetate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291.3K	分辨率 2.80 Å R-free 0.273
3	其他组合异源复合物蛋白 × 2 其他聚合物 1 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 E； UniProt 20–232	片段：Interleukin 21 receptor extracellular domain 突变：N78Q, N85Q, N106D, N116Q	Interleukin-21 × 1 （Q9HBE4） ;alpha-D-mannopyranose-(1-6)-alpha-D-mannopyranose-(1-6)-alpha-D-mannopyranose-(1-6)-beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-[beta-L-fucopyranose-(1-6)]2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ; × 1 MAN alpha-D-mannopyranose × 1 NI NICKEL (II) ION × 1 SO4 SULFATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；291.3 K；1,8-1,9 M di-Ammonium sulphate and 0.1 M Sodium acetate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291.3K	分辨率 2.80 Å R-free 0.273
4	其他组合异源复合物蛋白 × 2 其他聚合物 1 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 G； UniProt 20–232	片段：Interleukin 21 receptor extracellular domain 突变：N78Q, N85Q, N106D, N116Q	Interleukin-21 × 1 （Q9HBE4） ;alpha-D-mannopyranose-(1-6)-alpha-D-mannopyranose-(1-6)-alpha-D-mannopyranose-(1-6)-beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-[beta-L-fucopyranose-(1-6)]2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ; × 1 MAN alpha-D-mannopyranose × 1 NI NICKEL (II) ION × 1 SO4 SULFATE ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；291.3 K；1,8-1,9 M di-Ammonium sulphate and 0.1 M Sodium acetate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291.3K	分辨率 2.80 Å R-free 0.273
5	其他组合异源复合物蛋白 × 2 其他聚合物 1 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 I； UniProt 20–232	片段：Interleukin 21 receptor extracellular domain 突变：N78Q, N85Q, N106D, N116Q	Interleukin-21 × 1 （Q9HBE4） ;alpha-D-mannopyranose-(1-6)-alpha-D-mannopyranose-(1-6)-alpha-D-mannopyranose-(1-6)-beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-[beta-L-fucopyranose-(1-6)]2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ; × 1 MAN alpha-D-mannopyranose × 1 SO4 SULFATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；291.3 K；1,8-1,9 M di-Ammonium sulphate and 0.1 M Sodium acetate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291.3K	分辨率 2.80 Å R-free 0.273
6	其他组合异源复合物蛋白 × 2 其他聚合物 1 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 K； UniProt 20–232	片段：Interleukin 21 receptor extracellular domain 突变：N78Q, N85Q, N106D, N116Q	Interleukin-21 × 1 （Q9HBE4） ;alpha-D-mannopyranose-(1-6)-alpha-D-mannopyranose-(1-6)-beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-[beta-L-fucopyranose-(1-6)]2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ; × 1 MAN alpha-D-mannopyranose × 1 SO4 SULFATE ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；291.3 K；1,8-1,9 M di-Ammonium sulphate and 0.1 M Sodium acetate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291.3K	分辨率 2.80 Å R-free 0.273
7	其他组合异源复合物蛋白 × 2 其他聚合物 1 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 M； UniProt 20–232	片段：Interleukin 21 receptor extracellular domain 突变：N78Q, N85Q, N106D, N116Q	Interleukin-21 × 1 （Q9HBE4） ;alpha-D-mannopyranose-(1-6)-alpha-D-mannopyranose-(1-6)-beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-[alpha-L-fucopyranose-(1-6)]2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ; × 1 MAN alpha-D-mannopyranose × 1 SO4 SULFATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；291.3 K；1,8-1,9 M di-Ammonium sulphate and 0.1 M Sodium acetate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291.3K	分辨率 2.80 Å R-free 0.273
8	其他组合异源复合物蛋白 × 2 其他聚合物 1 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 O； UniProt 20–232	片段：Interleukin 21 receptor extracellular domain 突变：N78Q, N85Q, N106D, N116Q	Interleukin-21 × 1 （Q9HBE4） ;alpha-D-mannopyranose-(1-6)-alpha-D-mannopyranose-(1-6)-beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-[beta-L-fucopyranose-(1-6)]2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ; × 1 MAN alpha-D-mannopyranose × 1 NI NICKEL (II) ION × 1 SO4 SULFATE ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；291.3 K；1,8-1,9 M di-Ammonium sulphate and 0.1 M Sodium acetate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291.3K	分辨率 2.80 Å R-free 0.273

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 3TGX	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
4NZD Interleukin 21 receptor 提交 2013-12-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 20–232（213 aa）	未记录	MAN alpha-D-mannopyranose × 1 NA SODIUM ION × 3 CL CHLORIDE ION × 4 TLA L(+)-TARTARIC ACID × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；278 K；5 mg/ml Protein in 10 mM Hepes, 150 mM NaCl, pH7.5 Crystalized in 1M Potassium sodium tartrate tetrahydrate, 3% W/V Peg5000 and 0.1 M tris Ph 8.5. Drops were 1:1, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 278K	分辨率 2.75 Å R-free 0.275
4NZD Interleukin 21 receptor 提交 2013-12-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 20–232（213 aa）	未记录	MAN alpha-D-mannopyranose × 1 CL CHLORIDE ION × 5 TLA L(+)-TARTARIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；278 K；5 mg/ml Protein in 10 mM Hepes, 150 mM NaCl, pH7.5 Crystalized in 1M Potassium sodium tartrate tetrahydrate, 3% W/V Peg5000 and 0.1 M tris Ph 8.5. Drops were 1:1, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 278K	分辨率 2.75 Å R-free 0.275
4NZD Interleukin 21 receptor 提交 2013-12-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 20–232（213 aa）	未记录	MAN alpha-D-mannopyranose × 1 NA SODIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；278 K；5 mg/ml Protein in 10 mM Hepes, 150 mM NaCl, pH7.5 Crystalized in 1M Potassium sodium tartrate tetrahydrate, 3% W/V Peg5000 and 0.1 M tris Ph 8.5. Drops were 1:1, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 278K	分辨率 2.75 Å R-free 0.275
4NZD Interleukin 21 receptor 提交 2013-12-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 其他组合同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 20–232（213 aa）链 B 20–232（213 aa）链 C 20–232（213 aa）	未记录	MAN alpha-D-mannopyranose × 6 NA SODIUM ION × 10 CL CHLORIDE ION × 22 TLA L(+)-TARTARIC ACID × 6 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；278 K；5 mg/ml Protein in 10 mM Hepes, 150 mM NaCl, pH7.5 Crystalized in 1M Potassium sodium tartrate tetrahydrate, 3% W/V Peg5000 and 0.1 M tris Ph 8.5. Drops were 1:1, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 278K	分辨率 2.75 Å R-free 0.275
6PLH FAB fragment complexed with C-mannosylated tryptophan peptide 提交 2019-06-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 202–232（31 aa）片段：UNP Residues 202-232	未记录	PO4 PHOSPHATE ION × 1 MAN alpha-D-mannopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；25% (w/v) polyethylene glycol 1500, 0.1 M succinate-phosphate-glycine, pH 7.0	分辨率 1.60 Å R-free 0.221
7KQ7 Crystal structure of IL21R in complex with an antibody Fab fragment 提交 2020-11-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 20–233（214 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；300 K；10% PEG MME 5000 and 0.1M MES, pH 6.5	分辨率 2.20 Å R-free 0.240
8ENT Interleukin-21 signaling complex with IL-21R and IL-2Rg 提交 2022-09-30	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 20–229（210 aa）	突变：N78Q, N85Q, N106D, N116Q	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295 K；0.1M Tris pH 8, 20% PEG 6000	分辨率 2.83 Å R-free 0.300
8ENT Interleukin-21 signaling complex with IL-21R and IL-2Rg 提交 2022-09-30	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 E 20–229（210 aa）	突变：N78Q, N85Q, N106D, N116Q	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295 K；0.1M Tris pH 8, 20% PEG 6000	分辨率 2.83 Å R-free 0.300
8ENT Interleukin-21 signaling complex with IL-21R and IL-2Rg 提交 2022-09-30	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 20–229（210 aa）	突变：N78Q, N85Q, N106D, N116Q	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295 K；0.1M Tris pH 8, 20% PEG 6000	分辨率 2.83 Å R-free 0.300
8ENT Interleukin-21 signaling complex with IL-21R and IL-2Rg 提交 2022-09-30	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 K 20–229（210 aa）	突变：N78Q, N85Q, N106D, N116Q	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295 K；0.1M Tris pH 8, 20% PEG 6000	分辨率 2.83 Å R-free 0.300
9E2T Structure of a de novo designed interleukin-21 mimetic complex with IL-21R and IL-2Rg 提交 2024-10-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 20–228（209 aa）片段：extracellular domain	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；0.2M Potassium thiocyanate, 0.1M Bis-Tris propane, pH 6.5, 20% w/v PEG 3350	分辨率 2.28 Å R-free 0.242
9E2T Structure of a de novo designed interleukin-21 mimetic complex with IL-21R and IL-2Rg 提交 2024-10-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 E 20–228（209 aa）片段：extracellular domain	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；0.2M Potassium thiocyanate, 0.1M Bis-Tris propane, pH 6.5, 20% w/v PEG 3350	分辨率 2.28 Å R-free 0.242
9E2T Structure of a de novo designed interleukin-21 mimetic complex with IL-21R and IL-2Rg 提交 2024-10-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 20–228（209 aa）片段：extracellular domain	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；0.2M Potassium thiocyanate, 0.1M Bis-Tris propane, pH 6.5, 20% w/v PEG 3350	分辨率 2.28 Å R-free 0.242
9E2T Structure of a de novo designed interleukin-21 mimetic complex with IL-21R and IL-2Rg 提交 2024-10-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 J 20–228（209 aa）片段：extracellular domain	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；0.2M Potassium thiocyanate, 0.1M Bis-Tris propane, pH 6.5, 20% w/v PEG 3350	分辨率 2.28 Å R-free 0.242

共 5 个其他 PDB 条目、14 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	IL21R_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–213； UniProt 20–232 作者链 C； PDB构建体 1–213； UniProt 20–232 作者链 E； PDB构建体 1–213； UniProt 20–232 作者链 G； PDB构建体 1–213； UniProt 20–232 作者链 I； PDB构建体 1–213； UniProt 20–232 作者链 K； PDB构建体 1–213； UniProt 20–232 作者链 M； PDB构建体 1–213； UniProt 20–232 作者链 O； PDB构建体 1–213； UniProt 20–232

Interleukin-21

Homo sapiens

UniProt Q9HBE4

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	其他组合异源复合物蛋白 × 2 其他聚合物 1 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 23–155	片段：unp RESIDUES 23-155	Interleukin-21 receptor × 1 （Q9HBE5） ;alpha-D-mannopyranose-(1-6)-alpha-D-mannopyranose-(1-6)-alpha-D-mannopyranose-(1-6)-beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-[beta-L-fucopyranose-(1-6)]2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ; × 1 MAN alpha-D-mannopyranose × 1 NI NICKEL (II) ION × 1 SO4 SULFATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；291.3 K；1,8-1,9 M di-Ammonium sulphate and 0.1 M Sodium acetate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291.3K	分辨率 2.80 Å R-free 0.273
2	其他组合异源复合物蛋白 × 2 其他聚合物 1 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 D； UniProt 23–155	片段：unp RESIDUES 23-155	Interleukin-21 receptor × 1 （Q9HBE5） ;alpha-D-mannopyranose-(1-6)-alpha-D-mannopyranose-(1-6)-alpha-D-mannopyranose-(1-6)-beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-[beta-L-fucopyranose-(1-6)]2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ; × 1 MAN alpha-D-mannopyranose × 1 SO4 SULFATE ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；291.3 K；1,8-1,9 M di-Ammonium sulphate and 0.1 M Sodium acetate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291.3K	分辨率 2.80 Å R-free 0.273
3	其他组合异源复合物蛋白 × 2 其他聚合物 1 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 F； UniProt 23–155	片段：unp RESIDUES 23-155	Interleukin-21 receptor × 1 （Q9HBE5） ;alpha-D-mannopyranose-(1-6)-alpha-D-mannopyranose-(1-6)-alpha-D-mannopyranose-(1-6)-beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-[beta-L-fucopyranose-(1-6)]2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ; × 1 MAN alpha-D-mannopyranose × 1 NI NICKEL (II) ION × 1 SO4 SULFATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；291.3 K；1,8-1,9 M di-Ammonium sulphate and 0.1 M Sodium acetate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291.3K	分辨率 2.80 Å R-free 0.273
4	其他组合异源复合物蛋白 × 2 其他聚合物 1 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 H； UniProt 23–155	片段：unp RESIDUES 23-155	Interleukin-21 receptor × 1 （Q9HBE5） ;alpha-D-mannopyranose-(1-6)-alpha-D-mannopyranose-(1-6)-alpha-D-mannopyranose-(1-6)-beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-[beta-L-fucopyranose-(1-6)]2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ; × 1 MAN alpha-D-mannopyranose × 1 NI NICKEL (II) ION × 1 SO4 SULFATE ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；291.3 K；1,8-1,9 M di-Ammonium sulphate and 0.1 M Sodium acetate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291.3K	分辨率 2.80 Å R-free 0.273
5	其他组合异源复合物蛋白 × 2 其他聚合物 1 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 J； UniProt 23–155	片段：unp RESIDUES 23-155	Interleukin-21 receptor × 1 （Q9HBE5） ;alpha-D-mannopyranose-(1-6)-alpha-D-mannopyranose-(1-6)-alpha-D-mannopyranose-(1-6)-beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-[beta-L-fucopyranose-(1-6)]2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ; × 1 MAN alpha-D-mannopyranose × 1 SO4 SULFATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；291.3 K；1,8-1,9 M di-Ammonium sulphate and 0.1 M Sodium acetate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291.3K	分辨率 2.80 Å R-free 0.273
6	其他组合异源复合物蛋白 × 2 其他聚合物 1 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 L； UniProt 23–155	片段：unp RESIDUES 23-155	Interleukin-21 receptor × 1 （Q9HBE5） ;alpha-D-mannopyranose-(1-6)-alpha-D-mannopyranose-(1-6)-beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-[beta-L-fucopyranose-(1-6)]2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ; × 1 MAN alpha-D-mannopyranose × 1 SO4 SULFATE ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；291.3 K；1,8-1,9 M di-Ammonium sulphate and 0.1 M Sodium acetate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291.3K	分辨率 2.80 Å R-free 0.273
7	其他组合异源复合物蛋白 × 2 其他聚合物 1 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 N； UniProt 23–155	片段：unp RESIDUES 23-155	Interleukin-21 receptor × 1 （Q9HBE5） ;alpha-D-mannopyranose-(1-6)-alpha-D-mannopyranose-(1-6)-beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-[alpha-L-fucopyranose-(1-6)]2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ; × 1 MAN alpha-D-mannopyranose × 1 SO4 SULFATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；291.3 K；1,8-1,9 M di-Ammonium sulphate and 0.1 M Sodium acetate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291.3K	分辨率 2.80 Å R-free 0.273
8	其他组合异源复合物蛋白 × 2 其他聚合物 1 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 P； UniProt 23–155	片段：unp RESIDUES 23-155	Interleukin-21 receptor × 1 （Q9HBE5） ;alpha-D-mannopyranose-(1-6)-alpha-D-mannopyranose-(1-6)-beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-[beta-L-fucopyranose-(1-6)]2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ; × 1 MAN alpha-D-mannopyranose × 1 NI NICKEL (II) ION × 1 SO4 SULFATE ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；291.3 K；1,8-1,9 M di-Ammonium sulphate and 0.1 M Sodium acetate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291.3K	分辨率 2.80 Å R-free 0.273

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 3TGX	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
2OQP Solution structure of human interleukin-21 提交 2007-02-01	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 23–155（133 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5.5；300 K；离子强度（mmCIF原始值）50mM NaCl；压力 ambient NMR样品组成 0.8mM IL21 U-15N, 20mM phosphate, 50mM NaCl, 1mM NaN3 \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.8mM IL21 U-15N,13C, 20mM phosphate, 50mM NaCl, 1mM NaN3 \| 100% D2O	分辨率未提供
8ENT Interleukin-21 signaling complex with IL-21R and IL-2Rg 提交 2022-09-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 30–162（133 aa）	突变：N68Q	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295 K；0.1M Tris pH 8, 20% PEG 6000	分辨率 2.83 Å R-free 0.300
8ENT Interleukin-21 signaling complex with IL-21R and IL-2Rg 提交 2022-09-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 D 30–162（133 aa）	突变：N68Q	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295 K；0.1M Tris pH 8, 20% PEG 6000	分辨率 2.83 Å R-free 0.300
8ENT Interleukin-21 signaling complex with IL-21R and IL-2Rg 提交 2022-09-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 G 30–162（133 aa）	突变：N68Q	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295 K；0.1M Tris pH 8, 20% PEG 6000	分辨率 2.83 Å R-free 0.300
8ENT Interleukin-21 signaling complex with IL-21R and IL-2Rg 提交 2022-09-30	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 J 30–162（133 aa）	突变：N68Q	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295 K；0.1M Tris pH 8, 20% PEG 6000	分辨率 2.83 Å R-free 0.300

共 2 个其他 PDB 条目、5 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	IL21_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 2–134； UniProt 23–155 作者链 D； PDB构建体 2–134； UniProt 23–155 作者链 F； PDB构建体 2–134； UniProt 23–155 作者链 H； PDB构建体 2–134； UniProt 23–155 作者链 J； PDB构建体 2–134； UniProt 23–155 作者链 L； PDB构建体 2–134； UniProt 23–155 作者链 N； PDB构建体 2–134； UniProt 23–155 作者链 P； PDB构建体 2–134； UniProt 23–155

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	3tgx
沉积日期 deposition_date	2011-08-18
结构标题 title	IL-21:IL21R complex
关键词 keywords	Class I cytokine, Class I cytokine Receptor, sugarbridge, Fibronectin domain, Signaling, CYTOKINE-CYTOKINE RECEPTOR complex; CYTOKINE/CYTOKINE RECEPTOR
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	68.70 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	68.70 Å
零角强度 I(0) i0	1473780000.00
分子量 molecular_weight	311980.0 kDa
排除体积 excluded_volume	385560 Å³
包络体积 envelope_volume	689270 Å³
水化壳体积 shell_volume	90235 Å³
包络直径 envelope_diameter	231.6 Å
壳层 Rg shell_rg	60.78 Å
包络 Rg envelope_rg	65.61 Å
形状 Rg shape_rg	68.74 Å
总 Rg total_rg	68.38 Å
总原子数 total_atoms	21830
残基数 n_residues	2571
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

▼

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	238.8 Å
Rg (实空间) rg_real	68.63 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	2.51 Å
I(0) (实空间) i0_real	1.4740e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	3.3490e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal	68.81 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	1474000000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8781
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	93.5 Å
偏度 Skewness skewness	0.099
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.578
角度范围 angular_range	— – 0.1150 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0003
最高正则化参数 α highest_alpha	42790000.0000
实空间数据点数 n_real_points	24
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.858; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.995; Smooth: 0.844

▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

▶

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (8)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Interleukin-21 receptor
分子量 formula_weight	25451.3 kDa
突变 mutation	N78Q, N85Q, N106D, N116Q
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	8

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,C,E,G,I,K,M,O
原子数 atom_count	21830

CPDLVCYTDYLQTVICILEMWNLHPSTLTLTWQDQYEELKDEATSCSLHRSAHNATHATYTCHMDVFHFMADDIFSVQITDQSGQYSQECGSFLLAESIKPAPPFDVTVTFSGQYQISWRSDYEDPAFYMLKGKLQYELQYRNRGDPWAVSPRRKLISVDSRSVSLLPLEFRKDSSYELQVRAGPMPGSSYQGTWSEWSDPVIFQTQSEELKEHHHHHH

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Homo Sapiens

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Interleukin-21
分子量 formula_weight	15622.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	8

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,D,F,H,J,L,N,P

MQGQDRHMIRMRQLIDIVDQLKNYVNDLVPEFLPAPEDVETNCEWSAFSCFQKAQLKSANTGNNERIINVSIKKLKRKPPSTNAGRRQKHRLTCPSCDSYEKKPPKEFLERFKSLLQKMIHQHLSSRTHGSEDS

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 branched

描述 description	;alpha-D-mannopyranose-(1-6)-alpha-D-mannopyranose-(1-6)-alpha-D-mannopyranose-(1-6)-beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-[beta-L-fucopyranose-(1-6)]2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ;
分子量 formula_weight	1219.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	5

实体 4 Entity 4 branched

描述 description	;alpha-D-mannopyranose-(1-6)-alpha-D-mannopyranose-(1-6)-beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-[beta-L-fucopyranose-(1-6)]2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ;
分子量 formula_weight	1057.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

实体 5 Entity 5 branched

描述 description	;alpha-D-mannopyranose-(1-6)-alpha-D-mannopyranose-(1-6)-beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-[alpha-L-fucopyranose-(1-6)]2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ;
分子量 formula_weight	1057.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	alpha-D-mannopyranose
分子量 formula_weight	180.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	8

实体 7 Entity 7 non-polymer

描述 description	NICKEL (II) ION
分子量 formula_weight	58.7 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 8 Entity 8 non-polymer

描述 description	SULFATE ION
分子量 formula_weight	96.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	39

▼

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 32 domains

SCOP 2.08 (8 domains)

结构域编号 domain_id	d3tgxb_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.26 — 4-helical cytokines
超家族 Superfamily superfamily	a.26.1 — 4-helical cytokines
家族 Family family	a.26.1.2 — Short-chain cytokines

结构域编号 domain_id	d3tgxd_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.26 — 4-helical cytokines
超家族 Superfamily superfamily	a.26.1 — 4-helical cytokines
家族 Family family	a.26.1.2 — Short-chain cytokines

结构域编号 domain_id	d3tgxf_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.26 — 4-helical cytokines
超家族 Superfamily superfamily	a.26.1 — 4-helical cytokines
家族 Family family	a.26.1.2 — Short-chain cytokines

结构域编号 domain_id	d3tgxh_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.26 — 4-helical cytokines
超家族 Superfamily superfamily	a.26.1 — 4-helical cytokines
家族 Family family	a.26.1.2 — Short-chain cytokines

结构域编号 domain_id	d3tgxj_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.26 — 4-helical cytokines
超家族 Superfamily superfamily	a.26.1 — 4-helical cytokines
家族 Family family	a.26.1.2 — Short-chain cytokines

结构域编号 domain_id	d3tgxl_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.26 — 4-helical cytokines
超家族 Superfamily superfamily	a.26.1 — 4-helical cytokines
家族 Family family	a.26.1.2 — Short-chain cytokines

结构域编号 domain_id	d3tgxn_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.26 — 4-helical cytokines
超家族 Superfamily superfamily	a.26.1 — 4-helical cytokines
家族 Family family	a.26.1.2 — Short-chain cytokines

结构域编号 domain_id	d3tgxp_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.26 — 4-helical cytokines
超家族 Superfamily superfamily	a.26.1 — 4-helical cytokines
家族 Family family	a.26.1.2 — Short-chain cytokines

CATH v4.4 (24 domains)

结构域编号 domain_id	3tgxA01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	3tgxA02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	3tgxB00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1250 — Growth Hormone; Chain: A;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	70 — Interleukin-15/Interleukin-21

结构域编号 domain_id	3tgxC01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	3tgxC02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	3tgxD00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1250 — Growth Hormone; Chain: A;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	70 — Interleukin-15/Interleukin-21

结构域编号 domain_id	3tgxE01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	3tgxE02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	3tgxF00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1250 — Growth Hormone; Chain: A;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	70 — Interleukin-15/Interleukin-21

结构域编号 domain_id	3tgxG01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	3tgxG02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	3tgxH00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1250 — Growth Hormone; Chain: A;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	70 — Interleukin-15/Interleukin-21

结构域编号 domain_id	3tgxI01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	3tgxI02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	3tgxJ00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1250 — Growth Hormone; Chain: A;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	70 — Interleukin-15/Interleukin-21

结构域编号 domain_id	3tgxK01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	3tgxK02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	3tgxL00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1250 — Growth Hormone; Chain: A;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	70 — Interleukin-15/Interleukin-21

结构域编号 domain_id	3tgxM01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	3tgxM02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	3tgxN00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1250 — Growth Hormone; Chain: A;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	70 — Interleukin-15/Interleukin-21

结构域编号 domain_id	3tgxO01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	3tgxO02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	3tgxP00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1250 — Growth Hormone; Chain: A;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	70 — Interleukin-15/Interleukin-21

▶

8. 引用文献 (1)

▶

晶胞边长 a length_a	82.230 Å
晶胞边长 b length_b	151.120 Å
晶胞边长 c length_c	364.820 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	32

空间群 space_group	P 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	19
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.800 Å
最低分辨率 resolution_low	80.220 Å
R 因子 r_factor	0.2440
R_work r_work	0.2420
R_free r_free	0.2730

IL-21:IL21R complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Interleukin-21 receptor

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Interleukin-21

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (8)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 branched

实体 4 Entity 4 branched

实体 5 Entity 5 branched

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 non-polymer

实体 8 Entity 8 non-polymer

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 32 domains

SCOP 2.08 (8 domains)

CATH v4.4 (24 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)

fit	/app/data/saxs_computation/tg/3tgx/3tgx.fit
pddf	/app/data/pr_computation/tg/3tgx/3tgx.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/tg/3tgx/3tgx.dat