3tl8

The AvrPtoB-BAK1 complex reveals two structurally similar kinaseinteracting domains in a single type III effector

Method: X-RAY DIFFRACTION

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

BRASSINOSTEROID INSENSITIVE 1-associated receptor kinase 1

Arabidopsis thaliana

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Effector protein HopAB2 × 1 （Q8RSY1） water × 2	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Effector protein HopAB2 × 1 （Q8RSY1） water × 2	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Effector protein HopAB2 × 1 （Q8RSY1） water × 2	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Effector protein HopAB2 × 1 （Q8RSY1） water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	BAK1_ARATH
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–341； UniProt 250–590 作者链 D； PDB构建体 1–341； UniProt 250–590 作者链 G； PDB构建体 1–341； UniProt 250–590 作者链 H； PDB构建体 1–341； UniProt 250–590

Effector protein HopAB2

Pseudomonas syringae pv. tomato

UniProt Q8RSY1

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	BRASSINOSTEROID INSENSITIVE 1-associated receptor kinase 1 × 1 （Q94F62） water × 2	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	BRASSINOSTEROID INSENSITIVE 1-associated receptor kinase 1 × 1 （Q94F62） water × 2	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	BRASSINOSTEROID INSENSITIVE 1-associated receptor kinase 1 × 1 （Q94F62） water × 2	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	BRASSINOSTEROID INSENSITIVE 1-associated receptor kinase 1 × 1 （Q94F62） water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	HPAB2_PSESM
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 8–117； UniProt 250–359 作者链 F； PDB构建体 8–117； UniProt 250–359 作者链 K； PDB构建体 8–117； UniProt 250–359 作者链 L； PDB构建体 8–117； UniProt 250–359

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	3tl8
沉积日期 deposition_date	2011-08-29
结构标题 title	The AvrPtoB-BAK1 complex reveals two structurally similar kinaseinteracting domains in a single type III effector
关键词 keywords	;Plant immunity, Pseudomonas syringae, Solanum lycopersicum, PAMP-triggered immunity, Bacterial pathogenesis, TRANSFERASE-LIGASE complex ;; TRANSFERASE/LIGASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

3tl8__assembly_2__model_1

Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

3tl8__assembly_2__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

3tl8__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	22.57 Å
Rg（电子密度）	21.51 Å
总 Rg	22.36 Å
原子数	3147
残基数	394
排除体积	55965 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`3tl8__assembly_1__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`3tl8__assembly_2__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
3	1	`3tl8__assembly_3__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
4	1	`3tl8__assembly_4__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	BRASSINOSTEROID INSENSITIVE 1-associated receptor kinase 1
分子量 formula_weight	40353.6 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.10.1, 2.7.11.1
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,D,G,H
原子数 atom_count	12644

RRKKPQDHFFDVPAEEDPEVHLGQLKRFSLRELQVASDNFSNKNILGRGGFGKVYKGRLADGTLVAVKRLKEERTQGGELQFQTEVEMISMAVHRNLLRLRGFCMTPTERLLVYPYMANGSVASCLRERPESQPPLDWPKRQRIALGSARGLAYLHDHCDPKIIHRDVKAANILLDEEFEAVVGDFGLAKLMDYKDTHVTTAVRGTIGHIAPEYLSTGKSSEKTDVFGYGVMLLELITGQRAFDLARLANDDDVMLLDWVKGLLKEKKLEALVDVDLQGNYKDEEVEQLIQVALLCTQSSPMERPKMSEVVRMLEGDGLAERWEEWQKEEMFRQDFNYPTHLEHHHHHH

来源 Source

来源生物 organism	Arabidopsis thaliana
通用名 common_name	mouse-ear cress, thale-cress
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	3702
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Effector protein HopAB2
分子量 formula_weight	12790.6 kDa
EC 编号 ec_number	6.3.2.-
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,F,K,L

GPLGSDRASQTPVDRSPPRVNQRPIRVDRAAMRNRGNDEADAALRGLVQQGVNLEHLRTALERHVMQRLPIPLDIGSALQNVGINPSIDLGESLVQHPLLNLNVALNRMLGLRPSAE

来源 Source

来源生物 organism	Pseudomonas syringae pv. tomato
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	323
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	188

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 16 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_id	d3tl8a_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.144 — Protein kinase-like (PK-like)
超家族 Superfamily superfamily	d.144.1 — Protein kinase-like (PK-like)
家族 Family family	d.144.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d3tl8d_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.144 — Protein kinase-like (PK-like)
超家族 Superfamily superfamily	d.144.1 — Protein kinase-like (PK-like)
家族 Family family	d.144.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d3tl8g_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.144 — Protein kinase-like (PK-like)
超家族 Superfamily superfamily	d.144.1 — Protein kinase-like (PK-like)
家族 Family family	d.144.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d3tl8h_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.144 — Protein kinase-like (PK-like)
超家族 Superfamily superfamily	d.144.1 — Protein kinase-like (PK-like)
家族 Family family	d.144.1.0 — automated matches

CATH v4.4 (12 domains)

结构域编号 domain_id	3tl8A01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	200 — Phosphorylase Kinase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Phosphorylase Kinase; domain 1

结构域编号 domain_id	3tl8A02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	510 — Transferase(Phosphotransferase); domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Transferase(Phosphotransferase) domain 1

结构域编号 domain_id	3tl8B00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1280 — Monooxygenase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	220 — Effector protein HopAB, BAK1-interacting domain

结构域编号 domain_id	3tl8D01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	200 — Phosphorylase Kinase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Phosphorylase Kinase; domain 1

结构域编号 domain_id	3tl8D02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	510 — Transferase(Phosphotransferase); domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Transferase(Phosphotransferase) domain 1

结构域编号 domain_id	3tl8F00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1280 — Monooxygenase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	220 — Effector protein HopAB, BAK1-interacting domain

结构域编号 domain_id	3tl8G01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	200 — Phosphorylase Kinase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Phosphorylase Kinase; domain 1

结构域编号 domain_id	3tl8G02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	510 — Transferase(Phosphotransferase); domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Transferase(Phosphotransferase) domain 1

结构域编号 domain_id	3tl8H01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	200 — Phosphorylase Kinase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Phosphorylase Kinase; domain 1

结构域编号 domain_id	3tl8H02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	510 — Transferase(Phosphotransferase); domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Transferase(Phosphotransferase) domain 1

结构域编号 domain_id	3tl8K00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1280 — Monooxygenase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	220 — Effector protein HopAB, BAK1-interacting domain

结构域编号 domain_id	3tl8L00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1280 — Monooxygenase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	220 — Effector protein HopAB, BAK1-interacting domain

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晶胞边长 a length_a	106.836 Å
晶胞边长 b length_b	108.140 Å
晶胞边长 c length_c	83.247 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	92.67 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.500 Å
最低分辨率 resolution_low	24.141 Å
R 因子 r_factor	0.1864
R_work r_work	0.1836
R_free r_free	0.2378

The AvrPtoB-BAK1 complex reveals two structurally similar kinaseinteracting domains in a single type III effector

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

BRASSINOSTEROID INSENSITIVE 1-associated receptor kinase 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Effector protein HopAB2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

3tl8__assembly_2__model_1

3tl8__assembly_2__model_1 | I(q)

3tl8__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 16 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

CATH v4.4 (12 domains)

7. 引用文献 (1)

The AvrPtoB-BAK1 complex reveals two structurally similar kinaseinteracting domains in a single type III effector

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

BRASSINOSTEROID INSENSITIVE 1-associated receptor kinase 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Effector protein HopAB2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

3tl8__assembly_2__model_1

3tl8__assembly_2__model_1 | I(q)

3tl8__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 16 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

CATH v4.4 (12 domains)

7. 引用文献 (1)