SAXSdb — 3uez

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Secreted protein BARF1

Human herpesvirus 4

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	其他组合异源复合物蛋白 × 12 其他聚合物 6 PDB 声明：dodecameric（12）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 21–221 链 D； UniProt 21–221	突变：T169S	Macrophage colony-stimulating factor 1 × 6 （P09603） beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.1M Tris HCl, 1.0M ammonium sulphate, pH 8.50, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 3.41 Å R-free 0.274
2	其他组合异源复合物蛋白 × 12 其他聚合物 6 PDB 声明：dodecameric（12）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 21–221 链 C； UniProt 21–221	突变：T169S	Macrophage colony-stimulating factor 1 × 6 （P09603） beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.1M Tris HCl, 1.0M ammonium sulphate, pH 8.50, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 3.41 Å R-free 0.274

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 3UEZ	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
2CH8 Structure of the Epstein-Barr Virus Oncogene BARF1 提交 2006-03-13	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 21–221（201 aa）链 D 21–221（201 aa）	未记录	PT PLATINUM (II) ION × 18	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6；1 M AMMONIUM SULPHATE,1-2 % PEG 3350,100 MM BISTRIS/HCL PH 6.0	分辨率 2.30 Å R-free 0.233
2CH8 Structure of the Epstein-Barr Virus Oncogene BARF1 提交 2006-03-13	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 B 21–221（201 aa）链 C 21–221（201 aa）	未记录	PT PLATINUM (II) ION × 18	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6；1 M AMMONIUM SULPHATE,1-2 % PEG 3350,100 MM BISTRIS/HCL PH 6.0	分辨率 2.30 Å R-free 0.233

共 1 个其他 PDB 条目、2 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	BARF1_EBVB9
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–201； UniProt 21–221 作者链 B； PDB构建体 1–201； UniProt 21–221 作者链 C； PDB构建体 1–201； UniProt 21–221 作者链 D； PDB构建体 1–201； UniProt 21–221

Macrophage colony-stimulating factor 1

Homo sapiens

UniProt P09603

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	其他组合异源复合物蛋白 × 12 其他聚合物 6 PDB 声明：dodecameric（12）与蛋白拷贝数一致	链 E； UniProt 33–181 链 F； UniProt 33–181	片段：UNP RESIDUES 33-181	Secreted protein BARF1 × 6 （P03228） beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.1M Tris HCl, 1.0M ammonium sulphate, pH 8.50, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 3.41 Å R-free 0.274
2	其他组合异源复合物蛋白 × 12 其他聚合物 6 PDB 声明：dodecameric（12）与蛋白拷贝数一致	链 G； UniProt 33–181 链 H； UniProt 33–181	片段：UNP RESIDUES 33-181	Secreted protein BARF1 × 6 （P03228） beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.1M Tris HCl, 1.0M ammonium sulphate, pH 8.50, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 3.41 Å R-free 0.274

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 3UEZ	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1HMC THREE-DIMENSIONAL STRUCTURE OF DIMERIC HUMAN RECOMBINANT MACROPHAGE COLONY STIMULATING FACTOR 提交 1993-12-22	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 36–181（146 aa）链 B 36–181（146 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.50 Å
3UF2 Crystal structure of the human Colony-Stimulating Factor 1 (hCSF-1) cytokine 提交 2011-10-31	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 33–181（149 aa）片段：UNP RESIDUES 33-181 链 B 33–181（149 aa）片段：UNP RESIDUES 33-181	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；0.1M magnesium chloride, 0.1M sodium citrate pH 5.0, 15% w/v PEG 4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.75 Å R-free 0.190
3UF2 Crystal structure of the human Colony-Stimulating Factor 1 (hCSF-1) cytokine 提交 2011-10-31	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 33–181（149 aa）片段：UNP RESIDUES 33-181 链 D 33–181（149 aa）片段：UNP RESIDUES 33-181	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；0.1M magnesium chloride, 0.1M sodium citrate pH 5.0, 15% w/v PEG 4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.75 Å R-free 0.190
3UF2 Crystal structure of the human Colony-Stimulating Factor 1 (hCSF-1) cytokine 提交 2011-10-31	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 33–181（149 aa）片段：UNP RESIDUES 33-181 链 F 33–181（149 aa）片段：UNP RESIDUES 33-181	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；0.1M magnesium chloride, 0.1M sodium citrate pH 5.0, 15% w/v PEG 4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.75 Å R-free 0.190
3UF2 Crystal structure of the human Colony-Stimulating Factor 1 (hCSF-1) cytokine 提交 2011-10-31	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 G 33–181（149 aa）片段：UNP RESIDUES 33-181 链 H 33–181（149 aa）片段：UNP RESIDUES 33-181	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；0.1M magnesium chloride, 0.1M sodium citrate pH 5.0, 15% w/v PEG 4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.75 Å R-free 0.190
3UF2 Crystal structure of the human Colony-Stimulating Factor 1 (hCSF-1) cytokine 提交 2011-10-31	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 I 33–181（149 aa）片段：UNP RESIDUES 33-181 链 J 33–181（149 aa）片段：UNP RESIDUES 33-181	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；0.1M magnesium chloride, 0.1M sodium citrate pH 5.0, 15% w/v PEG 4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.75 Å R-free 0.190
4ADF CRYSTAL STRUCTURE OF THE HUMAN COLONY-STIMULATING FACTOR 1 (hCSF-1) CYTOKINE IN COMPLEX WITH THE VIRAL RECEPTOR BARF1 提交 2011-12-23	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 G 33–181（149 aa）片段：UNP RESIDUES 33-181 链 H 33–181（149 aa）片段：UNP RESIDUES 33-181 链 I 33–181（149 aa）片段：UNP RESIDUES 33-181 链 J 33–181（149 aa）片段：UNP RESIDUES 33-181 链 K 33–181（149 aa）片段：UNP RESIDUES 33-181 链 L 33–181（149 aa）片段：UNP RESIDUES 33-181	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；0.1 M TRIS HCL, PH 8.50, 1.0 M AMMONIUM PHOSPHATE MONOBASIC	分辨率 4.40 Å R-free 0.276
4ADF CRYSTAL STRUCTURE OF THE HUMAN COLONY-STIMULATING FACTOR 1 (hCSF-1) CYTOKINE IN COMPLEX WITH THE VIRAL RECEPTOR BARF1 提交 2011-12-23	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 S 33–181（149 aa）片段：UNP RESIDUES 33-181 链 T 33–181（149 aa）片段：UNP RESIDUES 33-181 链 U 33–181（149 aa）片段：UNP RESIDUES 33-181 链 V 33–181（149 aa）片段：UNP RESIDUES 33-181 链 W 33–181（149 aa）片段：UNP RESIDUES 33-181 链 X 33–181（149 aa）片段：UNP RESIDUES 33-181	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；0.1 M TRIS HCL, PH 8.50, 1.0 M AMMONIUM PHOSPHATE MONOBASIC	分辨率 4.40 Å R-free 0.276
4FA8 Multi-pronged modulation of cytokine signaling 提交 2012-05-21	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 E 36–180（145 aa）片段：UNP residues 36-180 链 F 36–180（145 aa）片段：UNP residues 36-180 链 G 36–180（145 aa）片段：UNP residues 36-180	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；8% PEG8000, 0.1M imidazole pH8.0, 0.22M calcium acetate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.20 Å R-free 0.260
4FA8 Multi-pronged modulation of cytokine signaling 提交 2012-05-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 36–180（145 aa）片段：UNP residues 36-180	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；8% PEG8000, 0.1M imidazole pH8.0, 0.22M calcium acetate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.20 Å R-free 0.260
4FA8 Multi-pronged modulation of cytokine signaling 提交 2012-05-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 36–180（145 aa）片段：UNP residues 36-180 链 G 36–180（145 aa）片段：UNP residues 36-180	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；8% PEG8000, 0.1M imidazole pH8.0, 0.22M calcium acetate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.20 Å R-free 0.260
4WRL Structure of the human CSF-1:CSF-1R complex 提交 2014-10-24	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 33–181（149 aa）片段：UNP residues 33-181 链 D 33–181（149 aa）片段：UNP residues 33-181	未记录	SIA N-acetyl-alpha-neuraminic acid × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；0.2 M Lithium sulfate monohydrate, 0.1 M Tris pH 8.5 and 28% w/v PEG 3350	分辨率 2.80 Å R-free 0.261
4WRM Structure of the human CSF-1:CSF-1R complex 提交 2014-10-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 33–181（149 aa）片段：UNP RESIDUES 33-181	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；0.1 M NaCl, 0.1 M Tris pH 8.0 and 8% w/v PEG 20000	分辨率 6.85 Å R-free 0.359
5LXF Crystal structure of the human Macrophage Colony Stimulating Factor M- CSF_C31S variant 提交 2016-09-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 33–190（158 aa）链 B 33–190（158 aa）	突变：C31S 突变：C31S	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.8；293 K；0.03M Bis-Tris pH 6.5; 0.17M Mg Formate; 16.67% PEG 3350; 0.07M Bis-Tris pH 5.5	分辨率 2.00 Å R-free 0.253

共 7 个其他 PDB 条目、14 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CSF1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 5–153； UniProt 33–181 作者链 F； PDB构建体 5–153； UniProt 33–181 作者链 G； PDB构建体 5–153； UniProt 33–181 作者链 H； PDB构建体 5–153； UniProt 33–181

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	3uez
沉积日期 deposition_date	2011-10-31
结构标题 title	Crystal structure of the human Colony-Stimulating Factor 1 (hCSF-1) cytokine in complex with the viral receptor BARF1
关键词 keywords	;VIRAL RECEPTOR, RTKIII, EXTRACELLULAR, CYTOKINE RECEPTOR-CYTOKINE complex, CYTOKINE, FOUR-HELIX BUNDLE, GLYCOPROTEIN, IMMUNOGLOBULIN DOMAIN, ONCOGENE, RECEPTOR, CYTOKINE/SIGNALING, PROTEIN COMPLEX ;; CYTOKINE RECEPTOR/CYTOKINE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

▼

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	41.68 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	41.42 Å
零角强度 I(0) i0	343615000.00
分子量 molecular_weight	151990.0 kDa
排除体积 excluded_volume	190560 Å³
包络体积 envelope_volume	282640 Å³
水化壳体积 shell_volume	57477 Å³
包络直径 envelope_diameter	143.1 Å
壳层 Rg shell_rg	45.59 Å
包络 Rg envelope_rg	41.21 Å
形状 Rg shape_rg	41.44 Å
总 Rg total_rg	41.63 Å
总原子数 total_atoms	10687
残基数 n_residues	1307
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

▼

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	133.2 Å
Rg (实空间) rg_real	41.55 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.99 Å
I(0) (实空间) i0_real	3.4360e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	6.3370e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	41.67 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	343700000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8976
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	52.6 Å
偏度 Skewness skewness	0.170
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.474
角度范围 angular_range	— – 0.1900 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	16370000.0000
实空间数据点数 n_real_points	39
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.920; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.991; Smooth: 0.915

▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

▶

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Secreted protein BARF1
分子量 formula_weight	23412.7 kDa
突变 mutation	T169S
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D
原子数 atom_count	10693

VTAFLGERVTLTSYWRRVSLGPEIEVSWFKLGPGEEQVLIGRMHHDVIFIEWPFRGFFDIHRSANTFFLVVTAANISHDGNYLCRMKLGETEVTKQEHLSVVKPLTLSVHSERSQFPDFSVLTVTCTVNAFPHPHVQWLMPEGVEPAPSAANGGVMKEKDGSLSVAVDLSLPKPWHLPVTCVGKNDKEEAHGVYVSGYLSQKHHHHHH

来源 Source

来源生物 organism	Human herpesvirus 4
通用名 common_name	HHV-4
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10377
宿主生物 host_organism	Homo Sapiens

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Macrophage colony-stimulating factor 1
分子量 formula_weight	17868.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E,F,G,H

GSHMEEVSEYCSHMIGSGHLQSLQRLIDSQMETSCQITFEFVDQEQLKDPVCYLKKAFLLVQDIMEDTMRFRDNTPNAIAIVQLQELSLRLKSCFTKDYEEHDKACVRTFYETPLQLLEKVKNVFNETKNLLDKDWNIFSKNCNNSFAECSSQ

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 branched

描述 description	beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	586.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

▼

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 12 domains

CATH v4.4 (12 domains)

结构域编号 domain_id	3uezA01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	3uezA02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	3uezB01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	3uezB02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	3uezC01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	3uezC02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	3uezD01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	3uezD02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	3uezE00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1250 — Growth Hormone; Chain: A;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

结构域编号 domain_id	3uezF00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1250 — Growth Hormone; Chain: A;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

结构域编号 domain_id	3uezG00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1250 — Growth Hormone; Chain: A;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

结构域编号 domain_id	3uezH00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1250 — Growth Hormone; Chain: A;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

▶

8. 引用文献 (1)

▶

晶胞边长 a length_a	235.240 Å
晶胞边长 b length_b	235.240 Å
晶胞边长 c length_c	95.710 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	36

空间群 space_group	H 3
空间群编号 int_tables_number	146
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.414 Å
最低分辨率 resolution_low	40.000 Å
R 因子 r_factor	0.2336
R_work r_work	0.2314
R_free r_free	0.2735

fit	/app/data/saxs_computation/ue/3uez/3uez.fit
pddf	/app/data/pr_computation/ue/3uez/3uez.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/ue/3uez/3uez.dat

Crystal structure of the human Colony-Stimulating Factor 1 (hCSF-1) cytokine in complex with the viral receptor BARF1

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Secreted protein BARF1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Macrophage colony-stimulating factor 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 branched

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 12 domains

CATH v4.4 (12 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)