4al3

peptide deformylase (Co-form) with mercaptoethanol

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 53.7 Å Quality: GOOD

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

PEPTIDE DEFORMYLASE

ESCHERICHIA COLI

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 2–169	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CO COBALT (II) ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 BME BETA-MERCAPTOETHANOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 6；293 K；20.5% PEG 4000, 100 MM NA-ACETATE PH 4.0, 293 K. TRANSFERRED TO 20% PEG, 50 MM ACETATE PH 6.0, THEN SOAKED WITH 10 MM MERCAPTOETHANOL	分辨率 1.98 Å R-free 0.276

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 4AL3	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1BS4 PEPTIDE DEFORMYLASE AS ZN2+ CONTAINING FORM (NATIVE) IN COMPLEX WITH INHIBITOR POLYETHYLENE GLYCOL 提交 1998-09-01	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–168（168 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 2PE NONAETHYLENE GLYCOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.4；REFERENCE: D.GROCHE,A.BECKER,I.SCHLICHTING,W.KABSCH, S.SCHULTZ,A.F.V.WAGNER ( 1998) BIOCHEM.BIOPHYS.RES.COMM. 246, 342, pH 7.4	分辨率 1.90 Å R-free 0.240
1BS4 PEPTIDE DEFORMYLASE AS ZN2+ CONTAINING FORM (NATIVE) IN COMPLEX WITH INHIBITOR POLYETHYLENE GLYCOL 提交 1998-09-01	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–168（168 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 2PE NONAETHYLENE GLYCOL × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.4；REFERENCE: D.GROCHE,A.BECKER,I.SCHLICHTING,W.KABSCH, S.SCHULTZ,A.F.V.WAGNER ( 1998) BIOCHEM.BIOPHYS.RES.COMM. 246, 342, pH 7.4	分辨率 1.90 Å R-free 0.240
1BS4 PEPTIDE DEFORMYLASE AS ZN2+ CONTAINING FORM (NATIVE) IN COMPLEX WITH INHIBITOR POLYETHYLENE GLYCOL 提交 1998-09-01	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–168（168 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 2PE NONAETHYLENE GLYCOL × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.4；REFERENCE: D.GROCHE,A.BECKER,I.SCHLICHTING,W.KABSCH, S.SCHULTZ,A.F.V.WAGNER ( 1998) BIOCHEM.BIOPHYS.RES.COMM. 246, 342, pH 7.4	分辨率 1.90 Å R-free 0.240
1BS5 PEPTIDE DEFORMYLASE AS ZN2+ CONTAINING FORM 提交 1998-09-01	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–168（168 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.4；SEE: D.GROCHE,A.BECKER,I.SCHLICHTING,W.KABSCH, S.SCHULTZ,A.F.V.WAGNER (1998) BIOCHEM.BIOPHYS.RES.COMM. 246, 342, pH 7.4	分辨率 2.50 Å R-free 0.258
1BS5 PEPTIDE DEFORMYLASE AS ZN2+ CONTAINING FORM 提交 1998-09-01	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–168（168 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.4；SEE: D.GROCHE,A.BECKER,I.SCHLICHTING,W.KABSCH, S.SCHULTZ,A.F.V.WAGNER (1998) BIOCHEM.BIOPHYS.RES.COMM. 246, 342, pH 7.4	分辨率 2.50 Å R-free 0.258
1BS5 PEPTIDE DEFORMYLASE AS ZN2+ CONTAINING FORM 提交 1998-09-01	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–168（168 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.4；SEE: D.GROCHE,A.BECKER,I.SCHLICHTING,W.KABSCH, S.SCHULTZ,A.F.V.WAGNER (1998) BIOCHEM.BIOPHYS.RES.COMM. 246, 342, pH 7.4	分辨率 2.50 Å R-free 0.258
1BS6 PEPTIDE DEFORMYLASE AS NI2+ CONTAINING FORM IN COMPLEX WITH TRIPEPTIDE MET-ALA-SER 提交 1998-09-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–168（168 aa）	未记录	NI NICKEL (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.4；SEE: D.GROCHE,A.BECKER,I.SCHLICHTING,W.KABSCH, S.SCHULTZ,A.F.V.WAGNER (1998) BIOCHEM.BIOPHYS.RES.COMM. 246, 342, pH 7.4	分辨率 2.10 Å R-free 0.258
1BS6 PEPTIDE DEFORMYLASE AS NI2+ CONTAINING FORM IN COMPLEX WITH TRIPEPTIDE MET-ALA-SER 提交 1998-09-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–168（168 aa）	未记录	NI NICKEL (II) ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.4；SEE: D.GROCHE,A.BECKER,I.SCHLICHTING,W.KABSCH, S.SCHULTZ,A.F.V.WAGNER (1998) BIOCHEM.BIOPHYS.RES.COMM. 246, 342, pH 7.4	分辨率 2.10 Å R-free 0.258
1BS6 PEPTIDE DEFORMYLASE AS NI2+ CONTAINING FORM IN COMPLEX WITH TRIPEPTIDE MET-ALA-SER 提交 1998-09-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–168（168 aa）	未记录	NI NICKEL (II) ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.4；SEE: D.GROCHE,A.BECKER,I.SCHLICHTING,W.KABSCH, S.SCHULTZ,A.F.V.WAGNER (1998) BIOCHEM.BIOPHYS.RES.COMM. 246, 342, pH 7.4	分辨率 2.10 Å R-free 0.258
1BS7 PEPTIDE DEFORMYLASE AS NI2+ CONTAINING FORM 提交 1998-09-01	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–168（168 aa）	未记录	NI NICKEL (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.4；SEE: D.GROCHE,A.BECKER,I.SCHLICHTING,W.KABSCH, S.SCHULTZ,A.F.V.WAGNER (1998) BIOCHEM.BIOPHYS.RES.COMM. 246, 342, pH 7.4	分辨率 2.50 Å R-free 0.272
1BS7 PEPTIDE DEFORMYLASE AS NI2+ CONTAINING FORM 提交 1998-09-01	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–168（168 aa）	未记录	NI NICKEL (II) ION × 1 SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.4；SEE: D.GROCHE,A.BECKER,I.SCHLICHTING,W.KABSCH, S.SCHULTZ,A.F.V.WAGNER (1998) BIOCHEM.BIOPHYS.RES.COMM. 246, 342, pH 7.4	分辨率 2.50 Å R-free 0.272
1BS7 PEPTIDE DEFORMYLASE AS NI2+ CONTAINING FORM 提交 1998-09-01	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–168（168 aa）	未记录	NI NICKEL (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.4；SEE: D.GROCHE,A.BECKER,I.SCHLICHTING,W.KABSCH, S.SCHULTZ,A.F.V.WAGNER (1998) BIOCHEM.BIOPHYS.RES.COMM. 246, 342, pH 7.4	分辨率 2.50 Å R-free 0.272
1BS8 PEPTIDE DEFORMYLASE AS ZN2+ CONTAINING FORM IN COMPLEX WITH TRIPEPTIDE MET-ALA-SER 提交 1998-09-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–168（168 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.4；SEE: D.GROCHE,A.BECKER,I.SCHLICHTING,W.KABSCH, S.SCHULTZ,A.F.V.WAGNER (1998) BIOCHEM.BIOPHYS.RES.COMM. 246, 342, pH 7.4	分辨率 2.20 Å R-free 0.261
1BS8 PEPTIDE DEFORMYLASE AS ZN2+ CONTAINING FORM IN COMPLEX WITH TRIPEPTIDE MET-ALA-SER 提交 1998-09-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–168（168 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.4；SEE: D.GROCHE,A.BECKER,I.SCHLICHTING,W.KABSCH, S.SCHULTZ,A.F.V.WAGNER (1998) BIOCHEM.BIOPHYS.RES.COMM. 246, 342, pH 7.4	分辨率 2.20 Å R-free 0.261
1BS8 PEPTIDE DEFORMYLASE AS ZN2+ CONTAINING FORM IN COMPLEX WITH TRIPEPTIDE MET-ALA-SER 提交 1998-09-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–168（168 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.4；SEE: D.GROCHE,A.BECKER,I.SCHLICHTING,W.KABSCH, S.SCHULTZ,A.F.V.WAGNER (1998) BIOCHEM.BIOPHYS.RES.COMM. 246, 342, pH 7.4	分辨率 2.20 Å R-free 0.261
1BSJ COBALT DEFORMYLASE INHIBITOR COMPLEX FROM E.COLI 提交 1998-08-28	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–169（168 aa）	未记录	CO COBALT (II) ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 MLN (S)-2-(PHOSPHONOXY)CAPROYL-L-LEUCYL-P-NITROANILIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.5；pH 7.5	分辨率 3.00 Å R-free 0.207
1BSK ZINC DEFORMYLASE INHIBITOR COMPLEX FROM E.COLI 提交 1998-08-28	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–169（168 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 MLN (S)-2-(PHOSPHONOXY)CAPROYL-L-LEUCYL-P-NITROANILIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.5；pH 7.5	分辨率 3.00 Å R-free 0.221
1BSZ PEPTIDE DEFORMYLASE AS FE2+ CONTAINING FORM (NATIVE) IN COMPLEX WITH INHIBITOR POLYETHYLENE GLYCOL 提交 1998-09-01	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–168（168 aa）	未记录	FE FE (III) ION × 1 2PE NONAETHYLENE GLYCOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.4；SEE: D.GROCHE,A.BECKER,I.SCHLICHTING,W.KABSCH, S.SCHULTZ,A.F.V.WAGNER (1998) BIOCHEM.BIOPHYS.RES.COMM. 246, 342, pH 7.4	分辨率 1.90 Å R-free 0.247
1BSZ PEPTIDE DEFORMYLASE AS FE2+ CONTAINING FORM (NATIVE) IN COMPLEX WITH INHIBITOR POLYETHYLENE GLYCOL 提交 1998-09-01	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–168（168 aa）	未记录	FE FE (III) ION × 1 2PE NONAETHYLENE GLYCOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.4；SEE: D.GROCHE,A.BECKER,I.SCHLICHTING,W.KABSCH, S.SCHULTZ,A.F.V.WAGNER (1998) BIOCHEM.BIOPHYS.RES.COMM. 246, 342, pH 7.4	分辨率 1.90 Å R-free 0.247
1BSZ PEPTIDE DEFORMYLASE AS FE2+ CONTAINING FORM (NATIVE) IN COMPLEX WITH INHIBITOR POLYETHYLENE GLYCOL 提交 1998-09-01	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–168（168 aa）	未记录	FE FE (III) ION × 1 2PE NONAETHYLENE GLYCOL × 1 SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.4；SEE: D.GROCHE,A.BECKER,I.SCHLICHTING,W.KABSCH, S.SCHULTZ,A.F.V.WAGNER (1998) BIOCHEM.BIOPHYS.RES.COMM. 246, 342, pH 7.4	分辨率 1.90 Å R-free 0.247
1DEF PEPTIDE DEFORMYLASE CATALYTIC CORE (RESIDUES 1-147), NMR, 9 STRUCTURES 提交 1996-03-19	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–147（147 aa）片段：ACTIVE CATALYTIC CORE, RESIDUES 1 - 147	未记录	ZN ZINC ION × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.2；318 K	分辨率未提供
1DFF PEPTIDE DEFORMYLASE 提交 1997-08-19	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–164（164 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.88 Å R-free 0.289
1G27 CRYSTAL STRUCTURE OF E.COLI POLYPEPTIDE DEFORMYLASE COMPLEXED WITH THE INHIBITOR BB-3497 提交 2000-10-17	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–168（168 aa）	未记录	NI NICKEL (II) ION × 1 BB1 2-[(FORMYL-HYDROXY-AMINO)-METHYL]-HEXANOIC ACID (1-DIMETHYLCARBAMOYL-2,2-DIMETHYL-PROPYL)-AMIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；290 K；10mg/ml PDF, 20mM BB-3497, 25% PEG 4000, 0.1M sodium citrate, 0.2M ammonium acetate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 290K	分辨率 2.10 Å R-free 0.270
1G27 CRYSTAL STRUCTURE OF E.COLI POLYPEPTIDE DEFORMYLASE COMPLEXED WITH THE INHIBITOR BB-3497 提交 2000-10-17	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–168（168 aa）	未记录	NI NICKEL (II) ION × 1 BB1 2-[(FORMYL-HYDROXY-AMINO)-METHYL]-HEXANOIC ACID (1-DIMETHYLCARBAMOYL-2,2-DIMETHYL-PROPYL)-AMIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；290 K；10mg/ml PDF, 20mM BB-3497, 25% PEG 4000, 0.1M sodium citrate, 0.2M ammonium acetate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 290K	分辨率 2.10 Å R-free 0.270
1G27 CRYSTAL STRUCTURE OF E.COLI POLYPEPTIDE DEFORMYLASE COMPLEXED WITH THE INHIBITOR BB-3497 提交 2000-10-17	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–168（168 aa）	未记录	NI NICKEL (II) ION × 1 BB1 2-[(FORMYL-HYDROXY-AMINO)-METHYL]-HEXANOIC ACID (1-DIMETHYLCARBAMOYL-2,2-DIMETHYL-PROPYL)-AMIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；290 K；10mg/ml PDF, 20mM BB-3497, 25% PEG 4000, 0.1M sodium citrate, 0.2M ammonium acetate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 290K	分辨率 2.10 Å R-free 0.270
1G2A THE CRYSTAL STRUCTURE OF E.COLI PEPTIDE DEFORMYLASE COMPLEXED WITH ACTINONIN 提交 2000-10-18	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–168（168 aa）	未记录	NI NICKEL (II) ION × 1 BB2 ACTINONIN × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；290 K；10mg/ml PDF, 20mM actinonin, 50mM HEPES, pH 7.5 + 25-32% PEG 4000, 0.1M sodium citrate, pH 5.6, 0.2M ammonium acetate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 290K	分辨率 1.75 Å R-free 0.250
1G2A THE CRYSTAL STRUCTURE OF E.COLI PEPTIDE DEFORMYLASE COMPLEXED WITH ACTINONIN 提交 2000-10-18	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–168（168 aa）	未记录	NI NICKEL (II) ION × 1 BB2 ACTINONIN × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；290 K；10mg/ml PDF, 20mM actinonin, 50mM HEPES, pH 7.5 + 25-32% PEG 4000, 0.1M sodium citrate, pH 5.6, 0.2M ammonium acetate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 290K	分辨率 1.75 Å R-free 0.250
1G2A THE CRYSTAL STRUCTURE OF E.COLI PEPTIDE DEFORMYLASE COMPLEXED WITH ACTINONIN 提交 2000-10-18	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–168（168 aa）	未记录	NI NICKEL (II) ION × 1 BB2 ACTINONIN × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；290 K；10mg/ml PDF, 20mM actinonin, 50mM HEPES, pH 7.5 + 25-32% PEG 4000, 0.1M sodium citrate, pH 5.6, 0.2M ammonium acetate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 290K	分辨率 1.75 Å R-free 0.250
1ICJ PDF PROTEIN IS CRYSTALLIZED AS NI2+ CONTAINING FORM, COCRYSTALLIZED WITH INHIBITOR POLYETHYLENE GLYCOL (PEG) 提交 1998-03-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–168（168 aa）链 B 1–168（168 aa）链 C 1–168（168 aa）	未记录	NI NICKEL (II) ION × 3 2PE NONAETHYLENE GLYCOL × 3 SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.90 Å R-free 0.230
1LRU Crystal Structure of E.coli Peptide Deformylase Complexed with Antibiotic Actinonin 提交 2002-05-16	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–168（168 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 BB2 ACTINONIN × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；290 K；0.5M (NH4)2SO4, 28%PEG400, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K	分辨率 2.10 Å
1LRU Crystal Structure of E.coli Peptide Deformylase Complexed with Antibiotic Actinonin 提交 2002-05-16	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–168（168 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 BB2 ACTINONIN × 1 SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；290 K；0.5M (NH4)2SO4, 28%PEG400, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K	分辨率 2.10 Å
1LRU Crystal Structure of E.coli Peptide Deformylase Complexed with Antibiotic Actinonin 提交 2002-05-16	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–168（168 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 BB2 ACTINONIN × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；290 K；0.5M (NH4)2SO4, 28%PEG400, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K	分辨率 2.10 Å
1LRU Crystal Structure of E.coli Peptide Deformylase Complexed with Antibiotic Actinonin 提交 2002-05-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–168（168 aa）链 C 1–168（168 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2 BB2 ACTINONIN × 2 SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；290 K；0.5M (NH4)2SO4, 28%PEG400, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K	分辨率 2.10 Å
1XEM High Resolution Crystal Structure of Escherichia coli Zinc- Peptide Deformylase bound to formate 提交 2004-09-10	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–168（168 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 FMT FORMIC ACID × 10	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；277 K；Sodium Acetate, Sodium Formate, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 1.76 Å R-free 0.204
1XEN High Resolution Crystal Structure of Escherichia coli Iron- Peptide Deformylase Bound To Formate 提交 2004-09-10	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–168（168 aa）	未记录	FE FE (III) ION × 1 FMT FORMIC ACID × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；277 K；Sodium Acetate, Sodium Formate, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 1.85 Å R-free 0.218
1XEO High Resolution Crystals Structure of Cobalt- Peptide Deformylase Bound To Formate 提交 2004-09-10	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–168（168 aa）	未记录	CO COBALT (II) ION × 1 FMT FORMIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；277 K；Sodium Acetate, Sodium Formate, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 1.30 Å R-free 0.215
2AI8 E.coli Polypeptide Deformylase complexed with SB-485343 提交 2005-07-29	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–168（168 aa）	未记录	NI NICKEL (II) ION × 1 SB7 [HYDROXY(3-PHENYLPROPYL)AMINO]METHANOL × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.70 Å R-free 0.226
2AI8 E.coli Polypeptide Deformylase complexed with SB-485343 提交 2005-07-29	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–168（168 aa）	未记录	NI NICKEL (II) ION × 1 SB7 [HYDROXY(3-PHENYLPROPYL)AMINO]METHANOL × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.70 Å R-free 0.226
2AI8 E.coli Polypeptide Deformylase complexed with SB-485343 提交 2005-07-29	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–168（168 aa）	未记录	NI NICKEL (II) ION × 1 SB7 [HYDROXY(3-PHENYLPROPYL)AMINO]METHANOL × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.70 Å R-free 0.226
2DEF PEPTIDE DEFORMYLASE CATALYTIC CORE (RESIDUES 1-147), NMR, 20 STRUCTURES 提交 1997-12-15	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–147（146 aa）片段：ACTIVE CATALYTIC CORE, RESIDUES 1 - 147	突变：S1A	NI NICKEL (II) ION × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.2；318 K	分辨率未提供
2KMN Solution structure of peptide deformylase complexed with actinonin 提交 2009-08-01	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–148（147 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 BB2 ACTINONIN × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.2；310 K；离子强度（mmCIF原始值）10；压力 ambient NMR样品组成 0.6-1.0 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Protein-1, 1.2 mM ACTINONIN-2, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
2W3T Chloro complex of the Ni-Form of E.coli deformylase 提交 2008-11-14	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–169（168 aa）片段：RESIDUES 2-169	未记录	NI NICKEL (II) ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 EOH ETHANOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 4；293 K；20.5% PEG4000, 100MM NAOAC PH 4.0, 293 K	分辨率 1.69 Å R-free 0.243
2W3U formate complex of the Ni-Form of E.coli deformylase 提交 2008-11-14	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–169（168 aa）片段：RESIDUES 2-169	未记录	NI NICKEL (II) ION × 1 FMT FORMIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 4.1；293 K；20% PEG4000, 0.2M (NH4)2SO4, 0.1M NAOAC PH 4.1, 293 K	分辨率 1.96 Å R-free 0.285
3K6L The structure of E.coli peptide deformylase (PDF) in complex with peptidomimetic ligand BB2827 提交 2009-10-09	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–169（169 aa）	未记录	NI NICKEL (II) ION × 1 2BB (2S,3R)-N~4~-[(1S)-1-(dimethylcarbamoyl)-2,2-dimethylpropyl]-N~1~,2-dihydroxy-3-(2-methylpropyl)butanediamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；20% PEG3350, 0.2M Potassium formate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 294K	分辨率 2.15 Å R-free 0.319
3K6L The structure of E.coli peptide deformylase (PDF) in complex with peptidomimetic ligand BB2827 提交 2009-10-09	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–169（169 aa）	未记录	NI NICKEL (II) ION × 1 2BB (2S,3R)-N~4~-[(1S)-1-(dimethylcarbamoyl)-2,2-dimethylpropyl]-N~1~,2-dihydroxy-3-(2-methylpropyl)butanediamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；20% PEG3350, 0.2M Potassium formate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 294K	分辨率 2.15 Å R-free 0.319
3K6L The structure of E.coli peptide deformylase (PDF) in complex with peptidomimetic ligand BB2827 提交 2009-10-09	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–169（169 aa）	未记录	NI NICKEL (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；20% PEG3350, 0.2M Potassium formate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 294K	分辨率 2.15 Å R-free 0.319
4AL2 peptide deformylase (Ni-form) with hydrosulfide 提交 2012-02-29	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–169（168 aa）	未记录	NI NICKEL (II) ION × 1 H2S HYDROSULFURIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 4.6；293 K；25% PEG 4000, 200 MM NAOAC PH 4.6, 293 K, INCUBATED IN H2S ATMOSPHERE EQUILIBRATED WITH 50 MM NA2S AT PH 4.6	分辨率 2.60 Å R-free 0.298
4AL2 peptide deformylase (Ni-form) with hydrosulfide 提交 2012-02-29	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 2–169（168 aa）	未记录	NI NICKEL (II) ION × 1 H2S HYDROSULFURIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 4.6；293 K；25% PEG 4000, 200 MM NAOAC PH 4.6, 293 K, INCUBATED IN H2S ATMOSPHERE EQUILIBRATED WITH 50 MM NA2S AT PH 4.6	分辨率 2.60 Å R-free 0.298
4AL2 peptide deformylase (Ni-form) with hydrosulfide 提交 2012-02-29	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 2–169（168 aa）	未记录	NI NICKEL (II) ION × 1 H2S HYDROSULFURIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 4.6；293 K；25% PEG 4000, 200 MM NAOAC PH 4.6, 293 K, INCUBATED IN H2S ATMOSPHERE EQUILIBRATED WITH 50 MM NA2S AT PH 4.6	分辨率 2.60 Å R-free 0.298
4AZ4 E.coli deformylase with Co(II) and hydrosulfide 提交 2012-06-22	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–169（168 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CO COBALT (II) ION × 1 H2S HYDROSULFURIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 4.6；293 K；2 UL PROTEIN PLUS 2 UL (20% PEG 4000, 0.1 M NAOAC PH 4.6), 293 K. SOAKED IN 10% PEG4000, 20% PEG400, 0.1 M NAOAC PH 4.6, 293 K, FOR 1 DAY. INCUBATED IN H2S ATMOSPHERE EQUILIBRATED WITH 50 MM NA2S AT PH 4.6	分辨率 1.80 Å R-free 0.221
4V5B Structure of PDF binding helix in complex with the ribosome. 提交 2007-11-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：53-meric	链 A5 147–162（16 aa）	突变：YES	MG MAGNESIUM ION × 170	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.5；pH 7.5	分辨率 3.74 Å R-free 0.323
6IY7 E. coli peptide deformylase crystal structure fitted into the cryo-EM density map of E. coli 70S ribosome in complex with peptide deformylase 提交 2018-12-13	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 P 1–169（169 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 10.50 Å
6IZI Crystal structure of E. coli peptide deformylase and methionine aminopeptidase fitted into the cryo-EM density map of the complex 提交 2018-12-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 P 1–169（169 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 11.80 Å
7D6Z Molecular model of the cryo-EM structure of 70S ribosome in complex with peptide deformylase and trigger factor 提交 2020-10-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：58-meric	链 g 1–169（169 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
7D80 Molecular model of the cryo-EM structure of 70S ribosome in complex with peptide deformylase, trigger factor, and methionine aminopeptidase 提交 2020-10-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 51 PDB 声明：57-meric	链 3 1–169（169 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å

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查看构建体与数据证据

UniProt名称	DEF_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–168； UniProt 2–169

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	4al3
沉积日期 deposition_date	2012-02-29
结构标题 title	peptide deformylase (Co-form) with mercaptoethanol
关键词 keywords	HYDROLASE, OXIDATION-REDUCTION; HYDROLASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	16.80 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	15.65 Å
零角强度 I(0) i0	6692890.00
分子量 molecular_weight	18664.0 kDa
排除体积 excluded_volume	23374 Å³
包络体积 envelope_volume	26889 Å³
水化壳体积 shell_volume	14499 Å³
包络直径 envelope_diameter	54.0 Å
壳层 Rg shell_rg	21.49 Å
包络 Rg envelope_rg	16.06 Å
形状 Rg shape_rg	15.68 Å
总 Rg total_rg	16.62 Å
总原子数 total_atoms	1303
残基数 n_residues	161
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	53.7 Å
Rg (实空间) rg_real	16.72 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.35 Å
I(0) (实空间) i0_real	6.6930e+06
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	8.7830e+04
Rg (倒空间) rg_reciprocal	16.73 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	6693000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8118
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	3
主峰位置 r_peak_primary	21.6 Å
偏度 Skewness skewness	0.205
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.333
角度范围 angular_range	— – 0.4750 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	1368000.0000
实空间数据点数 n_real_points	78
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.851; Stabil: 0.999; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.997; Smooth: 0.000

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	PEPTIDE DEFORMYLASE
分子量 formula_weight	21244.4 kDa
EC 编号 ec_number	3.5.1.88
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	1415

SVLQVLHIPDERLRKVAKPVEEVNAEIQRIVDDMFETMYAEEGIGLAATQVDIHQRIIVIDVSENRDERLVLINPELLEKSGETGIEEGCLSIPEQRALVPRAEKVKIRALDRDGKPFELEADGLLAICIQHEMDHLVGKLFMDYLSPLKQQRIRQKVEKLDRLKARASSSVDKLAAALEHHHHHH

来源 Source

来源生物 organism	ESCHERICHIA COLI
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	469008
宿主生物 host_organism	ESCHERICHIA COLI

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	COBALT (II) ION
分子量 formula_weight	58.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	CHLORIDE ION
分子量 formula_weight	35.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	BETA-MERCAPTOETHANOL
分子量 formula_weight	78.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 5 Entity 5 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	98

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_id	d4al3a_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.167 — Peptide deformylase
超家族 Superfamily superfamily	d.167.1 — Peptide deformylase
家族 Family family	d.167.1.1 — Peptide deformylase

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id	4al3A00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	45 — Peptide Deformylase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Peptide deformylase

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	55.630 Å
晶胞边长 b length_b	55.630 Å
晶胞边长 c length_c	229.340 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	12

空间群 space_group	P 61 2 2
空间群编号 int_tables_number	178
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.980 Å
最低分辨率 resolution_low	48.180 Å
R 因子 r_factor	0.2165
R_work r_work	0.2135
R_free r_free	0.2758

fit	/app/data/saxs_computation/al/4al3/4al3.fit
pddf	/app/data/pr_computation/al/4al3/4al3.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/al/4al3/4al3.dat