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1ADQ
CRYSTAL STRUCTURE OF A HUMAN IGM RHEUMATOID FACTOR FAB IN COMPLEX WITH ITS AUTOANTIGEN IGG FC
提交 1997-02-18
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
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链 A
118–323(206 aa)
片段:FC
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未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;CRYSTALS WERE GROWN BY HANGING DROP VAPOR DIFFUSION. THE HANGING DROPS CONSISTED OF 2UL OF PROTEIN SOLUTION CONTAINING EACH PROTEIN AT 1MG/ML IN 0.1 % SODIUM AZIDE, 20MM TRIS-HCL AT PH 7.0, MIXED WITH AN EQUAL VOLUME OF THE RESERVOIR SOLUTION TO BE SCREENED. CRYSTALS WERE OBTAINED WITH RESERVOIR SOLUTIONS CONTAINING 17.5 - 22.5 % (W/V) POLYETHYLENE GLYCOL (MEAN MW 8000) IN 0.1 % SODIUM AZIDE, 100MM TRIS-HCL, PH 7.0, AT TEMPERATURES BETWEEN 17.5 AND 21.5 (CELSIUS)., vapor diffusion - hanging drop
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分辨率 3.15 Å
R-free 0.289
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1BBJ
CRYSTAL STRUCTURE OF A CHIMERIC FAB' FRAGMENT OF AN ANTIBODY BINDING TUMOUR CELLS
提交 1992-04-30
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 H
1–98(98 aa)
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非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
mmCIF 未提供已读取条件
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分辨率 3.10 Å
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1BBJ
CRYSTAL STRUCTURE OF A CHIMERIC FAB' FRAGMENT OF AN ANTIBODY BINDING TUMOUR CELLS
提交 1992-04-30
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 B
1–98(98 aa)
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非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
mmCIF 未提供已读取条件
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分辨率 3.10 Å
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4B53
Crystal structure of the isolated IgG4 CH3 domain
提交 2012-08-02
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
222–327(106 aa)
片段:CH3 DOMAIN, RESIDUES 222-327
链 B
222–327(106 aa)
片段:CH3 DOMAIN, RESIDUES 222-327
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非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
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EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 4
TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1
ACT ACETATE ION × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;291 K;SITTING DROP AT 291K. RESERVOIR OF 100 MICROLITRE 22% PEG 3350 AND 150MM CALCIUM ACETATE. DROP SIZE 100 NANOLITRE PROTEIN AND 100 NANOLITRE RESERVOIR. PROTEIN CONCENTRATION OF 1.5MG/ML
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分辨率 1.80 Å
R-free 0.237
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4C54
Crystal structure of recombinant human IgG4 Fc
提交 2013-09-10
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
结构质量不同
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Assembly 1
其他组合
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
114–327(214 aa)
片段:FC FRAGMENT, RESIDUES 114-327
链 B
114–327(214 aa)
片段:FC FRAGMENT, RESIDUES 114-327
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未记录
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MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 9
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 6.5;MES PH6.5. 18-20% PEG 20 000
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分辨率 1.90 Å
R-free 0.209
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4D2N
Crystal structure of deglycosylated serum-derived human IgG4 Fc
提交 2014-05-12
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 C
102–327(226 aa)
片段:FC FRAGMENT, RESIDUES 102-327
链 D
102–327(226 aa)
片段:FC FRAGMENT, RESIDUES 102-327
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突变:YES
突变:YES
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7;291 K;CRYSTALS WERE GROWN AT 291K USING A RESERVOIR OF 100MM BIS-TRIS PROPANE PH7.5, 20% PEG 3350 AND 200MM SODIUM CITRATE, AND A PROTEIN CONCENTRATION OF 6MG/ML.
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分辨率 2.70 Å
R-free 0.254
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4D2N
Crystal structure of deglycosylated serum-derived human IgG4 Fc
提交 2014-05-12
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 2
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
102–327(226 aa)
片段:FC FRAGMENT, RESIDUES 102-327
链 B
102–327(226 aa)
片段:FC FRAGMENT, RESIDUES 102-327
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突变:YES
突变:YES
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GOL GLYCEROL × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7;291 K;CRYSTALS WERE GROWN AT 291K USING A RESERVOIR OF 100MM BIS-TRIS PROPANE PH7.5, 20% PEG 3350 AND 200MM SODIUM CITRATE, AND A PROTEIN CONCENTRATION OF 6MG/ML.
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分辨率 2.70 Å
R-free 0.254
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5HVW
Monomeric IgG4 Fc
提交 2016-01-28
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
其他组合
同源多聚体;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
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链 A
115–324(210 aa)
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突变:L351F, T366R, P395K, F405R, Y407E
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ZN ZINC ION × 12
GOL GLYCEROL × 6
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;293 K;9 mM ZnCl2, 90 mM Hepes, pH 7.0, 18% PEG 6000 (w/v)
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分辨率 1.95 Å
R-free 0.258
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5HVW
Monomeric IgG4 Fc
提交 2016-01-28
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构建体不同
突变/修饰不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 2
其他组合
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 A
115–324(210 aa)
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突变:L351F, T366R, P395K, F405R, Y407E
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ZN ZINC ION × 2
GOL GLYCEROL × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;293 K;9 mM ZnCl2, 90 mM Hepes, pH 7.0, 18% PEG 6000 (w/v)
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分辨率 1.95 Å
R-free 0.258
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5LG1
Room temperature structure of human IgG4-Fc from crystals analysed in situ
提交 2016-07-05
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
其他组合
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
114–327(214 aa)
链 B
114–327(214 aa)
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未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;291 K;0.1M MES, 18-20% PEG 20 000
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分辨率 2.70 Å
R-free 0.231
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5W5M
Crystal structure of human IgG4-Sigma1 Fc fragment
提交 2017-06-15
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
其他组合
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
106–327(222 aa)
片段:Sigma1 Fc fragment, UNP residues 106-327
链 B
106–327(222 aa)
片段:Sigma1 Fc fragment, UNP residues 106-327
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未记录
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GOL GLYCEROL × 2
ACT ACETATE ION × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;9% (w/v) PEG 20K, 0.1 M sodium acetate, pH 5.5
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分辨率 1.90 Å
R-free 0.225
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5W5N
Crystal structure of human IgG4-Sigma2 Fc fragment
提交 2017-06-15
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
其他组合
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
106–327(222 aa)
片段:Sigma2 Fc fragment, UNP residues 106-327
链 B
106–327(222 aa)
片段:Sigma2 Fc fragment, UNP residues 106-327
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未记录
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GOL GLYCEROL × 2
ACT ACETATE ION × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;10% (w/v) PEG 20K, 0.1 M sodium acetate, 5.5, 5% (v/v) MPD
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分辨率 1.85 Å
R-free 0.215
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6WIB
Next generation monomeric IgG4 Fc
提交 2020-04-09
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构建体不同
突变/修饰不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
其他组合
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 A
115–325(211 aa)
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突变:L351F, T366R, P395K, F405R, Y407e, L432C, H433S, N434W, Y436L, T437C, Q438 deleted
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ZN ZINC ION × 3
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 6.5;298 K;0.01 M zinc sulfate heptahydrate; 0.1 M morpholineethanesulfonic acid (MES) monohydrate, pH 6.5, and 25% (w/v) PEG 550 MME at a protein concentration of 5.5 mg/mL
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分辨率 2.55 Å
R-free 0.266
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6WMH
Next generation monomeric IgG4 Fc
提交 2020-04-21
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 H
118–324(207 aa)
片段:domains Ch2 and Ch3
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突变:M252Y, S254T, T256E, N297D, L351F, S354E, T366R, P395K, F405R, Y407E
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 7.5;295 K;DL-Glutamic acid monohydrate,
DL-Alanine,
Glycine,
DL-Lysine monohydrochloride,
DL-Serine,
Sodium HEPES, MOPS (acid),
Ethylene glycol,
PEG 8000
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分辨率 2.30 Å
R-free 0.243
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6WMH
Next generation monomeric IgG4 Fc
提交 2020-04-21
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 A
118–324(207 aa)
片段:domains Ch2 and Ch3
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突变:M252Y, S254T, T256E, N297D, L351F, S354E, T366R, P395K, F405R, Y407E
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 7.5;295 K;DL-Glutamic acid monohydrate,
DL-Alanine,
Glycine,
DL-Lysine monohydrochloride,
DL-Serine,
Sodium HEPES, MOPS (acid),
Ethylene glycol,
PEG 8000
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分辨率 2.30 Å
R-free 0.243
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6WNA
Next generation monomeric IgG4 Fc
提交 2020-04-22
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
其他组合
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
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链 H
118–324(207 aa)
片段:domains Ch2 and Ch3
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突变:M252Y, S254T, T256E, L351F, S354E, T366R, P395K, F405R, Y407E,
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;295 K;0.2 M magnesium chloride hexahydrate, 30% 1,5-diaminopentane dihydrochloride, 0.1 M MES, pH 6 and 20% PEG 6000 at a protein concentration of 6 mg/mL
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分辨率 2.40 Å
R-free 0.263
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6WOL
Next generation monomeric IgG4 Fc bound to neonatal Fc receptor
提交 2020-04-24
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
其他组合
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
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链 H
117–326(210 aa)
片段:domains Ch3 and Ch4
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突变:L351F, S354E, T366R, P395K, F405R, Y407E, L432C, H433S, N434Y, Y436L, T437C, Q438 deleted
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 6;295 K;0.2 M magnesium chloride hexahydrate, 1 M sodium iodide, 0.1 M MES, pH 6 and 20% PEG 6000 at a protein concentration of 6.35 mg/mL
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分辨率 2.49 Å
R-free 0.270
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