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1BXL
STRUCTURE OF BCL-XL/BAK PEPTIDE COMPLEX, NMR, MINIMIZED AVERAGE STRUCTURE
提交 1996-10-16
|
构建体不同
聚集状态不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
72–87(16 aa)
片段:RESIDUES 572 - 587 OF BAK PROTEIN
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未记录
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未记录非水小分子
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SOLUTION NMR
NMR测量条件
303 K
|
分辨率未提供
|
|
2IMS
The X-ray Structure of a Bak Homodimer Reveals an Inhibitory Zinc Binding Site
提交 2006-10-04
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
16–186(171 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
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ZN ZINC ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.6;298 K;PEG 3350 15-30% and 1-50 mM zinc acetate, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.48 Å
R-free 0.204
|
|
2IMT
The X-ray Structure of a Bak Homodimer Reveals an Inhibitory Zinc Binding Site
提交 2006-10-04
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
16–186(171 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.6;298 K;PEG 3350 15-30% and 0.2 M ammonium fluoride, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.49 Å
R-free 0.220
|
|
2IMT
The X-ray Structure of a Bak Homodimer Reveals an Inhibitory Zinc Binding Site
提交 2006-10-04
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
16–186(171 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.6;298 K;PEG 3350 15-30% and 0.2 M ammonium fluoride, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.49 Å
R-free 0.220
|
|
2JCN
The crystal structure of BAK1 - a mitochondrial apoptosis regulator
提交 2006-12-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
21–190(170 aa)
|
未记录
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SO4 SULFATE ION × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.5;22% PEG3350, 20% GLYCEROL, 0.2M SODIUM SULPHATE, 2MM TCEP, 0.3M NACL, 20 MM HEPES PH7.5, pH 7.50
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.232
|
|
2LP8
SOLUTION STRUCTURE OF AN APOPTOSIS ACTIVATING PHOTOSWITCHABLE BAK PEPTIDE BOUND to BCL-XL
提交 2012-02-03
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
72–87(16 aa)
片段:BH3 domain residues 72-87
|
突变:Q73C, Q77A, I80A, I81F, D84C
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
33B 3,3'-(E)-diazene-1,2-diylbis{6-[(chloroacetyl)amino]benzenesulfonic acid} × 1
|
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 7.3;298 K;离子强度(mmCIF原始值)50;压力 AMBIENT
NMR样品组成
1 MM [U-98% 13C U-98% 15N] BCL- XL, 1.1 MM PHOTOSWITCHABLE BAK, 5 MM SODIUM PHOSPHATE, 5 MM 2- MERCAPTOETHANOL, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1 MM [U-98% 13C U-98% 15N] BCL- XL, 1.1 MM PHOTOSWITCHABLE BAK, 5 MM SODIUM PHOSPHATE, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1 MM [U-98% 13C U-98% 15N] BCL-XL, 1.1 MM PHOTOSWITCHABLE BAK, 5 MM SODIUM PHOSPHATE, 100% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供
|
|
2M5B
The NMR structure of the BID-BAK complex
提交 2013-02-19
|
构建体不同
聚集状态不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
18–186(169 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.8;300 K;离子强度(mmCIF原始值)0;压力 ambient
NMR样品组成
~0.5 mM [U-98% 13C; U-98% 15N] human cBAK, ~0.5 mM human BID BH3 SAHB, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供
|
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2XPX
Crystal structure of BHRF1:Bak BH3 complex
提交 2010-08-31
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
67–92(26 aa)
片段:RESIDUES 67-92
|
未记录
|
NO3 NITRATE ION × 4
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 4.4;1.6 M NANO3, 50 MM MALIC ACID PH 4.4
|
分辨率 2.05 Å
R-free 0.217
|
|
2YV6
Crystal structure of human Bcl-2 family protein Bak
提交 2007-04-09
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
23–185(163 aa)
片段:residues 23-185
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
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SO4 SULFATE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.2;293 K;ammonium sulfate, iso-propanol, pH 5.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.248
|
|
3I1H
Crystal structure of human BFL-1 in complex with BAK BH3 peptide
提交 2009-06-26
|
构建体不同
聚集状态不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
72–87(16 aa)
片段:BH3
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.8;298 K;1.5 M sodium malonate, pH 5.8
protein 1.67 mg/ml, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.238
|
|
3QBR
BakBH3 in complex with sjA
提交 2011-01-13
|
构建体不同
聚集状态不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
63–96(34 aa)
片段:BH3 (UNP RESIDUES 63-96)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9;295 K;1M tri-sodium citrate, 0.1M CHES, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.60 Å
R-free 0.234
|
|
3QBR
BakBH3 in complex with sjA
提交 2011-01-13
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 Y
63–96(34 aa)
片段:BH3 (UNP RESIDUES 63-96)
|
未记录
|
NHE 2-[N-CYCLOHEXYLAMINO]ETHANE SULFONIC ACID × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9;295 K;1M tri-sodium citrate, 0.1M CHES, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.60 Å
R-free 0.234
|
|
4U2U
Bak domain swapped dimer induced by BidBH3 with CHAPS
提交 2014-07-18
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
23–186(164 aa)
片段:UNP residues 23-186
链 B
23–186(164 aa)
片段:UNP residues 23-186
|
突变:C166S
突变:C166S
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291 K;26.7% PEG 3350, 0.05 M sodium acetate
|
分辨率 2.90 Å
R-free 0.263
|
|
4U2V
Bak BH3-in-Groove dimer (GFP)
提交 2014-07-18
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
信息不足
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
68–148(81 aa)
片段:UNP P42212 residues 1-230, UNP Q16611 residues 68-148
链 C
68–148(81 aa)
片段:UNP P42212 residues 1-230, UNP Q16611 residues 68-148
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
CAC CACODYLATE ION × 1
MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;281 K;4.5% PEG 8000, 40% MPD, 100 mM tri-sodium citrate, 90 mM cacodylate acid pH 6.5 and 1% Octyl glucoside
|
分辨率 2.30 Å
R-free 0.250
|
|
4U2V
Bak BH3-in-Groove dimer (GFP)
提交 2014-07-18
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
信息不足
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
68–148(81 aa)
片段:UNP P42212 residues 1-230, UNP Q16611 residues 68-148
链 D
68–148(81 aa)
片段:UNP P42212 residues 1-230, UNP Q16611 residues 68-148
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
CAC CACODYLATE ION × 5
MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;281 K;4.5% PEG 8000, 40% MPD, 100 mM tri-sodium citrate, 90 mM cacodylate acid pH 6.5 and 1% Octyl glucoside
|
分辨率 2.30 Å
R-free 0.250
|
|
4UF1
Deerpox virus DPV022 in complex with Bak BH3
提交 2014-12-23
|
构建体不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 B
67–92(26 aa)
片段:BH3, UNP RESIDUES 67-92
|
未记录
|
SO4 SULFATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5;17% PEG 8000, 0.2M MES PH 5.5, 0.2M AMMONIUM SULPHATE
|
分辨率 2.30 Å
R-free 0.206
|
|
5AJK
Crystal structure of variola virus virulence factor F1L in complex with human Bak BH3 domain
提交 2015-02-25
|
构建体不同
突变/修饰不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 B
67–92(26 aa)
片段:RESIDUES 67-92
链 D
67–92(26 aa)
片段:RESIDUES 67-92
|
未记录
|
CL CHLORIDE ION × 2
ACT ACETATE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.2;1.7 M MGSO4, 0.1 M NA-ACETATE PH 5.2
|
分辨率 2.55 Å
R-free 0.240
|
|
5AJK
Crystal structure of variola virus virulence factor F1L in complex with human Bak BH3 domain
提交 2015-02-25
|
构建体不同
突变/修饰不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 F
67–92(26 aa)
片段:RESIDUES 67-92
链 L
67–92(26 aa)
片段:RESIDUES 67-92
|
未记录
|
ACT ACETATE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.2;1.7 M MGSO4, 0.1 M NA-ACETATE PH 5.2
|
分辨率 2.55 Å
R-free 0.240
|
|
5AJK
Crystal structure of variola virus virulence factor F1L in complex with human Bak BH3 domain
提交 2015-02-25
|
构建体不同
突变/修饰不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 H
67–92(26 aa)
片段:RESIDUES 67-92
链 J
67–92(26 aa)
片段:RESIDUES 67-92
|
未记录
|
ACT ACETATE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.2;1.7 M MGSO4, 0.1 M NA-ACETATE PH 5.2
|
分辨率 2.55 Å
R-free 0.240
|
|
5FMI
Human Bak Q77L
提交 2015-11-06
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
23–184(162 aa)
片段:UNP RESIDUES 23-184
|
突变:YES
|
ZN ZINC ION × 6
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 4.5;10% PEG 3350, 0.1M SODIUM ACETATE PH 4.5, 20 MM ZINC ACETATE
|
分辨率 1.49 Å
R-free 0.211
|
|
5FMK
Bcl-xL with Bak BH3 complex
提交 2015-11-06
|
构建体不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 B
63–96(34 aa)
片段:BH3 DOMAIN, UNP RESIDUES 63-96
|
未记录
|
GOL GLYCEROL × 8
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 6.5;0.16M CALCIUM ACETATE, 0.08M SODIUM CACODYLATE, PH6.5, 20% GLYCEROL, 14.4% PEG 8000
|
分辨率 1.73 Å
R-free 0.186
|
|
5VWV
Bak core latch dimer in complex with Bim-BH3 - Cubic
提交 2017-05-23
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
23–186(164 aa)
片段:UNP residues 23-186
|
突变:C166S
|
TFA trifluoroacetic acid × 1
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6
CL CHLORIDE ION × 1
GOL GLYCEROL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;281 K;18 % glycerol, 21.6 % PEG (poly-ethylene glycol) 1500 and 0.5 % ethyl acetate
|
分辨率 1.90 Å
R-free 0.177
|
|
5VWV
Bak core latch dimer in complex with Bim-BH3 - Cubic
提交 2017-05-23
|
构建体不同
突变/修饰不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
23–186(164 aa)
片段:UNP residues 23-186
|
突变:C166S
|
TFA trifluoroacetic acid × 2
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 12
CL CHLORIDE ION × 2
GOL GLYCEROL × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;281 K;18 % glycerol, 21.6 % PEG (poly-ethylene glycol) 1500 and 0.5 % ethyl acetate
|
分辨率 1.90 Å
R-free 0.177
|
|
5VWW
Bak core latch dimer in complex with Bim-RT - Tetragonal
提交 2017-05-23
|
构建体不同
突变/修饰不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
23–186(164 aa)
片段:UNP residues 23-186
链 B
23–186(164 aa)
片段:UNP residues 23-186
|
突变:C166S
突变:C166S
|
MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1
BR BROMIDE ION × 2
IMD IMIDAZOLE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;281 K;12.5 % MPD (2-methyl-2,4-pentanediol), 38 mM imidazole pH 6.5, 12.5 % PEG 1000, 12.5 % PEG 3350, 30 mM sodium fluoride, 30 mM sodium iodide, 62 mM sodium MES pH 6.5 and 30 mM sodium bromide
|
分辨率 2.80 Å
R-free 0.281
|
|
5VWX
Bak core latch dimer in complex with Bim-h0-h3Glt
提交 2017-05-23
|
构建体不同
突变/修饰不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
23–186(164 aa)
片段:UNP residues 23-186
链 C
23–186(164 aa)
片段:UNP residues 23-186
|
未记录
|
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5;281 K;200 mM calcium acetate, 30 % PEG 400 and 100 mM sodium acetate-acetic acid pH 5.0
|
分辨率 2.49 Å
R-free 0.305
|
|
5VWY
Bak core latch dimer in complex with Bim-h3Pc-RT
提交 2017-05-23
|
构建体不同
突变/修饰不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
23–186(164 aa)
片段:UNP residues 23-186
|
突变:C166S
|
PO4 PHOSPHATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;277 K;15.8 % PEG 8000, 50 mM potassium dihydrogen phosphate, and 22.7 % glycerol
|
分辨率 1.55 Å
R-free 0.216
|
|
5VWZ
Bak in complex with Bim-h3Pc
提交 2017-05-23
|
构建体不同
突变/修饰不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
23–186(164 aa)
片段:UNP residues 23-186
链 C
23–186(164 aa)
片段:UNP residues 23-186
|
突变:C166S
突变:C166S
|
1PG 2-(2-{2-[2-(2-METHOXY-ETHOXY)-ETHOXY]-ETHOXY}-ETHOXY)-ETHANOL × 2
NH4 AMMONIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;281 K;10 % PEG 20000, 20 % PEG MME 550, 38 mM Imidazole pH 6.5, 20 mM ammonium acetate, 20 mM potassium sodium tartrate, 20 mM sodium formate, 62 mM sodium MES pH 6.5, 20 mM trisodium citrate, and 20 mM sodium oxamate
|
分辨率 1.62 Å
R-free 0.191
|
|
5VX0
Bak in complex with Bim-h3Glg
提交 2017-05-23
|
构建体不同
突变/修饰不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
23–186(164 aa)
片段:UNP residues 23-186
链 C
23–186(164 aa)
片段:UNP residues 23-186
|
突变:C166S
突变:C166S
|
MG MAGNESIUM ION × 6
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;281 K;200 mM magnesium chloride, 25 % PEG 3350, and 100 mM bis-tris chloride (pH 6.5)
|
分辨率 1.60 Å
R-free 0.200
|
|
5VX1
Bak L100A
提交 2017-05-23
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
23–186(164 aa)
片段:UNP residues 23-186
链 B
23–186(164 aa)
片段:UNP residues 23-186
|
突变:L100A, C166S
突变:L100A, C166S
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;281 K;1M sodium malonate-malonic acid pH 7.0 and 10 % DL-malate-MES-tris pH 9
|
分辨率 1.22 Å
R-free 0.193
|
|
6ODH
BH3 domain swapped dimer of a BAK fragment
提交 2019-03-26
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
71–147(77 aa)
片段:residues 71-147
链 B
71–147(77 aa)
片段:residues 71-147
|
未记录
|
SO4 SULFATE ION × 2
EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;277 K;12% PEG 3350 and 100 mM ammonium sulfate
|
分辨率 2.30 Å
R-free 0.271
|
|
6ODH
BH3 domain swapped dimer of a BAK fragment
提交 2019-03-26
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 C
71–147(77 aa)
片段:residues 71-147
链 D
71–147(77 aa)
片段:residues 71-147
|
未记录
|
EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;277 K;12% PEG 3350 and 100 mM ammonium sulfate
|
分辨率 2.30 Å
R-free 0.271
|
|
6ODH
BH3 domain swapped dimer of a BAK fragment
提交 2019-03-26
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 E
71–147(77 aa)
片段:residues 71-147
链 F
71–147(77 aa)
片段:residues 71-147
|
未记录
|
EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 2
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;277 K;12% PEG 3350 and 100 mM ammonium sulfate
|
分辨率 2.30 Å
R-free 0.271
|
|
6UXM
Crystal structure of BAK core domain BH3-groove-dimer in complex with E. coli lipid
提交 2019-11-07
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
68–148(81 aa)
片段:Core/dimerisation domain, residues 68-148
链 B
68–148(81 aa)
片段:Core/dimerisation domain, residues 68-148
|
未记录
|
PEE 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;293 K;ammonium sulphate, PEG 10000, sodium acetate, bis-tris chloride
|
分辨率 2.49 Å
R-free 0.237
|
|
6UXM
Crystal structure of BAK core domain BH3-groove-dimer in complex with E. coli lipid
提交 2019-11-07
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 C
68–148(81 aa)
片段:Core/dimerisation domain, residues 68-148
链 D
68–148(81 aa)
片段:Core/dimerisation domain, residues 68-148
|
未记录
|
PEE 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;293 K;ammonium sulphate, PEG 10000, sodium acetate, bis-tris chloride
|
分辨率 2.49 Å
R-free 0.237
|
|
6UXM
Crystal structure of BAK core domain BH3-groove-dimer in complex with E. coli lipid
提交 2019-11-07
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 E
68–148(81 aa)
片段:Core/dimerisation domain, residues 68-148
链 F
68–148(81 aa)
片段:Core/dimerisation domain, residues 68-148
|
未记录
|
PEE 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;293 K;ammonium sulphate, PEG 10000, sodium acetate, bis-tris chloride
|
分辨率 2.49 Å
R-free 0.237
|
|
6UXN
Crystal structure of BAK core domain BH3-groove-dimer in complex with phosphatidylserine
提交 2019-11-07
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
68–148(81 aa)
链 B
68–148(81 aa)
|
未记录
|
8SP O-[(R)-{[(2R)-2,3-bis(octanoyloxy)propyl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]-L-serine × 4
SO4 SULFATE ION × 3
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;ammonium sulphate
|
分辨率 2.49 Å
R-free 0.253
|
|
6UXN
Crystal structure of BAK core domain BH3-groove-dimer in complex with phosphatidylserine
提交 2019-11-07
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 C
68–148(81 aa)
链 D
68–148(81 aa)
|
未记录
|
8SP O-[(R)-{[(2R)-2,3-bis(octanoyloxy)propyl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]-L-serine × 2
SO4 SULFATE ION × 2
GOL GLYCEROL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;ammonium sulphate
|
分辨率 2.49 Å
R-free 0.253
|
|
6UXN
Crystal structure of BAK core domain BH3-groove-dimer in complex with phosphatidylserine
提交 2019-11-07
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 E
68–148(81 aa)
链 F
68–148(81 aa)
|
未记录
|
8SP O-[(R)-{[(2R)-2,3-bis(octanoyloxy)propyl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]-L-serine × 3
SO4 SULFATE ION × 4
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;ammonium sulphate
|
分辨率 2.49 Å
R-free 0.253
|
|
6UXN
Crystal structure of BAK core domain BH3-groove-dimer in complex with phosphatidylserine
提交 2019-11-07
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 4
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 G
68–148(81 aa)
链 H
68–148(81 aa)
|
未记录
|
8SP O-[(R)-{[(2R)-2,3-bis(octanoyloxy)propyl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]-L-serine × 3
SO4 SULFATE ION × 4
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;ammonium sulphate
|
分辨率 2.49 Å
R-free 0.253
|
|
6UXN
Crystal structure of BAK core domain BH3-groove-dimer in complex with phosphatidylserine
提交 2019-11-07
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 5
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 I
68–148(81 aa)
链 J
68–148(81 aa)
|
未记录
|
8SP O-[(R)-{[(2R)-2,3-bis(octanoyloxy)propyl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]-L-serine × 3
SO4 SULFATE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;ammonium sulphate
|
分辨率 2.49 Å
R-free 0.253
|
|
6UXN
Crystal structure of BAK core domain BH3-groove-dimer in complex with phosphatidylserine
提交 2019-11-07
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 6
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 K
68–148(81 aa)
链 L
68–148(81 aa)
|
未记录
|
8SP O-[(R)-{[(2R)-2,3-bis(octanoyloxy)propyl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]-L-serine × 3
SO4 SULFATE ION × 5
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;ammonium sulphate
|
分辨率 2.49 Å
R-free 0.253
|
|
6UXO
Crystal structure of BAK core domain BH3-groove-dimer in complex with DDM
提交 2019-11-07
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
68–148(81 aa)
片段:Core/dimerisation domain, residues 68-148
链 B
68–148(81 aa)
片段:Core/dimerisation domain, residues 68-148
|
未记录
|
LMT DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 3
SO4 SULFATE ION × 6
ACT ACETATE ION × 1
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 4.6;293 K;ammonium sulfate, n-Dodecyl-b-D-maltoside, sodium acetate
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.250
|
|
6UXO
Crystal structure of BAK core domain BH3-groove-dimer in complex with DDM
提交 2019-11-07
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 C
68–148(81 aa)
片段:Core/dimerisation domain, residues 68-148
链 D
68–148(81 aa)
片段:Core/dimerisation domain, residues 68-148
|
未记录
|
LMT DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 4
SO4 SULFATE ION × 7
ACT ACETATE ION × 1
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 4.6;293 K;ammonium sulfate, n-Dodecyl-b-D-maltoside, sodium acetate
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.250
|
|
6UXO
Crystal structure of BAK core domain BH3-groove-dimer in complex with DDM
提交 2019-11-07
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 E
68–148(81 aa)
片段:Core/dimerisation domain, residues 68-148
链 F
68–148(81 aa)
片段:Core/dimerisation domain, residues 68-148
|
未记录
|
LMT DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 5
SO4 SULFATE ION × 5
ACT ACETATE ION × 1
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 4.6;293 K;ammonium sulfate, n-Dodecyl-b-D-maltoside, sodium acetate
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.250
|
|
6UXO
Crystal structure of BAK core domain BH3-groove-dimer in complex with DDM
提交 2019-11-07
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 4
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 G
68–148(81 aa)
片段:Core/dimerisation domain, residues 68-148
链 H
68–148(81 aa)
片段:Core/dimerisation domain, residues 68-148
|
未记录
|
LMT DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 4
SO4 SULFATE ION × 7
ACT ACETATE ION × 1
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 4.6;293 K;ammonium sulfate, n-Dodecyl-b-D-maltoside, sodium acetate
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.250
|
|
6UXO
Crystal structure of BAK core domain BH3-groove-dimer in complex with DDM
提交 2019-11-07
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 5
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 I
68–148(81 aa)
片段:Core/dimerisation domain, residues 68-148
链 J
68–148(81 aa)
片段:Core/dimerisation domain, residues 68-148
|
未记录
|
LMT DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 5
SO4 SULFATE ION × 6
ACT ACETATE ION × 1
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 4.6;293 K;ammonium sulfate, n-Dodecyl-b-D-maltoside, sodium acetate
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.250
|
|
6UXO
Crystal structure of BAK core domain BH3-groove-dimer in complex with DDM
提交 2019-11-07
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 6
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 K
68–148(81 aa)
片段:Core/dimerisation domain, residues 68-148
链 L
68–148(81 aa)
片段:Core/dimerisation domain, residues 68-148
|
未记录
|
LMT DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 3
SO4 SULFATE ION × 4
ACT ACETATE ION × 1
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 4.6;293 K;ammonium sulfate, n-Dodecyl-b-D-maltoside, sodium acetate
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.250
|
|
6UXP
Crystal structure of BAK core domain BH3-groove-dimer in complex with phosphatidylglycerol
提交 2019-11-07
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
68–148(81 aa)
片段:Core/dimerisation domain, residues 68-148
链 B
68–148(81 aa)
片段:Core/dimerisation domain, residues 68-148
|
未记录
|
PG8 1,2-DIOCTANOYL-SN-GLYCERO-3-[PHOSPHO-RAC-(1-GLYCEROL) × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;293 K;magnesium chloride, PEG 4000, tris-chloride
|
分辨率 2.49 Å
R-free 0.247
|
|
6UXP
Crystal structure of BAK core domain BH3-groove-dimer in complex with phosphatidylglycerol
提交 2019-11-07
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 C
68–148(81 aa)
片段:Core/dimerisation domain, residues 68-148
链 D
68–148(81 aa)
片段:Core/dimerisation domain, residues 68-148
|
未记录
|
PG8 1,2-DIOCTANOYL-SN-GLYCERO-3-[PHOSPHO-RAC-(1-GLYCEROL) × 3
GOL GLYCEROL × 4
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;293 K;magnesium chloride, PEG 4000, tris-chloride
|
分辨率 2.49 Å
R-free 0.247
|
|
6UXP
Crystal structure of BAK core domain BH3-groove-dimer in complex with phosphatidylglycerol
提交 2019-11-07
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 E
68–148(81 aa)
片段:Core/dimerisation domain, residues 68-148
链 F
68–148(81 aa)
片段:Core/dimerisation domain, residues 68-148
|
未记录
|
PG8 1,2-DIOCTANOYL-SN-GLYCERO-3-[PHOSPHO-RAC-(1-GLYCEROL) × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;293 K;magnesium chloride, PEG 4000, tris-chloride
|
分辨率 2.49 Å
R-free 0.247
|
|
6UXP
Crystal structure of BAK core domain BH3-groove-dimer in complex with phosphatidylglycerol
提交 2019-11-07
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 4
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 G
68–148(81 aa)
片段:Core/dimerisation domain, residues 68-148
链 H
68–148(81 aa)
片段:Core/dimerisation domain, residues 68-148
|
未记录
|
PG8 1,2-DIOCTANOYL-SN-GLYCERO-3-[PHOSPHO-RAC-(1-GLYCEROL) × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;293 K;magnesium chloride, PEG 4000, tris-chloride
|
分辨率 2.49 Å
R-free 0.247
|
|
6UXQ
Crystal structure of BAK core domain BH3-groove-dimer in complex with POPC and C8E4
提交 2019-11-07
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
68–148(81 aa)
片段:Core/dimerisation domain, residues 68-148
链 B
68–148(81 aa)
片段:Core/dimerisation domain, residues 68-148
|
未记录
|
SO4 SULFATE ION × 3
C8E (HYDROXYETHYLOXY)TRI(ETHYLOXY)OCTANE × 6
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3
LBN 1-palmitoyl-2-oleoyl-sn-glycero-3-phosphocholine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;293 K;ammonium sulphate, trisodium citrate, tetraethylene glycol monooctyl ether, 1-palmitoyl-2-oleoyl-glycero-3-phosphocholine
|
分辨率 1.70 Å
R-free 0.214
|
|
6UXQ
Crystal structure of BAK core domain BH3-groove-dimer in complex with POPC and C8E4
提交 2019-11-07
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 C
68–148(81 aa)
片段:Core/dimerisation domain, residues 68-148
链 D
68–148(81 aa)
片段:Core/dimerisation domain, residues 68-148
|
未记录
|
SO4 SULFATE ION × 1
C8E (HYDROXYETHYLOXY)TRI(ETHYLOXY)OCTANE × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;293 K;ammonium sulphate, trisodium citrate, tetraethylene glycol monooctyl ether, 1-palmitoyl-2-oleoyl-glycero-3-phosphocholine
|
分辨率 1.70 Å
R-free 0.214
|
|
6UXR
Crystal structure of BAK core domain BH3-groove-dimer in complex with LysoPC
提交 2019-11-07
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
68–148(81 aa)
片段:Core/dimerisation domain, residues 68-148
链 B
68–148(81 aa)
片段:Core/dimerisation domain, residues 68-148
|
未记录
|
K6G [(2~{R})-2-oxidanyl-3-[oxidanyl-[2-(trimethyl-$l^{4}-azanyl)ethoxy]phosphoryl]oxy-propyl] hexadecanoate × 2
PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1
PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 4
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;calcium chloride, PEG 3350, sodium acetate, sodium HEPES
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.232
|
|
7K02
The crystal structure of a BAK dimer activated by detergent
提交 2020-09-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
67–186(120 aa)
链 B
67–186(120 aa)
|
突变:C166S
突变:C166S
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 7;291 K;50% (v/v) methane pentane diol (MPD) and 0.1 M imidazole pH 7.0
|
分辨率 3.40 Å
R-free 0.343
|
|
7K02
The crystal structure of a BAK dimer activated by detergent
提交 2020-09-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 C
67–186(120 aa)
链 D
67–186(120 aa)
|
突变:C166S
突变:C166S
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 7;291 K;50% (v/v) methane pentane diol (MPD) and 0.1 M imidazole pH 7.0
|
分辨率 3.40 Å
R-free 0.343
|
|
7K02
The crystal structure of a BAK dimer activated by detergent
提交 2020-09-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 E
67–186(120 aa)
链 F
67–186(120 aa)
|
突变:C166S
突变:C166S
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 7;291 K;50% (v/v) methane pentane diol (MPD) and 0.1 M imidazole pH 7.0
|
分辨率 3.40 Å
R-free 0.343
|
|
7LK4
Crystal structure of BAK L100A in complex with activating antibody fragments
提交 2021-02-01
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 P
23–186(164 aa)
链 R
23–186(164 aa)
|
突变:L100A, C166S
突变:L100A, C166S
|
MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 3
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;281 K;38.9 % 2-methyl-2,4-pentanediol,
0.1 M Sodium cacodylate pH 6.44,
4 % Polyethylene glycol 8000
|
分辨率 3.10 Å
R-free 0.262
|
|
7LK4
Crystal structure of BAK L100A in complex with activating antibody fragments
提交 2021-02-01
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 Q
23–186(164 aa)
链 S
23–186(164 aa)
|
突变:L100A, C166S
突变:L100A, C166S
|
MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 4
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;281 K;38.9 % 2-methyl-2,4-pentanediol,
0.1 M Sodium cacodylate pH 6.44,
4 % Polyethylene glycol 8000
|
分辨率 3.10 Å
R-free 0.262
|
|
7M5A
Crystal Structure of human BAK in complex with W3W5_BID
提交 2021-03-23
|
构建体不同
聚集状态不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
21–186(166 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION;293 K;0.2 M Potassium Sodium tartrate, 20% PEG 3350
|
分辨率 1.50 Å
R-free 0.219
|
|
7M5B
Crystal Structure of human BAK in complex with M3W5_BID
提交 2021-03-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
21–186(166 aa)
|
未记录
|
CU COPPER (II) ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION;pH 6.5;293 K;15% PEG 4000 0.2 M NaCl 0.1 MES 6.5
|
分辨率 1.85 Å
R-free 0.205
|
|
7M5B
Crystal Structure of human BAK in complex with M3W5_BID
提交 2021-03-23
|
构建体不同
聚集状态不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 C
21–186(166 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION;pH 6.5;293 K;15% PEG 4000 0.2 M NaCl 0.1 MES 6.5
|
分辨率 1.85 Å
R-free 0.205
|
|
7M5C
Crystal Structure of human BAK in complex with WT BAK BH3 peptide
提交 2021-03-23
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
21–186(166 aa)
链 B
68–89(22 aa)
|
未记录
|
CU COPPER (II) ION × 1
SO4 SULFATE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION;pH 6.5;293 K;0.1 M MES (pH 6.5), 0.5 M Ammonium Sulfate
|
分辨率 3.06 Å
R-free 0.249
|
|
7M5C
Crystal Structure of human BAK in complex with WT BAK BH3 peptide
提交 2021-03-23
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 10
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 S
21–186(166 aa)
链 T
68–89(22 aa)
|
未记录
|
CU COPPER (II) ION × 1
SO4 SULFATE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION;pH 6.5;293 K;0.1 M MES (pH 6.5), 0.5 M Ammonium Sulfate
|
分辨率 3.06 Å
R-free 0.249
|
|
7M5C
Crystal Structure of human BAK in complex with WT BAK BH3 peptide
提交 2021-03-23
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 C
21–186(166 aa)
链 D
68–89(22 aa)
|
未记录
|
CU COPPER (II) ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION;pH 6.5;293 K;0.1 M MES (pH 6.5), 0.5 M Ammonium Sulfate
|
分辨率 3.06 Å
R-free 0.249
|
|
7M5C
Crystal Structure of human BAK in complex with WT BAK BH3 peptide
提交 2021-03-23
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 E
21–186(166 aa)
链 F
68–89(22 aa)
|
未记录
|
CU COPPER (II) ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION;pH 6.5;293 K;0.1 M MES (pH 6.5), 0.5 M Ammonium Sulfate
|
分辨率 3.06 Å
R-free 0.249
|
|
7M5C
Crystal Structure of human BAK in complex with WT BAK BH3 peptide
提交 2021-03-23
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 4
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 G
21–186(166 aa)
链 H
68–89(22 aa)
|
未记录
|
CU COPPER (II) ION × 1
SO4 SULFATE ION × 3
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION;pH 6.5;293 K;0.1 M MES (pH 6.5), 0.5 M Ammonium Sulfate
|
分辨率 3.06 Å
R-free 0.249
|
|
7M5C
Crystal Structure of human BAK in complex with WT BAK BH3 peptide
提交 2021-03-23
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 5
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 I
21–186(166 aa)
链 J
68–89(22 aa)
|
未记录
|
CU COPPER (II) ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION;pH 6.5;293 K;0.1 M MES (pH 6.5), 0.5 M Ammonium Sulfate
|
分辨率 3.06 Å
R-free 0.249
|
|
7M5C
Crystal Structure of human BAK in complex with WT BAK BH3 peptide
提交 2021-03-23
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 6
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 K
21–186(166 aa)
链 L
68–89(22 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION;pH 6.5;293 K;0.1 M MES (pH 6.5), 0.5 M Ammonium Sulfate
|
分辨率 3.06 Å
R-free 0.249
|
|
7M5C
Crystal Structure of human BAK in complex with WT BAK BH3 peptide
提交 2021-03-23
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 7
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 M
21–186(166 aa)
链 N
68–89(22 aa)
|
未记录
|
CU COPPER (II) ION × 1
SO4 SULFATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION;pH 6.5;293 K;0.1 M MES (pH 6.5), 0.5 M Ammonium Sulfate
|
分辨率 3.06 Å
R-free 0.249
|
|
7M5C
Crystal Structure of human BAK in complex with WT BAK BH3 peptide
提交 2021-03-23
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 8
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 O
21–186(166 aa)
链 P
68–89(22 aa)
|
未记录
|
CU COPPER (II) ION × 1
SO4 SULFATE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION;pH 6.5;293 K;0.1 M MES (pH 6.5), 0.5 M Ammonium Sulfate
|
分辨率 3.06 Å
R-free 0.249
|
|
7M5C
Crystal Structure of human BAK in complex with WT BAK BH3 peptide
提交 2021-03-23
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 9
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 Q
21–186(166 aa)
链 R
68–89(22 aa)
|
未记录
|
CU COPPER (II) ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION;pH 6.5;293 K;0.1 M MES (pH 6.5), 0.5 M Ammonium Sulfate
|
分辨率 3.06 Å
R-free 0.249
|
|
7OFM
NMR structure of the Bak transmembrane helix in DPC micelles
提交 2021-05-05
|
构建体不同
聚集状态不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
183–211(29 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 7;310 K;离子强度(mmCIF原始值)100;压力 1
NMR样品组成
400 uM [U-13C; U-15N; U-2H] Bak-TMH, 20 mM sodium phosphate, 50 mM sodium chloride, 0.5 mM EDTA, 5 mM DTT, 300 mM DPC, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
|
分辨率未提供
|
|
7OFO
NMR structure of the Bak transmembrane helix in lipid nanodiscs
提交 2021-05-05
|
构建体不同
聚集状态不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
183–211(29 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 7;315 K;离子强度(mmCIF原始值)100;压力 1
NMR样品组成
400 uM [U-13C; U-15N; U-2H] Bak transmembrane helix, 20 mM sodium phosphate, 50 mM sodium chloride, 1 mM EDTA, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
|
分辨率未提供
|
|
8CZF
Human BAK in complex with the dF2 peptide
提交 2022-05-24
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
23–186(164 aa)
|
突变:C166S
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;1.2 M sodium malonate
|
分辨率 1.30 Å
R-free 0.180
|
|
8CZG
Human BAK in complex with the dF3 peptide
提交 2022-05-24
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
23–186(164 aa)
|
突变:C166S
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;PEG 3350 (20% w/v), 0.2 M calcium acetate
|
分辨率 1.99 Å
R-free 0.267
|
|
8CZG
Human BAK in complex with the dF3 peptide
提交 2022-05-24
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
23–186(164 aa)
|
突变:C166S
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;PEG 3350 (20% w/v), 0.2 M calcium acetate
|
分辨率 1.99 Å
R-free 0.267
|
|
8CZG
Human BAK in complex with the dF3 peptide
提交 2022-05-24
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 C
23–186(164 aa)
|
突变:C166S
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;PEG 3350 (20% w/v), 0.2 M calcium acetate
|
分辨率 1.99 Å
R-free 0.267
|
|
8CZG
Human BAK in complex with the dF3 peptide
提交 2022-05-24
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 4
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 D
23–186(164 aa)
|
突变:C166S
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;PEG 3350 (20% w/v), 0.2 M calcium acetate
|
分辨率 1.99 Å
R-free 0.267
|
|
8CZH
Human BAK in complex with the dM2 peptide
提交 2022-05-24
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
23–186(164 aa)
|
突变:C166S
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;298 K;3.5 M sodium formate
|
分辨率 1.30 Å
R-free 0.201
|
|
8GSV
Crystal structure of human BAK in complex with the Pxt1 BH3 domain
提交 2022-09-07
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 24
PDB 声明:24-meric
|
链 A
23–185(163 aa)
链 C
23–185(163 aa)
链 E
23–185(163 aa)
链 G
23–185(163 aa)
链 I
23–185(163 aa)
链 K
23–185(163 aa)
链 M
23–185(163 aa)
链 O
23–185(163 aa)
链 Q
23–185(163 aa)
链 S
23–185(163 aa)
链 U
23–185(163 aa)
链 W
23–185(163 aa)
|
突变:C166S
突变:C166S
突变:C166S
突变:C166S
突变:C166S
突变:C166S
突变:C166S
突变:C166S
突变:C166S
突变:C166S
突变:C166S
突变:C166S
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;291 K;0.1 M Sodium citrate(pH 4.8) and 17 % PEG 3000
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.266
|
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8IGC
Crystal structure of Bak bound to Bnip5 BH3
提交 2023-02-20
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
23–183(161 aa)
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突变:C166S
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;291 K;0.7 M sodium citrate tribasic dehydrate and 0.1 M Tris-HCl (pH 8.5)
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分辨率 1.70 Å
R-free 0.226
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8IVB
K113-Ubiquitinated BAK
提交 2023-03-26
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 B
18–186(169 aa)
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突变:K113C
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未记录非水小分子
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SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.8;310 K;离子强度(mmCIF原始值)100;压力 1
NMR样品组成
20 mM sodium phosphate, 0.1 M sodium chloride, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
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分辨率未提供
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8SRX
Crystal structure of BAK-BAX heterodimer with lysoPC
提交 2023-05-07
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构建体不同
突变/修饰不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
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链 A
68–146(79 aa)
链 C
68–146(79 aa)
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未记录
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K6G [(2~{R})-2-oxidanyl-3-[oxidanyl-[2-(trimethyl-$l^{4}-azanyl)ethoxy]phosphoryl]oxy-propyl] hexadecanoate × 3
ZN ZINC ION × 1
NA SODIUM ION × 2
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2
CL CHLORIDE ION × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;281 K;0.1 M Bis-tris chloride pH 5.5, 25% PEG 3350, 200 mM sodium acetate
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分辨率 2.09 Å
R-free 0.265
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8SRY
Crystal structure of BAK-BAX heterodimer with C12E8
提交 2023-05-08
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构建体不同
突变/修饰不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
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链 A
68–146(79 aa)
链 C
68–146(79 aa)
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未记录
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PG0 2-(2-METHOXYETHOXY)ETHANOL × 1
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2
N8E 3,6,9,12,15-PENTAOXATRICOSAN-1-OL × 1
P33 3,6,9,12,15,18-HEXAOXAICOSANE-1,20-DIOL × 1
PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;281 K;30% PEG MME 2000, 0.1 M potassium thiocyanate, 0.01% C12E8
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分辨率 2.40 Å
R-free 0.248
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8UKY
Crystal structure of BAK in complex with inhibiting antibody 14G6
提交 2023-10-15
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
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链 C
23–186(164 aa)
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未记录
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SO4 SULFATE ION × 1
CCN ACETONITRILE × 3
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3
144 TRIS-HYDROXYMETHYL-METHYL-AMMONIUM × 1
PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.09 M Bis-Tris chloride, pH 5.5, 22.5% PEG3350, 4% acetonitrile
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分辨率 2.40 Å
R-free 0.252
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8UKY
Crystal structure of BAK in complex with inhibiting antibody 14G6
提交 2023-10-15
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
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链 D
23–186(164 aa)
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未记录
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SO4 SULFATE ION × 2
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 5
144 TRIS-HYDROXYMETHYL-METHYL-AMMONIUM × 1
PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2
1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.09 M Bis-Tris chloride, pH 5.5, 22.5% PEG3350, 4% acetonitrile
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分辨率 2.40 Å
R-free 0.252
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8Y1Y
Crystal structure of the Mcl-1 in complex with a long BH3 peptide of BAK
提交 2024-01-25
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 B
72–92(21 aa)
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未记录
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ZN ZINC ION × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291 K;0.01M Nickel (II) Chloride, 0.1M Tris-HCl pH 8.5, 20% polyethylene glycol monomethyl ether 2000
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分辨率 2.01 Å
R-free 0.252
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8Y1Z
Crystal structure of the Mcl-1 in complex with a Short BH3 peptide of BAK
提交 2024-01-25
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构建体不同
聚集状态不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 B
72–87(16 aa)
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未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291 K;0.2M Lithium Acetate, 18-25% polyethylene glycol 3350
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分辨率 1.91 Å
R-free 0.235
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9CLB
Crystal structure of Bak bound to the inhibitory aBAK
提交 2024-07-10
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
86–186(101 aa)
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突变:C166S
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 6.5;293 K;0.1 M 2-(N-Morpholino)ethanesulfonic acid (MES) pH 6.5, 0.2 M L-Proline and 10% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 3350
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分辨率 2.86 Å
R-free 0.270
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9CLB
Crystal structure of Bak bound to the inhibitory aBAK
提交 2024-07-10
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 C
86–186(101 aa)
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突变:C166S
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 6.5;293 K;0.1 M 2-(N-Morpholino)ethanesulfonic acid (MES) pH 6.5, 0.2 M L-Proline and 10% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 3350
|
分辨率 2.86 Å
R-free 0.270
|
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9CLB
Crystal structure of Bak bound to the inhibitory aBAK
提交 2024-07-10
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 3
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 E
86–186(101 aa)
|
突变:C166S
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 6.5;293 K;0.1 M 2-(N-Morpholino)ethanesulfonic acid (MES) pH 6.5, 0.2 M L-Proline and 10% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 3350
|
分辨率 2.86 Å
R-free 0.270
|
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9CLB
Crystal structure of Bak bound to the inhibitory aBAK
提交 2024-07-10
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 4
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 G
86–186(101 aa)
|
突变:C166S
|
未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 6.5;293 K;0.1 M 2-(N-Morpholino)ethanesulfonic acid (MES) pH 6.5, 0.2 M L-Proline and 10% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 3350
|
分辨率 2.86 Å
R-free 0.270
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9CPE
Structural basis of BAK sequestration by MCL-1 and consequences for apoptosis initiation
提交 2024-07-18
|
构建体不同
聚集状态不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 A
20–186(167 aa)
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未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;295 K;15-25% PEG 3350, 0.1 M sodium acetate, 0.1M HEPES pH 7.5
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分辨率 1.49 Å
R-free 0.212
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9CPF
Structural basis of BAK sequestration by MCL-1 and consequences for apoptosis initiation
提交 2024-07-18
|
构建体不同
聚集状态不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
其他组合
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 E
68–89(22 aa)
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未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;295 K;15-25% PEG 4000, 0.2 M lithium sulfate, 0.1 M TRIS pH 8.5
|
分辨率 1.70 Å
R-free 0.224
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9CPF
Structural basis of BAK sequestration by MCL-1 and consequences for apoptosis initiation
提交 2024-07-18
|
构建体不同
聚集状态不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 2
其他组合
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 F
68–89(22 aa)
|
未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;295 K;15-25% PEG 4000, 0.2 M lithium sulfate, 0.1 M TRIS pH 8.5
|
分辨率 1.70 Å
R-free 0.224
|
|
9CPF
Structural basis of BAK sequestration by MCL-1 and consequences for apoptosis initiation
提交 2024-07-18
|
构建体不同
聚集状态不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 3
其他组合
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 G
68–89(22 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;295 K;15-25% PEG 4000, 0.2 M lithium sulfate, 0.1 M TRIS pH 8.5
|
分辨率 1.70 Å
R-free 0.224
|
|
9CPF
Structural basis of BAK sequestration by MCL-1 and consequences for apoptosis initiation
提交 2024-07-18
|
构建体不同
聚集状态不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 4
其他组合
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 H
68–89(22 aa)
|
未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;295 K;15-25% PEG 4000, 0.2 M lithium sulfate, 0.1 M TRIS pH 8.5
|
分辨率 1.70 Å
R-free 0.224
|
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9CPH
Structural basis of BAK sequestration by MCL-1 and consequences for apoptosis initiation
提交 2024-07-18
|
构建体不同
聚集状态不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
其他组合
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
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链 B
69–89(21 aa)
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未记录
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未记录非水小分子
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.34 Å
|
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9CPN
Structural basis of BAK sequestration by MCL-1 and consequences for apoptosis initiation
提交 2024-07-18
|
构建体不同
聚集状态不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
其他组合
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 E
68–89(22 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;295 K;15-25% PEG 4000, 0.2 M lithium sulfate, 0.1 M TRIS pH 8.5
|
分辨率 1.89 Å
R-free 0.243
|
|
9CPN
Structural basis of BAK sequestration by MCL-1 and consequences for apoptosis initiation
提交 2024-07-18
|
构建体不同
聚集状态不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
其他组合
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 F
68–89(22 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;295 K;15-25% PEG 4000, 0.2 M lithium sulfate, 0.1 M TRIS pH 8.5
|
分辨率 1.89 Å
R-free 0.243
|
|
9CPN
Structural basis of BAK sequestration by MCL-1 and consequences for apoptosis initiation
提交 2024-07-18
|
构建体不同
聚集状态不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
其他组合
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 G
68–89(22 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;295 K;15-25% PEG 4000, 0.2 M lithium sulfate, 0.1 M TRIS pH 8.5
|
分辨率 1.89 Å
R-free 0.243
|
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9CPN
Structural basis of BAK sequestration by MCL-1 and consequences for apoptosis initiation
提交 2024-07-18
|
构建体不同
聚集状态不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 4
其他组合
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 H
68–89(22 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;295 K;15-25% PEG 4000, 0.2 M lithium sulfate, 0.1 M TRIS pH 8.5
|
分辨率 1.89 Å
R-free 0.243
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