Homo sapiens
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 2 | Protein Nef × 1 （P03406） water × 2 | 与蛋白数一致 |
| 2 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 2 | Protein Nef × 1 （P03406） GLYCEROL × 1 water × 2 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | FYN_HUMAN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–58； UniProt 84–141 作者链 C； PDB构建体 1–58； UniProt 84–141 |
Human immunodeficiency virus type 1
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 2 | Tyrosine-protein kinase Fyn × 1 （P06241） water × 2 | 与蛋白数一致 |
| 2 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 2 | Tyrosine-protein kinase Fyn × 1 （P06241） GLYCEROL × 1 water × 2 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | NEF_HV1BR |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 2 |
| 链与序列区间 | 作者链 B； PDB构建体 3–149； UniProt 58–204 作者链 D； PDB构建体 3–149； UniProt 58–204 |
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| 条目编号 entry_id | 4d8d |
| 沉积日期 deposition_date | 2012-01-10 |
| 结构标题 title | Crystal structure of HIV-1 NEF Fyn-SH3 R96W variant |
| 关键词 keywords | signaling molecules, TRANSFERASE-PROTEIN BINDING complex; TRANSFERASE/PROTEIN BINDING |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 18.40 Å |
| Rg（电子密度） | 17.87 Å |
| 总 Rg | 18.92 Å |
| 原子数 | 1362 |
| 残基数 | 163 |
| 排除体积 | 24171 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d4d8da_ |
| 类 Class class | b — All beta proteins |
| 折叠类型 Fold fold | b.34 — SH3-like barrel |
| 超家族 Superfamily superfamily | b.34.2 — SH3-domain |
| 家族 Family family | b.34.2.1 — SH3-domain |
| 结构域编号 domain_id | d4d8db_ |
| 类 Class class | d — Alpha and beta proteins (a+b) |
| 折叠类型 Fold fold | d.102 — Regulatory factor Nef |
| 超家族 Superfamily superfamily | d.102.1 — Regulatory factor Nef |
| 家族 Family family | d.102.1.1 — Regulatory factor Nef |
| 结构域编号 domain_id | d4d8dc_ |
| 类 Class class | b — All beta proteins |
| 折叠类型 Fold fold | b.34 — SH3-like barrel |
| 超家族 Superfamily superfamily | b.34.2 — SH3-domain |
| 家族 Family family | b.34.2.1 — SH3-domain |
| 结构域编号 domain_id | d4d8dd_ |
| 类 Class class | d — Alpha and beta proteins (a+b) |
| 折叠类型 Fold fold | d.102 — Regulatory factor Nef |
| 超家族 Superfamily superfamily | d.102.1 — Regulatory factor Nef |
| 家族 Family family | d.102.1.1 — Regulatory factor Nef |
| 结构域编号 domain_id | 4d8dA00 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — Roll |
| 拓扑 Topology topology | 30 — SH3 type barrels. |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 40 — SH3 Domains |
| 结构域编号 domain_id | 4d8dB00 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — 2-Layer Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 62 — Nef Regulatory Factor |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Nef Regulatory Factor |
| 结构域编号 domain_id | 4d8dC00 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — Roll |
| 拓扑 Topology topology | 30 — SH3 type barrels. |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 40 — SH3 Domains |
| 结构域编号 domain_id | 4d8dD00 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — 2-Layer Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 62 — Nef Regulatory Factor |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Nef Regulatory Factor |