Mus musculus
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 3 | Protein Nef × 1 （Q90VU7） MHC-I × 1 water × 3 | 与蛋白数一致 |
| 2 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 3 | Protein Nef × 1 （Q90VU7） MHC-I × 1 water × 3 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | AP1M1_MOUSE |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–266； UniProt 158–423 作者链 M； PDB构建体 1–266； UniProt 158–423 |
Human immunodeficiency virus 1
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 3 | AP-1 complex subunit mu-1 × 1 （P35585） MHC-I × 1 water × 3 | 与蛋白数一致 |
| 2 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 3 | AP-1 complex subunit mu-1 × 1 （P35585） MHC-I × 1 water × 3 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | Q90VU7_9HIV1 |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 2 |
| 链与序列区间 | 作者链 B； PDB构建体 1–206； UniProt 1–206 作者链 C； PDB构建体 1–206； UniProt 1–206 |
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| 条目编号 entry_id | 4en2 |
| 沉积日期 deposition_date | 2012-04-12 |
| 结构标题 title | HIV-1 Nef in complex with MHC-I cytoplasmic domain and Mu1 adaptin subunit of AP1 adaptor (second domain) |
| 关键词 keywords | ;Human immunodeficiency virus 1, HIV, Nef, MHC-I, antigen presentation, host defense, Adaptor protein complex 1, Mu1 adaptin subunit, sorting motif recognition, CLASP, membrane trafficking, viral hijacking, VIRAL PROTEIN-IMMUNE SYSTEM complex ;; VIRAL PROTEIN/IMMUNE SYSTEM |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 26.57 Å |
| Rg（电子密度） | 25.95 Å |
| 总 Rg | 26.62 Å |
| 原子数 | 3289 |
| 残基数 | 401 |
| 排除体积 | 58626 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d4en2a_ |
| 类 Class class | b — All beta proteins |
| 折叠类型 Fold fold | b.2 — Common fold of diphtheria toxin/transcription factors/cytochrome f |
| 超家族 Superfamily superfamily | b.2.7 — Second domain of Mu2 adaptin subunit (ap50) of ap2 adaptor |
| 家族 Family family | b.2.7.0 — automated matches |
| 结构域编号 domain_id | d4en2m_ |
| 类 Class class | b — All beta proteins |
| 折叠类型 Fold fold | b.2 — Common fold of diphtheria toxin/transcription factors/cytochrome f |
| 超家族 Superfamily superfamily | b.2.7 — Second domain of Mu2 adaptin subunit (ap50) of ap2 adaptor |
| 家族 Family family | b.2.7.0 — automated matches |
| 结构域编号 domain_id | 4en2A01 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 60 — Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 40 — Immunoglobulin-like |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 1170 — Mu homology domain, subdomain B |
| 结构域编号 domain_id | 4en2A02 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 60 — Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 40 — Immunoglobulin-like |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 1170 — Mu homology domain, subdomain B |
| 结构域编号 domain_id | 4en2B00 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — 2-Layer Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 62 — Nef Regulatory Factor |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Nef Regulatory Factor |
| 结构域编号 domain_id | 4en2C00 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — 2-Layer Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 62 — Nef Regulatory Factor |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Nef Regulatory Factor |
| 结构域编号 domain_id | 4en2M01 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 60 — Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 40 — Immunoglobulin-like |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 1170 — Mu homology domain, subdomain B |
| 结构域编号 domain_id | 4en2M02 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 60 — Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 40 — Immunoglobulin-like |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 1170 — Mu homology domain, subdomain B |