4g5o

Structure of LGN GL4/Galphai3(Q147L) complex

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 149.2 Å Quality: GOOD

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Guanine nucleotide-binding protein G(k) subunit alpha

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 25–354	片段：UNP RESIDUES 25-354 突变：Q147L	G-protein-signaling modulator 2 × 1 （Q8VDU0） GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 CIT CITRIC ACID × 2 SO4 SULFATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；291 K；0.5M ammonium sulfate, 1.0M lithium sulfate monohydrate, 0.1M sodium citrate tribasic dihydrate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.90 Å R-free 0.244
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 25–354	片段：UNP RESIDUES 25-354 突变：Q147L	G-protein-signaling modulator 2 × 1 （Q8VDU0） GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 SO4 SULFATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；291 K；0.5M ammonium sulfate, 1.0M lithium sulfate monohydrate, 0.1M sodium citrate tribasic dihydrate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.90 Å R-free 0.244
3	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 25–354	片段：UNP RESIDUES 25-354 突变：Q147L	G-protein-signaling modulator 2 × 1 （Q8VDU0） GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 CIT CITRIC ACID × 1 SO4 SULFATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；291 K；0.5M ammonium sulfate, 1.0M lithium sulfate monohydrate, 0.1M sodium citrate tribasic dihydrate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.90 Å R-free 0.244
4	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 D； UniProt 25–354	片段：UNP RESIDUES 25-354 突变：Q147L	G-protein-signaling modulator 2 × 1 （Q8VDU0） GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 CIT CITRIC ACID × 1 SO4 SULFATE ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；291 K；0.5M ammonium sulfate, 1.0M lithium sulfate monohydrate, 0.1M sodium citrate tribasic dihydrate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.90 Å R-free 0.244

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 4G5O	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
2IHB Crystal structure of the heterodimeric complex of human RGS10 and activated Gi alpha 3 提交 2006-09-26	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 32–354（323 aa）	未记录	ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；0.2M (NH4)2SO4, 0.1M Bis-Tris, pH 5.5, 25% PEG3350 , VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.71 Å R-free 0.236
2ODE Crystal structure of the heterodimeric complex of human RGS8 and activated Gi alpha 3 提交 2006-12-22	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 4–350（347 aa）	未记录	ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.20M NH4Cl, 20.0% PEG 6K, 10.0% EtGly, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 1.90 Å R-free 0.211
2ODE Crystal structure of the heterodimeric complex of human RGS8 and activated Gi alpha 3 提交 2006-12-22	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 4–350（347 aa）	未记录	ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.20M NH4Cl, 20.0% PEG 6K, 10.0% EtGly, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 1.90 Å R-free 0.211
2V4Z The crystal structure of the human G-protein subunit alpha (GNAI3) in complex with an engineered regulator of G-protein signaling type 2 domain (RGS2) 提交 2008-09-30	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 4–350（347 aa）片段：SUBUNIT ALPHA, RESIDUES 4-350	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.5；0.1 M HEPES PH 7.5, 2 M AMMONIUM SULPHATE	分辨率 2.80 Å R-free 0.254
4G5R Structure of LGN GL4/Galphai3 complex 提交 2012-07-18	突变/修饰不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 25–354（330 aa）片段：UNP RESIDUES 25-354	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；291 K；0.5M ammonium sulfate, 1.0M lithium sulfate monohydrate, 0.1M sodium citrate tribasic dihydrate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.48 Å R-free 0.253
4G5R Structure of LGN GL4/Galphai3 complex 提交 2012-07-18	突变/修饰不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 25–354（330 aa）片段：UNP RESIDUES 25-354	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 SO4 SULFATE ION × 1 CIT CITRIC ACID × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；291 K；0.5M ammonium sulfate, 1.0M lithium sulfate monohydrate, 0.1M sodium citrate tribasic dihydrate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.48 Å R-free 0.253
4G5R Structure of LGN GL4/Galphai3 complex 提交 2012-07-18	突变/修饰不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 25–354（330 aa）片段：UNP RESIDUES 25-354	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 SO4 SULFATE ION × 1 CIT CITRIC ACID × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；291 K；0.5M ammonium sulfate, 1.0M lithium sulfate monohydrate, 0.1M sodium citrate tribasic dihydrate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.48 Å R-free 0.253
4G5R Structure of LGN GL4/Galphai3 complex 提交 2012-07-18	突变/修饰不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 25–354（330 aa）片段：UNP RESIDUES 25-354	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；291 K；0.5M ammonium sulfate, 1.0M lithium sulfate monohydrate, 0.1M sodium citrate tribasic dihydrate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.48 Å R-free 0.253
4G5S Structure of LGN GL3/Galphai3 complex 提交 2012-07-18	突变/修饰不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 25–354（330 aa）片段：UNP RESIDUES 25-354	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 CIT CITRIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；291 K；0.5M ammonium sulfate, 1.0M lithium sulfate monohydrate, 0.1M sodium citrate tribasic dihydrate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.62 Å R-free 0.253
4G5S Structure of LGN GL3/Galphai3 complex 提交 2012-07-18	突变/修饰不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 25–354（330 aa）片段：UNP RESIDUES 25-354	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；291 K；0.5M ammonium sulfate, 1.0M lithium sulfate monohydrate, 0.1M sodium citrate tribasic dihydrate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.62 Å R-free 0.253
4G5S Structure of LGN GL3/Galphai3 complex 提交 2012-07-18	突变/修饰不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 25–354（330 aa）片段：UNP RESIDUES 25-354	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 CIT CITRIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；291 K；0.5M ammonium sulfate, 1.0M lithium sulfate monohydrate, 0.1M sodium citrate tribasic dihydrate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.62 Å R-free 0.253
4G5S Structure of LGN GL3/Galphai3 complex 提交 2012-07-18	突变/修饰不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 25–354（330 aa）片段：UNP RESIDUES 25-354	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；291 K；0.5M ammonium sulfate, 1.0M lithium sulfate monohydrate, 0.1M sodium citrate tribasic dihydrate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.62 Å R-free 0.253
7E9H Cryo-EM structure of Gi-bound metabotropic glutamate receptor mGlu4 提交 2021-03-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–354（354 aa）	突变：S47N, F191D, G203A, E245A, A326S	SEP PHOSPHOSERINE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
7KH0 Cryo-EM structure of the human arginine vasopressin AVP-vasopressin receptor V2R-Gs signaling complex 提交 2020-10-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 A 2–18（17 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
7RA3 cryo-EM of human Gastric inhibitory polypeptide receptor GIPR bound to GIP 提交 2021-06-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 A 1–18（18 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.24 Å
7RGP cryo-EM of human Glucagon-like peptide 1 receptor GLP-1R bound to tirzepatide 提交 2021-07-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 A 1–18（18 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
7T10 CryoEM structure of somatostatin receptor 2 in complex with somatostatin-14 and Gi3 提交 2021-11-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–354（354 aa）	突变：S47N, G203A, E245A, A326S	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.50 Å
7T11 CryoEM structure of somatostatin receptor 2 in complex with Octreotide and Gi3. 提交 2021-11-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–354（354 aa）	突变：S47N, G203A, E245A, A326S	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.70 Å
7X6I Cryo-EM structure of the human TRPC5 ion channel in complex with G alpha i3 subunits, class1 提交 2022-03-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 E 1–119（119 aa）链 E 120–354（235 aa）链 F 1–119（119 aa）链 F 120–354（235 aa）链 G 1–119（119 aa）链 G 120–354（235 aa）链 H 1–119（119 aa）链 H 120–354（235 aa）	突变：Q204L 突变：Q204L 突变：Q204L 突变：Q204L 突变：Q204L 突变：Q204L 突变：Q204L 突变：Q204L	PTY PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 4 Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 4 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 YZY (2S)-2-(hexadecanoyloxy)-3-hydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 4 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.93 Å
8GVX Cryo-EM structure of the human TRPC5 ion channel in complex with G alpha i3 subunits, class2 提交 2022-09-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 E 1–354（354 aa）链 F 1–354（354 aa）链 G 1–354（354 aa）链 H 1–354（354 aa）	突变：Q204L 突变：Q204L 突变：Q204L 突变：Q204L	PTY PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 4 Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 4 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 YZY (2S)-2-(hexadecanoyloxy)-3-hydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 4 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.91 Å
8GY7 Cryo-EM structure of ACTH-bound melanocortin-2 receptor in complex with MRAP1 and Gs protein 提交 2022-09-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–230（230 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
8JD6 Cryo-EM structure of Gi1-bound metabotropic glutamate receptor mGlu4 提交 2023-05-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–354（354 aa）	未记录	BK0 N-(3-chlorophenyl)pyridine-2-carboxamide × 1 SEP PHOSPHOSERINE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8OY1 Structure of the human Guanine Nucleotide-Binding Protein G(K) Subunit Alpha 提交 2023-05-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 31–350（320 aa）	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；297 K；0.1 M sodium MES at pH 6.5 containing 20% PEG 8000 and 0.2 M ammonium sulfate	分辨率 3.34 Å R-free 0.280
8SZH Cryo-EM structure of cinacalcet-bound human calcium-sensing receptor CaSR-Gi complex in lipid nanodiscs 提交 2023-05-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 C 1–354（354 aa）	未记录	YP4 N-[(1R)-1-(naphthalen-1-yl)ethyl]-3-[3-(trifluoromethyl)phenyl]propan-1-amine × 2 PCW 1,2-DIOLEOYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 CA CALCIUM ION × 4 TRP TRYPTOPHAN × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 2 SPM SPERMINE × 4 CLR CHOLESTEROL × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8SZI Cryo-EM structure of PAM-free human calcium-sensing receptor CaSR-Gi complex in lipid nanodiscs 提交 2023-05-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 C 1–354（354 aa）	突变：S47N, G203A, E245A, A326S	PCW 1,2-DIOLEOYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 CA CALCIUM ION × 4 TRP TRYPTOPHAN × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 CLR CHOLESTEROL × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
8WGB mGlu2-4 heterodimer bound with Gi 提交 2023-09-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：hexameric	链 C 1–354（354 aa）	未记录	GLU GLUTAMIC ACID × 2 W9R (1R,2S)-2-[[3,5-bis(chloranyl)phenyl]carbamoyl]cyclohexane-1-carboxylic acid × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
8YK0 Cryo-EM structure of human GPR156-Gi3 complex 提交 2024-03-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 C 6–354（349 aa）	未记录	MW9 (21R,24R,27S)-24,27,28-trihydroxy-18,24-dioxo-19,23,25-trioxa-24lambda~5~-phosphaoctacosan-21-yl (9Z)-octadec-9-enoate × 4 CLR CHOLESTEROL × 11	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.40 Å
9AVL Structure of human calcium-sensing receptor in complex with Gi3 protein in nanodiscs 提交 2024-03-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 1–354（354 aa）	突变：S47N, G203A, E245A, A326S	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 TCR CYCLOMETHYLTRYPTOPHAN × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 2 CA CALCIUM ION × 6 9IG 3-(2-chlorophenyl)-N-[(1R)-1-(3-methoxyphenyl)ethyl]propan-1-amine × 2 Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 1 A1AF7 (19R,22S,25R)-22,25,26-trihydroxy-16,22-dioxo-17,21,23-trioxa-22lambda~5~-phosphahexacosan-19-yl (9Z)-octadec-9-enoate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；The sample was blotted for 6s before plunge-frozen.	分辨率 3.80 Å
9VJ6 Cryo-EM structure of 5-HT1AR-Gi3 in complex with F-15599 提交 2025-06-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 B 1–354（354 aa）	未记录	A1ESC (3-chloranyl-4-fluoranyl-phenyl)-[4-fluoranyl-4-[[(5-methylpyrimidin-2-yl)methylamino]methyl]piperidin-1-yl]methanone × 1 CLR CHOLESTEROL × 2 T7M (2R)-1-(heptadecanoyloxy)-3-{[(R)-hydroxy{[(1R,2R,3R,4R,5S,6R)-2,3,5,6-tetrahydroxy-4-(phosphonooxy)cyclohexyl]oxy}phosphoryl]oxy}propan-2-yl (5Z,8Z,11Z,14Z)-icosa-5,8,11,14-tetraenoate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.62 Å
9VJF Cryo-EM structure of 5-HT1AR-Gi3 in complex with buspirone 提交 2025-06-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 B 1–354（354 aa）	未记录	CLR CHOLESTEROL × 2 T7M (2R)-1-(heptadecanoyloxy)-3-{[(R)-hydroxy{[(1R,2R,3R,4R,5S,6R)-2,3,5,6-tetrahydroxy-4-(phosphonooxy)cyclohexyl]oxy}phosphoryl]oxy}propan-2-yl (5Z,8Z,11Z,14Z)-icosa-5,8,11,14-tetraenoate × 1 YLX Buspirone × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.70 Å
9WXM Cryo-EM structure of the full-length GPR15L bound GPR15-Gi complex 提交 2025-09-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–354（354 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å

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UniProt名称	GNAI3_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–330； UniProt 25–354 作者链 B； PDB构建体 1–330； UniProt 25–354 作者链 C； PDB构建体 1–330； UniProt 25–354 作者链 D； PDB构建体 1–330； UniProt 25–354

G-protein-signaling modulator 2

物种未注明

UniProt Q8VDU0

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 E； UniProt 628–653	片段：GoLoco 4 (UNP RESIDUES 628-653)	Guanine nucleotide-binding protein G(k) subunit alpha × 1 （P08754） GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 CIT CITRIC ACID × 2 SO4 SULFATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；291 K；0.5M ammonium sulfate, 1.0M lithium sulfate monohydrate, 0.1M sodium citrate tribasic dihydrate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.90 Å R-free 0.244
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 F； UniProt 628–653	片段：GoLoco 4 (UNP RESIDUES 628-653)	Guanine nucleotide-binding protein G(k) subunit alpha × 1 （P08754） GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 SO4 SULFATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；291 K；0.5M ammonium sulfate, 1.0M lithium sulfate monohydrate, 0.1M sodium citrate tribasic dihydrate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.90 Å R-free 0.244
3	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 G； UniProt 628–653	片段：GoLoco 4 (UNP RESIDUES 628-653)	Guanine nucleotide-binding protein G(k) subunit alpha × 1 （P08754） GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 CIT CITRIC ACID × 1 SO4 SULFATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；291 K；0.5M ammonium sulfate, 1.0M lithium sulfate monohydrate, 0.1M sodium citrate tribasic dihydrate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.90 Å R-free 0.244
4	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 H； UniProt 628–653	片段：GoLoco 4 (UNP RESIDUES 628-653)	Guanine nucleotide-binding protein G(k) subunit alpha × 1 （P08754） GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 CIT CITRIC ACID × 1 SO4 SULFATE ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；291 K；0.5M ammonium sulfate, 1.0M lithium sulfate monohydrate, 0.1M sodium citrate tribasic dihydrate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.90 Å R-free 0.244

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 4G5O	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
3RO2 Structures of the LGN/NuMA complex 提交 2011-04-25	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 22–357（336 aa）片段：TPR domain, UNP residues 22-357	未记录	GOL GLYCEROL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；0.02M MgCl2, 0.1M HEPES pH 7.5, 22% w/v polyacrylic acid 5100 buffer, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.30 Å R-free 0.271
3RO3 crystal structure of LGN/mInscuteable complex 提交 2011-04-25	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 198–357（160 aa）片段：UNP residues 198-357	突变：R236I	GOL GLYCEROL × 1 EOH ETHANOL × 1 CL CHLORIDE ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；1.5M NaCl, 10% Ethanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 1.10 Å R-free 0.150
4G2V Structure complex of LGN binding with FRMPD1 提交 2012-07-13	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 22–357（336 aa）片段：TPR domain, UNP residues 22-357	未记录	GOL GLYCEROL × 8 BTB 2-[BIS-(2-HYDROXY-ETHYL)-AMINO]-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.2M Sodium Chloride, 0.1M BISTIS PH6.5, 25% PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.40 Å R-free 0.232
4G5Q Structure of LGN GL4/Galphai1 complex 提交 2012-07-18	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 628–652（25 aa）片段：GoLoco 4 (UNP RESIDUES 628-652)	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 SO4 SULFATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；291 K；0.5M ammonium sulfate, 1.0M lithium sulfate monohydrate, 0.1M sodium citrate tribasic dihydrate, pH 5.6 , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.90 Å R-free 0.243
4G5Q Structure of LGN GL4/Galphai1 complex 提交 2012-07-18	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 628–652（25 aa）片段：GoLoco 4 (UNP RESIDUES 628-652)	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 SO4 SULFATE ION × 4 CIT CITRIC ACID × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；291 K；0.5M ammonium sulfate, 1.0M lithium sulfate monohydrate, 0.1M sodium citrate tribasic dihydrate, pH 5.6 , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.90 Å R-free 0.243
4G5Q Structure of LGN GL4/Galphai1 complex 提交 2012-07-18	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 G 628–652（25 aa）片段：GoLoco 4 (UNP RESIDUES 628-652)	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 SO4 SULFATE ION × 4 CIT CITRIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；291 K；0.5M ammonium sulfate, 1.0M lithium sulfate monohydrate, 0.1M sodium citrate tribasic dihydrate, pH 5.6 , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.90 Å R-free 0.243
4G5Q Structure of LGN GL4/Galphai1 complex 提交 2012-07-18	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 628–652（25 aa）片段：GoLoco 4 (UNP RESIDUES 628-652)	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 SO4 SULFATE ION × 5 CIT CITRIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；291 K；0.5M ammonium sulfate, 1.0M lithium sulfate monohydrate, 0.1M sodium citrate tribasic dihydrate, pH 5.6 , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.90 Å R-free 0.243
4G5R Structure of LGN GL4/Galphai3 complex 提交 2012-07-18	构建体不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 628–652（25 aa）片段：GoLoco 4 (UNP RESIDUES 628-653)	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；291 K；0.5M ammonium sulfate, 1.0M lithium sulfate monohydrate, 0.1M sodium citrate tribasic dihydrate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.48 Å R-free 0.253
4G5R Structure of LGN GL4/Galphai3 complex 提交 2012-07-18	构建体不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 628–652（25 aa）片段：GoLoco 4 (UNP RESIDUES 628-653)	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 SO4 SULFATE ION × 1 CIT CITRIC ACID × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；291 K；0.5M ammonium sulfate, 1.0M lithium sulfate monohydrate, 0.1M sodium citrate tribasic dihydrate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.48 Å R-free 0.253
4G5R Structure of LGN GL4/Galphai3 complex 提交 2012-07-18	构建体不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 G 628–652（25 aa）片段：GoLoco 4 (UNP RESIDUES 628-653)	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 SO4 SULFATE ION × 1 CIT CITRIC ACID × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；291 K；0.5M ammonium sulfate, 1.0M lithium sulfate monohydrate, 0.1M sodium citrate tribasic dihydrate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.48 Å R-free 0.253
4G5R Structure of LGN GL4/Galphai3 complex 提交 2012-07-18	构建体不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 Z 628–652（25 aa）片段：GoLoco 4 (UNP RESIDUES 628-653)	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；291 K；0.5M ammonium sulfate, 1.0M lithium sulfate monohydrate, 0.1M sodium citrate tribasic dihydrate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.48 Å R-free 0.253
4G5S Structure of LGN GL3/Galphai3 complex 提交 2012-07-18	构建体不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 594–618（25 aa）片段：GoLoco 3 (UNP RESIDUES 594-618)	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 CIT CITRIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；291 K；0.5M ammonium sulfate, 1.0M lithium sulfate monohydrate, 0.1M sodium citrate tribasic dihydrate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.62 Å R-free 0.253
4G5S Structure of LGN GL3/Galphai3 complex 提交 2012-07-18	构建体不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 594–618（25 aa）片段：GoLoco 3 (UNP RESIDUES 594-618)	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；291 K；0.5M ammonium sulfate, 1.0M lithium sulfate monohydrate, 0.1M sodium citrate tribasic dihydrate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.62 Å R-free 0.253
4G5S Structure of LGN GL3/Galphai3 complex 提交 2012-07-18	构建体不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 G 594–618（25 aa）片段：GoLoco 3 (UNP RESIDUES 594-618)	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 CIT CITRIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；291 K；0.5M ammonium sulfate, 1.0M lithium sulfate monohydrate, 0.1M sodium citrate tribasic dihydrate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.62 Å R-free 0.253
4G5S Structure of LGN GL3/Galphai3 complex 提交 2012-07-18	构建体不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 Z 594–618（25 aa）片段：GoLoco 3 (UNP RESIDUES 594-618)	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；291 K；0.5M ammonium sulfate, 1.0M lithium sulfate monohydrate, 0.1M sodium citrate tribasic dihydrate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.62 Å R-free 0.253
4JHR An auto-inhibited conformation of LGN reveals a distinct interaction mode between GoLoco motifs and TPR motifs 提交 2013-03-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 96–357（262 aa）链 A 593–651（59 aa）链 B 96–357（262 aa）链 B 593–651（59 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 5.5；291 K；0.2M NaCl, 0.1M Bis-Tris, 25% Polyethylene Glycol 3350, pH 5.5, EVAPORATION, temperature 291K	分辨率 2.80 Å R-free 0.311
7EP7 The complex structure of Gpsm2 and Whirlin 提交 2021-04-26	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 22–357（336 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；1.2 M Ammonium tartrate dibasic, 0.1 M Tris, pH 8.8	分辨率 2.60 Å R-free 0.283

共 8 个其他 PDB 条目、17 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	GPSM2_MOUSE
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–26； UniProt 628–653 作者链 F； PDB构建体 1–26； UniProt 628–653 作者链 G； PDB构建体 1–26； UniProt 628–653 作者链 H； PDB构建体 1–26； UniProt 628–653

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	4g5o
沉积日期 deposition_date	2012-07-18
结构标题 title	Structure of LGN GL4/Galphai3(Q147L) complex
关键词 keywords	Galphai, GoLoco, Galpha signaling, asymmetric cell division, CELL CYCLE-SIGNALING PROTEIN complex; CELL CYCLE/SIGNALING PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	47.38 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	47.91 Å
零角强度 I(0) i0	389387000.00
分子量 molecular_weight	159460.0 kDa
排除体积 excluded_volume	198060 Å³
包络体积 envelope_volume	281120 Å³
水化壳体积 shell_volume	51938 Å³
包络直径 envelope_diameter	158.5 Å
壳层 Rg shell_rg	47.35 Å
包络 Rg envelope_rg	47.42 Å
形状 Rg shape_rg	47.90 Å
总 Rg total_rg	47.91 Å
总原子数 total_atoms	11165
残基数 n_residues	1364
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	149.2 Å
Rg (实空间) rg_real	47.93 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	1.30 Å
I(0) (实空间) i0_real	3.8940e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	7.3000e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	47.39 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	389100000.0000
解质量估计 total_estimate	0.7908
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	40.7 Å
偏度 Skewness skewness	0.458
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.662
角度范围 angular_range	— – 0.1650 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	19750000.0000
实空间数据点数 n_real_points	34
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.815; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.825; Smooth: 0.007

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Guanine nucleotide-binding protein G(k) subunit alpha
分子量 formula_weight	37888.1 kDa
突变 mutation	Q147L
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D
原子数 atom_count	11190

EDGEKAAKEVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHEDGYSEDECKQYKVVVYSNTIQSIIAIIRAMGRLKIDFGEAARADDARQLFVLAGSAEEGVMTPELAGVIKRLWRDGGVQACFSRSREYLLNDSASYYLNDLDRISQSNYIPTQQDVLRTRVKTTGIVETHFTFKDLYFKMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSDYDLVLAEDEEMNRMHESMKLFDSICNNKWFTETSIILFLNKKDLFEEKIKRSPLTICYPEYTGSNTYEEAAAYIQCQFEDLNRRKDTKEIYTHFTCATDTKNVQFVFDAVTDVIIKNNLKECGLY

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	G-protein-signaling modulator 2
分子量 formula_weight	3214.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E,F,G,H

DEDFFSLILRSQAKRMDEQRVLLQRD

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE
分子量 formula_weight	443.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	CITRIC ACID
分子量 formula_weight	192.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	SULFATE ION
分子量 formula_weight	96.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	17

实体 6 Entity 6 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	12

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

CATH v4.4 (8 domains)

结构域编号 domain_id	4g5oA01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

结构域编号 domain_id	4g5oA02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	400 — GI Alpha 1, domain 2-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — GI Alpha 1, domain 2-like

结构域编号 domain_id	4g5oB01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

结构域编号 domain_id	4g5oB02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	400 — GI Alpha 1, domain 2-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — GI Alpha 1, domain 2-like

结构域编号 domain_id	4g5oC01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

结构域编号 domain_id	4g5oC02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	400 — GI Alpha 1, domain 2-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — GI Alpha 1, domain 2-like

结构域编号 domain_id	4g5oD01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

结构域编号 domain_id	4g5oD02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	400 — GI Alpha 1, domain 2-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — GI Alpha 1, domain 2-like

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	207.326 Å
晶胞边长 b length_b	207.326 Å
晶胞边长 c length_c	236.545 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	48

空间群 space_group	P 61 2 2
空间群编号 int_tables_number	178
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.900 Å
最低分辨率 resolution_low	50.000 Å
R 因子 r_factor	0.2097
R_work r_work	0.2079
R_free r_free	0.2436

fit	/app/data/saxs_computation/g5/4g5o/4g5o.fit
pddf	/app/data/pr_computation/g5/4g5o/4g5o.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/g5/4g5o/4g5o.dat

Structure of LGN GL4/Galphai3(Q147L) complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Guanine nucleotide-binding protein G(k) subunit alpha

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

G-protein-signaling modulator 2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

CATH v4.4 (8 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)