Bradyrhizobium japonicum
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 信息不足 | 同源多聚体 | 蛋白 2 | FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 2 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 SULFATE ION × 10 water × 2 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | PHOT_BACSU |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–126； UniProt 1–126 作者链 B； PDB构建体 1–126； UniProt 1–126 |
Bradyrhizobium japonicum
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 信息不足 | 同源多聚体 | 蛋白 2 | FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 2 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 SULFATE ION × 10 water × 2 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | FIXL_BRAJA |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 127–375； UniProt 257–505 作者链 B； PDB构建体 127–375； UniProt 257–505 |
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| 条目编号 entry_id | 4gcz |
| 沉积日期 deposition_date | 2012-07-31 |
| 结构标题 title | Structure of a blue-light photoreceptor |
| 关键词 keywords | ;photoreceptor, signal transduction, two-component system, light-oxygen-voltage, Per-Arnt-Sim, DHp, sensor histidine kinase, Signaling Protein, De Novo Protein ;; Signaling Protein, De Novo Protein |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 36.02 Å |
| Rg（电子密度） | 36.19 Å |
| 总 Rg | 36.28 Å |
| 原子数 | 5898 |
| 残基数 | 724 |
| 排除体积 | 103710 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | 4gczA01 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — 2-Layer Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 450 — Beta-Lactamase |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 20 — PAS domain |
| 结构域编号 domain_id | 4gczA02 |
| 类 Class class | 6 — Special |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Helix non-globular |
| 拓扑 Topology topology | 250 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 2580 — |
| 结构域编号 domain_id | 4gczA03 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Orthogonal Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 287 — Helix Hairpins |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 130 — Signal transduction histidine kinase, dimerisation/phosphotransfer (DHp) domain |
| 结构域编号 domain_id | 4gczA04 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — 2-Layer Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 565 — Heat Shock Protein 90 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Histidine kinase-like ATPase, C-terminal domain |
| 结构域编号 domain_id | 4gczB01 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — 2-Layer Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 450 — Beta-Lactamase |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 20 — PAS domain |
| 结构域编号 domain_id | 4gczB02 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Orthogonal Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 287 — Helix Hairpins |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 130 — Signal transduction histidine kinase, dimerisation/phosphotransfer (DHp) domain |
| 结构域编号 domain_id | 4gczB03 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — 2-Layer Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 565 — Heat Shock Protein 90 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Histidine kinase-like ATPase, C-terminal domain |