SAXSdb — 4hil

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Cytochrome b5 type B

Rattus norvegicus

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 17–102	未记录	HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；293 K；30% (w/v) PEG 8000, 100 sodium cacodylate, 200 mM sodium acetate, pH 6.5, vapor diffusion, temperature 293K	分辨率 1.25 Å R-free 0.152
2	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 17–102	未记录	HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 NA SODIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；293 K；30% (w/v) PEG 8000, 100 sodium cacodylate, 200 mM sodium acetate, pH 6.5, vapor diffusion, temperature 293K	分辨率 1.25 Å R-free 0.152

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 4HIL	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1AWP RAT OUTER MITOCHONDRIAL MEMBRANE CYTOCHROME B5 提交 1997-10-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 13–103（91 aa）片段：WATER SOLUBLE DOMAIN 链 B 13–103（91 aa）片段：WATER SOLUBLE DOMAIN	突变：V45L, V61L 突变：V45L, V61L	HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.00 Å R-free 0.225
1B5M RAT OUTER MITOCHONDRIAL MEMBRANE CYTOCHROME B5 提交 1996-11-07	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 19–102（84 aa）片段：WATER SOLUBLE DOMAIN	未记录	HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 vapor diffusion with slow evaporation；pH 6.5；CRYSTALS WERE OBTAINED BY VAPOR DIFFUSION TOGETHER WITH SLOW EVAPORATION USING 20% PEG 8000 IN 0.1M SODIUM CACODYLATE (PH = 6.5 WITH 0.2 M MAGNESIUM ACETATE., vapor diffusion with slow evaporation	分辨率 2.70 Å
1EUE RAT OUTER MITOCHONDRIAL MEMBRANE CYTOCHROME B5 提交 2000-04-19	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 6–91（86 aa）片段：WATER SOLUBLE DOMAIN	突变：V45I, V61I	HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；277 K；20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate, 0.1 M PIPES, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K	分辨率 1.80 Å R-free 0.232
1EUE RAT OUTER MITOCHONDRIAL MEMBRANE CYTOCHROME B5 提交 2000-04-19	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 6–91（86 aa）片段：WATER SOLUBLE DOMAIN	突变：V45I, V61I	HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；277 K；20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate, 0.1 M PIPES, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K	分辨率 1.80 Å R-free 0.232
1ICC RAT OUTER MITOCHONDRIAL MEMBRANE CYTOCHROME B5 提交 2001-03-30	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 17–103（87 aa）片段：WATER SOLUBLE DOMAIN	突变：A18S, I32L, L47R	MG MAGNESIUM ION × 2 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；278 K；PEG 8000 Magnesium Acetate PIPES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 278K	分辨率 2.00 Å R-free 0.240
1ICC RAT OUTER MITOCHONDRIAL MEMBRANE CYTOCHROME B5 提交 2001-03-30	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 17–103（87 aa）片段：WATER SOLUBLE DOMAIN	突变：A18S, I32L, L47R	HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；278 K；PEG 8000 Magnesium Acetate PIPES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 278K	分辨率 2.00 Å R-free 0.240
1ICC RAT OUTER MITOCHONDRIAL MEMBRANE CYTOCHROME B5 提交 2001-03-30	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 17–103（87 aa）片段：WATER SOLUBLE DOMAIN	突变：A18S, I32L, L47R	MG MAGNESIUM ION × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；278 K；PEG 8000 Magnesium Acetate PIPES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 278K	分辨率 2.00 Å R-free 0.240
1ICC RAT OUTER MITOCHONDRIAL MEMBRANE CYTOCHROME B5 提交 2001-03-30	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 17–103（87 aa）片段：WATER SOLUBLE DOMAIN	突变：A18S, I32L, L47R	HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；278 K；PEG 8000 Magnesium Acetate PIPES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 278K	分辨率 2.00 Å R-free 0.240
1ICC RAT OUTER MITOCHONDRIAL MEMBRANE CYTOCHROME B5 提交 2001-03-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 17–103（87 aa）片段：WATER SOLUBLE DOMAIN 链 C 17–103（87 aa）片段：WATER SOLUBLE DOMAIN	突变：A18S, I32L, L47R 突变：A18S, I32L, L47R	MG MAGNESIUM ION × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；278 K；PEG 8000 Magnesium Acetate PIPES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 278K	分辨率 2.00 Å R-free 0.240
1LJ0 Structure of quintuple mutant of the rat outer mitocondrial cytochrome b5. 提交 2002-04-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 12–103（92 aa）片段：water soluble domain 链 B 12–103（92 aa）片段：water soluble domain	突变：A18S, I25L, I32L, L47R, L71S 突变：A18S, I25L, I32L, L47R, L71S	MG MAGNESIUM ION × 2 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；278 K；PEG 8000, MG ACETATE, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 278K	分辨率 2.00 Å R-free 0.251
1LJ0 Structure of quintuple mutant of the rat outer mitocondrial cytochrome b5. 提交 2002-04-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 12–103（92 aa）片段：water soluble domain 链 C 12–103（92 aa）片段：water soluble domain	突变：A18S, I25L, I32L, L47R, L71S 突变：A18S, I25L, I32L, L47R, L71S	HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；278 K；PEG 8000, MG ACETATE, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 278K	分辨率 2.00 Å R-free 0.251
1LJ0 Structure of quintuple mutant of the rat outer mitocondrial cytochrome b5. 提交 2002-04-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 12–103（92 aa）片段：water soluble domain 链 D 12–103（92 aa）片段：water soluble domain	突变：A18S, I25L, I32L, L47R, L71S 突变：A18S, I25L, I32L, L47R, L71S	MG MAGNESIUM ION × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；278 K；PEG 8000, MG ACETATE, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 278K	分辨率 2.00 Å R-free 0.251
1LJ0 Structure of quintuple mutant of the rat outer mitocondrial cytochrome b5. 提交 2002-04-18	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 12–103（92 aa）片段：water soluble domain	突变：A18S, I25L, I32L, L47R, L71S	MG MAGNESIUM ION × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；278 K；PEG 8000, MG ACETATE, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 278K	分辨率 2.00 Å R-free 0.251
1LJ0 Structure of quintuple mutant of the rat outer mitocondrial cytochrome b5. 提交 2002-04-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 12–103（92 aa）片段：water soluble domain 链 C 12–103（92 aa）片段：water soluble domain	突变：A18S, I25L, I32L, L47R, L71S 突变：A18S, I25L, I32L, L47R, L71S	HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；278 K；PEG 8000, MG ACETATE, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 278K	分辨率 2.00 Å R-free 0.251
1LJ0 Structure of quintuple mutant of the rat outer mitocondrial cytochrome b5. 提交 2002-04-18	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 12–103（92 aa）片段：water soluble domain	突变：A18S, I25L, I32L, L47R, L71S	MG MAGNESIUM ION × 2 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；278 K；PEG 8000, MG ACETATE, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 278K	分辨率 2.00 Å R-free 0.251
2I89 Structure of septuple mutant of Rat Outer Mitochondrial Membrane Cytochrome B5 提交 2006-09-01	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 12–103（92 aa）片段：Water Soluble Domain	突变：R15H/A18S/E20S/I25L/I32L/L47R/L71S	MG MAGNESIUM ION × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.8；278 K；PEG8K 30%, O.2M MgAc, 0.1M Pipes, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 278K, pH 6.80	分辨率 2.10 Å R-free 0.278
2I89 Structure of septuple mutant of Rat Outer Mitochondrial Membrane Cytochrome B5 提交 2006-09-01	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 12–103（92 aa）片段：Water Soluble Domain	突变：R15H/A18S/E20S/I25L/I32L/L47R/L71S	MG MAGNESIUM ION × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.8；278 K；PEG8K 30%, O.2M MgAc, 0.1M Pipes, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 278K, pH 6.80	分辨率 2.10 Å R-free 0.278
2I89 Structure of septuple mutant of Rat Outer Mitochondrial Membrane Cytochrome B5 提交 2006-09-01	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 12–103（92 aa）片段：Water Soluble Domain	突变：R15H/A18S/E20S/I25L/I32L/L47R/L71S	MG MAGNESIUM ION × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.8；278 K；PEG8K 30%, O.2M MgAc, 0.1M Pipes, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 278K, pH 6.80	分辨率 2.10 Å R-free 0.278
2I89 Structure of septuple mutant of Rat Outer Mitochondrial Membrane Cytochrome B5 提交 2006-09-01	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 12–103（92 aa）片段：Water Soluble Domain	突变：R15H/A18S/E20S/I25L/I32L/L47R/L71S	HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.8；278 K；PEG8K 30%, O.2M MgAc, 0.1M Pipes, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 278K, pH 6.80	分辨率 2.10 Å R-free 0.278
2I89 Structure of septuple mutant of Rat Outer Mitochondrial Membrane Cytochrome B5 提交 2006-09-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 12–103（92 aa）片段：Water Soluble Domain 链 C 12–103（92 aa）片段：Water Soluble Domain	突变：R15H/A18S/E20S/I25L/I32L/L47R/L71S 突变：R15H/A18S/E20S/I25L/I32L/L47R/L71S	MG MAGNESIUM ION × 2 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.8；278 K；PEG8K 30%, O.2M MgAc, 0.1M Pipes, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 278K, pH 6.80	分辨率 2.10 Å R-free 0.278
3MUS 2A Resolution Structure of Rat Type B Cytochrome b5 提交 2010-05-03	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 17–102（86 aa）片段：UNP residues 17-102	未记录	HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.8；277 K；30%PEG8K, 0.2M MgAc, 0.1M Hepes, pH 6.8, EVAPORATION, temperature 277K	分辨率 2.00 Å R-free 0.223
3MUS 2A Resolution Structure of Rat Type B Cytochrome b5 提交 2010-05-03	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 17–102（86 aa）片段：UNP residues 17-102	未记录	HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.8；277 K；30%PEG8K, 0.2M MgAc, 0.1M Hepes, pH 6.8, EVAPORATION, temperature 277K	分辨率 2.00 Å R-free 0.223

共 7 个其他 PDB 条目、22 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CYB5B_RAT
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–86； UniProt 17–102 作者链 B； PDB构建体 1–86； UniProt 17–102

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	4hil
沉积日期 deposition_date	2012-10-11
结构标题 title	1.25A Resolution Structure of Rat Type B Cytochrome b5
关键词 keywords	CYTOCHROME B5, HEME, ELECTRON TRANSPORT; ELECTRON TRANSPORT
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	17.41 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	16.42 Å
零角强度 I(0) i0	7641330.00
分子量 molecular_weight	20045.0 kDa
排除体积 excluded_volume	24886 Å³
包络体积 envelope_volume	28232 Å³
水化壳体积 shell_volume	14832 Å³
包络直径 envelope_diameter	55.4 Å
壳层 Rg shell_rg	21.86 Å
包络 Rg envelope_rg	16.50 Å
形状 Rg shape_rg	16.41 Å
总 Rg total_rg	17.40 Å
总原子数 total_atoms	1415
残基数 n_residues	166
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	54.8 Å
Rg (实空间) rg_real	17.34 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.35 Å
I(0) (实空间) i0_real	7.6410e+06
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	8.0340e+04
Rg (倒空间) rg_reciprocal	17.35 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	7641000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8185
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	3
主峰位置 r_peak_primary	21.2 Å
偏度 Skewness skewness	0.232
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.395
角度范围 angular_range	— – 0.4550 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	2011000.0000
实空间数据点数 n_real_points	76
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.880; Stabil: 0.999; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 1.000; Smooth: 0.000

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Cytochrome b5 type B
分子量 formula_weight	9888.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	1758

DPAVTYYRLEEVAKRNTAEETWMVIHGRVYDITRFLSEHPGGEEVLLEQAGADATESFEDVGHSPDAREMLKQYYIGDVHPNDLKPA

来源 Source

来源生物 organism	Rattus norvegicus
通用名 common_name	brown rat,rat,rats
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10116
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE
分子量 formula_weight	616.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	SODIUM ION
分子量 formula_weight	23.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 4 Entity 4 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	233

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_id	d4hila_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.120 — Cytochrome b5-like heme/steroid binding domain
超家族 Superfamily superfamily	d.120.1 — Cytochrome b5-like heme/steroid binding domain
家族 Family family	d.120.1.1 — Cytochrome b5

结构域编号 domain_id	d4hilb_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.120 — Cytochrome b5-like heme/steroid binding domain
超家族 Superfamily superfamily	d.120.1 — Cytochrome b5-like heme/steroid binding domain
家族 Family family	d.120.1.1 — Cytochrome b5

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id	4hilA00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	10 — Roll
拓扑 Topology topology	120 — Flavocytochrome B2; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Cytochrome b5-like heme/steroid binding domain

结构域编号 domain_id	4hilB00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	10 — Roll
拓扑 Topology topology	120 — Flavocytochrome B2; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Cytochrome b5-like heme/steroid binding domain

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	38.609 Å
晶胞边长 b length_b	67.847 Å
晶胞边长 c length_c	70.342 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	19
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.250 Å
最低分辨率 resolution_low	35.171 Å
R 因子 r_factor	0.1379
R_work r_work	0.1371
R_free r_free	0.1522

fit	/app/data/saxs_computation/hi/4hil/4hil.fit
pddf	/app/data/pr_computation/hi/4hil/4hil.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/hi/4hil/4hil.dat

1.25A Resolution Structure of Rat Type B Cytochrome b5

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Cytochrome b5 type B

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction