SAXSdb — 4hin

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Cytochrome b5

Bos taurus

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 8–89	突变：S71L	HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 CU COPPER (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；293 K；20% (w/v) PEG 8000, 100 mM Tris, 200 mM MgCl2, 10 mM CuCl2, pH 8.5, vapor diffusion, temperature 293K	分辨率 2.40 Å R-free 0.245
2	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 8–89	突变：S71L	HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 CU COPPER (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；293 K；20% (w/v) PEG 8000, 100 mM Tris, 200 mM MgCl2, 10 mM CuCl2, pH 8.5, vapor diffusion, temperature 293K	分辨率 2.40 Å R-free 0.245
3	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 8–89	突变：S71L	HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 CU COPPER (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；293 K；20% (w/v) PEG 8000, 100 mM Tris, 200 mM MgCl2, 10 mM CuCl2, pH 8.5, vapor diffusion, temperature 293K	分辨率 2.40 Å R-free 0.245
4	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 D； UniProt 8–89	突变：S71L	HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 CU COPPER (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；293 K；20% (w/v) PEG 8000, 100 mM Tris, 200 mM MgCl2, 10 mM CuCl2, pH 8.5, vapor diffusion, temperature 293K	分辨率 2.40 Å R-free 0.245

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 4HIN	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1CYO BOVINE CYTOCHROME B(5) 提交 1994-08-03	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 5–97（93 aa）	未记录	HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.50 Å
1EHB CRYSTAL STRUCTURE OF RECOMBINANT TRYPSIN-SOLUBILIZED FRAGMENT OF CYTOCHROME B5 提交 2000-02-20	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 8–89（82 aa）片段：TRYPSIN-SOLUBILIZED FRAGMENT	未记录	HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；phosphate buffer, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.90 Å R-free 0.248
1ES1 CRYSTAL STRUCTURE OF VAL61HIS MUTANT OF TRYPSIN-SOLUBILIZED FRAGMENT OF CYTOCHROME B5 提交 2000-04-07	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 8–89（82 aa）片段：TRYPSIN-SOLUBILIZED FRAGMENT	突变：VAL61HIS	HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；phosphate buffer, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.10 Å R-free 0.244
1F03 SOLUTION STRUCTURE OF OXIDIZED BOVINE MICROSOMAL CYTOCHROME B5 MUTANT (E44A, E48A, E56A, D60A) AND ITS INTERACTION WITH CYTOCHROME C 提交 2000-05-14	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 7–88（82 aa）	突变：E44A, E48A, E56A, D60A	HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；303 K；离子强度（mmCIF原始值）10 mM；压力 1 NMR样品组成 6 mM cytochrome b5 mutant 1H \| 10 mM phosphate buffer, 90% H2O, 10% D2O NMR样品组成 6 mM cytochrome b5 mutant 1H \| 10 mM phosphate buffer, D2O	分辨率未提供
1F04 SOLUTION STRUCTURE OF OXIDIZED BOVINE MICROSOMAL CYTOCHROME B5 MUTANT (E44A, E48A, E56A, D60A) AND ITS INTERACTION WITH CYTOCHROME C 提交 2000-05-14	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 7–88（82 aa）	突变：E44A, E48A, E56A, D60A	HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；303 K；离子强度（mmCIF原始值）10 mM；压力 1 NMR样品组成 6 mM cytochrome b5 mutant 1H \| 10 mM phosphate buffer , 90% H2O, 10% D2O NMR样品组成 6 mM cytochrome b5 mutant 1H \| 10 mM phosphate buffer, D2O	分辨率未提供
1HKO NMR structure of bovine cytochrome b5 提交 2003-03-10	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–104（104 aa）片段：HEME BINDING DOMAIN, RESIDUES 1-104	未记录	HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；300 K	分辨率未提供
1I5U SOLUTION STRUCTURE OF CYTOCHROME B5 TRIPLE MUTANT (E48A/E56A/D60A) 提交 2001-02-28	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 8–89（82 aa）片段：SOLUBLE DOMAIN (RESIDUES 8-89)	突变：E48A/E56A/D60A	HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；303 K；压力 1 NMR测量条件 pH 7；303 K；压力 1 NMR测量条件 pH 7；303 K；压力 1 NMR测量条件 pH 7；303 K；压力 1 NMR样品组成 4mM cytochrome b5 triple mutant(E48A/E56A/D60A) \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
1J0Q Solution Structure of Oxidized Bovine Microsomal Cytochrome b5 mutant V61H 提交 2002-11-20	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 7–88（82 aa）片段：Trypsin-Solubilized Fragment	突变：V61H	HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；293 K；压力 ambient NMR样品组成 2.9mM enzyme, pH 7.0, 25mM phosphate buffer \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
1LQX Crystal structure of V45E mutant of cytochrome b5 提交 2002-05-14	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 7–88（82 aa）片段：trypsin-solubilized fragment of cytochrome b5	突变：V45E	HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；293 K；PHOSPHATE BUFFER, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 293.0K	分辨率 1.80 Å R-free 0.222
1LR6 Crystal structure of V45Y mutant of cytochrome b5 提交 2002-05-15	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 7–88（82 aa）片段：trypsin-solubilized fragment of cytochrome b5	突变：V45Y	HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；PHOSPHATE BUFFER, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 1.90 Å R-free 0.236
1M20 Crystal Structure of F35Y Mutant of Trypsin-solubilized Fragment of Cytochrome b5 提交 2002-06-20	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 7–88（82 aa）片段：trypsin-solubilized fragment	突变：F35Y	HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；phosphate buffer, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.80 Å R-free 0.227
1M2I Crystal structure of E44A/E56A mutant of cytochrome b5 提交 2002-06-24	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 7–88（82 aa）片段：trypsin-solubilized fragment of cytochrome b5	突变：E44A, E56A	HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；PHOSPHATE BUFFER, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 1.80 Å R-free 0.232
1M2M Crystal structure of E44A/E48A/E56A/D60A mutant of cytochrome b5 提交 2002-06-24	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 7–88（82 aa）片段：trypsin-solubilized fragment of cytochrome b5	突变：E44A, E48A, E56A, D60A	HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；PHOSPHATE BUFFER, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.80 Å R-free 0.238
1M59 Crystal Structure of P40V Mutant of Trypsin-solubilized Fragment of Cytochrome b5 提交 2002-07-09	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 7–88（82 aa）片段：trypsin-solubilized fragment	突变：P40V	HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；phosphate buffer, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.90 Å R-free 0.227
1NX7 Solution Structure of Oxidized Bovine Microsomal Cytochrome B5 提交 2003-02-10	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 7–88（82 aa）片段：RESIDUES 3-84	未记录	HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；300 K；离子强度（mmCIF原始值）25mM Phosphate buffer；压力 1 NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）25mM Phosphate buffer；压力 1 NMR样品组成 3.0mM \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 3.0mM \| 100% D2O	分辨率未提供
1SH4 Solution structure of oxidized bovine microsomal cytochrome B5 Mutant V45H 提交 2004-02-25	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 7–88（82 aa）片段：residues 3-84	突变：V45H	HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；293 K；离子强度（mmCIF原始值）25mM PHOSPHATE BUFFER；压力 1 NMR样品组成 3.0mM \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 3.0mM \| 100% D2O	分辨率未提供
1U9M Crystal structure of F58W mutant of cytochrome b5 提交 2004-08-10	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 7–88（82 aa）片段：trypsin-solubilized fragment	突变：F58W	HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；phosphate buffer, dioxane, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.00 Å R-free 0.266
1U9M Crystal structure of F58W mutant of cytochrome b5 提交 2004-08-10	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 7–88（82 aa）片段：trypsin-solubilized fragment	突变：F58W	HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；phosphate buffer, dioxane, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.00 Å R-free 0.266
1U9M Crystal structure of F58W mutant of cytochrome b5 提交 2004-08-10	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 7–88（82 aa）片段：trypsin-solubilized fragment	突变：F58W	HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；phosphate buffer, dioxane, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.00 Å R-free 0.266
1U9M Crystal structure of F58W mutant of cytochrome b5 提交 2004-08-10	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 7–88（82 aa）片段：trypsin-solubilized fragment	突变：F58W	HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；phosphate buffer, dioxane, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.00 Å R-free 0.266
1U9M Crystal structure of F58W mutant of cytochrome b5 提交 2004-08-10	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 E 7–88（82 aa）片段：trypsin-solubilized fragment	突变：F58W	HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；phosphate buffer, dioxane, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.00 Å R-free 0.266
1U9M Crystal structure of F58W mutant of cytochrome b5 提交 2004-08-10	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 F 7–88（82 aa）片段：trypsin-solubilized fragment	突变：F58W	HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；phosphate buffer, dioxane, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.00 Å R-free 0.266
1U9U Crystal structure of F58Y mutant of cytochrome b5 提交 2004-08-11	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 7–88（82 aa）片段：Trypsin-solubilized fragment	突变：F58Y	HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；phosphate buffer, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.86 Å R-free 0.215
3OZZ Structure of a cytochrome b5 core-swap mutant 提交 2010-09-27	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 8–89（82 aa）片段：N-TERMINAL HEME-BINDING DOMAIN (unp residues 8-89)	未记录	HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7；277 K；30% PEG8000, 0.2M MgAc, 0.1M Pipes, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K	分辨率 1.70 Å R-free 0.229

共 19 个其他 PDB 条目、24 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CYB5_BOVIN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–82； UniProt 8–89 作者链 B； PDB构建体 1–82； UniProt 8–89 作者链 C； PDB构建体 1–82； UniProt 8–89 作者链 D； PDB构建体 1–82； UniProt 8–89

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	4hin
沉积日期 deposition_date	2012-10-11
结构标题 title	2.4A Resolution Structure of Bovine Cytochrome b5 (S71L)
关键词 keywords	CYTOCHROME B5, HEME, ELECTRON TRANSPORT; ELECTRON TRANSPORT
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	24.35 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	23.53 Å
零角强度 I(0) i0	27064300.00
分子量 molecular_weight	39336.0 kDa
排除体积 excluded_volume	48820 Å³
包络体积 envelope_volume	62239 Å³
水化壳体积 shell_volume	22802 Å³
包络直径 envelope_diameter	81.6 Å
壳层 Rg shell_rg	29.65 Å
包络 Rg envelope_rg	23.55 Å
形状 Rg shape_rg	23.51 Å
总 Rg total_rg	24.38 Å
总原子数 total_atoms	2776
残基数 n_residues	327
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	78.6 Å
Rg (实空间) rg_real	24.22 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.50 Å
I(0) (实空间) i0_real	2.7060e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	3.5560e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal	24.26 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	27060000.0000
解质量估计 total_estimate	0.9007
解质量评级 solution_quality	EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	33.7 Å
偏度 Skewness skewness	0.116
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.547
角度范围 angular_range	— – 0.3250 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	4241000.0000
实空间数据点数 n_real_points	64
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.911; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.993; Smooth: 0.978

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Cytochrome b5
分子量 formula_weight	9501.5 kDa
突变 mutation	S71L
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D
原子数 atom_count	2812

AVKYYTLEEIQKHNNSKSTWLILHYKVYDLTKFLEEHPGGEEVLREQAGGDATENFEDVGHSTDARELLKTFIIGELHPDDR

来源 Source

来源生物 organism	Bos taurus
通用名 common_name	bovine,cow,domestic cattle,domestic cow
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9913
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE
分子量 formula_weight	616.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	COPPER (II) ION
分子量 formula_weight	63.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 4 Entity 4 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	36

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_id	d4hina_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.120 — Cytochrome b5-like heme/steroid binding domain
超家族 Superfamily superfamily	d.120.1 — Cytochrome b5-like heme/steroid binding domain
家族 Family family	d.120.1.1 — Cytochrome b5

结构域编号 domain_id	d4hinb_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.120 — Cytochrome b5-like heme/steroid binding domain
超家族 Superfamily superfamily	d.120.1 — Cytochrome b5-like heme/steroid binding domain
家族 Family family	d.120.1.1 — Cytochrome b5

结构域编号 domain_id	d4hinc_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.120 — Cytochrome b5-like heme/steroid binding domain
超家族 Superfamily superfamily	d.120.1 — Cytochrome b5-like heme/steroid binding domain
家族 Family family	d.120.1.1 — Cytochrome b5

结构域编号 domain_id	d4hind_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.120 — Cytochrome b5-like heme/steroid binding domain
超家族 Superfamily superfamily	d.120.1 — Cytochrome b5-like heme/steroid binding domain
家族 Family family	d.120.1.1 — Cytochrome b5

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id	4hinA00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	10 — Roll
拓扑 Topology topology	120 — Flavocytochrome B2; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Cytochrome b5-like heme/steroid binding domain

结构域编号 domain_id	4hinB00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	10 — Roll
拓扑 Topology topology	120 — Flavocytochrome B2; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Cytochrome b5-like heme/steroid binding domain

结构域编号 domain_id	4hinC00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	10 — Roll
拓扑 Topology topology	120 — Flavocytochrome B2; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Cytochrome b5-like heme/steroid binding domain

结构域编号 domain_id	4hinD00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	10 — Roll
拓扑 Topology topology	120 — Flavocytochrome B2; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Cytochrome b5-like heme/steroid binding domain

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	47.530 Å
晶胞边长 b length_b	92.709 Å
晶胞边长 c length_c	48.990 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	113.11 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.400 Å
最低分辨率 resolution_low	46.350 Å
R 因子 r_factor	0.2104
R_work r_work	0.2086
R_free r_free	0.2451

fit	/app/data/saxs_computation/hi/4hin/4hin.fit
pddf	/app/data/pr_computation/hi/4hin/4hin.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/hi/4hin/4hin.dat

2.4A Resolution Structure of Bovine Cytochrome b5 (S71L)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Cytochrome b5

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction