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4hu9

E. coli thioredoxin variant with (4S)-FluoroPro76 as single proline residue

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 43.4 Å Quality: GOOD
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Thioredoxin-1

Escherichia coli

UniProt P0AA25

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 2–109 突变：P34A, P40A, P64A, P68A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） CU COPPER (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；277.15 K；20 mM acetic acid-NaOH, 2 mM CuCl2, 30 % (v/v) MPD, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277.15K 分辨率 1.55 Å R-free 0.210

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 4HU9 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1F6M CRYSTAL STRUCTURE OF A COMPLEX BETWEEN THIOREDOXIN REDUCTASE, THIOREDOXIN, AND THE NADP+ ANALOG, AADP+ 提交 2000-06-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 1–108（108 aa）
链 D 1–108（108 aa）
突变：C35S 突变：C35S FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 2 3AA 3-AMINOPYRIDINE-ADENINE DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；295 K；cacodylate, ammonium sulfate, PEG 3350, 3-aminopyridine adenine dinucleotide phosphate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.95 Å R-free 0.247
1F6M CRYSTAL STRUCTURE OF A COMPLEX BETWEEN THIOREDOXIN REDUCTASE, THIOREDOXIN, AND THE NADP+ ANALOG, AADP+ 提交 2000-06-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 G 1–108（108 aa）
链 H 1–108（108 aa）
突变：C35S 突变：C35S FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 2 3AA 3-AMINOPYRIDINE-ADENINE DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；295 K；cacodylate, ammonium sulfate, PEG 3350, 3-aminopyridine adenine dinucleotide phosphate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.95 Å R-free 0.247
1KEB Crystal Structure of Double Mutant M37L,P40S E.coli Thioredoxin 提交 2001-11-15 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–108（108 aa）
突变：M37L,P40S CU COPPER (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 3.8；300 K；100mM sodium acetate buffer, 10mM cupric acetate, 25% ethanol as precipitant, pH 3.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K
分辨率 1.80 Å R-free 0.222
1KEB Crystal Structure of Double Mutant M37L,P40S E.coli Thioredoxin 提交 2001-11-15 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–108（108 aa）
突变：M37L,P40S CU COPPER (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 3.8；300 K；100mM sodium acetate buffer, 10mM cupric acetate, 25% ethanol as precipitant, pH 3.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K
分辨率 1.80 Å R-free 0.222
1SKR T7 DNA Polymerase Complexed To DNA Primer/Template and ddATP 提交 2004-03-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–108（108 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 3 DAD 2',3'-DIDEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；294 K；PEG 8000, ammonium sulfate, aces, ethylene glycol, DTT , pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
分辨率 2.40 Å R-free 0.270
1SKS Binary 3' complex of T7 DNA polymerase with a DNA primer/template containing a cis-syn thymine dimer on the template 提交 2004-03-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–108（108 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, pH 7.5
分辨率 2.30 Å R-free 0.266
1SKW Binary 3' complex of T7 DNA polymerase with a DNA primer/template containing a disordered cis-syn thymine dimer on the template 提交 2004-03-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–108（108 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, pH 7.5
分辨率 2.30 Å R-free 0.278
1SL0 Ternary 3' complex of T7 DNA polymerase with a DNA primer/template containing a disordered cis-syn thymine dimer on the template and an incoming nucleotide 提交 2004-03-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–108（108 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 DAD 2',3'-DIDEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.20 Å R-free 0.351
1SL0 Ternary 3' complex of T7 DNA polymerase with a DNA primer/template containing a disordered cis-syn thymine dimer on the template and an incoming nucleotide 提交 2004-03-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 D 1–108（108 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 DAD 2',3'-DIDEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.20 Å R-free 0.351
1SL1 Binary 5' complex of T7 DNA polymerase with a DNA primer/template containing a cis-syn thymine dimer on the template 提交 2004-03-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–108（108 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, pH 7.5
分辨率 2.20 Å R-free 0.262
1SL2 Ternary 5' complex of T7 DNA polymerase with a DNA primer/template containing a cis-syn thymine dimer on the template and an incoming nucleotide 提交 2004-03-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–108（108 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 3 DAD 2',3'-DIDEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, pH 7.5
分辨率 2.30 Å R-free 0.279
1SRX THREE-DIMENSIONAL STRUCTURE OF ESCHERICHIA COLI THIOREDOXIN-S2 TO 2.8 ANGSTROMS RESOLUTION 提交 1976-05-06 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–108（108 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.80 Å
1T8E T7 DNA Polymerase Ternary Complex with dCTP at the Insertion Site. 提交 2004-05-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–108（108 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 3 SO4 SULFATE ION × 1 DCT 2',3'-DIDEOXYCYTIDINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.54 Å R-free 0.255
1THO CRYSTAL STRUCTURE OF A MUTANT ESCHERICHIA COLI THIOREDOXIN WITH AN ARGININE INSERTION IN THE ACTIVE SITE 提交 1993-01-28 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–108（108 aa）
未记录 CU COPPER (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.30 Å
1TK0 T7 DNA polymerase ternary complex with 8 oxo guanosine and ddCTP at the insertion site 提交 2004-06-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–108（108 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 3 SO4 SULFATE ION × 2 DCT 2',3'-DIDEOXYCYTIDINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；294 K；PEG8000, Amonium Sulfate, PEG400, Ethylene Glycol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 21K
分辨率 2.30 Å R-free 0.263
1TK5 T7 DNA polymerase binary complex with 8 oxo guanosine in the templating strand 提交 2004-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–108（108 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；PEG 8000, Ammonium Sulfate. PEG400, Etylen Glyco, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 100K
分辨率 2.20 Å R-free 0.246
1TK8 T7 DNA polymerase ternary complex with 8 oxo guanosine and dAMP at the elongation site 提交 2004-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–108（108 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 4 SO4 SULFATE ION × 2 D3T 2',3'-DIDEOXY-THYMIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；294 K；PEG 8000, Ammonium Sulfate, PEG400, Ethylene Glycol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
分辨率 2.50 Å R-free 0.261
1TKD T7 DNA polymerase ternary complex with 8 oxo guanosine and dCMP at the elongation site 提交 2004-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–108（108 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 3 SO4 SULFATE ION × 3 D3T 2',3'-DIDEOXY-THYMIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；294 K；PEG8000, Ammonium Sulfate, PEG400, Ethylene Glycol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
分辨率 2.49 Å R-free 0.265
1TXX ACTIVE-SITE VARIANT OF E.COLI THIOREDOXIN 提交 1999-04-07 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–109（108 aa）
突变：P33V, G34W CU COPPER (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.2；DROPS (6 ML) OF 0.050 M SODIUM SUCCINATE BUFFER, PH 4.2, CONTAINING CVWC THIOREDOXIN (10 MG/ML), METHYL-ETHER PEG2000 (10% W/V) AND CUPRIC ACETATE (1 MM) WERE SUSPENDED OVER 1.0 ML WELLS OF 0.10 M SODIUM SUCCINATE BUFFER, PH 4.2, CONTAINING METHYL-ETHER PEG 2000 (20% W/V) AND CUPRIC ACETATE (2 MM)., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 2.20 Å
1X9M T7 DNA polymerase in complex with an N-2-acetylaminofluorene-adducted DNA 提交 2004-08-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–108（108 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；295 K；PEG 8000, ammonium sulfate, magnesium chloride, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 295K
分辨率 2.10 Å R-free 0.236
1X9S T7 DNA polymerase in complex with a primer/template DNA containing a disordered N-2 aminofluorene on the template, crystallized with dideoxy-CTP as the incoming nucleotide. 提交 2004-08-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–108（108 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；295 K；PEG 8000, ammonium sulfate, magnesium chloride, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.70 Å R-free 0.279
1X9W T7 DNA polymerase in complex with a primer/template DNA containing a disordered N-2 aminofluorene on the template, crystallized with dideoxy-ATP as the incoming nucleotide. 提交 2004-08-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–108（108 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；295 K；PEG 8000, ammonium sulfate, magnesium chloride, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.30 Å R-free 0.258
1XOA THIOREDOXIN (OXIDIZED DISULFIDE FORM), NMR, 20 STRUCTURES 提交 1995-11-28 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–108（108 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件 分辨率未提供
1XOB THIOREDOXIN (REDUCED DITHIO FORM), NMR, 20 STRUCTURES 提交 1995-11-28 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–108（108 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件 分辨率未提供
1ZCP Crystal Structure of a catalytic site mutant E. coli TrxA (CACA) 提交 2005-04-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–108（108 aa）
链 B 1–108（108 aa）
突变：G33A, P34C, C35A 突变：G33A, P34C, C35A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；30% PEG4000, 0.1 M Tris, 0.2 M Magnesium chloride, 4% acetonitrile, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.30 Å R-free 0.281
1ZCP Crystal Structure of a catalytic site mutant E. coli TrxA (CACA) 提交 2005-04-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–108（108 aa）
链 D 1–108（108 aa）
突变：G33A, P34C, C35A 突变：G33A, P34C, C35A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；30% PEG4000, 0.1 M Tris, 0.2 M Magnesium chloride, 4% acetonitrile, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.30 Å R-free 0.281
1ZYQ T7 DNA polymerase in complex with 8oG and incoming ddATP 提交 2005-06-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–108（108 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 3 DAD 2',3'-DIDEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；PEG, amonium sulfate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.70 Å R-free 0.272
2AJQ Structure of replicative DNA polymerase provides insigts into the mechanisms for processivity, frameshifting and editing 提交 2005-08-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–108（108 aa）
突变：Residues 5 and 7 mutated to Ala 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；273 K；A complex of 1x10^-4 M T7 DNA polymerase 5A7A:thioredoxin was assembled with an equimolar amount of double stranded DNA substrate. Crystallization was achieved using a buffer containing 50mM HEPES pH 7.5, 10mM MgCl_2, 2mM DTT, and 0.5 mM terminal ddTTP Seed crystals were grown by hanging drop vapor diffusion by mixing 1ul each of protein-DNA solution and a reservoir solutions containing between 16 to 20% PEG 8000, 100mM ACES pH 7.5, 120 ammonium sulfate, 30mM MgCl2, and 5mM DTT. These crystals were used to streak-seed a grid of protein/reservoir solutions with concentrations of PEG 8000 between 13 to 15%. Pyramidal crystals appeared overnight and reached a maximum size of ~150 X 150 X 100 um3 after 3 to 4 days. Crystals were harvested overnight in mother-liquor containing 10 % PEG 400, temperature 273K, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 2.60 Å R-free 0.284
2AJQ Structure of replicative DNA polymerase provides insigts into the mechanisms for processivity, frameshifting and editing 提交 2005-08-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 I 1–108（108 aa）
突变：Residues 5 and 7 mutated to Ala 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；273 K；A complex of 1x10^-4 M T7 DNA polymerase 5A7A:thioredoxin was assembled with an equimolar amount of double stranded DNA substrate. Crystallization was achieved using a buffer containing 50mM HEPES pH 7.5, 10mM MgCl_2, 2mM DTT, and 0.5 mM terminal ddTTP Seed crystals were grown by hanging drop vapor diffusion by mixing 1ul each of protein-DNA solution and a reservoir solutions containing between 16 to 20% PEG 8000, 100mM ACES pH 7.5, 120 ammonium sulfate, 30mM MgCl2, and 5mM DTT. These crystals were used to streak-seed a grid of protein/reservoir solutions with concentrations of PEG 8000 between 13 to 15%. Pyramidal crystals appeared overnight and reached a maximum size of ~150 X 150 X 100 um3 after 3 to 4 days. Crystals were harvested overnight in mother-liquor containing 10 % PEG 400, temperature 273K, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 2.60 Å R-free 0.284
2EIO Design of Disulfide-linked Thioredoxin Dimers and Multimers Through Analysis of Crystal Contacts 提交 2007-03-13 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–109（108 aa）
突变：E101C 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；289 K；20% PEG 3350, 0.1M TRIS, 0.2M MAGNESIUM CHLORIDE, pH 8.50, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
分辨率 2.60 Å R-free 0.292
2EIO Design of Disulfide-linked Thioredoxin Dimers and Multimers Through Analysis of Crystal Contacts 提交 2007-03-13 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 2–109（108 aa）
突变：E101C 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；289 K；20% PEG 3350, 0.1M TRIS, 0.2M MAGNESIUM CHLORIDE, pH 8.50, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
分辨率 2.60 Å R-free 0.292
2EIO Design of Disulfide-linked Thioredoxin Dimers and Multimers Through Analysis of Crystal Contacts 提交 2007-03-13 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 2–109（108 aa）
突变：E101C 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；289 K；20% PEG 3350, 0.1M TRIS, 0.2M MAGNESIUM CHLORIDE, pH 8.50, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
分辨率 2.60 Å R-free 0.292
2EIO Design of Disulfide-linked Thioredoxin Dimers and Multimers Through Analysis of Crystal Contacts 提交 2007-03-13 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 2–109（108 aa）
突变：E101C 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；289 K；20% PEG 3350, 0.1M TRIS, 0.2M MAGNESIUM CHLORIDE, pH 8.50, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
分辨率 2.60 Å R-free 0.292
2EIQ Design of Disulfide-linked Thioredoxin Dimers and Multimers Through Analysis of Crystal Contacts 提交 2007-03-13 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–109（108 aa）
突变：T89C CU COPPER (II) ION × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；277 K；40% MPD, 1MM CUPRIC ACETATE, 10MM SODIUM ACETATE, pH 4.50, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.90 Å R-free 0.218
2EIQ Design of Disulfide-linked Thioredoxin Dimers and Multimers Through Analysis of Crystal Contacts 提交 2007-03-13 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 2–109（108 aa）
突变：T89C CU COPPER (II) ION × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；277 K；40% MPD, 1MM CUPRIC ACETATE, 10MM SODIUM ACETATE, pH 4.50, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.90 Å R-free 0.218
2EIQ Design of Disulfide-linked Thioredoxin Dimers and Multimers Through Analysis of Crystal Contacts 提交 2007-03-13 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 2–109（108 aa）
突变：T89C CU COPPER (II) ION × 2 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；277 K；40% MPD, 1MM CUPRIC ACETATE, 10MM SODIUM ACETATE, pH 4.50, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.90 Å R-free 0.218
2EIR Design of Disulfide-linked Thioredoxin Dimers and Multimers Through Analysis of Crystal Contacts 提交 2007-03-13 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–109（108 aa）
突变：E101C/A105C CU COPPER (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；277 K；45% MPD, 5MM CUPRIC ACETATE, 0.1M SODIUM ACETATE, pH 4.50, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.50 Å R-free 0.311
2EIR Design of Disulfide-linked Thioredoxin Dimers and Multimers Through Analysis of Crystal Contacts 提交 2007-03-13 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 2–109（108 aa）
突变：E101C/A105C CU COPPER (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；277 K；45% MPD, 5MM CUPRIC ACETATE, 0.1M SODIUM ACETATE, pH 4.50, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.50 Å R-free 0.311
2EIR Design of Disulfide-linked Thioredoxin Dimers and Multimers Through Analysis of Crystal Contacts 提交 2007-03-13 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 2–109（108 aa）
突变：E101C/A105C CU COPPER (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；277 K；45% MPD, 5MM CUPRIC ACETATE, 0.1M SODIUM ACETATE, pH 4.50, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.50 Å R-free 0.311
2EIR Design of Disulfide-linked Thioredoxin Dimers and Multimers Through Analysis of Crystal Contacts 提交 2007-03-13 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 2–109（108 aa）
突变：E101C/A105C CU COPPER (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；277 K；45% MPD, 5MM CUPRIC ACETATE, 0.1M SODIUM ACETATE, pH 4.50, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.50 Å R-free 0.311
2FCH Crystal Structure of Thioredoxin Mutant G74S 提交 2005-12-12 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–108（108 aa）
突变：G74S MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 COUNTER-DIFFUSION；pH 5.4；277 K；60% (v/v) MPD, Hepes 15 mM, 1 mM Ac2Cu, pH 5.4, Counter-diffusion, temperature 277K
分辨率 2.60 Å R-free 0.276
2FCH Crystal Structure of Thioredoxin Mutant G74S 提交 2005-12-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 10 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–108（108 aa）
链 C 1–108（108 aa）
链 D 1–108（108 aa）
突变：G74S 突变：G74S 突变：G74S MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 COUNTER-DIFFUSION；pH 5.4；277 K；60% (v/v) MPD, Hepes 15 mM, 1 mM Ac2Cu, pH 5.4, Counter-diffusion, temperature 277K
分辨率 2.60 Å R-free 0.276
2FCH Crystal Structure of Thioredoxin Mutant G74S 提交 2005-12-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 11 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 1–108（108 aa）
链 G 1–108（108 aa）
突变：G74S 突变：G74S MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 COUNTER-DIFFUSION；pH 5.4；277 K；60% (v/v) MPD, Hepes 15 mM, 1 mM Ac2Cu, pH 5.4, Counter-diffusion, temperature 277K
分辨率 2.60 Å R-free 0.276
2FCH Crystal Structure of Thioredoxin Mutant G74S 提交 2005-12-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 12 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–108（108 aa）
链 D 1–108（108 aa）
突变：G74S 突变：G74S MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 COUNTER-DIFFUSION；pH 5.4；277 K；60% (v/v) MPD, Hepes 15 mM, 1 mM Ac2Cu, pH 5.4, Counter-diffusion, temperature 277K
分辨率 2.60 Å R-free 0.276
2FCH Crystal Structure of Thioredoxin Mutant G74S 提交 2005-12-12 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–108（108 aa）
突变：G74S 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 COUNTER-DIFFUSION；pH 5.4；277 K；60% (v/v) MPD, Hepes 15 mM, 1 mM Ac2Cu, pH 5.4, Counter-diffusion, temperature 277K
分辨率 2.60 Å R-free 0.276
2FCH Crystal Structure of Thioredoxin Mutant G74S 提交 2005-12-12 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 1–108（108 aa）
突变：G74S 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 COUNTER-DIFFUSION；pH 5.4；277 K；60% (v/v) MPD, Hepes 15 mM, 1 mM Ac2Cu, pH 5.4, Counter-diffusion, temperature 277K
分辨率 2.60 Å R-free 0.276
2FCH Crystal Structure of Thioredoxin Mutant G74S 提交 2005-12-12 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 1–108（108 aa）
突变：G74S MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 COUNTER-DIFFUSION；pH 5.4；277 K；60% (v/v) MPD, Hepes 15 mM, 1 mM Ac2Cu, pH 5.4, Counter-diffusion, temperature 277K
分辨率 2.60 Å R-free 0.276
2FCH Crystal Structure of Thioredoxin Mutant G74S 提交 2005-12-12 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 E 1–108（108 aa）
突变：G74S MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 COUNTER-DIFFUSION；pH 5.4；277 K；60% (v/v) MPD, Hepes 15 mM, 1 mM Ac2Cu, pH 5.4, Counter-diffusion, temperature 277K
分辨率 2.60 Å R-free 0.276
2FCH Crystal Structure of Thioredoxin Mutant G74S 提交 2005-12-12 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 F 1–108（108 aa）
突变：G74S 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 COUNTER-DIFFUSION；pH 5.4；277 K；60% (v/v) MPD, Hepes 15 mM, 1 mM Ac2Cu, pH 5.4, Counter-diffusion, temperature 277K
分辨率 2.60 Å R-free 0.276
2FCH Crystal Structure of Thioredoxin Mutant G74S 提交 2005-12-12 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 7 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 G 1–108（108 aa）
突变：G74S MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 COUNTER-DIFFUSION；pH 5.4；277 K；60% (v/v) MPD, Hepes 15 mM, 1 mM Ac2Cu, pH 5.4, Counter-diffusion, temperature 277K
分辨率 2.60 Å R-free 0.276
2FCH Crystal Structure of Thioredoxin Mutant G74S 提交 2005-12-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 8 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 1–108（108 aa）
链 C 1–108（108 aa）
链 D 1–108（108 aa）
链 F 1–108（108 aa）
链 G 1–108（108 aa）
突变：G74S 突变：G74S 突变：G74S 突变：G74S 突变：G74S MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 COUNTER-DIFFUSION；pH 5.4；277 K；60% (v/v) MPD, Hepes 15 mM, 1 mM Ac2Cu, pH 5.4, Counter-diffusion, temperature 277K
分辨率 2.60 Å R-free 0.276
2FCH Crystal Structure of Thioredoxin Mutant G74S 提交 2005-12-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 9 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–108（108 aa）
链 E 1–108（108 aa）
突变：G74S 突变：G74S MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 COUNTER-DIFFUSION；pH 5.4；277 K；60% (v/v) MPD, Hepes 15 mM, 1 mM Ac2Cu, pH 5.4, Counter-diffusion, temperature 277K
分辨率 2.60 Å R-free 0.276
2FD3 Crystal Structure of Thioredoxin Mutant P34H 提交 2005-12-13 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–108（108 aa）
突变：P34H 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 COUNTER-DIFFUSION；pH 8；277 K；60% (v/v) MPD, Hepes 15 mM, 1 mM Ac2Cu, pH 8.0, Counter-diffusion, temperature 277K
分辨率 2.45 Å R-free 0.305
2FD3 Crystal Structure of Thioredoxin Mutant P34H 提交 2005-12-13 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–108（108 aa）
突变：P34H 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 COUNTER-DIFFUSION；pH 8；277 K；60% (v/v) MPD, Hepes 15 mM, 1 mM Ac2Cu, pH 8.0, Counter-diffusion, temperature 277K
分辨率 2.45 Å R-free 0.305
2TIR CRYSTAL STRUCTURE ANALYSIS OF A MUTANT ESCHERICHIA COLI THIOREDOXIN IN WHICH LYSINE 36 IS REPLACED BY GLUTAMIC ACID 提交 1993-01-10 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–108（108 aa）
未记录 CU COPPER (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.00 Å
2TRX CRYSTAL STRUCTURE OF THIOREDOXIN FROM ESCHERICHIA COLI AT 1.68 ANGSTROMS RESOLUTION 提交 1990-03-19 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–108（108 aa）
未记录 CU COPPER (II) ION × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 4 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.68 Å
2TRX CRYSTAL STRUCTURE OF THIOREDOXIN FROM ESCHERICHIA COLI AT 1.68 ANGSTROMS RESOLUTION 提交 1990-03-19 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–108（108 aa）
未记录 CU COPPER (II) ION × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 3 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.68 Å
2TRX CRYSTAL STRUCTURE OF THIOREDOXIN FROM ESCHERICHIA COLI AT 1.68 ANGSTROMS RESOLUTION 提交 1990-03-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–108（108 aa）
未记录 CU COPPER (II) ION × 2 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 8 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.68 Å
2TRX CRYSTAL STRUCTURE OF THIOREDOXIN FROM ESCHERICHIA COLI AT 1.68 ANGSTROMS RESOLUTION 提交 1990-03-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–108（108 aa）
未记录 CU COPPER (II) ION × 2 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 6 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.68 Å
3DYR Crystal structure of E. coli thioredoxin mutant I76T in its oxidized form 提交 2008-07-28 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–109（108 aa）
突变：I76T 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.00 Å R-free 0.290
3DYR Crystal structure of E. coli thioredoxin mutant I76T in its oxidized form 提交 2008-07-28 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 2–109（108 aa）
突变：I76T 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.00 Å R-free 0.290
4HU7 E. coli thioredoxin variant with Pro76 as single proline residue 提交 2012-11-02 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–109（108 aa）
突变：P34A, P40A, P64A, P68A CU COPPER (II) ION × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；277.15 K；20 mM acetic acid-NaOH, 2 mM CuCl2, 35 % (v/v) MPD , pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277.15K
分辨率 1.40 Å R-free 0.198
4HU7 E. coli thioredoxin variant with Pro76 as single proline residue 提交 2012-11-02 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 2–109（108 aa）
突变：P34A, P40A, P64A, P68A CU COPPER (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；277.15 K；20 mM acetic acid-NaOH, 2 mM CuCl2, 35 % (v/v) MPD , pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277.15K
分辨率 1.40 Å R-free 0.198
4HU7 E. coli thioredoxin variant with Pro76 as single proline residue 提交 2012-11-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 2–109（108 aa）
链 B 2–109（108 aa）
突变：P34A, P40A, P64A, P68A 突变：P34A, P40A, P64A, P68A CU COPPER (II) ION × 2 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；277.15 K；20 mM acetic acid-NaOH, 2 mM CuCl2, 35 % (v/v) MPD , pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277.15K
分辨率 1.40 Å R-free 0.198
4HUA E. coli thioredoxin variant with (4R)-FluoroPro76 as single proline residue 提交 2012-11-02 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–109（108 aa）
突变：P34A, P40A, P64A, P68A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） CU COPPER (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；277.15 K；20 mM acetic acid-NaOH pH 4.5, 2 mM CuCl2, 35 % (v/v) MPD, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277.15K
分辨率 1.10 Å R-free 0.172
4X43 Structure of proline-free E. coli Thioredoxin 提交 2014-12-02 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：Monomeric
链 A 2–109（108 aa）
突变：P34A, P40A, P64A, P68A, P76A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；10% (w/v) PEG 1000, 10% (w/v) PEG 8000
分辨率 1.65 Å R-free 0.218
4X43 Structure of proline-free E. coli Thioredoxin 提交 2014-12-02 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：Monomeric
链 B 2–109（108 aa）
突变：P34A, P40A, P64A, P68A, P76A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；10% (w/v) PEG 1000, 10% (w/v) PEG 8000
分辨率 1.65 Å R-free 0.218
4X43 Structure of proline-free E. coli Thioredoxin 提交 2014-12-02 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：Monomeric
链 C 2–109（108 aa）
突变：P34A, P40A, P64A, P68A, P76A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；10% (w/v) PEG 1000, 10% (w/v) PEG 8000
分辨率 1.65 Å R-free 0.218
5XOC Crystal structure of human Smad3-FoxH1 complex 提交 2017-05-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 2–109（108 aa） 片段：UNP residues 2-109,UNP residues 322-345
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.4；293 K；0.1 M citrate pH 5.4, 0.8% ethylene imine polymer and 0.5 M NaCl
分辨率 2.40 Å R-free 0.235
6GD1 Structure of HuR RRM3 提交 2018-04-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–109（109 aa）
链 B 1–109（109 aa）
未记录 NA SODIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；23% (w/v) PEG 2000 MME, 0.1 M potassium thiocyanate
分辨率 2.01 Å R-free 0.244
6H1Y CRYSTAL STRUCTURE OF A CHIMERIC VARIANT OF THIOREDOXIN FROM ESCHERICHIA COLI 提交 2018-07-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–14（13 aa）
链 A 24–109（86 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；Crystals were obtained with a protein concentration of 20-25 mg/ml. The composition of the reservoir solution was 17% (w/v) PEG10000, 0.1 M ammonium acetate and 0.1 M BIS-TRIS buffer, pH 5.5.
分辨率 2.99 Å R-free 0.259
6H1Y CRYSTAL STRUCTURE OF A CHIMERIC VARIANT OF THIOREDOXIN FROM ESCHERICHIA COLI 提交 2018-07-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 2–14（13 aa）
链 B 24–109（86 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；Crystals were obtained with a protein concentration of 20-25 mg/ml. The composition of the reservoir solution was 17% (w/v) PEG10000, 0.1 M ammonium acetate and 0.1 M BIS-TRIS buffer, pH 5.5.
分辨率 2.99 Å R-free 0.259
6H7J ACTIVATED TURKEY BETA1 ADRENOCEPTOR WITH BOUND AGONIST ISOPRENALINE AND NANOBODY Nb80 提交 2018-07-31 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 2–109（108 aa）
突变：C32S,C35S 5FW ISOPRENALINE × 1 NA SODIUM ION × 1 2CV HEGA-10 × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；0.1 M Hepes-NaOH pH7.5 and 21-24% PEG1500
分辨率 2.80 Å R-free 0.317
6H7J ACTIVATED TURKEY BETA1 ADRENOCEPTOR WITH BOUND AGONIST ISOPRENALINE AND NANOBODY Nb80 提交 2018-07-31 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 2–109（108 aa）
突变：C32S,C35S 5FW ISOPRENALINE × 1 NA SODIUM ION × 1 2CV HEGA-10 × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；0.1 M Hepes-NaOH pH7.5 and 21-24% PEG1500
分辨率 2.80 Å R-free 0.317
6H7L ACTIVATED TURKEY BETA1 ADRENOCEPTOR WITH BOUND PARTIAL AGONIST DOBUTAMINE AND NANOBODY Nb6B9 提交 2018-07-31 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 2–109（108 aa）
突变：C32S,C35S 2CV HEGA-10 × 6 NA SODIUM ION × 1 Y00 DOBUTAMINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；0.1 M Hepes-NaOH pH7.5 and 21-24% PEG1500
分辨率 2.70 Å R-free 0.278
6H7L ACTIVATED TURKEY BETA1 ADRENOCEPTOR WITH BOUND PARTIAL AGONIST DOBUTAMINE AND NANOBODY Nb6B9 提交 2018-07-31 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 2–109（108 aa）
突变：C32S,C35S 2CV HEGA-10 × 3 NA SODIUM ION × 1 Y00 DOBUTAMINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；0.1 M Hepes-NaOH pH7.5 and 21-24% PEG1500
分辨率 2.70 Å R-free 0.278
6H7M ACTIVATED TURKEY BETA1 ADRENOCEPTOR WITH BOUND PARTIAL AGONIST SALBUTAMOL AND NANOBODY Nb6B9 提交 2018-07-31 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 2–109（108 aa）
突变：C32S,C35S 2CV HEGA-10 × 3 68H SALBUTAMOL × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；0.1 M Hepes-NaOH pH7.5 and 21-24% PEG1500
分辨率 2.76 Å R-free 0.285
6H7M ACTIVATED TURKEY BETA1 ADRENOCEPTOR WITH BOUND PARTIAL AGONIST SALBUTAMOL AND NANOBODY Nb6B9 提交 2018-07-31 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 2–109（108 aa）
突变：C32S,C35S 2CV HEGA-10 × 4 68H SALBUTAMOL × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；0.1 M Hepes-NaOH pH7.5 and 21-24% PEG1500
分辨率 2.76 Å R-free 0.285
6H7N ACTIVATED TURKEY BETA1 ADRENOCEPTOR WITH BOUND PARTIAL AGONIST XAMOTEROL AND NANOBODY Nb6B9 提交 2018-07-31 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 2–109（108 aa）
突变：C32S,C35S FVK ~{N}-[2-[[(2~{S})-2-oxidanyl-3-(4-oxidanylphenoxy)propyl]amino]ethyl]morpholine-4-carboxamide × 1 NA SODIUM ION × 1 2CV HEGA-10 × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；0.1 M Hepes-NaOH pH7.5 and 21-24% PEG1500
分辨率 2.50 Å R-free 0.266
6H7N ACTIVATED TURKEY BETA1 ADRENOCEPTOR WITH BOUND PARTIAL AGONIST XAMOTEROL AND NANOBODY Nb6B9 提交 2018-07-31 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 2–109（108 aa）
突变：C32S,C35S FVK ~{N}-[2-[[(2~{S})-2-oxidanyl-3-(4-oxidanylphenoxy)propyl]amino]ethyl]morpholine-4-carboxamide × 1 NA SODIUM ION × 1 2CV HEGA-10 × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；0.1 M Hepes-NaOH pH7.5 and 21-24% PEG1500
分辨率 2.50 Å R-free 0.266
6H7O ACTIVATED TURKEY BETA1 ADRENOCEPTOR WITH BOUND WEAK PARTIAL AGONIST CYANOPINDOLOL AND NANOBODY Nb6B9 提交 2018-07-31 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 2–109（108 aa）
突变：C32S,C35S P32 Cyanopindolol × 1 NA SODIUM ION × 1 2CV HEGA-10 × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；0.1 M Hepes-NaOH pH7.5 and 21-24% PEG1500
分辨率 2.80 Å R-free 0.274
6H7O ACTIVATED TURKEY BETA1 ADRENOCEPTOR WITH BOUND WEAK PARTIAL AGONIST CYANOPINDOLOL AND NANOBODY Nb6B9 提交 2018-07-31 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 2–109（108 aa）
突变：C32S,C35S P32 Cyanopindolol × 1 NA SODIUM ION × 1 2CV HEGA-10 × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；0.1 M Hepes-NaOH pH7.5 and 21-24% PEG1500
分辨率 2.80 Å R-free 0.274
6IBL ACTIVATED TURKEY BETA1 ADRENOCEPTOR WITH BOUND AGONIST FORMOTEROL AND NANOBODY Nb80 提交 2018-11-30 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 2–109（108 aa）
突变：C32S,C35S,C32S,C35S H98 ~{N}-[5-[(1~{R})-2-[[(2~{R})-1-(4-methoxyphenyl)propan-2-yl]amino]-1-oxidanyl-ethyl]-2-oxidanyl-phenyl]methanamide × 1 NA SODIUM ION × 1 2CV HEGA-10 × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；0.1 M Hepes-NaOH pH7.5 and 21-24% PEG1500
分辨率 2.70 Å R-free 0.277
6IBL ACTIVATED TURKEY BETA1 ADRENOCEPTOR WITH BOUND AGONIST FORMOTEROL AND NANOBODY Nb80 提交 2018-11-30 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 2–109（108 aa）
突变：C32S,C35S,C32S,C35S H98 ~{N}-[5-[(1~{R})-2-[[(2~{R})-1-(4-methoxyphenyl)propan-2-yl]amino]-1-oxidanyl-ethyl]-2-oxidanyl-phenyl]methanamide × 1 NA SODIUM ION × 1 2CV HEGA-10 × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；0.1 M Hepes-NaOH pH7.5 and 21-24% PEG1500
分辨率 2.70 Å R-free 0.277
6LUR Human PUF60 UHM domain (thioredoxin fusion) in complex with a small molecule binder 提交 2020-01-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–109（109 aa）
链 B 1–109（109 aa）
链 C 1–109（109 aa）
链 D 1–109（109 aa）
链 E 1–109（109 aa）
链 F 1–109（109 aa）
链 G 1–109（109 aa）
链 H 1–109（109 aa）
未记录 EVU 4-[2-[4-(aminomethyl)phenyl]phenyl]piperazin-2-one × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；1.3-1.6M AmSO4, 0.2M potassium formate
分辨率 2.00 Å R-free 0.253
6Y4Y The crystal structure of human MACROD2 in space group P41212 提交 2020-02-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–109（109 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.7；293 K；0.2 M Ammonium tartarate dibasic pH 6.7, 20% PEG 3350
分辨率 1.75 Å R-free 0.227
6Y4Y The crystal structure of human MACROD2 in space group P41212 提交 2020-02-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–109（109 aa）
未记录 TLA L(+)-TARTARIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.7；293 K；0.2 M Ammonium tartarate dibasic pH 6.7, 20% PEG 3350
分辨率 1.75 Å R-free 0.227
6Y4Y The crystal structure of human MACROD2 in space group P41212 提交 2020-02-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 1–109（109 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.7；293 K；0.2 M Ammonium tartarate dibasic pH 6.7, 20% PEG 3350
分辨率 1.75 Å R-free 0.227
6Y4Y The crystal structure of human MACROD2 in space group P41212 提交 2020-02-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 1–109（109 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.7；293 K；0.2 M Ammonium tartarate dibasic pH 6.7, 20% PEG 3350
分辨率 1.75 Å R-free 0.227
6Y4Z The crystal structure of human MACROD2 in space group P43212 提交 2020-02-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–109（109 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.7；293 K；0.2 M Ammonium tartarate dibasic pH 6.7, 20% PEG 3350
分辨率 1.90 Å R-free 0.228
6Y4Z The crystal structure of human MACROD2 in space group P43212 提交 2020-02-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–109（109 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.7；293 K；0.2 M Ammonium tartarate dibasic pH 6.7, 20% PEG 3350
分辨率 1.90 Å R-free 0.228
6Y4Z The crystal structure of human MACROD2 in space group P43212 提交 2020-02-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 1–109（109 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.7；293 K；0.2 M Ammonium tartarate dibasic pH 6.7, 20% PEG 3350
分辨率 1.90 Å R-free 0.228
6Y4Z The crystal structure of human MACROD2 in space group P43212 提交 2020-02-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 1–109（109 aa）
未记录 TLA L(+)-TARTARIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.7；293 K；0.2 M Ammonium tartarate dibasic pH 6.7, 20% PEG 3350
分辨率 1.90 Å R-free 0.228
6YEV Crystal structure of MsrA C206 and Trx C35S complex from Escherichia coli 提交 2020-03-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 1–109（109 aa）
突变：Cys35Ser NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277.15 K；0.1M BIS-TRIS propane pH 6.5, 0.2M trisodium citrate, 20% PEG 3350
分辨率 2.94 Å R-free 0.258
6YEV Crystal structure of MsrA C206 and Trx C35S complex from Escherichia coli 提交 2020-03-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 1–109（109 aa）
突变：Cys35Ser NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277.15 K；0.1M BIS-TRIS propane pH 6.5, 0.2M trisodium citrate, 20% PEG 3350
分辨率 2.94 Å R-free 0.258
6YEV Crystal structure of MsrA C206 and Trx C35S complex from Escherichia coli 提交 2020-03-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 1–109（109 aa）
突变：Cys35Ser NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277.15 K；0.1M BIS-TRIS propane pH 6.5, 0.2M trisodium citrate, 20% PEG 3350
分辨率 2.94 Å R-free 0.258
7SCD Ternary complex of fixed-arm Trx-3ost5 (I299E) with 8mer-1 octasaccharide substrate and co-factor product PAP 提交 2021-09-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–108（108 aa）
突变：I299E A3P ADENOSINE-3'-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；0.2M ammonium tartrate, 20% (w/v) PEG3350
分辨率 2.90 Å R-free 0.252
7SCE Ternary complex of fixed-arm Trx-3ost5 (I299E) with 8mer-2 octasaccharide substrate and co-factor product PAP 提交 2021-09-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–108（108 aa）
突变：I299E A3P ADENOSINE-3'-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；295 K；85mM sodium acetate pH 4.6, 0.17M ammonium acetate, 25.5% (w/v) PEG4000, 15% (v/v) ethylene glycol
分辨率 2.75 Å R-free 0.246
8KGZ Crystal structure of single-chain Fv antibody against antigen peptide from SARS-CoV2 S-spike protein 提交 2023-08-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–109（109 aa）
链 B 1–109（109 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；25% PEG 3350, 0.1M HEPES pH7.5
分辨率 2.21 Å R-free 0.321
8S2N Xenorhabdus bovienii Rhs toxin TreTu complex with TrxA and TriTu immunity protein 提交 2024-02-18 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 2–109（108 aa）
未记录 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Ammonium sulfate, 0.02 M Sodium chloride, 0.02 M Sodium acetate pH 4.0, 33 % v/v PEG 200
分辨率 2.11 Å R-free 0.232

共 52 个其他 PDB 条目、100 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 THIO_ECOLI
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–108； UniProt 2–109

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 4hu9

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 4hu9
下载 Download
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id4hu9
沉积日期 deposition_date2012-11-02
结构标题 titleE. coli thioredoxin variant with (4S)-FluoroPro76 as single proline residue
关键词 keywords4s-fluoroproline, cisproline, thioredoxin fold, protein disulfide oxidoreductase activity, oxidoreductase; OXIDOREDUCTASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier14.50 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron12.78 Å
零角强度 I(0) i02703780.00
分子量 molecular_weight11649.0 kDa
排除体积 excluded_volume14698 ų
包络体积 envelope_volume16213 ų
水化壳体积 shell_volume10853 ų
包络直径 envelope_diameter41.4 Å
壳层 Rg shell_rg18.50 Å
包络 Rg envelope_rg13.00 Å
形状 Rg shape_rg12.75 Å
总 Rg total_rg14.17 Å
总原子数 total_atoms816
残基数 n_residues107
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax43.4 Å
Rg (实空间) rg_real14.38 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.15 Å
I(0) (实空间) i0_real2.7040e+06
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error2.5390e+04
Rg (倒空间) rg_reciprocal14.39 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal2704000.0000
解质量估计 total_estimate0.8976
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary19.2 Å
偏度 Skewness skewness-0.013
峰度 Kurtosis kurtosis-0.416
角度范围 angular_range— – 0.5000 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha414100.0000
实空间数据点数 n_real_points80
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.901; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.968; Smooth: 0.994
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_idd4hu9a_
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.47 — Thioredoxin fold
超家族 Superfamily superfamilyc.47.1 — Thioredoxin-like
家族 Family familyc.47.1.1 — Thioltransferase

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id4hu9A00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology30 — Glutaredoxin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Glutaredoxin
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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)