SAXSdb — 4jcj

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Insulin gene enhancer protein ISL-1,LIM domain-binding protein 1

Mus musculus

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	单体	蛋白 1	ZINC ION × 4	与蛋白数一致
2	信息不足	单体	蛋白 1	ZINC ION × 4	与蛋白数一致
3	信息不足	单体	蛋白 1	ZINC ION × 4	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ISL1_MOUSE
Isoform	P61372-2
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 3–130； UniProt 11–138 作者链 B； PDB构建体 3–130； UniProt 11–138 作者链 C； PDB构建体 3–130； UniProt 11–138

Insulin gene enhancer protein ISL-1,LIM domain-binding protein 1

Mus musculus

UniProt P70662

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	单体	蛋白 1	ZINC ION × 4	与蛋白数一致
2	信息不足	单体	蛋白 1	ZINC ION × 4	与蛋白数一致
3	信息不足	单体	蛋白 1	ZINC ION × 4	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	LDB1_MOUSE
Isoform	P70662-3
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 143–173； UniProt 300–330 作者链 B； PDB构建体 143–173； UniProt 300–330 作者链 C； PDB构建体 143–173； UniProt 300–330

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	4jcj
沉积日期 deposition_date	2013-02-21
结构标题 title	Crystal structure of Isl1 LIM domains with Ldb1 LIM-interaction domain
关键词 keywords	Zinc finger, Transcriptional complex, Zinc binding, Nucleus, PROTEIN BINDING; PROTEIN BINDING
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

4jcj__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

4jcj__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

4jcj__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	21.68 Å
Rg（电子密度）	21.61 Å
总 Rg	22.18 Å
原子数	995
残基数	144
排除体积	17261 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`4jcj__assembly_1__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`4jcj__assembly_2__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
3	1	`4jcj__assembly_3__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

CATH v4.4 (6 domains)

结构域编号 domain_id	4jcjA01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	10 — Ribbon
拓扑 Topology topology	110 — Cysteine Rich Protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Cysteine Rich Protein

结构域编号 domain_id	4jcjA02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	10 — Ribbon
拓扑 Topology topology	110 — Cysteine Rich Protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Cysteine Rich Protein

结构域编号 domain_id	4jcjB01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	10 — Ribbon
拓扑 Topology topology	110 — Cysteine Rich Protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Cysteine Rich Protein

结构域编号 domain_id	4jcjB02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	10 — Ribbon
拓扑 Topology topology	110 — Cysteine Rich Protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Cysteine Rich Protein

结构域编号 domain_id	4jcjC01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	10 — Ribbon
拓扑 Topology topology	110 — Cysteine Rich Protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Cysteine Rich Protein

结构域编号 domain_id	4jcjC02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	10 — Ribbon
拓扑 Topology topology	110 — Cysteine Rich Protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Cysteine Rich Protein

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晶胞边长 a length_a	57.310 Å
晶胞边长 b length_b	56.639 Å
晶胞边长 c length_c	179.342 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	12

空间群 space_group	P 2 2 21
空间群编号 int_tables_number	17
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.000 Å
最低分辨率 resolution_low	48.290 Å
R 因子 r_factor	0.2556
R_work r_work	0.2536
R_free r_free	0.2987

描述 description	Insulin gene enhancer protein ISL-1,LIM domain-binding protein 1
分子量 formula_weight	19354.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C
原子数 atom_count	3095

Crystal structure of Isl1 LIM domains with Ldb1 LIM-interaction domain

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Insulin gene enhancer protein ISL-1,LIM domain-binding protein 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Insulin gene enhancer protein ISL-1,LIM domain-binding protein 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

4jcj__assembly_1__model_1

4jcj__assembly_1__model_1 | I(q)

4jcj__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

CATH v4.4 (6 domains)

7. 引用文献 (1)

来源生物 organism	Mus musculus
通用名 common_name	Mouse
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10090
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	12

Crystal structure of Isl1 LIM domains with Ldb1 LIM-interaction domain

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Insulin gene enhancer protein ISL-1,LIM domain-binding protein 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Insulin gene enhancer protein ISL-1,LIM domain-binding protein 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

4jcj__assembly_1__model_1

4jcj__assembly_1__model_1 | I(q)

4jcj__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

CATH v4.4 (6 domains)

7. 引用文献 (1)