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4jd2

Crystal structure of Bos taurus Arp2/3 complex binding with Mus musculus GMF

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 147.7 Å Quality: GOOD
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Actin-related protein 3

物种未注明

UniProt P61157

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 1–418 未记录 Actin-related protein 2 × 1 （A7MB62） Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B × 1 （Q58CQ2） Actin-related protein 2/3 complex subunit 2 × 1 （Q3MHR7） Actin-related protein 2/3 complex subunit 3 × 1 （Q3T035） Actin-related protein 2/3 complex subunit 4 × 1 （Q148J6） Actin-related protein 2/3 complex subunit 5 × 1 （Q3SYX9） Glia maturation factor gamma × 1 （Q9ERL7） CA CALCIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 2 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取环境条件 分辨率 3.08 Å R-free 0.248

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 4JD2 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1K8K Crystal Structure of Arp2/3 Complex 提交 2001-10-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–418（418 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；PEG 8000, KSCN, Hepes at pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 298K
分辨率 2.00 Å R-free 0.251
1TYQ Crystal structure of Arp2/3 complex with bound ATP and calcium 提交 2004-07-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–418（418 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；PEG 8000, potassium thiocyanate, Hepes, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.55 Å R-free 0.272
1U2V Crystal structure of Arp2/3 complex with bound ADP and calcium 提交 2004-07-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–418（418 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；Hepes, potassium thiocyanate, PEG 8000, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.55 Å R-free 0.258
1U2V Crystal structure of Arp2/3 complex with bound ADP and calcium 提交 2004-07-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–418（418 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；Hepes, potassium thiocyanate, PEG 8000, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.55 Å R-free 0.258
2P9I Crystal Structure of bovine Arp2/3 Complex co-crystallized with ADP and crosslinked with gluteraldehyde 提交 2007-03-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–418（418 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；7.5% PEG 3350 50mM HEPES 100mM KSCN 10% Sucrose, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.46 Å R-free 0.261
2P9K Crystal structure of bovine Arp2/3 complex co-crystallized with ATP and crosslinked with glutaraldehyde 提交 2007-03-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–418（418 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；278 K；7.5% PEG 3350, 50mM HEPES, 100mM KSCN, 10% Sucrose, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 278K
分辨率 2.59 Å R-free 0.260
2P9L Crystal Structure of bovine Arp2/3 complex 提交 2007-03-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–418（418 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；7.5% PEG3350 50mM HEPES 100mM KSCN 10% Sucrose, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.65 Å R-free 0.266
2P9N Crystal Structure of bovine Arp2/3 complex co-crystallized with ADP 提交 2007-03-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–418（418 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；6% PEG 8000 100mM HEPES 100mM KSCN, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.85 Å R-free 0.272
2P9P Crystal Structure of bovine Arp2/3 complex co-crystallized with ADP 提交 2007-03-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–418（418 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；7.5% PEG 3350 50mM HEPES 100mM KSCN 10% Sucrose, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.90 Å R-free 0.288
2P9S Structure of bovine Arp2/3 complex co-crystallized with ATP/Mg2+ 提交 2007-03-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–418（418 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；7.5% PEG3350 50mM HEPES 100mM KSCN 10% Sucrose, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.68 Å R-free 0.261
2P9U Crystal structure of bovine Arp2/3 complex co-crystallized with AMP-PNP and calcium 提交 2007-03-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–418（418 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 2 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；7.5% PEG3350 50mM HEPES 100mM KSCN 10% Sucrose, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.75 Å R-free 0.265
3DXK Structure of Bos Taurus Arp2/3 Complex with Bound Inhibitor CK0944636 提交 2008-07-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–418（418 aa）
未记录 N23 N-[2-(2-methyl-1H-indol-3-yl)ethyl]thiophene-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；8% PEG 8000, 50 mM HEPES, pH 7.5, 100 mM KSCN, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.70 Å R-free 0.262
3DXM Structure of Bos taurus Arp2/3 Complex with Bound Inhibitor CK0993548 提交 2008-07-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–418（418 aa）
未记录 N24 (2S)-2-(3-bromophenyl)-3-(5-chloro-2-hydroxyphenyl)-1,3-thiazolidin-4-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；8% PEG 8000, 50 mM HEPES, pH 7.5,100 mM KSCN, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.85 Å R-free 0.258
3RSE Structural and biochemical characterization of two binding sites for nucleation promoting factor WASp-VCA on Arp2/3 complex 提交 2011-05-02 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–418（418 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；100 mM HEPES 7.5, 8% PEG 8000, 200 mM KCl, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.65 Å R-free 0.259
3UKR Crystal structure of Bos taurus Arp2/3 complex with bound inhibitor CK-666 提交 2011-11-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–418（418 aa）
未记录 CKH 2-fluoro-N-[2-(2-methyl-1H-indol-3-yl)ethyl]benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；0.1M Hepes (pH 7.5), 0.2M KSCN, 16% PEG 8000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.48 Å R-free 0.261
3UKU Structure of Arp2/3 complex with bound inhibitor CK-869 提交 2011-11-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–418（418 aa）
未记录 C69 (2S)-2-(3-bromophenyl)-3-(2,4-dimethoxyphenyl)-1,3-thiazolidin-4-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；278 K；8% PEG 8000, 50 mM HEPES, pH 7.5, 100 mM KSCN, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 278K
分辨率 2.75 Å R-free 0.301
3ULE Structure of Bos taurus Arp2/3 complex with bound inhibitor CK-869 and ATP 提交 2011-11-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–418（418 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 C69 (2S)-2-(3-bromophenyl)-3-(2,4-dimethoxyphenyl)-1,3-thiazolidin-4-one × 1 CA CALCIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；277 K；8% PEG 8000, 50 mM HEPES, pH 7.5,100 mM KSCN, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.50 Å R-free 0.274
4XEI Orthorhombic isomorph of bovine Arp2/3 complex 提交 2014-12-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–418（418 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；277 K；Ethanol 10%, 1,4-butanediol 15%, 100 mM Tris 7.4
分辨率 3.87 Å R-free 0.329
4XF2 Tetragonal structure of Arp2/3 complex 提交 2014-12-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–418（418 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；100 mM Tris 7.0, 15% ethanol
分辨率 5.00 Å R-free 0.303
4XF2 Tetragonal structure of Arp2/3 complex 提交 2014-12-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 T 1–418（418 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；100 mM Tris 7.0, 15% ethanol
分辨率 5.00 Å R-free 0.303
6DEC Crystal structure of Bos taurus Arp2/3 complex binding with C-terminus of Homo sapiens SPIN90 提交 2018-05-11 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–418（418 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；50 mM HEPES, pH 7.5, 5% PEG3350, 50 mM L-Proline, 0.5 mM ATP, 0.5 mM calcium chloride, 1 mM DTT
分辨率 4.60 Å R-free 0.314
6DEC Crystal structure of Bos taurus Arp2/3 complex binding with C-terminus of Homo sapiens SPIN90 提交 2018-05-11 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 H 1–418（418 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；50 mM HEPES, pH 7.5, 5% PEG3350, 50 mM L-Proline, 0.5 mM ATP, 0.5 mM calcium chloride, 1 mM DTT
分辨率 4.60 Å R-free 0.314
7JPN Cryo-EM structure of Arpin-bound Arp2/3 complex 提交 2020-08-09 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 3–415（413 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Grids were manually blotted for 3 seconds with Whatman 41 filter paper and manually plunged using a Leica EM CPC manual plunger.
分辨率 3.24 Å
7T5Q Cryo-EM Structure of a Transition State of Arp2/3 Complex Activation 提交 2021-12-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 A 1–418（418 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 3 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Grids were manually blotted for 3 seconds with Whatman 41 filter paper and manually plunged using a Leica EM CPC manual plunger.
分辨率 3.40 Å
7TPT Single-particle Cryo-EM structure of Arp2/3 complex at branched-actin junction. 提交 2022-01-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric
链 A 1–418（418 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 16 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 16 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8TAH Cryo-EM structure of Cortactin-bound to Arp2/3 complex 提交 2023-06-27 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–418（418 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7；10 mM imidazole pH 7.0, 50 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.89 Å
9DLX Bovine Arp2/3 complex with N-WASP CA bound to Arp3 and Arp2-ArpC1 提交 2024-09-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 3–414（412 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.91 Å
9DLZ Bovine Arp2/3 complex with N-WASP CA bound to Arp3 提交 2024-09-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 3–413（411 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
9EAM Coronin-7 CA bound to Arp2/3 complex 提交 2024-11-11 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–418（418 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.97 Å
9M5E Structure of SPIN90 dimer-Arp2/3 complex-nucleated actin filament (singlet complex) 提交 2025-03-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric
链 A 1–418（418 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.55 Å
9M64 Structure of SPIN90 dimer-Arp2/3 complexes-nucleated actin filaments (Doublet Complex) 提交 2025-03-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric
链 A 1–418（418 aa）
链 a 1–418（418 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 12 MG MAGNESIUM ION × 10 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å

共 28 个其他 PDB 条目、31 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ARP3_BOVIN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–418； UniProt 1–418

Actin-related protein 2

物种未注明

UniProt A7MB62

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白拷贝数一致 链 B； UniProt 1–394 未记录 Actin-related protein 3 × 1 （P61157） Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B × 1 （Q58CQ2） Actin-related protein 2/3 complex subunit 2 × 1 （Q3MHR7） Actin-related protein 2/3 complex subunit 3 × 1 （Q3T035） Actin-related protein 2/3 complex subunit 4 × 1 （Q148J6） Actin-related protein 2/3 complex subunit 5 × 1 （Q3SYX9） Glia maturation factor gamma × 1 （Q9ERL7） CA CALCIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 2 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取环境条件 分辨率 3.08 Å R-free 0.248

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 4JD2 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1K8K Crystal Structure of Arp2/3 Complex 提交 2001-10-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 B 1–394（394 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；PEG 8000, KSCN, Hepes at pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 298K
分辨率 2.00 Å R-free 0.251
2P9I Crystal Structure of bovine Arp2/3 Complex co-crystallized with ADP and crosslinked with gluteraldehyde 提交 2007-03-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 B 1–394（394 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；7.5% PEG 3350 50mM HEPES 100mM KSCN 10% Sucrose, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.46 Å R-free 0.261
2P9K Crystal structure of bovine Arp2/3 complex co-crystallized with ATP and crosslinked with glutaraldehyde 提交 2007-03-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 B 1–394（394 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；278 K；7.5% PEG 3350, 50mM HEPES, 100mM KSCN, 10% Sucrose, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 278K
分辨率 2.59 Å R-free 0.260
2P9L Crystal Structure of bovine Arp2/3 complex 提交 2007-03-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 B 1–394（394 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；7.5% PEG3350 50mM HEPES 100mM KSCN 10% Sucrose, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.65 Å R-free 0.266
2P9N Crystal Structure of bovine Arp2/3 complex co-crystallized with ADP 提交 2007-03-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 B 1–394（394 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；6% PEG 8000 100mM HEPES 100mM KSCN, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.85 Å R-free 0.272
2P9P Crystal Structure of bovine Arp2/3 complex co-crystallized with ADP 提交 2007-03-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 B 1–394（394 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；7.5% PEG 3350 50mM HEPES 100mM KSCN 10% Sucrose, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.90 Å R-free 0.288
2P9S Structure of bovine Arp2/3 complex co-crystallized with ATP/Mg2+ 提交 2007-03-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 B 1–394（394 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；7.5% PEG3350 50mM HEPES 100mM KSCN 10% Sucrose, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.68 Å R-free 0.261
2P9U Crystal structure of bovine Arp2/3 complex co-crystallized with AMP-PNP and calcium 提交 2007-03-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 B 1–394（394 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 2 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；7.5% PEG3350 50mM HEPES 100mM KSCN 10% Sucrose, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.75 Å R-free 0.265
3DXK Structure of Bos Taurus Arp2/3 Complex with Bound Inhibitor CK0944636 提交 2008-07-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 B 1–394（394 aa）
未记录 N23 N-[2-(2-methyl-1H-indol-3-yl)ethyl]thiophene-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；8% PEG 8000, 50 mM HEPES, pH 7.5, 100 mM KSCN, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.70 Å R-free 0.262
3DXM Structure of Bos taurus Arp2/3 Complex with Bound Inhibitor CK0993548 提交 2008-07-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 B 1–394（394 aa）
未记录 N24 (2S)-2-(3-bromophenyl)-3-(5-chloro-2-hydroxyphenyl)-1,3-thiazolidin-4-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；8% PEG 8000, 50 mM HEPES, pH 7.5,100 mM KSCN, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.85 Å R-free 0.258
3RSE Structural and biochemical characterization of two binding sites for nucleation promoting factor WASp-VCA on Arp2/3 complex 提交 2011-05-02 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 B 1–394（394 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；100 mM HEPES 7.5, 8% PEG 8000, 200 mM KCl, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.65 Å R-free 0.259
3UKR Crystal structure of Bos taurus Arp2/3 complex with bound inhibitor CK-666 提交 2011-11-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 B 1–394（394 aa）
未记录 CKH 2-fluoro-N-[2-(2-methyl-1H-indol-3-yl)ethyl]benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；0.1M Hepes (pH 7.5), 0.2M KSCN, 16% PEG 8000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.48 Å R-free 0.261
3UKU Structure of Arp2/3 complex with bound inhibitor CK-869 提交 2011-11-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 B 1–394（394 aa）
未记录 C69 (2S)-2-(3-bromophenyl)-3-(2,4-dimethoxyphenyl)-1,3-thiazolidin-4-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；278 K；8% PEG 8000, 50 mM HEPES, pH 7.5, 100 mM KSCN, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 278K
分辨率 2.75 Å R-free 0.301
3ULE Structure of Bos taurus Arp2/3 complex with bound inhibitor CK-869 and ATP 提交 2011-11-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 B 1–394（394 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 C69 (2S)-2-(3-bromophenyl)-3-(2,4-dimethoxyphenyl)-1,3-thiazolidin-4-one × 1 CA CALCIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；277 K；8% PEG 8000, 50 mM HEPES, pH 7.5,100 mM KSCN, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.50 Å R-free 0.274
4XEI Orthorhombic isomorph of bovine Arp2/3 complex 提交 2014-12-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 B 1–394（394 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；277 K；Ethanol 10%, 1,4-butanediol 15%, 100 mM Tris 7.4
分辨率 3.87 Å R-free 0.329
4XF2 Tetragonal structure of Arp2/3 complex 提交 2014-12-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 B 1–394（394 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；100 mM Tris 7.0, 15% ethanol
分辨率 5.00 Å R-free 0.303
4XF2 Tetragonal structure of Arp2/3 complex 提交 2014-12-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 U 1–394（394 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；100 mM Tris 7.0, 15% ethanol
分辨率 5.00 Å R-free 0.303
6DEC Crystal structure of Bos taurus Arp2/3 complex binding with C-terminus of Homo sapiens SPIN90 提交 2018-05-11 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 B 1–394（394 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；50 mM HEPES, pH 7.5, 5% PEG3350, 50 mM L-Proline, 0.5 mM ATP, 0.5 mM calcium chloride, 1 mM DTT
分辨率 4.60 Å R-free 0.314
6DEC Crystal structure of Bos taurus Arp2/3 complex binding with C-terminus of Homo sapiens SPIN90 提交 2018-05-11 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 I 1–394（394 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；50 mM HEPES, pH 7.5, 5% PEG3350, 50 mM L-Proline, 0.5 mM ATP, 0.5 mM calcium chloride, 1 mM DTT
分辨率 4.60 Å R-free 0.314
7JPN Cryo-EM structure of Arpin-bound Arp2/3 complex 提交 2020-08-09 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 B 4–380（377 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Grids were manually blotted for 3 seconds with Whatman 41 filter paper and manually plunged using a Leica EM CPC manual plunger.
分辨率 3.24 Å
7T5Q Cryo-EM Structure of a Transition State of Arp2/3 Complex Activation 提交 2021-12-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 B 1–394（394 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 3 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Grids were manually blotted for 3 seconds with Whatman 41 filter paper and manually plunged using a Leica EM CPC manual plunger.
分辨率 3.40 Å
7TPT Single-particle Cryo-EM structure of Arp2/3 complex at branched-actin junction. 提交 2022-01-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric
链 B 1–394（394 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 16 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 16 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8TAH Cryo-EM structure of Cortactin-bound to Arp2/3 complex 提交 2023-06-27 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 B 1–394（394 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7；10 mM imidazole pH 7.0, 50 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.89 Å
9DLX Bovine Arp2/3 complex with N-WASP CA bound to Arp3 and Arp2-ArpC1 提交 2024-09-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 B 1–390（390 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.91 Å
9DLZ Bovine Arp2/3 complex with N-WASP CA bound to Arp3 提交 2024-09-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 B 1–390（390 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
9EAM Coronin-7 CA bound to Arp2/3 complex 提交 2024-11-11 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 B 1–394（394 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.97 Å
9M5E Structure of SPIN90 dimer-Arp2/3 complex-nucleated actin filament (singlet complex) 提交 2025-03-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric
链 B 1–394（394 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.55 Å
9M64 Structure of SPIN90 dimer-Arp2/3 complexes-nucleated actin filaments (Doublet Complex) 提交 2025-03-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric
链 B 1–394（394 aa）
链 b 1–394（394 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 12 MG MAGNESIUM ION × 10 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å

共 26 个其他 PDB 条目、28 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ARP2_BOVIN
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B； PDB构建体 1–394； UniProt 1–394

Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B

物种未注明

UniProt Q58CQ2

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白拷贝数一致 链 C； UniProt 1–372 未记录 Actin-related protein 3 × 1 （P61157） Actin-related protein 2 × 1 （A7MB62） Actin-related protein 2/3 complex subunit 2 × 1 （Q3MHR7） Actin-related protein 2/3 complex subunit 3 × 1 （Q3T035） Actin-related protein 2/3 complex subunit 4 × 1 （Q148J6） Actin-related protein 2/3 complex subunit 5 × 1 （Q3SYX9） Glia maturation factor gamma × 1 （Q9ERL7） CA CALCIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 2 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取环境条件 分辨率 3.08 Å R-free 0.248

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 4JD2 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1K8K Crystal Structure of Arp2/3 Complex 提交 2001-10-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 C 1–372（372 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；PEG 8000, KSCN, Hepes at pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 298K
分辨率 2.00 Å R-free 0.251
2P9I Crystal Structure of bovine Arp2/3 Complex co-crystallized with ADP and crosslinked with gluteraldehyde 提交 2007-03-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 C 1–372（372 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；7.5% PEG 3350 50mM HEPES 100mM KSCN 10% Sucrose, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.46 Å R-free 0.261
2P9K Crystal structure of bovine Arp2/3 complex co-crystallized with ATP and crosslinked with glutaraldehyde 提交 2007-03-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 C 1–372（372 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；278 K；7.5% PEG 3350, 50mM HEPES, 100mM KSCN, 10% Sucrose, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 278K
分辨率 2.59 Å R-free 0.260
2P9L Crystal Structure of bovine Arp2/3 complex 提交 2007-03-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 C 1–372（372 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；7.5% PEG3350 50mM HEPES 100mM KSCN 10% Sucrose, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.65 Å R-free 0.266
2P9N Crystal Structure of bovine Arp2/3 complex co-crystallized with ADP 提交 2007-03-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 C 1–372（372 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；6% PEG 8000 100mM HEPES 100mM KSCN, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.85 Å R-free 0.272
2P9P Crystal Structure of bovine Arp2/3 complex co-crystallized with ADP 提交 2007-03-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 C 1–372（372 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；7.5% PEG 3350 50mM HEPES 100mM KSCN 10% Sucrose, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.90 Å R-free 0.288
2P9S Structure of bovine Arp2/3 complex co-crystallized with ATP/Mg2+ 提交 2007-03-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 C 1–372（372 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；7.5% PEG3350 50mM HEPES 100mM KSCN 10% Sucrose, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.68 Å R-free 0.261
2P9U Crystal structure of bovine Arp2/3 complex co-crystallized with AMP-PNP and calcium 提交 2007-03-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 C 1–372（372 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 2 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；7.5% PEG3350 50mM HEPES 100mM KSCN 10% Sucrose, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.75 Å R-free 0.265
3DXK Structure of Bos Taurus Arp2/3 Complex with Bound Inhibitor CK0944636 提交 2008-07-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 C 1–372（372 aa）
未记录 N23 N-[2-(2-methyl-1H-indol-3-yl)ethyl]thiophene-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；8% PEG 8000, 50 mM HEPES, pH 7.5, 100 mM KSCN, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.70 Å R-free 0.262
3DXM Structure of Bos taurus Arp2/3 Complex with Bound Inhibitor CK0993548 提交 2008-07-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 C 1–372（372 aa）
未记录 N24 (2S)-2-(3-bromophenyl)-3-(5-chloro-2-hydroxyphenyl)-1,3-thiazolidin-4-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；8% PEG 8000, 50 mM HEPES, pH 7.5,100 mM KSCN, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.85 Å R-free 0.258
3RSE Structural and biochemical characterization of two binding sites for nucleation promoting factor WASp-VCA on Arp2/3 complex 提交 2011-05-02 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 C 1–372（372 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；100 mM HEPES 7.5, 8% PEG 8000, 200 mM KCl, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.65 Å R-free 0.259
3UKR Crystal structure of Bos taurus Arp2/3 complex with bound inhibitor CK-666 提交 2011-11-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 C 1–372（372 aa）
未记录 CKH 2-fluoro-N-[2-(2-methyl-1H-indol-3-yl)ethyl]benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；0.1M Hepes (pH 7.5), 0.2M KSCN, 16% PEG 8000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.48 Å R-free 0.261
3UKU Structure of Arp2/3 complex with bound inhibitor CK-869 提交 2011-11-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 C 1–372（372 aa）
未记录 C69 (2S)-2-(3-bromophenyl)-3-(2,4-dimethoxyphenyl)-1,3-thiazolidin-4-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；278 K；8% PEG 8000, 50 mM HEPES, pH 7.5, 100 mM KSCN, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 278K
分辨率 2.75 Å R-free 0.301
3ULE Structure of Bos taurus Arp2/3 complex with bound inhibitor CK-869 and ATP 提交 2011-11-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 C 1–372（372 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 C69 (2S)-2-(3-bromophenyl)-3-(2,4-dimethoxyphenyl)-1,3-thiazolidin-4-one × 1 CA CALCIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；277 K；8% PEG 8000, 50 mM HEPES, pH 7.5,100 mM KSCN, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.50 Å R-free 0.274
4XEI Orthorhombic isomorph of bovine Arp2/3 complex 提交 2014-12-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 C 1–372（372 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；277 K；Ethanol 10%, 1,4-butanediol 15%, 100 mM Tris 7.4
分辨率 3.87 Å R-free 0.329
4XF2 Tetragonal structure of Arp2/3 complex 提交 2014-12-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 C 1–372（372 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；100 mM Tris 7.0, 15% ethanol
分辨率 5.00 Å R-free 0.303
4XF2 Tetragonal structure of Arp2/3 complex 提交 2014-12-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 V 1–372（372 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；100 mM Tris 7.0, 15% ethanol
分辨率 5.00 Å R-free 0.303
6DEC Crystal structure of Bos taurus Arp2/3 complex binding with C-terminus of Homo sapiens SPIN90 提交 2018-05-11 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 C 1–372（372 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；50 mM HEPES, pH 7.5, 5% PEG3350, 50 mM L-Proline, 0.5 mM ATP, 0.5 mM calcium chloride, 1 mM DTT
分辨率 4.60 Å R-free 0.314
6DEC Crystal structure of Bos taurus Arp2/3 complex binding with C-terminus of Homo sapiens SPIN90 提交 2018-05-11 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 J 1–372（372 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；50 mM HEPES, pH 7.5, 5% PEG3350, 50 mM L-Proline, 0.5 mM ATP, 0.5 mM calcium chloride, 1 mM DTT
分辨率 4.60 Å R-free 0.314
7JPN Cryo-EM structure of Arpin-bound Arp2/3 complex 提交 2020-08-09 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 C 1–372（372 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Grids were manually blotted for 3 seconds with Whatman 41 filter paper and manually plunged using a Leica EM CPC manual plunger.
分辨率 3.24 Å
7TPT Single-particle Cryo-EM structure of Arp2/3 complex at branched-actin junction. 提交 2022-01-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric
链 C 1–372（372 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 16 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 16 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
9M5E Structure of SPIN90 dimer-Arp2/3 complex-nucleated actin filament (singlet complex) 提交 2025-03-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric
链 C 1–372（372 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.55 Å
9M64 Structure of SPIN90 dimer-Arp2/3 complexes-nucleated actin filaments (Doublet Complex) 提交 2025-03-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric
链 C 1–372（372 aa）
链 c 1–372（372 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 12 MG MAGNESIUM ION × 10 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å

共 21 个其他 PDB 条目、23 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ARC1B_BOVIN
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 C； PDB构建体 1–372； UniProt 1–372

Actin-related protein 2/3 complex subunit 2

物种未注明

UniProt Q3MHR7

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白拷贝数一致 链 D； UniProt 1–300 未记录 Actin-related protein 3 × 1 （P61157） Actin-related protein 2 × 1 （A7MB62） Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B × 1 （Q58CQ2） Actin-related protein 2/3 complex subunit 3 × 1 （Q3T035） Actin-related protein 2/3 complex subunit 4 × 1 （Q148J6） Actin-related protein 2/3 complex subunit 5 × 1 （Q3SYX9） Glia maturation factor gamma × 1 （Q9ERL7） CA CALCIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 2 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取环境条件 分辨率 3.08 Å R-free 0.248

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 4JD2 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1K8K Crystal Structure of Arp2/3 Complex 提交 2001-10-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 D 1–300（300 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；PEG 8000, KSCN, Hepes at pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 298K
分辨率 2.00 Å R-free 0.251
2P9I Crystal Structure of bovine Arp2/3 Complex co-crystallized with ADP and crosslinked with gluteraldehyde 提交 2007-03-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 D 1–300（300 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；7.5% PEG 3350 50mM HEPES 100mM KSCN 10% Sucrose, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.46 Å R-free 0.261
2P9K Crystal structure of bovine Arp2/3 complex co-crystallized with ATP and crosslinked with glutaraldehyde 提交 2007-03-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 D 1–300（300 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；278 K；7.5% PEG 3350, 50mM HEPES, 100mM KSCN, 10% Sucrose, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 278K
分辨率 2.59 Å R-free 0.260
2P9L Crystal Structure of bovine Arp2/3 complex 提交 2007-03-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 D 1–300（300 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；7.5% PEG3350 50mM HEPES 100mM KSCN 10% Sucrose, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.65 Å R-free 0.266
2P9N Crystal Structure of bovine Arp2/3 complex co-crystallized with ADP 提交 2007-03-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 D 1–300（300 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；6% PEG 8000 100mM HEPES 100mM KSCN, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.85 Å R-free 0.272
2P9P Crystal Structure of bovine Arp2/3 complex co-crystallized with ADP 提交 2007-03-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 D 1–300（300 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；7.5% PEG 3350 50mM HEPES 100mM KSCN 10% Sucrose, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.90 Å R-free 0.288
2P9S Structure of bovine Arp2/3 complex co-crystallized with ATP/Mg2+ 提交 2007-03-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 D 1–300（300 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；7.5% PEG3350 50mM HEPES 100mM KSCN 10% Sucrose, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.68 Å R-free 0.261
2P9U Crystal structure of bovine Arp2/3 complex co-crystallized with AMP-PNP and calcium 提交 2007-03-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 D 1–300（300 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 2 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；7.5% PEG3350 50mM HEPES 100mM KSCN 10% Sucrose, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.75 Å R-free 0.265
3DXK Structure of Bos Taurus Arp2/3 Complex with Bound Inhibitor CK0944636 提交 2008-07-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 D 1–300（300 aa）
未记录 N23 N-[2-(2-methyl-1H-indol-3-yl)ethyl]thiophene-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；8% PEG 8000, 50 mM HEPES, pH 7.5, 100 mM KSCN, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.70 Å R-free 0.262
3DXM Structure of Bos taurus Arp2/3 Complex with Bound Inhibitor CK0993548 提交 2008-07-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 D 1–300（300 aa）
未记录 N24 (2S)-2-(3-bromophenyl)-3-(5-chloro-2-hydroxyphenyl)-1,3-thiazolidin-4-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；8% PEG 8000, 50 mM HEPES, pH 7.5,100 mM KSCN, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.85 Å R-free 0.258
3RSE Structural and biochemical characterization of two binding sites for nucleation promoting factor WASp-VCA on Arp2/3 complex 提交 2011-05-02 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 D 1–300（300 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；100 mM HEPES 7.5, 8% PEG 8000, 200 mM KCl, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.65 Å R-free 0.259
3UKR Crystal structure of Bos taurus Arp2/3 complex with bound inhibitor CK-666 提交 2011-11-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 D 1–300（300 aa）
未记录 CKH 2-fluoro-N-[2-(2-methyl-1H-indol-3-yl)ethyl]benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；0.1M Hepes (pH 7.5), 0.2M KSCN, 16% PEG 8000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.48 Å R-free 0.261
3UKU Structure of Arp2/3 complex with bound inhibitor CK-869 提交 2011-11-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 D 1–300（300 aa）
未记录 C69 (2S)-2-(3-bromophenyl)-3-(2,4-dimethoxyphenyl)-1,3-thiazolidin-4-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；278 K；8% PEG 8000, 50 mM HEPES, pH 7.5, 100 mM KSCN, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 278K
分辨率 2.75 Å R-free 0.301
3ULE Structure of Bos taurus Arp2/3 complex with bound inhibitor CK-869 and ATP 提交 2011-11-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 D 1–300（300 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 C69 (2S)-2-(3-bromophenyl)-3-(2,4-dimethoxyphenyl)-1,3-thiazolidin-4-one × 1 CA CALCIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；277 K；8% PEG 8000, 50 mM HEPES, pH 7.5,100 mM KSCN, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.50 Å R-free 0.274
4XEI Orthorhombic isomorph of bovine Arp2/3 complex 提交 2014-12-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 D 1–300（300 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；277 K；Ethanol 10%, 1,4-butanediol 15%, 100 mM Tris 7.4
分辨率 3.87 Å R-free 0.329
4XF2 Tetragonal structure of Arp2/3 complex 提交 2014-12-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 D 1–300（300 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；100 mM Tris 7.0, 15% ethanol
分辨率 5.00 Å R-free 0.303
4XF2 Tetragonal structure of Arp2/3 complex 提交 2014-12-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 W 1–300（300 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；100 mM Tris 7.0, 15% ethanol
分辨率 5.00 Å R-free 0.303
6DEC Crystal structure of Bos taurus Arp2/3 complex binding with C-terminus of Homo sapiens SPIN90 提交 2018-05-11 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 D 1–300（300 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；50 mM HEPES, pH 7.5, 5% PEG3350, 50 mM L-Proline, 0.5 mM ATP, 0.5 mM calcium chloride, 1 mM DTT
分辨率 4.60 Å R-free 0.314
6DEC Crystal structure of Bos taurus Arp2/3 complex binding with C-terminus of Homo sapiens SPIN90 提交 2018-05-11 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 K 1–300（300 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；50 mM HEPES, pH 7.5, 5% PEG3350, 50 mM L-Proline, 0.5 mM ATP, 0.5 mM calcium chloride, 1 mM DTT
分辨率 4.60 Å R-free 0.314
7JPN Cryo-EM structure of Arpin-bound Arp2/3 complex 提交 2020-08-09 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 D 1–300（300 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Grids were manually blotted for 3 seconds with Whatman 41 filter paper and manually plunged using a Leica EM CPC manual plunger.
分辨率 3.24 Å
7T5Q Cryo-EM Structure of a Transition State of Arp2/3 Complex Activation 提交 2021-12-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 D 1–300（300 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 3 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Grids were manually blotted for 3 seconds with Whatman 41 filter paper and manually plunged using a Leica EM CPC manual plunger.
分辨率 3.40 Å
7TPT Single-particle Cryo-EM structure of Arp2/3 complex at branched-actin junction. 提交 2022-01-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric
链 D 1–300（300 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 16 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 16 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8TAH Cryo-EM structure of Cortactin-bound to Arp2/3 complex 提交 2023-06-27 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 D 1–300（300 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7；10 mM imidazole pH 7.0, 50 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.89 Å
9DLX Bovine Arp2/3 complex with N-WASP CA bound to Arp3 and Arp2-ArpC1 提交 2024-09-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 D 1–285（285 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.91 Å
9DLZ Bovine Arp2/3 complex with N-WASP CA bound to Arp3 提交 2024-09-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 D 1–285（285 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
9EAM Coronin-7 CA bound to Arp2/3 complex 提交 2024-11-11 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 D 1–300（300 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.97 Å
9M5E Structure of SPIN90 dimer-Arp2/3 complex-nucleated actin filament (singlet complex) 提交 2025-03-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric
链 D 1–300（300 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.55 Å
9M64 Structure of SPIN90 dimer-Arp2/3 complexes-nucleated actin filaments (Doublet Complex) 提交 2025-03-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric
链 D 1–300（300 aa）
链 d 1–300（300 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 12 MG MAGNESIUM ION × 10 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å

共 26 个其他 PDB 条目、28 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ARPC2_BOVIN
Isoform —
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 D； PDB构建体 1–300； UniProt 1–300

Actin-related protein 2/3 complex subunit 3

物种未注明

UniProt Q3T035

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白拷贝数一致 链 E； UniProt 1–178 未记录 Actin-related protein 3 × 1 （P61157） Actin-related protein 2 × 1 （A7MB62） Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B × 1 （Q58CQ2） Actin-related protein 2/3 complex subunit 2 × 1 （Q3MHR7） Actin-related protein 2/3 complex subunit 4 × 1 （Q148J6） Actin-related protein 2/3 complex subunit 5 × 1 （Q3SYX9） Glia maturation factor gamma × 1 （Q9ERL7） CA CALCIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 2 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取环境条件 分辨率 3.08 Å R-free 0.248

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 4JD2 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1K8K Crystal Structure of Arp2/3 Complex 提交 2001-10-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 E 1–178（178 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；PEG 8000, KSCN, Hepes at pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 298K
分辨率 2.00 Å R-free 0.251
2P9I Crystal Structure of bovine Arp2/3 Complex co-crystallized with ADP and crosslinked with gluteraldehyde 提交 2007-03-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 E 1–178（178 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；7.5% PEG 3350 50mM HEPES 100mM KSCN 10% Sucrose, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.46 Å R-free 0.261
2P9K Crystal structure of bovine Arp2/3 complex co-crystallized with ATP and crosslinked with glutaraldehyde 提交 2007-03-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 E 1–178（178 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；278 K；7.5% PEG 3350, 50mM HEPES, 100mM KSCN, 10% Sucrose, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 278K
分辨率 2.59 Å R-free 0.260
2P9L Crystal Structure of bovine Arp2/3 complex 提交 2007-03-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 E 1–178（178 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；7.5% PEG3350 50mM HEPES 100mM KSCN 10% Sucrose, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.65 Å R-free 0.266
2P9N Crystal Structure of bovine Arp2/3 complex co-crystallized with ADP 提交 2007-03-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 E 1–178（178 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；6% PEG 8000 100mM HEPES 100mM KSCN, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.85 Å R-free 0.272
2P9P Crystal Structure of bovine Arp2/3 complex co-crystallized with ADP 提交 2007-03-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 E 1–178（178 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；7.5% PEG 3350 50mM HEPES 100mM KSCN 10% Sucrose, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.90 Å R-free 0.288
2P9S Structure of bovine Arp2/3 complex co-crystallized with ATP/Mg2+ 提交 2007-03-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 E 1–178（178 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；7.5% PEG3350 50mM HEPES 100mM KSCN 10% Sucrose, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.68 Å R-free 0.261
2P9U Crystal structure of bovine Arp2/3 complex co-crystallized with AMP-PNP and calcium 提交 2007-03-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 E 1–178（178 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 2 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；7.5% PEG3350 50mM HEPES 100mM KSCN 10% Sucrose, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.75 Å R-free 0.265
3DXK Structure of Bos Taurus Arp2/3 Complex with Bound Inhibitor CK0944636 提交 2008-07-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 E 1–178（178 aa）
未记录 N23 N-[2-(2-methyl-1H-indol-3-yl)ethyl]thiophene-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；8% PEG 8000, 50 mM HEPES, pH 7.5, 100 mM KSCN, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.70 Å R-free 0.262
3DXM Structure of Bos taurus Arp2/3 Complex with Bound Inhibitor CK0993548 提交 2008-07-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 E 1–178（178 aa）
未记录 N24 (2S)-2-(3-bromophenyl)-3-(5-chloro-2-hydroxyphenyl)-1,3-thiazolidin-4-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；8% PEG 8000, 50 mM HEPES, pH 7.5,100 mM KSCN, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.85 Å R-free 0.258
3RSE Structural and biochemical characterization of two binding sites for nucleation promoting factor WASp-VCA on Arp2/3 complex 提交 2011-05-02 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 E 1–178（178 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；100 mM HEPES 7.5, 8% PEG 8000, 200 mM KCl, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.65 Å R-free 0.259
3UKR Crystal structure of Bos taurus Arp2/3 complex with bound inhibitor CK-666 提交 2011-11-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 E 1–178（178 aa）
未记录 CKH 2-fluoro-N-[2-(2-methyl-1H-indol-3-yl)ethyl]benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；0.1M Hepes (pH 7.5), 0.2M KSCN, 16% PEG 8000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.48 Å R-free 0.261
3UKU Structure of Arp2/3 complex with bound inhibitor CK-869 提交 2011-11-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 E 1–178（178 aa）
未记录 C69 (2S)-2-(3-bromophenyl)-3-(2,4-dimethoxyphenyl)-1,3-thiazolidin-4-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；278 K；8% PEG 8000, 50 mM HEPES, pH 7.5, 100 mM KSCN, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 278K
分辨率 2.75 Å R-free 0.301
3ULE Structure of Bos taurus Arp2/3 complex with bound inhibitor CK-869 and ATP 提交 2011-11-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 E 1–178（178 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 C69 (2S)-2-(3-bromophenyl)-3-(2,4-dimethoxyphenyl)-1,3-thiazolidin-4-one × 1 CA CALCIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；277 K；8% PEG 8000, 50 mM HEPES, pH 7.5,100 mM KSCN, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.50 Å R-free 0.274
4XEI Orthorhombic isomorph of bovine Arp2/3 complex 提交 2014-12-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 E 1–178（178 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；277 K；Ethanol 10%, 1,4-butanediol 15%, 100 mM Tris 7.4
分辨率 3.87 Å R-free 0.329
4XF2 Tetragonal structure of Arp2/3 complex 提交 2014-12-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 E 1–178（178 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；100 mM Tris 7.0, 15% ethanol
分辨率 5.00 Å R-free 0.303
4XF2 Tetragonal structure of Arp2/3 complex 提交 2014-12-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 X 1–178（178 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；100 mM Tris 7.0, 15% ethanol
分辨率 5.00 Å R-free 0.303
6DEC Crystal structure of Bos taurus Arp2/3 complex binding with C-terminus of Homo sapiens SPIN90 提交 2018-05-11 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 E 1–178（178 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；50 mM HEPES, pH 7.5, 5% PEG3350, 50 mM L-Proline, 0.5 mM ATP, 0.5 mM calcium chloride, 1 mM DTT
分辨率 4.60 Å R-free 0.314
6DEC Crystal structure of Bos taurus Arp2/3 complex binding with C-terminus of Homo sapiens SPIN90 提交 2018-05-11 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 L 1–178（178 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；50 mM HEPES, pH 7.5, 5% PEG3350, 50 mM L-Proline, 0.5 mM ATP, 0.5 mM calcium chloride, 1 mM DTT
分辨率 4.60 Å R-free 0.314
7JPN Cryo-EM structure of Arpin-bound Arp2/3 complex 提交 2020-08-09 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 E 1–178（178 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Grids were manually blotted for 3 seconds with Whatman 41 filter paper and manually plunged using a Leica EM CPC manual plunger.
分辨率 3.24 Å
7T5Q Cryo-EM Structure of a Transition State of Arp2/3 Complex Activation 提交 2021-12-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 E 1–178（178 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 3 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Grids were manually blotted for 3 seconds with Whatman 41 filter paper and manually plunged using a Leica EM CPC manual plunger.
分辨率 3.40 Å
7TPT Single-particle Cryo-EM structure of Arp2/3 complex at branched-actin junction. 提交 2022-01-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric
链 E 1–178（178 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 16 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 16 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8TAH Cryo-EM structure of Cortactin-bound to Arp2/3 complex 提交 2023-06-27 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 E 1–178（178 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7；10 mM imidazole pH 7.0, 50 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.89 Å
9DLX Bovine Arp2/3 complex with N-WASP CA bound to Arp3 and Arp2-ArpC1 提交 2024-09-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 E 2–176（175 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.91 Å
9DLZ Bovine Arp2/3 complex with N-WASP CA bound to Arp3 提交 2024-09-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 E 2–176（175 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
9EAM Coronin-7 CA bound to Arp2/3 complex 提交 2024-11-11 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 E 1–178（178 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.97 Å
9M5E Structure of SPIN90 dimer-Arp2/3 complex-nucleated actin filament (singlet complex) 提交 2025-03-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric
链 E 1–178（178 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.55 Å
9M64 Structure of SPIN90 dimer-Arp2/3 complexes-nucleated actin filaments (Doublet Complex) 提交 2025-03-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric
链 E 1–178（178 aa）
链 e 1–178（178 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 12 MG MAGNESIUM ION × 10 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å

共 26 个其他 PDB 条目、28 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ARPC3_BOVIN
Isoform —
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 E； PDB构建体 1–178； UniProt 1–178

Actin-related protein 2/3 complex subunit 4

物种未注明

UniProt Q148J6

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白拷贝数一致 链 F； UniProt 1–168 未记录 Actin-related protein 3 × 1 （P61157） Actin-related protein 2 × 1 （A7MB62） Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B × 1 （Q58CQ2） Actin-related protein 2/3 complex subunit 2 × 1 （Q3MHR7） Actin-related protein 2/3 complex subunit 3 × 1 （Q3T035） Actin-related protein 2/3 complex subunit 5 × 1 （Q3SYX9） Glia maturation factor gamma × 1 （Q9ERL7） CA CALCIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 2 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取环境条件 分辨率 3.08 Å R-free 0.248

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 4JD2 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1K8K Crystal Structure of Arp2/3 Complex 提交 2001-10-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 F 1–168（168 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；PEG 8000, KSCN, Hepes at pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 298K
分辨率 2.00 Å R-free 0.251
2P9I Crystal Structure of bovine Arp2/3 Complex co-crystallized with ADP and crosslinked with gluteraldehyde 提交 2007-03-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 F 1–168（168 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；7.5% PEG 3350 50mM HEPES 100mM KSCN 10% Sucrose, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.46 Å R-free 0.261
2P9K Crystal structure of bovine Arp2/3 complex co-crystallized with ATP and crosslinked with glutaraldehyde 提交 2007-03-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 F 1–168（168 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；278 K；7.5% PEG 3350, 50mM HEPES, 100mM KSCN, 10% Sucrose, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 278K
分辨率 2.59 Å R-free 0.260
2P9L Crystal Structure of bovine Arp2/3 complex 提交 2007-03-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 F 1–168（168 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；7.5% PEG3350 50mM HEPES 100mM KSCN 10% Sucrose, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.65 Å R-free 0.266
2P9N Crystal Structure of bovine Arp2/3 complex co-crystallized with ADP 提交 2007-03-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 F 1–168（168 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；6% PEG 8000 100mM HEPES 100mM KSCN, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.85 Å R-free 0.272
2P9P Crystal Structure of bovine Arp2/3 complex co-crystallized with ADP 提交 2007-03-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 F 1–168（168 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；7.5% PEG 3350 50mM HEPES 100mM KSCN 10% Sucrose, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.90 Å R-free 0.288
2P9S Structure of bovine Arp2/3 complex co-crystallized with ATP/Mg2+ 提交 2007-03-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 F 1–168（168 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；7.5% PEG3350 50mM HEPES 100mM KSCN 10% Sucrose, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.68 Å R-free 0.261
2P9U Crystal structure of bovine Arp2/3 complex co-crystallized with AMP-PNP and calcium 提交 2007-03-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 F 1–168（168 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 2 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；7.5% PEG3350 50mM HEPES 100mM KSCN 10% Sucrose, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.75 Å R-free 0.265
3DXK Structure of Bos Taurus Arp2/3 Complex with Bound Inhibitor CK0944636 提交 2008-07-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 F 1–168（168 aa）
未记录 N23 N-[2-(2-methyl-1H-indol-3-yl)ethyl]thiophene-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；8% PEG 8000, 50 mM HEPES, pH 7.5, 100 mM KSCN, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.70 Å R-free 0.262
3DXM Structure of Bos taurus Arp2/3 Complex with Bound Inhibitor CK0993548 提交 2008-07-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 F 1–168（168 aa）
未记录 N24 (2S)-2-(3-bromophenyl)-3-(5-chloro-2-hydroxyphenyl)-1,3-thiazolidin-4-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；8% PEG 8000, 50 mM HEPES, pH 7.5,100 mM KSCN, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.85 Å R-free 0.258
3RSE Structural and biochemical characterization of two binding sites for nucleation promoting factor WASp-VCA on Arp2/3 complex 提交 2011-05-02 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 F 1–168（168 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；100 mM HEPES 7.5, 8% PEG 8000, 200 mM KCl, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.65 Å R-free 0.259
3UKR Crystal structure of Bos taurus Arp2/3 complex with bound inhibitor CK-666 提交 2011-11-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 F 1–168（168 aa）
未记录 CKH 2-fluoro-N-[2-(2-methyl-1H-indol-3-yl)ethyl]benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；0.1M Hepes (pH 7.5), 0.2M KSCN, 16% PEG 8000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.48 Å R-free 0.261
3UKU Structure of Arp2/3 complex with bound inhibitor CK-869 提交 2011-11-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 F 1–168（168 aa）
未记录 C69 (2S)-2-(3-bromophenyl)-3-(2,4-dimethoxyphenyl)-1,3-thiazolidin-4-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；278 K；8% PEG 8000, 50 mM HEPES, pH 7.5, 100 mM KSCN, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 278K
分辨率 2.75 Å R-free 0.301
3ULE Structure of Bos taurus Arp2/3 complex with bound inhibitor CK-869 and ATP 提交 2011-11-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 F 1–168（168 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 C69 (2S)-2-(3-bromophenyl)-3-(2,4-dimethoxyphenyl)-1,3-thiazolidin-4-one × 1 CA CALCIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；277 K；8% PEG 8000, 50 mM HEPES, pH 7.5,100 mM KSCN, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.50 Å R-free 0.274
4XEI Orthorhombic isomorph of bovine Arp2/3 complex 提交 2014-12-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 F 1–168（168 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；277 K；Ethanol 10%, 1,4-butanediol 15%, 100 mM Tris 7.4
分辨率 3.87 Å R-free 0.329
4XF2 Tetragonal structure of Arp2/3 complex 提交 2014-12-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 F 1–168（168 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；100 mM Tris 7.0, 15% ethanol
分辨率 5.00 Å R-free 0.303
4XF2 Tetragonal structure of Arp2/3 complex 提交 2014-12-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 Y 1–168（168 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；100 mM Tris 7.0, 15% ethanol
分辨率 5.00 Å R-free 0.303
6DEC Crystal structure of Bos taurus Arp2/3 complex binding with C-terminus of Homo sapiens SPIN90 提交 2018-05-11 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 F 1–168（168 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；50 mM HEPES, pH 7.5, 5% PEG3350, 50 mM L-Proline, 0.5 mM ATP, 0.5 mM calcium chloride, 1 mM DTT
分辨率 4.60 Å R-free 0.314
6DEC Crystal structure of Bos taurus Arp2/3 complex binding with C-terminus of Homo sapiens SPIN90 提交 2018-05-11 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 N 1–168（168 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；50 mM HEPES, pH 7.5, 5% PEG3350, 50 mM L-Proline, 0.5 mM ATP, 0.5 mM calcium chloride, 1 mM DTT
分辨率 4.60 Å R-free 0.314
7JPN Cryo-EM structure of Arpin-bound Arp2/3 complex 提交 2020-08-09 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 F 1–168（168 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Grids were manually blotted for 3 seconds with Whatman 41 filter paper and manually plunged using a Leica EM CPC manual plunger.
分辨率 3.24 Å
7T5Q Cryo-EM Structure of a Transition State of Arp2/3 Complex Activation 提交 2021-12-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 F 1–168（168 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 3 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Grids were manually blotted for 3 seconds with Whatman 41 filter paper and manually plunged using a Leica EM CPC manual plunger.
分辨率 3.40 Å
7TPT Single-particle Cryo-EM structure of Arp2/3 complex at branched-actin junction. 提交 2022-01-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric
链 F 1–168（168 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 16 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 16 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8TAH Cryo-EM structure of Cortactin-bound to Arp2/3 complex 提交 2023-06-27 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 F 1–168（168 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7；10 mM imidazole pH 7.0, 50 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.89 Å
9DLX Bovine Arp2/3 complex with N-WASP CA bound to Arp3 and Arp2-ArpC1 提交 2024-09-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 F 2–168（167 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.91 Å
9DLZ Bovine Arp2/3 complex with N-WASP CA bound to Arp3 提交 2024-09-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 F 2–168（167 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
9EAM Coronin-7 CA bound to Arp2/3 complex 提交 2024-11-11 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 F 1–168（168 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.97 Å
9M5E Structure of SPIN90 dimer-Arp2/3 complex-nucleated actin filament (singlet complex) 提交 2025-03-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric
链 F 1–168（168 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.55 Å
9M64 Structure of SPIN90 dimer-Arp2/3 complexes-nucleated actin filaments (Doublet Complex) 提交 2025-03-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric
链 F 1–168（168 aa）
链 f 1–168（168 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 12 MG MAGNESIUM ION × 10 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å

共 26 个其他 PDB 条目、28 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ARPC4_BOVIN
Isoform —
PDB实体 6
链与序列区间 作者链 F； PDB构建体 1–168； UniProt 1–168

Actin-related protein 2/3 complex subunit 5

物种未注明

UniProt Q3SYX9

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白拷贝数一致 链 G； UniProt 1–151 未记录 Actin-related protein 3 × 1 （P61157） Actin-related protein 2 × 1 （A7MB62） Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B × 1 （Q58CQ2） Actin-related protein 2/3 complex subunit 2 × 1 （Q3MHR7） Actin-related protein 2/3 complex subunit 3 × 1 （Q3T035） Actin-related protein 2/3 complex subunit 4 × 1 （Q148J6） Glia maturation factor gamma × 1 （Q9ERL7） CA CALCIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 2 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取环境条件 分辨率 3.08 Å R-free 0.248

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 4JD2 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1K8K Crystal Structure of Arp2/3 Complex 提交 2001-10-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 G 1–151（151 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；PEG 8000, KSCN, Hepes at pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 298K
分辨率 2.00 Å R-free 0.251
2P9I Crystal Structure of bovine Arp2/3 Complex co-crystallized with ADP and crosslinked with gluteraldehyde 提交 2007-03-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 G 1–151（151 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；7.5% PEG 3350 50mM HEPES 100mM KSCN 10% Sucrose, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.46 Å R-free 0.261
2P9K Crystal structure of bovine Arp2/3 complex co-crystallized with ATP and crosslinked with glutaraldehyde 提交 2007-03-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 G 1–151（151 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；278 K；7.5% PEG 3350, 50mM HEPES, 100mM KSCN, 10% Sucrose, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 278K
分辨率 2.59 Å R-free 0.260
2P9L Crystal Structure of bovine Arp2/3 complex 提交 2007-03-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 G 1–151（151 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；7.5% PEG3350 50mM HEPES 100mM KSCN 10% Sucrose, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.65 Å R-free 0.266
2P9N Crystal Structure of bovine Arp2/3 complex co-crystallized with ADP 提交 2007-03-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 G 1–151（151 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；6% PEG 8000 100mM HEPES 100mM KSCN, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.85 Å R-free 0.272
2P9P Crystal Structure of bovine Arp2/3 complex co-crystallized with ADP 提交 2007-03-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 G 1–151（151 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；7.5% PEG 3350 50mM HEPES 100mM KSCN 10% Sucrose, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.90 Å R-free 0.288
2P9S Structure of bovine Arp2/3 complex co-crystallized with ATP/Mg2+ 提交 2007-03-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 G 1–151（151 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；7.5% PEG3350 50mM HEPES 100mM KSCN 10% Sucrose, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.68 Å R-free 0.261
2P9U Crystal structure of bovine Arp2/3 complex co-crystallized with AMP-PNP and calcium 提交 2007-03-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 G 1–151（151 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 2 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；7.5% PEG3350 50mM HEPES 100mM KSCN 10% Sucrose, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.75 Å R-free 0.265
3DXK Structure of Bos Taurus Arp2/3 Complex with Bound Inhibitor CK0944636 提交 2008-07-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 G 1–151（151 aa）
未记录 N23 N-[2-(2-methyl-1H-indol-3-yl)ethyl]thiophene-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；8% PEG 8000, 50 mM HEPES, pH 7.5, 100 mM KSCN, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.70 Å R-free 0.262
3DXM Structure of Bos taurus Arp2/3 Complex with Bound Inhibitor CK0993548 提交 2008-07-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 G 1–151（151 aa）
未记录 N24 (2S)-2-(3-bromophenyl)-3-(5-chloro-2-hydroxyphenyl)-1,3-thiazolidin-4-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；8% PEG 8000, 50 mM HEPES, pH 7.5,100 mM KSCN, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.85 Å R-free 0.258
3RSE Structural and biochemical characterization of two binding sites for nucleation promoting factor WASp-VCA on Arp2/3 complex 提交 2011-05-02 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 G 1–151（151 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；100 mM HEPES 7.5, 8% PEG 8000, 200 mM KCl, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.65 Å R-free 0.259
3UKR Crystal structure of Bos taurus Arp2/3 complex with bound inhibitor CK-666 提交 2011-11-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 G 1–151（151 aa）
未记录 CKH 2-fluoro-N-[2-(2-methyl-1H-indol-3-yl)ethyl]benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；0.1M Hepes (pH 7.5), 0.2M KSCN, 16% PEG 8000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.48 Å R-free 0.261
3UKU Structure of Arp2/3 complex with bound inhibitor CK-869 提交 2011-11-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 G 1–151（151 aa）
未记录 C69 (2S)-2-(3-bromophenyl)-3-(2,4-dimethoxyphenyl)-1,3-thiazolidin-4-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；278 K；8% PEG 8000, 50 mM HEPES, pH 7.5, 100 mM KSCN, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 278K
分辨率 2.75 Å R-free 0.301
3ULE Structure of Bos taurus Arp2/3 complex with bound inhibitor CK-869 and ATP 提交 2011-11-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 G 1–151（151 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 C69 (2S)-2-(3-bromophenyl)-3-(2,4-dimethoxyphenyl)-1,3-thiazolidin-4-one × 1 CA CALCIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；277 K；8% PEG 8000, 50 mM HEPES, pH 7.5,100 mM KSCN, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.50 Å R-free 0.274
4XEI Orthorhombic isomorph of bovine Arp2/3 complex 提交 2014-12-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 G 1–151（151 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；277 K；Ethanol 10%, 1,4-butanediol 15%, 100 mM Tris 7.4
分辨率 3.87 Å R-free 0.329
4XF2 Tetragonal structure of Arp2/3 complex 提交 2014-12-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 G 1–151（151 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；100 mM Tris 7.0, 15% ethanol
分辨率 5.00 Å R-free 0.303
4XF2 Tetragonal structure of Arp2/3 complex 提交 2014-12-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 Z 1–151（151 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；100 mM Tris 7.0, 15% ethanol
分辨率 5.00 Å R-free 0.303
6DEC Crystal structure of Bos taurus Arp2/3 complex binding with C-terminus of Homo sapiens SPIN90 提交 2018-05-11 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 G 1–151（151 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；50 mM HEPES, pH 7.5, 5% PEG3350, 50 mM L-Proline, 0.5 mM ATP, 0.5 mM calcium chloride, 1 mM DTT
分辨率 4.60 Å R-free 0.314
6DEC Crystal structure of Bos taurus Arp2/3 complex binding with C-terminus of Homo sapiens SPIN90 提交 2018-05-11 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 O 1–151（151 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；50 mM HEPES, pH 7.5, 5% PEG3350, 50 mM L-Proline, 0.5 mM ATP, 0.5 mM calcium chloride, 1 mM DTT
分辨率 4.60 Å R-free 0.314
7T5Q Cryo-EM Structure of a Transition State of Arp2/3 Complex Activation 提交 2021-12-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 G 1–151（151 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 3 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Grids were manually blotted for 3 seconds with Whatman 41 filter paper and manually plunged using a Leica EM CPC manual plunger.
分辨率 3.40 Å
7TPT Single-particle Cryo-EM structure of Arp2/3 complex at branched-actin junction. 提交 2022-01-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric
链 G 1–151（151 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 16 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 16 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
9DLX Bovine Arp2/3 complex with N-WASP CA bound to Arp3 and Arp2-ArpC1 提交 2024-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 G 1–151（151 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.91 Å
9DLZ Bovine Arp2/3 complex with N-WASP CA bound to Arp3 提交 2024-09-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 G 7–151（145 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
9EAM Coronin-7 CA bound to Arp2/3 complex 提交 2024-11-11 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 G 1–151（151 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.97 Å
9M5E Structure of SPIN90 dimer-Arp2/3 complex-nucleated actin filament (singlet complex) 提交 2025-03-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric
链 G 1–151（151 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.55 Å
9M64 Structure of SPIN90 dimer-Arp2/3 complexes-nucleated actin filaments (Doublet Complex) 提交 2025-03-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric
链 G 1–151（151 aa）
链 g 1–151（151 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 12 MG MAGNESIUM ION × 10 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å

共 24 个其他 PDB 条目、26 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ARPC5_BOVIN
Isoform —
PDB实体 7
链与序列区间 作者链 G； PDB构建体 1–151； UniProt 1–151

Glia maturation factor gamma

物种未注明

UniProt Q9ERL7

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白拷贝数一致 链 H； UniProt 1–142 未记录 Actin-related protein 3 × 1 （P61157） Actin-related protein 2 × 1 （A7MB62） Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B × 1 （Q58CQ2） Actin-related protein 2/3 complex subunit 2 × 1 （Q3MHR7） Actin-related protein 2/3 complex subunit 3 × 1 （Q3T035） Actin-related protein 2/3 complex subunit 4 × 1 （Q148J6） Actin-related protein 2/3 complex subunit 5 × 1 （Q3SYX9） CA CALCIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 2 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取环境条件 分辨率 3.08 Å R-free 0.248

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 4JD2 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1VKK Crystal structure of Glia maturation factor-gamma (GMFG) from Mus musculus at 1.50 A resolution 提交 2004-05-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–142（142 aa）
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION,SITTING DROP,NANODROP；pH 8.5；277 K；30% PEG-4000, 0.1M Tris hydrochloride pH 8.5,0.2M lithium sulfate monohydrate, VAPOR DIFFUSION,SITTING DROP,NANODROP, temperature 277K
分辨率 1.35 Å R-free 0.194
1WFS Solution Structure of Glia Maturation Factor-gamma from Mus Musculus 提交 2004-05-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–139（138 aa） 片段：COFILIN-ADF-domain
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6；298 K；离子强度（mmCIF原始值）120mM；压力 ambient
NMR样品组成 1.21mM cofilin U-15N,13C; 20mM phosphate buffer Na; 100mM NaCl; 0.02% NaN3; 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供

共 2 个其他 PDB 条目、2 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 GMFG_MOUSE
Isoform —
PDB实体 8
链与序列区间 作者链 H； PDB构建体 1–142； UniProt 1–142

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 4jd2

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 4jd2
下载 Download
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id4jd2
沉积日期 deposition_date2013-02-22
结构标题 titleCrystal structure of Bos taurus Arp2/3 complex binding with Mus musculus GMF
关键词 keywordsactin filament polymerization and branching, STRUCTURAL PROTEIN; STRUCTURAL PROTEIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier45.11 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron44.70 Å
零角强度 I(0) i0746548000.00
分子量 molecular_weight227640.0 kDa
排除体积 excluded_volume285520 ų
包络体积 envelope_volume381160 ų
水化壳体积 shell_volume70116 ų
包络直径 envelope_diameter150.4 Å
壳层 Rg shell_rg49.95 Å
包络 Rg envelope_rg44.43 Å
形状 Rg shape_rg44.72 Å
总 Rg total_rg44.87 Å
总原子数 total_atoms16016
残基数 n_residues2013
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax147.7 Å
Rg (实空间) rg_real45.02 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error1.32 Å
I(0) (实空间) i0_real7.4650e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error1.3350e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal45.11 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal746600000.0000
解质量估计 total_estimate0.8982
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary54.9 Å
偏度 Skewness skewness0.191
峰度 Kurtosis kurtosis-0.634
角度范围 angular_range— – 0.1750 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha101600000.0000
实空间数据点数 n_real_points36
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.926; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.990; Smooth: 0.903
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (11)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 22 domains

SCOP 2.08 (9 domains)

结构域编号 domain_idd4jd2a1
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.55 — Ribonuclease H-like motif
超家族 Superfamily superfamilyc.55.1 — Actin-like ATPase domain
家族 Family familyc.55.1.0 — automated matches
结构域编号 domain_idd4jd2a2
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.55 — Ribonuclease H-like motif
超家族 Superfamily superfamilyc.55.1 — Actin-like ATPase domain
家族 Family familyc.55.1.1 — Actin/HSP70
结构域编号 domain_idd4jd2c_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.69 — 7-bladed beta-propeller
超家族 Superfamily superfamilyb.69.4 — WD40 repeat-like
家族 Family familyb.69.4.1 — WD40-repeat
结构域编号 domain_idd4jd2d1
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.198 — Secretion chaperone-like
超家族 Superfamily superfamilyd.198.2 — Arp2/3 complex subunits
家族 Family familyd.198.2.1 — Arp2/3 complex subunits
结构域编号 domain_idd4jd2d2
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.198 — Secretion chaperone-like
超家族 Superfamily superfamilyd.198.2 — Arp2/3 complex subunits
家族 Family familyd.198.2.1 — Arp2/3 complex subunits
结构域编号 domain_idd4jd2e_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.148 — Arp2/3 complex 21 kDa subunit ARPC3
超家族 Superfamily superfamilya.148.1 — Arp2/3 complex 21 kDa subunit ARPC3
家族 Family familya.148.1.1 — Arp2/3 complex 21 kDa subunit ARPC3
结构域编号 domain_idd4jd2f_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.198 — Secretion chaperone-like
超家族 Superfamily superfamilyd.198.2 — Arp2/3 complex subunits
家族 Family familyd.198.2.1 — Arp2/3 complex subunits
结构域编号 domain_idd4jd2g_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.118 — alpha-alpha superhelix
超家族 Superfamily superfamilya.118.13 — Arp2/3 complex 16 kDa subunit ARPC5
家族 Family familya.118.13.1 — Arp2/3 complex 16 kDa subunit ARPC5
结构域编号 domain_idd4jd2h_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.109 — Gelsolin-like
超家族 Superfamily superfamilyd.109.1 — Actin depolymerizing proteins
家族 Family familyd.109.1.2 — Cofilin-like

CATH v4.4 (13 domains)

结构域编号 domain_id4jd2A01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology420 — Nucleotidyltransferase; domain 5
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily40 — ATPase, nucleotide binding domain
结构域编号 domain_id4jd2A02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology420 — Nucleotidyltransferase; domain 5
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily40 — ATPase, nucleotide binding domain
结构域编号 domain_id4jd2A03
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology640 — Actin; Chain A, domain 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — ATPase, substrate binding domain, subdomain 4
结构域编号 domain_id4jd2B01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology420 — Nucleotidyltransferase; domain 5
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily40 — ATPase, nucleotide binding domain
结构域编号 domain_id4jd2B02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology420 — Nucleotidyltransferase; domain 5
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily40 — ATPase, nucleotide binding domain
结构域编号 domain_id4jd2B03
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology640 — Actin; Chain A, domain 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — ATPase, substrate binding domain, subdomain 4
结构域编号 domain_id4jd2C00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture130 — 7 Propeller
拓扑 Topology topology10 — Methylamine Dehydrogenase; Chain H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — YVTN repeat-like/Quinoprotein amine dehydrogenase
结构域编号 domain_id4jd2D01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology1460 — Yope Regulator; Chain: A,
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 —
结构域编号 domain_id4jd2D02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology1460 — Yope Regulator; Chain: A,
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 —
结构域编号 domain_id4jd2E00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology1760 — Arp2/3 complex 21 kDa subunit ARPC3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Actin-related protein 2/3 complex subunit 3
结构域编号 domain_id4jd2F00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology1460 — Yope Regulator; Chain: A,
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 —
结构域编号 domain_id4jd2G00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture25 — Alpha Horseshoe
拓扑 Topology topology40 — Serine Threonine Protein Phosphatase 5, Tetratricopeptide repeat
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily190 — Actin-related protein 2/3 complex subunit 5
结构域编号 domain_id4jd2H00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology20 — Severin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Severin
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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)