SAXSdb — 4jpb

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Chemotaxis protein CheA

Thermotoga maritima

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 6	Chemotaxis protein CheW × 3 （Q56311）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CHEA_THEMA
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 4–319； UniProt 355–671

Chemotaxis protein CheW

Thermotoga maritima

UniProt Q56311

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 6	Chemotaxis protein CheA × 3 （Q56310）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CHEW_THEMA
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 W； PDB构建体 5–151； UniProt 1–147

Methyl-accepting chemotaxis protein

Thermotoga maritima

UniProt Q7DFA3

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
2	蛋白同源多聚体	同源多聚体	蛋白 4	无其他共同聚合物	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q7DFA3_THEMA
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 5–90； UniProt 107–192 作者链 C； PDB构建体 5–90； UniProt 107–192

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	4jpb
沉积日期 deposition_date	2013-03-19
结构标题 title	The structure of a ternary complex between CheA domains P4 and P5 with CheW and with an unzipped fragment of TM14, a chemoreceptor analog from Thermotoga maritima.
关键词 keywords	Ternary complex, Transmembrane Signaling Two component system Receptor, Histidine Kinase Adaptor protein, Membrane, IMMUNE SYSTEM; IMMUNE SYSTEM
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

4jpb__assembly_2__model_1

Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

4jpb__assembly_2__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

4jpb__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	36.39 Å
Rg（电子密度）	37.73 Å
总 Rg	37.31 Å
原子数	2628
残基数	338
排除体积	46617 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`4jpb__assembly_1__model_1`	hexameric （6）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`4jpb__assembly_2__model_1`	tetrameric （4）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Chemotaxis protein CheA
分子量 formula_weight	35403.9 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.13.3
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	3468

GSHMVPISFVFNRFPRMVRDLAKKMNKEVNFIMRGEDTELDRTFVEEIGEPLLHLLRNAIDHGIEPKEERIAKGKPPIGTLILSARHEGNNVVIEVEDDGRGIDKEKIIRKAIEKGLIDESKAATLSDQEILNFLVPGFSTKEKVSEVSGRGVGMDVVKNVVESLNGSISIESEKDKGTKVTIRLPLTLAIIQALLVKVNNLVYAIPIANIDTILSISKEDIQRVQDRDVIVIRGEVIPVYRLWEVLQIEHKEELEEMEAVIVRVGNRKYGIVVDDLLGQDDIVIKSLGKVFSEVKEFSGAAILGDGSIALIINVSGIV

来源 Source

来源生物 organism	Thermotoga maritima
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	243274
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Chemotaxis protein CheW
分子量 formula_weight	16976.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	W

GSHMMKTLADALKEFEVLSFEIDEQALAFDVDNIEMVIEKSDITPVPKSRHFVEGVINLRGRIIPVVNLAKILGISFDEQKMKSIIVARTKDVEVGFLVDRVLGVLRITENQLDLTNVSDKFGKKSKGLVKTDGRLIIYLDIDKIIEEITV

来源 Source

来源生物 organism	Thermotoga maritima
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	243274
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Methyl-accepting chemotaxis protein
分子量 formula_weight	9976.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,C

GSHMSQIGETLENIRSIEKLIQNIMRIARETNILALNATIEAARAGEAGKGFMIVANEVQNLSNETNEVTKQIVEKAREILESSQRSLEN

来源 Source

来源生物 organism	Thermotoga maritima
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	243274
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 5 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_id	d4jpbw_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.40 — OB-fold
超家族 Superfamily superfamily	b.40.7 — CheW-like
家族 Family family	b.40.7.1 — CheW-like

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id	4jpbB00
类 Class class	6 — Special
架构 Architecture architecture	10 — Helix non-globular
拓扑 Topology topology	250 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	3200 —

结构域编号 domain_id	4jpbC00
类 Class class	6 — Special
架构 Architecture architecture	10 — Helix non-globular
拓扑 Topology topology	250 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	3200 —

结构域编号 domain_id	4jpbW01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	30 — Roll
拓扑 Topology topology	30 — SH3 type barrels.
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 — SH3 Domains

结构域编号 domain_id	4jpbW02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	180 — CheA-289, Domain 4

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晶胞边长 a length_a	213.588 Å
晶胞边长 b length_b	213.588 Å
晶胞边长 c length_c	208.838 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	36

空间群 space_group	H 3 2
空间群编号 int_tables_number	155
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.186 Å
最低分辨率 resolution_low	46.156 Å
R 因子 r_factor	0.1977
R_work r_work	0.1961
R_free r_free	0.2203

The structure of a ternary complex between CheA domains P4 and P5 with CheW and with an unzipped fragment of TM14, a chemoreceptor analog from Thermotoga maritima.

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Chemotaxis protein CheA

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Chemotaxis protein CheW

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Methyl-accepting chemotaxis protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

4jpb__assembly_2__model_1

4jpb__assembly_2__model_1 | I(q)

4jpb__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 5 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

CATH v4.4 (4 domains)

7. 引用文献 (1)

The structure of a ternary complex between CheA domains P4 and P5 with CheW and with an unzipped fragment of TM14, a chemoreceptor analog from Thermotoga maritima.

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Chemotaxis protein CheA

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Chemotaxis protein CheW

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Methyl-accepting chemotaxis protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

4jpb__assembly_2__model_1

4jpb__assembly_2__model_1 | I(q)

4jpb__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 5 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

CATH v4.4 (4 domains)

7. 引用文献 (1)