SAXSdb — 4lcc

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Beta-2-microglobulin, MHC class I-related protein

Bos taurus

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	信息不足异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 19–295	片段：P01888 residues 21-118, C1ITJ8 residues 19-295 突变：A185M, R260Q, Q264L	Human MAIT TCR alpha chain × 1 Human MAIT TCR beta chain × 1 1XL 1-deoxy-1-[6-(hydroxymethyl)-2,4-dioxo-3,4-dihydropteridin-8(2H)-yl]-D-arabinitol × 1 SO4 SULFATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；0.1 M Hepes, 1.5 M Ammonium Sulfate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291.0K	分辨率 3.26 Å R-free 0.312

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 4LCC	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
4IIQ Crystal structure of a human MAIT TCR in complex with bovine MR1 提交 2012-12-20	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 19–295（277 aa）片段：UNP C1ITJ8 residues 19-295, UNP P01888 residues 21-118	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；0.1 M Hepes, 1.5 M Ammonium Sulfate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K	分辨率 2.86 Å R-free 0.271
4L8S Crystal structure of a human Valpha7.2/Vbeta13.3 MAIT TCR in complex with bovine MR1 提交 2013-06-17	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 19–295（277 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；0.1 M Hepes, 1.7 M Ammonium Sulfate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291.0K	分辨率 2.90 Å R-free 0.278
4L9L Crystal structure of a human Valpha7.2/Vbeta13.2 MAIT TCR in complex with bovine MR1 提交 2013-06-18	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 19–295（277 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；0.1 M Hepes, 1.6 M Ammonium Sulfate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291.0K	分辨率 3.40 Å R-free 0.312
4L9L Crystal structure of a human Valpha7.2/Vbeta13.2 MAIT TCR in complex with bovine MR1 提交 2013-06-18	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 19–295（277 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；0.1 M Hepes, 1.6 M Ammonium Sulfate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291.0K	分辨率 3.40 Å R-free 0.312
7RNO Model of the Ac-6-FP/hpMR1/bB2m/TAPBPR complex from integrated docking, NMR and restrained MD 提交 2021-07-29	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 198–288（91 aa）	未记录	30W N-(6-formyl-4-oxo-3,4-dihydropteridin-2-yl)acetamide × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.2；298.15 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 1.01325 NMR样品组成 100 uM hpMR1 (human platform MR1), 100 uM [U-100% 12C; U-100% 15N; Ala CB, Ile CD1, Leu CD1/CD2, Val CG1/CG2] bovine beta 2 microglobulin, 300 uM TAPBPR, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供

共 4 个其他 PDB 条目、5 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	C1ITJ8_BOVIN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 114–390； UniProt 19–295

Beta-2-microglobulin, MHC class I-related protein

Bos taurus

UniProt P01888

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	信息不足异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 21–118	片段：P01888 residues 21-118, C1ITJ8 residues 19-295 突变：A185M, R260Q, Q264L	Human MAIT TCR alpha chain × 1 Human MAIT TCR beta chain × 1 1XL 1-deoxy-1-[6-(hydroxymethyl)-2,4-dioxo-3,4-dihydropteridin-8(2H)-yl]-D-arabinitol × 1 SO4 SULFATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；0.1 M Hepes, 1.5 M Ammonium Sulfate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291.0K	分辨率 3.26 Å R-free 0.312

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 4LCC	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1BMG CRYSTAL STRUCTURE OF BOVINE BETA2-MICROGLOBULIN 提交 1995-07-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 21–118（98 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.50 Å R-free 0.290
2XFX cattle MHC class I N01301 presenting an 11mer from Theileria parva 提交 2010-05-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 20–118（99 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7；20% PEG 8000, 50MM POTASSIUM PHOSPHATE, PH 7.0	分辨率 1.90 Å R-free 0.238
3L9R Crystal structure of bovine CD1b3 with endogenously bound ligands 提交 2010-01-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 21–118（98 aa）片段：UNP residues 21-118	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 L9R (2S)-3-(octadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；100 mM Na cacodylate pH 6.5, 2 M ammonium sulfate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 2.30 Å R-free 0.248
3L9R Crystal structure of bovine CD1b3 with endogenously bound ligands 提交 2010-01-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 21–118（98 aa）片段：UNP residues 21-118	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 GOL GLYCEROL × 3 L9Q (1S)-2-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(octadecanoyloxy)methyl]ethyl (9Z)-octadec-9-enoate × 1 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；100 mM Na cacodylate pH 6.5, 2 M ammonium sulfate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 2.30 Å R-free 0.248
3L9R Crystal structure of bovine CD1b3 with endogenously bound ligands 提交 2010-01-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 21–118（98 aa）片段：UNP residues 21-118	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 L9R (2S)-3-(octadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；100 mM Na cacodylate pH 6.5, 2 M ammonium sulfate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 2.30 Å R-free 0.248
3L9R Crystal structure of bovine CD1b3 with endogenously bound ligands 提交 2010-01-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 21–118（98 aa）片段：UNP residues 21-118	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 GOL GLYCEROL × 4 L9Q (1S)-2-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(octadecanoyloxy)methyl]ethyl (9Z)-octadec-9-enoate × 1 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；100 mM Na cacodylate pH 6.5, 2 M ammonium sulfate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 2.30 Å R-free 0.248
3PWV An immmunodominant CTL epitope from rinderpest virus presented by cattle MHC class I molecule N*01801 (BoLA-A11) 提交 2010-12-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 21–118（98 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；pH 7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.70 Å R-free 0.232
3PWV An immmunodominant CTL epitope from rinderpest virus presented by cattle MHC class I molecule N*01801 (BoLA-A11) 提交 2010-12-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 E 21–118（98 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；pH 7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.70 Å R-free 0.232
4F7C Crystal structure of bovine CD1d with bound C12-di-sulfatide 提交 2012-05-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 21–118（98 aa）片段：UNP residues 21-118	未记录	0SG N-{(2S,3R,4E)-1-[(3,6-di-O-sulfo-beta-D-galactopyranosyl)oxy]-3-hydroxyoctadec-4-en-2-yl}dodecanamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；20% PEG3350, 200 mM sodium formate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 2.86 Å R-free 0.291
4F7C Crystal structure of bovine CD1d with bound C12-di-sulfatide 提交 2012-05-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 21–118（98 aa）片段：UNP residues 21-118	未记录	0SG N-{(2S,3R,4E)-1-[(3,6-di-O-sulfo-beta-D-galactopyranosyl)oxy]-3-hydroxyoctadec-4-en-2-yl}dodecanamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；20% PEG3350, 200 mM sodium formate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 2.86 Å R-free 0.291
4F7E Crystal structure of bovine CD1d with bound C16:0-alpha-galactosyl ceramide 提交 2012-05-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 21–118（98 aa）片段：UNP residues 21-118	未记录	0SH N-[(2S,3S,4R)-1-(alpha-D-galactopyranosyloxy)-3,4-dihydroxyoctadecan-2-yl]hexadecanamide × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；20% PEG4000, 200 mM potassium sulfate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 2.40 Å R-free 0.276
4IIQ Crystal structure of a human MAIT TCR in complex with bovine MR1 提交 2012-12-20	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 21–118（98 aa）片段：UNP C1ITJ8 residues 19-295, UNP P01888 residues 21-118	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；0.1 M Hepes, 1.5 M Ammonium Sulfate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K	分辨率 2.86 Å R-free 0.271
4L8S Crystal structure of a human Valpha7.2/Vbeta13.3 MAIT TCR in complex with bovine MR1 提交 2013-06-17	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 21–118（98 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；0.1 M Hepes, 1.7 M Ammonium Sulfate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291.0K	分辨率 2.90 Å R-free 0.278
4L9L Crystal structure of a human Valpha7.2/Vbeta13.2 MAIT TCR in complex with bovine MR1 提交 2013-06-18	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 21–118（98 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；0.1 M Hepes, 1.6 M Ammonium Sulfate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291.0K	分辨率 3.40 Å R-free 0.312
4L9L Crystal structure of a human Valpha7.2/Vbeta13.2 MAIT TCR in complex with bovine MR1 提交 2013-06-18	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 21–118（98 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；0.1 M Hepes, 1.6 M Ammonium Sulfate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291.0K	分辨率 3.40 Å R-free 0.312
7RNO Model of the Ac-6-FP/hpMR1/bB2m/TAPBPR complex from integrated docking, NMR and restrained MD 提交 2021-07-29	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 21–118（98 aa）	未记录	30W N-(6-formyl-4-oxo-3,4-dihydropteridin-2-yl)acetamide × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.2；298.15 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 1.01325 NMR样品组成 100 uM hpMR1 (human platform MR1), 100 uM [U-100% 12C; U-100% 15N; Ala CB, Ile CD1, Leu CD1/CD2, Val CG1/CG2] bovine beta 2 microglobulin, 300 uM TAPBPR, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供

共 10 个其他 PDB 条目、16 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	B2MG_BOVIN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–98； UniProt 21–118

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	4lcc
沉积日期 deposition_date	2013-06-21
结构标题 title	Crystal structure of a human MAIT TCR in complex with a bacterial antigen bound to humanized bovine MR1
关键词 keywords	;Immunoglobulin domain, MHC-class I-like, Antigen presentation, Antigen recognition, B Vitamins metabolites, Cell membrane, IMMUNE SYSTEM ;; IMMUNE SYSTEM
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	35.45 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	35.70 Å
零角强度 I(0) i0	109974000.00
分子量 molecular_weight	82519.0 kDa
排除体积 excluded_volume	102340 Å³
包络体积 envelope_volume	137070 Å³
水化壳体积 shell_volume	35291 Å³
包络直径 envelope_diameter	135.1 Å
壳层 Rg shell_rg	37.66 Å
包络 Rg envelope_rg	36.13 Å
形状 Rg shape_rg	35.69 Å
总 Rg total_rg	35.85 Å
总原子数 total_atoms	5826
残基数 n_residues	736
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	127.7 Å
Rg (实空间) rg_real	35.97 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	1.64 Å
I(0) (实空间) i0_real	1.1000e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	2.2240e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	35.64 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	109900000.0000
解质量估计 total_estimate	0.7749
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	31.2 Å
偏度 Skewness skewness	0.703
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.004
角度范围 angular_range	— – 0.2250 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	13370000.0000
实空间数据点数 n_real_points	46
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.586; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.620; Smooth: 0.692

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Beta-2-microglobulin, MHC class I-related protein
分子量 formula_weight	45265.6 kDa
突变 mutation	A185M, R260Q, Q264L
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C
原子数 atom_count	5827

IQRPPKIQVYSRHPPEDGKPNYLNCYVYGFHPPQIEIDLLKNGEKIKSEQSDLSFSKDWSFYLLSHAEFTPNSKDQYSCRVKHVTLEQPRIVKWDRDLGGGGSGGSGSGGGGSRTHSLRYFRLGISEPGYGIPEFISAGYVDSHPITMYNSVSQLKEPRALWMEENLAPDHWERYTQLLRGWQQMFKVELKQLQHHYNHSGFHTYQRMIGCELLEDGSITGFLQYAYDGQDFLIFNKDTLSWMAMDNVADIIRRVWEANQHELLYQKNWLEEECIAWLKRFLEYGKDALQRTEPPKVRVNHKETFPGITTLYCRAYGFYPPEISINWMKNGEEIFQDTDYGGILPSGDGTYQTWVSVELDPQNGDIYSCHVEHGGVHMVLQGFQESETILGG

来源 Source

来源生物 organism	Bos taurus
通用名 common_name	bovine,cow,domestic cattle,domestic cow
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9913
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Human MAIT TCR alpha chain
分子量 formula_weight	23164.7 kDa
突变 mutation	T157C
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A

MAGQNIDQPTEMTATEGAIVQINCTYQTSGFNGLFWYQQHAGEAPTFLSYNVLDGLEEKGRFSSFLSRSKGYSYLLLKELQMKDSASYLCAVKDSNYQLIWGAGTKLIIKPNIQNPDPAVYQLRDSKSSDKSVCLFTDFDSQTNVSQSKDSDVYITDKCVLDMRSMDFKSNSAVAWSNKSDFACANAFNNSIIPEDTFFPSPESSALE

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Human MAIT TCR beta chain
分子量 formula_weight	28291.4 kDa
突变 mutation	S172C
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

MANAGVTQTPKFQVLKTGQSMTLQCAQDMNHNSMYWYRQDPGMGLRLIYYSASEGTTDKGEVPNGYNVSRLNKREFSLRLESAAPSQTSVYFCASSVWTGEGSGELFFGEGSRLTVLEDLKNVFPPEVAVFEPSEAEISHTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKEVHSGVCTDPQPLKEQPALNDSRYALSSRLRVSATFWQNPRNHFRCQVQFYGLSENDEWTQDRAKPVTQIVSAEAWGRADSAAALE

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	1-deoxy-1-[6-(hydroxymethyl)-2,4-dioxo-3,4-dihydropteridin-8(2H)-yl]-D-arabinitol
分子量 formula_weight	328.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	SULFATE ION
分子量 formula_weight	96.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 6 Entity 6 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

CATH v4.4 (6 domains)

结构域编号 domain_id	4lccA01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	4lccB01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	4lccB02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	4lccC01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	4lccC02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	500 — Murine Class I Major Histocompatibility Complex, H2-DB; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — MHC class I-like antigen recognition-like

结构域编号 domain_id	4lccC03
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

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8. 引用文献 (1)

▶

晶胞边长 a length_a	85.902 Å
晶胞边长 b length_b	88.585 Å
晶胞边长 c length_c	155.505 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	P 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	19
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.263 Å
最低分辨率 resolution_low	48.316 Å
R 因子 r_factor	0.2597
R_work r_work	0.2569
R_free r_free	0.3124

fit	/app/data/saxs_computation/lc/4lcc/4lcc.fit
pddf	/app/data/pr_computation/lc/4lcc/4lcc.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/lc/4lcc/4lcc.dat

Crystal structure of a human MAIT TCR in complex with a bacterial antigen bound to humanized bovine MR1

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Beta-2-microglobulin, MHC class I-related protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Beta-2-microglobulin, MHC class I-related protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

CATH v4.4 (6 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)