SAXSdb — 4ne5

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Centromere protein S

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 14–105 链 E； UniProt 14–105	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	Centromere protein X × 2 （A8MT69）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：Micro-batch under oil；300 K；Micro-batch under oil, temperature 300K	分辨率 2.50 Å R-free 0.264
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 14–105 链 G； UniProt 14–105	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	Centromere protein X × 2 （A8MT69）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：Micro-batch under oil；300 K；Micro-batch under oil, temperature 300K	分辨率 2.50 Å R-free 0.264

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 4NE5	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
28OP Structure of the human inner kinetochore CCAN and CENP-C bound to DNA 提交 2026-02-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：18-meric	链 S 1–138（138 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.70 Å
4DRA Crystal structure of MHF complex 提交 2012-02-17	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–107（107 aa）片段：C-terminus deleted, UNP residues 1-107 链 D 1–107（107 aa）片段：C-terminus deleted, UNP residues 1-107	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；285 K；0.1M HEPES-NaOH, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 285K	分辨率 2.41 Å R-free 0.242
4DRA Crystal structure of MHF complex 提交 2012-02-17	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–107（107 aa）片段：C-terminus deleted, UNP residues 1-107 链 C 1–107（107 aa）片段：C-terminus deleted, UNP residues 1-107	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；285 K；0.1M HEPES-NaOH, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 285K	分辨率 2.41 Å R-free 0.242
4DRB The crystal structure of FANCM bound MHF complex 提交 2012-02-17	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 1–114（114 aa）片段：C-terminus deleted, UNP residues 1-114 链 B 1–114（114 aa）片段：C-terminus deleted, UNP residues 1-114	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；285 K；0.1M Tris-HCl, pH 8.5, 0.2 M (NH4)2SO4, 25% PEG 3350 , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 285K	分辨率 2.63 Å R-free 0.256
4DRB The crystal structure of FANCM bound MHF complex 提交 2012-02-17	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 D 1–114（114 aa）片段：C-terminus deleted, UNP residues 1-114 链 E 1–114（114 aa）片段：C-terminus deleted, UNP residues 1-114	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；285 K；0.1M Tris-HCl, pH 8.5, 0.2 M (NH4)2SO4, 25% PEG 3350 , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 285K	分辨率 2.63 Å R-free 0.256
4DRB The crystal structure of FANCM bound MHF complex 提交 2012-02-17	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 G 1–114（114 aa）片段：C-terminus deleted, UNP residues 1-114 链 H 1–114（114 aa）片段：C-terminus deleted, UNP residues 1-114	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；285 K；0.1M Tris-HCl, pH 8.5, 0.2 M (NH4)2SO4, 25% PEG 3350 , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 285K	分辨率 2.63 Å R-free 0.256
4E44 Crystal structure of the hMHF1/hMHF2 Histone-Fold Tetramer 提交 2012-03-12	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–110（110 aa）片段：UNP residues 1-110 链 C 1–110（110 aa）片段：UNP residues 1-110	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；298 K；Tracking Code C4, 0.1M Tris pH 7.8, 0.2M LiCl, 0.1M Na2SO4, 17.5% w/v PEG3350, 10% glycerol cryo., vapor diffusion, sitting drop, temperature 298K	分辨率 2.10 Å R-free 0.231
4E45 Crystal structure of the hMHF1/hMHF2 Histone-Fold Tetramer in Complex with Fanconi Anemia Associated Helicase hFANCM 提交 2012-03-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 1–110（110 aa）片段：UNP residues 1-110 链 C 1–110（110 aa）片段：UNP residues 1-110	未记录	GOL GLYCEROL × 1 ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；298 K；Tracking Code C4, 0.1M Tris pH 7.8, 0.2M LiCl, 0.1M Na2SO4, 17.5% w/v PEG3350, 10% glycerol cryo., vapor diffusion, sitting drop, temperature 298K	分辨率 2.00 Å R-free 0.245
4E45 Crystal structure of the hMHF1/hMHF2 Histone-Fold Tetramer in Complex with Fanconi Anemia Associated Helicase hFANCM 提交 2012-03-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 F 1–110（110 aa）片段：UNP residues 1-110 链 H 1–110（110 aa）片段：UNP residues 1-110	未记录	GOL GLYCEROL × 1 ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；298 K；Tracking Code C4, 0.1M Tris pH 7.8, 0.2M LiCl, 0.1M Na2SO4, 17.5% w/v PEG3350, 10% glycerol cryo., vapor diffusion, sitting drop, temperature 298K	分辨率 2.00 Å R-free 0.245
4E45 Crystal structure of the hMHF1/hMHF2 Histone-Fold Tetramer in Complex with Fanconi Anemia Associated Helicase hFANCM 提交 2012-03-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 K 1–110（110 aa）片段：UNP residues 1-110 链 M 1–110（110 aa）片段：UNP residues 1-110	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；298 K；Tracking Code C4, 0.1M Tris pH 7.8, 0.2M LiCl, 0.1M Na2SO4, 17.5% w/v PEG3350, 10% glycerol cryo., vapor diffusion, sitting drop, temperature 298K	分辨率 2.00 Å R-free 0.245
4NDY Human MHF1-MHF2 DNA complex 提交 2013-10-28	突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric	链 I 14–105（92 aa）链 J 14–105（92 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 Micro-batch under oil；300 K；0.1-0.3M Ammonium Phosphate, Micro-batch under oil, temperature 300K	分辨率 7.00 Å R-free 0.279
4NDY Human MHF1-MHF2 DNA complex 提交 2013-10-28	突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：octameric	链 K 14–105（92 aa）链 T 14–105（92 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 Micro-batch under oil；300 K；0.1-0.3M Ammonium Phosphate, Micro-batch under oil, temperature 300K	分辨率 7.00 Å R-free 0.279
4NDY Human MHF1-MHF2 DNA complex 提交 2013-10-28	突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric	链 Q 14–105（92 aa）链 R 14–105（92 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 Micro-batch under oil；300 K；0.1-0.3M Ammonium Phosphate, Micro-batch under oil, temperature 300K	分辨率 7.00 Å R-free 0.279
4NDY Human MHF1-MHF2 DNA complex 提交 2013-10-28	突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 14–105（92 aa）链 S 14–105（92 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 Micro-batch under oil；300 K；0.1-0.3M Ammonium Phosphate, Micro-batch under oil, temperature 300K	分辨率 7.00 Å R-free 0.279
4NDY Human MHF1-MHF2 DNA complex 提交 2013-10-28	突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 14–105（92 aa）链 G 14–105（92 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 Micro-batch under oil；300 K；0.1-0.3M Ammonium Phosphate, Micro-batch under oil, temperature 300K	分辨率 7.00 Å R-free 0.279
4NE1 Human MHF1 MHF2 DNA complexes 提交 2013-10-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：24-meric	链 A 14–118（105 aa）链 C 14–118（105 aa）链 G 14–118（105 aa）链 I 14–118（105 aa）链 J 14–118（105 aa）链 K 14–118（105 aa）链 Q 14–118（105 aa）链 R 14–118（105 aa）链 S 14–118（105 aa）链 T 14–118（105 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 Micro-batch under oil；300 K；0.1-0.3M ammonium phosphate, Micro-batch under oil, temperature 300K	分辨率 6.50 Å R-free 0.295
4NE1 Human MHF1 MHF2 DNA complexes 提交 2013-10-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：24-meric	链 Y 14–118（105 aa）链 a 14–118（105 aa）链 c 14–118（105 aa）链 e 14–118（105 aa）链 f 14–118（105 aa）链 g 14–118（105 aa）链 k 14–118（105 aa）链 l 14–118（105 aa）链 m 14–118（105 aa）链 n 14–118（105 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 Micro-batch under oil；300 K；0.1-0.3M ammonium phosphate, Micro-batch under oil, temperature 300K	分辨率 6.50 Å R-free 0.295
4NE3 Human MHF1-MHF2 complex 提交 2013-10-28	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 14–105（92 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.80 Å R-free 0.252
4NE6 Human MHF1-MHF2 complex 提交 2013-10-28	结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 14–105（92 aa）链 C 14–105（92 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 Micro-batch under oil；300 K；Micro-batch under oil, temperature 300K	分辨率 2.10 Å R-free 0.262
7R5S Structure of the human CCAN bound to alpha satellite DNA 提交 2022-02-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：heptadecameric	链 S 1–138（138 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.83 Å
7XHN Structure of human inner kinetochore CCAN-DNA complex 提交 2022-04-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric	链 S 1–138（138 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.71 Å
7XHO Structure of human inner kinetochore CCAN complex 提交 2022-04-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric	链 S 1–138（138 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.29 Å
7YWX Structure of the human CCAN CENP-A alpha-satellite complex 提交 2022-02-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 25 PDB 声明：27-meric	链 S 1–138（138 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 12.00 Å
9TAW Structure of the human inner kinetochore CCAN bound to DNA 提交 2025-11-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：18-meric	链 S 1–138（138 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.54 Å
9TAX Structure of the human inner kinetochore CCAN bound to a mono-CENP-A nucleosome 提交 2025-11-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 25 PDB 声明：27-meric	链 S 1–138（138 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
9TAY Structure of the human inner kinetochore CCAN bound to a di-CENP-A nucleosome 提交 2025-11-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：37-meric	链 S 1–138（138 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 15.50 Å

共 16 个其他 PDB 条目、26 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CENPS_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–92； UniProt 14–105 作者链 C； PDB构建体 1–92； UniProt 14–105 作者链 E； PDB构建体 1–92； UniProt 14–105 作者链 G； PDB构建体 1–92； UniProt 14–105

Centromere protein X

Homo sapiens

UniProt A8MT69

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 8–81 链 F； UniProt 8–81	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	Centromere protein S × 2 （Q8N2Z9）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：Micro-batch under oil；300 K；Micro-batch under oil, temperature 300K	分辨率 2.50 Å R-free 0.264
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 D； UniProt 8–81 链 H； UniProt 8–81	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	Centromere protein S × 2 （Q8N2Z9）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：Micro-batch under oil；300 K；Micro-batch under oil, temperature 300K	分辨率 2.50 Å R-free 0.264

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 4NE5	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
28OP Structure of the human inner kinetochore CCAN and CENP-C bound to DNA 提交 2026-02-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：18-meric	链 X 1–81（81 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.70 Å
4DRA Crystal structure of MHF complex 提交 2012-02-17	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 E 1–81（81 aa）链 H 1–81（81 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；285 K；0.1M HEPES-NaOH, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 285K	分辨率 2.41 Å R-free 0.242
4DRA Crystal structure of MHF complex 提交 2012-02-17	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 F 1–81（81 aa）链 G 1–81（81 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；285 K；0.1M HEPES-NaOH, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 285K	分辨率 2.41 Å R-free 0.242
4DRB The crystal structure of FANCM bound MHF complex 提交 2012-02-17	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 J 1–81（81 aa）链 K 1–81（81 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；285 K；0.1M Tris-HCl, pH 8.5, 0.2 M (NH4)2SO4, 25% PEG 3350 , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 285K	分辨率 2.63 Å R-free 0.256
4DRB The crystal structure of FANCM bound MHF complex 提交 2012-02-17	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 L 1–81（81 aa）链 M 1–81（81 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；285 K；0.1M Tris-HCl, pH 8.5, 0.2 M (NH4)2SO4, 25% PEG 3350 , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 285K	分辨率 2.63 Å R-free 0.256
4DRB The crystal structure of FANCM bound MHF complex 提交 2012-02-17	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 N 1–81（81 aa）链 O 1–81（81 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；285 K；0.1M Tris-HCl, pH 8.5, 0.2 M (NH4)2SO4, 25% PEG 3350 , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 285K	分辨率 2.63 Å R-free 0.256
4E44 Crystal structure of the hMHF1/hMHF2 Histone-Fold Tetramer 提交 2012-03-12	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–81（81 aa）链 D 1–81（81 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；298 K；Tracking Code C4, 0.1M Tris pH 7.8, 0.2M LiCl, 0.1M Na2SO4, 17.5% w/v PEG3350, 10% glycerol cryo., vapor diffusion, sitting drop, temperature 298K	分辨率 2.10 Å R-free 0.231
4E45 Crystal structure of the hMHF1/hMHF2 Histone-Fold Tetramer in Complex with Fanconi Anemia Associated Helicase hFANCM 提交 2012-03-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 B 1–81（81 aa）链 D 1–81（81 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 1 ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；298 K；Tracking Code C4, 0.1M Tris pH 7.8, 0.2M LiCl, 0.1M Na2SO4, 17.5% w/v PEG3350, 10% glycerol cryo., vapor diffusion, sitting drop, temperature 298K	分辨率 2.00 Å R-free 0.245
4E45 Crystal structure of the hMHF1/hMHF2 Histone-Fold Tetramer in Complex with Fanconi Anemia Associated Helicase hFANCM 提交 2012-03-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 G 1–81（81 aa）链 I 1–81（81 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 1 ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；298 K；Tracking Code C4, 0.1M Tris pH 7.8, 0.2M LiCl, 0.1M Na2SO4, 17.5% w/v PEG3350, 10% glycerol cryo., vapor diffusion, sitting drop, temperature 298K	分辨率 2.00 Å R-free 0.245
4E45 Crystal structure of the hMHF1/hMHF2 Histone-Fold Tetramer in Complex with Fanconi Anemia Associated Helicase hFANCM 提交 2012-03-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 L 1–81（81 aa）链 N 1–81（81 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；298 K；Tracking Code C4, 0.1M Tris pH 7.8, 0.2M LiCl, 0.1M Na2SO4, 17.5% w/v PEG3350, 10% glycerol cryo., vapor diffusion, sitting drop, temperature 298K	分辨率 2.00 Å R-free 0.245
4NDY Human MHF1-MHF2 DNA complex 提交 2013-10-28	突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric	链 M 8–81（74 aa）链 N 8–81（74 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 Micro-batch under oil；300 K；0.1-0.3M Ammonium Phosphate, Micro-batch under oil, temperature 300K	分辨率 7.00 Å R-free 0.279
4NDY Human MHF1-MHF2 DNA complex 提交 2013-10-28	突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：octameric	链 L 8–81（74 aa）链 U 8–81（74 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 Micro-batch under oil；300 K；0.1-0.3M Ammonium Phosphate, Micro-batch under oil, temperature 300K	分辨率 7.00 Å R-free 0.279
4NDY Human MHF1-MHF2 DNA complex 提交 2013-10-28	突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric	链 V 8–81（74 aa）链 W 8–81（74 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 Micro-batch under oil；300 K；0.1-0.3M Ammonium Phosphate, Micro-batch under oil, temperature 300K	分辨率 7.00 Å R-free 0.279
4NDY Human MHF1-MHF2 DNA complex 提交 2013-10-28	突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 8–81（74 aa）链 X 8–81（74 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 Micro-batch under oil；300 K；0.1-0.3M Ammonium Phosphate, Micro-batch under oil, temperature 300K	分辨率 7.00 Å R-free 0.279
4NDY Human MHF1-MHF2 DNA complex 提交 2013-10-28	突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 8–81（74 aa）链 H 8–81（74 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 Micro-batch under oil；300 K；0.1-0.3M Ammonium Phosphate, Micro-batch under oil, temperature 300K	分辨率 7.00 Å R-free 0.279
4NE1 Human MHF1 MHF2 DNA complexes 提交 2013-10-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：24-meric	链 B 8–81（74 aa）链 D 8–81（74 aa）链 H 8–81（74 aa）链 L 8–81（74 aa）链 M 8–81（74 aa）链 N 8–81（74 aa）链 U 8–81（74 aa）链 V 8–81（74 aa）链 W 8–81（74 aa）链 X 8–81（74 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 Micro-batch under oil；300 K；0.1-0.3M ammonium phosphate, Micro-batch under oil, temperature 300K	分辨率 6.50 Å R-free 0.295
4NE1 Human MHF1 MHF2 DNA complexes 提交 2013-10-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：24-meric	链 Z 8–81（74 aa）链 b 8–81（74 aa）链 d 8–81（74 aa）链 h 8–81（74 aa）链 i 8–81（74 aa）链 j 8–81（74 aa）链 o 8–81（74 aa）链 p 8–81（74 aa）链 q 8–81（74 aa）链 r 8–81（74 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 Micro-batch under oil；300 K；0.1-0.3M ammonium phosphate, Micro-batch under oil, temperature 300K	分辨率 6.50 Å R-free 0.295
4NE3 Human MHF1-MHF2 complex 提交 2013-10-28	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 8–81（74 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.80 Å R-free 0.252
4NE6 Human MHF1-MHF2 complex 提交 2013-10-28	结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 8–81（74 aa）链 D 8–81（74 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 Micro-batch under oil；300 K；Micro-batch under oil, temperature 300K	分辨率 2.10 Å R-free 0.262
7R5S Structure of the human CCAN bound to alpha satellite DNA 提交 2022-02-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：heptadecameric	链 X 1–81（81 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.83 Å
7XHN Structure of human inner kinetochore CCAN-DNA complex 提交 2022-04-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric	链 X 1–81（81 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.71 Å
7XHO Structure of human inner kinetochore CCAN complex 提交 2022-04-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric	链 X 1–81（81 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.29 Å
7YWX Structure of the human CCAN CENP-A alpha-satellite complex 提交 2022-02-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 25 PDB 声明：27-meric	链 X 1–81（81 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 12.00 Å
9TAW Structure of the human inner kinetochore CCAN bound to DNA 提交 2025-11-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：18-meric	链 X 1–81（81 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.54 Å
9TAX Structure of the human inner kinetochore CCAN bound to a mono-CENP-A nucleosome 提交 2025-11-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 25 PDB 声明：27-meric	链 X 1–81（81 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
9TAY Structure of the human inner kinetochore CCAN bound to a di-CENP-A nucleosome 提交 2025-11-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：37-meric	链 X 1–81（81 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 15.50 Å

共 16 个其他 PDB 条目、26 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CENPX_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–74； UniProt 8–81 作者链 D； PDB构建体 1–74； UniProt 8–81 作者链 F； PDB构建体 1–74； UniProt 8–81 作者链 H； PDB构建体 1–74； UniProt 8–81

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	4ne5
沉积日期 deposition_date	2013-10-28
结构标题 title	Human MHF1-MHF2 complex
关键词 keywords	Histone fold, DNA repair, genome maintenance, Fanconi Anemia, FancM, Nucleus, DNA Binding Protein; DNA BINDING PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	31.89 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	31.29 Å
零角强度 I(0) i0	93844900.00
分子量 molecular_weight	76507.0 kDa
排除体积 excluded_volume	95899 Å³
包络体积 envelope_volume	125880 Å³
水化壳体积 shell_volume	34701 Å³
包络直径 envelope_diameter	109.1 Å
壳层 Rg shell_rg	36.90 Å
包络 Rg envelope_rg	30.92 Å
形状 Rg shape_rg	31.28 Å
总 Rg total_rg	31.85 Å
总原子数 total_atoms	5332
残基数 n_residues	656
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	102.9 Å
Rg (实空间) rg_real	31.96 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.84 Å
I(0) (实空间) i0_real	9.3840e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	1.5360e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	31.93 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	93840000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8940
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	37.0 Å
偏度 Skewness skewness	0.367
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.385
角度范围 angular_range	— – 0.2500 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	11660000.0000
实空间数据点数 n_real_points	51
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.926; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.989; Smooth: 0.850

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Centromere protein S
分子量 formula_weight	10740.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,C,E,G
原子数 atom_count	5479

SYQQRLKAAVHYTVGCLCEEVALDKAMQFSKQTIAAISELTFRQCENFAKDLEMFARHAKRTTINTEDVKLLARRSNSLLKYITDKSEEIAQA

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Centromere protein X
分子量 formula_weight	8445.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,D,F,H

SGFRKELVSRLLHLHFKDDKTKVSGDALQLMVELLKVFVVEAAVRGVRQAQAEDALRVDVDQLEKVLPQLLLDF

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	147

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 12 domains

CATH v4.4 (12 domains)

结构域编号 domain_id	4ne5A00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	20 — Histone, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Histone, subunit A

结构域编号 domain_id	4ne5B01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	4980 —

结构域编号 domain_id	4ne5B02
类 Class class	6 — Special
架构 Architecture architecture	10 — Helix non-globular
拓扑 Topology topology	130 — GTP Cyclohydrolase I; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	30 —

结构域编号 domain_id	4ne5C00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	20 — Histone, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Histone, subunit A

结构域编号 domain_id	4ne5D01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	4980 —

结构域编号 domain_id	4ne5D02
类 Class class	6 — Special
架构 Architecture architecture	10 — Helix non-globular
拓扑 Topology topology	130 — GTP Cyclohydrolase I; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	30 —

结构域编号 domain_id	4ne5E00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	20 — Histone, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Histone, subunit A

结构域编号 domain_id	4ne5F01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	4980 —

结构域编号 domain_id	4ne5F02
类 Class class	6 — Special
架构 Architecture architecture	10 — Helix non-globular
拓扑 Topology topology	130 — GTP Cyclohydrolase I; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	30 —

结构域编号 domain_id	4ne5G00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	20 — Histone, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Histone, subunit A

结构域编号 domain_id	4ne5H01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	4980 —

结构域编号 domain_id	4ne5H02
类 Class class	6 — Special
架构 Architecture architecture	10 — Helix non-globular
拓扑 Topology topology	130 — GTP Cyclohydrolase I; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	30 —

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	41.076 Å
晶胞边长 b length_b	128.760 Å
晶胞边长 c length_c	88.836 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	100.96 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.500 Å
最低分辨率 resolution_low	38.510 Å
R 因子 r_factor	0.2312
R_work r_work	0.2295
R_free r_free	0.2636

fit	/app/data/saxs_computation/ne/4ne5/4ne5.fit
pddf	/app/data/pr_computation/ne/4ne5/4ne5.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/ne/4ne5/4ne5.dat

Human MHF1-MHF2 complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Centromere protein S

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Centromere protein X

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 12 domains

CATH v4.4 (12 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)