SAXSdb — 4pti

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

TRYPSIN INHIBITOR

Bos taurus

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白单体	单体	蛋白 1	water × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	BPT1_BOVIN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–58； UniProt 36–93

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	4pti
沉积日期 deposition_date	1982-09-27
结构标题 title	THE GEOMETRY OF THE REACTIVE SITE AND OF THE PEPTIDE GROUPS IN TRYPSIN, TRYPSINOGEN AND ITS COMPLEXES WITH INHIBITORS
关键词 keywords	PROTEINASE INHIBITOR (TRYPSIN); PROTEINASE INHIBITOR (TRYPSIN)
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

4pti__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

4pti__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

4pti__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	12.15 Å
Rg（电子密度）	11.01 Å
总 Rg	12.53 Å
原子数	454
残基数	58
排除体积	8026 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`4pti__assembly_1__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_id	d4ptia_
类 Class class	g — Small proteins
折叠类型 Fold fold	g.8 — BPTI-like
超家族 Superfamily superfamily	g.8.1 — BPTI-like
家族 Family family	g.8.1.1 — Small Kunitz-type inhibitors & BPTI-like toxins

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id	4ptiA00
类 Class class	4 — Few Secondary Structures
架构 Architecture architecture	10 — Irregular
拓扑 Topology topology	410 — Factor Xa Inhibitor
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Pancreatic trypsin inhibitor Kunitz domain

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7. 引用文献 (8)

The Geometry of the Reactive Site and of the Peptide Groups in Trypsin, Trypsinogen and its Complexes with Inhibitors

Acta Crystallogr.,Sect.B (1983)

PMID: -1 PRIMARY

Comparison of Two Highly Refined Structures of Bovine Pancreatic Trypsin Inhibitor

J.Mol.Biol. (1987)

Crystallographic Refinement of the Structure of Bovine Pancreatic Trypsin Inhibitor at 1.5 Angstroms Resolution

Acta Crystallogr.,Sect.B (1975)

The Model of the Basic Pancreatic Trypsin Inhibitor Refined at 1.5 Angstroms Resolution

Bayer Symp. (1974)

无标题

Atlas of Protein Sequence and Structure,Supplement 1 (1973)

Pancreatic Trypsin Inhibitor (Kunitz). Part I. Structure and Function

Cold Spring Harbor Symp.Quant.Biol. (1972)

Pancreatic Trypsin Inhibitor (Kunitz). Part II. Complexes with Proteinases

Cold Spring Harbor Symp.Quant.Biol. (1972)

The Basic Trypsin Inhibitor of Bovine Pancreas. I. Structure Analysis and Conformation of the Polypeptide Chain

Naturwissenschaften (1970)

晶胞边长 a length_a	43.100 Å
晶胞边长 b length_b	22.900 Å
晶胞边长 c length_c	48.600 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	P 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	19
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.500 Å
最低分辨率 resolution_low	7.000 Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	0.1620
R_free r_free	—

描述 description	TRYPSIN INHIBITOR
分子量 formula_weight	6527.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	514

THE GEOMETRY OF THE REACTIVE SITE AND OF THE PEPTIDE GROUPS IN TRYPSIN, TRYPSINOGEN AND ITS COMPLEXES WITH INHIBITORS

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

TRYPSIN INHIBITOR

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

4pti__assembly_1__model_1

4pti__assembly_1__model_1 | I(q)

4pti__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

CATH v4.4 (1 domains)

7. 引用文献 (8)

来源生物 organism	Bos taurus
通用名 common_name	cattle
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9913

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	60

THE GEOMETRY OF THE REACTIVE SITE AND OF THE PEPTIDE GROUPS IN TRYPSIN, TRYPSINOGEN AND ITS COMPLEXES WITH INHIBITORS

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

TRYPSIN INHIBITOR

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

4pti__assembly_1__model_1

4pti__assembly_1__model_1 | I(q)

4pti__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

CATH v4.4 (1 domains)

7. 引用文献 (8)