4puf

Complex between the Salmonella T3SS effector SlrP and its human target thioredoxin-1

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 158.0 Å Quality: GOOD

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

E3 ubiquitin-protein ligase SlrP

Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 141–765 链 B； UniProt 141–765	片段：UNP RESIDUES 141-765	Thioredoxin × 2 （P10599）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION；pH 7.8；291 K；15% PEG 4000, 0.2M NaCl, 0.1M MgCl2, 0.1M Hepes, 216 M SlrP, 430 M Trx1, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, temperature 291K	分辨率 3.30 Å R-free 0.308

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

数据库中没有找到同一 UniProt 蛋白的其他 PDB 条目。

查看构建体与数据证据

UniProt名称	SLRP_SALT1
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 13–637； UniProt 141–765 作者链 B； PDB构建体 13–637； UniProt 141–765

Thioredoxin

Homo sapiens

UniProt P10599

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 1–105 链 D； UniProt 1–105	未记录	E3 ubiquitin-protein ligase SlrP × 2 （D0ZRB2）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION；pH 7.8；291 K；15% PEG 4000, 0.2M NaCl, 0.1M MgCl2, 0.1M Hepes, 216 M SlrP, 430 M Trx1, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, temperature 291K	分辨率 3.30 Å R-free 0.308

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 4PUF	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1AIU HUMAN THIOREDOXIN (D60N MUTANT, REDUCED FORM) 提交 1997-04-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–104（104 aa）	突变：D60N	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 3.8；pH 3.8	分辨率 2.00 Å R-free 0.240
1AUC HUMAN THIOREDOXIN (OXIDIZED WITH DIAMIDE) 提交 1997-08-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–104（104 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5；pH 5.0	分辨率 2.10 Å R-free 0.270
1CQG HIGH RESOLUTION SOLUTION NMR STRUCTURE OF MIXED DISULFIDE INTERMEDIATE BETWEEN HUMAN THIOREDOXIN (C35A, C62A, C69A, C73A) MUTANT AND A 13 RESIDUE PEPTIDE COMPRISING ITS TARGET SITE IN HUMAN REF-1 (RESIDUES 59-71 OF THE P50 SUBUNIT OF NFKB), NMR, 31 STRUCTURES 提交 1996-04-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–104（104 aa）	突变：CHAIN A, C35A, C62A, C69A, C73A	未记录非水小分子	SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件	分辨率未提供
1CQH HIGH RESOLUTION SOLUTION NMR STRUCTURE OF MIXED DISULFIDE INTERMEDIATE BETWEEN HUMAN THIOREDOXIN (C35A, C62A, C69A, C73A) MUTANT AND A 13 RESIDUE PEPTIDE COMPRISING ITS TARGET SITE IN HUMAN REF-1 (RESIDUES 59-71 OF THE P50 SUBUNIT OF NFKB), NMR, MINIMIZED AVERAGE STRUCTURE 提交 1996-04-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–104（104 aa）	突变：CHAIN A, C35A, C62A, C69A, C73A	未记录非水小分子	SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件	分辨率未提供
1ERT HUMAN THIOREDOXIN (REDUCED FORM) 提交 1996-02-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–104（104 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.70 Å R-free 0.240
1ERU HUMAN THIOREDOXIN (OXIDIZED FORM) 提交 1996-02-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–104（104 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.10 Å R-free 0.330
1ERV HUMAN THIOREDOXIN MUTANT WITH CYS 73 REPLACED BY SER (REDUCED FORM) 提交 1996-02-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–104（104 aa）	突变：C73S	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.65 Å R-free 0.240
1ERW HUMAN THIOREDOXIN DOUBLE MUTANT WITH CYS 32 REPLACED BY SER AND CYS 35 REPLACED BY SER 提交 1996-02-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–104（104 aa）	突变：C32S, C35S	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.80 Å R-free 0.260
1M7T Solution Structure and Dynamics of the Human-Escherichia coli Thioredoxin Chimera: Insights into Thermodynamic Stability 提交 2002-07-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 0–65（66 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；308 K NMR样品组成 1 mM protein in 100 mM sodium phosphate buffer (pH 7.0), 20 M EDTA, 0.02% sodium azide, and 10% D2O. \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
1MDI HIGH RESOLUTION SOLUTION NMR STRUCTURE OF MIXED DISULFIDE INTERMEDIATE BETWEEN MUTANT HUMAN THIOREDOXIN AND A 13 RESIDUE PEPTIDE COMPRISING ITS TARGET SITE IN HUMAN NFKB 提交 1995-02-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–104（104 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件	分辨率未提供
1MDJ HIGH RESOLUTION SOLUTION NMR STRUCTURE OF MIXED DISULFIDE INTERMEDIATE BETWEEN HUMAN THIOREDOXIN (C35A, C62A, C69A, C73A) MUTANT AND A 13 RESIDUE PEPTIDE COMPRISING ITS TARGET SITE IN HUMAN NFKB (RESIDUES 56-68 OF THE P50 SUBUNIT OF NFKB) 提交 1995-02-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–104（104 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件	分辨率未提供
1MDK HIGH RESOLUTION SOLUTION NMR STRUCTURE OF MIXED DISULFIDE INTERMEDIATE BETWEEN HUMAN THIOREDOXIN (C35A, C62A, C69A, C73A) MUTANT AND A 13 RESIDUE PEPTIDE COMPRISING ITS TARGET SITE IN HUMAN NFKB (RESIDUES 56-68 OF THE P50 SUBUNIT OF NFKB) 提交 1995-02-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–104（104 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件	分辨率未提供
1TRS THE HIGH-RESOLUTION THREE-DIMENSIONAL SOLUTION STRUCTURES OF THE OXIDIZED AND REDUCED STATES OF HUMAN THIOREDOXIN 提交 1994-05-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–104（104 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件	分辨率未提供
1TRU THE HIGH-RESOLUTION THREE-DIMENSIONAL SOLUTION STRUCTURES OF THE OXIDIZED AND REDUCED STATES OF HUMAN THIOREDOXIN 提交 1994-05-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–104（104 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件	分辨率未提供
1TRV THE HIGH-RESOLUTION THREE-DIMENSIONAL SOLUTION STRUCTURES OF THE OXIDIZED AND REDUCED STATES OF HUMAN THIOREDOXIN 提交 1994-05-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–104（104 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件	分辨率未提供
1TRW THE HIGH-RESOLUTION THREE-DIMENSIONAL SOLUTION STRUCTURES OF THE OXIDIZED AND REDUCED STATES OF HUMAN THIOREDOXIN 提交 1994-05-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–104（104 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件	分辨率未提供
2IFQ Crystal structure of S-nitroso thioredoxin 提交 2006-09-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 0–104（105 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；32% PEG 4000, 50 mM sodium phosphate, ethanol, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.20 Å R-free 0.206
2IFQ Crystal structure of S-nitroso thioredoxin 提交 2006-09-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 0–104（105 aa）	未记录	EOH ETHANOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；32% PEG 4000, 50 mM sodium phosphate, ethanol, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.20 Å R-free 0.206
2IFQ Crystal structure of S-nitroso thioredoxin 提交 2006-09-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 0–104（105 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	EOH ETHANOL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；32% PEG 4000, 50 mM sodium phosphate, ethanol, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.20 Å R-free 0.206
2IIY Crystal structure of S-nitroso thioredoxin 提交 2006-09-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 0–104（105 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；32% PEG 1500, 50 mM sodium phosphate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.70 Å R-free 0.239
3E3E Human Thioredoxin Double Mutant C35S,C73R 提交 2008-08-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–105（105 aa）	突变：C35S, C73R	P6G HEXAETHYLENE GLYCOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；292 K；0.1 M Na acetate, pH 4.6, and 30 % (v/v) PEG 300, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K	分辨率 2.01 Å R-free 0.261
3E3E Human Thioredoxin Double Mutant C35S,C73R 提交 2008-08-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–105（105 aa）	突变：C35S, C73R	P6G HEXAETHYLENE GLYCOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；292 K；0.1 M Na acetate, pH 4.6, and 30 % (v/v) PEG 300, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K	分辨率 2.01 Å R-free 0.261
3KD0 Human thioredoxin C35S,C62S,C69S,C73S mutant showing cadmium chloride bound to the active site 提交 2009-10-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–105（105 aa）	突变：C35S, C62S, C69S, C73S	CL CHLORIDE ION × 4 CD CADMIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；292 K；0.16M Cadmium Chloride, 2.0M ammonium sulphate, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K	分辨率 1.70 Å R-free 0.279
3KD0 Human thioredoxin C35S,C62S,C69S,C73S mutant showing cadmium chloride bound to the active site 提交 2009-10-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–105（105 aa）	突变：C35S, C62S, C69S, C73S	CL CHLORIDE ION × 8 CD CADMIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；292 K；0.16M Cadmium Chloride, 2.0M ammonium sulphate, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K	分辨率 1.70 Å R-free 0.279
3M9J Crystal structure of human thioredoxin C69/73S double mutant, reduced form 提交 2010-03-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–105（105 aa）	突变：C69S, C73S	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.6；298 K；30% PEG 4000, 200 mM ammonium acetate, 100 mM sodium citrate, 5 mM DTT, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.10 Å R-free 0.172
3M9J Crystal structure of human thioredoxin C69/73S double mutant, reduced form 提交 2010-03-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–105（105 aa）	突变：C69S, C73S	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.6；298 K；30% PEG 4000, 200 mM ammonium acetate, 100 mM sodium citrate, 5 mM DTT, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.10 Å R-free 0.172
3M9K Crystal structure of human thioredoxin C69/73S double-mutant, oxidized form 提交 2010-03-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–105（105 aa）	突变：C69S, C73S	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.6；298 K；1.8 M ammonium sulfate, 100 mM MES, 10 mM CoCl2, 2 mM DTT, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.50 Å R-free 0.211
3M9K Crystal structure of human thioredoxin C69/73S double-mutant, oxidized form 提交 2010-03-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–105（105 aa）	突变：C69S, C73S	SO4 SULFATE ION × 3 D1D (4S,5S)-1,2-DITHIANE-4,5-DIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.6；298 K；1.8 M ammonium sulfate, 100 mM MES, 10 mM CoCl2, 2 mM DTT, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.50 Å R-free 0.211
3M9K Crystal structure of human thioredoxin C69/73S double-mutant, oxidized form 提交 2010-03-22	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–105（105 aa）链 B 1–105（105 aa）	突变：C69S, C73S 突变：C69S, C73S	SO4 SULFATE ION × 8 D1D (4S,5S)-1,2-DITHIANE-4,5-DIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.6；298 K；1.8 M ammonium sulfate, 100 mM MES, 10 mM CoCl2, 2 mM DTT, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.50 Å R-free 0.211
3QFA Crystal structure of the human thioredoxin reductase-thioredoxin complex 提交 2011-01-21	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 2–105（104 aa）链 D 2–105（104 aa）	突变：C35S, C73S 突变：C35S, C73S	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 2 GOL GLYCEROL × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；297.15 K；15% PEG 6000, 0.1M MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 297.15 K	分辨率 2.20 Å R-free 0.283
3QFB Crystal structure of the human thioredoxin reductase-thioredoxin complex 提交 2011-01-21	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 2–105（104 aa）链 D 2–105（104 aa）	突变：C35S, C73S 突变：C35S, C73S	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 2 GOL GLYCEROL × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.6；297.15 K；15% PEG 4000, pH 7.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 297.15K	分辨率 2.60 Å R-free 0.297
3TRX HIGH-RESOLUTION THREE-DIMENSIONAL STRUCTURE OF REDUCED RECOMBINANT HUMAN THIOREDOXIN IN SOLUTION 提交 1990-12-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–104（104 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件	分辨率未提供
4LL1 The structure of the TRX and TXNIP complex 提交 2013-07-09	突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–105（105 aa）链 D 1–105（105 aa）	突变：C35A 突变：C35A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；294.15 K；0.16M tri-sodium citrate, 16% PEG3350, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 294.15K	分辨率 2.00 Å R-free 0.288
4LL4 The structure of the TRX and TXNIP complex 提交 2013-07-09	突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–105（105 aa）链 D 1–105（105 aa）	突变：C35A 突变：C35A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；294.15 K；0.16M tri-sodium citrate, 16% PEG3350, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 294.15K	分辨率 2.70 Å R-free 0.264
4OO4 Crystal Structure of Human Thioredoxin Mutant 提交 2014-01-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–105（105 aa）	突变：Q63A, C69S, C73S	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；289 K；20% PEG 3350, 0.1 M sodium acetate, 2 mM DTT, pH 4.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K	分辨率 0.97 Å R-free 0.165
4OO4 Crystal Structure of Human Thioredoxin Mutant 提交 2014-01-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–105（105 aa）	突变：Q63A, C69S, C73S	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；289 K；20% PEG 3350, 0.1 M sodium acetate, 2 mM DTT, pH 4.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K	分辨率 0.97 Å R-free 0.165
4OO4 Crystal Structure of Human Thioredoxin Mutant 提交 2014-01-30	突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–105（105 aa）链 B 1–105（105 aa）	突变：Q63A, C69S, C73S 突变：Q63A, C69S, C73S	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；289 K；20% PEG 3350, 0.1 M sodium acetate, 2 mM DTT, pH 4.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K	分辨率 0.97 Å R-free 0.165
4OO5 Crystal Structure of S-nitrosated Human Thioredoxin Mutant 提交 2014-01-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–105（105 aa）	突变：C69S, C73S 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；289 K；21% PEG 3350, 0.1 M sodium acetate, pH 4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K	分辨率 1.54 Å R-free 0.248
4POK Crystal structures of thioredoxin with mesna at 2.5A resolution 提交 2014-02-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–105（105 aa）	突变：E13K, D16K, E95K, E103K	COM 1-THIOETHANESULFONIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；20% ethanol, 0.1 M Tris, 60 mg/mL Trx protein, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.52 Å R-free 0.296
4POK Crystal structures of thioredoxin with mesna at 2.5A resolution 提交 2014-02-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–105（105 aa）	突变：E13K, D16K, E95K, E103K	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；20% ethanol, 0.1 M Tris, 60 mg/mL Trx protein, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.52 Å R-free 0.296
4POK Crystal structures of thioredoxin with mesna at 2.5A resolution 提交 2014-02-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–105（105 aa）	突变：E13K, D16K, E95K, E103K	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；20% ethanol, 0.1 M Tris, 60 mg/mL Trx protein, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.52 Å R-free 0.296
4POK Crystal structures of thioredoxin with mesna at 2.5A resolution 提交 2014-02-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 1–105（105 aa）	突变：E13K, D16K, E95K, E103K	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；20% ethanol, 0.1 M Tris, 60 mg/mL Trx protein, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.52 Å R-free 0.296
4POK Crystal structures of thioredoxin with mesna at 2.5A resolution 提交 2014-02-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–105（105 aa）链 B 1–105（105 aa）链 C 1–105（105 aa）链 D 1–105（105 aa）	突变：E13K, D16K, E95K, E103K 突变：E13K, D16K, E95K, E103K 突变：E13K, D16K, E95K, E103K 突变：E13K, D16K, E95K, E103K	COM 1-THIOETHANESULFONIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；20% ethanol, 0.1 M Tris, 60 mg/mL Trx protein, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.52 Å R-free 0.296
4POK Crystal structures of thioredoxin with mesna at 2.5A resolution 提交 2014-02-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–105（105 aa）链 B 1–105（105 aa）链 C 1–105（105 aa）链 D 1–105（105 aa）	突变：E13K, D16K, E95K, E103K 突变：E13K, D16K, E95K, E103K 突变：E13K, D16K, E95K, E103K 突变：E13K, D16K, E95K, E103K	COM 1-THIOETHANESULFONIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；20% ethanol, 0.1 M Tris, 60 mg/mL Trx protein, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.52 Å R-free 0.296
4POL Crystal structures of thioredoxin with mesna at 2.8A resolution 提交 2014-02-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–105（105 aa）	突变：E13K, D16K, E95K, E103K	COM 1-THIOETHANESULFONIC ACID × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；20% PEG3350, 0.2 M KCl, 60 mg/mL Trx protein, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.80 Å R-free 0.312
4POL Crystal structures of thioredoxin with mesna at 2.8A resolution 提交 2014-02-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–105（105 aa）	突变：E13K, D16K, E95K, E103K	COM 1-THIOETHANESULFONIC ACID × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；20% PEG3350, 0.2 M KCl, 60 mg/mL Trx protein, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.80 Å R-free 0.312
4POL Crystal structures of thioredoxin with mesna at 2.8A resolution 提交 2014-02-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–105（105 aa）	突变：E13K, D16K, E95K, E103K	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；20% PEG3350, 0.2 M KCl, 60 mg/mL Trx protein, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.80 Å R-free 0.312
4POL Crystal structures of thioredoxin with mesna at 2.8A resolution 提交 2014-02-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 1–105（105 aa）	突变：E13K, D16K, E95K, E103K	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；20% PEG3350, 0.2 M KCl, 60 mg/mL Trx protein, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.80 Å R-free 0.312
4POL Crystal structures of thioredoxin with mesna at 2.8A resolution 提交 2014-02-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–105（105 aa）链 B 1–105（105 aa）链 C 1–105（105 aa）链 D 1–105（105 aa）	突变：E13K, D16K, E95K, E103K 突变：E13K, D16K, E95K, E103K 突变：E13K, D16K, E95K, E103K 突变：E13K, D16K, E95K, E103K	COM 1-THIOETHANESULFONIC ACID × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；20% PEG3350, 0.2 M KCl, 60 mg/mL Trx protein, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.80 Å R-free 0.312
4POL Crystal structures of thioredoxin with mesna at 2.8A resolution 提交 2014-02-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–105（105 aa）链 B 1–105（105 aa）链 C 1–105（105 aa）链 D 1–105（105 aa）	突变：E13K, D16K, E95K, E103K 突变：E13K, D16K, E95K, E103K 突变：E13K, D16K, E95K, E103K 突变：E13K, D16K, E95K, E103K	COM 1-THIOETHANESULFONIC ACID × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；20% PEG3350, 0.2 M KCl, 60 mg/mL Trx protein, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.80 Å R-free 0.312
4POM Crystal structures of thioredoxin with mesna at 1.85A resolution 提交 2014-02-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–105（105 aa）	突变：E13K, D16K, E95K, E103K	COM 1-THIOETHANESULFONIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；28% PEG3350, 0.2M KCl, 160 mg/mL Trx protein, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 1.85 Å R-free 0.261
4POM Crystal structures of thioredoxin with mesna at 1.85A resolution 提交 2014-02-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–105（105 aa）	突变：E13K, D16K, E95K, E103K	COM 1-THIOETHANESULFONIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；28% PEG3350, 0.2M KCl, 160 mg/mL Trx protein, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 1.85 Å R-free 0.261
4POM Crystal structures of thioredoxin with mesna at 1.85A resolution 提交 2014-02-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–105（105 aa）	突变：E13K, D16K, E95K, E103K	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；28% PEG3350, 0.2M KCl, 160 mg/mL Trx protein, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 1.85 Å R-free 0.261
4POM Crystal structures of thioredoxin with mesna at 1.85A resolution 提交 2014-02-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 1–105（105 aa）	突变：E13K, D16K, E95K, E103K	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；28% PEG3350, 0.2M KCl, 160 mg/mL Trx protein, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 1.85 Å R-free 0.261
4POM Crystal structures of thioredoxin with mesna at 1.85A resolution 提交 2014-02-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–105（105 aa）链 B 1–105（105 aa）链 C 1–105（105 aa）链 D 1–105（105 aa）	突变：E13K, D16K, E95K, E103K 突变：E13K, D16K, E95K, E103K 突变：E13K, D16K, E95K, E103K 突变：E13K, D16K, E95K, E103K	COM 1-THIOETHANESULFONIC ACID × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；28% PEG3350, 0.2M KCl, 160 mg/mL Trx protein, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 1.85 Å R-free 0.261
4POM Crystal structures of thioredoxin with mesna at 1.85A resolution 提交 2014-02-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–105（105 aa）链 B 1–105（105 aa）链 C 1–105（105 aa）链 D 1–105（105 aa）	突变：E13K, D16K, E95K, E103K 突变：E13K, D16K, E95K, E103K 突变：E13K, D16K, E95K, E103K 突变：E13K, D16K, E95K, E103K	COM 1-THIOETHANESULFONIC ACID × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；28% PEG3350, 0.2M KCl, 160 mg/mL Trx protein, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 1.85 Å R-free 0.261
4TRX HIGH-RESOLUTION THREE-DIMENSIONAL STRUCTURE OF REDUCED RECOMBINANT HUMAN THIOREDOXIN IN SOLUTION 提交 1990-12-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–104（104 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件	分辨率未提供
5DQY A fully oxidized human thioredoxin 提交 2015-09-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–105（104 aa）	未记录	BEZ BENZOIC ACID × 1 CL CHLORIDE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；294.15 K；Ammonium citrate, Bis-Tris propane	分辨率 1.40 Å R-free 0.209
5DQY A fully oxidized human thioredoxin 提交 2015-09-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–105（104 aa）	未记录	BEZ BENZOIC ACID × 2 CL CHLORIDE ION × 2 GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；294.15 K；Ammonium citrate, Bis-Tris propane	分辨率 1.40 Å R-free 0.209

共 34 个其他 PDB 条目、59 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	THIO_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 13–117； UniProt 1–105 作者链 D； PDB构建体 13–117； UniProt 1–105

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	4puf
沉积日期 deposition_date	2014-03-13
结构标题 title	Complex between the Salmonella T3SS effector SlrP and its human target thioredoxin-1
关键词 keywords	LRR domain, NEL domain, E3 ubiquitin ligase, human thioredoxin 1, LIGASE -OXIDOREDUCTASE complex, LIGASE-OXIDOREDUCTASE complex; LIGASE/OXIDOREDUCTASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	44.25 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	44.26 Å
零角强度 I(0) i0	394272000.00
分子量 molecular_weight	161900.0 kDa
排除体积 excluded_volume	202540 Å³
包络体积 envelope_volume	301380 Å³
水化壳体积 shell_volume	59523 Å³
包络直径 envelope_diameter	166.4 Å
壳层 Rg shell_rg	46.00 Å
包络 Rg envelope_rg	44.59 Å
形状 Rg shape_rg	44.26 Å
总 Rg total_rg	44.37 Å
总原子数 total_atoms	11382
残基数 n_residues	1421
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	158.0 Å
Rg (实空间) rg_real	44.59 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	1.98 Å
I(0) (实空间) i0_real	3.9430e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	7.9820e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	44.25 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	394100000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8362
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	48.3 Å
偏度 Skewness skewness	0.606
峰度 Kurtosis kurtosis	0.143
角度范围 angular_range	— – 0.1800 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	51160000.0000
实空间数据点数 n_real_points	37
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.733; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.903; Smooth: 0.766

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	E3 ubiquitin-protein ligase SlrP
分子量 formula_weight	72967.6 kDa
EC 编号 ec_number	6.3.2.-
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	11382

MRGSHHHHHHGSKDAVNYELIWSEWVKEAPAKEAANREEAVQRMRDCLKNNKTELRLKILGLTTIPAYIPEQITTLILDNNELKSLPENLQGNIKTLYANSNQLTSIPATLPDTIQEMELSINRITELPERLPSALQSLDLFHNKISCLPENLPEELRYLSVYDNSIRTLPAHLPSEITHLNVQSNSLTALPETLPPGLKTLEAGENALTSLPASLPPELQVLDVSKNQITVLPETLPPTITTLDVSRNALTNLPENLPAALQIMQASRNNLVRLPESLPHFRGEGPQPTRIIVEYNPFSERTIQNMQRLMSSVDYQGPRVLFAMGDFSIVRVTRPLHQAVQGWLTSLEEEDVNQWRAFEAEANAAAFSGFLDYLGDTQNTRHPDFKEQVSAWLMRLAEDSALRETVFIIAMNATISCEDRVTLAYHQMQEATLVHDAERGAFDSHLAELIMAGREIFRLEQIESLAREKVKRLFFIDEVEVFLGFQNQLRESLSLTTMTRDMRFYNVSGITESDLDEAEIRIKMAENRDFHKWFALWGPWHKVLERIAPEEWREMMAKRDECIETDEYQSRVNAELEDLRIADDSDAERTTEVQMDAERAIGIKIMEEINQTLFTEIMENILLKKEVSSLMSAYWR

来源 Source

来源生物 organism	Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	588858
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Thioredoxin
分子量 formula_weight	13156.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,D

MRGSHHHHHHGSMVKQIESKTAFQEALDAAGDKLVVVDFSATWCGPCKMIKPFFHSLSEKYSNVIFLEVDVDDCQDVASECEVKCMPTFQFFKKGQKVGEFSGANKEKLEATINELV

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id	4pufA01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	80 — Alpha-Beta Horseshoe
拓扑 Topology topology	10 — Leucine-rich repeat, LRR (right-handed beta-alpha superhelix)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Ribonuclease Inhibitor

结构域编号 domain_id	4pufB01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	80 — Alpha-Beta Horseshoe
拓扑 Topology topology	10 — Leucine-rich repeat, LRR (right-handed beta-alpha superhelix)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Ribonuclease Inhibitor

结构域编号 domain_id	4pufC00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	30 — Glutaredoxin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Glutaredoxin

结构域编号 domain_id	4pufD00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	30 — Glutaredoxin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Glutaredoxin

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	106.290 Å
晶胞边长 b length_b	134.830 Å
晶胞边长 c length_c	154.620 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	19
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.296 Å
最低分辨率 resolution_low	43.854 Å
R 因子 r_factor	0.2735
R_work r_work	0.2717
R_free r_free	0.3084

fit	/app/data/saxs_computation/pu/4puf/4puf.fit
pddf	/app/data/pr_computation/pu/4puf/4puf.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/pu/4puf/4puf.dat

Complex between the Salmonella T3SS effector SlrP and its human target thioredoxin-1

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

E3 ubiquitin-protein ligase SlrP

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Thioredoxin

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

CATH v4.4 (4 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)