4v8s

Archaeal RNAP-DNA binary complex at 4.32Ang

Method: X-RAY DIFFRACTION

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT K

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 13 DNA 2	5'-D(TPCPTPTPAPTPAPCPTPCPTPAPTPCP)-3' × 1 ;5'-D(APTPAPGPAPGPTPAPTPAPAPGPAPTP APG)-3' ; × 1 RNA POLYMERASE SUBUNIT 13 × 1 （B8YB65） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT L × 1 （B8YB62） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT N × 1 （B8YB63） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE × 1 （B8YB55） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT D × 1 （B8YB56） RNA POLYMERASE SUBUNIT 7 × 1 （B8YB57） RNA POLYMERASE SUBUNIT 4 × 1 （B8YB58） RNA POLYMERASE SUBUNIT 8 × 1 （B8YB59） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE × 1 （B8YB53） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT P × 1 （B8YB64） ;DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT A'' ; × 1 （B8YB54） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT H × 1 （B8YB60） ZINC ION × 6 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致
2	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 13 DNA 2	5'-D(TPCPTPTPAPTPAPCPTPCPTPAPTPCP)-3' × 1 ;5'-D(APTPAPGPAPGPTPAPTPAPAPGPAPTP APG)-3' ; × 1 RNA POLYMERASE SUBUNIT 13 × 1 （B8YB65） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT L × 1 （B8YB62） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT N × 1 （B8YB63） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE × 1 （B8YB55） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT D × 1 （B8YB56） RNA POLYMERASE SUBUNIT 7 × 1 （B8YB57） RNA POLYMERASE SUBUNIT 4 × 1 （B8YB58） RNA POLYMERASE SUBUNIT 8 × 1 （B8YB59） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE × 1 （B8YB53） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT P × 1 （B8YB64） ;DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT A'' ; × 1 （B8YB54） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT H × 1 （B8YB60） ZINC ION × 6 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	B8YB61_SULSH
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 AI； PDB构建体 1–95； UniProt 1–95 作者链 BK； PDB构建体 1–95； UniProt 1–95

RNA POLYMERASE SUBUNIT 13

物种未注明

UniProt B8YB65

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 13 DNA 2	5'-D(TPCPTPTPAPTPAPCPTPCPTPAPTPCP)-3' × 1 ;5'-D(APTPAPGPAPGPTPAPTPAPAPGPAPTP APG)-3' ; × 1 DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT K × 1 （B8YB61） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT L × 1 （B8YB62） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT N × 1 （B8YB63） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE × 1 （B8YB55） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT D × 1 （B8YB56） RNA POLYMERASE SUBUNIT 7 × 1 （B8YB57） RNA POLYMERASE SUBUNIT 4 × 1 （B8YB58） RNA POLYMERASE SUBUNIT 8 × 1 （B8YB59） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE × 1 （B8YB53） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT P × 1 （B8YB64） ;DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT A'' ; × 1 （B8YB54） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT H × 1 （B8YB60） ZINC ION × 6 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致
2	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 13 DNA 2	5'-D(TPCPTPTPAPTPAPCPTPCPTPAPTPCP)-3' × 1 ;5'-D(APTPAPGPAPGPTPAPTPAPAPGPAPTP APG)-3' ; × 1 DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT K × 1 （B8YB61） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT L × 1 （B8YB62） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT N × 1 （B8YB63） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE × 1 （B8YB55） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT D × 1 （B8YB56） RNA POLYMERASE SUBUNIT 7 × 1 （B8YB57） RNA POLYMERASE SUBUNIT 4 × 1 （B8YB58） RNA POLYMERASE SUBUNIT 8 × 1 （B8YB59） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE × 1 （B8YB53） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT P × 1 （B8YB64） ;DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT A'' ; × 1 （B8YB54） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT H × 1 （B8YB60） ZINC ION × 6 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	B8YB65_SULSH
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 AJ； PDB构建体 1–104； UniProt 1–104 作者链 BQ； PDB构建体 1–104； UniProt 1–104

DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT L

物种未注明

UniProt B8YB62

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 13 DNA 2	5'-D(TPCPTPTPAPTPAPCPTPCPTPAPTPCP)-3' × 1 ;5'-D(APTPAPGPAPGPTPAPTPAPAPGPAPTP APG)-3' ; × 1 DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT K × 1 （B8YB61） RNA POLYMERASE SUBUNIT 13 × 1 （B8YB65） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT N × 1 （B8YB63） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE × 1 （B8YB55） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT D × 1 （B8YB56） RNA POLYMERASE SUBUNIT 7 × 1 （B8YB57） RNA POLYMERASE SUBUNIT 4 × 1 （B8YB58） RNA POLYMERASE SUBUNIT 8 × 1 （B8YB59） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE × 1 （B8YB53） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT P × 1 （B8YB64） ;DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT A'' ; × 1 （B8YB54） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT H × 1 （B8YB60） ZINC ION × 6 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致
2	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 13 DNA 2	5'-D(TPCPTPTPAPTPAPCPTPCPTPAPTPCP)-3' × 1 ;5'-D(APTPAPGPAPGPTPAPTPAPAPGPAPTP APG)-3' ; × 1 DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT K × 1 （B8YB61） RNA POLYMERASE SUBUNIT 13 × 1 （B8YB65） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT N × 1 （B8YB63） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE × 1 （B8YB55） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT D × 1 （B8YB56） RNA POLYMERASE SUBUNIT 7 × 1 （B8YB57） RNA POLYMERASE SUBUNIT 4 × 1 （B8YB58） RNA POLYMERASE SUBUNIT 8 × 1 （B8YB59） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE × 1 （B8YB53） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT P × 1 （B8YB64） ;DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT A'' ; × 1 （B8YB54） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT H × 1 （B8YB60） ZINC ION × 6 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	B8YB62_SULSH
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 AM； PDB构建体 1–92； UniProt 1–92 作者链 BL； PDB构建体 1–92； UniProt 1–92

DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT N

物种未注明

UniProt B8YB63

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 13 DNA 2	5'-D(TPCPTPTPAPTPAPCPTPCPTPAPTPCP)-3' × 1 ;5'-D(APTPAPGPAPGPTPAPTPAPAPGPAPTP APG)-3' ; × 1 DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT K × 1 （B8YB61） RNA POLYMERASE SUBUNIT 13 × 1 （B8YB65） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT L × 1 （B8YB62） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE × 1 （B8YB55） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT D × 1 （B8YB56） RNA POLYMERASE SUBUNIT 7 × 1 （B8YB57） RNA POLYMERASE SUBUNIT 4 × 1 （B8YB58） RNA POLYMERASE SUBUNIT 8 × 1 （B8YB59） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE × 1 （B8YB53） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT P × 1 （B8YB64） ;DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT A'' ; × 1 （B8YB54） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT H × 1 （B8YB60） ZINC ION × 6 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致
2	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 13 DNA 2	5'-D(TPCPTPTPAPTPAPCPTPCPTPAPTPCP)-3' × 1 ;5'-D(APTPAPGPAPGPTPAPTPAPAPGPAPTP APG)-3' ; × 1 DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT K × 1 （B8YB61） RNA POLYMERASE SUBUNIT 13 × 1 （B8YB65） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT L × 1 （B8YB62） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE × 1 （B8YB55） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT D × 1 （B8YB56） RNA POLYMERASE SUBUNIT 7 × 1 （B8YB57） RNA POLYMERASE SUBUNIT 4 × 1 （B8YB58） RNA POLYMERASE SUBUNIT 8 × 1 （B8YB59） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE × 1 （B8YB53） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT P × 1 （B8YB64） ;DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT A'' ; × 1 （B8YB54） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT H × 1 （B8YB60） ZINC ION × 6 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	B8YB63_SULSH
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 AO； PDB构建体 1–66； UniProt 1–66 作者链 BN； PDB构建体 1–66； UniProt 1–66

DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE

物种未注明

UniProt B8YB55

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 13 DNA 2	5'-D(TPCPTPTPAPTPAPCPTPCPTPAPTPCP)-3' × 1 ;5'-D(APTPAPGPAPGPTPAPTPAPAPGPAPTP APG)-3' ; × 1 DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT K × 1 （B8YB61） RNA POLYMERASE SUBUNIT 13 × 1 （B8YB65） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT L × 1 （B8YB62） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT N × 1 （B8YB63） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT D × 1 （B8YB56） RNA POLYMERASE SUBUNIT 7 × 1 （B8YB57） RNA POLYMERASE SUBUNIT 4 × 1 （B8YB58） RNA POLYMERASE SUBUNIT 8 × 1 （B8YB59） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE × 1 （B8YB53） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT P × 1 （B8YB64） ;DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT A'' ; × 1 （B8YB54） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT H × 1 （B8YB60） ZINC ION × 6 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致
2	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 13 DNA 2	5'-D(TPCPTPTPAPTPAPCPTPCPTPAPTPCP)-3' × 1 ;5'-D(APTPAPGPAPGPTPAPTPAPAPGPAPTP APG)-3' ; × 1 DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT K × 1 （B8YB61） RNA POLYMERASE SUBUNIT 13 × 1 （B8YB65） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT L × 1 （B8YB62） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT N × 1 （B8YB63） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT D × 1 （B8YB56） RNA POLYMERASE SUBUNIT 7 × 1 （B8YB57） RNA POLYMERASE SUBUNIT 4 × 1 （B8YB58） RNA POLYMERASE SUBUNIT 8 × 1 （B8YB59） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE × 1 （B8YB53） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT P × 1 （B8YB64） ;DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT A'' ; × 1 （B8YB54） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT H × 1 （B8YB60） ZINC ION × 6 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	B8YB55_SULSH
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 AR； PDB构建体 1–1131； UniProt 1–1131 作者链 BB； PDB构建体 1–1131； UniProt 1–1131

DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT D

物种未注明

UniProt B8YB56

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 13 DNA 2	5'-D(TPCPTPTPAPTPAPCPTPCPTPAPTPCP)-3' × 1 ;5'-D(APTPAPGPAPGPTPAPTPAPAPGPAPTP APG)-3' ; × 1 DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT K × 1 （B8YB61） RNA POLYMERASE SUBUNIT 13 × 1 （B8YB65） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT L × 1 （B8YB62） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT N × 1 （B8YB63） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE × 1 （B8YB55） RNA POLYMERASE SUBUNIT 7 × 1 （B8YB57） RNA POLYMERASE SUBUNIT 4 × 1 （B8YB58） RNA POLYMERASE SUBUNIT 8 × 1 （B8YB59） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE × 1 （B8YB53） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT P × 1 （B8YB64） ;DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT A'' ; × 1 （B8YB54） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT H × 1 （B8YB60） ZINC ION × 6 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致
2	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 13 DNA 2	5'-D(TPCPTPTPAPTPAPCPTPCPTPAPTPCP)-3' × 1 ;5'-D(APTPAPGPAPGPTPAPTPAPAPGPAPTP APG)-3' ; × 1 DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT K × 1 （B8YB61） RNA POLYMERASE SUBUNIT 13 × 1 （B8YB65） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT L × 1 （B8YB62） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT N × 1 （B8YB63） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE × 1 （B8YB55） RNA POLYMERASE SUBUNIT 7 × 1 （B8YB57） RNA POLYMERASE SUBUNIT 4 × 1 （B8YB58） RNA POLYMERASE SUBUNIT 8 × 1 （B8YB59） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE × 1 （B8YB53） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT P × 1 （B8YB64） ;DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT A'' ; × 1 （B8YB54） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT H × 1 （B8YB60） ZINC ION × 6 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	B8YB56_SULSH
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 AS； PDB构建体 1–265； UniProt 1–265 作者链 BD； PDB构建体 1–265； UniProt 1–265

RNA POLYMERASE SUBUNIT 7

物种未注明

UniProt B8YB57

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 13 DNA 2	5'-D(TPCPTPTPAPTPAPCPTPCPTPAPTPCP)-3' × 1 ;5'-D(APTPAPGPAPGPTPAPTPAPAPGPAPTP APG)-3' ; × 1 DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT K × 1 （B8YB61） RNA POLYMERASE SUBUNIT 13 × 1 （B8YB65） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT L × 1 （B8YB62） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT N × 1 （B8YB63） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE × 1 （B8YB55） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT D × 1 （B8YB56） RNA POLYMERASE SUBUNIT 4 × 1 （B8YB58） RNA POLYMERASE SUBUNIT 8 × 1 （B8YB59） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE × 1 （B8YB53） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT P × 1 （B8YB64） ;DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT A'' ; × 1 （B8YB54） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT H × 1 （B8YB60） ZINC ION × 6 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致
2	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 13 DNA 2	5'-D(TPCPTPTPAPTPAPCPTPCPTPAPTPCP)-3' × 1 ;5'-D(APTPAPGPAPGPTPAPTPAPAPGPAPTP APG)-3' ; × 1 DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT K × 1 （B8YB61） RNA POLYMERASE SUBUNIT 13 × 1 （B8YB65） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT L × 1 （B8YB62） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT N × 1 （B8YB63） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE × 1 （B8YB55） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT D × 1 （B8YB56） RNA POLYMERASE SUBUNIT 4 × 1 （B8YB58） RNA POLYMERASE SUBUNIT 8 × 1 （B8YB59） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE × 1 （B8YB53） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT P × 1 （B8YB64） ;DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT A'' ; × 1 （B8YB54） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT H × 1 （B8YB60） ZINC ION × 6 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	B8YB57_SULSH
Isoform	—
PDB实体	9
链与序列区间	作者链 AT； PDB构建体 1–180； UniProt 1–180 作者链 BE； PDB构建体 1–180； UniProt 1–180

RNA POLYMERASE SUBUNIT 4

物种未注明

UniProt B8YB58

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 13 DNA 2	5'-D(TPCPTPTPAPTPAPCPTPCPTPAPTPCP)-3' × 1 ;5'-D(APTPAPGPAPGPTPAPTPAPAPGPAPTP APG)-3' ; × 1 DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT K × 1 （B8YB61） RNA POLYMERASE SUBUNIT 13 × 1 （B8YB65） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT L × 1 （B8YB62） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT N × 1 （B8YB63） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE × 1 （B8YB55） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT D × 1 （B8YB56） RNA POLYMERASE SUBUNIT 7 × 1 （B8YB57） RNA POLYMERASE SUBUNIT 8 × 1 （B8YB59） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE × 1 （B8YB53） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT P × 1 （B8YB64） ;DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT A'' ; × 1 （B8YB54） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT H × 1 （B8YB60） ZINC ION × 6 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致
2	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 13 DNA 2	5'-D(TPCPTPTPAPTPAPCPTPCPTPAPTPCP)-3' × 1 ;5'-D(APTPAPGPAPGPTPAPTPAPAPGPAPTP APG)-3' ; × 1 DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT K × 1 （B8YB61） RNA POLYMERASE SUBUNIT 13 × 1 （B8YB65） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT L × 1 （B8YB62） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT N × 1 （B8YB63） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE × 1 （B8YB55） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT D × 1 （B8YB56） RNA POLYMERASE SUBUNIT 7 × 1 （B8YB57） RNA POLYMERASE SUBUNIT 8 × 1 （B8YB59） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE × 1 （B8YB53） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT P × 1 （B8YB64） ;DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT A'' ; × 1 （B8YB54） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT H × 1 （B8YB60） ZINC ION × 6 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	B8YB58_SULSH
Isoform	—
PDB实体	10
链与序列区间	作者链 AU； PDB构建体 1–113； UniProt 1–113 作者链 BF； PDB构建体 1–113； UniProt 1–113

RNA POLYMERASE SUBUNIT 8

物种未注明

UniProt B8YB59

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 13 DNA 2	5'-D(TPCPTPTPAPTPAPCPTPCPTPAPTPCP)-3' × 1 ;5'-D(APTPAPGPAPGPTPAPTPAPAPGPAPTP APG)-3' ; × 1 DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT K × 1 （B8YB61） RNA POLYMERASE SUBUNIT 13 × 1 （B8YB65） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT L × 1 （B8YB62） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT N × 1 （B8YB63） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE × 1 （B8YB55） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT D × 1 （B8YB56） RNA POLYMERASE SUBUNIT 7 × 1 （B8YB57） RNA POLYMERASE SUBUNIT 4 × 1 （B8YB58） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE × 1 （B8YB53） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT P × 1 （B8YB64） ;DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT A'' ; × 1 （B8YB54） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT H × 1 （B8YB60） ZINC ION × 6 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致
2	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 13 DNA 2	5'-D(TPCPTPTPAPTPAPCPTPCPTPAPTPCP)-3' × 1 ;5'-D(APTPAPGPAPGPTPAPTPAPAPGPAPTP APG)-3' ; × 1 DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT K × 1 （B8YB61） RNA POLYMERASE SUBUNIT 13 × 1 （B8YB65） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT L × 1 （B8YB62） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT N × 1 （B8YB63） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE × 1 （B8YB55） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT D × 1 （B8YB56） RNA POLYMERASE SUBUNIT 7 × 1 （B8YB57） RNA POLYMERASE SUBUNIT 4 × 1 （B8YB58） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE × 1 （B8YB53） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT P × 1 （B8YB64） ;DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT A'' ; × 1 （B8YB54） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT H × 1 （B8YB60） ZINC ION × 6 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	B8YB59_SULSH
Isoform	—
PDB实体	11
链与序列区间	作者链 AV； PDB构建体 1–132； UniProt 1–132 作者链 BG； PDB构建体 1–132； UniProt 1–132

DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE

物种未注明

UniProt B8YB53

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 13 DNA 2	5'-D(TPCPTPTPAPTPAPCPTPCPTPAPTPCP)-3' × 1 ;5'-D(APTPAPGPAPGPTPAPTPAPAPGPAPTP APG)-3' ; × 1 DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT K × 1 （B8YB61） RNA POLYMERASE SUBUNIT 13 × 1 （B8YB65） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT L × 1 （B8YB62） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT N × 1 （B8YB63） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE × 1 （B8YB55） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT D × 1 （B8YB56） RNA POLYMERASE SUBUNIT 7 × 1 （B8YB57） RNA POLYMERASE SUBUNIT 4 × 1 （B8YB58） RNA POLYMERASE SUBUNIT 8 × 1 （B8YB59） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT P × 1 （B8YB64） ;DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT A'' ; × 1 （B8YB54） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT H × 1 （B8YB60） ZINC ION × 6 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致
2	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 13 DNA 2	5'-D(TPCPTPTPAPTPAPCPTPCPTPAPTPCP)-3' × 1 ;5'-D(APTPAPGPAPGPTPAPTPAPAPGPAPTP APG)-3' ; × 1 DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT K × 1 （B8YB61） RNA POLYMERASE SUBUNIT 13 × 1 （B8YB65） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT L × 1 （B8YB62） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT N × 1 （B8YB63） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE × 1 （B8YB55） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT D × 1 （B8YB56） RNA POLYMERASE SUBUNIT 7 × 1 （B8YB57） RNA POLYMERASE SUBUNIT 4 × 1 （B8YB58） RNA POLYMERASE SUBUNIT 8 × 1 （B8YB59） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT P × 1 （B8YB64） ;DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT A'' ; × 1 （B8YB54） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT H × 1 （B8YB60） ZINC ION × 6 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	B8YB53_SULSH
Isoform	—
PDB实体	12
链与序列区间	作者链 AW； PDB构建体 1–880； UniProt 1–880 作者链 BA； PDB构建体 1–880； UniProt 1–880

DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT P

物种未注明

UniProt B8YB64

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 13 DNA 2	5'-D(TPCPTPTPAPTPAPCPTPCPTPAPTPCP)-3' × 1 ;5'-D(APTPAPGPAPGPTPAPTPAPAPGPAPTP APG)-3' ; × 1 DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT K × 1 （B8YB61） RNA POLYMERASE SUBUNIT 13 × 1 （B8YB65） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT L × 1 （B8YB62） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT N × 1 （B8YB63） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE × 1 （B8YB55） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT D × 1 （B8YB56） RNA POLYMERASE SUBUNIT 7 × 1 （B8YB57） RNA POLYMERASE SUBUNIT 4 × 1 （B8YB58） RNA POLYMERASE SUBUNIT 8 × 1 （B8YB59） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE × 1 （B8YB53） ;DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT A'' ; × 1 （B8YB54） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT H × 1 （B8YB60） ZINC ION × 6 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致
2	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 13 DNA 2	5'-D(TPCPTPTPAPTPAPCPTPCPTPAPTPCP)-3' × 1 ;5'-D(APTPAPGPAPGPTPAPTPAPAPGPAPTP APG)-3' ; × 1 DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT K × 1 （B8YB61） RNA POLYMERASE SUBUNIT 13 × 1 （B8YB65） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT L × 1 （B8YB62） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT N × 1 （B8YB63） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE × 1 （B8YB55） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT D × 1 （B8YB56） RNA POLYMERASE SUBUNIT 7 × 1 （B8YB57） RNA POLYMERASE SUBUNIT 4 × 1 （B8YB58） RNA POLYMERASE SUBUNIT 8 × 1 （B8YB59） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE × 1 （B8YB53） ;DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT A'' ; × 1 （B8YB54） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT H × 1 （B8YB60） ZINC ION × 6 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	B8YB64_SULSH
Isoform	—
PDB实体	13
链与序列区间	作者链 AX； PDB构建体 1–48； UniProt 1–48 作者链 BP； PDB构建体 1–48； UniProt 1–48

;DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT A'' ;

物种未注明

UniProt B8YB54

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 13 DNA 2	5'-D(TPCPTPTPAPTPAPCPTPCPTPAPTPCP)-3' × 1 ;5'-D(APTPAPGPAPGPTPAPTPAPAPGPAPTP APG)-3' ; × 1 DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT K × 1 （B8YB61） RNA POLYMERASE SUBUNIT 13 × 1 （B8YB65） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT L × 1 （B8YB62） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT N × 1 （B8YB63） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE × 1 （B8YB55） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT D × 1 （B8YB56） RNA POLYMERASE SUBUNIT 7 × 1 （B8YB57） RNA POLYMERASE SUBUNIT 4 × 1 （B8YB58） RNA POLYMERASE SUBUNIT 8 × 1 （B8YB59） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE × 1 （B8YB53） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT P × 1 （B8YB64） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT H × 1 （B8YB60） ZINC ION × 6 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致
2	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 13 DNA 2	5'-D(TPCPTPTPAPTPAPCPTPCPTPAPTPCP)-3' × 1 ;5'-D(APTPAPGPAPGPTPAPTPAPAPGPAPTP APG)-3' ; × 1 DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT K × 1 （B8YB61） RNA POLYMERASE SUBUNIT 13 × 1 （B8YB65） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT L × 1 （B8YB62） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT N × 1 （B8YB63） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE × 1 （B8YB55） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT D × 1 （B8YB56） RNA POLYMERASE SUBUNIT 7 × 1 （B8YB57） RNA POLYMERASE SUBUNIT 4 × 1 （B8YB58） RNA POLYMERASE SUBUNIT 8 × 1 （B8YB59） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE × 1 （B8YB53） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT P × 1 （B8YB64） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT H × 1 （B8YB60） ZINC ION × 6 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	B8YB54_SULSH
Isoform	—
PDB实体	14
链与序列区间	作者链 AY； PDB构建体 1–395； UniProt 1–395 作者链 BC； PDB构建体 1–395； UniProt 1–395

DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT H

物种未注明

UniProt B8YB60

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 13 DNA 2	5'-D(TPCPTPTPAPTPAPCPTPCPTPAPTPCP)-3' × 1 ;5'-D(APTPAPGPAPGPTPAPTPAPAPGPAPTP APG)-3' ; × 1 DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT K × 1 （B8YB61） RNA POLYMERASE SUBUNIT 13 × 1 （B8YB65） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT L × 1 （B8YB62） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT N × 1 （B8YB63） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE × 1 （B8YB55） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT D × 1 （B8YB56） RNA POLYMERASE SUBUNIT 7 × 1 （B8YB57） RNA POLYMERASE SUBUNIT 4 × 1 （B8YB58） RNA POLYMERASE SUBUNIT 8 × 1 （B8YB59） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE × 1 （B8YB53） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT P × 1 （B8YB64） ;DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT A'' ; × 1 （B8YB54） ZINC ION × 6 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致
2	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 13 DNA 2	5'-D(TPCPTPTPAPTPAPCPTPCPTPAPTPCP)-3' × 1 ;5'-D(APTPAPGPAPGPTPAPTPAPAPGPAPTP APG)-3' ; × 1 DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT K × 1 （B8YB61） RNA POLYMERASE SUBUNIT 13 × 1 （B8YB65） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT L × 1 （B8YB62） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT N × 1 （B8YB63） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE × 1 （B8YB55） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT D × 1 （B8YB56） RNA POLYMERASE SUBUNIT 7 × 1 （B8YB57） RNA POLYMERASE SUBUNIT 4 × 1 （B8YB58） RNA POLYMERASE SUBUNIT 8 × 1 （B8YB59） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE × 1 （B8YB53） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT P × 1 （B8YB64） ;DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT A'' ; × 1 （B8YB54） ZINC ION × 6 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	B8YB60_SULSH
Isoform	—
PDB实体	15
链与序列区间	作者链 AZ； PDB构建体 1–84； UniProt 1–84 作者链 BH； PDB构建体 1–84； UniProt 1–84

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	4v8s
沉积日期 deposition_date	2012-07-12
结构标题 title	Archaeal RNAP-DNA binary complex at 4.32Ang
关键词 keywords	TRANSFERASE-DNA COMPLEX, TRANSCRIPTION; TRANSFERASE/DNA
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

▼

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

4v8s__assembly_2__model_1

Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

4v8s__assembly_2__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

4v8s__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	49.86 Å
Rg（电子密度）	49.58 Å
总 Rg	49.88 Å
原子数	55837
残基数	3442
排除体积	496100 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`4v8s__assembly_1__model_1`	pentadecameric （15）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`4v8s__assembly_2__model_1`	pentadecameric （15）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

▶

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

▶

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (18)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	5'-D(TPCPTPTPAPTPAPCPTPCPTPAPTPCP)-3'
分子量 formula_weight	4180.7 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide
链编号 strand_id	AC,BR
原子数 atom_count	111598

TCTTATACTCTATC

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	;5'-D(APTPAPGPAPGPTPAPTPAPAPGPAPTP APG)-3' ;
分子量 formula_weight	4994.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide
链编号 strand_id	AD,BS

ATAGAGTATAAGATAG

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT K
分子量 formula_weight	10729.5 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.7.6
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	AI,BK

MGLERDGILSQDLHFNEVFVSLWQNKLTRYEIARVISARALQLAMGAPALIDINNISSTDVISIAEEEFKRGVLPITIRRRLPNGKIILLSLRKS

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	RNA POLYMERASE SUBUNIT 13
分子量 formula_weight	12170.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	AJ,BQ

MVSGMSTEEEKEGTNDEEVSEEREVEETSEEEFPKLSIQDIELLMKNTEIWDNLLNGKISVDEAKRLFEDNYKDYEKRDSRRKAKKAASKKVKKTKKKEKSVEG

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT L
分子量 formula_weight	10211.8 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.7.6
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	AM,BL

MEIKILKSESNYLELEIEGEDHTLGNLIAGTLRKISGVSFASYYQPHPLTDKIIVKILTDGSIAPKDALLKAIETVRVMASHYIDEIKGLTK

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT N
分子量 formula_weight	7617.1 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.7.6
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	AO,BN

MMIPIRCFTCGSLIADKWQPFITRVNAGENPGKVLDDLGVKRYCCRRMLLSHIDIISEVIHYTRPI

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE
分子量 formula_weight	127582.0 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.7.6
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	AR,BB

MNELSSNLSIDERWKVIEAYFKSKGLVRQHLDSYNDFVRNKLQEIIDEQGEIPTEIPGLKVRLGKIRIGKPRVRESDRGEREISPMEARLRNLTYAAPLWLTMIPVENNIEAEPEEVYIGDLPIMLKSAIDPISQYTLDKLIEIGEDPKDPGGYFIVNGSERVIVTQEDLAPNRVLVDTGKTGSNITHTAKIISSTAGYRVPVTIERLKDGTFHVSFPAVPGKIPFVILMRALGILTDRDIVYAVSLDPEIQNELFPSLEQASSIANVDDALDFIGSRVAIGQKRENRIEKAQQIIDKYFLPHLGTSADDRRKKAYYLAYAISKVIELYLGRREPDDKDHYANKRLRLAGDLFASLFRVAFKAFVKDLTYQLEKSKVRGRKLALKALVRPDIVTERIRHALATGNWVGGRTGVSQLLDRTNWLSMLSHLRRVISSLARGQPNFEARDLHGTQWGRMCPFETPEGPNSGLVKNLALMAQIAVGINEKIVEKTLYEMGVVPVEEVIRRVTEGGEDQNEYLKWSKVILNGRLVGYYRDGEELAKKIRERRRKGEISDEVNVGHIVTDFINEVHVNCDSGRVRRPLIIVSNGNPLVTREDIEKLDSGSITFDDLVRQGKIEYLDAEEEENAYVALEPSDLTPEHTHLEIWSPAILGITASIIPYPEHNQSPRNTYQSAMAKQALGLYAANYQLRTDTRAHLLHYPQRPLVQTRALDIIGYTNRPAGNNAILAVISFTGYNMEDSIIMNRSSVERGMYRSTFFRLYSTEEVKYPGGQEDKIVMPEPGVRGYKGKEYYRLLEDNGVVSPEVEVKGGDVLIGKVSPPRFLQEFKELSPEQAKRDTSIVTRHGEMGIVDLVLITETAEGNKLVKVRVRDLRIPSIGDKFASRHGQKGVIGMLIPQVDMPYTVKGVVPDVILNPHALPSRMTLGQIMEGIAGKYAALSGNIVDATPFYKTPIEQLQNEILKYGYLPDATEVTYDGRTGQKIKSRIYFGVVYYQKLHHMVADKIHARARGPVQILTRQPTEGRAREGGLRFGEMERDCLIGFGTAMLLKDRLLDNSDRTTIYVCDQCGYIGWYDKNKNKYVCPIHGDKSNLFPVTVSYAFKLLIQELMSMIISPRLILEDRVGLSGGKGNE

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT D
分子量 formula_weight	30179.1 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.7.6
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	AS,BD

MSINLLHKDDKRIDLVFEGYPLEFVNAIRRAAMLYVPVMSIDDVYFIENNSPLYDEILAHRLALIPFTSEEALDTYRWPEECIDCTENCEKCYTKIYIEAEALNEPKMLYSKDIKSEDPSIVPISGDIPIVLLGANQKISLEARLRLGYGKEHAKFIPVSLAIVRYYPKVEILGNCEKGATVCPEGVFELKDGKLSVKNELACTLCEECLRYCNGLIRISSVEDKYILELESVGSLKPERILLEAGKSIIRKIEELEKKLVEVIK

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	RNA POLYMERASE SUBUNIT 7
分子量 formula_weight	20328.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	AT,BE

MYKLIKARSIVRIPPNEFGKPLNEIALNELRQQYQEKILKDLGLVLAILNVKTSEEGMLVFGDGATYHEVEFDMITYVPVVQEVVEGEVLQVDNYGVFVNLGPMDGLVHISQITDDTLKYDNVRGIIFGEKSKKVIQKGDKVRARVISVASTVTGRLPRIALTMRQPYLGKLEWITQAKK

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	RNA POLYMERASE SUBUNIT 4
分子量 formula_weight	12822.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	AU,BF

MSSVYIVEEHYIPYSVAKKLLSDVIKSGSSSNLLQRTYDYLNSVEKCDAESAQKVVEELSSIISREDVRAVLASICPITPDEVRSILIMDSNRTYTSEDIQKIIDIIRKYIKS

实体 11 Entity 11 polymer

描述 description	RNA POLYMERASE SUBUNIT 8
分子量 formula_weight	15139.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	AV,BG

MMESKAQEIILSCEINSIERGSLKNLSIIHMSCNDFNISFDIIDSINIFSQKEKVKAFISKNRLSYTNDDFCGHGYIVTELKDSSSNNGNRYITIISLFGLLVKIISNKESFLKIHQLNVMDHIYFCVKKNT

实体 12 Entity 12 polymer

描述 description	DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE
分子量 formula_weight	99766.5 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.7.6
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	AW,BA

MSEKNIKGIKFGILSPDEIRKMSVTAIITPDVYDEDGTPIEGSVMDPRLGVIEPGQKCPTCGNTLGNCPGHFGHIELVRPVIHVGFVKHVYEFLKATCRRCGRVKISEDEIEKYSRIYNAIKKRWPSAARRLTEYVKKTAMKAQVCPHCGEKQFKIKLEKPYNFYEERKEGVAKLTPSDIRERLEKVPESDVEILGYDPTTSRPEWMILTVLPVPPITIRPSIMIESGIRAEDDLTHKLVDIVRINERLKESIDAGAPQLIIEDLWDLLQYHVATYFDNEIPGLPPSKHRSGRPLRTLAQRLKGKEGRFRGNLSGKRVDFSSRTVISPDPNISIDEVGVPEIIARTLTVPERITPWNIEKLRQFVINGPDKWPGANYVIRPDGRRIDLRYVKDRKELASTLAPGYVVERHLTDGDVVLFNRQPSLHRISMMAHRVRVLKGLTFRLNLLVCPPYNADFDGDEMNLHVPQSEEAIAEAKEIMLVHKNIITPRYGGPIIGAAQDYISGAYLLTVKTTLLTKEEAQQILGVADVKIDLGEPAILAPREYYTGKQVVSAFLPKDFNFHGQANVSSGPRLCKNEDCPHDSYVVIKNGILLEGVFDKKAIGNQQPESILHWLIKEYSDEYGKWLMDNLFRVFIRFVELQGFTMRLEDVSLGDDVKKEIYNEIDRAKVEVDNLIQKYKNGELEPIPGRTLEESLENYILDTLDKLRSTAGDIASKYLDPFNFAYVMARTGARGSVLNITQMAAMLGQQSVRGERIKRGYMTRTLPHFKPYDISPEARGFIYSSFRTGLKPTELFFHAAGGREGLVDTAVRTSQSGYMQRRLINALSDLRAEYDGTVRSLYGEVIQVAYGDDGVFPMYSAHGKTVDVNRIFERVVGWKT

实体 13 Entity 13 polymer

描述 description	DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT P
分子量 formula_weight	5607.0 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.7.6
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	AX,BP

MAVYRCGKCWKTFTDEQLKVLPGVRCPYCGYKIIFMVRKPTIKIVKAI

实体 14 Entity 14 polymer

描述 description	;DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT A'' ;
分子量 formula_weight	43792.8 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.7.6
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	AY,BC

MENVIDEKDKSYLEEKVKQASNILPQKIVEDLKNLISNKEVLVTRDEIDKIFDLAIKEYSEGLIAPGEAIGIVAAQSVGEPGTQMTLRTFHFAGIRELNVTLGLPRLIEIVDAKKVPSTPMMTIYLTDEYKHDKEKALEVARKLEYTKIENVVSSTSIDIASMSIILQLDNEMLKDKGVTVDDVKKAINRLKLGEFVIDESEGNTLNISFANIDSIAALFKLRDKILNTKIKGIKGIKRAIVQKKGDEYIILTDGSNLSGVLSVKGVDIAKVETNNIREIEEVFGIEAAREIIIREISKVLAEQGLDVDMRHILLVADVMTRTGVVRQIGRHGVTGEKNSVLARAAFEVTVKHLLDAAARGDVEEFKGVVENIIIGHPIKLGTGMVELTMRPILR

实体 15 Entity 15 polymer

描述 description	DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT H
分子量 formula_weight	9688.3 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.7.6
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	AZ,BH

MRGSSNRKIDPRIHYLVPKHEVLSIDEAYKILKELGIRPEQLPWIRASDPVARSINAKPGDIIRIIRKSQLYGEVVSYRYVISG

实体 16 Entity 16 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	12

实体 17 Entity 17 non-polymer

描述 description	IRON/SULFUR CLUSTER
分子量 formula_weight	351.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 18 Entity 18 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

▶

晶胞边长 a length_a	134.134 Å
晶胞边长 b length_b	199.416 Å
晶胞边长 c length_c	214.246 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	103.54 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	4.323 Å
最低分辨率 resolution_low	50.424 Å
R 因子 r_factor	0.2926
R_work r_work	0.2917
R_free r_free	0.3105

Archaeal RNAP-DNA binary complex at 4.32Ang

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT K

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

RNA POLYMERASE SUBUNIT 13

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT L

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT N

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE SUBUNIT D

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

RNA POLYMERASE SUBUNIT 7

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

RNA POLYMERASE SUBUNIT 4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

RNA POLYMERASE SUBUNIT 8

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体