4x2g

Selection of fragments for kinase inhibitor design: decoration is key

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 66.1 Å Quality: GOOD

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

TGF-beta receptor type-1

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 200–503	片段：UNP residues 200-503	3WK 4-[(4-aminophenyl)amino]pyrido[2,3-d]pyrimidin-5(6H)-one × 1 SO4 SULFATE ION × 1 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M Tris-HCl, 240 mM Li2SO4, 24% PEG 4000, pH 7.5	分辨率 1.51 Å R-free 0.185

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 4X2G	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1B6C CRYSTAL STRUCTURE OF THE CYTOPLASMIC DOMAIN OF THE TYPE I TGF-BETA RECEPTOR IN COMPLEX WITH FKBP12 提交 1999-01-13	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 162–503（342 aa）片段：CYTOPLASMIC PORTION	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；pH 8.5	分辨率 2.60 Å R-free 0.269
1B6C CRYSTAL STRUCTURE OF THE CYTOPLASMIC DOMAIN OF THE TYPE I TGF-BETA RECEPTOR IN COMPLEX WITH FKBP12 提交 1999-01-13	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 162–503（342 aa）片段：CYTOPLASMIC PORTION	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；pH 8.5	分辨率 2.60 Å R-free 0.269
1B6C CRYSTAL STRUCTURE OF THE CYTOPLASMIC DOMAIN OF THE TYPE I TGF-BETA RECEPTOR IN COMPLEX WITH FKBP12 提交 1999-01-13	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 162–503（342 aa）片段：CYTOPLASMIC PORTION	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；pH 8.5	分辨率 2.60 Å R-free 0.269
1B6C CRYSTAL STRUCTURE OF THE CYTOPLASMIC DOMAIN OF THE TYPE I TGF-BETA RECEPTOR IN COMPLEX WITH FKBP12 提交 1999-01-13	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 162–503（342 aa）片段：CYTOPLASMIC PORTION	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；pH 8.5	分辨率 2.60 Å R-free 0.269
1B6C CRYSTAL STRUCTURE OF THE CYTOPLASMIC DOMAIN OF THE TYPE I TGF-BETA RECEPTOR IN COMPLEX WITH FKBP12 提交 1999-01-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 B 162–503（342 aa）片段：CYTOPLASMIC PORTION 链 D 162–503（342 aa）片段：CYTOPLASMIC PORTION 链 F 162–503（342 aa）片段：CYTOPLASMIC PORTION 链 H 162–503（342 aa）片段：CYTOPLASMIC PORTION	未记录	SO4 SULFATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；pH 8.5	分辨率 2.60 Å R-free 0.269
1IAS CYTOPLASMIC DOMAIN OF UNPHOSPHORYLATED TYPE I TGF-BETA RECEPTOR CRYSTALLIZED WITHOUT FKBP12 提交 2001-03-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 162–503（342 aa）片段：CYTOPLASMIC DOMAIN (RESIDUES 162-503) 链 B 162–503（342 aa）片段：CYTOPLASMIC DOMAIN (RESIDUES 162-503) 链 C 162–503（342 aa）片段：CYTOPLASMIC DOMAIN (RESIDUES 162-503) 链 D 162–503（342 aa）片段：CYTOPLASMIC DOMAIN (RESIDUES 162-503) 链 E 162–503（342 aa）片段：CYTOPLASMIC DOMAIN (RESIDUES 162-503)	未记录	SO4 SULFATE ION × 15	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.8；277 K；100 mM MES pH 5.8, 2.4 M ammonium sulfate, 10 % glycerol v/v, 150 mM NaCl, 1 mM NPC-30345, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.90 Å R-free 0.284
1PY5 Crystal Structure of TGF-beta receptor I kinase with inhibitor 提交 2003-07-08	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 175–500（326 aa）片段：Truncated kinase domain, residues 175-500	未记录	SO4 SULFATE ION × 1 PY1 4-(3-PYRIDIN-2-YL-1H-PYRAZOL-4-YL)QUINOLINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.6；298 K；Tris, ATP, MgCl2, DTT, Hexanediol, PEG4000, LiSO4, pH 7.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K	分辨率 2.30 Å R-free 0.292
1RW8 Crystal Structure of TGF-beta receptor I kinase with ATP site inhibitor 提交 2003-12-16	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 200–500（301 aa）片段：Truncated kinase domain (residues 200-500)	未记录	580 3-(4-FLUOROPHENYL)-2-(6-METHYLPYRIDIN-2-YL)-5,6-DIHYDRO-4H-PYRROLO[1,2-B]PYRAZOLE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；Tris, ATP, MgCl2, DTT, Hexanediol, PEG 4000, LiSo4, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.40 Å R-free 0.291
1VJY Crystal Structure of a Naphthyridine Inhibitor of Human TGF-beta Type I Receptor 提交 2004-04-07	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–303（303 aa）片段：protein kinase	未记录	460 2-[5-(6-METHYLPYRIDIN-2-YL)-2,3-DIHYDRO-1H-PYRAZOL-4-YL]-1,5-NAPHTHYRIDINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；278 K；20% PEG 4000, 0.1M Tris HCl, 0.2 M magnesium chloride, pH 8.0, vapor diffusion/sitting drop, temperature 278K, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP	分辨率 2.00 Å R-free 0.275
2L5S Solution structure of the extracellular domain of the TGF-beta type I receptor 提交 2010-11-04	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 31–115（85 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.2；300 K；离子强度（mmCIF原始值）0.025；压力 ambient NMR样品组成 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] TbRI-1, 95% H2O/5% D2O \| 95% H2O/5% D2O	分辨率未提供
2PJY Structural basis for cooperative assembly of the TGF-beta signaling complex 提交 2007-04-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 C 33–111（79 aa）片段：extracellular domain	突变：M70S	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；10-20% PEG 3350, 0.4-0.65 M calcium acetate, 0.1-0.25M NaCl, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 3.00 Å R-free 0.297
2WOT ALK5 IN COMPLEX WITH 4-((5,6-dimethyl-2-(2-pyridyl)-3-pyridyl)oxy)-N-(3,4,5-trimethoxyphenyl)pyridin-2-amine 提交 2009-07-28	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 200–503（304 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 200-503	未记录	ZZG 4-[(5,6-DIMETHYL-2,2'-BIPYRIDIN-3-YL)OXY]-N-(3,4,5-TRIMETHOXYPHENYL)PYRIDIN-2-AMINE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；SITTING DROP METHOD. DROPS PROTEIN-PRECIPITANT 1-1, PROTEIN: 10MG/ML ALK5, PRECIPITANT: 20-30% PEG8K, 100 MM PCTP BUFFER PH 8.5-9.2, 0.2 M NAAC	分辨率 1.85 Å R-free 0.221
2WOU ALK5 IN COMPLEX WITH 4-((4-((2,6-dimethyl-3-pyridyl)oxy)-2-pyridyl) amino)benzenesulfonamide 提交 2009-07-28	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 200–503（304 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 200-503	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 ZZF 4-({4-[(2,6-DIMETHYLPYRIDIN-3-YL)OXY]PYRIDIN-2-YL}AMINO)BENZENESULFONAMIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；SITTING DROP METHOD. DROPS PROTEIN-PRECIPITANT 1-1, PROTEIN: 10MG/ML ALK5, PRECIPITANT: 20-30% PEG8K, 100 MM PCTP BUFFER PH 8.5-9.2, 0.2 M NAAC	分辨率 2.30 Å R-free 0.302
2X7O Crystal structure of TGFbRI complexed with an indolinone inhibitor 提交 2010-03-03	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 162–503（342 aa）片段：CYTOPLASMIC DOMAIN, RESIDUES 162-503	未记录	ZOP (3Z)-N-ETHYL-N-METHYL-2-OXO-3-(PHENYL{[4-(PIPERIDIN-1-YLMETHYL)PHENYL]AMINO}METHYLIDENE)-2,3-DIHYDRO-1H-INDOLE-6-CARBOXAMIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.2；1.5 M AMMONIUM SULFATE, 0.1 M GLYCINE PH 7.25	分辨率 3.70 Å R-free 0.273
2X7O Crystal structure of TGFbRI complexed with an indolinone inhibitor 提交 2010-03-03	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 162–503（342 aa）片段：CYTOPLASMIC DOMAIN, RESIDUES 162-503	未记录	ZOP (3Z)-N-ETHYL-N-METHYL-2-OXO-3-(PHENYL{[4-(PIPERIDIN-1-YLMETHYL)PHENYL]AMINO}METHYLIDENE)-2,3-DIHYDRO-1H-INDOLE-6-CARBOXAMIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.2；1.5 M AMMONIUM SULFATE, 0.1 M GLYCINE PH 7.25	分辨率 3.70 Å R-free 0.273
2X7O Crystal structure of TGFbRI complexed with an indolinone inhibitor 提交 2010-03-03	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 162–503（342 aa）片段：CYTOPLASMIC DOMAIN, RESIDUES 162-503	未记录	ZOP (3Z)-N-ETHYL-N-METHYL-2-OXO-3-(PHENYL{[4-(PIPERIDIN-1-YLMETHYL)PHENYL]AMINO}METHYLIDENE)-2,3-DIHYDRO-1H-INDOLE-6-CARBOXAMIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.2；1.5 M AMMONIUM SULFATE, 0.1 M GLYCINE PH 7.25	分辨率 3.70 Å R-free 0.273
2X7O Crystal structure of TGFbRI complexed with an indolinone inhibitor 提交 2010-03-03	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 162–503（342 aa）片段：CYTOPLASMIC DOMAIN, RESIDUES 162-503	未记录	ZOP (3Z)-N-ETHYL-N-METHYL-2-OXO-3-(PHENYL{[4-(PIPERIDIN-1-YLMETHYL)PHENYL]AMINO}METHYLIDENE)-2,3-DIHYDRO-1H-INDOLE-6-CARBOXAMIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.2；1.5 M AMMONIUM SULFATE, 0.1 M GLYCINE PH 7.25	分辨率 3.70 Å R-free 0.273
2X7O Crystal structure of TGFbRI complexed with an indolinone inhibitor 提交 2010-03-03	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 E 162–503（342 aa）片段：CYTOPLASMIC DOMAIN, RESIDUES 162-503	未记录	ZOP (3Z)-N-ETHYL-N-METHYL-2-OXO-3-(PHENYL{[4-(PIPERIDIN-1-YLMETHYL)PHENYL]AMINO}METHYLIDENE)-2,3-DIHYDRO-1H-INDOLE-6-CARBOXAMIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.2；1.5 M AMMONIUM SULFATE, 0.1 M GLYCINE PH 7.25	分辨率 3.70 Å R-free 0.273
3FAA Crystal structure of TGFbRI complexed with a 2-aminoimidazole inhibitor 提交 2008-11-16	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 162–503（342 aa）片段：GS and Kinase domains: UNP residues 162-503	未记录	55F N-[4-(5-fluoro-6-methylpyridin-2-yl)-5-quinoxalin-6-yl-1H-imidazol-2-yl]acetamide × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；Na/K phosphate, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.35 Å R-free 0.271
3FAA Crystal structure of TGFbRI complexed with a 2-aminoimidazole inhibitor 提交 2008-11-16	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 162–503（342 aa）片段：GS and Kinase domains: UNP residues 162-503	未记录	55F N-[4-(5-fluoro-6-methylpyridin-2-yl)-5-quinoxalin-6-yl-1H-imidazol-2-yl]acetamide × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；Na/K phosphate, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.35 Å R-free 0.271
3FAA Crystal structure of TGFbRI complexed with a 2-aminoimidazole inhibitor 提交 2008-11-16	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 162–503（342 aa）片段：GS and Kinase domains: UNP residues 162-503	未记录	55F N-[4-(5-fluoro-6-methylpyridin-2-yl)-5-quinoxalin-6-yl-1H-imidazol-2-yl]acetamide × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；Na/K phosphate, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.35 Å R-free 0.271
3FAA Crystal structure of TGFbRI complexed with a 2-aminoimidazole inhibitor 提交 2008-11-16	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 162–503（342 aa）片段：GS and Kinase domains: UNP residues 162-503	未记录	55F N-[4-(5-fluoro-6-methylpyridin-2-yl)-5-quinoxalin-6-yl-1H-imidazol-2-yl]acetamide × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；Na/K phosphate, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.35 Å R-free 0.271
3FAA Crystal structure of TGFbRI complexed with a 2-aminoimidazole inhibitor 提交 2008-11-16	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 E 162–503（342 aa）片段：GS and Kinase domains: UNP residues 162-503	未记录	55F N-[4-(5-fluoro-6-methylpyridin-2-yl)-5-quinoxalin-6-yl-1H-imidazol-2-yl]acetamide × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；Na/K phosphate, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.35 Å R-free 0.271
3GXL ALK-5 kinase complex with GW857175 提交 2009-04-02	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 201–503（303 aa）片段：kinase domain, residues 201-503	未记录	QIG N-1H-indazol-5-yl-2-(6-methylpyridin-2-yl)quinazolin-4-amine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；vapor diffusion	分辨率 1.80 Å R-free 0.263
3HMM Structure of Alk5 + GW855857 提交 2009-05-29	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 201–503（303 aa）片段：KINASE DOMAIN, RESIDUES 201-503	未记录	855 2-(6-methylpyridin-2-yl)-N-pyridin-4-ylquinazolin-4-amine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；VAPOR DIFFUSION	分辨率 1.70 Å R-free 0.241
3KCF Crystal structure of TGFbRI complexed with a pyrazolone inhibitor 提交 2009-10-21	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 162–503（342 aa）片段：UNP residues 162-503, GS AND KINASE DOMAINS	未记录	JZO 4-[3-(methoxymethyl)phenyl]-1,2-dimethyl-5-quinoxalin-6-yl-1,2-dihydro-3H-pyrazol-3-one × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；Sodium potassium phosphate, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.80 Å R-free 0.278
3KCF Crystal structure of TGFbRI complexed with a pyrazolone inhibitor 提交 2009-10-21	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 162–503（342 aa）片段：UNP residues 162-503, GS AND KINASE DOMAINS	未记录	JZO 4-[3-(methoxymethyl)phenyl]-1,2-dimethyl-5-quinoxalin-6-yl-1,2-dihydro-3H-pyrazol-3-one × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；Sodium potassium phosphate, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.80 Å R-free 0.278
3KCF Crystal structure of TGFbRI complexed with a pyrazolone inhibitor 提交 2009-10-21	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 162–503（342 aa）片段：UNP residues 162-503, GS AND KINASE DOMAINS	未记录	JZO 4-[3-(methoxymethyl)phenyl]-1,2-dimethyl-5-quinoxalin-6-yl-1,2-dihydro-3H-pyrazol-3-one × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；Sodium potassium phosphate, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.80 Å R-free 0.278
3KCF Crystal structure of TGFbRI complexed with a pyrazolone inhibitor 提交 2009-10-21	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 162–503（342 aa）片段：UNP residues 162-503, GS AND KINASE DOMAINS	未记录	JZO 4-[3-(methoxymethyl)phenyl]-1,2-dimethyl-5-quinoxalin-6-yl-1,2-dihydro-3H-pyrazol-3-one × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；Sodium potassium phosphate, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.80 Å R-free 0.278
3KCF Crystal structure of TGFbRI complexed with a pyrazolone inhibitor 提交 2009-10-21	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 E 162–503（342 aa）片段：UNP residues 162-503, GS AND KINASE DOMAINS	未记录	JZO 4-[3-(methoxymethyl)phenyl]-1,2-dimethyl-5-quinoxalin-6-yl-1,2-dihydro-3H-pyrazol-3-one × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；Sodium potassium phosphate, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.80 Å R-free 0.278
3KFD Ternary complex of TGF-b1 reveals isoform-specific ligand recognition and receptor recruitment in the superfamily 提交 2009-10-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 I 31–115（85 aa）片段：extracellular domain 链 J 31–115（85 aa）片段：extracellular domain	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7；298 K；8-15% Peg 4000-8000, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K	分辨率 3.00 Å R-free 0.268
3KFD Ternary complex of TGF-b1 reveals isoform-specific ligand recognition and receptor recruitment in the superfamily 提交 2009-10-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 K 31–115（85 aa）片段：extracellular domain 链 L 31–115（85 aa）片段：extracellular domain	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7；298 K；8-15% Peg 4000-8000, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K	分辨率 3.00 Å R-free 0.268
3KFD Ternary complex of TGF-b1 reveals isoform-specific ligand recognition and receptor recruitment in the superfamily 提交 2009-10-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 I 31–115（85 aa）片段：extracellular domain 链 J 31–115（85 aa）片段：extracellular domain 链 K 31–115（85 aa）片段：extracellular domain 链 L 31–115（85 aa）片段：extracellular domain	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7；298 K；8-15% Peg 4000-8000, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K	分辨率 3.00 Å R-free 0.268
3TZM TGF-beta Receptor type 1 in complex with SB431542 提交 2011-09-27	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 200–503（304 aa）片段：kinase domain, UNP residues 200-503	未记录	085 4-[5-(1,3-benzodioxol-5-yl)-4-(pyridin-2-yl)-1H-imidazol-2-yl]benzamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；100 mM Imidazole 10% PEG 8000, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.70 Å R-free 0.205
4X0M Selection of fragments for kinase inhibitor design: decoration is key 提交 2014-11-21	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 200–503（304 aa）片段：UNP residues 200-503	未记录	3WA 4-aminopyrido[2,3-d]pyrimidin-5(8H)-one × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M Tris-HCl, 240 mM Li2SO4, 24% PEG 4000, pH 7.5	分辨率 1.68 Å R-free 0.239
4X2F Selection of fragments for kinase inhibitor design: decoration is key 提交 2014-11-26	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 200–503（304 aa）片段：UNP residues 200-503	未记录	3WJ 4-amino-8-(4-aminophenyl)pyrido[2,3-d]pyrimidin-5(8H)-one × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M Tris-HCl, 240 mM Li2SO4, 24% PEG 4000, pH 7.5	分辨率 1.49 Å R-free 0.191
4X2J Selection of fragments for kinase inhibitor design: decoration is key 提交 2014-11-26	构建体不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 200–503（304 aa）	未记录	3WN 4-[(3-aminophenyl)amino]pyrido[2,3-d]pyrimidin-5(8H)-one × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M Tris-HCl, 240 mM Li2SO4, 24% PEG 4000, pH 7.5	分辨率 1.69 Å R-free 0.184
4X2K Selection of fragments for kinase inhibitor design: decoration is key 提交 2014-11-26	构建体不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：MONOMERIC	链 A 200–503（304 aa）	未记录	3WO 4-[(3-aminophenyl)amino]pyrido[2,3-d]pyrimidin-5(6H)-one × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M Tris-HCl, 240 mM Li2SO4, 24% PEG 4000, pH 7.5	分辨率 1.69 Å R-free 0.184
4X2N Selection of fragments for kinase inhibitor design: decoration is key 提交 2014-11-26	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 200–503（304 aa）片段：UNP residues 200-503	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M Tris-HCl, 240 mM Li2SO4, 24% PEG 4000, pH 7.5	分辨率 1.80 Å R-free 0.201
5E8S TGF-BETA RECEPTOR TYPE 1 KINASE DOMAIN (WT) 提交 2015-10-14	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 200–503（304 aa）片段：KINASE DOMAIN, UNP RESIDUES 200-503	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；23%(w/v) PEG3350, 3%(v/v) glcyerol	分辨率 1.45 Å R-free 0.188
5E8T TGF-BETA RECEPTOR TYPE 1 KINASE DOMAIN (T204D) 提交 2015-10-14	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 200–503（304 aa）片段：KINASE DOMAIN, UNP RESIDUES 200-503	突变：T204D	GOL GLYCEROL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；23%(w/v) PEG3350, 3%(v/v) glcyerol	分辨率 1.70 Å R-free 0.190
5E8U TGF-BETA RECEPTOR TYPE 1 KINASE DOMAIN (T204D,I211V,Y249F,S280T, Y282F,S287N,A350C,L352F) 提交 2015-10-14	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 200–503（304 aa）片段：KINASE DOMAIN, UNP RESIDUES 200-503	突变：T204D,I211V,Y249F,S280T,Y282F,S287N,A350C,L352F	GOL GLYCEROL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；23%(w/v) PEG3350, 3%(v/v) glcyerol	分辨率 2.03 Å R-free 0.223
5E8W TGF-BETA RECEPTOR TYPE 1 KINASE DOMAIN (T204D) IN COMPLEX WITH STAUROSPORINE 提交 2015-10-14	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 200–503（304 aa）片段：KINASE DOMAIN, UNP RESIDUES 200-503	突变：T204D	STU STAUROSPORINE × 1 GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；23%(w/v) PEG3350, 3%(v/v) glcyerol	分辨率 1.86 Å R-free 0.186
5E8X TGF-BETA RECEPTOR TYPE 1 KINASE DOMAIN (T204D,I211V,Y249F,S280T, Y282F,S287N,A350C,L352F) IN COMPLEX WITH STAUROSPORINE 提交 2015-10-14	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 200–503（304 aa）片段：KINASE DOMAIN, UNP RESIDUES 200-503	突变：T204D,I211V,Y249F,S280T, Y282F,S287N,A350C,L352F	STU STAUROSPORINE × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；23%(w/v) PEG3350, 3%(v/v) glcyerol	分辨率 1.45 Å R-free 0.210
5E8Z TGF-BETA RECEPTOR TYPE 1 KINASE DOMAIN (T204D) IN COMPLEX WITH 3-AMINO-6-[4-(2-HYDROXYETHYL)PHENYL]-N-[4-(MORPHOLIN-4-YL)PYRIDIN-3-YL]PYRAZINE-2-CARBOXAMIDE 提交 2015-10-14	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 200–503（304 aa）片段：KINASE DOMAIN, UNP RESIDUES 200-503	突变：T204D	5L4 3-amino-6-[4-(2-hydroxyethyl)phenyl]-N-[4-(morpholin-4-yl)pyridin-3-yl]pyrazine-2-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；23%(w/v) PEG3350, 3%(v/v) glcyerol	分辨率 1.51 Å R-free 0.207
5E90 TGF-BETA RECEPTOR TYPE 1 KINASE DOMAIN (T204D,I211V,Y249F, S280T,Y282F,S287N,A350C,L352F) IN COMPLEX WITH 3-AMINO-6- [4-(2-HYDROXYETHYL)PHENYL]-N-[4-(MORPHOLIN-4-YL)PYRIDIN-3-YL]PYRAZINE-2-CARBOXAMIDE 提交 2015-10-14	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 200–503（304 aa）片段：KINASE DOMAIN, UNP RESIDUES 200-503	突变：T204D,I211V,Y249F,S280T,Y282F,S287N,A350C,L352F	5L4 3-amino-6-[4-(2-hydroxyethyl)phenyl]-N-[4-(morpholin-4-yl)pyridin-3-yl]pyrazine-2-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；23%(w/v) PEG3350, 3%(v/v) glcyerol	分辨率 2.05 Å R-free 0.218
5FRI ALK5 in complex witha an N-(4-anilino-2-pyridyl)acetamide inhibitor. 提交 2015-12-17	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 200–498（299 aa）片段：UNP RESIDUES 200-498	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 ZUQ N-[4-[(6-chloro-[1,3]dioxolo[4,5-b]pyridin-7-yl)amino]-2-pyridyl]cyclopropanecarboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；SITTING DROP METHOD. DROPS PROTEIN-PRECIPITANT 1-1, PROTEIN: 10MG/ML ALK5, PRECIPITANT: 20-30% PEG8K, 100 MM PCTP BUFFER PH 8.5-9.2, 0.2 M NAAC	分辨率 2.00 Å R-free 0.193
5QIK TGF-BETA RECEPTOR TYPE 1 KINASE DOMAIN (T204D) IN COMPLEX WITH N-{4-[3-(6-fluoropyridin-3-yl)-4-oxo-4,5,6,7-tetrahydro-1H-pyrrolo[3,2-c]pyridin-2-yl]pyridin-2-yl}acetamide 提交 2018-08-05	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 200–503（304 aa）片段：KINASE DOMAIN, UNP RESIDUES 200-503	突变：T204D	J2M N-{4-[3-(6-fluoropyridin-3-yl)-4-oxo-4,5,6,7-tetrahydro-1H-pyrrolo[3,2-c]pyridin-2-yl]pyridin-2-yl}acetamide × 1 GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；23%(w/v) PEG3350, 3%(v/v) glcyerol	分辨率 1.58 Å R-free 0.190
5QIL TGF-BETA RECEPTOR TYPE 1 KINASE DOMAIN (T204D) IN COMPLEX WITH N-{4-[3-(6-METHOXYPYRIDIN-3-YL)-1H-PYRROLO[3,2-B]PYRIDIN-2-YL]PYRIDIN-2-YL}ACETAMIDE 提交 2018-08-05	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 200–503（304 aa）片段：KINASE DOMAIN, UNP RESIDUES 200-503	突变：T204D	J2V N-{4-[3-(6-methoxypyridin-3-yl)-1H-pyrrolo[3,2-b]pyridin-2-yl]pyridin-2-yl}acetamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；23%(w/v) PEG3350, 3%(v/v) glcyerol	分辨率 1.98 Å R-free 0.210
5QIM TGF-BETA RECEPTOR TYPE 1 KINASE DOMAIN (T204D) IN COMPLEX WITH N-{4-[3-(5-METHOXYPYRIDIN-2-YL)-1H-PYRROLO[3,2-B] PYRIDIN-2-YL]PYRIDIN-2-YL}ACETAMIDE 提交 2018-08-05	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 200–503（304 aa）片段：KINASE DOMAIN, UNP RESIDUES 200-503	未记录	J2Y N-{4-[3-(5-methoxypyridin-2-yl)-1H-pyrrolo[3,2-b]pyridin-2-yl]pyridin-2-yl}acetamide × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；23%(w/v) PEG3350, 3%(v/v) glcyerol	分辨率 1.75 Å R-free 0.188
5QTZ TGF-BETA RECEPTOR TYPE 1 KINASE DOMAIN (T204D) IN COMPLEX WITH 6-[1-(2,2-DIFLUOROETHYL)-4-(6-METHYLPYRIDIN-2-YL)-1H-IMIDAZOL-5-YL]IMIDAZO[1,2-A]PYRIDINE 提交 2019-11-19	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 200–503（304 aa）片段：KINASE DOMAIN, UNP RESIDUES 200-503	突变：T204D	QMY 6-[1-(2,2-difluoroethyl)-4-(6-methylpyridin-2-yl)-1H-imidazol-5-yl]imidazo[1,2-a]pyridine × 1 GOL GLYCEROL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；23%(w/v) PEG3350, 3%(v/v) glcyerol	分辨率 1.83 Å R-free 0.200
5QU0 TGF-BETA RECEPTOR TYPE 1 KINASE DOMAIN (T204D) IN COMPLEX WITH 6-[4-(3-CHLORO-4-FLUOROPHENYL)-1-(2-HYDROXYETHYL)-1H-IMIDAZOL-5-YL]IMIDAZO[1,2-B]PYRIDAZINE-3-CARBONITRILE 提交 2019-11-19	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 200–503（304 aa）片段：KINASE DOMAIN, UNP RESIDUES 200-503	突变：YES	QMV 6-[4-(3-chloro-4-fluorophenyl)-1-(2-hydroxyethyl)-1H-imidazol-5-yl]imidazo[1,2-b]pyridazine-3-carbonitrile × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；23%(w/v) PEG3350, 3%(v/v) glcyerol	分辨率 1.67 Å R-free 0.206
5USQ ALK-5 kinase inhibitor complex 提交 2017-02-13	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 123–421（299 aa）片段：UNP residues 123-421	未记录	8LY N-[2-(5-chloro-2-fluorophenyl)pyridin-4-yl]-2-[(piperidin-4-yl)methyl]-2H-pyrazolo[4,3-b]pyridin-7-amine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.2；293 K；16 % PEG 8000 100mM CHES pH 9.2	分辨率 2.55 Å R-free 0.231
6B8Y TGF-BETA RECEPTOR TYPE 1 KINASE DOMAIN (T204D) IN COMPLEX WITH N-(3-fluoropyridin-4-yl)-2-[6-(trifluoromethyl)pyridin-2-yl]-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-amine 提交 2017-10-09	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 200–503（304 aa）片段：kinase domain	突变：T204D	D0A N-(3-fluoropyridin-4-yl)-2-[6-(trifluoromethyl)pyridin-2-yl]-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-amine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；23%(w/v) PEG3350, 3%(v/v) glcyerol	分辨率 1.65 Å R-free 0.208
6MAC Ternary structure of GDF11 bound to ActRIIB-ECD and Alk5-ECD 提交 2018-08-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 K 33–112（80 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；.05-.15M sodium acetate 12-24% polyethylene glycol 8000 .05-.15M sodium thiocyanate	分辨率 2.34 Å R-free 0.267
8YHF The Crystal Structure of the Type I TGF beta receptor from Biortus. 提交 2024-02-28	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 162–503（342 aa）	未记录	A1D6I Vactosertib × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.02M K/Na PO4, 0.1M Bis-Tris propane pH6.5, 20% PEG3350	分辨率 1.40 Å R-free 0.192
8YHL The Crystal Structure of Tgf-Beta Type I Receptor (Alk5) from Biortus 提交 2024-02-28	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 200–503（304 aa）	未记录	A1D6I Vactosertib × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 ACY ACETIC ACID × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1M MgAC2, 0.1M MES pH6.5, 10% PEG10,000	分辨率 1.47 Å R-free 0.193
9B9F Zebrafish Betaglycan Orphan Domain (zfBGo) in complex with TGF-B3 and extracellular domains of TGFBRI and TGFBRII 提交 2024-04-02	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 C 31–115（85 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；0.2 M lithium sulfate, 0.1 M tris pH 8.5, 30 %(w/v) polyethylene glycol 4000	分辨率 3.00 Å R-free 0.278
9B9F Zebrafish Betaglycan Orphan Domain (zfBGo) in complex with TGF-B3 and extracellular domains of TGFBRI and TGFBRII 提交 2024-04-02	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 H 31–115（85 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；0.2 M lithium sulfate, 0.1 M tris pH 8.5, 30 %(w/v) polyethylene glycol 4000	分辨率 3.00 Å R-free 0.278
9F6X Human transforming growth factor b type I receptor in complex with kinase inhibitor SB505124 提交 2024-05-02	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 200–500（301 aa）	未记录	A1IAZ 2-[5-(1,3-benzodioxol-5-yl)-2-~{tert}-butyl-1~{H}-imidazol-4-yl]-6-methyl-pyridine × 1 GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.6；291 K；23%(w/v) PEG 3350, 3%(v/v) glycerol at pH 5.6	分辨率 2.68 Å R-free 0.248
9FK5 Zebrafish Betaglycan Orphan Domain (zfBGo) in complex with TGF-B3 and extracellular domains of TGFBRI and TGFBRII 提交 2024-06-02	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 C 30–115（86 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
9J9D Crystal structure of ALK5 kinase domain in complex with inhibitor HM-279 提交 2024-08-22	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 200–503（304 aa）	未记录	A1L30 2-((1-(but-2-yn-1-yl)-1H-pyrazol-4-yl)(cyclopropylmethyl)amino)-5-(4-(dimethylcarbamoyl)-1H-pyrrol-2-yl)thiazole-4-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；20-25% PEG8000, 0.2 M Na acetate, 0.1 M Tris-HCl pH8.5	分辨率 1.34 Å R-free 0.209
9SUV Structure of an inhibitor of Human TGF-beta Type I Receptor 提交 2025-09-30	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 200–503（304 aa）	未记录	A1JQO ~{N}-[4-[[6-(5-chloranyl-2-fluoranyl-phenyl)-3-(2-hydroxyethylsulfanyl)pyridazin-4-yl]amino]pyridin-2-yl]-3-(4-methylpiperazin-1-yl)propanamide × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；0.2 M potassium thiocyanate 20 % w/v PEG 3350	分辨率 1.50 Å R-free 0.211

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UniProt名称	TGFR1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 2–305； UniProt 200–503

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	4x2g
沉积日期 deposition_date	2014-11-26
结构标题 title	Selection of fragments for kinase inhibitor design: decoration is key
关键词 keywords	TRANSFERASE, PROTEIN KINASE, INHIBITOR COMPLEX, TRANSFERASE-TRANSFERASE INHIBITOR complex; TRANSFERASE/TRANSFERASE INHIBITOR
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	20.69 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	19.51 Å
零角强度 I(0) i0	21903800.00
分子量 molecular_weight	35029.0 kDa
排除体积 excluded_volume	43676 Å³
包络体积 envelope_volume	51089 Å³
水化壳体积 shell_volume	21642 Å³
包络直径 envelope_diameter	67.8 Å
壳层 Rg shell_rg	26.29 Å
包络 Rg envelope_rg	19.80 Å
形状 Rg shape_rg	19.51 Å
总 Rg total_rg	20.43 Å
总原子数 total_atoms	2461
残基数 n_residues	303
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	66.1 Å
Rg (实空间) rg_real	20.58 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.39 Å
I(0) (实空间) i0_real	2.1900e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	2.5650e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal	20.60 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	21900000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8167
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	26.8 Å
偏度 Skewness skewness	0.199
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.383
角度范围 angular_range	— – 0.3850 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	6890000.0000
实空间数据点数 n_real_points	70
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.872; Stabil: 0.999; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.997; Smooth: 0.000

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	TGF-beta receptor type-1
分子量 formula_weight	34882.1 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.11.30
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	2805

GTIARTIVLQESIGKGRFGEVWRGKWRGEEVAVKIFSSREERSWFREAEIYQTVMLRHENILGFIAADNKDNGTWTQLWLVSDYHEHGSLFDYLNRYTVTVEGMIKLALSTASGLAHLHMEIVGTQGKPAIAHRDLKSKNILVKKNGTCCIADLGLAVRHDSATDTIDIAPNHRVGTKRYMAPEVLDDSINMKHFESFKRADIYAMGLVFWEIARRCSIGGIHEDYQLPYYDLVPSDPSVEEMRKVVCEQKLRPNIPNRWQSCEALRVMAKIMRECWYANGAARLTALRIKKTLSQLSQQEGIKM

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	4-[(4-aminophenyl)amino]pyrido[2,3-d]pyrimidin-5(6H)-one
分子量 formula_weight	253.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	SULFATE ION
分子量 formula_weight	96.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL
分子量 formula_weight	122.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 5 Entity 5 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	315

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_id	d4x2ga1
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.144 — Protein kinase-like (PK-like)
超家族 Superfamily superfamily	d.144.1 — Protein kinase-like (PK-like)
家族 Family family	d.144.1.7 — Protein kinases, catalytic subunit

结构域编号 domain_id	d4x2ga2
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id	4x2gA01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	200 — Phosphorylase Kinase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Phosphorylase Kinase; domain 1

结构域编号 domain_id	4x2gA02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	510 — Transferase(Phosphotransferase); domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Transferase(Phosphotransferase) domain 1

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	42.220 Å
晶胞边长 b length_b	77.680 Å
晶胞边长 c length_c	90.160 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	P 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	19
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.510 Å
最低分辨率 resolution_low	22.110 Å
R 因子 r_factor	0.1658
R_work r_work	0.1648
R_free r_free	0.1853

fit	/app/data/saxs_computation/x2/4x2g/4x2g.fit
pddf	/app/data/pr_computation/x2/4x2g/4x2g.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/x2/4x2g/4x2g.dat