4y5z

T=1 capsid structure of SeMV Ndel65CP fused with B-domain of S. aureus protein SpA at the N-terminus (P1 crystal form)

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 188.3 Å Quality: GOOD

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Immunoglobulin G-binding protein A,Coat protein

Sesbania mosaic virus

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	信息不足同源多聚体蛋白 × 60 PDB 声明：60-meric（60）与蛋白拷贝数一致	链 0； UniProt 158–211 链 1； UniProt 158–211 链 2； UniProt 158–211 链 3； UniProt 158–211 链 4； UniProt 158–211 链 5； UniProt 158–211 链 6； UniProt 158–211 链 7； UniProt 158–211 链 A； UniProt 158–211 链 B； UniProt 158–211 链 C； UniProt 158–211 链 D； UniProt 158–211 链 E； UniProt 158–211 链 F； UniProt 158–211 链 G； UniProt 158–211 链 H； UniProt 158–211 链 I； UniProt 158–211 链 J； UniProt 158–211 链 K； UniProt 158–211 链 L； UniProt 158–211 链 M； UniProt 158–211 链 N； UniProt 158–211 链 O； UniProt 158–211 链 P； UniProt 158–211 链 Q； UniProt 158–211 链 R； UniProt 158–211 链 S； UniProt 158–211 链 T； UniProt 158–211 链 U； UniProt 158–211 链 V； UniProt 158–211 链 W； UniProt 158–211 链 X； UniProt 158–211 链 Y； UniProt 158–211 链 Z； UniProt 158–211 链 a； UniProt 158–211 链 b； UniProt 158–211 链 c； UniProt 158–211 链 d； UniProt 158–211 链 e； UniProt 158–211 链 f； UniProt 158–211 链 g； UniProt 158–211 链 h； UniProt 158–211 链 i； UniProt 158–211 链 j； UniProt 158–211 链 k； UniProt 158–211 链 l； UniProt 158–211 链 m； UniProt 158–211 链 n； UniProt 158–211 链 o； UniProt 158–211 链 p； UniProt 158–211 链 q； UniProt 158–211 链 r； UniProt 158–211 链 s； UniProt 158–211 链 t； UniProt 158–211 链 u； UniProt 158–211 链 v； UniProt 158–211 链 w； UniProt 158–211 链 x； UniProt 158–211 链 y； UniProt 158–211 链 z； UniProt 158–211	片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268	SO4 SULFATE ION × 12	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；295 K；15-25% PEG 400, 0.2M magnesium chloride, 0.1M HEPES	分辨率 2.95 Å R-free 0.249

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 4Y5Z	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1DEE Structure of S. aureus protein A bound to a human IgM Fab 提交 1999-11-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 G 100–153（54 aa）片段：RECOMBINANT DOMAIN D	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；MPEG 5000, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.70 Å R-free 0.281
1DEE Structure of S. aureus protein A bound to a human IgM Fab 提交 1999-11-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 100–153（54 aa）片段：RECOMBINANT DOMAIN D	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；MPEG 5000, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.70 Å R-free 0.281
1FC2 Crystallographic Refinement and Atomic Models of a Human FC Fragment and its Complex with Fragment B of Protein A from Staphylococcus Aureus at 2.9-and 2.8-Angstroms Resolution 提交 1981-05-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 212–269（58 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.80 Å
1H0T An affibody in complex with a target protein: structure and coupled folding 提交 2002-06-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 213–269（57 aa）片段：RESIDUES 213-269	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5.6；303 K；压力 1	分辨率未提供
4Y4Y T=1 capsid structure of SeMV Ndel65CP fused with B-domain of S. aureus protein SpA at the N-terminus (C2 crystal form) 提交 2015-02-11	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 60 PDB 声明：60-meric	链 A 158–211（54 aa）片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268 链 B 158–211（54 aa）片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268 链 C 158–211（54 aa）片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268 链 D 158–211（54 aa）片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268 链 E 158–211（54 aa）片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268 链 F 158–211（54 aa）片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268 链 G 158–211（54 aa）片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268 链 H 158–211（54 aa）片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268 链 I 158–211（54 aa）片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268 链 J 158–211（54 aa）片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268 链 K 158–211（54 aa）片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268 链 L 158–211（54 aa）片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268 链 M 158–211（54 aa）片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268 链 N 158–211（54 aa）片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268 链 O 158–211（54 aa）片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268 链 P 158–211（54 aa）片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268 链 Q 158–211（54 aa）片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268 链 R 158–211（54 aa）片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268 链 S 158–211（54 aa）片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268 链 T 158–211（54 aa）片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268 链 U 158–211（54 aa）片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268 链 V 158–211（54 aa）片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268 链 W 158–211（54 aa）片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268 链 X 158–211（54 aa）片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268 链 Y 158–211（54 aa）片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268 链 Z 158–211（54 aa）片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268 链 a 158–211（54 aa）片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268 链 b 158–211（54 aa）片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268 链 c 158–211（54 aa）片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268 链 d 158–211（54 aa）片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268	未记录	SO4 SULFATE ION × 12	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；15-20% PEG 4000, 5% Iso-propanol, 100 mM Sodium citrate	分辨率 3.00 Å R-free 0.200
9BDE Middle Region of Apolipoprotein B 100 bound to Low Density Lipoprotein Receptor 提交 2024-04-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 B 278–327（50 aa）片段：;residues 27-384 (Uniprot numbering),residues 278-327 (Uniprot numbering),103-151 (Uniprot numbering),residues 440-497 (Uniprot numbering) ; 链 B 103–151（49 aa）片段：;residues 27-384 (Uniprot numbering),residues 278-327 (Uniprot numbering),103-151 (Uniprot numbering),residues 440-497 (Uniprot numbering) ;	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 CA CALCIUM ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.18 Å
9HXS CS-ROSETTA Structure of the Z Domain of the IgG-Binding Staphylococcal Protein A 提交 2025-01-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 212–269（58 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6；298 K；离子强度（mmCIF原始值）150；压力 1 NMR样品组成 2 mg/mL [U-100% 13C; U-100% 15N] Protein Z, 25 mM MES, 1 mM CaCl2, 93% H2O/7% D2O \| 93% H2O/7% D2O	分辨率未提供
9M5D Crystal structure of S. aureus protein A bound to a human single-domain antibody 提交 2025-03-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 93–153（61 aa）链 H 93–153（61 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；25% w/v Polyethylene glycol 3350, 0.2M Magnesium chloride and 0.1M BIS-Tris 5.5	分辨率 3.57 Å R-free 0.271
9M6J Crystal structure of S. aureus protein A bound to a camelid single-domain antibody 提交 2025-03-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 93–153（61 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；2.0 M Ammonium sulfate	分辨率 2.00 Å R-free 0.226
9M6O Crystal structure of S. aureus protein A bound to a camelid single-domain antibody 提交 2025-03-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 93–153（61 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；25% w/v Polyethylene glycol 3350 and 0.1M Citric acid 3.5	分辨率 1.49 Å R-free 0.257
9M6O Crystal structure of S. aureus protein A bound to a camelid single-domain antibody 提交 2025-03-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 93–153（61 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；25% w/v Polyethylene glycol 3350 and 0.1M Citric acid 3.5	分辨率 1.49 Å R-free 0.257
9QBJ Legobody dimer 提交 2025-03-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 I 295–321（27 aa）链 J 295–321（27 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å

共 10 个其他 PDB 条目、12 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	SPA_STAA8
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 0； PDB构建体 19–72； UniProt 158–211 作者链 1； PDB构建体 19–72； UniProt 158–211 作者链 2； PDB构建体 19–72； UniProt 158–211 作者链 3； PDB构建体 19–72； UniProt 158–211 作者链 4； PDB构建体 19–72； UniProt 158–211 作者链 5； PDB构建体 19–72； UniProt 158–211 作者链 6； PDB构建体 19–72； UniProt 158–211 作者链 7； PDB构建体 19–72； UniProt 158–211 作者链 A； PDB构建体 19–72； UniProt 158–211 作者链 B； PDB构建体 19–72； UniProt 158–211 作者链 C； PDB构建体 19–72； UniProt 158–211 作者链 D； PDB构建体 19–72； UniProt 158–211 作者链 E； PDB构建体 19–72； UniProt 158–211 作者链 F； PDB构建体 19–72； UniProt 158–211 作者链 G； PDB构建体 19–72； UniProt 158–211 作者链 H； PDB构建体 19–72； UniProt 158–211 作者链 I； PDB构建体 19–72； UniProt 158–211 作者链 J； PDB构建体 19–72； UniProt 158–211 作者链 K； PDB构建体 19–72； UniProt 158–211 作者链 L； PDB构建体 19–72； UniProt 158–211 作者链 M； PDB构建体 19–72； UniProt 158–211 作者链 N； PDB构建体 19–72； UniProt 158–211 作者链 O； PDB构建体 19–72； UniProt 158–211 作者链 P； PDB构建体 19–72； UniProt 158–211 作者链 Q； PDB构建体 19–72； UniProt 158–211 作者链 R； PDB构建体 19–72； UniProt 158–211 作者链 S； PDB构建体 19–72； UniProt 158–211 作者链 T； PDB构建体 19–72； UniProt 158–211 作者链 U； PDB构建体 19–72； UniProt 158–211 作者链 V； PDB构建体 19–72； UniProt 158–211 作者链 W； PDB构建体 19–72； UniProt 158–211 作者链 X； PDB构建体 19–72； UniProt 158–211 作者链 Y； PDB构建体 19–72； UniProt 158–211 作者链 Z； PDB构建体 19–72； UniProt 158–211 作者链 a； PDB构建体 19–72； UniProt 158–211 作者链 b； PDB构建体 19–72； UniProt 158–211 作者链 c； PDB构建体 19–72； UniProt 158–211 作者链 d； PDB构建体 19–72； UniProt 158–211 作者链 e； PDB构建体 19–72； UniProt 158–211 作者链 f； PDB构建体 19–72； UniProt 158–211 作者链 g； PDB构建体 19–72； UniProt 158–211 作者链 h； PDB构建体 19–72； UniProt 158–211 作者链 i； PDB构建体 19–72； UniProt 158–211 作者链 j； PDB构建体 19–72； UniProt 158–211 作者链 k； PDB构建体 19–72； UniProt 158–211 作者链 l； PDB构建体 19–72； UniProt 158–211 作者链 m； PDB构建体 19–72； UniProt 158–211 作者链 n； PDB构建体 19–72； UniProt 158–211 作者链 o； PDB构建体 19–72； UniProt 158–211 作者链 p； PDB构建体 19–72； UniProt 158–211 作者链 q； PDB构建体 19–72； UniProt 158–211 作者链 r； PDB构建体 19–72； UniProt 158–211 作者链 s； PDB构建体 19–72； UniProt 158–211 作者链 t； PDB构建体 19–72； UniProt 158–211 作者链 u； PDB构建体 19–72； UniProt 158–211 作者链 v； PDB构建体 19–72； UniProt 158–211 作者链 w； PDB构建体 19–72； UniProt 158–211 作者链 x； PDB构建体 19–72； UniProt 158–211 作者链 y； PDB构建体 19–72； UniProt 158–211 作者链 z； PDB构建体 19–72； UniProt 158–211

Immunoglobulin G-binding protein A,Coat protein

Sesbania mosaic virus

UniProt Q9EB06

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	信息不足同源多聚体蛋白 × 60 PDB 声明：60-meric（60）与蛋白拷贝数一致	链 0； UniProt 66–268 链 1； UniProt 66–268 链 2； UniProt 66–268 链 3； UniProt 66–268 链 4； UniProt 66–268 链 5； UniProt 66–268 链 6； UniProt 66–268 链 7； UniProt 66–268 链 A； UniProt 66–268 链 B； UniProt 66–268 链 C； UniProt 66–268 链 D； UniProt 66–268 链 E； UniProt 66–268 链 F； UniProt 66–268 链 G； UniProt 66–268 链 H； UniProt 66–268 链 I； UniProt 66–268 链 J； UniProt 66–268 链 K； UniProt 66–268 链 L； UniProt 66–268 链 M； UniProt 66–268 链 N； UniProt 66–268 链 O； UniProt 66–268 链 P； UniProt 66–268 链 Q； UniProt 66–268 链 R； UniProt 66–268 链 S； UniProt 66–268 链 T； UniProt 66–268 链 U； UniProt 66–268 链 V； UniProt 66–268 链 W； UniProt 66–268 链 X； UniProt 66–268 链 Y； UniProt 66–268 链 Z； UniProt 66–268 链 a； UniProt 66–268 链 b； UniProt 66–268 链 c； UniProt 66–268 链 d； UniProt 66–268 链 e； UniProt 66–268 链 f； UniProt 66–268 链 g； UniProt 66–268 链 h； UniProt 66–268 链 i； UniProt 66–268 链 j； UniProt 66–268 链 k； UniProt 66–268 链 l； UniProt 66–268 链 m； UniProt 66–268 链 n； UniProt 66–268 链 o； UniProt 66–268 链 p； UniProt 66–268 链 q； UniProt 66–268 链 r； UniProt 66–268 链 s； UniProt 66–268 链 t； UniProt 66–268 链 u； UniProt 66–268 链 v； UniProt 66–268 链 w； UniProt 66–268 链 x； UniProt 66–268 链 y； UniProt 66–268 链 z； UniProt 66–268	片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268	SO4 SULFATE ION × 12	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；295 K；15-25% PEG 400, 0.2M magnesium chloride, 0.1M HEPES	分辨率 2.95 Å R-free 0.249

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 4Y5Z	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1SMV PRIMARY STRUCTURE OF SESBANIA MOSAIC VIRUS COAT PROTEIN: ITS IMPLICATIONS TO THE ASSEMBLY AND ARCHITECTURE OF THE VIRUS 提交 1995-06-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 180 PDB 声明：complete icosahedral assembly	链 A 5–267（263 aa）链 B 5–267（263 aa）链 C 5–267（263 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 240	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.00 Å
1SMV PRIMARY STRUCTURE OF SESBANIA MOSAIC VIRUS COAT PROTEIN: ITS IMPLICATIONS TO THE ASSEMBLY AND ARCHITECTURE OF THE VIRUS 提交 1995-06-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 5–267（263 aa）链 B 5–267（263 aa）链 C 5–267（263 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.00 Å
1SMV PRIMARY STRUCTURE OF SESBANIA MOSAIC VIRUS COAT PROTEIN: ITS IMPLICATIONS TO THE ASSEMBLY AND ARCHITECTURE OF THE VIRUS 提交 1995-06-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric	链 A 5–267（263 aa）链 B 5–267（263 aa）链 C 5–267（263 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 20	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.00 Å
1SMV PRIMARY STRUCTURE OF SESBANIA MOSAIC VIRUS COAT PROTEIN: ITS IMPLICATIONS TO THE ASSEMBLY AND ARCHITECTURE OF THE VIRUS 提交 1995-06-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric	链 A 5–267（263 aa）链 B 5–267（263 aa）链 C 5–267（263 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 24	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.00 Å
1SMV PRIMARY STRUCTURE OF SESBANIA MOSAIC VIRUS COAT PROTEIN: ITS IMPLICATIONS TO THE ASSEMBLY AND ARCHITECTURE OF THE VIRUS 提交 1995-06-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 5–267（263 aa）链 B 5–267（263 aa）链 C 5–267（263 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.00 Å
1SMV PRIMARY STRUCTURE OF SESBANIA MOSAIC VIRUS COAT PROTEIN: ITS IMPLICATIONS TO THE ASSEMBLY AND ARCHITECTURE OF THE VIRUS 提交 1995-06-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 60 PDB 声明：60-meric	链 A 5–267（263 aa）链 B 5–267（263 aa）链 C 5–267（263 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 80	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.00 Å
1VAK T=1 capsid structure of Sesbania mosaic virus coat protein deletion mutant CP-N(delta)65 提交 2004-02-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 60 PDB 声明：complete icosahedral assembly	链 A 66–268（203 aa）片段：residues 66-268	未记录	CA CALCIUM ION × 60	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；PEG 3350, magnesium chloride, isopropanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.05 Å R-free 0.214
1VAK T=1 capsid structure of Sesbania mosaic virus coat protein deletion mutant CP-N(delta)65 提交 2004-02-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 66–268（203 aa）片段：residues 66-268	未记录	CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；PEG 3350, magnesium chloride, isopropanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.05 Å R-free 0.214
1VAK T=1 capsid structure of Sesbania mosaic virus coat protein deletion mutant CP-N(delta)65 提交 2004-02-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 66–268（203 aa）片段：residues 66-268	未记录	CA CALCIUM ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；PEG 3350, magnesium chloride, isopropanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.05 Å R-free 0.214
1VAK T=1 capsid structure of Sesbania mosaic virus coat protein deletion mutant CP-N(delta)65 提交 2004-02-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 66–268（203 aa）片段：residues 66-268	未记录	CA CALCIUM ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；PEG 3350, magnesium chloride, isopropanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.05 Å R-free 0.214
1VAK T=1 capsid structure of Sesbania mosaic virus coat protein deletion mutant CP-N(delta)65 提交 2004-02-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 66–268（203 aa）片段：residues 66-268	未记录	CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；PEG 3350, magnesium chloride, isopropanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.05 Å R-free 0.214
1VAK T=1 capsid structure of Sesbania mosaic virus coat protein deletion mutant CP-N(delta)65 提交 2004-02-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 60 PDB 声明：60-meric	链 A 66–268（203 aa）片段：residues 66-268	未记录	CA CALCIUM ION × 60	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；PEG 3350, magnesium chloride, isopropanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.05 Å R-free 0.214
1VB2 T=1 capsid structure of Sesbania mosaic virus coat protein deletion mutant CP-N(delta)65-D146N-D149N 提交 2004-02-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 60 PDB 声明：complete icosahedral assembly	链 A 66–268（203 aa）片段：residues 66-268	突变：D146N/D149N	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；290 K；PEG 3350, Magnesium Chloride, Isopropanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K	分辨率 3.40 Å R-free 0.261
1VB2 T=1 capsid structure of Sesbania mosaic virus coat protein deletion mutant CP-N(delta)65-D146N-D149N 提交 2004-02-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 66–268（203 aa）片段：residues 66-268	突变：D146N/D149N	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；290 K；PEG 3350, Magnesium Chloride, Isopropanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K	分辨率 3.40 Å R-free 0.261
1VB2 T=1 capsid structure of Sesbania mosaic virus coat protein deletion mutant CP-N(delta)65-D146N-D149N 提交 2004-02-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 66–268（203 aa）片段：residues 66-268	突变：D146N/D149N	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；290 K；PEG 3350, Magnesium Chloride, Isopropanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K	分辨率 3.40 Å R-free 0.261
1VB2 T=1 capsid structure of Sesbania mosaic virus coat protein deletion mutant CP-N(delta)65-D146N-D149N 提交 2004-02-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 66–268（203 aa）片段：residues 66-268	突变：D146N/D149N	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；290 K；PEG 3350, Magnesium Chloride, Isopropanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K	分辨率 3.40 Å R-free 0.261
1VB2 T=1 capsid structure of Sesbania mosaic virus coat protein deletion mutant CP-N(delta)65-D146N-D149N 提交 2004-02-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 66–268（203 aa）片段：residues 66-268	突变：D146N/D149N	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；290 K；PEG 3350, Magnesium Chloride, Isopropanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K	分辨率 3.40 Å R-free 0.261
1VB2 T=1 capsid structure of Sesbania mosaic virus coat protein deletion mutant CP-N(delta)65-D146N-D149N 提交 2004-02-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 60 PDB 声明：60-meric	链 A 66–268（203 aa）片段：residues 66-268	突变：D146N/D149N	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；290 K；PEG 3350, Magnesium Chloride, Isopropanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K	分辨率 3.40 Å R-free 0.261
1VB4 T=1 capsid structure of Sesbania mosaic virus coat protein deletion mutant CP-N(delta)36 提交 2004-02-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 60 PDB 声明：complete icosahedral assembly	链 A 37–268（232 aa）片段：residues 37-268	未记录	CA CALCIUM ION × 60	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；290 K；PEG 3350, magnesium chloride, isopropanol , pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K	分辨率 3.30 Å R-free 0.259
1VB4 T=1 capsid structure of Sesbania mosaic virus coat protein deletion mutant CP-N(delta)36 提交 2004-02-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 37–268（232 aa）片段：residues 37-268	未记录	CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；290 K；PEG 3350, magnesium chloride, isopropanol , pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K	分辨率 3.30 Å R-free 0.259
1VB4 T=1 capsid structure of Sesbania mosaic virus coat protein deletion mutant CP-N(delta)36 提交 2004-02-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 37–268（232 aa）片段：residues 37-268	未记录	CA CALCIUM ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；290 K；PEG 3350, magnesium chloride, isopropanol , pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K	分辨率 3.30 Å R-free 0.259
1VB4 T=1 capsid structure of Sesbania mosaic virus coat protein deletion mutant CP-N(delta)36 提交 2004-02-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 37–268（232 aa）片段：residues 37-268	未记录	CA CALCIUM ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；290 K；PEG 3350, magnesium chloride, isopropanol , pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K	分辨率 3.30 Å R-free 0.259
1VB4 T=1 capsid structure of Sesbania mosaic virus coat protein deletion mutant CP-N(delta)36 提交 2004-02-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 37–268（232 aa）片段：residues 37-268	未记录	CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；290 K；PEG 3350, magnesium chloride, isopropanol , pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K	分辨率 3.30 Å R-free 0.259
1VB4 T=1 capsid structure of Sesbania mosaic virus coat protein deletion mutant CP-N(delta)36 提交 2004-02-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 60 PDB 声明：60-meric	链 A 37–268（232 aa）片段：residues 37-268	未记录	CA CALCIUM ION × 60	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；290 K；PEG 3350, magnesium chloride, isopropanol , pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K	分辨率 3.30 Å R-free 0.259
1X33 T=3 recombinant capsid of SeMV CP 提交 2005-04-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 180 PDB 声明：complete icosahedral assembly	链 A 1–268（268 aa）链 B 1–268（268 aa）链 C 1–268（268 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 180	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；6% PEG 3350, 0.1M MgCl2, Isopropanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.60 Å R-free 0.234
1X33 T=3 recombinant capsid of SeMV CP 提交 2005-04-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–268（268 aa）链 B 1–268（268 aa）链 C 1–268（268 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；6% PEG 3350, 0.1M MgCl2, Isopropanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.60 Å R-free 0.234
1X33 T=3 recombinant capsid of SeMV CP 提交 2005-04-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric	链 A 1–268（268 aa）链 B 1–268（268 aa）链 C 1–268（268 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 15	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；6% PEG 3350, 0.1M MgCl2, Isopropanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.60 Å R-free 0.234
1X33 T=3 recombinant capsid of SeMV CP 提交 2005-04-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric	链 A 1–268（268 aa）链 B 1–268（268 aa）链 C 1–268（268 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 18	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；6% PEG 3350, 0.1M MgCl2, Isopropanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.60 Å R-free 0.234
1X33 T=3 recombinant capsid of SeMV CP 提交 2005-04-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–268（268 aa）链 B 1–268（268 aa）链 C 1–268（268 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；6% PEG 3350, 0.1M MgCl2, Isopropanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.60 Å R-free 0.234
1X33 T=3 recombinant capsid of SeMV CP 提交 2005-04-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 60 PDB 声明：60-meric	链 A 1–268（268 aa）链 B 1–268（268 aa）链 C 1–268（268 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 60	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；6% PEG 3350, 0.1M MgCl2, Isopropanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.60 Å R-free 0.234
1X35 Recombinant T=3 capsid of a site specific mutant of SeMV CP 提交 2005-04-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 180 PDB 声明：complete icosahedral assembly	链 A 1–268（268 aa）链 B 1–268（268 aa）链 C 1–268（268 aa）	突变：P53A 突变：P53A 突变：P53A	CA CALCIUM ION × 180	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；6% PEG 3350, 0.1M MgCl2, Isopropanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 4.10 Å R-free 0.270
1X35 Recombinant T=3 capsid of a site specific mutant of SeMV CP 提交 2005-04-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–268（268 aa）链 B 1–268（268 aa）链 C 1–268（268 aa）	突变：P53A 突变：P53A 突变：P53A	CA CALCIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；6% PEG 3350, 0.1M MgCl2, Isopropanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 4.10 Å R-free 0.270
1X35 Recombinant T=3 capsid of a site specific mutant of SeMV CP 提交 2005-04-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric	链 A 1–268（268 aa）链 B 1–268（268 aa）链 C 1–268（268 aa）	突变：P53A 突变：P53A 突变：P53A	CA CALCIUM ION × 15	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；6% PEG 3350, 0.1M MgCl2, Isopropanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 4.10 Å R-free 0.270
1X35 Recombinant T=3 capsid of a site specific mutant of SeMV CP 提交 2005-04-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric	链 A 1–268（268 aa）链 B 1–268（268 aa）链 C 1–268（268 aa）	突变：P53A 突变：P53A 突变：P53A	CA CALCIUM ION × 18	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；6% PEG 3350, 0.1M MgCl2, Isopropanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 4.10 Å R-free 0.270
1X35 Recombinant T=3 capsid of a site specific mutant of SeMV CP 提交 2005-04-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–268（268 aa）链 B 1–268（268 aa）链 C 1–268（268 aa）	突变：P53A 突变：P53A 突变：P53A	CA CALCIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；6% PEG 3350, 0.1M MgCl2, Isopropanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 4.10 Å R-free 0.270
1X35 Recombinant T=3 capsid of a site specific mutant of SeMV CP 提交 2005-04-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 90 PDB 声明：90-meric	链 A 1–268（268 aa）链 B 1–268（268 aa）链 C 1–268（268 aa）	突变：P53A 突变：P53A 突变：P53A	CA CALCIUM ION × 90	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；6% PEG 3350, 0.1M MgCl2, Isopropanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 4.10 Å R-free 0.270
1X36 T=1 capsid of an amino-terminal deletion mutant of SeMV CP 提交 2005-04-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 60 PDB 声明：complete icosahedral assembly	链 A 32–268（237 aa）片段：residues 32-268	未记录	CA CALCIUM ION × 60	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；4% PEG 3350, 0.1M MgCl2, Isopropanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 2.70 Å R-free 0.247
1X36 T=1 capsid of an amino-terminal deletion mutant of SeMV CP 提交 2005-04-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 32–268（237 aa）片段：residues 32-268	未记录	CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；4% PEG 3350, 0.1M MgCl2, Isopropanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 2.70 Å R-free 0.247
1X36 T=1 capsid of an amino-terminal deletion mutant of SeMV CP 提交 2005-04-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 32–268（237 aa）片段：residues 32-268	未记录	CA CALCIUM ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；4% PEG 3350, 0.1M MgCl2, Isopropanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 2.70 Å R-free 0.247
1X36 T=1 capsid of an amino-terminal deletion mutant of SeMV CP 提交 2005-04-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 32–268（237 aa）片段：residues 32-268	未记录	CA CALCIUM ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；4% PEG 3350, 0.1M MgCl2, Isopropanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 2.70 Å R-free 0.247
1X36 T=1 capsid of an amino-terminal deletion mutant of SeMV CP 提交 2005-04-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 32–268（237 aa）片段：residues 32-268	未记录	CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；4% PEG 3350, 0.1M MgCl2, Isopropanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 2.70 Å R-free 0.247
1X36 T=1 capsid of an amino-terminal deletion mutant of SeMV CP 提交 2005-04-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 60 PDB 声明：60-meric	链 A 32–268（237 aa）片段：residues 32-268	未记录	CA CALCIUM ION × 60	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；4% PEG 3350, 0.1M MgCl2, Isopropanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 2.70 Å R-free 0.247
2VQ0 Capsid structure of Sesbania mosaic virus coat protein deletion mutant rCP(delta 48 to 59) 提交 2008-03-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 180 PDB 声明：180-MERIC	链 A 1–47（47 aa）片段：RESIDUES 1-47,60-268 链 A 60–268（209 aa）片段：RESIDUES 1-47,60-268 链 B 1–47（47 aa）片段：RESIDUES 1-47,60-268 链 B 60–268（209 aa）片段：RESIDUES 1-47,60-268 链 C 1–47（47 aa）片段：RESIDUES 1-47,60-268 链 C 60–268（209 aa）片段：RESIDUES 1-47,60-268	未记录	CA CALCIUM ION × 180	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；0.2 M LI2SO4 MONOHYDRATE, 0.1 M BISTRIS (PH7.5), 25 % PEG 3350 VAPOUR DIFFUSION, SITTING DROP	分辨率 3.60 Å R-free 0.258
2VQ0 Capsid structure of Sesbania mosaic virus coat protein deletion mutant rCP(delta 48 to 59) 提交 2008-03-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–47（47 aa）片段：RESIDUES 1-47,60-268 链 A 60–268（209 aa）片段：RESIDUES 1-47,60-268 链 B 1–47（47 aa）片段：RESIDUES 1-47,60-268 链 B 60–268（209 aa）片段：RESIDUES 1-47,60-268 链 C 1–47（47 aa）片段：RESIDUES 1-47,60-268 链 C 60–268（209 aa）片段：RESIDUES 1-47,60-268	未记录	CA CALCIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；0.2 M LI2SO4 MONOHYDRATE, 0.1 M BISTRIS (PH7.5), 25 % PEG 3350 VAPOUR DIFFUSION, SITTING DROP	分辨率 3.60 Å R-free 0.258
2VQ0 Capsid structure of Sesbania mosaic virus coat protein deletion mutant rCP(delta 48 to 59) 提交 2008-03-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric	链 A 1–47（47 aa）片段：RESIDUES 1-47,60-268 链 A 60–268（209 aa）片段：RESIDUES 1-47,60-268 链 B 1–47（47 aa）片段：RESIDUES 1-47,60-268 链 B 60–268（209 aa）片段：RESIDUES 1-47,60-268 链 C 1–47（47 aa）片段：RESIDUES 1-47,60-268 链 C 60–268（209 aa）片段：RESIDUES 1-47,60-268	未记录	CA CALCIUM ION × 15	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；0.2 M LI2SO4 MONOHYDRATE, 0.1 M BISTRIS (PH7.5), 25 % PEG 3350 VAPOUR DIFFUSION, SITTING DROP	分辨率 3.60 Å R-free 0.258
2VQ0 Capsid structure of Sesbania mosaic virus coat protein deletion mutant rCP(delta 48 to 59) 提交 2008-03-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric	链 A 1–47（47 aa）片段：RESIDUES 1-47,60-268 链 A 60–268（209 aa）片段：RESIDUES 1-47,60-268 链 B 1–47（47 aa）片段：RESIDUES 1-47,60-268 链 B 60–268（209 aa）片段：RESIDUES 1-47,60-268 链 C 1–47（47 aa）片段：RESIDUES 1-47,60-268 链 C 60–268（209 aa）片段：RESIDUES 1-47,60-268	未记录	CA CALCIUM ION × 18	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；0.2 M LI2SO4 MONOHYDRATE, 0.1 M BISTRIS (PH7.5), 25 % PEG 3350 VAPOUR DIFFUSION, SITTING DROP	分辨率 3.60 Å R-free 0.258
2VQ0 Capsid structure of Sesbania mosaic virus coat protein deletion mutant rCP(delta 48 to 59) 提交 2008-03-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–47（47 aa）片段：RESIDUES 1-47,60-268 链 A 60–268（209 aa）片段：RESIDUES 1-47,60-268 链 B 1–47（47 aa）片段：RESIDUES 1-47,60-268 链 B 60–268（209 aa）片段：RESIDUES 1-47,60-268 链 C 1–47（47 aa）片段：RESIDUES 1-47,60-268 链 C 60–268（209 aa）片段：RESIDUES 1-47,60-268	未记录	CA CALCIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；0.2 M LI2SO4 MONOHYDRATE, 0.1 M BISTRIS (PH7.5), 25 % PEG 3350 VAPOUR DIFFUSION, SITTING DROP	分辨率 3.60 Å R-free 0.258
2WLP Sesbania mosaic virus capsid protein dimer mutant (rCP-DEL-N65-W170K) 提交 2009-06-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 66–268（203 aa）片段：RESIDUES 66-268	突变：YES	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 MICROBATCH；pH 6.5；0.1 M BIS TRIS (PH 6.5) AND 28% PEG 2000	分辨率 2.65 Å R-free 0.294
2WLP Sesbania mosaic virus capsid protein dimer mutant (rCP-DEL-N65-W170K) 提交 2009-06-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 66–268（203 aa）片段：RESIDUES 66-268	突变：YES	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 MICROBATCH；pH 6.5；0.1 M BIS TRIS (PH 6.5) AND 28% PEG 2000	分辨率 2.65 Å R-free 0.294
4Y4Y T=1 capsid structure of SeMV Ndel65CP fused with B-domain of S. aureus protein SpA at the N-terminus (C2 crystal form) 提交 2015-02-11	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 60 PDB 声明：60-meric	链 A 66–268（203 aa）片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268 链 B 66–268（203 aa）片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268 链 C 66–268（203 aa）片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268 链 D 66–268（203 aa）片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268 链 E 66–268（203 aa）片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268 链 F 66–268（203 aa）片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268 链 G 66–268（203 aa）片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268 链 H 66–268（203 aa）片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268 链 I 66–268（203 aa）片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268 链 J 66–268（203 aa）片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268 链 K 66–268（203 aa）片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268 链 L 66–268（203 aa）片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268 链 M 66–268（203 aa）片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268 链 N 66–268（203 aa）片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268 链 O 66–268（203 aa）片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268 链 P 66–268（203 aa）片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268 链 Q 66–268（203 aa）片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268 链 R 66–268（203 aa）片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268 链 S 66–268（203 aa）片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268 链 T 66–268（203 aa）片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268 链 U 66–268（203 aa）片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268 链 V 66–268（203 aa）片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268 链 W 66–268（203 aa）片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268 链 X 66–268（203 aa）片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268 链 Y 66–268（203 aa）片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268 链 Z 66–268（203 aa）片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268 链 a 66–268（203 aa）片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268 链 b 66–268（203 aa）片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268 链 c 66–268（203 aa）片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268 链 d 66–268（203 aa）片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268	未记录	SO4 SULFATE ION × 12	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；15-20% PEG 4000, 5% Iso-propanol, 100 mM Sodium citrate	分辨率 3.00 Å R-free 0.200

共 10 个其他 PDB 条目、50 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q9EB06_9VIRU
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 0； PDB构建体 80–282； UniProt 66–268 作者链 1； PDB构建体 80–282； UniProt 66–268 作者链 2； PDB构建体 80–282； UniProt 66–268 作者链 3； PDB构建体 80–282； UniProt 66–268 作者链 4； PDB构建体 80–282； UniProt 66–268 作者链 5； PDB构建体 80–282； UniProt 66–268 作者链 6； PDB构建体 80–282； UniProt 66–268 作者链 7； PDB构建体 80–282； UniProt 66–268 作者链 A； PDB构建体 80–282； UniProt 66–268 作者链 B； PDB构建体 80–282； UniProt 66–268 作者链 C； PDB构建体 80–282； UniProt 66–268 作者链 D； PDB构建体 80–282； UniProt 66–268 作者链 E； PDB构建体 80–282； UniProt 66–268 作者链 F； PDB构建体 80–282； UniProt 66–268 作者链 G； PDB构建体 80–282； UniProt 66–268 作者链 H； PDB构建体 80–282； UniProt 66–268 作者链 I； PDB构建体 80–282； UniProt 66–268 作者链 J； PDB构建体 80–282； UniProt 66–268 作者链 K； PDB构建体 80–282； UniProt 66–268 作者链 L； PDB构建体 80–282； UniProt 66–268 作者链 M； PDB构建体 80–282； UniProt 66–268 作者链 N； PDB构建体 80–282； UniProt 66–268 作者链 O； PDB构建体 80–282； UniProt 66–268 作者链 P； PDB构建体 80–282； UniProt 66–268 作者链 Q； PDB构建体 80–282； UniProt 66–268 作者链 R； PDB构建体 80–282； UniProt 66–268 作者链 S； PDB构建体 80–282； UniProt 66–268 作者链 T； PDB构建体 80–282； UniProt 66–268 作者链 U； PDB构建体 80–282； UniProt 66–268 作者链 V； PDB构建体 80–282； UniProt 66–268 作者链 W； PDB构建体 80–282； UniProt 66–268 作者链 X； PDB构建体 80–282； UniProt 66–268 作者链 Y； PDB构建体 80–282； UniProt 66–268 作者链 Z； PDB构建体 80–282； UniProt 66–268 作者链 a； PDB构建体 80–282； UniProt 66–268 作者链 b； PDB构建体 80–282； UniProt 66–268 作者链 c； PDB构建体 80–282； UniProt 66–268 作者链 d； PDB构建体 80–282； UniProt 66–268 作者链 e； PDB构建体 80–282； UniProt 66–268 作者链 f； PDB构建体 80–282； UniProt 66–268 作者链 g； PDB构建体 80–282； UniProt 66–268 作者链 h； PDB构建体 80–282； UniProt 66–268 作者链 i； PDB构建体 80–282； UniProt 66–268 作者链 j； PDB构建体 80–282； UniProt 66–268 作者链 k； PDB构建体 80–282； UniProt 66–268 作者链 l； PDB构建体 80–282； UniProt 66–268 作者链 m； PDB构建体 80–282； UniProt 66–268 作者链 n； PDB构建体 80–282； UniProt 66–268 作者链 o； PDB构建体 80–282； UniProt 66–268 作者链 p； PDB构建体 80–282； UniProt 66–268 作者链 q； PDB构建体 80–282； UniProt 66–268 作者链 r； PDB构建体 80–282； UniProt 66–268 作者链 s； PDB构建体 80–282； UniProt 66–268 作者链 t； PDB构建体 80–282； UniProt 66–268 作者链 u； PDB构建体 80–282； UniProt 66–268 作者链 v； PDB构建体 80–282； UniProt 66–268 作者链 w； PDB构建体 80–282； UniProt 66–268 作者链 x； PDB构建体 80–282； UniProt 66–268 作者链 y； PDB构建体 80–282； UniProt 66–268 作者链 z； PDB构建体 80–282； UniProt 66–268

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	4y5z
沉积日期 deposition_date	2015-02-12
结构标题 title	T=1 capsid structure of SeMV Ndel65CP fused with B-domain of S. aureus protein SpA at the N-terminus (P1 crystal form)
关键词 keywords	coat protein, chimeric VLP, in vitro assembly, VIRUS; VIRUS
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	76.98 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	75.96 Å
零角强度 I(0) i0	19851900000.00
分子量 molecular_weight	1216500.0 kDa
排除体积 excluded_volume	1527700 Å³
包络体积 envelope_volume	2672600 Å³
水化壳体积 shell_volume	288300 Å³
包络直径 envelope_diameter	197.9 Å
壳层 Rg shell_rg	88.45 Å
包络 Rg envelope_rg	67.24 Å
形状 Rg shape_rg	75.96 Å
总 Rg total_rg	76.14 Å
总原子数 total_atoms	85471
残基数 n_residues	11534
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	188.3 Å
Rg (实空间) rg_real	76.27 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.52 Å
I(0) (实空间) i0_real	1.9850e+10
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	3.5010e+08
Rg (倒空间) rg_reciprocal	79.40 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	19980000000.0000
解质量估计 total_estimate	0.7936
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	131.8 Å
偏度 Skewness skewness	-0.419
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.629
角度范围 angular_range	— – 0.1000 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0001
最高正则化参数 α highest_alpha	7115000000.0000
实空间数据点数 n_real_points	21
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.810; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.882; Smooth: 0.000

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Immunoglobulin G-binding protein A,Coat protein
分子量 formula_weight	30543.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	60

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,a,c,e,g,i,k,m,o,q,r,s,t,u,v,w,x,y,z,0,1,2,3,4,5,6,7,b,d,f,h,j,l,n,p
原子数 atom_count	86922

MRGSHHHHHHGMASMDNKFNKEQQNAFYEILNMPNLNEEQRNGFIQSLKDDPSQSANLLSEAKKLNESQAPKEGSELEMAVSSSRGGITVLTHSELSAEIGVTDSIVVSSELVMPYTVGTWLRGVAANWSKYSWLSVRYTYIPSCPSSTAGSIHMGFQYDMADTVPVSVNQLSNLRGYVSGQVWSGSAGLCFINGTRCSDTSTAISTTLDVSKLGKKWYPYKTSADYATAVGVDVNIATPLVPARLVIALLDGSSSTAVAAGRIYCTYTIQMIEPTASALNN

来源 Source

来源生物 organism	Sesbania mosaic virus
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	12558
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	SULFATE ION
分子量 formula_weight	96.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	12

实体 3 Entity 3 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1451

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 94 domains

SCOP 2.08 (34 domains)

结构域编号 domain_id	d4y5z0_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.121 — Nucleoplasmin-like/VP (viral coat and capsid proteins)
超家族 Superfamily superfamily	b.121.4 — Positive stranded ssRNA viruses
家族 Family family	b.121.4.7 — Tombusviridae-like VP

结构域编号 domain_id	d4y5z1_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.121 — Nucleoplasmin-like/VP (viral coat and capsid proteins)
超家族 Superfamily superfamily	b.121.4 — Positive stranded ssRNA viruses
家族 Family family	b.121.4.7 — Tombusviridae-like VP

结构域编号 domain_id	d4y5z2_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.121 — Nucleoplasmin-like/VP (viral coat and capsid proteins)
超家族 Superfamily superfamily	b.121.4 — Positive stranded ssRNA viruses
家族 Family family	b.121.4.7 — Tombusviridae-like VP

结构域编号 domain_id	d4y5z3_
类 Class class	b — All beta proteins
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家族 Family family	b.121.4.7 — Tombusviridae-like VP

结构域编号 domain_id	d4y5z4_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.121 — Nucleoplasmin-like/VP (viral coat and capsid proteins)
超家族 Superfamily superfamily	b.121.4 — Positive stranded ssRNA viruses
家族 Family family	b.121.4.7 — Tombusviridae-like VP

结构域编号 domain_id	d4y5z5_
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超家族 Superfamily superfamily	b.121.4 — Positive stranded ssRNA viruses
家族 Family family	b.121.4.7 — Tombusviridae-like VP

结构域编号 domain_id	d4y5z7_
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类 Class class	b — All beta proteins
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类 Class class	b — All beta proteins
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类 Class class	b — All beta proteins
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结构域编号 domain_id	d4y5zz_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.121 — Nucleoplasmin-like/VP (viral coat and capsid proteins)
超家族 Superfamily superfamily	b.121.4 — Positive stranded ssRNA viruses
家族 Family family	b.121.4.7 — Tombusviridae-like VP

CATH v4.4 (60 domains)

结构域编号 domain_id	4y5z000
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 —

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同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 —

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同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 —

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同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 —

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同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 —

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同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 —

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同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 —

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同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 —

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拓扑 Topology topology	120 — Jelly Rolls
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同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 —

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同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 —

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架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 —

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类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 —

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架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 —

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架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 —

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类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 —

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类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 —

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类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 —

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类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 —

结构域编号 domain_id	4y5zw00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 —

结构域编号 domain_id	4y5zx00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 —

结构域编号 domain_id	4y5zy00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 —

结构域编号 domain_id	4y5zz00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 —

▶

8. 引用文献 (1)

▶

晶胞边长 a length_a	186.480 Å
晶胞边长 b length_b	187.420 Å
晶胞边长 c length_c	187.930 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	61.09 °
晶胞夹角 β angle_beta	89.24 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	60.20 °
晶胞分子数 Z z_pdb	60

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.950 Å
最低分辨率 resolution_low	41.916 Å
R 因子 r_factor	0.1987
R_work r_work	0.1960
R_free r_free	0.2494

T=1 capsid structure of SeMV Ndel65CP fused with B-domain of S. aureus protein SpA at the N-terminus (P1 crystal form)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Immunoglobulin G-binding protein A,Coat protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Immunoglobulin G-binding protein A,Coat protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 94 domains

SCOP 2.08 (34 domains)

CATH v4.4 (60 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)

fit	/app/data/saxs_computation/y5/4y5z/4y5z.fit
pddf	/app/data/pr_computation/y5/4y5z/4y5z.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/y5/4y5z/4y5z.dat