4yeu

ELIC-GLIC chimera in the resting conformation

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 119.8 Å Quality: GOOD

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Cys-loop ligand-gated ion channel,Proton-gated ion channel

物种未注明

UniProt P0C7B7

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 信息不足 同源多聚体 蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 11–199 链 B; UniProt 11–199 链 C; UniProt 11–199 链 D; UniProt 11–199 链 E; UniProt 11–199 未记录 无其他共同聚合物 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;PEG 4000, Ammonium Sulfate, Sodium ADA 分辨率 4.60 Å R-free 0.248

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 17 个其他 PDB 条目、30 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ELIC_DICCH
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–190; UniProt 11–199 作者链 B; PDB构建体 1–190; UniProt 11–199 作者链 C; PDB构建体 1–190; UniProt 11–199 作者链 D; PDB构建体 1–190; UniProt 11–199 作者链 E; PDB构建体 1–190; UniProt 11–199

Cys-loop ligand-gated ion channel,Proton-gated ion channel

物种未注明

UniProt Q7NDN8

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 信息不足 同源多聚体 蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 236–357 链 B; UniProt 236–357 链 C; UniProt 236–357 链 D; UniProt 236–357 链 E; UniProt 236–357 未记录 无其他共同聚合物 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;PEG 4000, Ammonium Sulfate, Sodium ADA 分辨率 4.60 Å R-free 0.248

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 129 个其他 PDB 条目、135 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 GLIC_GLOVI
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 191–312; UniProt 236–357 作者链 B; PDB构建体 191–312; UniProt 236–357 作者链 C; PDB构建体 191–312; UniProt 236–357 作者链 D; PDB构建体 191–312; UniProt 236–357 作者链 E; PDB构建体 191–312; UniProt 236–357

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 4yeu

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 4yeu
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id4yeu
沉积日期 deposition_date2015-02-24
结构标题 titleELIC-GLIC chimera in the resting conformation
关键词 keywordsion channel, membrane protein, low resolution structure; MEMBRANE PROTEIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier37.46
回转半径 Rg (电子) rg_electron36.57
零角强度 I(0) i0427515000.00
分子量 molecular_weight180650.0 kDa
排除体积 excluded_volume230980 ų
包络体积 envelope_volume301200 ų
水化壳体积 shell_volume66725 ų
包络直径 envelope_diameter118.6
壳层 Rg shell_rg44.59
包络 Rg envelope_rg35.91
形状 Rg shape_rg36.55
总 Rg total_rg37.19
总原子数 total_atoms12825
残基数 n_residues1560
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax119.8
Rg (实空间) rg_real37.30
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.90
I(0) (实空间) i0_real4.2750e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error7.1470e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal37.40
I(0) (倒空间) i0_reciprocal427600000.0000
解质量估计 total_estimate0.8848
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary48.5
偏度 Skewness skewness0.251
峰度 Kurtosis kurtosis-0.361
角度范围 angular_range— – 0.2100 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha144600000.0000
实空间数据点数 n_real_points43
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.868; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.983; Smooth: 0.913

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)