SAXSdb — 4z1v

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Hypoxia-inducible factor 1-alpha inhibitor

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白同源多聚体	同源多聚体	蛋白 2	N-OXALYLGLYCINE × 2 NITRIC OXIDE × 2 DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 FE (III) ION × 2 SULFATE ION × 10 water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	HIF1N_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 4–352； UniProt 1–349

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	4z1v
沉积日期 deposition_date	2015-03-27
结构标题 title	Structure of Factor Inhibiting HIF (FIH) in complex with Fe, NO, and NOG
关键词 keywords	Hypoxia Inducible Factor, Factor Inhibiting HIF, Hydroxylase, Oxygen Sensing, OXIDOREDUCTASE; OXIDOREDUCTASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

▼

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

4z1v__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

4z1v__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

4z1v__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	34.70 Å
Rg（电子密度）	34.65 Å
总 Rg	34.96 Å
原子数	5610
残基数	682
排除体积	98704 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`4z1v__assembly_1__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

▶

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

▶

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Hypoxia-inducible factor 1-alpha inhibitor
分子量 formula_weight	40610.6 kDa
EC 编号 ec_number	1.14.11.30,1.14.11.-
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	2904

GSHMAATAAEAVASGSGEPREEAGALGPAWDESQLRSYSFPTRPIPRLSQSDPRAEELIENEEPVVLTDTNLVYPALKWDLEYLQENIGNGDFSVYSASTHKFLYYDEKKMANFQNFKPRSNREEMKFHEFVEKLQDIQQRGGEERLYLQQTLNDTVGRKIVMDFLGFNWNWINKQQGKRGWGQLTSNLLLIGMEGNVTPAHYDEQQNFFAQIKGYKRCILFPPDQFECLYPYPVHHPCDRQSQVDFDNPDYERFPNFQNVVGYETVVGPGDVLYIPMYWWHHIESLLNGGITITVNFWYKGAPTPKRIEYPLKAHQKVAIMRNIEKMLGEALGNPQEVGPLLNTMIKGRYN

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	N-OXALYLGLYCINE
分子量 formula_weight	147.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	NITRIC OXIDE
分子量 formula_weight	30.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	DI(HYDROXYETHYL)ETHER
分子量 formula_weight	106.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	FE (III) ION
分子量 formula_weight	55.8 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	SULFATE ION
分子量 formula_weight	96.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	5

实体 7 Entity 7 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	99

▼

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_id	d4z1va_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.82 — Double-stranded beta-helix
超家族 Superfamily superfamily	b.82.2 — Clavaminate synthase-like
家族 Family family	b.82.2.6 — Hypoxia-inducible factor HIF ihhibitor (FIH1)

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id	4z1vA01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Jelly Rolls

结构域编号 domain_id	4z1vA02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	287 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1010 — Clavaminate synthase-like

▶

晶胞边长 a length_a	86.650 Å
晶胞边长 b length_b	86.650 Å
晶胞边长 c length_c	147.730 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 41 21 2
空间群编号 int_tables_number	92
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.100 Å
最低分辨率 resolution_low	74.740 Å
R 因子 r_factor	0.1945
R_work r_work	0.1896
R_free r_free	0.2397

Structure of Factor Inhibiting HIF (FIH) in complex with Fe, NO, and NOG

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Hypoxia-inducible factor 1-alpha inhibitor

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

4z1v__assembly_1__model_1

4z1v__assembly_1__model_1 | I(q)

4z1v__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

CATH v4.4 (2 domains)

7. 引用文献 (1)

Structure of Factor Inhibiting HIF (FIH) in complex with Fe, NO, and NOG

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Hypoxia-inducible factor 1-alpha inhibitor

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

4z1v__assembly_1__model_1

4z1v__assembly_1__model_1 | I(q)

4z1v__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

CATH v4.4 (2 domains)

7. 引用文献 (1)