SAXSdb — 4zjs

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

;Acetylcholine receptor subunit alpha,Soluble acetylcholine receptor,Acetylcholine receptor subunit alpha,Soluble acetylcholine receptor ;

Aplysia californica

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	同源多聚体	蛋白 5	1-[(1R,6R)-9-azabicyclo[4.2.1]non-2-en-2-yl]ethanone × 3 water × 5	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ACHA_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 10–39； UniProt 21–50 作者链 A； PDB构建体 70–90； UniProt 106–126 作者链 B； PDB构建体 10–39； UniProt 21–50 作者链 B； PDB构建体 70–90； UniProt 106–126 作者链 C； PDB构建体 10–39； UniProt 21–50 作者链 C； PDB构建体 70–90； UniProt 106–126 作者链 D； PDB构建体 10–39； UniProt 21–50 作者链 D； PDB构建体 70–90； UniProt 106–126 作者链 E； PDB构建体 10–39； UniProt 21–50 作者链 E； PDB构建体 70–90； UniProt 106–126

;Acetylcholine receptor subunit alpha,Soluble acetylcholine receptor,Acetylcholine receptor subunit alpha,Soluble acetylcholine receptor ;

Aplysia californica

UniProt Q8WSF8

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	同源多聚体	蛋白 5	1-[(1R,6R)-9-azabicyclo[4.2.1]non-2-en-2-yl]ethanone × 3 water × 5	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q8WSF8_APLCA
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 40–69； UniProt 48–77 作者链 A； PDB构建体 91–228； UniProt 99–236 作者链 B； PDB构建体 40–69； UniProt 48–77 作者链 B； PDB构建体 91–228； UniProt 99–236 作者链 C； PDB构建体 40–69； UniProt 48–77 作者链 C； PDB构建体 91–228； UniProt 99–236 作者链 D； PDB构建体 40–69； UniProt 48–77 作者链 D； PDB构建体 91–228； UniProt 99–236 作者链 E； PDB构建体 40–69； UniProt 48–77 作者链 E； PDB构建体 91–228； UniProt 99–236

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	4zjs
沉积日期 deposition_date	2015-04-29
结构标题 title	Crystal structure of a chimeric acetylcholine binding protein from Aplysia Californica (Ac-AChBP) containing the main immunogenic region (MIR) from the human alpha 1 subunit of the muscle nicotinic acetylcholine receptor in complex with anatoxin-A.
关键词 keywords	anatoxin-A, nicotinic, receptor, acetylcholine, IMMUNE SYSTEM; IMMUNE SYSTEM
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

4zjs__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

4zjs__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

4zjs__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	31.15 Å
Rg（电子密度）	29.52 Å
总 Rg	30.39 Å
原子数	8080
残基数	1028
排除体积	142920 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`4zjs__assembly_1__model_1`	pentameric （5）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	;Acetylcholine receptor subunit alpha,Soluble acetylcholine receptor,Acetylcholine receptor subunit alpha,Soluble acetylcholine receptor ;
分子量 formula_weight	26309.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	5

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D,E
原子数 atom_count	8261

DYKDDDDKLSEHETRLVAKLFKDYSSVVRPVEDHRQVVEVTLGFTLQDIVKADSSTNEVDLVYYEQQRWVDYNLKWNPDDYGGVKKIHIPAADIWTPDITAYSSTRPVQVLSPQIAVVTHDGSVMFIPAQRLSFMCDPTGVDSEEGATCAVKFGSWVYSGFEIDLKTDTDQVDLSSYYASSKYEILSATQTRQVQHYSCCPEPYIDVNLVVKFRERRAGNGFFRNLFDSR

来源 Source

来源生物 organism	Aplysia californica
通用名 common_name	California sea hare
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	6500
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	1-[(1R,6R)-9-azabicyclo[4.2.1]non-2-en-2-yl]ethanone
分子量 formula_weight	165.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

实体 3 Entity 3 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	181

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 10 domains

SCOP 2.08 (5 domains)

结构域编号 domain_id	d4zjsa_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.96 — Nicotinic receptor ligand binding domain-like
超家族 Superfamily superfamily	b.96.1 — Nicotinic receptor ligand binding domain-like
家族 Family family	b.96.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d4zjsb_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.96 — Nicotinic receptor ligand binding domain-like
超家族 Superfamily superfamily	b.96.1 — Nicotinic receptor ligand binding domain-like
家族 Family family	b.96.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d4zjsc_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.96 — Nicotinic receptor ligand binding domain-like
超家族 Superfamily superfamily	b.96.1 — Nicotinic receptor ligand binding domain-like
家族 Family family	b.96.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d4zjsd_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.96 — Nicotinic receptor ligand binding domain-like
超家族 Superfamily superfamily	b.96.1 — Nicotinic receptor ligand binding domain-like
家族 Family family	b.96.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d4zjse_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.96 — Nicotinic receptor ligand binding domain-like
超家族 Superfamily superfamily	b.96.1 — Nicotinic receptor ligand binding domain-like
家族 Family family	b.96.1.0 — automated matches

CATH v4.4 (5 domains)

结构域编号 domain_id	4zjsA00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	70 — Distorted Sandwich
拓扑 Topology topology	170 — Acetylcholine Binding Protein; Chain: A,
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding domain

结构域编号 domain_id	4zjsB00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	70 — Distorted Sandwich
拓扑 Topology topology	170 — Acetylcholine Binding Protein; Chain: A,
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding domain

结构域编号 domain_id	4zjsC00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	70 — Distorted Sandwich
拓扑 Topology topology	170 — Acetylcholine Binding Protein; Chain: A,
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding domain

结构域编号 domain_id	4zjsD00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	70 — Distorted Sandwich
拓扑 Topology topology	170 — Acetylcholine Binding Protein; Chain: A,
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding domain

结构域编号 domain_id	4zjsE00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	70 — Distorted Sandwich
拓扑 Topology topology	170 — Acetylcholine Binding Protein; Chain: A,
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding domain

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晶胞边长 a length_a	207.604 Å
晶胞边长 b length_b	207.604 Å
晶胞边长 c length_c	207.604 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	120

空间群 space_group	I 2 3
空间群编号 int_tables_number	197
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.230 Å
最低分辨率 resolution_low	48.930 Å
R 因子 r_factor	0.1970
R_work r_work	0.1970
R_free r_free	0.2280

Crystal structure of a chimeric acetylcholine binding protein from Aplysia Californica (Ac-AChBP) containing the main immunogenic region (MIR) from the human alpha 1 subunit of the muscle nicotinic acetylcholine receptor in complex with anatoxin-A.

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

;Acetylcholine receptor subunit alpha,Soluble acetylcholine receptor,Acetylcholine receptor subunit alpha,Soluble acetylcholine receptor ;

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

;Acetylcholine receptor subunit alpha,Soluble acetylcholine receptor,Acetylcholine receptor subunit alpha,Soluble acetylcholine receptor ;

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

4zjs__assembly_1__model_1

4zjs__assembly_1__model_1 | I(q)

4zjs__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 10 domains

SCOP 2.08 (5 domains)

CATH v4.4 (5 domains)

7. 引用文献 (1)

Crystal structure of a chimeric acetylcholine binding protein from Aplysia Californica (Ac-AChBP) containing the main immunogenic region (MIR) from the human alpha 1 subunit of the muscle nicotinic acetylcholine receptor in complex with anatoxin-A.

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

;Acetylcholine receptor subunit alpha,Soluble acetylcholine receptor,Acetylcholine receptor subunit alpha,Soluble acetylcholine receptor ;

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

;Acetylcholine receptor subunit alpha,Soluble acetylcholine receptor,Acetylcholine receptor subunit alpha,Soluble acetylcholine receptor ;

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

4zjs__assembly_1__model_1

4zjs__assembly_1__model_1 | I(q)

4zjs__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 10 domains

SCOP 2.08 (5 domains)

CATH v4.4 (5 domains)

7. 引用文献 (1)