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1ZY3
Structural model of complex of Bcl-w protein with Bid BH3-peptide
提交 2005-06-09
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 B
82–101(20 aa)
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突变:R203K
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未记录非水小分子
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SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 7;303 K;离子强度(mmCIF原始值)10 mM NaCl;压力 1
NMR样品组成
0.7 mM Bcl-w U-15N,13C, 0.7 mM Bid BH3-peptide, 20 mM phosphate buffer, 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.7 mM Bcl-w U-15N, 0.7 mM Bid BH3-peptide, 20 mM phosphate buffer, 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.7 mM Bid BH3-peptide U-15N, 0.7 mM Bcl-w, 20 mM phosphate buffer, 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供
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2BID
HUMAN PRO-APOPTOTIC PROTEIN BID
提交 1999-01-27
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 A
1–195(195 aa)
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未记录
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未记录非水小分子
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SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.5;298 K;压力 1
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分辨率未提供
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2KBW
Solution Structure of human Mcl-1 complexed with human Bid_BH3 peptide
提交 2008-12-09
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 B
76–106(31 aa)
片段:BH3 motif, residues 76-106
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未记录
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未记录非水小分子
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SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.5;303 K;离子强度(mmCIF原始值)20;压力 ambient
NMR样品组成
0.5 mM [U-95% 15N] Mcl-1-1, 0.5 mM Bid_BH3-2, 20 mM HEPES-3, 1 mM DTT-4, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.5 mM Mcl-1-5, 0.5 mM [U-95% 15N] Bid_BH3-6, 20 mM HEPES-7, 1 mM DTT-8, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.5 mM [U-95% 13C; U-95% 15N] Mcl-1-9, 0.5 mM Bid_BH3-10, 20 mM HEPES-11, 1 mM DTT-12, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.5 mM [U-95% 13C; U-95% 15N] Mcl-1-13, 0.5 mM Bid_BH3-14, 20 mM HEPES-15, 1 mM DTT-16, 100 % [U-100% 2H] D2O-17, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成
0.5 mM Mcl-1-18, 0.5 mM [U-95% 13C; U-95% 15N] Bid_BH3-19, 20 mM HEPES-20, 1 mM DTT-21, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.5 mM Mcl-1-22, 0.5 mM [U-95% 13C; U-95% 15N] Bid_BH3-23, 20 mM HEPES-24, 1 mM DTT-25, 100 % [U-100% 2H] D2O-26, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成
0.4 mM [U-95% 15N] Mcl-1-27, 0.4 mM Bid_BH3-28, 20 mM HEPES-29, 1 mM DTT-30, 6 mg/mL Pf1 phage-31, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.4 mM Mcl-1-32, 0.4 mM [U-95% 15N] Bid_BH3-33, 20 mM HEPES-34, 1 mM DTT-35, 8 mg/mL Pf1 phage-36, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供
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2M5I
NMR structures of human apoptotic protein tBid in LPPG micelle
提交 2013-02-25
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 A
61–195(135 aa)
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未记录
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未记录非水小分子
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SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.6;318 K;离子强度(mmCIF原始值)0.1;压力 ambient
NMR样品组成
0.5 mM [U-15N] tBid in LPPG micelle, 0.8 mM [U-13C; U-15N] tBid in LPPG micelle, 0.8 mM [U-100% 15N; U-80% 2H] tBid in LPPG micelle, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1.0 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] tBid in LPPG micelle, 100% D2O | 100% D2O
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分辨率未提供
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4BD2
Bax domain swapped dimer in complex with BidBH3
提交 2012-10-04
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构建体不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
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链 C
76–109(34 aa)
片段:RESIDUES 76-109
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未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
1.4 M SODIUM CITRATE, 0.1 M SODIUM CACODYLATE PH 5.75
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分辨率 2.21 Å
R-free 0.227
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4QVE
Crystal structure of Bcl-xL in complex with BID BH3 domain
提交 2014-07-14
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 B
76–109(34 aa)
片段:BID BH3, UNP RESIDUES 76-109
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未记录
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IMD IMIDAZOLE × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 10.5;291 K;2.0M Ammonium Sulphate, 0.2M Lithium Sulphate, 0.1M CAPS pH 10.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
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分辨率 2.05 Å
R-free 0.224
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4ZEQ
Crystal Structure of human BFL-1 in complex with tBid BH3 peptide, Northeast Structural Genomics Consortium Target HX9247
提交 2015-04-20
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 B
125–150(26 aa)
片段:UNP Residues 125-150
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未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.4;295 K;Sodium Malonate
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分辨率 1.80 Å
R-free 0.239
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4ZIG
Crystal Structure of core/latch dimer of Bax in complex with BidBH3mini
提交 2015-04-28
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构建体不同
突变/修饰不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
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链 B
125–144(20 aa)
片段:BH3 motif
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非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;277 K;Tri-sodium citrate, Sodium cacodylate
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分辨率 2.20 Å
R-free 0.229
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4ZII
Crystal Structure of core/latch dimer of BaxI66A in complex with BidBH3
提交 2015-04-28
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构建体不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
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链 C
122–155(34 aa)
片段:BH3 motif
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未记录
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EDO 1,2-ETHANEDIOL × 10
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;277 K;Tri-sodium citrate, sodium cacodylate
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分辨率 2.19 Å
R-free 0.223
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7M5A
Crystal Structure of human BAK in complex with W3W5_BID
提交 2021-03-23
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 B
80–100(21 aa)
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未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION;293 K;0.2 M Potassium Sodium tartrate, 20% PEG 3350
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分辨率 1.50 Å
R-free 0.219
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7M5B
Crystal Structure of human BAK in complex with M3W5_BID
提交 2021-03-23
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 B
80–100(21 aa)
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未记录
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CU COPPER (II) ION × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION;pH 6.5;293 K;15% PEG 4000 0.2 M NaCl 0.1 MES 6.5
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分辨率 1.85 Å
R-free 0.205
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7M5B
Crystal Structure of human BAK in complex with M3W5_BID
提交 2021-03-23
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 D
80–100(21 aa)
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未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION;pH 6.5;293 K;15% PEG 4000 0.2 M NaCl 0.1 MES 6.5
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分辨率 1.85 Å
R-free 0.205
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7P33
Epstein-Barr virus encoded Bcl-2 homolog BHRF-1 in complex with Bid BH3 peptide
提交 2021-07-07
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 G
76–109(34 aa)
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未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.4M Ammonium phosphate mono basic
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分辨率 2.79 Å
R-free 0.274
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7P33
Epstein-Barr virus encoded Bcl-2 homolog BHRF-1 in complex with Bid BH3 peptide
提交 2021-07-07
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 F
76–109(34 aa)
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未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.4M Ammonium phosphate mono basic
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分辨率 2.79 Å
R-free 0.274
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7P33
Epstein-Barr virus encoded Bcl-2 homolog BHRF-1 in complex with Bid BH3 peptide
提交 2021-07-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 3
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 H
76–109(34 aa)
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未记录
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EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.4M Ammonium phosphate mono basic
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分辨率 2.79 Å
R-free 0.274
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7P33
Epstein-Barr virus encoded Bcl-2 homolog BHRF-1 in complex with Bid BH3 peptide
提交 2021-07-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 4
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 I
76–109(34 aa)
|
未记录
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PO4 PHOSPHATE ION × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.4M Ammonium phosphate mono basic
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分辨率 2.79 Å
R-free 0.274
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7P33
Epstein-Barr virus encoded Bcl-2 homolog BHRF-1 in complex with Bid BH3 peptide
提交 2021-07-07
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 5
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 J
76–109(34 aa)
|
未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.4M Ammonium phosphate mono basic
|
分辨率 2.79 Å
R-free 0.274
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7QTW
Kaposi sarcoma associated herpes virus(KSHV) encoded apoptosis inhibitor, KsBcl-2 in complex with Bid BH3
提交 2022-01-17
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
76–109(34 aa)
|
未记录
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EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 4.6;293 K;0.1 M Sodium acetate pH 4.6
8% PEG 4000
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分辨率 1.41 Å
R-free 0.215
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