5anc

Mechanism of eIF6 release from the nascent 60S ribosomal subunit

Method: ELECTRON MICROSCOPY
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

60S RIBOSOMAL PROTEIN L3

物种未注明

UniProt P34113

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 10 RNA 1 60S RIBOSOMAL PROTEIN L9 × 1 (Q54XI5) 60S ACIDIC RIBOSOMAL PROTEIN P0 × 1 (P22685) 60S RIBOSOMAL PROTEIN L12 × 1 (Q54J50) 60S RIBOSOMAL PROTEIN L23 × 1 (Q54G86) 60S RIBOSOMAL PROTEIN L10 × 1 (Q54J69) 60S RIBOSOMAL PROTEIN L24 × 1 (Q54VN6) UBIQUITIN-60S RIBOSOMAL PROTEIN L40 × 1 (P14794) RIBOSOME MATURATION PROTEIN SBDS × 1 (Q9Y3A5) ELONGATION FACTOR TU GTP-BINDING DOMAIN-CONTAINING PROTEIN 1 × 1 (Q7Z2Z2) 26S RIBOSOMAL RNA × 1 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RL3_DICDI
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–398; UniProt 1–398

60S RIBOSOMAL PROTEIN L9

物种未注明

UniProt Q54XI5

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 10 RNA 1 60S RIBOSOMAL PROTEIN L3 × 1 (P34113) 60S ACIDIC RIBOSOMAL PROTEIN P0 × 1 (P22685) 60S RIBOSOMAL PROTEIN L12 × 1 (Q54J50) 60S RIBOSOMAL PROTEIN L23 × 1 (Q54G86) 60S RIBOSOMAL PROTEIN L10 × 1 (Q54J69) 60S RIBOSOMAL PROTEIN L24 × 1 (Q54VN6) UBIQUITIN-60S RIBOSOMAL PROTEIN L40 × 1 (P14794) RIBOSOME MATURATION PROTEIN SBDS × 1 (Q9Y3A5) ELONGATION FACTOR TU GTP-BINDING DOMAIN-CONTAINING PROTEIN 1 × 1 (Q7Z2Z2) 26S RIBOSOMAL RNA × 1 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RL9_DICDI
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 1–188; UniProt 1–188

60S ACIDIC RIBOSOMAL PROTEIN P0

物种未注明

UniProt P22685

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 10 RNA 1 60S RIBOSOMAL PROTEIN L3 × 1 (P34113) 60S RIBOSOMAL PROTEIN L9 × 1 (Q54XI5) 60S RIBOSOMAL PROTEIN L12 × 1 (Q54J50) 60S RIBOSOMAL PROTEIN L23 × 1 (Q54G86) 60S RIBOSOMAL PROTEIN L10 × 1 (Q54J69) 60S RIBOSOMAL PROTEIN L24 × 1 (Q54VN6) UBIQUITIN-60S RIBOSOMAL PROTEIN L40 × 1 (P14794) RIBOSOME MATURATION PROTEIN SBDS × 1 (Q9Y3A5) ELONGATION FACTOR TU GTP-BINDING DOMAIN-CONTAINING PROTEIN 1 × 1 (Q7Z2Z2) 26S RIBOSOMAL RNA × 1 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RLA0_DICDI
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 C; PDB构建体 1–205; UniProt 1–205

60S RIBOSOMAL PROTEIN L12

物种未注明

UniProt Q54J50

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 10 RNA 1 60S RIBOSOMAL PROTEIN L3 × 1 (P34113) 60S RIBOSOMAL PROTEIN L9 × 1 (Q54XI5) 60S ACIDIC RIBOSOMAL PROTEIN P0 × 1 (P22685) 60S RIBOSOMAL PROTEIN L23 × 1 (Q54G86) 60S RIBOSOMAL PROTEIN L10 × 1 (Q54J69) 60S RIBOSOMAL PROTEIN L24 × 1 (Q54VN6) UBIQUITIN-60S RIBOSOMAL PROTEIN L40 × 1 (P14794) RIBOSOME MATURATION PROTEIN SBDS × 1 (Q9Y3A5) ELONGATION FACTOR TU GTP-BINDING DOMAIN-CONTAINING PROTEIN 1 × 1 (Q7Z2Z2) 26S RIBOSOMAL RNA × 1 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RL12_DICDI
Isoform —
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 D; PDB构建体 1–166; UniProt 1–166

60S RIBOSOMAL PROTEIN L23

物种未注明

UniProt Q54G86

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 10 RNA 1 60S RIBOSOMAL PROTEIN L3 × 1 (P34113) 60S RIBOSOMAL PROTEIN L9 × 1 (Q54XI5) 60S ACIDIC RIBOSOMAL PROTEIN P0 × 1 (P22685) 60S RIBOSOMAL PROTEIN L12 × 1 (Q54J50) 60S RIBOSOMAL PROTEIN L10 × 1 (Q54J69) 60S RIBOSOMAL PROTEIN L24 × 1 (Q54VN6) UBIQUITIN-60S RIBOSOMAL PROTEIN L40 × 1 (P14794) RIBOSOME MATURATION PROTEIN SBDS × 1 (Q9Y3A5) ELONGATION FACTOR TU GTP-BINDING DOMAIN-CONTAINING PROTEIN 1 × 1 (Q7Z2Z2) 26S RIBOSOMAL RNA × 1 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 RL23_DICDI
Isoform —
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 E; PDB构建体 1–136; UniProt 1–136

60S RIBOSOMAL PROTEIN L10

物种未注明

UniProt Q54J69

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 10 RNA 1 60S RIBOSOMAL PROTEIN L3 × 1 (P34113) 60S RIBOSOMAL PROTEIN L9 × 1 (Q54XI5) 60S ACIDIC RIBOSOMAL PROTEIN P0 × 1 (P22685) 60S RIBOSOMAL PROTEIN L12 × 1 (Q54J50) 60S RIBOSOMAL PROTEIN L23 × 1 (Q54G86) 60S RIBOSOMAL PROTEIN L24 × 1 (Q54VN6) UBIQUITIN-60S RIBOSOMAL PROTEIN L40 × 1 (P14794) RIBOSOME MATURATION PROTEIN SBDS × 1 (Q9Y3A5) ELONGATION FACTOR TU GTP-BINDING DOMAIN-CONTAINING PROTEIN 1 × 1 (Q7Z2Z2) 26S RIBOSOMAL RNA × 1 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RL10_DICDI
Isoform —
PDB实体 6
链与序列区间 作者链 F; PDB构建体 1–217; UniProt 1–217

60S RIBOSOMAL PROTEIN L24

物种未注明

UniProt Q54VN6

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 10 RNA 1 60S RIBOSOMAL PROTEIN L3 × 1 (P34113) 60S RIBOSOMAL PROTEIN L9 × 1 (Q54XI5) 60S ACIDIC RIBOSOMAL PROTEIN P0 × 1 (P22685) 60S RIBOSOMAL PROTEIN L12 × 1 (Q54J50) 60S RIBOSOMAL PROTEIN L23 × 1 (Q54G86) 60S RIBOSOMAL PROTEIN L10 × 1 (Q54J69) UBIQUITIN-60S RIBOSOMAL PROTEIN L40 × 1 (P14794) RIBOSOME MATURATION PROTEIN SBDS × 1 (Q9Y3A5) ELONGATION FACTOR TU GTP-BINDING DOMAIN-CONTAINING PROTEIN 1 × 1 (Q7Z2Z2) 26S RIBOSOMAL RNA × 1 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RL24_DICDI
Isoform —
PDB实体 7
链与序列区间 作者链 G; PDB构建体 1–69; UniProt 1–69

UBIQUITIN-60S RIBOSOMAL PROTEIN L40

物种未注明

UniProt P14794

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 10 RNA 1 60S RIBOSOMAL PROTEIN L3 × 1 (P34113) 60S RIBOSOMAL PROTEIN L9 × 1 (Q54XI5) 60S ACIDIC RIBOSOMAL PROTEIN P0 × 1 (P22685) 60S RIBOSOMAL PROTEIN L12 × 1 (Q54J50) 60S RIBOSOMAL PROTEIN L23 × 1 (Q54G86) 60S RIBOSOMAL PROTEIN L10 × 1 (Q54J69) 60S RIBOSOMAL PROTEIN L24 × 1 (Q54VN6) RIBOSOME MATURATION PROTEIN SBDS × 1 (Q9Y3A5) ELONGATION FACTOR TU GTP-BINDING DOMAIN-CONTAINING PROTEIN 1 × 1 (Q7Z2Z2) 26S RIBOSOMAL RNA × 1 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RL40_DICDI
Isoform —
PDB实体 8
链与序列区间 作者链 H; PDB构建体 1–52; UniProt 77–128

RIBOSOME MATURATION PROTEIN SBDS

HOMO SAPIENS

UniProt Q9Y3A5

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 10 RNA 1 60S RIBOSOMAL PROTEIN L3 × 1 (P34113) 60S RIBOSOMAL PROTEIN L9 × 1 (Q54XI5) 60S ACIDIC RIBOSOMAL PROTEIN P0 × 1 (P22685) 60S RIBOSOMAL PROTEIN L12 × 1 (Q54J50) 60S RIBOSOMAL PROTEIN L23 × 1 (Q54G86) 60S RIBOSOMAL PROTEIN L10 × 1 (Q54J69) 60S RIBOSOMAL PROTEIN L24 × 1 (Q54VN6) UBIQUITIN-60S RIBOSOMAL PROTEIN L40 × 1 (P14794) ELONGATION FACTOR TU GTP-BINDING DOMAIN-CONTAINING PROTEIN 1 × 1 (Q7Z2Z2) 26S RIBOSOMAL RNA × 1 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 SBDS_HUMAN
Isoform —
PDB实体 9
链与序列区间 作者链 J; PDB构建体 1–250; UniProt 1–250

ELONGATION FACTOR TU GTP-BINDING DOMAIN-CONTAINING PROTEIN 1

HOMO SAPIENS

UniProt Q7Z2Z2

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 10 RNA 1 60S RIBOSOMAL PROTEIN L3 × 1 (P34113) 60S RIBOSOMAL PROTEIN L9 × 1 (Q54XI5) 60S ACIDIC RIBOSOMAL PROTEIN P0 × 1 (P22685) 60S RIBOSOMAL PROTEIN L12 × 1 (Q54J50) 60S RIBOSOMAL PROTEIN L23 × 1 (Q54G86) 60S RIBOSOMAL PROTEIN L10 × 1 (Q54J69) 60S RIBOSOMAL PROTEIN L24 × 1 (Q54VN6) UBIQUITIN-60S RIBOSOMAL PROTEIN L40 × 1 (P14794) RIBOSOME MATURATION PROTEIN SBDS × 1 (Q9Y3A5) 26S RIBOSOMAL RNA × 1 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ETUD1_HUMAN
Isoform —
PDB实体 10
链与序列区间 作者链 K; PDB构建体 1–1120; UniProt 1–1120

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id5anc
沉积日期 deposition_date2015-09-06
结构标题 titleMechanism of eIF6 release from the nascent 60S ribosomal subunit
关键词 keywordsTRANSLATION, RIBOSOMOPATHY, EFL1, GTPASE, RIBOSOME BIOGENESIS; TRANSLATION
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

5anc__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

5anc__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 109 1010 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

5anc__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)60.45 Å
Rg(电子密度)60.66 Å
总 Rg60.75 Å
原子数46807
残基数3963
排除体积746100 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 5anc__assembly_1__model_1 undecameric (11) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (11)

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7. 引用文献 (1)