SAXSdb — 5b5w

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

MOB kinase activator 1B

Mus musculus

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Serine/threonine-protein kinase LATS1 × 1 （O95835） ZINC ION × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	MOB1B_MOUSE
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 3–186； UniProt 33–216

Serine/threonine-protein kinase LATS1

Homo sapiens

UniProt O95835

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	MOB kinase activator 1B × 1 （Q8BPB0） ZINC ION × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	LATS1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 U； PDB构建体 3–85； UniProt 622–704

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	5b5w
沉积日期 deposition_date	2016-05-24
结构标题 title	Crystal structure of MOB1-LATS1 NTR domain complex
关键词 keywords	MOB1 LATS1 Hippo pathway, METAL BINDING PROTEIN-APOTOSIS complex; METAL BINDING PROTEIN/APOTOSIS
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

5b5w__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

5b5w__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

5b5w__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	21.14 Å
Rg（电子密度）	20.09 Å
总 Rg	21.21 Å
原子数	1966
残基数	236
排除体积	35180 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`5b5w__assembly_1__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	MOB kinase activator 1B
分子量 formula_weight	21592.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	1966

GPEATLGSGNLRMAVMLPEGEDLNEWVAVNTVDFFNQINMLYGTITDFCTEESCPVMSAGPKYEYHWADGTNIKKPIKCSAPKYIDYLMTWVQDQLDDETLFPSKIGVPFPKNFMSVAKTILKRLFRVYAHIYHQHFDPVIQLQEEAHLNTSFKHFIFFVQEFNLIDRRELAPLQELIEKLTSKDR

来源 Source

来源生物 organism	Mus musculus
通用名 common_name	Mouse
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10090
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Serine/threonine-protein kinase LATS1
分子量 formula_weight	10379.0 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.11.1
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	U

GPKDEERRESRIQSYSPQAFKFFMEQHVENVLKSHQQRLHRKKQLENEMMRVGLSQDAQDQMRKMLCQKESNYIRLKRAKMDKSM

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_id	d5b5wa_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.29 — Bromodomain-like
超家族 Superfamily superfamily	a.29.7 — Mob1/phocein
家族 Family family	a.29.7.1 — Mob1/phocein

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id	5b5wA00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	140 — Butyryl-CoA Dehydrogenase, subunit A; domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	30 — MOB kinase activator

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晶胞边长 a length_a	78.747 Å
晶胞边长 b length_b	71.760 Å
晶胞边长 c length_c	57.855 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	101.99 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	C 1 2 1
空间群编号 int_tables_number	5
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.957 Å
最低分辨率 resolution_low	28.296 Å
R 因子 r_factor	0.2357
R_work r_work	0.2336
R_free r_free	0.2704

Crystal structure of MOB1-LATS1 NTR domain complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

MOB kinase activator 1B

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Serine/threonine-protein kinase LATS1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

5b5w__assembly_1__model_1

5b5w__assembly_1__model_1 | I(q)

5b5w__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

CATH v4.4 (1 domains)

7. 引用文献 (1)

Crystal structure of MOB1-LATS1 NTR domain complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

MOB kinase activator 1B

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Serine/threonine-protein kinase LATS1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

5b5w__assembly_1__model_1

5b5w__assembly_1__model_1 | I(q)

5b5w__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

CATH v4.4 (1 domains)

7. 引用文献 (1)