SAXSdb — 5b6b

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

MOB kinase activator 1B

Mus musculus

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	Serine/threonine-protein kinase LATS1 × 2 （Q8BYR2） CHLORIDE ION × 2 ZINC ION × 2	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	Serine/threonine-protein kinase LATS1 × 2 （Q8BYR2） CHLORIDE ION × 2 ZINC ION × 2	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	Serine/threonine-protein kinase LATS1 × 2 （Q8BYR2） CHLORIDE ION × 2 ZINC ION × 2	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	Serine/threonine-protein kinase LATS1 × 2 （Q8BYR2） CHLORIDE ION × 1 ZINC ION × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	MOB1B_MOUSE
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 3–218； UniProt 1–216 作者链 B； PDB构建体 3–218； UniProt 1–216 作者链 D； PDB构建体 3–218； UniProt 1–216 作者链 F； PDB构建体 3–218； UniProt 1–216 作者链 H； PDB构建体 3–218； UniProt 1–216 作者链 K； PDB构建体 3–218； UniProt 1–216 作者链 M； PDB构建体 3–218； UniProt 1–216 作者链 O； PDB构建体 3–218； UniProt 1–216

Serine/threonine-protein kinase LATS1

Mus musculus

UniProt Q8BYR2

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	MOB kinase activator 1B × 2 （Q8BPB0） CHLORIDE ION × 2 ZINC ION × 2	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	MOB kinase activator 1B × 2 （Q8BPB0） CHLORIDE ION × 2 ZINC ION × 2	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	MOB kinase activator 1B × 2 （Q8BPB0） CHLORIDE ION × 2 ZINC ION × 2	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	MOB kinase activator 1B × 2 （Q8BPB0） CHLORIDE ION × 1 ZINC ION × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	LATS1_MOUSE
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 3–85； UniProt 621–703 作者链 E； PDB构建体 3–85； UniProt 621–703 作者链 G； PDB构建体 3–85； UniProt 621–703 作者链 I； PDB构建体 3–85； UniProt 621–703 作者链 J； PDB构建体 3–85； UniProt 621–703 作者链 L； PDB构建体 3–85； UniProt 621–703 作者链 N； PDB构建体 3–85； UniProt 621–703 作者链 P； PDB构建体 3–85； UniProt 621–703

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	5b6b
沉积日期 deposition_date	2016-05-26
结构标题 title	Complex of LATS1 and phosphomimetic MOB1b
关键词 keywords	MOB1 LATS1 Hippo pathway, METAL BINDING PROTEIN-SIGNALING PROTEIN complex; METAL BINDING PROTEIN/SIGNALING PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

5b6b__assembly_2__model_1

Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

5b6b__assembly_2__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

5b6b__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	28.40 Å
Rg（电子密度）	27.82 Å
总 Rg	28.49 Å
原子数	4167
残基数	500
排除体积	74443 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`5b6b__assembly_1__model_1`	tetrameric （4）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`5b6b__assembly_2__model_1`	tetrameric （4）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
3	1	`5b6b__assembly_3__model_1`	tetrameric （4）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
4	1	`5b6b__assembly_4__model_1`	tetrameric （4）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	MOB kinase activator 1B
分子量 formula_weight	25305.0 kDa
突变 mutation	T35D, T22D
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	8

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,D,F,H,K,M,O
原子数 atom_count	16626

GPMSFLFGSRSSKDFKPKKNIPEGSHQYELLKHAEADLGSGNLRMAVMLPEGEDLNEWVAVNTVDFFNQINMLYGTITDFCTEESCPVMSAGPKYEYHWADGTNIKKPIKCSAPKYIDYLMTWVQDQLDDETLFPSKIGVPFPKNFMSVAKTILKRLFRVYAHIYHQHFDPVIQLQEEAHLNTSFKHFIFFVQEFNLIDRRELAPLQELIEKLTSKDR

来源 Source

来源生物 organism	Mus musculus
通用名 common_name	Mouse
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10090
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Serine/threonine-protein kinase LATS1
分子量 formula_weight	10379.0 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.11.1
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	8

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	J,C,E,G,I,L,N,P

GPKDEERRESRIQSYSPQAFKFFMEQHVENVLKSHQQRLHRKKQLENEMMRVGLSQDAQDQMRKMLCQKESNYIRLKRAKMDKSM

来源 Source

来源生物 organism	Mus musculus
通用名 common_name	Mouse
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10090
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	CHLORIDE ION
分子量 formula_weight	35.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	7

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	8

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

CATH v4.4 (8 domains)

结构域编号 domain_id	5b6bA00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	140 — Butyryl-CoA Dehydrogenase, subunit A; domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	30 — MOB kinase activator

结构域编号 domain_id	5b6bB00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	140 — Butyryl-CoA Dehydrogenase, subunit A; domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	30 — MOB kinase activator

结构域编号 domain_id	5b6bD00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	140 — Butyryl-CoA Dehydrogenase, subunit A; domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	30 — MOB kinase activator

结构域编号 domain_id	5b6bF00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	140 — Butyryl-CoA Dehydrogenase, subunit A; domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	30 — MOB kinase activator

结构域编号 domain_id	5b6bH00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	140 — Butyryl-CoA Dehydrogenase, subunit A; domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	30 — MOB kinase activator

结构域编号 domain_id	5b6bK00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	140 — Butyryl-CoA Dehydrogenase, subunit A; domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	30 — MOB kinase activator

结构域编号 domain_id	5b6bM00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	140 — Butyryl-CoA Dehydrogenase, subunit A; domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	30 — MOB kinase activator

结构域编号 domain_id	5b6bO00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	140 — Butyryl-CoA Dehydrogenase, subunit A; domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	30 — MOB kinase activator

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晶胞边长 a length_a	168.646 Å
晶胞边长 b length_b	301.437 Å
晶胞边长 c length_c	127.379 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	64

空间群 space_group	C 2 2 21
空间群编号 int_tables_number	20
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.536 Å
最低分辨率 resolution_low	48.644 Å
R 因子 r_factor	0.2245
R_work r_work	0.2223
R_free r_free	0.2656

Complex of LATS1 and phosphomimetic MOB1b

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

MOB kinase activator 1B

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Serine/threonine-protein kinase LATS1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

5b6b__assembly_2__model_1

5b6b__assembly_2__model_1 | I(q)

5b6b__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

CATH v4.4 (8 domains)

7. 引用文献 (1)

Complex of LATS1 and phosphomimetic MOB1b

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

MOB kinase activator 1B

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Serine/threonine-protein kinase LATS1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

5b6b__assembly_2__model_1

5b6b__assembly_2__model_1 | I(q)

5b6b__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

CATH v4.4 (8 domains)

7. 引用文献 (1)