SAXSdb — 5but

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Ktr system potassium uptake protein A,Ktr system potassium uptake protein A

Bacillus subtilis

UniProt O32080

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 6	Ktr system potassium uptake protein B × 2 （O32081） POTASSIUM ION × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	KTRA_BACSU
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–144； UniProt 1–144 作者链 A； PDB构建体 149–282； UniProt 7–140 作者链 C； PDB构建体 1–144； UniProt 1–144 作者链 C； PDB构建体 149–282； UniProt 7–140 作者链 E； PDB构建体 1–144； UniProt 1–144 作者链 E； PDB构建体 149–282； UniProt 7–140 作者链 G； PDB构建体 1–144； UniProt 1–144 作者链 G； PDB构建体 149–282； UniProt 7–140

Ktr system potassium uptake protein B

Bacillus subtilis

UniProt O32081

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 6	Ktr system potassium uptake protein A,Ktr system potassium uptake protein A × 4 （O32080） POTASSIUM ION × 2	与蛋白数一致
2	蛋白同源多聚体	同源多聚体	蛋白 2	POTASSIUM ION × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	KTRB_BACSU
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 I； PDB构建体 1–445； UniProt 1–445 作者链 J； PDB构建体 1–445； UniProt 1–445 作者链 K； PDB构建体 1–445； UniProt 1–445 作者链 L； PDB构建体 1–445； UniProt 1–445

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	5but
沉积日期 deposition_date	2015-06-04
结构标题 title	Crystal structure of inactive conformation of KtrAB K+ transporter
关键词 keywords	membrane protein complex, membrane protein; MEMBRANE PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

▼

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

5but__assembly_2__model_1

Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

5but__assembly_2__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

5but__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	29.91 Å
Rg（电子密度）	29.27 Å
总 Rg	30.11 Å
原子数	6546
残基数	862
排除体积	121040 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`5but__assembly_1__model_1`	Hexameric （6）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`5but__assembly_2__model_1`	Dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

▶

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

▶

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Ktr system potassium uptake protein A,Ktr system potassium uptake protein A
分子量 formula_weight	32038.7 kDa
突变 mutation	truncation of C-terminal domain,truncation of C-terminal domain
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,C,E,G
原子数 atom_count	21476

MGRIKNKQFAVIGLGRFGGSIVKELHRMGHEVLAVDINEEKVNAYASYATHAVIANATEENELLSLGIRNFEYVIVAIGANIQASTLTTLLLKELDIPNIWVKAQNYYHHKVLEKIGADRIIHPEKDMGVKIAQSLSDENVLNYLEGSKQFAVIGLGRFGGSIVKELHRMGHEVLAVDINEEKVNAYASYATHAVIANATEENELLSLGIRNFEYVIVAIGANIQASTLTTLLLKELDIPNIWVKAQNYYHHKVLEKIGADRIIHPEKDMGVKIAQSLSDENLELVPR

来源 Source

来源生物 organism	Bacillus subtilis
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	1423
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Ktr system potassium uptake protein B
分子量 formula_weight	48158.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I,J,K,L

MTLQKDKVIKWVRFTPPQVLAIGFFLTIIIGAVLLMLPISTTKPLSWIDALFTAASATTVTGLAVVDTGTQFTVFGQTVIMGLIQIGGLGFMTFAVLIVMILAAAIGLKERMLVQEALNQPTIGGVIGLVKVLFLFSISIELIAALILSIRLVPQYGWSSGLFASLFHAISAFNNAGFSLWPDNLMSYVGDPTVNLVITFLFITGGIGFTVLFDVMKQRRFKTFSLHTALMLTGTLMLNAIAMLTVFILEYSNPGTLGHLAAVDKLWASYFQAVTPRTAGFNSLDFGSMREGTIVFTLLLMFIGAGSASTASGIKLTTFIVILTSVIAYLRGKKETVIFRRSIKYPIIIKALAVSVTSLFIVFLGIFALTITEQAPFLQIVFETFSAFGTVGLTMGLTPELTTAGKCIIIVIMFIGRIGPLTFVFSFAATEQSNIRYPDGEVFTG

来源 Source

来源生物 organism	Bacillus subtilis
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	1423
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	POTASSIUM ION
分子量 formula_weight	39.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

▶

晶胞边长 a length_a	307.060 Å
晶胞边长 b length_b	79.410 Å
晶胞边长 c length_c	205.650 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	98.10 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	16

空间群 space_group	C 1 2 1
空间群编号 int_tables_number	5
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	5.970 Å
最低分辨率 resolution_low	200.000 Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	0.3250
R_free r_free	0.3390

Crystal structure of inactive conformation of KtrAB K+ transporter

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Ktr system potassium uptake protein A,Ktr system potassium uptake protein A

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Ktr system potassium uptake protein B

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

5but__assembly_2__model_1

5but__assembly_2__model_1 | I(q)

5but__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

7. 引用文献 (1)

Crystal structure of inactive conformation of KtrAB K+ transporter

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Ktr system potassium uptake protein A,Ktr system potassium uptake protein A

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Ktr system potassium uptake protein B

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

5but__assembly_2__model_1

5but__assembly_2__model_1 | I(q)

5but__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

7. 引用文献 (1)