SAXSdb — 5byw

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Endoglucanase H

Clostridium thermocellum (strain ATCC 27405 / DSM 1237 / NBRC 103400 / NCIMB 10682 / NRRL B-4536 / VPI 7372)

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 290–654	片段：UNP residues 290-654	无其他共同聚合物	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；298 K；50mM sodium acetate, 8% PEG 4000	分辨率 2.60 Å R-free 0.260
2	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 290–654	片段：UNP residues 290-654	无其他共同聚合物	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；298 K；50mM sodium acetate, 8% PEG 4000	分辨率 2.60 Å R-free 0.260
3	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 290–654	片段：UNP residues 290-654	无其他共同聚合物	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；298 K；50mM sodium acetate, 8% PEG 4000	分辨率 2.60 Å R-free 0.260
4	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 D； UniProt 290–654	片段：UNP residues 290-654	无其他共同聚合物	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；298 K；50mM sodium acetate, 8% PEG 4000	分辨率 2.60 Å R-free 0.260
5	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 E； UniProt 290–654	片段：UNP residues 290-654	无其他共同聚合物	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；298 K；50mM sodium acetate, 8% PEG 4000	分辨率 2.60 Å R-free 0.260

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 5BYW	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1V0A Family 11 Carbohydrate-Binding Module of cellulosomal cellulase Lic26A-Cel5E of Clostridium thermocellum 提交 2004-03-25	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 655–821（167 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CA CALCIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6；pH 6.00	分辨率 1.98 Å R-free 0.232
2BV9 HOW FAMILY 26 GLYCOSIDE HYDROLASES ORCHESTRATE CATALYSIS ON DIFFERENT POLYSACCHARIDES. STRUCTURE AND ACTIVITY OF A CLOSTRIDIUM THERMOCELLUM LICHENASE, CtLIC26A 提交 2005-06-23	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 26–304（279 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 26-304	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 0.3-1.2M NA FORMATE, 0.1M NA CACODYLATE BUFFERED AT PH 6.5 AND 5-20% PEG 4K	分辨率 1.50 Å R-free 0.157
2BVD HOW FAMILY 26 GLYCOSIDE HYDROLASES ORCHESTRATE CATALYSIS ON DIFFERENT POLYSACCHARIDES. STRUCTURE AND ACTIVITY OF A CLOSTRIDIUM THERMOCELLUM LICHENASE, CtLIC26A 提交 2005-06-27	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 26–304（279 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 26-304	未记录	ISX (3R,4R,5R)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)piperidin-3-yl beta-D-glucopyranoside × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；PROTEIN WAS CO-CRYSTALLIZED WITH THE LIGAND FROM 0.15 M AMMONIUM SULPHATE, 30% PEG 5K MME BUFFERED TO PH 6.5 WITH MES	分辨率 1.60 Å R-free 0.186
2CIP Structure of the Michaelis complex of a family 26 lichenase 提交 2006-03-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 26–304（279 aa）片段：RESIDUES 26-304	突变：YES	ZZ1 4-METHYL-2H-CHROMEN-2-ONE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；0.15 M AMMONIUM SULPHATE, 30 % PEG 5K MME BUFFERED TO PH6.5 WITH 0.1 M MES, pH 6.50	分辨率 1.40 Å R-free 0.179
2CIT Structure of the covalent intermediate of a family 26 lichenase 提交 2006-03-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 26–304（279 aa）片段：RESIDUES 26-304	突变：YES	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；0.15 M AMMONIUM SULPHATE, 30 % PEG 5K MME BUFFERED TO PH 6.5 WITH 0.1 M MES	分辨率 1.40 Å R-free 0.179
2LRO Solution structure, dynamics and binding studies of CtCBM11 提交 2012-04-11	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 655–821（167 aa）片段：CBM11 domain residues 655-821	未记录	CA CALCIUM ION × 2	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.75；压力 ambient NMR样品组成 1 mM [U-13C; U-15N] protein_1, 0.75 mM potassium phosphate, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
2LRP Solution structure, dynamics and binding studies of CtCBM11 提交 2012-04-11	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 655–821（167 aa）片段：CBM11 domain residues 655-821	未记录	CA CALCIUM ION × 2	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.5；323 K；离子强度（mmCIF原始值）0.75；压力 ambient NMR样品组成 1 mM [U-13C; U-15N] protein_1, 0.75 mM potassium phosphate, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
2V3G Structure of a family 26 lichenase in complex with noeuromycin 提交 2007-06-18	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 26–305（280 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 26-305	未记录	BGC beta-D-glucopyranose × 1 NOY (2R,3S,4R,5R)-5-(HYDROXYMETHYL)PIPERIDINE-2,3,4-TRIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；CO-CRYSTALLIZED WITH THE LIGAND FROM 0.15 M AMMONIUM SULPHATE, 30% PEG 5K MME BUFFERED TO PH 6.5 WITH MES AND SEEDED	分辨率 1.20 Å R-free 0.144
2VI0 Lichenase CtLic26 in complex with a thio-oligosaccharide 提交 2007-11-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 26–304（279 aa）片段：RESIDUES 26-304	突变：G271E	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；0.15 M AMMONIUM SULPHATE, 30 % PEG 5K, MME, 0.1 M MES PH 6.5	分辨率 1.51 Å R-free 0.189
4U3A Crystal structure of CtCel5E 提交 2014-07-19	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 290–654（365 aa）片段：UNP residues 290-654	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；298 K；0.1 M sodium acetate and 21% (W/V) PEG 4000	分辨率 2.42 Å R-free 0.248
4U3A Crystal structure of CtCel5E 提交 2014-07-19	实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 290–654（365 aa）片段：UNP residues 290-654	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；298 K；0.1 M sodium acetate and 21% (W/V) PEG 4000	分辨率 2.42 Å R-free 0.248
4U5I Complex structure of mutant CtCel5E (E314A) with xylobiose 提交 2014-07-25	突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 290–654（365 aa）片段：UNP residues 290-654	突变：E314A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；298 K；0.2 M ammonium acetate, 0.1 M sodium acetate and 21% (W/V) PEG 4000	分辨率 2.50 Å R-free 0.252
4U5I Complex structure of mutant CtCel5E (E314A) with xylobiose 提交 2014-07-25	突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 290–654（365 aa）片段：UNP residues 290-654	突变：E314A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；298 K；0.2 M ammonium acetate, 0.1 M sodium acetate and 21% (W/V) PEG 4000	分辨率 2.50 Å R-free 0.252
4U5K Complex structure of mutant CtCel5E (E314A) with cellobiose 提交 2014-07-25	突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 290–654（365 aa）片段：UNP residues 290-654	突变：E314A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；298 K；0.2M ammonium acetate, 0.1M sodium acetate, 21% (W/V) PEG 4000	分辨率 2.65 Å R-free 0.255
4U5K Complex structure of mutant CtCel5E (E314A) with cellobiose 提交 2014-07-25	突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 290–654（365 aa）片段：UNP residues 290-654	突变：E314A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；298 K；0.2M ammonium acetate, 0.1M sodium acetate, 21% (W/V) PEG 4000	分辨率 2.65 Å R-free 0.255
6R31 Family 11 Carbohydrate-Binding Module from Clostridium thermocellum in complex with beta-1,3-1,4-mixed-linked tetrasaccharide 提交 2019-03-19	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 655–821（167 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293.15 K；20-28% (m/v) polyethyleneglycol (PEG) 3350, 0.2 M potassium phosphate, 0.1 M sodium acetate buffer pH 4.6	分辨率 2.60 Å R-free 0.254
6R3M Family 11 Carbohydrate-Binding Module from Clostridium thermocellum in complex with beta-1,3-1,4-mixed-linked tetrasaccharide 提交 2019-03-20	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 655–821（167 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 2 ACT ACETATE ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 4 GLC alpha-D-glucopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293.15 K；20-28% (m/v) polyethyleneglycol (PEG) 3350, 0.2 M potassium phosphate, 0.1 M sodium acetate buffer pH 4.6	分辨率 1.45 Å R-free 0.208
6ZPL Inward-open structure of human glycine transporter 1 in complex with a benzoylisoindoline inhibitor, sybody Sb_GlyT1#7 and bound Na and Cl ions. 提交 2020-07-08	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 C 31–303（273 aa）	未记录	QET [5-fluoranyl-6-(oxan-4-yloxy)-1,3-dihydroisoindol-2-yl]-[5-methylsulfonyl-2-[2,2,3,3,3-pentakis(fluoranyl)propoxy]phenyl]methanone × 2 NA SODIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 7；292.75 K；Crystals appeared in 3-10 days in 0.1 M ADA pH 7, 13-25% PEG600, 4-14% v/v, 1,3-Butanediol with the longest dimension of 2-5 um.	分辨率 3.94 Å R-free 0.291
8XVI Cryo-EM structure of ETAR bound with Endothelin1 提交 2024-01-15	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 R 26–304（279 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.32 Å
8XVJ Cryo-EM structure of ETAR bound with Macitentan 提交 2024-01-15	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 R 26–304（279 aa）	未记录	A1D5I Macitentan × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.26 Å
8XVK Cryo-EM structure of ETAR bound with Ambrisentan 提交 2024-01-15	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 R 26–304（279 aa）	未记录	A1D5J Ambrisentan × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.21 Å
8XVL Cryo-EM structure of ETAR bound with Zibotentan 提交 2024-01-15	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 R 26–304（279 aa）	未记录	A1D5L Zibotentan × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.22 Å

共 19 个其他 PDB 条目、22 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	GUNH_CLOTH
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 39–414； UniProt 290–654 作者链 B； PDB构建体 39–414； UniProt 290–654 作者链 C； PDB构建体 39–414； UniProt 290–654 作者链 D； PDB构建体 39–414； UniProt 290–654 作者链 E； PDB构建体 39–414； UniProt 290–654

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	5byw
沉积日期 deposition_date	2015-06-11
结构标题 title	Crystal structure of engineered trifunctional CtCEL5E
关键词 keywords	Ctcel5E, cellulose, HYDROLASE; HYDROLASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	38.06 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	37.86 Å
零角强度 I(0) i0	525457000.00
分子量 molecular_weight	186810.0 kDa
排除体积 excluded_volume	232850 Å³
包络体积 envelope_volume	282920 Å³
水化壳体积 shell_volume	61995 Å³
包络直径 envelope_diameter	135.2 Å
壳层 Rg shell_rg	44.00 Å
包络 Rg envelope_rg	37.73 Å
形状 Rg shape_rg	37.82 Å
总 Rg total_rg	38.30 Å
总原子数 total_atoms	13220
残基数 n_residues	1596
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	129.4 Å
Rg (实空间) rg_real	38.13 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	1.16 Å
I(0) (实空间) i0_real	5.2550e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	8.4700e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	38.09 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	525400000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8649
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	46.2 Å
偏度 Skewness skewness	0.453
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.136
角度范围 angular_range	— – 0.2100 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	307000000.0000
实空间数据点数 n_real_points	43
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.792; Stabil: 0.999; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.999; Smooth: 0.865

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Endoglucanase H
分子量 formula_weight	47372.7 kDa
EC 编号 ec_number	3.2.1.4
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	5

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D,E
原子数 atom_count	13396

MGSSHHHHHHSSGLVPRGSHMASMTGGQQMGRIEGREFSSPEALAAYREAIGAGSSNPTPTPTWTSTPPSSSPKAVDPFEMVRKMGMGTNLGNTLEAPYEGSWSKSAMEYYFDDFKAAGYKNVRIPVRWDNHTMRTYPYTIDKAFLDRVEQVVDWSLSRGFVTIINSHHDDWIKEDYNGNIERFEKIWEQIAERFKNKSENLLFEIMNEPFGNITDEQIDDMNSRILKIIRKTNPTRIVIIGGGYWNSYNTLVNIKIPDDPYLIGTAHYYDPFEFTHQGAEWVEGSEKWLGRKWGTQEDMDTVVRVFDFVKSWSDRNNIPVYFGEFAVMAYADRTSRVKWYDFISDAALERGFACSVWDNGVFGSLDNDMAIYNRDTRTFDTEILNALFNPGTYPSYSPKPSPTPRPTKPPVTP

来源 Source

来源生物 organism	Clostridium thermocellum (strain ATCC 27405 / DSM 1237 / NBRC 103400 / NCIMB 10682 / NRRL B-4536 / VPI 7372)
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	203119
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 2 Entity 2 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	176

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 10 domains

SCOP 2.08 (5 domains)

结构域编号 domain_id	d5bywa_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.1 — TIM beta/alpha-barrel
超家族 Superfamily superfamily	c.1.8 — (Trans)glycosidases
家族 Family family	c.1.8.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d5bywb_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.1 — TIM beta/alpha-barrel
超家族 Superfamily superfamily	c.1.8 — (Trans)glycosidases
家族 Family family	c.1.8.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d5bywc_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.1 — TIM beta/alpha-barrel
超家族 Superfamily superfamily	c.1.8 — (Trans)glycosidases
家族 Family family	c.1.8.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d5bywd_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.1 — TIM beta/alpha-barrel
超家族 Superfamily superfamily	c.1.8 — (Trans)glycosidases
家族 Family family	c.1.8.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d5bywe_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.1 — TIM beta/alpha-barrel
超家族 Superfamily superfamily	c.1.8 — (Trans)glycosidases
家族 Family family	c.1.8.0 — automated matches

CATH v4.4 (5 domains)

结构域编号 domain_id	5bywA00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	20 — Alpha-Beta Barrel
拓扑 Topology topology	20 — TIM Barrel
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	80 — Glycosidases

结构域编号 domain_id	5bywB00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	20 — Alpha-Beta Barrel
拓扑 Topology topology	20 — TIM Barrel
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	80 — Glycosidases

结构域编号 domain_id	5bywC00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	20 — Alpha-Beta Barrel
拓扑 Topology topology	20 — TIM Barrel
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	80 — Glycosidases

结构域编号 domain_id	5bywD00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	20 — Alpha-Beta Barrel
拓扑 Topology topology	20 — TIM Barrel
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	80 — Glycosidases

结构域编号 domain_id	5bywE00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	20 — Alpha-Beta Barrel
拓扑 Topology topology	20 — TIM Barrel
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	80 — Glycosidases

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	222.325 Å
晶胞边长 b length_b	222.325 Å
晶胞边长 c length_c	207.895 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	60

空间群 space_group	P 62 2 2
空间群编号 int_tables_number	180
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.600 Å
最低分辨率 resolution_low	20.000 Å
R 因子 r_factor	0.2113
R_work r_work	0.2088
R_free r_free	0.2605

fit	/app/data/saxs_computation/by/5byw/5byw.fit
pddf	/app/data/pr_computation/by/5byw/5byw.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/by/5byw/5byw.dat

Crystal structure of engineered trifunctional CtCEL5E

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Endoglucanase H

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction