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5fo8

Crystal Structure of Human Complement C3b in Complex with MCP (CCP1-4)

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 152.5 Å Quality: GOOD
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

COMPLEMENT C3

物种未注明

UniProt P01024

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 其他组合 异源复合物 蛋白 × 3 其他聚合物 2 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 23–667 链 B； UniProt 749–1663 片段：UNP RESIDUES 23-667 片段：UNP RESIDUES 749-1663 MEMBRANE COFACTOR PROTEIN × 1 （P15529） 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 32 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：100MM AMMONIUM CITRATE 7% PEG 3350 5MM GLUTATHIONE 50MM BIS-TRIS PROPANE, PH 6.5 分辨率 2.40 Å R-free 0.219

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 5FO8 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1C3D X-RAY CRYSTAL STRUCTURE OF C3D: A C3 FRAGMENT AND LIGAND FOR COMPLEMENT RECEPTOR 2 提交 1998-05-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 996–1287（292 aa）
突变：C17A GOL GLYCEROL × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 12% PEG 20K, 100 MM MES BUFFER, PH 6.5, 10 MM DTT
分辨率 1.80 Å R-free 0.230
1GHQ CR2-C3D COMPLEX STRUCTURE 提交 2001-01-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 996–1300（305 aa） 片段：FRAGMENT OF ALPHA CHAIN
突变：C17A ZN ZINC ION × 2 NDG 2-acetamido-2-deoxy-alpha-D-glucopyranose × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；pH 6.0
分辨率 2.04 Å R-free 0.239
1W2S Solution structure of CR2 SCR 1-2 in its complex with C3d by X-ray scattering 提交 2004-07-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 996–1287（292 aa）
链 A 1288–1299（12 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION SCATTERING mmCIF 未提供已读取条件 分辨率未提供
2A73 Human Complement Component C3 提交 2005-07-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 23–665（643 aa） 片段：residue 1-645
链 B 673–1663（991 aa） 片段：residue 650-1663
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.2；293 K；PEG 550 MME, sodium acetate, pH 6.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.30 Å R-free 0.289
2A74 Human Complement Component C3c 提交 2005-07-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 23–665（643 aa） 片段：residues 23-665
链 B 749–936（188 aa） 片段：residues 749-936
链 C 1321–1663（343 aa） 片段：esidues 1321-1663
未记录 GOL GLYCEROL × 7 NO3 NITRATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；PEG3000, lithium nitrate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.40 Å R-free 0.275
2A74 Human Complement Component C3c 提交 2005-07-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 23–665（643 aa） 片段：residues 23-665
链 E 749–936（188 aa） 片段：residues 749-936
链 F 1321–1663（343 aa） 片段：esidues 1321-1663
未记录 GOL GLYCEROL × 6 NO3 NITRATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；PEG3000, lithium nitrate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.40 Å R-free 0.275
2GOX Crystal structure of Efb-C / C3d Complex 提交 2006-04-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 996–1287（292 aa） 片段：Fragment of alpha chain: Residues 996-1287
突变：C1010A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；60% Tacsimate pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K
分辨率 2.20 Å R-free 0.231
2GOX Crystal structure of Efb-C / C3d Complex 提交 2006-04-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 996–1287（292 aa） 片段：Fragment of alpha chain: Residues 996-1287
突变：C1010A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；60% Tacsimate pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K
分辨率 2.20 Å R-free 0.231
2I07 Human Complement Component C3b 提交 2006-08-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 23–667（645 aa）
链 B 749–1663（915 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；303 K；PEG-MME 2000, sodium acetate, Bis-Tris propane, taurine, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 303K
分辨率 4.00 Å R-free 0.323
2ICE CRIg bound to C3c 提交 2006-09-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 23–664（642 aa）
链 B 749–954（206 aa）
链 C 1321–1663（343 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.10 Å R-free 0.295
2ICE CRIg bound to C3c 提交 2006-09-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 23–664（642 aa）
链 E 749–954（206 aa）
链 F 1321–1663（343 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.10 Å R-free 0.295
2ICF CRIg bound to C3b 提交 2006-09-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 23–664（642 aa）
链 B 749–1663（915 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.5；293 K；pH 6.5, EVAPORATION, temperature 293K
分辨率 4.10 Å R-free 0.330
2NOJ Crystal structure of Ehp / C3d complex 提交 2006-10-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 996–1287（292 aa） 片段：Residues 996-1287
突变：C1010A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.2；293 K；0.2M LiSO4, 25% PEG 3350, 0.1M Tris-HCl pH 8.2, additive: CaCl2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.70 Å R-free 0.284
2NOJ Crystal structure of Ehp / C3d complex 提交 2006-10-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 996–1287（292 aa） 片段：Residues 996-1287
突变：C1010A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.2；293 K；0.2M LiSO4, 25% PEG 3350, 0.1M Tris-HCl pH 8.2, additive: CaCl2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.70 Å R-free 0.284
2NOJ Crystal structure of Ehp / C3d complex 提交 2006-10-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 996–1287（292 aa） 片段：Residues 996-1287
突变：C1010A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.2；293 K；0.2M LiSO4, 25% PEG 3350, 0.1M Tris-HCl pH 8.2, additive: CaCl2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.70 Å R-free 0.284
2NOJ Crystal structure of Ehp / C3d complex 提交 2006-10-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 996–1287（292 aa） 片段：Residues 996-1287
突变：C1010A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.2；293 K；0.2M LiSO4, 25% PEG 3350, 0.1M Tris-HCl pH 8.2, additive: CaCl2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.70 Å R-free 0.284
2QKI Human C3c in complex with the inhibitor compstatin 提交 2007-07-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 23–665（643 aa） 片段：residues 23-665
链 B 749–936（188 aa） 片段：residues 749-936
链 C 1321–1663（343 aa） 片段：residues 1321-1663
未记录 K POTASSIUM ION × 2 BR BROMIDE ION × 12 GOL GLYCEROL × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；PEG-MME 2000, KBr, Tris, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.40 Å R-free 0.281
2QKI Human C3c in complex with the inhibitor compstatin 提交 2007-07-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 23–665（643 aa） 片段：residues 23-665
链 E 749–936（188 aa） 片段：residues 749-936
链 F 1321–1663（343 aa） 片段：residues 1321-1663
未记录 K POTASSIUM ION × 3 BR BROMIDE ION × 20 GOL GLYCEROL × 11 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；PEG-MME 2000, KBr, Tris, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.40 Å R-free 0.281
2WII Complement C3b in complex with factor H domains 1-4 提交 2009-05-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 23–667（645 aa） 片段：RESIDUES 23-667
链 B 749–1663（915 aa） 片段：RESIDUES 749-1663
未记录 CA CALCIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 17 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.1；7.0% (W/V) PEG 3,350, 70 MM AMMONIUM ACETATE, PH 7.1
分辨率 2.70 Å R-free 0.252
2WII Complement C3b in complex with factor H domains 1-4 提交 2009-05-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 23–667（645 aa） 片段：RESIDUES 23-667
未记录 CA CALCIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.1；7.0% (W/V) PEG 3,350, 70 MM AMMONIUM ACETATE, PH 7.1
分辨率 2.70 Å R-free 0.252
2WII Complement C3b in complex with factor H domains 1-4 提交 2009-05-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 749–1663（915 aa） 片段：RESIDUES 749-1663
未记录 GOL GLYCEROL × 13 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.1；7.0% (W/V) PEG 3,350, 70 MM AMMONIUM ACETATE, PH 7.1
分辨率 2.70 Å R-free 0.252
2WIN C3 convertase (C3bBb) stabilized by SCIN 提交 2009-05-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 23–667（645 aa） 片段：COMPLEMENT C3B BETA CHAIN, RESIDUES 23-667
链 B 749–1663（915 aa） 片段：;COMPLEMENT C3B ALPHA' CHAIN, RESIDUES 749-1663 ;
链 G 23–667（645 aa） 片段：COMPLEMENT C3B BETA CHAIN, RESIDUES 23-667
链 H 749–1663（915 aa） 片段：;COMPLEMENT C3B ALPHA' CHAIN, RESIDUES 749-1663 ;
未记录 MAN alpha-D-mannopyranose × 1 BMA beta-D-mannopyranose × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；75 MM SODIUM/POTASSIUM TARTRATE, 8.0% PEG 3350, 50 MM BIS-TRIS PROPANE, PH 6.5
分辨率 3.90 Å R-free 0.268
2WIN C3 convertase (C3bBb) stabilized by SCIN 提交 2009-05-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 C 23–667（645 aa） 片段：COMPLEMENT C3B BETA CHAIN, RESIDUES 23-667
链 D 749–1663（915 aa） 片段：;COMPLEMENT C3B ALPHA' CHAIN, RESIDUES 749-1663 ;
链 E 23–667（645 aa） 片段：COMPLEMENT C3B BETA CHAIN, RESIDUES 23-667
链 F 749–1663（915 aa） 片段：;COMPLEMENT C3B ALPHA' CHAIN, RESIDUES 749-1663 ;
未记录 BMA beta-D-mannopyranose × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；75 MM SODIUM/POTASSIUM TARTRATE, 8.0% PEG 3350, 50 MM BIS-TRIS PROPANE, PH 6.5
分辨率 3.90 Å R-free 0.268
2WY7 Staphylococcus aureus complement subversion protein Sbi-IV in complex with complement fragment C3d revealing an alternative binding mode 提交 2009-11-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 996–1303（308 aa） 片段：C3D, RESIDUES 996-1303
突变：YES GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8；100MM TRIS PH8.0, 200MM NACL, 20%(W/V) PEG 4000
分辨率 1.70 Å R-free 0.205
2WY8 Staphylococcus aureus complement subversion protein Sbi-IV in complex with complement fragment C3d 提交 2009-11-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 996–1303（308 aa） 片段：C3D, RESIDUES 996-1303
突变：YES GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8；100MM TRIS PH8.0, 200MM NACL, 20%(W/V) PEG 4000
分辨率 1.70 Å R-free 0.205
2XQW Structure of Factor H domains 19-20 in complex with complement C3d 提交 2010-09-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 996–1287（292 aa） 片段：THIOESTER DOMAIN, RESIDUES 996-1287
链 B 996–1287（292 aa） 片段：THIOESTER DOMAIN, RESIDUES 996-1287
突变：YES 突变：YES 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；295 K；12-18% PEG 4000, 0.1 M HEPES, PH 7.5, AT 22 DEGREES C
分辨率 2.31 Å R-free 0.242
2XQW Structure of Factor H domains 19-20 in complex with complement C3d 提交 2010-09-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 996–1287（292 aa） 片段：THIOESTER DOMAIN, RESIDUES 996-1287
突变：YES 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；295 K；12-18% PEG 4000, 0.1 M HEPES, PH 7.5, AT 22 DEGREES C
分辨率 2.31 Å R-free 0.242
2XQW Structure of Factor H domains 19-20 in complex with complement C3d 提交 2010-09-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 996–1287（292 aa） 片段：THIOESTER DOMAIN, RESIDUES 996-1287
突变：YES 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；295 K；12-18% PEG 4000, 0.1 M HEPES, PH 7.5, AT 22 DEGREES C
分辨率 2.31 Å R-free 0.242
2XWB Crystal Structure of Complement C3b in complex with Factors B and D 提交 2010-11-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 23–664（642 aa） 片段：RESIDUES 23-664
链 B 752–1663（912 aa） 片段：RESIDUES 752-1663
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.7；PH 7.7
分辨率 3.49 Å R-free 0.244
2XWB Crystal Structure of Complement C3b in complex with Factors B and D 提交 2010-11-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 23–664（642 aa） 片段：RESIDUES 23-664
链 D 752–1663（912 aa） 片段：RESIDUES 752-1663
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.7；PH 7.7
分辨率 3.49 Å R-free 0.244
2XWB Crystal Structure of Complement C3b in complex with Factors B and D 提交 2010-11-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 23–664（642 aa） 片段：RESIDUES 23-664
链 D 752–1663（912 aa） 片段：RESIDUES 752-1663
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.7；PH 7.7
分辨率 3.49 Å R-free 0.244
2XWB Crystal Structure of Complement C3b in complex with Factors B and D 提交 2010-11-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 23–664（642 aa） 片段：RESIDUES 23-664
链 B 752–1663（912 aa） 片段：RESIDUES 752-1663
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.7；PH 7.7
分辨率 3.49 Å R-free 0.244
2XWJ Crystal Structure of Complement C3b in Complex with Factor B 提交 2010-11-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 23–667（645 aa） 片段：RESIDUES 23-667
链 B 749–1663（915 aa） 片段：RESIDUES 749-1663
突变：YES NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 NI NICKEL (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 4；pH 4.0
分辨率 4.00 Å R-free 0.281
2XWJ Crystal Structure of Complement C3b in Complex with Factor B 提交 2010-11-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 23–667（645 aa） 片段：RESIDUES 23-667
链 D 749–1663（915 aa） 片段：RESIDUES 749-1663
突变：YES NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 NI NICKEL (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 4；pH 4.0
分辨率 4.00 Å R-free 0.281
2XWJ Crystal Structure of Complement C3b in Complex with Factor B 提交 2010-11-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 23–667（645 aa） 片段：RESIDUES 23-667
链 H 749–1663（915 aa） 片段：RESIDUES 749-1663
突变：YES NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 NI NICKEL (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 4；pH 4.0
分辨率 4.00 Å R-free 0.281
2XWJ Crystal Structure of Complement C3b in Complex with Factor B 提交 2010-11-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 23–667（645 aa） 片段：RESIDUES 23-667
链 F 749–1663（915 aa） 片段：RESIDUES 749-1663
突变：YES NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 NI NICKEL (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 4；pH 4.0
分辨率 4.00 Å R-free 0.281
30JE Herpes simplex virus 2 delta28-73 glycoprotein C ectodomain in complex with C3b 提交 2026-04-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 23–667（645 aa）
链 C 749–1663（915 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
3D5R Crystal Structure of Efb-C (N138A) / C3d Complex 提交 2008-05-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 996–1287（292 aa） 片段：Complement C3d fragment, UNP residues 996-1287
突变：C1010A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；60% (v/v) tacsimate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.10 Å R-free 0.241
3D5R Crystal Structure of Efb-C (N138A) / C3d Complex 提交 2008-05-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 996–1287（292 aa） 片段：Complement C3d fragment, UNP residues 996-1287
突变：C1010A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；60% (v/v) tacsimate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.10 Å R-free 0.241
3D5S Crystal Structure of Efb-C (R131A) / C3d Complex 提交 2008-05-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 996–1287（292 aa） 片段：Complement C3d fragment, UNP residues 996-1287
突变：C1010A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；60% (v/v) tacsimate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.30 Å R-free 0.218
3D5S Crystal Structure of Efb-C (R131A) / C3d Complex 提交 2008-05-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 996–1287（292 aa） 片段：Complement C3d fragment, UNP residues 996-1287
突变：C1010A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；60% (v/v) tacsimate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.30 Å R-free 0.218
3G6J C3b in complex with a C3b specific Fab 提交 2009-02-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 23–666（644 aa）
链 B 749–1663（915 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；Crystals of the C3b:S77 complex were obtained within a week at 19\xB0 C from 4 ml hanging drops, consisting of a 1:1 ratio of protein solution (10 mg/ml protein in 50 mM NaCl, 25 mM TRIS pH 7.8) to mother liquor (10% PEG 4000, 0.2 M MgCl2, 100 mM Na-HEPES, pH 7.0), suspended over mother liquor, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.10 Å R-free 0.282
3G6J C3b in complex with a C3b specific Fab 提交 2009-02-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 23–666（644 aa）
链 D 749–1663（915 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；Crystals of the C3b:S77 complex were obtained within a week at 19\xB0 C from 4 ml hanging drops, consisting of a 1:1 ratio of protein solution (10 mg/ml protein in 50 mM NaCl, 25 mM TRIS pH 7.8) to mother liquor (10% PEG 4000, 0.2 M MgCl2, 100 mM Na-HEPES, pH 7.0), suspended over mother liquor, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.10 Å R-free 0.282
3G6J C3b in complex with a C3b specific Fab 提交 2009-02-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 23–666（644 aa）
链 B 749–1663（915 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；Crystals of the C3b:S77 complex were obtained within a week at 19\xB0 C from 4 ml hanging drops, consisting of a 1:1 ratio of protein solution (10 mg/ml protein in 50 mM NaCl, 25 mM TRIS pH 7.8) to mother liquor (10% PEG 4000, 0.2 M MgCl2, 100 mM Na-HEPES, pH 7.0), suspended over mother liquor, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.10 Å R-free 0.282
3G6J C3b in complex with a C3b specific Fab 提交 2009-02-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 23–666（644 aa）
链 D 749–1663（915 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；Crystals of the C3b:S77 complex were obtained within a week at 19\xB0 C from 4 ml hanging drops, consisting of a 1:1 ratio of protein solution (10 mg/ml protein in 50 mM NaCl, 25 mM TRIS pH 7.8) to mother liquor (10% PEG 4000, 0.2 M MgCl2, 100 mM Na-HEPES, pH 7.0), suspended over mother liquor, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.10 Å R-free 0.282
3L3O Staphylococcal Complement Inhibitor (SCIN) in complex with Human Complement Component C3c 提交 2009-12-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 23–667（645 aa） 片段：residues 23-667
链 B 749–954（206 aa） 片段：residues 749-954
链 C 1321–1663（343 aa） 片段：residues 1321-1663
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；Protein solution: 5mg/ml, 0.1M HEPES, 10% PEG 6000, 5% 2-Methyl-2,4-pentanediol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 3.40 Å R-free 0.271
3L3O Staphylococcal Complement Inhibitor (SCIN) in complex with Human Complement Component C3c 提交 2009-12-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 23–667（645 aa） 片段：residues 23-667
链 E 749–954（206 aa） 片段：residues 749-954
链 F 1321–1663（343 aa） 片段：residues 1321-1663
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；Protein solution: 5mg/ml, 0.1M HEPES, 10% PEG 6000, 5% 2-Methyl-2,4-pentanediol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 3.40 Å R-free 0.271
3L5N Staphylococcal Complement Inhibitor (SCIN) in complex with Human Complement Component C3b 提交 2009-12-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 23–667（645 aa） 片段：residues 23-667
链 B 749–1663（915 aa） 片段：residues 749-1663
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 MAN alpha-D-mannopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；Protein solution 5mg/ml, 0.1M HEPES-NaOH, 30%(v/v) Jeffamine ED-2001-HCl, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 7.54 Å R-free 0.268
3NMS Staphylococcal Complement Inhibitor (SCIN) in complex with Human Complement C3c 提交 2010-06-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 23–667（645 aa）
链 B 749–954（206 aa）
链 C 1321–1663（343 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；Protein solution: 5mg/ml, 0.1M HEPES, 10% PEG 6000, 5% 2-Methyl-2,4-pentanediol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 4.10 Å R-free 0.289
3OED The structure of the complex between complement receptor CR2 and its ligand complement fragment C3d 提交 2010-08-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 996–1303（308 aa） 片段：C3 (unp residues 996-1303)
突变：C1010A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；100 mM HEPES, 20% Poly Ethylene Glycol 6000, 200 mM CaCl2, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.16 Å R-free 0.259
3OED The structure of the complex between complement receptor CR2 and its ligand complement fragment C3d 提交 2010-08-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 996–1303（308 aa） 片段：C3 (unp residues 996-1303)
突变：C1010A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；100 mM HEPES, 20% Poly Ethylene Glycol 6000, 200 mM CaCl2, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.16 Å R-free 0.259
3OHX Molecular Basis for Complement Recognition and Inhibition Determined by Crystallographic Studies of the Staphylococcal Complement Inhibitor (SCIN) Bound to C3c and C3b 提交 2010-08-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 23–667（645 aa） 片段：Complement C3 beta chain
链 B 749–954（206 aa） 片段：;Complement C3 alpha' chain fragment 1 ;
链 C 1321–1663（343 aa） 片段：;Complement C3 alpha' chain fragment 2 ;
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；2.5mg/ml protein, 0.1M HEPES, 10% PEG6000, 5% 2-Methyl-2,4-pentanediol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 3.50 Å R-free 0.294
3OHX Molecular Basis for Complement Recognition and Inhibition Determined by Crystallographic Studies of the Staphylococcal Complement Inhibitor (SCIN) Bound to C3c and C3b 提交 2010-08-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 23–667（645 aa） 片段：Complement C3 beta chain
链 E 749–954（206 aa） 片段：;Complement C3 alpha' chain fragment 1 ;
链 F 1321–1663（343 aa） 片段：;Complement C3 alpha' chain fragment 2 ;
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；2.5mg/ml protein, 0.1M HEPES, 10% PEG6000, 5% 2-Methyl-2,4-pentanediol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 3.50 Å R-free 0.294
3OXU Complement components factor H CCP19-20 and C3d in complex 提交 2010-09-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 996–1303（308 aa） 片段：UNP residues 996-1303
突变：C1010A GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.8；290 K；4% w/v PEG 8000, 0.1 M Tris HCl, pH 8.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
分辨率 2.10 Å R-free 0.206
3OXU Complement components factor H CCP19-20 and C3d in complex 提交 2010-09-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 996–1303（308 aa） 片段：UNP residues 996-1303
突变：C1010A GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.8；290 K；4% w/v PEG 8000, 0.1 M Tris HCl, pH 8.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
分辨率 2.10 Å R-free 0.206
3OXU Complement components factor H CCP19-20 and C3d in complex 提交 2010-09-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 996–1303（308 aa） 片段：UNP residues 996-1303
突变：C1010A GOL GLYCEROL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.8；290 K；4% w/v PEG 8000, 0.1 M Tris HCl, pH 8.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
分辨率 2.10 Å R-free 0.206
3RJ3 Complement components factor H CCP19-20 (S1191L mutant) and C3D in complex 提交 2011-04-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 996–1303（308 aa） 片段：UNP residues 996-1303
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；290 K；4% w/v PEG 8000, 0.1 M Tris HCl, pH 8.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
分辨率 2.35 Å R-free 0.232
3RJ3 Complement components factor H CCP19-20 (S1191L mutant) and C3D in complex 提交 2011-04-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 996–1303（308 aa） 片段：UNP residues 996-1303
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；290 K；4% w/v PEG 8000, 0.1 M Tris HCl, pH 8.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
分辨率 2.35 Å R-free 0.232
3RJ3 Complement components factor H CCP19-20 (S1191L mutant) and C3D in complex 提交 2011-04-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 996–1303（308 aa） 片段：UNP residues 996-1303
未记录 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；290 K；4% w/v PEG 8000, 0.1 M Tris HCl, pH 8.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
分辨率 2.35 Å R-free 0.232
3T4A Structure of a truncated form of Staphylococcal Complement Inhibitor B bound to human C3c at 3.4 Angstrom resolution 提交 2011-07-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 23–667（645 aa） 片段：C3c beta chain, UNP residues 23-667
链 B 749–954（206 aa） 片段：;C3c alpha' chain fragment 1, UNP residues 749-954 ;
链 C 1321–1663（343 aa） 片段：;C3c alpha' chain fragment 2, UNP residues 1321-1663 ;
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；293 K；5mg/ml protein, 0.1M bis-Tris, 15% w/v PEG 3350, pH 6.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 3.40 Å R-free 0.270
3T4A Structure of a truncated form of Staphylococcal Complement Inhibitor B bound to human C3c at 3.4 Angstrom resolution 提交 2011-07-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 23–667（645 aa） 片段：C3c beta chain, UNP residues 23-667
链 E 749–954（206 aa） 片段：;C3c alpha' chain fragment 1, UNP residues 749-954 ;
链 F 1321–1663（343 aa） 片段：;C3c alpha' chain fragment 2, UNP residues 1321-1663 ;
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；293 K；5mg/ml protein, 0.1M bis-Tris, 15% w/v PEG 3350, pH 6.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 3.40 Å R-free 0.270
4HW5 Crystal Structure of the Human C3a anaphylatoxin 提交 2012-11-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 672–748（77 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；292 K；2-2.2 M ammonium sulfate with the pH ranging from 6 to 9 , VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K
分辨率 2.25 Å R-free 0.243
4HW5 Crystal Structure of the Human C3a anaphylatoxin 提交 2012-11-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 672–748（77 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；292 K；2-2.2 M ammonium sulfate with the pH ranging from 6 to 9 , VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K
分辨率 2.25 Å R-free 0.243
4HW5 Crystal Structure of the Human C3a anaphylatoxin 提交 2012-11-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 672–748（77 aa）
链 B 672–748（77 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；292 K；2-2.2 M ammonium sulfate with the pH ranging from 6 to 9 , VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K
分辨率 2.25 Å R-free 0.243
4HWJ Crystal Structure of the Human C3a desArg anaphylatoxin 提交 2012-11-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 672–747（76 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；292 K；0.1 M Tris pH 7.5-8.5, 25 % w/v PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K
分辨率 2.60 Å R-free 0.270
4I6O Crystal structure of chemically synthesized human anaphylatoxin C3a 提交 2012-11-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 672–748（77 aa） 片段：C3a anaphylatoxin (UNP residues 672-748)
未记录 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, 1 uL 5 mg/mL lyophilized C3a in 2 mM hydrochloric acid + 1 uL reservoir (0.1 M Tris-HCl, 0.2 M ammonium phosphate monobasic, 49-51% v/v MPD, pH 8.5) against 500 uL reservoir, prepared at 277K, incubated at 281K for 96 hours, stored at 277K, rhomboid-shaped crystals appeared after 6 days and grew to a final size of 0.5 x 0.2 x 0.2 mm
分辨率 2.14 Å R-free 0.268
4M76 Integrin I domain of complement receptor 3 in complex with C3d 提交 2013-08-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 994–1288（295 aa） 片段：unp residues 994-1288
突变：C1010A, C144A, I332G NI NICKEL (II) ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；PEG 3350, pH 7, vapor diffusion, hanging drop, temperature 298K
分辨率 2.80 Å R-free 0.242
4ONT Ternary host recognition complex of complement factor H, C3d, and sialic acid 提交 2014-01-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 996–1303（308 aa） 片段：UNP residues 996-1303
突变：C17A GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；293 K；0.1 M Tris-HCl, pH 9.0, 8% w/v PEG8000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.15 Å R-free 0.223
4ONT Ternary host recognition complex of complement factor H, C3d, and sialic acid 提交 2014-01-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 996–1303（308 aa） 片段：UNP residues 996-1303
突变：C17A GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；293 K；0.1 M Tris-HCl, pH 9.0, 8% w/v PEG8000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.15 Å R-free 0.223
4ONT Ternary host recognition complex of complement factor H, C3d, and sialic acid 提交 2014-01-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 996–1303（308 aa） 片段：UNP residues 996-1303
突变：C17A GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；293 K；0.1 M Tris-HCl, pH 9.0, 8% w/v PEG8000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.15 Å R-free 0.223
4ZH1 Complement factor H in complex with the GM1 glycan 提交 2015-04-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 996–1303（308 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1 M TRIS-HCL, PH 9.0, 8% W/V PRG 8000
分辨率 2.24 Å R-free 0.228
4ZH1 Complement factor H in complex with the GM1 glycan 提交 2015-04-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 996–1303（308 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1 M TRIS-HCL, PH 9.0, 8% W/V PRG 8000
分辨率 2.24 Å R-free 0.228
4ZH1 Complement factor H in complex with the GM1 glycan 提交 2015-04-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 996–1303（308 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1 M TRIS-HCL, PH 9.0, 8% W/V PRG 8000
分辨率 2.24 Å R-free 0.228
5FO7 Crystal Structure of Human Complement C3b at 2.8 Angstrom resolution 提交 2015-11-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 23–667（645 aa） 片段：RESIDUES 23-667
链 B 749–1663（915 aa） 片段：RESIDUES 749-1663
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 8% PEG 3350 35MM BIS-TRIS PH 5.5
分辨率 2.80 Å R-free 0.268
5FO9 Crystal Structure of Human Complement C3b in Complex with CR1 (CCP15- 17) 提交 2015-11-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 23–667（645 aa） 片段：RESIDUES 23-667
链 E 749–1663（915 aa） 片段：CCP DOMAINS, RESIDUES 749-1663
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 8% PEG 3350 35MM BIS-TRIS PH 5.5
分辨率 3.30 Å R-free 0.291
5FO9 Crystal Structure of Human Complement C3b in Complex with CR1 (CCP15- 17) 提交 2015-11-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 23–667（645 aa） 片段：RESIDUES 23-667
链 B 749–1663（915 aa） 片段：CCP DOMAINS, RESIDUES 749-1663
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 8% PEG 3350 35MM BIS-TRIS PH 5.5
分辨率 3.30 Å R-free 0.291
5FOA Crystal Structure of Human Complement C3b in complex with DAF (CCP2-4) 提交 2015-11-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 23–667（645 aa） 片段：UNP RESIDUES 23-667
链 B 749–1663（915 aa） 片段：UNP RESIDUES 749-1663
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 60MM MGCL2 30MM BIS-TRIS PH 5.5 6.5% PEG 3350 3% MESO-ERHYTROL
分辨率 4.19 Å R-free 0.307
5FOA Crystal Structure of Human Complement C3b in complex with DAF (CCP2-4) 提交 2015-11-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 23–667（645 aa） 片段：UNP RESIDUES 23-667
链 D 749–1663（915 aa） 片段：UNP RESIDUES 749-1663
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 60MM MGCL2 30MM BIS-TRIS PH 5.5 6.5% PEG 3350 3% MESO-ERHYTROL
分辨率 4.19 Å R-free 0.307
5FOB Crystal Structure of Human Complement C3b in complex with Smallpox Inhibitor of Complement (SPICE) 提交 2015-11-18 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 23–667（645 aa） 片段：RESIDUES 23-667
链 B 749–1663（915 aa） 片段：CCP DOMAINS, RESIDUES 749-1663
未记录 CL CHLORIDE ION × 5 GOL GLYCEROL × 24 NA SODIUM ION × 2 IOD IODIDE ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 75MM AMMONIUM IODIDE, 3.5% PEG 3350
分辨率 2.60 Å R-free 0.230
5NBQ The structure of the tripartite complex between OspE, the C-terminal domains of factor H and C3dg 提交 2017-03-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 994–1287（294 aa）
突变：A1153E, C1010A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；20% PEG3350, 0.1 M HEPES pH 7.5, 0.2 M MgCl2 or 24% PEG3350, 0.1 M HEPES pH 7.5, 0.2 M MgCl2 or 16% PEG3350, Tris pH 8.5, 0.2 M ammonium acetate
分辨率 3.18 Å R-free 0.261
5NBQ The structure of the tripartite complex between OspE, the C-terminal domains of factor H and C3dg 提交 2017-03-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 994–1287（294 aa）
突变：A1153E, C1010A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；20% PEG3350, 0.1 M HEPES pH 7.5, 0.2 M MgCl2 or 24% PEG3350, 0.1 M HEPES pH 7.5, 0.2 M MgCl2 or 16% PEG3350, Tris pH 8.5, 0.2 M ammonium acetate
分辨率 3.18 Å R-free 0.261
5NBQ The structure of the tripartite complex between OspE, the C-terminal domains of factor H and C3dg 提交 2017-03-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 994–1287（294 aa）
突变：A1153E, C1010A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；20% PEG3350, 0.1 M HEPES pH 7.5, 0.2 M MgCl2 or 24% PEG3350, 0.1 M HEPES pH 7.5, 0.2 M MgCl2 or 16% PEG3350, Tris pH 8.5, 0.2 M ammonium acetate
分辨率 3.18 Å R-free 0.261
5O32 The structure of complement complex 提交 2017-05-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 A 23–667（645 aa） 片段：beta chain, UNP residues 23-667
链 B 749–1663（915 aa） 片段：alpha chain, UNP residues 749-1663
链 E 23–667（645 aa） 片段：beta chain, UNP residues 23-667
链 F 749–1663（915 aa） 片段：alpha chain, UNP residues 749-1663
未记录 CA CALCIUM ION × 6 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 12 MLI MALONATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291.15 K；60mM sodium malonate PH5.0 6% w/v PEG3350
分辨率 4.21 Å R-free 0.254
5O35 Structure of complement proteins complex 提交 2017-05-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 23–667（645 aa）
链 B 749–1663（915 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291.15 K；60mM Ammonium sulfate, 6% w/v PEG3350
分辨率 4.20 Å R-free 0.246
6EHG complement component C3b in complex with a nanobody 提交 2017-09-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 23–665（643 aa）
链 B 749–1663（915 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；12 mM Sodium Citrate pH 8, 28 mM Sodium Citrate pH 6.0, 12.25 % (w/v) PEG 2000 MME, 70 mM Imidazole pH 7, 60 mM Ammonium acetate, 70 mM Tris pH 8.5, 13.5 % (v/v) and (+/-)-2-Methyl-2,4-pentanediol
分辨率 2.65 Å
6RMT Crystal structure of disulphide-linked human C3d dimer 提交 2019-05-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 996–1303（308 aa）
链 B 996–1303（308 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；100 mM Tris pH 8, 200 mM NaCl, 24% PEG 4000
分辨率 2.00 Å R-free 0.200
6RMU Crystal structure of disulphide-linked human C3d dimer in complex with Staphylococcus aureus complement subversion protein Sbi-IV 提交 2019-05-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 996–1303（308 aa）
链 B 996–1303（308 aa）
未记录 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.07；291 K；0.2 M sodium citrate tribasic dihydrate, 20% PEG 3350.
分辨率 2.40 Å R-free 0.211
6RU5 human complement C3 in complex with the hC3Nb1 nanobody 提交 2019-05-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 23–667（645 aa）
链 B 672–1663（992 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；100 mM HEPES pH 7.2, 1.75 % (w/v) PEG8000
分辨率 3.90 Å
6RUR Structure of the SCIN stabilized C3bBb convertase bound to properdin 提交 2019-05-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 23–667（645 aa）
链 B 749–1663（915 aa）
链 G 23–667（645 aa）
链 H 749–1663（915 aa）
未记录 MAN alpha-D-mannopyranose × 18 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；50 mM MgAcetate 50 mM Mes 6.5 5 % w/v PEG 10K
分辨率 6.00 Å R-free 0.272
6RUV Structure of the SCIN stabilized C3bBb convertase bound to Properdin and a the non-inhibitory nanobody hFPNb1 提交 2019-05-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 A 23–667（645 aa）
链 B 749–1663（915 aa）
链 G 23–667（645 aa）
链 H 749–1663（915 aa）
未记录 MAN alpha-D-mannopyranose × 21 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.8；277 K；100 mM NaCl, 5 % (w/v) PEG4000, 10 mM MgCl2, 100 mM Sodium Cacodylate trihydrate pH 5.8.
分辨率 6.15 Å R-free 0.271
6S0B Crystal Structure of Properdin in complex with the CTC domain of C3/C3b 提交 2019-06-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 1517–1663（147 aa）
未记录 MAN alpha-D-mannopyranose × 8 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；291 K；Tacsimate, PEG 3350
分辨率 2.31 Å R-free 0.277
7AKK Structure of a complement factor-receptor complex 提交 2020-10-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 749–1663（915 aa）
链 B 23–667（645 aa）
链 C 23–667（645 aa）
链 E 749–1663（915 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 3 K POTASSIUM ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295 K；100 mM Tris-HCl (pH 8.0), 8% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 8000
分辨率 3.40 Å R-free 0.229
7BAG C3b in complex with CP40 提交 2020-12-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 23–667（645 aa）
链 B 749–1663（915 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 5 ACM ACETAMIDE × 1 NH2 AMINO GROUP × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；291 K；6.66% w/v polyethylene glycol 8000, 66.6 mM sodium chloride and 33.3 mM disodium phosphate/citric acid pH 4.0
分辨率 2.00 Å R-free 0.225
7NOZ Structure of the nanobody stablized properdin bound alternative pathway proconvertase C3b:FB:FP 提交 2021-02-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 23–667（645 aa）
链 B 752–1663（912 aa）
未记录 MAN alpha-D-mannopyranose × 6 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.05 M Na-acetate pH 5.3, 0.1 M Mg-formate,7% PEG5000 MME
分辨率 3.90 Å R-free 0.265
7PI6 Trypanosoma brucei ISG65 bound to human complement C3d 提交 2021-08-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 996–1287（292 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M MES pH 6, 0.2 M MgCl2, 20% PEG 6000 with sliver bullet HR2-996-55
分辨率 2.60 Å R-free 0.310
7PI6 Trypanosoma brucei ISG65 bound to human complement C3d 提交 2021-08-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 996–1287（292 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 2 PG0 2-(2-METHOXYETHOXY)ETHANOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M MES pH 6, 0.2 M MgCl2, 20% PEG 6000 with sliver bullet HR2-996-55
分辨率 2.60 Å R-free 0.310
7QIV Structure of human C3b in complex with the EWE nanobody 提交 2021-12-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 23–667（645 aa）
链 B 749–1663（915 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；292 K；112 mM Sodium Citrate pH 8, 28 mM Sodium Citrate pH 6.0, 12.25 % (w/v) PEG 2000 MME, 70 mM Imidazole pH 7, 60 mM Ammonium acetate, 70 mM TRIS pH 8.5, and 13.5 % (v/v) 2-Methyl-2,4-pentanediol
分辨率 2.80 Å R-free 0.275
7TV9 HUMAN COMPLEMENT COMPONENT C3B IN COMPLEX WITH APL-1030 提交 2022-02-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 23–667（645 aa）
链 B 749–1663（915 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；293 K；100 mM HEPES, pH 7.8, 25% Poly(acrylic acid sodium salt) 5100
分辨率 3.40 Å R-free 0.328
7UE9 Structure of anti-C3d Fab(3d8b) in complex with C3d 提交 2022-03-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 994–1303（310 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 10 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.6；293 K；15% PEG 10,000, 0.1 M bicine pH 7.6
分辨率 1.75 Å R-free 0.201
7ZGJ Trypanosoma brucei gambiense ISG65 in complex with human complement component C3 提交 2022-04-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 23–667（645 aa）
链 B 672–1663（992 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.58 Å
7ZGK Trypanosoma brucei gambiense ISG65 in complex with human complement component C3b 提交 2022-04-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 23–667（645 aa）
链 B 749–1663（915 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.59 Å
8ENU Structure of the C3bB proconvertase in complex with lufaxin 提交 2022-09-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 G 23–667（645 aa）
链 H 749–1663（915 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.22 Å
8EOK Structure of the C3bB proconvertase in complex with lufaxin and factor Xa 提交 2022-10-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 G 23–667（645 aa）
链 H 749–1663（915 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.53 Å
8HK2 C3aR-Gi-C3a protein complex 提交 2022-11-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 D 672–748（77 aa）
未记录 CLR CHOLESTEROL × 5 PLM PALMITIC ACID × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8I9L Structure of C3a-C3aR-Go complex (Composite map) 提交 2023-02-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 D 672–748（77 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.18 Å
8OQ3 Structure of methylamine treated human complement C3 提交 2023-04-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 23–1663（1641 aa）
链 D 23–1663（1641 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8OVB Human Complement C3b in complex with Trypanosoma brucei ISG65. 提交 2023-04-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 23–664（642 aa）
链 B 749–1663（915 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8UH2 Complex of C3b with the inhibitor albicin 提交 2023-10-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 23–664（642 aa）
链 B 749–1663（915 aa）
链 G 23–664（642 aa）
链 H 749–1663（915 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.59 Å
8UIN Structure of the C3bBb-albicin complex 提交 2023-10-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 23–664（642 aa）
链 B 749–1663（915 aa）
链 G 23–664（642 aa）
链 H 749–1663（915 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；10 mM Hepes pH 7.4, 150 mM NaCl, 5 mM MgCl2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.86 Å
9N1Z Structure of C3d Bound to a Fragment of FHR-2 提交 2025-01-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 996–1287（292 aa）
突变：C1010A SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.075 M HEPES [PH 7.5] 1.2 M Ammonium Sulfate
分辨率 2.31 Å R-free 0.227
9N1Z Structure of C3d Bound to a Fragment of FHR-2 提交 2025-01-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 996–1287（292 aa）
突变：C1010A SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.075 M HEPES [PH 7.5] 1.2 M Ammonium Sulfate
分辨率 2.31 Å R-free 0.227
9N20 Structure of C3d Bound to a Fragment of FHR-2 and S. aureus Efb-C 提交 2025-01-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 996–1287（292 aa） 片段：residues 996-1287
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M imidazole [pH 6.7] 12% (w/v) peg-20k
分辨率 3.30 Å R-free 0.214
9QK2 Structure of the Complement classical and lectin pathway C3 convertase in complex with substrate C3 提交 2025-03-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 F 1–1663（1663 aa）
链 G 1–1663（1663 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
9RBO A cryo-EM structure of native C3 protein in a compact conformation. 提交 2025-05-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 32–227（196 aa）
链 B 350–665（316 aa）
链 C 686–734（49 aa）
链 D 762–1663（902 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.00 Å
9T3Y Cryo-EM structure of alphaM/beta2:C3d-anti-CR3-Nb headpiece complex (HPO2 3D class reconstruction) 提交 2025-10-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 995–1289（295 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 5 MN MANGANESE (II) ION × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；0.02 % w/v CHAPS added to sample just before vitrification
分辨率 3.44 Å
9U61 CP/MBL pathways C3 convertase C4b2a and C3 complex 提交 2025-03-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 1–1663（1663 aa）
链 D 1–1663（1663 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 NI NICKEL (II) ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9U62 AP pathways C3 convertase C3bBbP and C3 complex 提交 2025-03-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 C 1–1663（1663 aa）
链 D 1–1663（1663 aa）
链 E 1–1663（1663 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 NI NICKEL (II) ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å

共 74 个其他 PDB 条目、117 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CO3_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1, 2
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–645； UniProt 23–667 作者链 B； PDB构建体 1–915； UniProt 749–1663

MEMBRANE COFACTOR PROTEIN

HOMO SAPIENS

UniProt P15529

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 其他组合 异源复合物 蛋白 × 3 其他聚合物 2 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白拷贝数一致 链 C； UniProt 35–286 片段：CCP DOMAINS 1-4, UNP RESIDUES 35-286 COMPLEMENT C3 × 1 （P01024） COMPLEMENT C3 × 1 （P01024） 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 32 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：100MM AMMONIUM CITRATE 7% PEG 3350 5MM GLUTATHIONE 50MM BIS-TRIS PROPANE, PH 6.5 分辨率 2.40 Å R-free 0.219

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 5FO8 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1CKL N-TERMINAL TWO DOMAINS OF HUMAN CD46 (MEMBRANE COFACTOR PROTEIN, MCP) 提交 1999-04-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 35–160（126 aa） 片段：N-TERMINAL TWO SCR DOMAINS
未记录 CA CALCIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；16% PEG 8000, 40 MM CACL2, 100 MM NA-CACODYLATE PH 6.5, 7 MG/ML PROTEIN, 20C, pH 6.50
分辨率 3.10 Å R-free 0.298
1CKL N-TERMINAL TWO DOMAINS OF HUMAN CD46 (MEMBRANE COFACTOR PROTEIN, MCP) 提交 1999-04-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 35–160（126 aa） 片段：N-TERMINAL TWO SCR DOMAINS
未记录 CA CALCIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；16% PEG 8000, 40 MM CACL2, 100 MM NA-CACODYLATE PH 6.5, 7 MG/ML PROTEIN, 20C, pH 6.50
分辨率 3.10 Å R-free 0.298
1CKL N-TERMINAL TWO DOMAINS OF HUMAN CD46 (MEMBRANE COFACTOR PROTEIN, MCP) 提交 1999-04-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 35–160（126 aa） 片段：N-TERMINAL TWO SCR DOMAINS
未记录 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；16% PEG 8000, 40 MM CACL2, 100 MM NA-CACODYLATE PH 6.5, 7 MG/ML PROTEIN, 20C, pH 6.50
分辨率 3.10 Å R-free 0.298
1CKL N-TERMINAL TWO DOMAINS OF HUMAN CD46 (MEMBRANE COFACTOR PROTEIN, MCP) 提交 1999-04-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 35–160（126 aa） 片段：N-TERMINAL TWO SCR DOMAINS
未记录 CA CALCIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；16% PEG 8000, 40 MM CACL2, 100 MM NA-CACODYLATE PH 6.5, 7 MG/ML PROTEIN, 20C, pH 6.50
分辨率 3.10 Å R-free 0.298
1CKL N-TERMINAL TWO DOMAINS OF HUMAN CD46 (MEMBRANE COFACTOR PROTEIN, MCP) 提交 1999-04-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 E 35–160（126 aa） 片段：N-TERMINAL TWO SCR DOMAINS
未记录 CA CALCIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；16% PEG 8000, 40 MM CACL2, 100 MM NA-CACODYLATE PH 6.5, 7 MG/ML PROTEIN, 20C, pH 6.50
分辨率 3.10 Å R-free 0.298
1CKL N-TERMINAL TWO DOMAINS OF HUMAN CD46 (MEMBRANE COFACTOR PROTEIN, MCP) 提交 1999-04-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 F 35–160（126 aa） 片段：N-TERMINAL TWO SCR DOMAINS
未记录 CA CALCIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；16% PEG 8000, 40 MM CACL2, 100 MM NA-CACODYLATE PH 6.5, 7 MG/ML PROTEIN, 20C, pH 6.50
分辨率 3.10 Å R-free 0.298
2O39 Human Adenovirus type 11 knob in complex with domains SCR1 and SCR2 of CD46 (membrane cofactor protein, MCP) 提交 2006-12-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 C 35–160（126 aa） 片段：SCR1 and SCR 2 domains
未记录 CA CALCIUM ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；35% PEG 200, 200mM CaCl2, 100mM Tris, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.85 Å R-free 0.273
2O39 Human Adenovirus type 11 knob in complex with domains SCR1 and SCR2 of CD46 (membrane cofactor protein, MCP) 提交 2006-12-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 D 35–160（126 aa） 片段：SCR1 and SCR 2 domains
未记录 CA CALCIUM ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；35% PEG 200, 200mM CaCl2, 100mM Tris, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.85 Å R-free 0.273
3INB Structure of the measles virus hemagglutinin bound to the CD46 receptor 提交 2009-08-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 35–160（126 aa） 片段：Sushi domains 1 and 2, residues 35-160
链 D 35–160（126 aa） 片段：Sushi domains 1 and 2, residues 35-160
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；293 K；12% PEG-8000, 0.2 M Ammonium Sulphate 2% PEG-400, 1% 1,2,3 heptanetriol, 1 mM Sodium Tungstate, 0.1 M Mes, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.10 Å R-free 0.259
3L89 Human Adenovirus type 21 knob in complex with domains SCR1 and SCR2 of CD46 (membrane cofactor protein, MCP) 提交 2009-12-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 M 35–160（126 aa） 片段：CD46 SCR1 and SCR2 domains (UNP residues 35-160)
链 N 35–160（126 aa） 片段：CD46 SCR1 and SCR2 domains (UNP residues 35-160)
链 O 35–160（126 aa） 片段：CD46 SCR1 and SCR2 domains (UNP residues 35-160)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；298 K；6% PEG 8000, 0.1M LiCl, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 3.50 Å R-free 0.239
3L89 Human Adenovirus type 21 knob in complex with domains SCR1 and SCR2 of CD46 (membrane cofactor protein, MCP) 提交 2009-12-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 P 35–160（126 aa） 片段：CD46 SCR1 and SCR2 domains (UNP residues 35-160)
链 Q 35–160（126 aa） 片段：CD46 SCR1 and SCR2 domains (UNP residues 35-160)
链 R 35–160（126 aa） 片段：CD46 SCR1 and SCR2 domains (UNP residues 35-160)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；298 K；6% PEG 8000, 0.1M LiCl, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 3.50 Å R-free 0.239
3L89 Human Adenovirus type 21 knob in complex with domains SCR1 and SCR2 of CD46 (membrane cofactor protein, MCP) 提交 2009-12-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 S 35–160（126 aa） 片段：CD46 SCR1 and SCR2 domains (UNP residues 35-160)
链 T 35–160（126 aa） 片段：CD46 SCR1 and SCR2 domains (UNP residues 35-160)
链 U 35–160（126 aa） 片段：CD46 SCR1 and SCR2 domains (UNP residues 35-160)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；298 K；6% PEG 8000, 0.1M LiCl, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 3.50 Å R-free 0.239
3L89 Human Adenovirus type 21 knob in complex with domains SCR1 and SCR2 of CD46 (membrane cofactor protein, MCP) 提交 2009-12-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 V 35–160（126 aa） 片段：CD46 SCR1 and SCR2 domains (UNP residues 35-160)
链 W 35–160（126 aa） 片段：CD46 SCR1 and SCR2 domains (UNP residues 35-160)
链 X 35–160（126 aa） 片段：CD46 SCR1 and SCR2 domains (UNP residues 35-160)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；298 K；6% PEG 8000, 0.1M LiCl, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 3.50 Å R-free 0.239
3O8E Structure of extracelllar portion of CD46 in complex with Adenovirus type 11 knob 提交 2010-08-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 35–286（252 aa） 片段：CD46 SCR1-SCR4 (UNP RESIDUES 35-286)
未记录 DTD DITHIANE DIOL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8；298 K；microseeding, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
分辨率 2.84 Å R-free 0.229
3O8E Structure of extracelllar portion of CD46 in complex with Adenovirus type 11 knob 提交 2010-08-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 D 35–286（252 aa） 片段：CD46 SCR1-SCR4 (UNP RESIDUES 35-286)
未记录 DTD DITHIANE DIOL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8；298 K；microseeding, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
分辨率 2.84 Å R-free 0.229
8QK3 Human Adenovirus type 11 fiber knob in complex with its cell receptors, Desmoglein-2 and CD46 提交 2023-09-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 E 1–392（392 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å

共 6 个其他 PDB 条目、16 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 MCP_HUMAN
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 C； PDB构建体 1–252； UniProt 35–286

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 5fo8

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 5fo8
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id5fo8
沉积日期 deposition_date2015-11-18
结构标题 titleCrystal Structure of Human Complement C3b in Complex with MCP (CCP1-4)
关键词 keywordsLIPID BINDING, LIPID BIANDING, COMPLEMENT SYSTEM, IMMUNE SYSTEM, PLASMA PROTEIN, COFA ACTIVITY, REGULATORS OF COMPLEMENT ACTIVITY; LIPID BINDING
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier45.00 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron44.64 Å
零角强度 I(0) i0515804000.00
分子量 molecular_weight189400.0 kDa
排除体积 excluded_volume238230 ų
包络体积 envelope_volume335110 ų
水化壳体积 shell_volume63858 ų
包络直径 envelope_diameter154.1 Å
壳层 Rg shell_rg48.52 Å
包络 Rg envelope_rg43.49 Å
形状 Rg shape_rg44.62 Å
总 Rg total_rg44.91 Å
总原子数 total_atoms13313
残基数 n_residues1662
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax152.5 Å
Rg (实空间) rg_real45.05 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error1.53 Å
I(0) (实空间) i0_real5.1580e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error1.0050e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal45.00 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal515800000.0000
解质量估计 total_estimate0.8863
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary52.3 Å
偏度 Skewness skewness0.318
峰度 Kurtosis kurtosis-0.503
角度范围 angular_range— – 0.1750 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha53110000.0000
实空间数据点数 n_real_points36
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.877; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.963; Smooth: 0.922
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 14 domains

CATH v4.4 (14 domains)

结构域编号 domain_id5fo8A01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1930 — Macroglobulin (MG2) domain
结构域编号 domain_id5fo8A02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1930 — Macroglobulin (MG2) domain
结构域编号 domain_id5fo8A03
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1940 —
结构域编号 domain_id5fo8A04
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Immunoglobulins
结构域编号 domain_id5fo8A05
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1930 — Macroglobulin (MG2) domain
结构域编号 domain_id5fo8A06
类 Class class6 — Special
架构 Architecture architecture20 — Other non-globular
拓扑 Topology topology50 — N-terminal domain of TfIIb
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily160 —
结构域编号 domain_id5fo8B01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture20 — Single Sheet
拓扑 Topology topology130 — S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 —
结构域编号 domain_id5fo8B02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Immunoglobulins
结构域编号 domain_id5fo8B03
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1540 —
结构域编号 domain_id5fo8B04
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture50 — Alpha/alpha barrel
拓扑 Topology topology10 — Glycosyltransferase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 —
结构域编号 domain_id5fo8B05
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily690 — Alpha-macroglobulin, receptor-binding domain
结构域编号 domain_id5fo8B06
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily120 —
结构域编号 domain_id5fo8C01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture10 — Ribbon
拓扑 Topology topology70 — Complement Module; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Complement Module, domain 1
结构域编号 domain_id5fo8C02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture10 — Ribbon
拓扑 Topology topology70 — Complement Module; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Complement Module, domain 1
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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)