5gpg

Co-crystal structure of the FK506 binding domain of human FKBP25, Rapamycin and the FRB domain of human mTOR

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 63.1 Å Quality: GOOD

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP3

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 109–224	片段：UNP residues 109-224	Serine/threonine-protein kinase mTOR × 1 （P42345） RAP RAPAMYCIN IMMUNOSUPPRESSANT DRUG × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；30% polyethyleneglycol 8000, 100mM sodium cacodylate, 200mM sodium acetate, 10mM manganese chloride	分辨率 1.67 Å R-free 0.212

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 5GPG	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1PBK HOMOLOGOUS DOMAIN OF HUMAN FKBP25 提交 1995-09-01	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 109–224（116 aa）片段：FKBP12 HOMOLOGOUS DOMAIN, RESIDUES PRO 109 - ASP 2	未记录	RAP RAPAMYCIN IMMUNOSUPPRESSANT DRUG × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.50 Å R-free 0.243
2KFV Structure of the amino-terminal domain of human FK506-binding protein 3 / Northeast Structural Genomics Consortium Target HT99A 提交 2009-02-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–73（73 aa）片段：FKBP3-N Nterminal domain, residues 20-92	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.5；压力 ambient NMR样品组成 12.5 mg/ml [U-100% 13C; U-100% 15N] FKBP3-N, 10 mM TRIS, 500 mM NaCl, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
2MPH Solution Structure of human FK506 binding Protein 25 提交 2014-05-18	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–224（224 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）70；压力 ambient NMR样品组成 0.5 mM [U-13C; U-15N] human FK506 binding protein 25 (hFKBP25)-1, 10 % [U-100% 2H] D2O-2, 90 % H2O-3, 50 mM sodium chloride-4, 20 mM sodium phosphate-5, 0.001 % sodium azide-6, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.5 mM [U-15N] human FK506 binding protein 25 (hFKBP25)-7, 10 % [U-100% 2H] D2O-8, 90 % H2O-9, 50 mM sodium chloride-10, 20 mM sodium phosphate-11, 0.001 % sodium azide-12, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.5 mM [U-13C] human FK506 binding protein 25 (hFKBP25)-13, 100 % [U-100% 2H] D2O-14, 50 mM sodium chloride-15, 20 mM sodium phosphate-16, 0.001 % sodium phosphate-17, 100% D2O \| 100% D2O	分辨率未提供
5D75 Crystal structure of Human FKBD25 in complex with FK506 提交 2015-08-13	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 109–224（116 aa）片段：UNP RESIDUES 109-224	未记录	FK5 8-DEETHYL-8-[BUT-3-ENYL]-ASCOMYCIN × 1 JEF O-(O-(2-AMINOPROPYL)-O'-(2-METHOXYETHYL)POLYPROPYLENE GLYCOL 500) × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；30% v/v Jeffamine ED-2001, 0.1M HEPES pH 7.0	分辨率 1.83 Å R-free 0.233

共 4 个其他 PDB 条目、4 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	FKBP3_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 2–117； UniProt 109–224

Serine/threonine-protein kinase mTOR

Homo sapiens

UniProt P42345

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 2021–2112	片段：UNP residues 2021-2112 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP3 × 1 （Q00688） RAP RAPAMYCIN IMMUNOSUPPRESSANT DRUG × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；30% polyethyleneglycol 8000, 100mM sodium cacodylate, 200mM sodium acetate, 10mM manganese chloride	分辨率 1.67 Å R-free 0.212

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 5GPG	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1AUE FKBP-RAPAMYCIN BINDING DOMAIN (FRB) OF THE FKBP-RAPAMYCIN ASSOCIATED PROTEIN 提交 1997-08-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2015–2114（100 aa）片段：FKBP-RAPAMYCIN BINDING DOMAIN	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；HANGING DROPS AT 4 C, pH 8.0, vapor diffusion - hanging drop, temperature 277K	分辨率 2.33 Å R-free 0.339
1AUE FKBP-RAPAMYCIN BINDING DOMAIN (FRB) OF THE FKBP-RAPAMYCIN ASSOCIATED PROTEIN 提交 1997-08-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 2015–2114（100 aa）片段：FKBP-RAPAMYCIN BINDING DOMAIN	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；HANGING DROPS AT 4 C, pH 8.0, vapor diffusion - hanging drop, temperature 277K	分辨率 2.33 Å R-free 0.339
1FAP THE STRUCTURE OF THE IMMUNOPHILIN-IMMUNOSUPPRESSANT FKBP12-RAPAMYCIN COMPLEX INTERACTING WITH HUMAN FRAP 提交 1996-03-15	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 2018–2112（95 aa）片段：FRB	未记录	RAP RAPAMYCIN IMMUNOSUPPRESSANT DRUG × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.70 Å R-free 0.299
1NSG THE STRUCTURE OF THE IMMUNOPHILIN-IMMUNOSUPPRESSANT FKBP12-RAPAMYCIN COMPLEX INTERACTING WITH HUMAN FRAP 提交 1997-07-01	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 2019–2112（94 aa）	未记录	RAD C49-METHYL RAPAMYCIN × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.20 Å R-free 0.265
2FAP THE STRUCTURE OF THE IMMUNOPHILIN-IMMUNOSUPPRESSANT FKBP12-(C16)-ETHOXY RAPAMYCIN COMPLEX INTERACTING WITH HUMA 提交 1998-09-22	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 2019–2112（94 aa）片段：FRB	未记录	RAD C49-METHYL RAPAMYCIN × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；pH 8.5	分辨率 2.20 Å R-free 0.266
2GAQ NMR SOLUTION STRUCTURE OF THE FRB DOMAIN OF mTOR 提交 2006-03-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2015–2114（100 aa）片段：FRB DOMAIN	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.4；283 K；离子强度（mmCIF原始值）20 mM PBS 1 mM DTT；压力 ambient NMR样品组成 0.5 mM FRB U-15N \| PBS 10% D2O 90% H2O NMR样品组成 0.5 mM FRB U-15N \| PBS 100%D2O NMR样品组成 0.6 mM FRB U-15N, U-13C \| PBS 10% D2O 90% H2O	分辨率未提供
2NPU The solution structure of the rapamycin-binding domain of mTOR (FRB) 提交 2006-10-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2015–2114（100 aa）片段：FRB	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）100mM；压力 ambient NMR样品组成 0.1 mM FRB domain U-15N,13C; '25mM phosphate buffer; 90% H2O, 10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.1 mM FRB domain U-15N; 25mM phosphate buffer, 90% H2O, 10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.1 mM FRB domain U-15N,13C with unlabelled aromatics; 25mM phosphate buffer, 90% H2O, 10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
2RSE NMR structure of FKBP12-mTOR FRB domain-rapamycin complex structure determined based on PCS 提交 2012-01-25	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 2019–2112（94 aa）片段：UNP RESIDUES 2019-2112	未记录	TB TERBIUM(III) ION × 2	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.15；压力 ambient NMR样品组成 0.3 mM FKBP12-1, 0.3 mM [U-98% 15N] FRB-2, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
3FAP ATOMIC STRUCTURES OF THE RAPAMYCIN ANALOGS IN COMPLEX WITH BOTH HUMAN FKBP12 AND FRB DOMAIN OF FRAP 提交 1999-05-06	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 2019–2112（94 aa）片段：FRB	未记录	ARD C15-(R)-METHYLTHIENYL RAPAMYCIN × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8；20% PEG8000, 10% MPD, 0.1 M TRIS-HCL PH 8.5, pH 8.00	分辨率 1.85 Å R-free 0.273
3JBZ Crystal structure of mTOR docked into EM map of dimeric ATM kinase 提交 2015-11-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1385–2549（1165 aa）片段：C-terminal domain (UNP RESIDUES 1385-2020, 2119-2549)	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 MGF TRIFLUOROMAGNESATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 25 mM Tris pH 8.0, 100 mM NaCl, 1 mM TCEP, 10% glycerol；pH 8；25 mM Tris, 100 mM NaCl, 1 mM TCEP, 10% glycerol	分辨率 28.00 Å
4DRH Co-crystal structure of the PPIase domain of FKBP51, Rapamycin and the FRB fragment of mTOR at low pH 提交 2012-02-17	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 2025–2114（90 aa）片段：FRB domain, UNP RESIDUES 2025-2114	未记录	RAP RAPAMYCIN IMMUNOSUPPRESSANT DRUG × 1 SO4 SULFATE ION × 11	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 3.5；293 K；0.1M citric acid 2M (NH4)2SO4, pH 3.5, vapor diffusion, temperature 293K	分辨率 2.30 Å R-free 0.226
4DRH Co-crystal structure of the PPIase domain of FKBP51, Rapamycin and the FRB fragment of mTOR at low pH 提交 2012-02-17	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 2025–2114（90 aa）片段：FRB domain, UNP RESIDUES 2025-2114	未记录	RAP RAPAMYCIN IMMUNOSUPPRESSANT DRUG × 1 SO4 SULFATE ION × 10	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 3.5；293 K；0.1M citric acid 2M (NH4)2SO4, pH 3.5, vapor diffusion, temperature 293K	分辨率 2.30 Å R-free 0.226
4DRI Co-crystal structure of the PPIase domain of FKBP51, Rapamycin and the FRB fragment of mTOR 提交 2012-02-17	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 2025–2114（90 aa）片段：FRB domain, UNP residues 2025-2114	未记录	RAP RAPAMYCIN IMMUNOSUPPRESSANT DRUG × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；293 K；25% PEG3350, 0.1 M NaCl, 0.1M HEPES-NaOH pH 7.5, vapor diffusion, temperature 293K	分辨率 1.45 Å R-free 0.206
4DRJ o-crystal structure of the PPIase domain of FKBP52, Rapamycin and the FRB fragment of mTOR 提交 2012-02-17	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 2025–2114（90 aa）片段：FRB domain, UNP residues 2025-2114	未记录	RAP RAPAMYCIN IMMUNOSUPPRESSANT DRUG × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；293 K；0.1M BisTris, 1.95M (NH4)2SO4, pH 6.5, vapor diffusion, temperature 293K	分辨率 1.80 Å R-free 0.225
4FAP ATOMIC STRUCTURES OF THE RAPAMYCIN ANALOGS IN COMPLEX WITH BOTH HUMAN FKBP12 AND FRB DOMAIN OF FRAP 提交 1999-05-06	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 2019–2112（94 aa）片段：FRB	未记录	ARD C15-(R)-METHYLTHIENYL RAPAMYCIN × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8；20% PEG8000, 10% MPD, 0.1 M TRIS-HCL PH 8.5, pH 8.0	分辨率 2.80 Å R-free 0.266
4JSN structure of mTORdeltaN-mLST8 complex 提交 2013-03-22	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1376–2549（1174 aa）片段：FAT FRB KINASE	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；100 mM Tris, pH 8.5, 6-8% PEG 8000, 500 mM NaCl, 10 % (v/v) Glycerol, 10 mM DTT, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 3.20 Å R-free 0.256
4JSN structure of mTORdeltaN-mLST8 complex 提交 2013-03-22	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1376–2549（1174 aa）片段：FAT FRB KINASE	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；100 mM Tris, pH 8.5, 6-8% PEG 8000, 500 mM NaCl, 10 % (v/v) Glycerol, 10 mM DTT, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 3.20 Å R-free 0.256
4JSP structure of mTORDeltaN-mLST8-ATPgammaS-Mg complex 提交 2013-03-22	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1376–2549（1174 aa）片段：unp residues 1376-2549	未记录	AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；PEG 8000, NaCl , pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 3.30 Å R-free 0.268
4JSP structure of mTORDeltaN-mLST8-ATPgammaS-Mg complex 提交 2013-03-22	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1376–2549（1174 aa）片段：unp residues 1376-2549	未记录	AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；PEG 8000, NaCl , pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 3.30 Å R-free 0.268
4JSV mTOR kinase structure, mechanism and regulation. 提交 2013-03-22	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1376–2549（1174 aa）片段：unp residues 1376-2549	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 MGF TRIFLUOROMAGNESATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 hanging drop vapor diffusion；pH 8.5；277 K；PEG 8000, NaCl, pH 8.5, hanging drop vapor diffusion, temperature 277K	分辨率 3.50 Å R-free 0.251
4JSV mTOR kinase structure, mechanism and regulation. 提交 2013-03-22	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1376–2549（1174 aa）片段：unp residues 1376-2549	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 MGF TRIFLUOROMAGNESATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 hanging drop vapor diffusion；pH 8.5；277 K；PEG 8000, NaCl, pH 8.5, hanging drop vapor diffusion, temperature 277K	分辨率 3.50 Å R-free 0.251
4JSX structure of mTORDeltaN-mLST8-Torin2 complex 提交 2013-03-22	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1376–2549（1174 aa）片段：unp residues 1376-2549	未记录	17G 9-(6-aminopyridin-3-yl)-1-[3-(trifluoromethyl)phenyl]benzo[h][1,6]naphthyridin-2(1H)-one × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；PEG 8000, NaCl , pH 8.5, temperature 277K, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.50 Å R-free 0.257
4JSX structure of mTORDeltaN-mLST8-Torin2 complex 提交 2013-03-22	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1376–2549（1174 aa）片段：unp residues 1376-2549	未记录	17G 9-(6-aminopyridin-3-yl)-1-[3-(trifluoromethyl)phenyl]benzo[h][1,6]naphthyridin-2(1H)-one × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；PEG 8000, NaCl , pH 8.5, temperature 277K, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.50 Å R-free 0.257
4JT5 mTORdeltaN-mLST8-pp242 complex 提交 2013-03-22	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1376–2549（1174 aa）	未记录	P2X 2-[4-amino-1-(propan-2-yl)-1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-3-yl]-1H-indol-5-ol × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；PEG 8000, NaCl , pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 3.45 Å R-free 0.271
4JT5 mTORdeltaN-mLST8-pp242 complex 提交 2013-03-22	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1376–2549（1174 aa）	未记录	P2X 2-[4-amino-1-(propan-2-yl)-1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-3-yl]-1H-indol-5-ol × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；PEG 8000, NaCl , pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 3.45 Å R-free 0.271
4JT6 structure of mTORDeltaN-mLST8-PI-103 complex 提交 2013-03-22	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1376–2549（1174 aa）片段：unp residues 1376-2549	未记录	X6K 3-(4-MORPHOLIN-4-YLPYRIDO[3',2':4,5]FURO[3,2-D]PYRIMIDIN-2-YL)PHENOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；PEG 8000, NaCl, pH 8.5, hanging drop vapor diffusion, temperature 277K, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.60 Å R-free 0.275
4JT6 structure of mTORDeltaN-mLST8-PI-103 complex 提交 2013-03-22	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1376–2549（1174 aa）片段：unp residues 1376-2549	未记录	X6K 3-(4-MORPHOLIN-4-YLPYRIDO[3',2':4,5]FURO[3,2-D]PYRIMIDIN-2-YL)PHENOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；PEG 8000, NaCl, pH 8.5, hanging drop vapor diffusion, temperature 277K, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.60 Å R-free 0.275
5FLC Architecture of human mTOR Complex 1 - 5.9 Angstrom reconstruction 提交 2015-10-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 B 1382–2549（1168 aa）片段：FAT AND PIKK DOMAINS 链 F 1382–2549（1168 aa）片段：FAT AND PIKK DOMAINS	未记录	RAP RAPAMYCIN IMMUNOSUPPRESSANT DRUG × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 100 MM NACL, 10 MM NABICINE, 1 MM TCEP；pH 8；100 MM NACL, 10 MM NABICINE, 1 MM TCEP cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 100, TEMPERATURE- 120, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK I, METHOD- 4 SECOND BLOTTING,	分辨率 5.90 Å
5H64 Cryo-EM structure of mTORC1 提交 2016-11-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–2549（2549 aa）链 a 1–2549（2549 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.40 Å
5WBH Structure of the FRB domain of mTOR bound to a substrate recruitment peptide of S6K1 提交 2017-06-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2018–2114（97 aa）片段：residues 2018-2114	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；289 K；tacsimate	分辨率 1.75 Å R-free 0.210
5WBH Structure of the FRB domain of mTOR bound to a substrate recruitment peptide of S6K1 提交 2017-06-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 2018–2114（97 aa）片段：residues 2018-2114	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；289 K；tacsimate	分辨率 1.75 Å R-free 0.210
5WBH Structure of the FRB domain of mTOR bound to a substrate recruitment peptide of S6K1 提交 2017-06-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 2018–2114（97 aa）片段：residues 2018-2114	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；289 K；tacsimate	分辨率 1.75 Å R-free 0.210
5WBH Structure of the FRB domain of mTOR bound to a substrate recruitment peptide of S6K1 提交 2017-06-29	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 2018–2114（97 aa）片段：residues 2018-2114	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；289 K；tacsimate	分辨率 1.75 Å R-free 0.210
5WBH Structure of the FRB domain of mTOR bound to a substrate recruitment peptide of S6K1 提交 2017-06-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 E 2018–2114（97 aa）片段：residues 2018-2114	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；289 K；tacsimate	分辨率 1.75 Å R-free 0.210
5WBU Crystal structure of mTOR(deltaN)-mLST8-PRAS40(alpha-helix & beta-strand) complex 提交 2017-06-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1376–2549（1174 aa）片段：residues 1376-2549	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；PEG 8000	分辨率 3.42 Å R-free 0.266
5WBU Crystal structure of mTOR(deltaN)-mLST8-PRAS40(alpha-helix & beta-strand) complex 提交 2017-06-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1376–2549（1174 aa）片段：residues 1376-2549	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；PEG 8000	分辨率 3.42 Å R-free 0.266
5WBY Crystal structure of mTOR(deltaN)-mLST8-PRAS40(beta-strand) complex 提交 2017-06-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1376–2549（1174 aa）片段：residues 1376-2549	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；289 K；tacsimate	分辨率 3.10 Å R-free 0.276
5WBY Crystal structure of mTOR(deltaN)-mLST8-PRAS40(beta-strand) complex 提交 2017-06-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1376–2549（1174 aa）片段：residues 1376-2549	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；289 K；tacsimate	分辨率 3.10 Å R-free 0.276
5ZCS 4.9 Angstrom Cryo-EM structure of human mTOR complex 2 提交 2018-02-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 1–2549（2549 aa）链 B 1–2549（2549 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.90 Å
6BCU Cryo-EM structure of the activated RHEB-mTORC1 refined to 3.4 angstrom 提交 2017-10-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 A 579–2549（1971 aa）链 B 579–2549（1971 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
6BCX mTORC1 structure refined to 3.0 angstroms 提交 2017-10-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 579–2549（1971 aa）链 B 579–2549（1971 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.23 Å
6M4U Crystal structure of FKBP-FRB T2098L mutant in complex with rapamycin 提交 2020-03-09	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 2021–2113（93 aa）	突变：T2098L	RAP RAPAMYCIN IMMUNOSUPPRESSANT DRUG × 1 ZN ZINC ION × 8 CL CHLORIDE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM cacodylic acid buffer (pH 6.5), 350 mM zinc acetate and 8% (w/v) isopropanol	分辨率 2.20 Å R-free 0.258
6M4U Crystal structure of FKBP-FRB T2098L mutant in complex with rapamycin 提交 2020-03-09	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 2021–2113（93 aa）	突变：T2098L	RAP RAPAMYCIN IMMUNOSUPPRESSANT DRUG × 1 ZN ZINC ION × 6 CL CHLORIDE ION × 3 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM cacodylic acid buffer (pH 6.5), 350 mM zinc acetate and 8% (w/v) isopropanol	分辨率 2.20 Å R-free 0.258
6M4W Crystal structure of MBP fused split FKBP-FRB T2098L mutant in complex with rapamycin 提交 2020-03-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 G 2021–2113（93 aa）	突变：T2098L	RAP RAPAMYCIN IMMUNOSUPPRESSANT DRUG × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM Tris-HCl buffer (pH 7.0), 200 mM calcium acetate and 20% (w/v) PEG 3000	分辨率 3.11 Å R-free 0.278
6M4W Crystal structure of MBP fused split FKBP-FRB T2098L mutant in complex with rapamycin 提交 2020-03-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 2021–2113（93 aa）	突变：T2098L	RAP RAPAMYCIN IMMUNOSUPPRESSANT DRUG × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM Tris-HCl buffer (pH 7.0), 200 mM calcium acetate and 20% (w/v) PEG 3000	分辨率 3.11 Å R-free 0.278
6M4W Crystal structure of MBP fused split FKBP-FRB T2098L mutant in complex with rapamycin 提交 2020-03-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 信息不足异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 I 2021–2113（93 aa）	突变：T2098L	RAP RAPAMYCIN IMMUNOSUPPRESSANT DRUG × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM Tris-HCl buffer (pH 7.0), 200 mM calcium acetate and 20% (w/v) PEG 3000	分辨率 3.11 Å R-free 0.278
6SB0 cryo-EM structure of mTORC1 bound to PRAS40-fused active RagA/C GTPases 提交 2019-07-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 A 60–355（296 aa）链 A 381–2549（2169 aa）链 B 60–355（296 aa）链 B 381–2549（2169 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7；50mM HEPES pH 7.0, 100mM NaCl, 2mM MgCl2, 1mM TCEP cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.50 Å
6SB2 cryo-EM structure of mTORC1 bound to active RagA/C GTPases 提交 2019-07-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 A 60–355（296 aa）链 A 381–2549（2169 aa）链 B 60–355（296 aa）链 B 381–2549（2169 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7；100mM Tris-HCl pH7.0, 260mM NaCl, 5mM MgCl2, 1mM TCEP cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.20 Å
6ZWM cryo-EM structure of human mTOR complex 2, overall refinement 提交 2020-07-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 1–2549（2549 aa）链 B 1–2549（2549 aa）	未记录	AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 2 ACE ACETYL GROUP × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.20 Å
6ZWO cryo-EM structure of human mTOR complex 2, focused on one half 提交 2020-07-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–2549（2549 aa）	未记录	AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1 ACE ACETYL GROUP × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.00 Å
7OWG human DEPTOR in a complex with mutant human mTORC1 A1459P 提交 2021-06-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：Octameric	链 B 1–16（16 aa）链 B 31–36（6 aa）链 B 54–355（302 aa）链 B 379–2549（2171 aa）	突变：A1459P 突变：A1459P 突变：A1459P 突变：A1459P	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM HEPES, pH 7.5, 200 mM NaCl, 1 mM TCEP, 1 mM MgCl2, 500 uM AMP-PNP cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；blotting time of 2 s and a force of -15.	分辨率 4.70 Å
7PE7 cryo-EM structure of DEPTOR bound to human mTOR complex 2, overall refinement 提交 2021-08-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 A 1–2549（2549 aa）链 B 1–2549（2549 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 2 ACE ACETYL GROUP × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.41 Å
7PE8 cryo-EM structure of DEPTOR bound to human mTOR complex 2, focussed on one protomer 提交 2021-08-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 1–2549（2549 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1 ACE ACETYL GROUP × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
7PE9 cryo-EM structure of DEPTOR bound to human mTOR complex 2, DEPt-bound subset local refinement 提交 2021-08-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 1–2549（2549 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1 ACE ACETYL GROUP × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
7PEA cryo-EM structure of DEPTOR bound to human mTOR complex 1, overall refinement 提交 2021-08-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 1–16（16 aa）链 A 31–36（6 aa）链 A 54–355（302 aa）链 A 381–2549（2169 aa）链 B 1–16（16 aa）链 B 31–36（6 aa）链 B 54–355（302 aa）链 B 381–2549（2169 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.07 Å
7PEB cryo-EM structure of DEPTOR bound to human mTOR complex 1, focussed on one protomer 提交 2021-08-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–16（16 aa）链 A 31–36（6 aa）链 A 54–355（302 aa）链 A 381–2549（2169 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.67 Å
7PEC cryo-EM structure of DEPTOR bound to human mTOR complex 1, DEPt-bound subset local refinement 提交 2021-08-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–16（16 aa）链 A 31–36（6 aa）链 A 54–355（302 aa）链 A 381–2549（2169 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.24 Å
7TZO The apo structure of human mTORC2 complex 提交 2022-02-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 1–2549（2549 aa）链 B 1–2549（2549 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.28 Å
7UXC cryo-EM structure of the mTORC1-TFEB-Rag-Ragulator complex with symmetry expansion 提交 2022-05-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric	链 A 1–2549（2549 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
7UXH cryo-EM structure of the mTORC1-TFEB-Rag-Ragulator complex 提交 2022-05-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric	链 A 1–2549（2549 aa）链 C 1–2549（2549 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8ERA RMC-5552 in complex with mTORC1 and FKBP12 提交 2022-10-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–2549（2549 aa）	未记录	XZ9 1-[6-{[(3M)-4-amino-3-(2-amino-1,3-benzoxazol-5-yl)-1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-1-yl]methyl}-3,4-dihydroisoquinolin-2(1H)-yl]-3-hydroxypropan-1-one × 1 XYU (3S,5R,6R,7E,9R,10R,12R,14S,15E,17E,19E,21S,23S,26R,27R,30R,34aS)-5,9,27-trihydroxy-3-{(2R)-1-[(1S,3R,4R)-4-hydroxy-3-methoxycyclohexyl]propan-2-yl}-10,21-dimethoxy-6,8,12,14,20,26-hexamethyl-5,6,9,10,12,13,14,21,22,23,24,25,26,27,32,33,34,34a-octadecahydro-3H-23,27-epoxypyrido[2,1-c][1,4]oxazacyclohentriacontine-1,11,28,29(4H,31H)-tetrone × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.86 Å
8PPZ Co-crystal structure of FKBP12, compound 7 and the FRB fragment of mTOR 提交 2023-07-10	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 2025–2114（90 aa）	未记录	0AN (1~{S},5~{S},6~{R})-10-[3,5-bis(chloranyl)phenyl]sulfonyl-5-[(~{E})-2-(2-chlorophenyl)ethenyl]-3-(pyridin-2-ylmethyl)-3,10-diazabicyclo[4.3.1]decan-2-one × 1 CA CALCIUM ION × 4 ACT ACETATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG8000, 0.1 M HEPES pH 7.5, 0.2 M calcium actetate	分辨率 1.85 Å R-free 0.238
8RCH CryoEM structure of mTORC1 with a paediatric kidney cancer-associated 1455-EWED-1458 duplication in mTOR, overall refinement 提交 2023-12-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 1–2549（2549 aa）链 B 1–2549（2549 aa）	未记录	ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
8RCK CryoEM structure of mTORC1 with a paediatric kidney cancer-associated 1455-EWED-1458 duplication in mTOR, Focused on one protomer copy. 提交 2023-12-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–2549（2549 aa）	未记录	ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8RCN CryoEM structure of mTORC1 with a paediatric kidney cancer-associated 1455-EWED-1458 duplication in mTOR, Focused region of mTOR and RAPTOR on one protomer copy. 提交 2023-12-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–2549（2549 aa）	未记录	ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8XI9 Crystal structure of FRB-FKBP fusion protein in complex with rapamycin 提交 2023-12-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2023–2114（92 aa）	未记录	RAP RAPAMYCIN IMMUNOSUPPRESSANT DRUG × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；293 K；4.4M Sodium Acetate	分辨率 1.85 Å R-free 0.218
9DBO Crystal structure of a synthetic Fab (R3E9) in complex with the FRB domain of mTOR 提交 2024-08-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 2021–2113（93 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；0.2 M Calcium chloride dihydrate 16% PEG 3350	分辨率 1.55 Å R-free 0.217
9DL0 Crystal structure of a synthetic Fab (R3H8) in complex with the FRB domain of mTOR 提交 2024-09-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 G 2021–2113（93 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；0.1 M HEPES pH 7.5 4% PEG 400 2.2 M ammonium sulfate	分辨率 2.00 Å R-free 0.234
9DL0 Crystal structure of a synthetic Fab (R3H8) in complex with the FRB domain of mTOR 提交 2024-09-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 I 2021–2113（93 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；0.1 M HEPES pH 7.5 4% PEG 400 2.2 M ammonium sulfate	分辨率 2.00 Å R-free 0.234
9ED4 A composite map of mTORC1-Rag-Ragultor-4EBP1 on membrane 提交 2024-11-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric	链 A 1–2549（2549 aa）链 O 1–2549（2549 aa）	未记录	GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 8 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.23 Å
9ED7 Active state of mTOR on membrane 提交 2024-11-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–2549（2549 aa）	未记录	ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 3 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.16 Å
9ED8 Intermediate state of mTOR on membrane 提交 2024-11-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–2549（2549 aa）	未记录	ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.61 Å
9F44 cryo-EM structure of LST2 TOS peptide bound to human mTOR complex 1 提交 2024-04-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 1–2549（2549 aa）链 B 1–2549（2549 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.68 Å
9F45 cryo-EM structure of human LST2 bound to human mTOR complex 1 提交 2024-04-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 1–2549（2549 aa）链 B 1–2549（2549 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.74 Å
9NGT Crystal structure of CRBN-DDB1 and FPFT-2216 in complex with mTOR 提交 2025-02-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 2018–2114（97 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 A1BC8 (3S)-3-[(4M)-4-(4-methoxythiophen-3-yl)-1H-1,2,3-triazol-1-yl]piperidine-2,6-dione × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；70 mM MES pH 6.0, 1.8-3.2 % (w/v) PEG 3,000, and 13-24 % (w/v) PEG 200	分辨率 2.95 Å R-free 0.260
9T7J cryo-EM structure of AKT phosphorylated mTOR complex 2, overall refinement 提交 2025-11-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 1–2549（2549 aa）链 B 1–2549（2549 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
9T92 cryo-EM structure of autophosphorylated mTOR complex 2, overall refinement 提交 2025-11-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 1–2549（2549 aa）链 B 1–2549（2549 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
9T93 cryo-EM structure of autophosphorylated mTOR complex 2, focused on a single protomer 提交 2025-11-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–2549（2549 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.86 Å
9T94 cryo-EM structure of AKT phosphorylated mTOR complex 2, focused on a single protomer 提交 2025-11-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–2549（2549 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.60 Å
9TDS cryo-EM structure of dephosphorylated mTOR complex 2, overall refinement 提交 2025-11-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 1–2549（2549 aa）链 B 1–2549（2549 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
9TDT cryo-EM structure of dephosphorylated mTOR complex 2, focused on a single protomer 提交 2025-11-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–2549（2549 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
9TPW cryo-ET structure of mTOR complex 2 on a PIP2-containing membrane 提交 2025-12-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 1–2549（2549 aa）链 B 1–2549（2549 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.40 Å
9ZBJ Cryo-EM structure of human apo mTORC2 提交 2025-11-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 203–2549（2347 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
9ZBK mTORC2 in complex with Akt1 提交 2025-11-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 80–2549（2470 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 A1AID (1M,9M)-1-{4-[4-(prop-2-enoyl)piperazin-1-yl]-3-(trifluoromethyl)phenyl}-9-(quinolin-3-yl)benzo[h][1,6]naphthyridin-2(1H)-one × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.60 Å

共 66 个其他 PDB 条目、84 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	MTOR_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 2–93； UniProt 2021–2112

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	5gpg
沉积日期 deposition_date	2016-08-02
结构标题 title	Co-crystal structure of the FK506 binding domain of human FKBP25, Rapamycin and the FRB domain of human mTOR
关键词 keywords	complex, kinase, ISOMERASE-TRANSFERASE complex; ISOMERASE/TRANSFERASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	19.07 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	18.00 Å
零角强度 I(0) i0	10275800.00
分子量 molecular_weight	24471.0 kDa
排除体积 excluded_volume	30939 Å³
包络体积 envelope_volume	35110 Å³
水化壳体积 shell_volume	16733 Å³
包络直径 envelope_diameter	63.9 Å
壳层 Rg shell_rg	23.71 Å
包络 Rg envelope_rg	18.29 Å
形状 Rg shape_rg	17.95 Å
总 Rg total_rg	19.11 Å
总原子数 total_atoms	1721
残基数 n_residues	202
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	63.1 Å
Rg (实空间) rg_real	19.03 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.39 Å
I(0) (实空间) i0_real	1.0280e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	1.2510e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal	19.04 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	10280000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8890
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	21.9 Å
偏度 Skewness skewness	0.292
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.344
角度范围 angular_range	— – 0.4150 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	1941000.0000
实空间数据点数 n_real_points	73
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.854; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.994; Smooth: 0.998

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP3
分子量 formula_weight	13047.0 kDa
EC 编号 ec_number	5.2.1.8
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	2009

SPKYTKSVLKKGDKTNFPKKGDVVHCWYTGTLQDGTVFDTNIQTSAKKKKNAKPLSFKVGVGKVIRGWDEALLTMSKGEKARLEIEPEWAYGKKGQPDAKIPPNAKLTFEVELVDID

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Serine/threonine-protein kinase mTOR
分子量 formula_weight	11352.8 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.11.1
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

SILWHEMWHEGLEEASRLYFGERNVKGMFEVLEPLHAMMERGPQTLKETSFNQAYGRDLMEAQEWCRKYMKSGNVKDLTQAWDLYYHVFRRIS

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	RAPAMYCIN IMMUNOSUPPRESSANT DRUG
分子量 formula_weight	914.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 4 Entity 4 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	288

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_id	d5gpga1
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.26 — FKBP-like
超家族 Superfamily superfamily	d.26.1 — FKBP-like
家族 Family family	d.26.1.1 — FKBP immunophilin/proline isomerase

结构域编号 domain_id	d5gpga2
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d5gpgb1
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.24 — Four-helical up-and-down bundle
超家族 Superfamily superfamily	a.24.7 — FKBP12-rapamycin-binding domain of FKBP-rapamycin-associated protein (FRAP)
家族 Family family	a.24.7.1 — FKBP12-rapamycin-binding domain of FKBP-rapamycin-associated protein (FRAP)

结构域编号 domain_id	d5gpgb2
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id	5gpgA00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	10 — Roll
拓扑 Topology topology	50 — Chitinase A; domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 —

结构域编号 domain_id	5gpgB00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	120 — Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	150 — FKBP12-rapamycin binding domain

▶

8. 引用文献 (1)

▶

晶胞边长 a length_a	46.038 Å
晶胞边长 b length_b	58.352 Å
晶胞边长 c length_c	86.502 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	P 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	19
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.670 Å
最低分辨率 resolution_low	27.730 Å
R 因子 r_factor	0.1760
R_work r_work	0.1740
R_free r_free	0.2120

fit	/app/data/saxs_computation/gp/5gpg/5gpg.fit
pddf	/app/data/pr_computation/gp/5gpg/5gpg.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/gp/5gpg/5gpg.dat

Co-crystal structure of the FK506 binding domain of human FKBP25, Rapamycin and the FRB domain of human mTOR

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Serine/threonine-protein kinase mTOR

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

CATH v4.4 (2 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)