Jasmonic acid-amido synthetase JAR1
Arabidopsis thaliana
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白拷贝数一致 | 链 A; UniProt 1–575 | 未记录 | Glutathione S-transferase class-mu 26 kDa isozyme × 2 (P08515) JAA {(1R,2R)-3-oxo-2-[(2Z)-pent-2-en-1-yl]cyclopentyl}acetic acid × 1 GSH Glutathione × 2 | X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:VAPOR DIFFUSION;pH 8.5;297 K;0.2 M Magnesium chloride hexahydrate, 0.1 M Tris-HCl, 40%(w/v) PEG 4000 | 分辨率 2.39 Å R-free 0.234 |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 5GZZ | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4EPL Crystal Structure of Arabidopsis thaliana GH3.11 (JAR1) in Complex with JA-Ile 提交 2012-04-17 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1–575(575 aa)
|
未记录 | JAI N-({(1R,2R)-3-oxo-2-[(2Z)-pent-2-en-1-yl]cyclopentyl}acetyl)-L-isoleucine × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;277 K;1.5 M tartrate, 0.1 M MOPSO, 5 mM ATP, 5 mM MgCl2, 5mM jasmonic acid, 5 mM isoleucine, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.01 Å R-free 0.210 |
| 4EPL Crystal Structure of Arabidopsis thaliana GH3.11 (JAR1) in Complex with JA-Ile 提交 2012-04-17 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–575(575 aa)
|
未记录 | JAI N-({(1R,2R)-3-oxo-2-[(2Z)-pent-2-en-1-yl]cyclopentyl}acetyl)-L-isoleucine × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;277 K;1.5 M tartrate, 0.1 M MOPSO, 5 mM ATP, 5 mM MgCl2, 5mM jasmonic acid, 5 mM isoleucine, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.01 Å R-free 0.210 |
| 5ECH Crystal Structure of FIN219-FIP1 complex with JA and ATP 提交 2015-10-20 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
1–575(575 aa)
|
未记录 | JAA {(1R,2R)-3-oxo-2-[(2Z)-pent-2-en-1-yl]cyclopentyl}acetic acid × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GSH Glutathione × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;297 K;0.2 M sodium acetate trihydrate, 0.1 M Tris-HCl, 30%(w/v) PEG 3000
|
分辨率 2.14 Å R-free 0.180 |
| 5ECH Crystal Structure of FIN219-FIP1 complex with JA and ATP 提交 2015-10-20 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 D
1–575(575 aa)
|
未记录 | JAA {(1R,2R)-3-oxo-2-[(2Z)-pent-2-en-1-yl]cyclopentyl}acetic acid × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GSH Glutathione × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;297 K;0.2 M sodium acetate trihydrate, 0.1 M Tris-HCl, 30%(w/v) PEG 3000
|
分辨率 2.14 Å R-free 0.180 |
| 5ECI Crystal Structure of FIN219-FIP1 complex with JA, ATP and Mg 提交 2015-10-20 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
1–575(575 aa)
|
未记录 | JAA {(1R,2R)-3-oxo-2-[(2Z)-pent-2-en-1-yl]cyclopentyl}acetic acid × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GSH Glutathione × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;297 K;0.2 M sodium acetate trihydrate, 0.1 M Tris-HCl, 30%(w/v) PEG 3000
|
分辨率 1.56 Å R-free 0.225 |
| 5ECI Crystal Structure of FIN219-FIP1 complex with JA, ATP and Mg 提交 2015-10-20 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 D
1–575(575 aa)
|
未记录 | JAA {(1R,2R)-3-oxo-2-[(2Z)-pent-2-en-1-yl]cyclopentyl}acetic acid × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GSH Glutathione × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;297 K;0.2 M sodium acetate trihydrate, 0.1 M Tris-HCl, 30%(w/v) PEG 3000
|
分辨率 1.56 Å R-free 0.225 |
| 5ECK Crystal Structure of FIN219-FIP1 complex with JA, Ile and ATP 提交 2015-10-20 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
1–575(575 aa)
|
未记录 | ILE ISOLEUCINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 JAA {(1R,2R)-3-oxo-2-[(2Z)-pent-2-en-1-yl]cyclopentyl}acetic acid × 1 GSH Glutathione × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;297 K;0.2 M sodium acetate trihydrate, 0.1 M Tris-HCl, 30%(w/v) PEG 3000
|
分辨率 1.54 Å R-free 0.175 |
| 5ECK Crystal Structure of FIN219-FIP1 complex with JA, Ile and ATP 提交 2015-10-20 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 D
1–575(575 aa)
|
未记录 | ILE ISOLEUCINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 JAA {(1R,2R)-3-oxo-2-[(2Z)-pent-2-en-1-yl]cyclopentyl}acetic acid × 1 GSH Glutathione × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;297 K;0.2 M sodium acetate trihydrate, 0.1 M Tris-HCl, 30%(w/v) PEG 3000
|
分辨率 1.54 Å R-free 0.175 |
| 5ECL Crystal Structure of FIN219-FIP1 complex with JA, Ile and Mg 提交 2015-10-20 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
1–575(575 aa)
|
未记录 | JAA {(1R,2R)-3-oxo-2-[(2Z)-pent-2-en-1-yl]cyclopentyl}acetic acid × 1 ILE ISOLEUCINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GSH Glutathione × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;297 K;0.2 M sodium acetate trihydrate, 0.1 M Tris-HCl, 30%(w/v) PEG 3000
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.219 |
| 5ECL Crystal Structure of FIN219-FIP1 complex with JA, Ile and Mg 提交 2015-10-20 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 D
1–575(575 aa)
|
未记录 | JAA {(1R,2R)-3-oxo-2-[(2Z)-pent-2-en-1-yl]cyclopentyl}acetic acid × 1 ILE ISOLEUCINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 3 GSH Glutathione × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;297 K;0.2 M sodium acetate trihydrate, 0.1 M Tris-HCl, 30%(w/v) PEG 3000
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.219 |
| 5ECM Crystal Structure of FIN219-FIP1 complex with JA and Leu 提交 2015-10-20 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
1–575(575 aa)
|
未记录 | JAA {(1R,2R)-3-oxo-2-[(2Z)-pent-2-en-1-yl]cyclopentyl}acetic acid × 1 LEU LEUCINE × 1 GSH Glutathione × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;297 K;0.2 M sodium acetate trihydrate, 0.1 M Tris-HCl, 30%(w/v) PEG 3000
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.245 |
| 5ECM Crystal Structure of FIN219-FIP1 complex with JA and Leu 提交 2015-10-20 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 D
1–575(575 aa)
|
未记录 | JAA {(1R,2R)-3-oxo-2-[(2Z)-pent-2-en-1-yl]cyclopentyl}acetic acid × 1 LEU LEUCINE × 1 GSH Glutathione × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;297 K;0.2 M sodium acetate trihydrate, 0.1 M Tris-HCl, 30%(w/v) PEG 3000
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.245 |
| 5ECN Crystal Structure of FIN219-FIP1 complex with JA, Leu and ATP 提交 2015-10-20 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
1–575(575 aa)
|
未记录 | JAA {(1R,2R)-3-oxo-2-[(2Z)-pent-2-en-1-yl]cyclopentyl}acetic acid × 1 LEU LEUCINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GSH Glutathione × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;297 K;0.2 M sodium acetate trihydrate, 0.1 M Tris-HCl, 30%(w/v) PEG 3000
|
分辨率 1.72 Å R-free 0.188 |
| 5ECN Crystal Structure of FIN219-FIP1 complex with JA, Leu and ATP 提交 2015-10-20 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 D
1–575(575 aa)
|
未记录 | JAA {(1R,2R)-3-oxo-2-[(2Z)-pent-2-en-1-yl]cyclopentyl}acetic acid × 1 LEU LEUCINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GSH Glutathione × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;297 K;0.2 M sodium acetate trihydrate, 0.1 M Tris-HCl, 30%(w/v) PEG 3000
|
分辨率 1.72 Å R-free 0.188 |
| 5ECO Crystal Structure of FIN219-FIP1 complex with JA, Leu and Mg 提交 2015-10-20 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
1–575(575 aa)
|
未记录 | JAA {(1R,2R)-3-oxo-2-[(2Z)-pent-2-en-1-yl]cyclopentyl}acetic acid × 1 LEU LEUCINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GSH Glutathione × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;297 K;0.2 M sodium acetate trihydrate, 0.1 M Tris-HCl, 30%(w/v) PEG 3000
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.239 |
| 5ECO Crystal Structure of FIN219-FIP1 complex with JA, Leu and Mg 提交 2015-10-20 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 D
1–575(575 aa)
|
未记录 | JAA {(1R,2R)-3-oxo-2-[(2Z)-pent-2-en-1-yl]cyclopentyl}acetic acid × 1 LEU LEUCINE × 1 GSH Glutathione × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;297 K;0.2 M sodium acetate trihydrate, 0.1 M Tris-HCl, 30%(w/v) PEG 3000
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.239 |
| 5ECP Crystal Structure of FIN219-FIP1 complex with JA, MET and ATP 提交 2015-10-20 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
1–575(575 aa)
|
未记录 | JAA {(1R,2R)-3-oxo-2-[(2Z)-pent-2-en-1-yl]cyclopentyl}acetic acid × 1 MET METHIONINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GSH Glutathione × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;297 K;0.2 M sodium acetate trihydrate, 0.1 M Tris-HCl, 30%(w/v) PEG 3000
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.208 |
| 5ECP Crystal Structure of FIN219-FIP1 complex with JA, MET and ATP 提交 2015-10-20 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 D
1–575(575 aa)
|
未记录 | JAA {(1R,2R)-3-oxo-2-[(2Z)-pent-2-en-1-yl]cyclopentyl}acetic acid × 1 MET METHIONINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GSH Glutathione × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;297 K;0.2 M sodium acetate trihydrate, 0.1 M Tris-HCl, 30%(w/v) PEG 3000
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.208 |
| 5ECQ Crystal Structure of FIN219-FIP1 complex with JA, VAL and ATP 提交 2015-10-20 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
1–575(575 aa)
|
未记录 | JAA {(1R,2R)-3-oxo-2-[(2Z)-pent-2-en-1-yl]cyclopentyl}acetic acid × 1 VAL VALINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GSH Glutathione × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;297 K;0.2 M sodium acetate trihydrate, 0.1 M Tris-HCl, 30%(w/v) PEG 3000
|
分辨率 1.66 Å R-free 0.234 |
| 5ECQ Crystal Structure of FIN219-FIP1 complex with JA, VAL and ATP 提交 2015-10-20 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 D
1–575(575 aa)
|
未记录 | JAA {(1R,2R)-3-oxo-2-[(2Z)-pent-2-en-1-yl]cyclopentyl}acetic acid × 1 VAL VALINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GSH Glutathione × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;297 K;0.2 M sodium acetate trihydrate, 0.1 M Tris-HCl, 30%(w/v) PEG 3000
|
分辨率 1.66 Å R-free 0.234 |
| 5ECR Crystal Structure of FIN219-FIP1 complex with JA, VAL and Mg 提交 2015-10-20 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
1–575(575 aa)
|
未记录 | JAA {(1R,2R)-3-oxo-2-[(2Z)-pent-2-en-1-yl]cyclopentyl}acetic acid × 1 VAL VALINE × 1 GSH Glutathione × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;297 K;0.2 M sodium acetate trihydrate, 0.1 M Tris-HCl, 30%(w/v) PEG 3000
|
分辨率 1.72 Å R-free 0.281 |
| 5ECR Crystal Structure of FIN219-FIP1 complex with JA, VAL and Mg 提交 2015-10-20 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 D
1–575(575 aa)
|
未记录 | JAA {(1R,2R)-3-oxo-2-[(2Z)-pent-2-en-1-yl]cyclopentyl}acetic acid × 1 VAL VALINE × 1 GSH Glutathione × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;297 K;0.2 M sodium acetate trihydrate, 0.1 M Tris-HCl, 30%(w/v) PEG 3000
|
分辨率 1.72 Å R-free 0.281 |
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| UniProt名称 | JAR1_ARATH |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A; PDB构建体 1–575; UniProt 1–575 |