Histone acetyltransferase p300,Histone acetyltransferase p300
Homo sapiens
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白拷贝数一致 | 链 A; UniProt 1043–1519 链 A; UniProt 1581–1666 | 片段:UNP residues 1043-1519,UNP residues 1581-1666 突变:Y1467F,Y1467F | ZN ZINC ION × 4 BCO Butyryl Coenzyme A × 1 GOL GLYCEROL × 3 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;Tris, PEG MME 2000 | 分辨率 2.04 Å R-free 0.204 |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 5LKT | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1L3E NMR Structures of the HIF-1alpha CTAD/p300 CH1 Complex 提交 2002-02-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 B
323–423(101 aa)
片段:cysteine/histidine-rich 1 domain (CH1)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6;298 K;离子强度(mmCIF原始值)100 mM NaCl;压力 ambient
NMR样品组成
1mM CTAD/CH1 complex U-15N,13C; 0.1mM ZnSO4; 1mM DTT | 90% D2O, 10% H2O
NMR样品组成
1mM CTAD/CH1 complex U-15N,13C; 0.1mM ZnSO4; 1mM DTT | 99.9% D2O
NMR样品组成
1mM CTAD/CH1 complex U-15N; 0.1mM ZnSO4; 1mM DTT | 90% D2O, 10% H2O
NMR样品组成
1mM CTAD/CH1 complex; 0.1mM ZnSO4; 1mM DTT | 99.9% D2O
NMR样品组成
1mM CTAD/CH1 complex 10% U-13C; 0.1mM ZnSO4; 1mM DTT | 99.9% D2O
|
分辨率未提供 |
| 1P4Q Solution structure of the CITED2 transactivation domain in complex with the p300 CH1 domain 提交 2003-04-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 B
323–423(101 aa)
片段:cysteine/histidine-rich 1 (CH1) domain
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6;298 K;离子强度(mmCIF原始值)100mM NaCl;压力 ambient
NMR样品组成
1mM CITED/p300;10mM deut-MES, pH 6.0; 100mM NaCl; 0.1mM ZnSO4 | 99.9% D2O
NMR样品组成
1mM CITED/p300 U-15N;10mM deut-MES, pH 6.0; 100mM NaCl; 0.1mM ZnSO4 | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1mM CITED/p300 U-15N;10mM deut-MES, pH 6.0; 100mM NaCl; 0.1mM ZnSO4 | 99.9% D2O
NMR样品组成
1mM CITED/p300 U-15N,13C;10mM deut-MES, pH 6.0; 100mM NaCl; 0.1mM ZnSO4 | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1mM CITED/p300 U-15N,13C;10mM deut-MES, pH 6.0; 100mM NaCl; 0.1mM ZnSO4 | 99.9% D2O
NMR样品组成
1mM CITED/p300 10%13C;10mM deut-MES, pH 6.0; 100mM NaCl; 0.1mM ZnSO4 | 99.9% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2K8F Structural Basis for the Regulation of p53 Function by p300 提交 2008-09-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1723–1812(90 aa)
片段:UNP residues 1723-1812
|
突变:C1738A, C1746A, C1789A, C1790A | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.3;308 K;离子强度(mmCIF原始值)200;压力 ambient
NMR样品组成
1.1 mM TAZ2, 1.0 mM [U-100% 15N] TAD(1-39), 1.0 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] TAD(1-39), 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1.0 mM [U-100% 15N] TAZ2, 1.1 mM TAD(1-39), 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1.0 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] TAZ2, 1.1 mM TAD(1-39), 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1.0 mM TAZ2, 1.1 mM TAD(1-39), 100% D2O | 100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2MH0 Solution NMR structure of the p300 Taz2:ETAD1 complex 提交 2013-11-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 B
1723–1812(90 aa)
片段:TAZ-type 2 zinc finger residues 1723-1812
|
突变:C1738A, C1746A, C1789A, C1790A | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.5;288 K;离子强度(mmCIF原始值)0;压力 ambient
NMR样品组成
1.4 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] ETAD1, 2 mM Taz2, 20 mM MES, 1 mM sodium azide, 5 mM beta-mercaptoethanol, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
3078 uM ETAD1, 1038 uM [U-99% 13C; U-99% 15N] Taz2, 20 mM MES, 1 mM sodium azide, 5 mM beta-mercaptoethanol, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2MZD Characterization of the p300 Taz2-p53 TAD2 Complex and Comparison with the p300 Taz2-p53 TAD1 Complex 提交 2015-02-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1723–1812(90 aa)
片段:UNP residues 1723-1812
|
突变:C16A, C24A, C67A, C68A | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.3;308 K;离子强度(mmCIF原始值)200;压力 ambient
NMR样品组成
1.1 mM Taz2 domain of Histone Acetyltransferase p300, 1.0 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] TAD2 sub-domain of Cellular Tumor Antigen p53, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1.0 mM [U-100% 15N] Taz2 domain of Histone Acetyltransferase p300, 1.1 mM TAD2 sub-domain of Cellular Tumor Antigen p53, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1.0 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Taz2 domain of Histone Acetyltransferase p300, 1.1 mM TAD2 sub-domain of Cellular Tumor Antigen p53, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1.0 mM Taz2 domain of Histone Acetyltransferase p300, 1.1 mM TAD2 sub-domain of Cellular Tumor Antigen p53, 100% D2O | 100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 3BIY Crystal structure of p300 histone acetyltransferase domain in complex with a bisubstrate inhibitor, Lys-CoA 提交 2007-12-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1287–1666(380 aa)
片段:acetyltransferase domain
|
突变:K1637R, M1652G | BR BROMIDE ION × 5 01K [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-4-hydroxy-3-(phosphonooxy)tetrahydrofuran-2-yl]methyl (3R,20R)-20-carbamoyl-3-hydroxy-2,2-dimethyl-4,8,14,22-tetraoxo-12-thia-5,9,15,21-tetraazatricos-1-yl dihydrogen diphosphate × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES sodium pH 7.5, 20% w/v polyethylene glycol 4,000, 10% v/v 2-Propanol , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.213 |
| 3I3J Crystal Structure of the Bromodomain of Human EP300 提交 2009-06-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1040–1161(122 aa)
片段:UNP RESIDUES 1040-1161
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;277 K;30w/v PEG 3350, 0.2M ammonium_sulfate, 5.5pH Bis-Tris, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.33 Å R-free 0.275 |
| 3I3J Crystal Structure of the Bromodomain of Human EP300 提交 2009-06-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 10 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 J
1040–1161(122 aa)
片段:UNP RESIDUES 1040-1161
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;277 K;30w/v PEG 3350, 0.2M ammonium_sulfate, 5.5pH Bis-Tris, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.33 Å R-free 0.275 |
| 3I3J Crystal Structure of the Bromodomain of Human EP300 提交 2009-06-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 11 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 K
1040–1161(122 aa)
片段:UNP RESIDUES 1040-1161
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;277 K;30w/v PEG 3350, 0.2M ammonium_sulfate, 5.5pH Bis-Tris, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.33 Å R-free 0.275 |
| 3I3J Crystal Structure of the Bromodomain of Human EP300 提交 2009-06-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 12 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 L
1040–1161(122 aa)
片段:UNP RESIDUES 1040-1161
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;277 K;30w/v PEG 3350, 0.2M ammonium_sulfate, 5.5pH Bis-Tris, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.33 Å R-free 0.275 |
| 3I3J Crystal Structure of the Bromodomain of Human EP300 提交 2009-06-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
1040–1161(122 aa)
片段:UNP RESIDUES 1040-1161
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;277 K;30w/v PEG 3350, 0.2M ammonium_sulfate, 5.5pH Bis-Tris, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.33 Å R-free 0.275 |
| 3I3J Crystal Structure of the Bromodomain of Human EP300 提交 2009-06-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 C
1040–1161(122 aa)
片段:UNP RESIDUES 1040-1161
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;277 K;30w/v PEG 3350, 0.2M ammonium_sulfate, 5.5pH Bis-Tris, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.33 Å R-free 0.275 |
| 3I3J Crystal Structure of the Bromodomain of Human EP300 提交 2009-06-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 D
1040–1161(122 aa)
片段:UNP RESIDUES 1040-1161
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;277 K;30w/v PEG 3350, 0.2M ammonium_sulfate, 5.5pH Bis-Tris, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.33 Å R-free 0.275 |
| 3I3J Crystal Structure of the Bromodomain of Human EP300 提交 2009-06-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 5 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 E
1040–1161(122 aa)
片段:UNP RESIDUES 1040-1161
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 SO4 SULFATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;277 K;30w/v PEG 3350, 0.2M ammonium_sulfate, 5.5pH Bis-Tris, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.33 Å R-free 0.275 |
| 3I3J Crystal Structure of the Bromodomain of Human EP300 提交 2009-06-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 6 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 F
1040–1161(122 aa)
片段:UNP RESIDUES 1040-1161
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;277 K;30w/v PEG 3350, 0.2M ammonium_sulfate, 5.5pH Bis-Tris, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.33 Å R-free 0.275 |
| 3I3J Crystal Structure of the Bromodomain of Human EP300 提交 2009-06-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 7 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 G
1040–1161(122 aa)
片段:UNP RESIDUES 1040-1161
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;277 K;30w/v PEG 3350, 0.2M ammonium_sulfate, 5.5pH Bis-Tris, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.33 Å R-free 0.275 |
| 3I3J Crystal Structure of the Bromodomain of Human EP300 提交 2009-06-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 8 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 H
1040–1161(122 aa)
片段:UNP RESIDUES 1040-1161
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;277 K;30w/v PEG 3350, 0.2M ammonium_sulfate, 5.5pH Bis-Tris, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.33 Å R-free 0.275 |
| 3I3J Crystal Structure of the Bromodomain of Human EP300 提交 2009-06-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 9 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 I
1040–1161(122 aa)
片段:UNP RESIDUES 1040-1161
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;277 K;30w/v PEG 3350, 0.2M ammonium_sulfate, 5.5pH Bis-Tris, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.33 Å R-free 0.275 |
| 3IO2 Crystal structure of the Taz2 domain of p300 提交 2009-08-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1723–1836(114 aa)
片段:residues 1723-1836
|
突变:C1738A, C1746A, C1789A, C1790A | ZN ZINC ION × 3 SO4 SULFATE ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
MICROBATCH;pH 6.3;277 K;Protein solution: 30 mg/ml Taz2, 25 mM MES pH 6.3, 100 mM NaCl, 6% glycerol, 10% TCEP.
Precipitating solution: 3.2 M AMS in MES buffer pH 6.0, 10 % ethylene glycol.
Both solutions mixed 1:1 and kept under oil, Microbatch, temperature 277K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.236 |
| 3P57 Crystal structure of the p300 TAZ2 domain bound to MEF2 on DNA 提交 2010-10-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:tridecameric |
链 P
1726–1835(110 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.8;288 K;16% PEG 1000, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 288K
|
分辨率 2.19 Å R-free 0.272 |
| 3T92 Crystal structure of the Taz2:C/EBPepsilon-TAD chimera protein 提交 2011-08-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1723–1818(96 aa)
片段:unp residues 1723-1818; unp residues 37-61
|
突变:C1738A, C1746A, C1789A, C1790A, | ZN ZINC ION × 3 TCE 3,3',3''-phosphanetriyltripropanoic acid × 1 TAM TRIS(HYDROXYETHYL)AMINOMETHANE × 1 ACN ACETONE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
Micro batch under oil;pH 8.5;277 K;200mM NaCl, 5mM TCEP and 20% isopropanol, pH 8.5, Micro batch under oil, temperature 277K
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.228 |
| 4BHW Structural basis for autoinhibition of the acetyltransferase activity of p300 提交 2013-04-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1043–1519(477 aa)
片段:P300 CORE, RESIDUES 1043-1519,1581-1666
链 A
1581–1666(86 aa)
片段:P300 CORE, RESIDUES 1043-1519,1581-1666
链 B
1043–1519(477 aa)
片段:P300 CORE, RESIDUES 1043-1519,1581-1666
链 B
1581–1666(86 aa)
片段:P300 CORE, RESIDUES 1043-1519,1581-1666
|
突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES | ZN ZINC ION × 7 01K [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-4-hydroxy-3-(phosphonooxy)tetrahydrofuran-2-yl]methyl (3R,20R)-20-carbamoyl-3-hydroxy-2,2-dimethyl-4,8,14,22-tetraoxo-12-thia-5,9,15,21-tetraazatricos-1-yl dihydrogen diphosphate × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.5;100 MM HEPES, PH 7.5, 20% PEG3350, 0.2M NACL
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.244 |
| 4PZR Crystal structure of p300 histone acetyltransferase domain in complex with Coenzyme A 提交 2014-03-31 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1287–1664(378 aa)
片段:acetyltransferase domain (UNP residues 1287-1664)
|
突变:Y1467F | PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 COA COENZYME A × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;277 K;0.1 M HEPES, pH 7.5, 16% PEG3350, 3-10% isopropanol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.219 |
| 4PZS Crystal structure of p300 histone acetyltransferase domain in complex with Acetyl-Coenzyme A 提交 2014-03-31 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1287–1664(378 aa)
片段:acetyltransferase domain (UNP residues 1287-1664)
|
突变:Y1467F | ACO ACETYL COENZYME *A × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;277 K;0.1 M HEPES, pH 7.5, 16% PEG3350, 3-10% isopropanol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.94 Å R-free 0.230 |
| 4PZT Crystal structure of p300 histone acetyltransferase domain in complex with an inhibitor, Acetonyl-Coenzyme A 提交 2014-03-31 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1287–1664(378 aa)
片段:acetyltransferase domain (UNP residues 1287-1664)
|
突变:Y1467F | SOP [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-AMINO-9H-PURIN-9-YL)-4-HYDROXY-3-(PHOSPHONOOXY)TETRAHYDROFURAN-2-YL]METHYL (3R)-3-HYDROXY-2,2-DIMETHYL-4-OXO-4-{[3-OXO-3-({2-[(2-OXOPROPYL)THIO]ETHYL}AMINO)PROPYL]AMINO}BUTYL DIHYDROGEN DIPHOSPHATE × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;277 K;0.1 M HEPES, pH 7.5, 16% PEG3350, 3-10% isopropanol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.236 |
| 5BT3 Crystal structure of EP300 bromodomain in complex with SGC-CBP30 chemical probe 提交 2015-06-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1048–1161(114 aa)
片段:bromodomain, UNP residues 1048-1161
|
未记录 | 2LO 2-[2-(3-chloro-4-methoxyphenyl)ethyl]-5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-1-[(2S)-2-(morpholin-4-yl)propyl]-1H-benzimidazole × 1 IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.6;277 K;0.1 M tri-sodium citrate dihydrate pH 5.6, 20% iso-propanol, 20% PEG 4000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.178 |
| 5KJ2 The novel p300/CBP inhibitor A-485 uncovers a unique mechanism of action to target AR in castrate resistant prostate cancer 提交 2016-06-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1287–1666(380 aa)
|
未记录 | 6TF N-[(4-fluorophenyl)methyl]-2-{(1R)-5-[(methylcarbamoyl)amino]-2',4'-dioxo-2,3-dihydro-3'H-spiro[indene-1,5'-[1,3]oxazolidin]-3'-yl}-N-[(2S)-1,1,1-trifluoropropan-2-yl]acetamide × 1 NA SODIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;290 K;25% (w/v) PEG3350, 0.2M Sodium Chloride, 0.1M BIS-TRIS buffer pH5.5
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.260 |
| 5LKU Crystal structure of the p300 acetyltransferase catalytic core with coenzyme A. 提交 2016-07-25 | 构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1043–1519(477 aa)
链 A
1581–1666(86 aa)
|
突变:Y1467F,Y1467F 突变:Y1467F,Y1467F | ZN ZINC ION × 4 COA COENZYME A × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;Tris, PEG MME 2000
|
分辨率 3.50 Å R-free 0.242 |
| 5LKX Crystal structure of the p300 acetyltransferase catalytic core with propionyl-coenzyme A. 提交 2016-07-25 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1043–1519(477 aa)
链 A
1581–1666(86 aa)
|
突变:Y1467F,Y1467F 突变:Y1467F,Y1467F | ZN ZINC ION × 4 1VU propionyl Coenzyme A × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 GOL GLYCEROL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;Tris, PEG MME 2000, DMSO
|
分辨率 2.52 Å R-free 0.239 |
| 5LKZ Crystal structure of the p300 acetyltransferase catalytic core with crotonyl-coenzyme A. 提交 2016-07-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1043–1519(477 aa)
片段:UNP residues 1043-1519,UNP residues 1581-1666,UNP residues 1043-1519,UNP residues 1581-1666
链 A
1581–1666(86 aa)
片段:UNP residues 1043-1519,UNP residues 1581-1666,UNP residues 1043-1519,UNP residues 1581-1666
|
突变:Y1467F,Y1467F,Y1467F,Y1467F 突变:Y1467F,Y1467F,Y1467F,Y1467F | ZN ZINC ION × 4 COO CROTONYL COENZYME A × 1 GOL GLYCEROL × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;Tris, PEG MME 2000
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.234 |
| 5LPK Crystal structure of the bromodomain of human EP300 bound to the inhibitor XDM1 提交 2016-08-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1040–1161(122 aa)
片段:bromodomain, UNP residues 1040-1161
|
未记录 | XDM ~{N}-[(3-chlorophenyl)methyl]-4-ethanoyl-3-ethyl-5-methyl-1~{H}-pyrrole-2-carboxamide × 1 SO4 SULFATE ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION;pH 6.5;277 K;PEG 3350, NaCl
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.203 |
| 5LPK Crystal structure of the bromodomain of human EP300 bound to the inhibitor XDM1 提交 2016-08-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
1040–1161(122 aa)
片段:bromodomain, UNP residues 1040-1161
|
未记录 | XDM ~{N}-[(3-chlorophenyl)methyl]-4-ethanoyl-3-ethyl-5-methyl-1~{H}-pyrrole-2-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION;pH 6.5;277 K;PEG 3350, NaCl
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.203 |
| 5LPK Crystal structure of the bromodomain of human EP300 bound to the inhibitor XDM1 提交 2016-08-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 C
1040–1161(122 aa)
片段:bromodomain, UNP residues 1040-1161
|
未记录 | XDM ~{N}-[(3-chlorophenyl)methyl]-4-ethanoyl-3-ethyl-5-methyl-1~{H}-pyrrole-2-carboxamide × 1 SO4 SULFATE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION;pH 6.5;277 K;PEG 3350, NaCl
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.203 |
| 5LPK Crystal structure of the bromodomain of human EP300 bound to the inhibitor XDM1 提交 2016-08-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 D
1040–1161(122 aa)
片段:bromodomain, UNP residues 1040-1161
|
未记录 | XDM ~{N}-[(3-chlorophenyl)methyl]-4-ethanoyl-3-ethyl-5-methyl-1~{H}-pyrrole-2-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION;pH 6.5;277 K;PEG 3350, NaCl
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.203 |
| 5LPK Crystal structure of the bromodomain of human EP300 bound to the inhibitor XDM1 提交 2016-08-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 5 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 E
1040–1161(122 aa)
片段:bromodomain, UNP residues 1040-1161
|
未记录 | XDM ~{N}-[(3-chlorophenyl)methyl]-4-ethanoyl-3-ethyl-5-methyl-1~{H}-pyrrole-2-carboxamide × 2 SO4 SULFATE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION;pH 6.5;277 K;PEG 3350, NaCl
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.203 |
| 5LPK Crystal structure of the bromodomain of human EP300 bound to the inhibitor XDM1 提交 2016-08-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 6 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 F
1040–1161(122 aa)
片段:bromodomain, UNP residues 1040-1161
|
未记录 | XDM ~{N}-[(3-chlorophenyl)methyl]-4-ethanoyl-3-ethyl-5-methyl-1~{H}-pyrrole-2-carboxamide × 1 SO4 SULFATE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION;pH 6.5;277 K;PEG 3350, NaCl
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.203 |
| 5LPK Crystal structure of the bromodomain of human EP300 bound to the inhibitor XDM1 提交 2016-08-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 7 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 G
1040–1161(122 aa)
片段:bromodomain, UNP residues 1040-1161
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION;pH 6.5;277 K;PEG 3350, NaCl
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.203 |
| 5LPM Crystal structure of the bromodomain of human Ep300 bound to the inhibitor XDM3d 提交 2016-08-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1048–1161(114 aa)
片段:bromodomain, UNP residues 1048-1161
|
未记录 | 71Y ~{N}-[(1~{S},2~{S})-7-chloranyl-2-oxidanyl-1,2,3,4-tetrahydronaphthalen-1-yl]-4-ethanoyl-3-ethyl-5-methyl-1~{H}-pyrrole -2-carboxamide × 2 ACT ACETATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION;pH 5.5;277 K;NaCl, PEG 3350
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.187 |
| 5LPM Crystal structure of the bromodomain of human Ep300 bound to the inhibitor XDM3d 提交 2016-08-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
1048–1161(114 aa)
片段:bromodomain, UNP residues 1048-1161
|
未记录 | 71Y ~{N}-[(1~{S},2~{S})-7-chloranyl-2-oxidanyl-1,2,3,4-tetrahydronaphthalen-1-yl]-4-ethanoyl-3-ethyl-5-methyl-1~{H}-pyrrole -2-carboxamide × 2 ACT ACETATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION;pH 5.5;277 K;NaCl, PEG 3350
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.187 |
| 5NU5 Crystal structure of the human bromodomain of EP300 bound to the inhibitor XDM-CBP 提交 2017-04-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1048–1161(114 aa)
片段:bromodomain
|
未记录 | 99E ~{N}-[[2,8-bis(oxidanyl)naphthalen-1-yl]methyl]-4-ethanoyl-3-ethyl-5-methyl-1~{H}-pyrrole-2-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION;pH 6.5;277 K;KSCN, NaBr, PEG 6000, PEG 8000, PEG 10000
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.185 |
| 5NU5 Crystal structure of the human bromodomain of EP300 bound to the inhibitor XDM-CBP 提交 2017-04-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
1048–1161(114 aa)
片段:bromodomain
|
未记录 | 99E ~{N}-[[2,8-bis(oxidanyl)naphthalen-1-yl]methyl]-4-ethanoyl-3-ethyl-5-methyl-1~{H}-pyrrole-2-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION;pH 6.5;277 K;KSCN, NaBr, PEG 6000, PEG 8000, PEG 10000
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.185 |
| 5XZC Cryo-EM structure of p300-p53 protein complex 提交 2017-07-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1046–1664(619 aa)
片段:UNP residues 1046-1664
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 10.70 Å |
| 6DS6 Crystal structure of p300 ZZ domain in complex with histone H3 peptide 提交 2018-06-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1663–1713(51 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 CL CHLORIDE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;0.1 M HEPES and 70% MPD (pH 7.5)
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.253 |
| 6FGN Solution Structure of p300Taz2-p63TA 提交 2018-01-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1723–1812(90 aa)
片段:Taz2,transactivation domain
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.3;303 K;离子强度(mmCIF原始值)200;压力 AMBIENT
NMR样品组成
1200 mM [U-13C; U-15N] Fusion construct of p300 Taz2 and the transactivation domain of p63, 25 mM MES, 200 mM NaCl, 0.5 mM TCEP, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
|
分辨率未提供 |
| 6FGS Solution structure of p300Taz2-p73TA1 提交 2018-01-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1723–1812(90 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.3;303 K;离子强度(mmCIF原始值)50;压力 AMBIENT
NMR样品组成
700 uM [U-13C; U-15N] Fusion construct of p300 Taz2 and the transactivation domain 1 of p73, 25 mM MES, 50 mM NaCl, 0.5 mM TCEP, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
|
分辨率未提供 |
| 6GYR Transcription factor dimerization activates the p300 acetyltransferase 提交 2018-07-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1046–1664(619 aa)
链 C
1046–1664(619 aa)
|
突变:Y1467F 突变:Y1467F | ZN ZINC ION × 7 01K [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-4-hydroxy-3-(phosphonooxy)tetrahydrofuran-2-yl]methyl (3R,20R)-20-carbamoyl-3-hydroxy-2,2-dimethyl-4,8,14,22-tetraoxo-12-thia-5,9,15,21-tetraazatricos-1-yl dihydrogen diphosphate × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;277 K;100 mM HEPES, pH 7.5, 18-22% polyethylene glycol 3350, 0.2 M NaCl
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.265 |
| 6GYR Transcription factor dimerization activates the p300 acetyltransferase 提交 2018-07-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 B
1046–1664(619 aa)
链 D
1046–1664(619 aa)
|
突变:Y1467F 突变:Y1467F | ZN ZINC ION × 7 01K [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-4-hydroxy-3-(phosphonooxy)tetrahydrofuran-2-yl]methyl (3R,20R)-20-carbamoyl-3-hydroxy-2,2-dimethyl-4,8,14,22-tetraoxo-12-thia-5,9,15,21-tetraazatricos-1-yl dihydrogen diphosphate × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;277 K;100 mM HEPES, pH 7.5, 18-22% polyethylene glycol 3350, 0.2 M NaCl
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.265 |
| 6GYT Transcription factor dimerization activates the p300 acetyltransferase 提交 2018-07-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
1047–1168(122 aa)
链 B
1047–1168(122 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION;294 K;1.6 M Ammonium Sulfate, 100 mM Bicine, pH 9.0
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.288 |
| 6K4N Cryo-EM structure of p300 提交 2019-05-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1046–1664(619 aa)
片段:UNP RESIDUES 1046-1664
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 9.80 Å |
| 6PF1 Crystal structure of the p300 acetyltransferase domain with allosteric inhibitor CPI-090 and CoA 提交 2019-06-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1287–1513(227 aa)
链 A
1581–1663(83 aa)
|
突变:Y1467F 突变:Y1467F | COA COENZYME A × 1 OJ7 3-[3-chloro-5-(trifluoromethyl)pyridin-2-yl]-2-methyl-1H-indole × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;277 K;0.1 M CHES pH 9.5, 30% w/v PEG 3000
|
分辨率 2.32 Å R-free 0.247 |
| 6PF1 Crystal structure of the p300 acetyltransferase domain with allosteric inhibitor CPI-090 and CoA 提交 2019-06-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
1287–1513(227 aa)
链 B
1581–1663(83 aa)
|
突变:Y1467F 突变:Y1467F | COA COENZYME A × 1 OJ7 3-[3-chloro-5-(trifluoromethyl)pyridin-2-yl]-2-methyl-1H-indole × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;277 K;0.1 M CHES pH 9.5, 30% w/v PEG 3000
|
分辨率 2.32 Å R-free 0.247 |
| 6PGU Crystal structure of the p300 acetyltransferase domain with allosteric inhibitor CPI-076 and CoA 提交 2019-06-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1287–1519(233 aa)
链 A
1582–1663(82 aa)
|
突变:Y1467F, loop deletion 突变:Y1467F, loop deletion | COA COENZYME A × 1 OK7 N-(thiophen-2-yl)acetamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;277 K;20% MPD, 0.1 M Tris pH 8, 7.5% PEG-MME 5000
|
分辨率 1.72 Å R-free 0.206 |
| 6PGU Crystal structure of the p300 acetyltransferase domain with allosteric inhibitor CPI-076 and CoA 提交 2019-06-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
1287–1519(233 aa)
链 B
1582–1663(82 aa)
|
突变:Y1467F, loop deletion 突变:Y1467F, loop deletion | COA COENZYME A × 1 OK7 N-(thiophen-2-yl)acetamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;277 K;20% MPD, 0.1 M Tris pH 8, 7.5% PEG-MME 5000
|
分辨率 1.72 Å R-free 0.206 |
| 6V8B Crystal structure of the p300 acetyltransferase domain with AcCoA competitive inhibitor 1 提交 2019-12-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1287–1666(380 aa)
|
突变:M1652G | QRY 4-(2-{[(1R)-2-(1H-indol-3-yl)-2-oxo-1-phenylethyl]amino}ethyl)benzene-1-sulfonamide × 1 CL CHLORIDE ION × 2 SO4 SULFATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;277 K;INDEX F6. 25% PEG3350, 0.2 M Ammonium sulfate, 0.1 M BisTris pH 5.5
|
分辨率 3.13 Å R-free 0.316 |
| 6V8K Crystal structure of the p300 acetyltransferase domain with peptide-competitive inhibitor 2 提交 2019-12-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1287–1519(233 aa)
链 A
1581–1663(83 aa)
|
突变:Y1467F 突变:Y1467F | COA COENZYME A × 1 QS4 1-(2-methyl-1H-indol-3-yl)-2-[(2R)-2-methylpiperidin-1-yl]ethan-1-one × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;277 K;0.24 mM HAT, 0.12 mM CoA, 0.75 mM ligand. 200+150 (+20) nL sitting drops.
Internal focus screen with microseeding. 17.5% MPD, 0.1 M Tris pH 8, 2.5 % PEG3350. Cryo 30% MPD, 5% PEG 3350, 1 mM ligand
|
分辨率 1.84 Å R-free 0.213 |
| 6V8N Crystal structure of the p300 acetyltransferase domain with AcCoA competitive inhibitor 17 提交 2019-12-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1287–1666(380 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | SO4 SULFATE ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1 QS1 (2R)-2-{[(2S)-2-(4-cyanophenyl)propyl]amino}-N-[5-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)pyridin-2-yl]-2-phenylacetamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;277 K;0.2 M Ammonium Sulfate, 0.1 M BisTris pH 5.5, 20% PEG 3350, streak-seed with loop
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.247 |
| 6V90 Crystal structure of the p300 acetyltransferase domain with AcCoA competitive inhibitor 12 提交 2019-12-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1287–1666(380 aa)
|
突变:M1652G | QSD (2R)-2-{[2-(4-cyanophenyl)ethyl]amino}-N-[5-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)pyridin-2-yl]-2-phenylacetamide × 1 SO4 SULFATE ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;INDEX F6. 0.1 M Bis-Tris pH 5.5, 0.2 M ammonium sulfate 25% w/v PEG 3350. The crystal was cryoprotected with MiTeGen Low Viscosity Cryo Oil
|
分辨率 2.04 Å R-free 0.241 |
| 7LJE Discovery of Spirohydantoins as Selective, Orally Bioavailable Inhibitors of p300/CBP Histone Acetyltransferases 提交 2021-01-29 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1287–1666(380 aa)
片段:acetyltransferase domain (UNP residues 1287-1666)
|
未记录 | Y2P 2-[4-[(3'R,4S)-3'-fluoro-1-[2-[(4-fluorophenyl)methyl-[(1S)-2,2,2-trifluoro-1-methyl-ethyl]amino]-2-oxo-ethyl]-2,5-dioxo-spiro[imidazolidine-4,1'-indane]-5'-yl]pyrazol-1-yl]-N-methyl-acetamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 5.5;290 K;25% PEG 3350, 0.2 M Ammonium Acetate, 0.1 M Bis-Tris HCl pH 5.5
|
分辨率 2.61 Å R-free 0.265 |
| 7LJE Discovery of Spirohydantoins as Selective, Orally Bioavailable Inhibitors of p300/CBP Histone Acetyltransferases 提交 2021-01-29 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
1287–1666(380 aa)
片段:acetyltransferase domain (UNP residues 1287-1666)
|
未记录 | Y2P 2-[4-[(3'R,4S)-3'-fluoro-1-[2-[(4-fluorophenyl)methyl-[(1S)-2,2,2-trifluoro-1-methyl-ethyl]amino]-2-oxo-ethyl]-2,5-dioxo-spiro[imidazolidine-4,1'-indane]-5'-yl]pyrazol-1-yl]-N-methyl-acetamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 5.5;290 K;25% PEG 3350, 0.2 M Ammonium Acetate, 0.1 M Bis-Tris HCl pH 5.5
|
分辨率 2.61 Å R-free 0.265 |
| 7LJE Discovery of Spirohydantoins as Selective, Orally Bioavailable Inhibitors of p300/CBP Histone Acetyltransferases 提交 2021-01-29 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 C
1287–1666(380 aa)
片段:acetyltransferase domain (UNP residues 1287-1666)
|
未记录 | Y2P 2-[4-[(3'R,4S)-3'-fluoro-1-[2-[(4-fluorophenyl)methyl-[(1S)-2,2,2-trifluoro-1-methyl-ethyl]amino]-2-oxo-ethyl]-2,5-dioxo-spiro[imidazolidine-4,1'-indane]-5'-yl]pyrazol-1-yl]-N-methyl-acetamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 5.5;290 K;25% PEG 3350, 0.2 M Ammonium Acetate, 0.1 M Bis-Tris HCl pH 5.5
|
分辨率 2.61 Å R-free 0.265 |
| 7LJE Discovery of Spirohydantoins as Selective, Orally Bioavailable Inhibitors of p300/CBP Histone Acetyltransferases 提交 2021-01-29 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 D
1287–1666(380 aa)
片段:acetyltransferase domain (UNP residues 1287-1666)
|
未记录 | Y2P 2-[4-[(3'R,4S)-3'-fluoro-1-[2-[(4-fluorophenyl)methyl-[(1S)-2,2,2-trifluoro-1-methyl-ethyl]amino]-2-oxo-ethyl]-2,5-dioxo-spiro[imidazolidine-4,1'-indane]-5'-yl]pyrazol-1-yl]-N-methyl-acetamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 5.5;290 K;25% PEG 3350, 0.2 M Ammonium Acetate, 0.1 M Bis-Tris HCl pH 5.5
|
分辨率 2.61 Å R-free 0.265 |
| 7SS8 Human P300 complexed with a proline-based inhibitor 提交 2021-11-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1048–1519(472 aa)
链 A
1582–1664(83 aa)
|
突变:Y1467F, residues 1520-1581 replaced with SGGSG 突变:Y1467F, residues 1520-1581 replaced with SGGSG | ZN ZINC ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 C0C 1-[1-(4-chlorophenyl)cyclopentane-1-carbonyl]-N-{[3-(methylcarbamoyl)phenyl]methyl}-D-prolinamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 6.5;277 K;20% PEG3350, 0.1 M MES pH 6.5
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.230 |
| 7SSK Human P300 complexed with a glycine-based inhibitor 提交 2021-11-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1048–1519(472 aa)
链 A
1582–1664(83 aa)
|
突变:Y1467F, residues 1520-1581 replaced with SGGSG 突变:Y1467F, residues 1520-1581 replaced with SGGSG | ZN ZINC ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 C3I N-[2-(4-methoxyanilino)-2-oxoethyl]-N-methyl-1-phenylcyclopentane-1-carboxamide × 1 ACT ACETATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 6.5;277 K;20% PEG3350, 0.1 M MES pH 6.5
|
分辨率 2.36 Å R-free 0.235 |
| 7SZQ Human P300 complexed with an azaindazole inhibitor 提交 2021-11-29 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1279–1666(388 aa)
|
突变:Y1467F | ETL 1-[1-(4-chlorophenyl)cyclopentane-1-carbonyl]-N-1H-pyrazolo[4,3-b]pyridin-5-yl-D-prolinamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 9.5;277 K;30% PEG400, 0.1 M CHES pH 9.5
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.235 |
| 7UGI Bromodomain of EP300 liganded with BMS-536924 提交 2022-03-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1048–1161(114 aa)
|
未记录 | N6I (3M)-4-{[(2S)-2-(3-chlorophenyl)-2-hydroxyethyl]amino}-3-[4-methyl-6-(morpholin-4-yl)-1H-benzimidazol-2-yl]pyridin-2(1H)-one × 1 PE5 3,6,9,12,15,18,21,24-OCTAOXAHEXACOSAN-1-OL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;292 K;0.05M Potassium phosphate monobasic 20% w/v Polyethylene glycol 8,000
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.274 |
| 7UGI Bromodomain of EP300 liganded with BMS-536924 提交 2022-03-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
1048–1161(114 aa)
|
未记录 | N6I (3M)-4-{[(2S)-2-(3-chlorophenyl)-2-hydroxyethyl]amino}-3-[4-methyl-6-(morpholin-4-yl)-1H-benzimidazol-2-yl]pyridin-2(1H)-one × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;292 K;0.05M Potassium phosphate monobasic 20% w/v Polyethylene glycol 8,000
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.274 |
| 7VHY Crystal structure of EP300 HAT domain in complex with compound (+)-3 提交 2021-09-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1159–1519(361 aa)
片段:(UNP residues 1159-1519)-linker-(UNP residues 1581-1666)
链 A
1581–1666(86 aa)
片段:(UNP residues 1159-1519)-linker-(UNP residues 1581-1666)
|
突变:Y1467E 突变:Y1467E | ZN ZINC ION × 3 6QI [(6R)-6-(1H-indazol-4-ylmethyl)-1,4-oxazepan-4-yl]-[1-(4-methoxyphenyl)cyclopentyl]methanone × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;277 K;15% PEG3350, 0.1 M HEPES (pH7.0)
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.250 |
| 7VHY Crystal structure of EP300 HAT domain in complex with compound (+)-3 提交 2021-09-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
1159–1519(361 aa)
片段:(UNP residues 1159-1519)-linker-(UNP residues 1581-1666)
链 B
1581–1666(86 aa)
片段:(UNP residues 1159-1519)-linker-(UNP residues 1581-1666)
|
突变:Y1467E 突变:Y1467E | ZN ZINC ION × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;277 K;15% PEG3350, 0.1 M HEPES (pH7.0)
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.250 |
| 7VHZ Crystal structure of EP300 HAT domain in complex with compound 7 提交 2021-09-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1159–1519(361 aa)
片段:(UNP residues 1159-1519)-linker-(UNP residues 1581-1666)
链 A
1581–1666(86 aa)
片段:(UNP residues 1159-1519)-linker-(UNP residues 1581-1666)
|
突变:Y1467E 突变:Y1467E | ZN ZINC ION × 3 6TI (2R)-N-(2H-indazol-4-yl)-1-[1-(4-methoxyphenyl)cyclopentyl]carbonyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;277 K;16% PEG3350, 0.1 M HEPES (pH 7.0)
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.219 |
| 7VHZ Crystal structure of EP300 HAT domain in complex with compound 7 提交 2021-09-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
1159–1519(361 aa)
片段:(UNP residues 1159-1519)-linker-(UNP residues 1581-1666)
链 B
1581–1666(86 aa)
片段:(UNP residues 1159-1519)-linker-(UNP residues 1581-1666)
|
突变:Y1467E 突变:Y1467E | ZN ZINC ION × 3 6TI (2R)-N-(2H-indazol-4-yl)-1-[1-(4-methoxyphenyl)cyclopentyl]carbonyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;277 K;16% PEG3350, 0.1 M HEPES (pH 7.0)
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.219 |
| 7VI0 Crystal structure of EP300 HAT domain in complex with compound 11 提交 2021-09-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1159–1519(361 aa)
片段:(UNP residues 1159-1519)-linker-(UNP residues 1581-1666)
链 A
1581–1666(86 aa)
片段:(UNP residues 1159-1519)-linker-(UNP residues 1581-1666)
|
突变:Y1467E 突变:Y1467E | ZN ZINC ION × 3 6YI (4S)-N-(3H-indazol-4-yl)-3-[1-(4-methoxyphenyl)cyclopentyl]carbonyl-1,1-bis(oxidanylidene)-1,3-thiazolidine-4-carboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;277 K;12% PEG3350, 0.1 M HEPES (pH 7.0)
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.235 |
| 7VI0 Crystal structure of EP300 HAT domain in complex with compound 11 提交 2021-09-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
1159–1519(361 aa)
片段:(UNP residues 1159-1519)-linker-(UNP residues 1581-1666)
链 B
1581–1666(86 aa)
片段:(UNP residues 1159-1519)-linker-(UNP residues 1581-1666)
|
突变:Y1467E 突变:Y1467E | ZN ZINC ION × 3 6YI (4S)-N-(3H-indazol-4-yl)-3-[1-(4-methoxyphenyl)cyclopentyl]carbonyl-1,1-bis(oxidanylidene)-1,3-thiazolidine-4-carboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;277 K;12% PEG3350, 0.1 M HEPES (pH 7.0)
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.235 |
| 7W9V Cryo-EM structure of nucleosome in complex with p300 acetyltransferase catalytic core (complex I) 提交 2021-12-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:undecameric |
链 K
1035–1519(485 aa)
链 K
1581–1720(140 aa)
|
突变:Y1467F 突变:Y1467F | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.95 Å |
| 7XEZ NMR solution structures of p300 TAZ2 domain in complex with BRD4-NUT F1c domain binding motif #2 提交 2022-03-31 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1723–1812(90 aa)
|
突变:C1738A, C1746A, C1789A, C1790A | ZN ZINC ION × 3 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.3;298 K;压力 1
NMR样品组成
0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] p300 TAZ2 domain in fusion with BRD4-NUT F1c domain binding motif #2, 200 mM sodium phosphate, 3 mM [U-100% 2H] DTT, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] p300 TAZ2 domain in fusion with BRD4-NUT F1c domain binding motif #2, 200 mM sodium phosphate, 3 mM [U-100% 2H] DTT, 100% D2O | 100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 7XFG NMR solution structures of p300 TAZ2 domain in complex with BRD4-NUT F1c domain binding motif #1 提交 2022-04-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1723–1812(90 aa)
片段:TAZ2 domain
|
突变:C1738A, C1746A, C1789A, C1790A | ZN ZINC ION × 3 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.3;298 K;离子强度(mmCIF原始值)null;压力 1
NMR样品组成
0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] p300 TAZ2 domain, 1.5 mM BRD4-NUT fusion protein F1c domain binding motif #1, 200 mM sodium phosphate, 3.0 mM [U-100% 2H] DTT, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] p300 TAZ2 domain, 1.5 mM BRD4-NUT fusion protein F1c domain binding motif #1, 200 mM sodium phosphate, 3.0 mM [U-100% 2H] DTT, 100% D2O | 100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 8E1D NMR-derived ensemble of the TAZ2 domain of p300 bound to the microphthalmia-associated transcription factor 提交 2022-08-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1723–1812(90 aa)
|
突变:C1738A C1746A C1789A C1790A | ZN ZINC ION × 3 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6;308 K;离子强度(mmCIF原始值)20;压力 1
NMR样品组成
20 mM 2-(N-morpholino)ethanesulfonic acid (MES), 5 mM beta mercaptoethanol, 10 uM Zinc chloride, 1 mM [U-13C; U-15N] Microphthalmia-associated transcription factor, 1.2 mM TAZ2 domain of p300, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
20 mM 2-(N-morpholino)ethanesulfonic acid (MES), 5 mM beta mercaptoethanol, 10 mM Zinc chloride, 1.15 mM Microphthalmia-associated transcription factor, 0.95 mM [U-13C; U-15N] TAZ2 domain of p300, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
|
分辨率未提供 |
| 8FVF Bromodomain of EP300 liganded with CCS-1477 提交 2023-01-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1048–1161(114 aa)
片段:bromodomain
|
未记录 | JHL (6S)-1-[3,4-bis(fluoranyl)phenyl]-6-[5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-1-(4-methoxycyclohexyl)benzimidazol-2-yl]piperidin-2-one × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 NI NICKEL (II) ION × 6 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;291 K;0.1M Sodium chloride, 0.1M HEPES pH7.5, 1.6M Ammonium sulfate
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.239 |
| 8FVF Bromodomain of EP300 liganded with CCS-1477 提交 2023-01-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
1048–1161(114 aa)
片段:bromodomain
|
未记录 | JHL (6S)-1-[3,4-bis(fluoranyl)phenyl]-6-[5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-1-(4-methoxycyclohexyl)benzimidazol-2-yl]piperidin-2-one × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 NI NICKEL (II) ION × 3 SO4 SULFATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;291 K;0.1M Sodium chloride, 0.1M HEPES pH7.5, 1.6M Ammonium sulfate
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.239 |
| 8GZC Crystal structure of EP300 HAT domain in complex with compound 10 提交 2022-09-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1159–1519(361 aa)
链 A
1581–1666(86 aa)
|
突变:Y1467E 突变:Y1467E | ZN ZINC ION × 3 KQO (2~{R},4~{R})-4-fluoranyl-1-[1-(4-methoxyphenyl)cyclohexyl]carbonyl-~{N}-(1~{H}-pyrazolo[4,3-b]pyridin-5-yl)pyrrolidine-2-carboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;277 K;15% PEG3350, 0.1 M HEPES
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.227 |
| 8GZC Crystal structure of EP300 HAT domain in complex with compound 10 提交 2022-09-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
1159–1519(361 aa)
链 B
1581–1666(86 aa)
|
突变:Y1467E 突变:Y1467E | ZN ZINC ION × 3 KQO (2~{R},4~{R})-4-fluoranyl-1-[1-(4-methoxyphenyl)cyclohexyl]carbonyl-~{N}-(1~{H}-pyrazolo[4,3-b]pyridin-5-yl)pyrrolidine-2-carboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;277 K;15% PEG3350, 0.1 M HEPES
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.227 |
| 8HAG Cryo-EM structure of the p300 catalytic core bound to the H4K12acK16ac nucleosome, class 1 (3.2 angstrom resolution) 提交 2022-10-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:undecameric |
链 K
1048–1836(789 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 8HAH Cryo-EM structure of the p300 catalytic core bound to the H4K12acK16ac nucleosome, class 2 (3.9 angstrom resolution) 提交 2022-10-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:undecameric |
链 K
1048–1836(789 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å |
| 8HAI Cryo-EM structure of the p300 catalytic core bound to the H4K12acK16ac nucleosome, class 1 (4.7 angstrom resolution) 提交 2022-10-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:undecameric |
链 K
1048–1836(789 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.70 Å |
| 8HAJ Cryo-EM structure of the p300 catalytic core bound to the H4K12acK16ac nucleosome, class 2 (4.8 angstrom resolution) 提交 2022-10-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:undecameric |
链 K
1048–1836(789 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.80 Å |
| 8HAK Cryo-EM structure of the p300 catalytic core bound to the H4K12acK16ac nucleosome, class 4 (4.5 angstrom resolution) 提交 2022-10-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:undecameric |
链 N
1048–1836(789 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.50 Å |
| 9IT5 p300 KAT domain in complex with KB528 提交 2024-07-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1287–1666(380 aa)
片段:KAT domain
|
突变:K1637R/M1652G | A1L3B 4-[(2~{S})-1-[[(~{R})-[(3~{S})-7-(1-methylpyrazol-4-yl)-2,3-dihydro-1~{H}-pyrido[2,3-b][1,4]oxazin-3-yl]-phenyl-methyl]amino]propan-2-yl]benzenecarbonitrile × 1 CL CHLORIDE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;HM(PEGs-E9)-D6 (0.18M NH4Cl, 24% PEG 3350)
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.238 |
| 9IT5 p300 KAT domain in complex with KB528 提交 2024-07-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
1287–1666(380 aa)
片段:KAT domain
|
突变:K1637R/M1652G | A1L3B 4-[(2~{S})-1-[[(~{R})-[(3~{S})-7-(1-methylpyrazol-4-yl)-2,3-dihydro-1~{H}-pyrido[2,3-b][1,4]oxazin-3-yl]-phenyl-methyl]amino]propan-2-yl]benzenecarbonitrile × 1 CL CHLORIDE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;HM(PEGs-E9)-D6 (0.18M NH4Cl, 24% PEG 3350)
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.238 |
| 9JEJ Crystal structure of human EP300 KIX domain (L644C mutant) 提交 2024-09-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
566–652(87 aa)
片段:KIX domain
|
突变:L644C | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.2 M Sodium Chloride, 0.1 M Sodium Citrate : Citric Acid pH5.5, 1 M Ammonium Phosphate Dibasic
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.281 |
| 9JEJ Crystal structure of human EP300 KIX domain (L644C mutant) 提交 2024-09-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
566–652(87 aa)
片段:KIX domain
|
突变:L644C | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.2 M Sodium Chloride, 0.1 M Sodium Citrate : Citric Acid pH5.5, 1 M Ammonium Phosphate Dibasic
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.281 |
| 9JEJ Crystal structure of human EP300 KIX domain (L644C mutant) 提交 2024-09-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 C
566–652(87 aa)
片段:KIX domain
|
突变:L644C | ZN ZINC ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.2 M Sodium Chloride, 0.1 M Sodium Citrate : Citric Acid pH5.5, 1 M Ammonium Phosphate Dibasic
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.281 |
| 9JUT X-ray crystal structure of Y16524 in EP300 提交 2024-10-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1040–1161(122 aa)
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未记录 | A1EDM (6~{S})-1-(3-chloranyl-4-methoxy-phenyl)-6-[4-(3-methyl-1,2-benzoxazol-5-yl)-1-[(2~{S})-2-morpholin-4-ylpropyl]imidazol-2-yl]piperidin-2-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;277 K;60% v/v Tacsimate pH 7.0, 0.1 M BIS-TRIS propane pH 7.0
|
分辨率 2.13 Å R-free 0.234 |
| 9MZA Chemically Hijacked BCL6-TCIP3-p300 Complex 提交 2025-01-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 B
1040–1161(122 aa)
链 D
1040–1161(122 aa)
|
未记录 | A1BUC 1-{1-[5-({1-[5-chloro-4-({8-methoxy-1-methyl-3-[2-(methylamino)-2-oxoethoxy]-2-oxo-1,2-dihydroquinolin-6-yl}amino)pyrimidin-2-yl]piperidine-4-carbonyl}amino)pentanoyl]piperidin-4-yl}-3-[(6M)-7-(difluoromethyl)-6-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)-3,4-dihydroquinolin-1(2H)-yl]-N-methyl-1,4,6,7-tetrahydro-5H-pyrazolo[4,3-c]pyridine-5-carboxamide × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;289 K;0.15 M DL-Malic acid pH 7.0, PEG 3,350 20%
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.277 |
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| UniProt名称 | EP300_HUMAN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A; PDB构建体 11–487; UniProt 1043–1519 作者链 A; PDB构建体 493–578; UniProt 1581–1666 |