Beta-nerve growth factor
Mus musculus
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白拷贝数一致 | 链 A； UniProt 122–239 链 B； UniProt 122–239 | 未记录 | 无其他共同聚合物 | SOLUTION NMR NMR测量条件：pH 7；303 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 1 NMR测量条件：pH 7；308 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 1 NMR样品组成：0.1 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] Nerve Growth Factor, 50 mM sodium phosphate, 1 mM EDTA, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O | 分辨率未提供 |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 5LSD | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1BET NEW PROTEIN FOLD REVEALED BY A 2.3 ANGSTROM RESOLUTION CRYSTAL STRUCTURE OF NERVE GROWTH FACTOR 提交 1993-04-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
131–237（107 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.30 Å |
| 1BTG CRYSTAL STRUCTURE OF BETA NERVE GROWTH FACTOR AT 2.5 A RESOLUTION IN C2 SPACE GROUP WITH ZN IONS BOUND 提交 1995-08-29 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
130–239（110 aa）
链 B
130–239（110 aa）
链 C
130–239（110 aa）
|
突变：BIS-DES-OCTA (MISSING RESIDUES 1-8, PROTEOLYTICALLY CLEAVED) 突变：BIS-DES-OCTA (MISSING RESIDUES 1-8, PROTEOLYTICALLY CLEAVED) 突变：BIS-DES-OCTA (MISSING RESIDUES 1-8, PROTEOLYTICALLY CLEAVED) | ZN ZINC ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.50 Å |
| 1BTG CRYSTAL STRUCTURE OF BETA NERVE GROWTH FACTOR AT 2.5 A RESOLUTION IN C2 SPACE GROUP WITH ZN IONS BOUND 提交 1995-08-29 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
130–239（110 aa）
|
突变：BIS-DES-OCTA (MISSING RESIDUES 1-8, PROTEOLYTICALLY CLEAVED) | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.50 Å |
| 1BTG CRYSTAL STRUCTURE OF BETA NERVE GROWTH FACTOR AT 2.5 A RESOLUTION IN C2 SPACE GROUP WITH ZN IONS BOUND 提交 1995-08-29 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
130–239（110 aa）
链 C
130–239（110 aa）
|
突变：BIS-DES-OCTA (MISSING RESIDUES 1-8, PROTEOLYTICALLY CLEAVED) 突变：BIS-DES-OCTA (MISSING RESIDUES 1-8, PROTEOLYTICALLY CLEAVED) | ZN ZINC ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.50 Å |
| 1BTG CRYSTAL STRUCTURE OF BETA NERVE GROWTH FACTOR AT 2.5 A RESOLUTION IN C2 SPACE GROUP WITH ZN IONS BOUND 提交 1995-08-29 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
130–239（110 aa）
链 C
130–239（110 aa）
|
突变：BIS-DES-OCTA (MISSING RESIDUES 1-8, PROTEOLYTICALLY CLEAVED) 突变：BIS-DES-OCTA (MISSING RESIDUES 1-8, PROTEOLYTICALLY CLEAVED) | ZN ZINC ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.50 Å |
| 1SGF CRYSTAL STRUCTURE OF 7S NGF: A COMPLEX OF NERVE GROWTH FACTOR WITH FOUR BINDING PROTEINS (SERINE PROTEINASES) 提交 1997-08-08 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 B
122–239（118 aa）
链 Y
122–239（118 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 ZN ZINC ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 4.9；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 20MG/ML PROTEIN SOLUTION IN 50MM SODIUM PHOSPHATE (PH6.8) MIXED WITH AN EQUAL VOLUME OF WELL SOLUTION (50MM SODIUM ACETATE PH4.5-5.1, 12-21% PEG 4000, 10 MICROMOLAR ZNSO4) (MCDONALD AND BLUNDELL, 1991, JMB, 219, 595-601)., pH 4.9
|
分辨率 3.15 Å R-free 0.282 |
| 3IJ2 Ligand-receptor structure 提交 2009-08-03 | 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
129–351（223 aa）
片段：UNP RESIDUES 129-241
链 B
129–351（223 aa）
片段：UNP RESIDUES 129-241
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.75 Å R-free 0.274 |
| 4EAX Mouse NGF in complex with Lyso-PS 提交 2012-03-23 | 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
122–241（120 aa）
链 B
122–241（120 aa）
|
未记录 | S12 O-[(S)-hydroxy{[(2S)-2-hydroxy-3-(octadec-9-enoyloxy)propyl]oxy}phosphoryl]-L-serine × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；289 K；0.1M Imidazole, 1.0M Sodium Acetate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.259 |
| 4EAX Mouse NGF in complex with Lyso-PS 提交 2012-03-23 | 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 C
122–241（120 aa）
链 D
122–241（120 aa）
|
未记录 | S12 O-[(S)-hydroxy{[(2S)-2-hydroxy-3-(octadec-9-enoyloxy)propyl]oxy}phosphoryl]-L-serine × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；289 K；0.1M Imidazole, 1.0M Sodium Acetate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.259 |
| 4XPJ Crystal structure of Nerve growth factor in complex with lysophosphatidylinositol 提交 2015-01-17 | 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
122–241（120 aa）
链 B
122–241（120 aa）
|
未记录 | LPY (2R)-2-hydroxy-3-{[(S)-hydroxy{[(1S,2R,3R,4S,5S,6R)-2,3,4,5,6-pentahydroxycyclohexyl]oxy}phosphoryl]oxy}propyl tridecanoate × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；289 K；0.1 M imidazole, 1.0 M Na acetate
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.266 |
| 6FFY Structure of the mouse SorCS2-NGF complex 提交 2018-01-09 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 B
122–238（117 aa）
链 C
122–238（117 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.6；291 K；0.225 M MES/bis-tris pH 6.6 and 6.6 % w/v PEG 6000
|
分辨率 3.90 Å R-free 0.305 |
共 7 个其他 PDB 条目、11 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态
查看构建体与数据证据
| UniProt名称 | NGF_MOUSE |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–118； UniProt 122–239 作者链 B； PDB构建体 1–118； UniProt 122–239 |
