SAXSdb — 5tdy

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Flagellar M-ring protein

Thermotoga maritima

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Flagellar motor switch protein FliG × 1 （Q9WY63） water × 2	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Flagellar motor switch protein FliG × 1 （Q9WY63） water × 2	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	Flagellar motor switch protein FliG × 2 （Q9WY63） water × 4	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	Flagellar motor switch protein FliG × 2 （Q9WY63） water × 4	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q9WY64_THEMA
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 2–37； UniProt 497–532 作者链 C； PDB构建体 2–37； UniProt 497–532

Flagellar motor switch protein FliG

Thermotoga maritima (strain ATCC 43589 / MSB8 / DSM 3109 / JCM 10099)

UniProt Q9WY63

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Flagellar M-ring protein × 1 （Q9WY64） water × 2	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Flagellar M-ring protein × 1 （Q9WY64） water × 2	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	Flagellar M-ring protein × 2 （Q9WY64） water × 4	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	Flagellar M-ring protein × 2 （Q9WY64） water × 4	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	FLIG_THEMA
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–98； UniProt 1–98 作者链 D； PDB构建体 1–98； UniProt 1–98

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	5tdy
沉积日期 deposition_date	2016-09-20
结构标题 title	Structure of cofolded FliFc:FliGn complex from Thermotoga maritima
关键词 keywords	flagellar motor, switch complex, MOTOR PROTEIN; MOTOR PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

5tdy__assembly_3__model_1

Assembly 3 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

5tdy__assembly_3__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

5tdy__assembly_3__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	21.77 Å
Rg（电子密度）	20.72 Å
总 Rg	21.56 Å
原子数	2090
残基数	255
排除体积	37898 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`5tdy__assembly_1__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`5tdy__assembly_2__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
3	1	`5tdy__assembly_3__model_1`	tetrameric （4）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
4	1	`5tdy__assembly_4__model_1`	tetrameric （4）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Flagellar M-ring protein
分子量 formula_weight	5296.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,C
原子数 atom_count	2263

MPEEKELLELLEELENIFSRSPSDIAEIVRLWFFERGLENLYF

来源 Source

来源生物 organism	Thermotoga maritima
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	243274
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Flagellar motor switch protein FliG
分子量 formula_weight	11156.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,D

MPEKKIDGRRKAAVLLVALGPEKAAQVMKHLDEETVEQLVVEIANIGRVTPEEKKQVLEEFLSLAKAKEMISEGGIEYAKKVLEKAFGPERARKIIER

来源 Source

来源生物 organism	Thermotoga maritima (strain ATCC 43589 / MSB8 / DSM 3109 / JCM 10099)
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	243274
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	173

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晶胞边长 a length_a	49.180 Å
晶胞边长 b length_b	59.327 Å
晶胞边长 c length_c	51.722 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	115.59 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.105 Å
最低分辨率 resolution_low	46.647 Å
R 因子 r_factor	0.1740
R_work r_work	0.1692
R_free r_free	0.2173

Structure of cofolded FliFc:FliGn complex from Thermotoga maritima

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Flagellar M-ring protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Flagellar motor switch protein FliG

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

5tdy__assembly_3__model_1

5tdy__assembly_3__model_1 | I(q)

5tdy__assembly_3__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 water

7. 引用文献 (1)

Structure of cofolded FliFc:FliGn complex from Thermotoga maritima

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Flagellar M-ring protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Flagellar motor switch protein FliG

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

5tdy__assembly_3__model_1

5tdy__assembly_3__model_1 | I(q)

5tdy__assembly_3__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 water

7. 引用文献 (1)