5wir

Structure of the TRF1-TERB1 interface

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 90.4 Å Quality: GOOD

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Telomeric repeat-binding factor 1

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 62–265 链 B； UniProt 62–265	未记录	TERB1-TBM × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；289 K；TRF1-TRFH and TERB1-TBM were mixed in a 1:5 molar ratio and crystal screens set up using 0.3 microliter protein solution and 0.3 microliter reservoir solution in a sitting drop format. Diffracting crystals were obtained in 0.1 M Tris-Cl (pH 8.5) and 30% PEG 300. Crystals were cryoprotected in the crystallization solution plus 10% PEG 400 and harvested in liquid nitrogen.	分辨率 2.10 Å R-free 0.210

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 5WIR	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1BA5 DNA-BINDING DOMAIN OF HUMAN TELOMERIC PROTEIN, HTRF1, NMR, 18 STRUCTURES 提交 1998-04-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 378–430（53 aa）片段：DNA-BINDING DOMAIN	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.8；300 K；离子强度（mmCIF原始值）100 mM PHOSPHATE POTASSIU；压力 1 NMR样品组成 H2O	分辨率未提供
1H6O Dimerisation domain from human TRF1 提交 2001-06-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 62–265（204 aa）片段：DIMERISATION DOMAIN RESIDUES 63-265	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6；PH6, 5-15% GLYCEROL, 1-5 MM MAGNESIUM ACETATE, 1 % PEG 8000, pH 6.00	分辨率 2.90 Å R-free 0.303
1ITY Solution structure of the DNA binding domain of human TRF1 提交 2002-02-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 371–439（69 aa）片段：DNA binding domain	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.8；300 K；压力 ambient NMR样品组成 1.5-2.5mM TRF1 U-15N, 13C, 50mM phosphate buffer, 100mM NaCl \| 90% H2O, 10% D2O, 100% D2O	分辨率未提供
1IV6 Solution Structure of the DNA Complex of Human TRF1 提交 2002-03-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric	链 A 371–439（69 aa）片段：DNA-binding domain	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.8；305 K；压力 ambient NMR样品组成 1.5-2.5mM TRF1-DNA complex; 5mM Phosphate buffer with 10mM NaCl \| 90% H2O, 10% D2O or 100% D2O	分辨率未提供
1W0T hTRF1 DNA-binding domain in complex with telomeric DNA. 提交 2004-06-11	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 A 379–431（53 aa）片段：DNA-BINDING DOMAIN, RESIDUES 379-431 链 B 379–431（53 aa）片段：DNA-BINDING DOMAIN, RESIDUES 379-431	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6；PROTEIN WAS CRYSTALLISED IN 50 MM MES, PH 6.0, 0.1 M KCL, 2 MM MGCL2 AND 10 % PEG 400 AND CRYOPROTECTED IN 20 % GLYCEROL	分辨率 2.00 Å R-free 0.273
3BQO Crystal Structure of TRF1 TRFH domain and TIN2 peptide complex 提交 2007-12-20	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 58–268（211 aa）片段：TRFH domain, Dimerization domain	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.6；289 K；NaCl 2.5 M MgCl2 0.35 M Tris 0.1 M pH 8.6 DTT 5 mM , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K	分辨率 2.00 Å R-free 0.237
3BQO Crystal Structure of TRF1 TRFH domain and TIN2 peptide complex 提交 2007-12-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 58–268（211 aa）片段：TRFH domain, Dimerization domain	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.6；289 K；NaCl 2.5 M MgCl2 0.35 M Tris 0.1 M pH 8.6 DTT 5 mM , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K	分辨率 2.00 Å R-free 0.237
3L82 X-ray Crystal structure of TRF1 and Fbx4 complex 提交 2009-12-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 58–268（211 aa）片段：Dimerization domain residues 58-268	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.2；289 K；300 mM NH4H2PO4, 100 mM sodium citrate pH 6.2, 10% n-propanol and 10 mM DTT, VAPOR DIFFUSION, temperature 289K	分辨率 2.40 Å R-free 0.263
3L82 X-ray Crystal structure of TRF1 and Fbx4 complex 提交 2009-12-29	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 58–268（211 aa）片段：Dimerization domain residues 58-268	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.2；289 K；300 mM NH4H2PO4, 100 mM sodium citrate pH 6.2, 10% n-propanol and 10 mM DTT, VAPOR DIFFUSION, temperature 289K	分辨率 2.40 Å R-free 0.263
3L82 X-ray Crystal structure of TRF1 and Fbx4 complex 提交 2009-12-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 58–268（211 aa）片段：Dimerization domain residues 58-268	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.2；289 K；300 mM NH4H2PO4, 100 mM sodium citrate pH 6.2, 10% n-propanol and 10 mM DTT, VAPOR DIFFUSION, temperature 289K	分辨率 2.40 Å R-free 0.263
5HKP Crystal structure of mouse Tankyrase/human TRF1 complex 提交 2016-01-14	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 1–55（55 aa）片段：UNP residues 1-55 链 D 1–55（55 aa）片段：UNP residues 1-55	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.035M Calcium Chloride dihydrate 0.07M MES monohydrate pH6.0 0.03M Tris pH8.5 31.5% v/v Polyethylene glycol 200 6% v/v Ethanol	分辨率 2.20 Å R-free 0.229
5XUP Crystal structure of TRF1 and TERB1 提交 2017-06-24	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 65–266（202 aa）片段：TRFH domain (UNP RESIDUES 65-266) 链 B 65–266（202 aa）片段：TRFH domain (UNP RESIDUES 65-266)	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 8.5；289 K；10% 2-propanol, 0.1M Tris-HCl	分辨率 2.10 Å R-free 0.221
8F0A Client-bound structure of a DegP trimer within a 12mer cage 提交 2022-11-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 a 404–430（27 aa）片段：UNP residues 404-430 链 b 404–430（27 aa）片段：UNP residues 404-430 链 c 404–430（27 aa）片段：UNP residues 404-430	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 2.60 Å
8F0U Structure of a 12mer DegP cage bound to the client protein hTRF1 提交 2022-11-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric	链 a 404–430（27 aa）片段：UNP residues 404-430	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.10 Å
8F0U Structure of a 12mer DegP cage bound to the client protein hTRF1 提交 2022-11-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 a 404–430（27 aa）片段：UNP residues 404-430	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.10 Å
8F0U Structure of a 12mer DegP cage bound to the client protein hTRF1 提交 2022-11-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 a 404–430（27 aa）片段：UNP residues 404-430	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.10 Å
8F1T Structure of an 18mer DegP cage bound to the client protein hTRF1 提交 2022-11-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：54-meric	链 a 404–430（27 aa）片段：UNP residues 404-430 链 b 404–430（27 aa）片段：UNP residues 404-430 链 c 404–430（27 aa）片段：UNP residues 404-430	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 12.10 Å
8F1T Structure of an 18mer DegP cage bound to the client protein hTRF1 提交 2022-11-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 a 404–430（27 aa）片段：UNP residues 404-430 链 b 404–430（27 aa）片段：UNP residues 404-430 链 c 404–430（27 aa）片段：UNP residues 404-430	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 12.10 Å
8F1T Structure of an 18mer DegP cage bound to the client protein hTRF1 提交 2022-11-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 a 404–430（27 aa）片段：UNP residues 404-430 链 b 404–430（27 aa）片段：UNP residues 404-430 链 c 404–430（27 aa）片段：UNP residues 404-430	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 12.10 Å
8F1U Structure of a 24mer DegP cage bound to the client protein hTRF1 提交 2022-11-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 72 PDB 声明：72-meric	链 a 404–430（27 aa）片段：UNP residues 404-430 链 b 404–430（27 aa）片段：UNP residues 404-430 链 c 404–430（27 aa）片段：UNP residues 404-430	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 13.80 Å
8F1U Structure of a 24mer DegP cage bound to the client protein hTRF1 提交 2022-11-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 a 404–430（27 aa）片段：UNP residues 404-430 链 b 404–430（27 aa）片段：UNP residues 404-430 链 c 404–430（27 aa）片段：UNP residues 404-430	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 13.80 Å
8F1U Structure of a 24mer DegP cage bound to the client protein hTRF1 提交 2022-11-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 a 404–430（27 aa）片段：UNP residues 404-430 链 b 404–430（27 aa）片段：UNP residues 404-430 链 c 404–430（27 aa）片段：UNP residues 404-430	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 13.80 Å
8F21 Structure of a 30mer DegP cage bound to the client protein hTRF1 提交 2022-11-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 90 PDB 声明：90-meric	链 a 404–430（27 aa）片段：UNP residues 404-430 链 b 404–430（27 aa）片段：UNP residues 404-430 链 c 404–430（27 aa）片段：UNP residues 404-430	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 14.10 Å
8F21 Structure of a 30mer DegP cage bound to the client protein hTRF1 提交 2022-11-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 a 404–430（27 aa）片段：UNP residues 404-430 链 b 404–430（27 aa）片段：UNP residues 404-430 链 c 404–430（27 aa）片段：UNP residues 404-430	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 14.10 Å
8F21 Structure of a 30mer DegP cage bound to the client protein hTRF1 提交 2022-11-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 a 404–430（27 aa）片段：UNP residues 404-430 链 b 404–430（27 aa）片段：UNP residues 404-430 链 c 404–430（27 aa）片段：UNP residues 404-430	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 14.10 Å
8F26 Structure of a 60mer DegP cage bound to the client protein hTRF1 提交 2022-11-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 180 PDB 声明：180-meric	链 a 404–430（27 aa）片段：UNP residues 404-430	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 9.70 Å
8F26 Structure of a 60mer DegP cage bound to the client protein hTRF1 提交 2022-11-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 a 404–430（27 aa）片段：UNP residues 404-430	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 9.70 Å
8F26 Structure of a 60mer DegP cage bound to the client protein hTRF1 提交 2022-11-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric	链 a 404–430（27 aa）片段：UNP residues 404-430	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 9.70 Å
8F26 Structure of a 60mer DegP cage bound to the client protein hTRF1 提交 2022-11-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric	链 a 404–430（27 aa）片段：UNP residues 404-430	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 9.70 Å
8F26 Structure of a 60mer DegP cage bound to the client protein hTRF1 提交 2022-11-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 a 404–430（27 aa）片段：UNP residues 404-430	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 9.70 Å
8OX1 Structure of TRF1core in complex with telomeric nucleosome 提交 2023-04-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 L 1–439（439 aa）链 M 1–439（439 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；25 mM HEPES-KOH pH 8.0, 150 mM KCl, 1 mM MgCl2, 1% glycerol, 0.01% Igepal CA-630, 1 mM DTT cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Blot Force: -15 Blot Time: 2.5 s	分辨率 2.70 Å
8W8G Crystal structure of human TRF1 with PinX1 提交 2023-09-02	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 58–269（212 aa）链 B 58–269（212 aa）	未记录	HEZ HEXANE-1,6-DIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.6；289 K；0.05 M HEPES, 4% PEG2000 MME, 3% 1.6-hexanediol and 0.04 M NaCl	分辨率 2.70 Å R-free 0.263
8W8G Crystal structure of human TRF1 with PinX1 提交 2023-09-02	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 58–269（212 aa）链 D 58–269（212 aa）	未记录	HEZ HEXANE-1,6-DIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.6；289 K；0.05 M HEPES, 4% PEG2000 MME, 3% 1.6-hexanediol and 0.04 M NaCl	分辨率 2.70 Å R-free 0.263
9HCL Crystal structure of human TRF1 TRFH domain in complex with compound 12 提交 2024-11-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 48–268（221 aa）	未记录	TWC 2-ethyl-5-(trifluoromethyl)-2,4-dihydro-3H-pyrazol-3-one × 6 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；150 nanoliter of TRF1 TRFH at 28.6 mg/mL plus 150 nanoliter of a crystallisation solution consisting of 0.1 M MES pH 6, 1-12 mM Mg(OAc)2, 1% PEG8000, and 10-15% glycerol, against 35 microliter of crystallisation solution.	分辨率 1.87 Å R-free 0.220
9HCM Crystal structure of human TRF1 TRFH domain in complex with compound 45 提交 2024-11-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 48–268（221 aa）	未记录	LX7 1-[4-(trifluoromethyloxy)phenyl]thiourea × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；150 nanoliter of TRF1 TRFH at 28.6 mg/mL plus 150 nanoliter of a crystallisation solution consisting of 0.1 M MES pH 6, 50 mM CaCl2 and 35-45 % PEG 200, against 35 microliter of crystallisation solution.	分辨率 2.32 Å R-free 0.314
9HCN Crystal structure of human TRF1 TRFH domain in complex with compound 46 提交 2024-11-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 48–268（221 aa）	未记录	UVA N-methyl-2-(methylsulfonyl)aniline × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；150 nanoliter of TRF1 TRFH at 28.6 mg/mL plus 150 nanoliter of a crystallisation solution consisting of 0.1 M MES pH 6, 50 mM CaCl2 and 35-45 % PEG 200, against 35 microliter of crystallisation solution.	分辨率 1.93 Å R-free 0.224
9HCP Crystal structure of human TRF1 TRFH domain in complex with compound 15 提交 2024-11-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 48–268（221 aa）	未记录	LL0 2-(difluoromethoxy)benzene-1-sulfonamide × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 4 CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；150 nanoliter of TRF1 TRFH at 28.6 mg/mL plus 150 nanoliter of a crystallisation solution consisting of 0.1 M MES pH 6, 50 mM CaCl2 and 35-45 % PEG 200, against 35 microliter of crystallisation solution.	分辨率 1.70 Å R-free 0.240
9HCQ Crystal structure of human TRF1 TRFH domain in complex with compound 47 提交 2024-11-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 48–268（221 aa）	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 JHJ N-(4-methoxyphenyl)-N'-pyridin-4-ylurea × 2 CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；150 nanoliter of TRF1 TRFH at 28.6 mg/mL plus 150 nanoliter of a crystallisation solution consisting of 0.1 M MES pH 6, 50 mM CaCl2 and 35-45 % PEG 200, against 35 microliter of crystallisation solution.	分辨率 1.96 Å R-free 0.245
9HCR Crystal structure of human TRF1 TRFH domain in complex with compound 48 提交 2024-11-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 48–268（221 aa）	未记录	W1P 5-methyl-2-phenyl-2,4-dihydro-3H-pyrazol-3-one × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；150 nanoliter of TRF1 TRFH at 28.6 mg/mL plus 150 nanoliter of a crystallisation solution consisting of 0.1 M MES pH 6, 50 mM CaCl2 and 35-45 % PEG 200, against 35 microliter of crystallisation solution.	分辨率 1.93 Å R-free 0.217
9HCS Crystal structure of human TRF1 TRFH domain in complex with compound 49 提交 2024-11-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 48–268（221 aa）	未记录	JGA N-ethyl-N'-(5-methyl-1,2-oxazol-3-yl)urea × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；150 nanoliter of TRF1 TRFH at 28.6 mg/mL plus 150 nanoliter of a crystallisation solution consisting of 0.1 M MES pH 6, 50 mM CaCl2 and 35-45 % PEG 200, against 35 microliter of crystallisation solution.	分辨率 2.20 Å R-free 0.242
9HCT Crystal structure of human TRF1 TRFH domain in complex with compound 50 提交 2024-11-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 48–268（221 aa）	未记录	B0V 2-methoxy-~{N}-(2,4,6-trimethylphenyl)ethanamide × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 10 CA CALCIUM ION × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；150 nanoliter of TRF1 TRFH at 28.6 mg/mL plus 150 nanoliter of a crystallisation solution consisting of 0.1 M MES pH 6, 50 mM CaCl2 and 35-45 % PEG 200, against 35 microliter of crystallisation solution.	分辨率 1.70 Å R-free 0.240
9HCU Crystal structure of human TRF1 TRFH domain in complex with compound 51 提交 2024-11-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 48–268（221 aa）	未记录	ZU7 N-(4-fluorophenyl)-2-(piperazin-1-yl)acetamide × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；150 nanoliter of TRF1 TRFH at 28.6 mg/mL plus 150 nanoliter of a crystallisation solution consisting of 0.1 M MES pH 6, 50 mM CaCl2 and 35-45 % PEG 200, against 35 microliter of crystallisation solution.	分辨率 2.07 Å R-free 0.260
9HCV Crystal structure of human TRF1 TRFH domain in complex with compound 16 提交 2024-11-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 48–268（221 aa）	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 A1ITZ 5-cyclobutyl-3-pyridin-2-yl-1,2,4-oxadiazole × 2 CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；150 nanoliter of TRF1 TRFH at 28.6 mg/mL plus 150 nanoliter of a crystallisation solution consisting of 0.1 M MES pH 6, 50 mM CaCl2 and 35-45 % PEG 200, against 35 microliter of crystallisation solution.	分辨率 2.08 Å R-free 0.268
9HCW Crystal structure of human TRF1 TRFH domain in complex with compound 52 提交 2024-11-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 48–268（221 aa）	未记录	A1IT0 1-(methylsulfonylamino)cyclohexane-1-carboxylic acid × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；150 nanoliter of TRF1 TRFH at 28.6 mg/mL plus 150 nanoliter of a crystallisation solution consisting of 0.1 M MES pH 6, 50 mM CaCl2 and 35-45 % PEG 200, against 35 microliter of crystallisation solution.	分辨率 2.08 Å R-free 0.255
9HCX Crystal structure of human TRF1 TRFH domain in complex with compound 53 提交 2024-11-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 48–268（221 aa）	未记录	W0S 1-(3,4,5-trimethoxyphenyl)methanamine × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 10 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；150 nanoliter of TRF1 TRFH at 28.6 mg/mL plus 150 nanoliter of a crystallisation solution consisting of 0.1 M MES pH 6, 50 mM CaCl2 and 35-45 % PEG 200, against 35 microliter of crystallisation solution.	分辨率 1.69 Å R-free 0.247
9HCY Crystal structure of human TRF1 TRFH domain in complex with compound 54 提交 2024-11-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 48–268（221 aa）	未记录	A9E 2-(4-ethylphenoxy)-1-piperidin-1-yl-ethanone × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；150 nanoliter of TRF1 TRFH at 28.6 mg/mL plus 150 nanoliter of a crystallisation solution consisting of 0.1 M MES pH 6, 50 mM CaCl2 and 35-45 % PEG 200, against 35 microliter of crystallisation solution.	分辨率 1.93 Å R-free 0.223
9HCZ Crystal structure of human TRF1 TRFH domain in complex with compound 6 提交 2024-11-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 48–268（221 aa）	未记录	TT3 2-(3-fluorophenoxy)-N,N-dimethylacetamide × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；150 nanoliter of TRF1 TRFH at 28.6 mg/mL plus 150 nanoliter of a crystallisation solution consisting of 0.1 M MES pH 6, 50 mM CaCl2 and 35-45 % PEG 200, against 35 microliter of crystallisation solution.	分辨率 1.55 Å R-free 0.214
9HD0 Crystal structure of human TRF1 TRFH domain in complex with compound 55 提交 2024-11-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 48–268（221 aa）	未记录	A9E 2-(4-ethylphenoxy)-1-piperidin-1-yl-ethanone × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；SNAQVQVGAPEEEEEEEEDAGLVAEAEAVAAGWMLDFLCLSLCRAFRDGRSEDFRRTRNSAEAIIHGLSSLTACQLRTIYICQFLTRIAAGKTLDAQFENDERITPLESALMIWGSIEKEHDKLHEEIQNLIKIQAIAVCMENGNFKEAEEVFERIFGDPNSHMPFKSKLLMIISQKDTFHSFFQHFSYNHMMEKIKSYVNYVLSEKSSTFLMKAAAKVVESKR	分辨率 1.93 Å R-free 0.223
9HD1 Crystal structure of human TRF1 TRFH domain in complex with compound 59 提交 2024-11-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 48–268（221 aa）	未记录	XH1 N-propan-2-ylurea × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 2 CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；150 nanoliter of TRF1 TRFH at 28.6 mg/mL plus 150 nanoliter of a crystallisation solution consisting of 0.1 M MES pH 6, 50 mM CaCl2 and 35-45 % PEG 200, against 35 microliter of crystallisation solution.	分辨率 1.73 Å R-free 0.227
9HD2 Crystal structure of human TRF1 TRFH domain in complex with compound 40 提交 2024-11-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 48–268（221 aa）	未记录	A1ITY 4-[(3,5-dimethoxyphenyl)methoxy]naphthalene-1-sulfonic acid × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；150 nanoliter of TRF1 TRFH at 28.6 mg/mL plus 150 nanoliter of a crystallisation solution consisting of 0.1 M MES pH 6, 50 mM CaCl2 and 35-45 % PEG 200, against 35 microliter of crystallisation solution	分辨率 2.07 Å R-free 0.268
9HD3 Crystal structure of human TRF1 TRFH domain in complex with compound 27 提交 2024-11-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 48–268（221 aa）	未记录	A1ITX 4-ethoxynaphthalene-1-sulfonic acid × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；150 nanoliter of TRF1 TRFH at 28.6 mg/mL plus 150 nanoliter of a crystallisation solution consisting of 0.1 M MES pH 6, 50 mM CaCl2 and 35-45 % PEG 200, against 35 microliter of crystallisation solution.	分辨率 2.19 Å R-free 0.274
9HD9 Crystal structure of human TRF1 TRFH domain in complex with compound 1 提交 2024-11-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 48–268（221 aa）	未记录	UUP N-cyclopropylpyrazolo[1,5-a]pyrimidine-3-carboxamide × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；150 nanoliter of TRF1 TRFH at 28.6 mg/mL plus 150 nanoliter of a crystallisation solution consisting of 0.1 M MES pH 6, 50 mM CaCl2 and 35-45 % PEG 200, against 35 microliter of crystallisation solution.	分辨率 1.87 Å R-free 0.266
9HDA Crystal structure of human TRF1 TRFH domain in complex with compound 58 提交 2024-11-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 48–268（221 aa）	未记录	PYZ 4-IODOPYRAZOLE × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；150 nanoliter of TRF1 TRFH at 28.6 mg/mL plus 150 nanoliter of a crystallisation solution consisting of 0.1 M MES pH 6, 50 mM CaCl2 and 35-45 % PEG 200, against 35 microliter of crystallisation solution.	分辨率 2.10 Å R-free 0.283
9HF4 Crystal structure of human TRF1 TRFH domain in complex with compound 32 提交 2024-11-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 48–268（221 aa）	未记录	A1IUC 4-phenylmethoxynaphthalene-1-sulfonic acid × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；150 nanoliter of TRF1 TRFH at 28.6 mg/mL plus 150 nanoliter of a crystallisation solution consisting of 0.1 M MES pH 6, 50 mM CaCl2 and 35-45 % PEG 200, against 35 microliter of crystallisation solution.	分辨率 2.17 Å R-free 0.258
9HF6 Crystal structure of human TRF1 TRFH domain in complex with compound 1 提交 2024-11-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 48–268（221 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 2 UUP N-cyclopropylpyrazolo[1,5-a]pyrimidine-3-carboxamide × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；150 nanoliter of TRF1 TRFH at 28.6 mg/mL plus 150 nanoliter of a crystallisation solution consisting of 0.1 M MES pH 6, 1-12 mM Mg(OAc)2, 1% PEG8000, and 10-15% glycerol, against 35 microliter of crystallisation solution.	分辨率 2.23 Å R-free 0.248
9HF7 Crystal structure of human TRF1 TRFH domain in complex with compound 3 提交 2024-11-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 48–268（221 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 2 JFP N-(4-methyl-1,3-thiazol-2-yl)propanamide × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；150 nanoliter of TRF1 TRFH at 28.6 mg/mL plus 150 nanoliter of a crystallisation solution consisting of 0.1 M MES pH 6, 1-12 mM Mg(OAc)2, 1% PEG8000, and 10-15% glycerol, against 35 microliter of crystallisation solution.	分辨率 2.38 Å R-free 0.255
9HF8 Crystal structure of human TRF1 TRFH domain in complex with compound 4 提交 2024-11-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 48–268（221 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 2 T9Q N-Benzyl-2-methoxyacetamide × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；150 nanoliter of TRF1 TRFH at 28.6 mg/mL plus 150 nanoliter of a crystallisation solution consisting of 0.1 M MES pH 6, 1-12 mM Mg(OAc)2, 1% PEG8000, and 10-15% glycerol, against 35 microliter of crystallisation solution.	分辨率 2.19 Å R-free 0.255
9HF9 Crystal structure of human TRF1 TRFH domain in complex with compound 5 提交 2024-11-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 48–268（221 aa）	未记录	NZ1 5-methoxy-1,3-benzothiazol-2-amine × 4 GOL GLYCEROL × 8 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；150 nanoliter of TRF1 TRFH at 28.6 mg/mL plus 150 nanoliter of a crystallisation solution consisting of 0.1 M MES pH 6, 1-12 mM Mg(OAc)2, 1% PEG8000, and 10-15% glycerol, against 35 microliter of crystallisation solution.	分辨率 1.90 Å R-free 0.228
9HFA Crystal structure of human TRF1 TRFH domain in complex with compound 6 提交 2024-11-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 48–268（221 aa）	未记录	TT3 2-(3-fluorophenoxy)-N,N-dimethylacetamide × 4 GOL GLYCEROL × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；150 nanoliter of TRF1 TRFH at 28.6 mg/mL plus 150 nanoliter of a crystallisation solution consisting of 0.1 M MES pH 6, 1-12 mM Mg(OAc)2, 1% PEG8000, and 10-15% glycerol, against 35 microliter of crystallisation solution.	分辨率 2.05 Å R-free 0.246
9HFB Crystal structure of human TRF1 TRFH domain in complex with compound 7 提交 2024-11-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 48–268（221 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 2 JP4 [2-(morpholin-4-yl)phenyl]methanol × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；150 nanoliter of TRF1 TRFH at 28.6 mg/mL plus 150 nanoliter of a crystallisation solution consisting of 0.1 M MES pH 6, 1-12 mM Mg(OAc)2, 1% PEG8000, and 10-15% glycerol, against 35 microliter of crystallisation solution.	分辨率 2.29 Å R-free 0.265
9HFC Crystal structure of human TRF1 TRFH domain in complex with compound 8 提交 2024-11-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 48–268（221 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 2 WHM 2-[(3-fluorophenyl)methyl]-1lambda~6~,2-thiazolidine-1,1-dione × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；150 nanoliter of TRF1 TRFH at 28.6 mg/mL plus 150 nanoliter of a crystallisation solution consisting of 0.1 M MES pH 6, 1-12 mM Mg(OAc)2, 1% PEG8000, and 10-15% glycerol, against 35 microliter of crystallisation solution.	分辨率 2.17 Å R-free 0.243
9HFD Crystal structure of human TRF1 TRFH domain in complex with compound 9 提交 2024-11-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 48–268（221 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 2 VW4 (2S)-2-phenylpropane-1-sulfonamide × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；150 nanoliter of TRF1 TRFH at 28.6 mg/mL plus 150 nanoliter of a crystallisation solution consisting of 0.1 M MES pH 6, 1-12 mM Mg(OAc)2, 1% PEG8000, and 10-15% glycerol, against 35 microliter of crystallisation solution.	分辨率 2.15 Å R-free 0.245
9HFE Crystal structure of human TRF1 TRFH domain in complex with compound 10 提交 2024-11-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 48–268（221 aa）	未记录	PK4 2-fluoro-N,3-dimethylbenzene-1-sulfonamide × 4 GOL GLYCEROL × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；150 nanoliter of TRF1 TRFH at 28.6 mg/mL plus 150 nanoliter of a crystallisation solution consisting of 0.1 M MES pH 6, 1-12 mM Mg(OAc)2, 1% PEG8000, and 10-15% glycerol, against 35 microliter of crystallisation solution.	分辨率 2.04 Å R-free 0.247
9HFF Crystal structure of human TRF1 TRFH domain in complex with compound 11 提交 2024-11-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 48–268（221 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 2 A1IUE (2~{S})-2-[(5-chloranylpyrimidin-2-yl)-methyl-amino]propan-1-ol × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；150 nanoliter of TRF1 TRFH at 28.6 mg/mL plus 150 nanoliter of a crystallisation solution consisting of 0.1 M MES pH 6, 1-12 mM Mg(OAc)2, 1% PEG8000, and 10-15% glycerol, against 35 microliter of crystallisation solution.	分辨率 2.06 Å R-free 0.261
9HFG Crystal structure of human TRF1 TRFH domain in complex with compound 14 提交 2024-11-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 48–268（221 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 2 A1A34 2-methoxy-N-[(4-methylphenyl)methyl]acetamide × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；150 nanoliter of TRF1 TRFH at 28.6 mg/mL plus 150 nanoliter of a crystallisation solution consisting of 0.1 M MES pH 6, 1-12 mM Mg(OAc)2, 1% PEG8000, and 10-15% glycerol, against 35 microliter of crystallisation solution.	分辨率 2.02 Å R-free 0.253
9HFH Crystal structure of human TRF1 TRFH domain in complex with compound 16 提交 2024-11-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 48–268（221 aa）	未记录	A1ITZ 5-cyclobutyl-3-pyridin-2-yl-1,2,4-oxadiazole × 4 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；150 nanoliter of TRF1 TRFH at 28.6 mg/mL plus 150 nanoliter of a crystallisation solution consisting of 0.1 M MES pH 6, 1-12 mM Mg(OAc)2, 1% PEG8000, and 10-15% glycerol, against 35 microliter of crystallisation solution.	分辨率 2.12 Å R-free 0.263
9HFI Crystal structure of human TRF1 TRFH domain in complex with compound 17 提交 2024-11-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 48–268（221 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 2 A1BGH (3R)-3-[1-methyl-4-(trifluoromethyl)-1H-imidazol-2-yl]piperidine × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；150 nanoliter of TRF1 TRFH at 28.6 mg/mL plus 150 nanoliter of a crystallisation solution consisting of 0.1 M MES pH 6, 1-12 mM Mg(OAc)2, 1% PEG8000, and 10-15% glycerol, against 35 microliter of crystallisation solution.	分辨率 2.44 Å R-free 0.276
9HHK Crystal structure of human TRF1 TRFH domain in complex with compound 2 提交 2024-11-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 48–268（221 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 2 A1IU1 ~{N}-(furan-2-ylmethyl)-2-methyl-furan-3-carboxamide × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；150 nanoliter of TRF1 TRFH at 28.6 mg/mL plus 150 nanoliter of a crystallisation solution consisting of 0.1 M MES pH 6, 1-12 mM Mg(OAc)2, 1% PEG8000, and 10-15% glycerol, against 35 microliter of crystallisation solution.	分辨率 2.23 Å R-free 0.246
9HLP Crystal structure of human TRF1 TRFH domain in complex with compound 18 提交 2024-12-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 48–268（221 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 2 A1IV7 1-piperidin-4-ylindole × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；150 nanoliter of TRF1 TRFH at 28.6 mg/mL plus 150 nanoliter of a crystallisation solution consisting of 0.1 M MES pH 6, 1-12 mM Mg(OAc)2, 1% PEG8000, and 10-15% glycerol, against 35 microliter of crystallisation solution.	分辨率 2.24 Å R-free 0.255
9HLQ Crystal structure of human TRF1 TRFH domain in complex with compound 57 提交 2024-12-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 48–268（221 aa）	未记录	HHQ 4-iodanyl-3~{H}-pyridin-2-one × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；150 nanoliter of TRF1 TRFH at 28.6 mg/mL plus 150 nanoliter of a crystallisation solution consisting of 0.1 M MES pH 6, 50 mM CaCl2 and 35-45 % PEG 200, against 35 microliter of crystallisation solution.	分辨率 2.50 Å R-free 0.297
9HLR Crystal structure of human TRF1 TRFH domain in complex with compound 15 提交 2024-12-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 48–268（221 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 2 LL0 2-(difluoromethoxy)benzene-1-sulfonamide × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；150 nanoliter of TRF1 TRFH at 28.6 mg/mL plus 150 nanoliter of a crystallisation solution consisting of 0.1 M MES pH 6, 1-12 mM Mg(OAc)2, 1% PEG8000, and 10-15% glycerol, against 35 microliter of crystallisation solution.	分辨率 2.48 Å R-free 0.269
9HLT Crystal structure of human TRF1 TRFH domain in complex with compound 13 提交 2024-12-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 48–268（221 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 2 UJK 1-(2-methylphenyl)-1,2,3-triazole-4-carboxylic acid × 4 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；150 nanoliter of TRF1 TRFH at 28.6 mg/mL plus 150 nanoliter of a crystallisation solution consisting of 0.1 M MES pH 6, 1-12 mM Mg(OAc)2, 1% PEG8000, and 10-15% glycerol, against 35 microliter of crystallisation solution.	分辨率 2.16 Å R-free 0.261
9HLU Crystal structure of human TRF1 TRFH domain in complex with compound 19 提交 2024-12-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 48–268（221 aa）	未记录	UUG (4-bromo-2-methoxyphenyl)methanol × 4 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；150 nanoliter of TRF1 TRFH at 28.6 mg/mL plus 150 nanoliter of a crystallisation solution consisting of 0.1 M MES pH 6, 1-12 mM Mg(OAc)2, 1% PEG8000, and 10-15% glycerol, against 35 microliter of crystallisation solution.	分辨率 2.23 Å R-free 0.279

共 57 个其他 PDB 条目、73 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TERF1_HUMAN
Isoform	P54274-2
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 2–205； UniProt 62–265 作者链 B； PDB构建体 2–205； UniProt 62–265

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	5wir
沉积日期 deposition_date	2017-07-20
结构标题 title	Structure of the TRF1-TERB1 interface
关键词 keywords	meiosis, telomere, CDK phosphorylation, DNA BINDING PROTEIN; DNA BINDING PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	27.60 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	27.36 Å
零角强度 I(0) i0	39593300.00
分子量 molecular_weight	49113.0 kDa
排除体积 excluded_volume	61554 Å³
包络体积 envelope_volume	76103 Å³
水化壳体积 shell_volume	24592 Å³
包络直径 envelope_diameter	94.4 Å
壳层 Rg shell_rg	32.72 Å
包络 Rg envelope_rg	27.40 Å
形状 Rg shape_rg	27.40 Å
总 Rg total_rg	27.79 Å
总原子数 total_atoms	3446
残基数 n_residues	429
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	90.4 Å
Rg (实空间) rg_real	27.81 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.63 Å
I(0) (实空间) i0_real	3.9590e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	5.5910e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal	27.75 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	39590000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8565
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	25.4 Å
偏度 Skewness skewness	0.477
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.399
角度范围 angular_range	— – 0.2850 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	11010000.0000
实空间数据点数 n_real_points	58
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.847; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.865; Smooth: 0.723

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

▶

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	TERB1-TBM
分子量 formula_weight	1858.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D,C
原子数 atom_count	3778

SKKILLTPRRRQRLS

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Telomeric repeat-binding factor 1
分子量 formula_weight	23413.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,A

SEDAGLVAEAEAVAAGWMLDFLCLSLCRAFRDGRSEDFRRTRNSAEAIIHGLSSLTACQLRTIYICQFLTRIAAGKTLDAQFENDERITPLESALMIWGSIEKEHDKLHEEIQNLIKIQAIAVCMENGNFKEAEEVFERIFGDPNSHMPFKSKLLMIISQKDTFHSFFQHFSYNHMMEKIKSYVNYVLSEKSSTFLMKAAAKVVE

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	332

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id	5wirA00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	25 — Alpha Horseshoe
拓扑 Topology topology	40 — Serine Threonine Protein Phosphatase 5, Tetratricopeptide repeat
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	210 — Telomere repeat-binding factor, dimerisation domain

结构域编号 domain_id	5wirB00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	25 — Alpha Horseshoe
拓扑 Topology topology	40 — Serine Threonine Protein Phosphatase 5, Tetratricopeptide repeat
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	210 — Telomere repeat-binding factor, dimerisation domain

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	161.720 Å
晶胞边长 b length_b	161.720 Å
晶胞边长 c length_c	45.170 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	12

空间群 space_group	P 64
空间群编号 int_tables_number	172
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.100 Å
最低分辨率 resolution_low	46.685 Å
R 因子 r_factor	0.1806
R_work r_work	0.1790
R_free r_free	0.2104

fit	/app/data/saxs_computation/wi/5wir/5wir.fit
pddf	/app/data/pr_computation/wi/5wir/5wir.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/wi/5wir/5wir.dat

Structure of the TRF1-TERB1 interface

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Telomeric repeat-binding factor 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)