5x6u

Crystal structure of human heteropentameric complex

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 82.5 Å Quality: EXCELLENT

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Ragulator complex protein LAMTOR3

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 2–124	未记录	Ragulator complex protein LAMTOR2 × 1 （Q9Y2Q5） Ragulator complex protein LAMTOR5 × 1 （O43504） Ragulator complex protein LAMTOR4 × 1 （Q0VGL1） Ragulator complex protein LAMTOR1 × 1 （Q6IAA8）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；Tris-HCl, 2-propanol, 1,6-hexandiol, 1,4-butandiol, 1-butanol, 1,3-propanediol, PEG 100, PEG 3350, 2-Methyl-2,4-pentanediol	分辨率 2.40 Å R-free 0.232

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 5X6U	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1SKO MP1-p14 Complex 提交 2004-03-05	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–124（123 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；293 K；14% PEG 3350, 0.1M Tris-HCl buffer, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.00 Å R-free 0.271
2ZL1 MP1-p14 Scaffolding complex 提交 2008-04-02	突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–124（123 aa）	突变：L63A, L65A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；295 K；11%(w/v) PEG 3350, 0.1M HEPES, pH 7.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 295K	分辨率 2.00 Å R-free 0.256
3CPT MP1-p14 Scaffolding complex 提交 2008-04-01	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–124（123 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；295 K；10%(w/v) PEG 3350, 0.1 M HEPES, pH 7.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 295K	分辨率 1.90 Å R-free 0.277
5X6V Crystal structure of human heteroheptameric complex 提交 2017-02-23	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 A 2–124（123 aa）	未记录	NA SODIUM ION × 1 ACT ACETATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；sodium citrate, ammonium acetate, PEG 4000	分辨率 2.02 Å R-free 0.243
5Y39 Crystal structure of Ragulator complex (p18 76-145) 提交 2017-07-28	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 C 1–124（124 aa）片段：Roadblock domain	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；289 K；0.1 M Bis-Tris (pH 5.5), and 25% (w/v) PEG 3350	分辨率 2.65 Å R-free 0.263
5Y39 Crystal structure of Ragulator complex (p18 76-145) 提交 2017-07-28	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 H 1–124（124 aa）片段：Roadblock domain	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；289 K；0.1 M Bis-Tris (pH 5.5), and 25% (w/v) PEG 3350	分辨率 2.65 Å R-free 0.263
5Y3A Crystal structure of Ragulator complex (p18 49-161) 提交 2017-07-28	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 C 1–124（124 aa）片段：Roadblock domain	未记录	SO4 SULFATE ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；289 K；0.1 M Bis-Tris (pH 5.5), and 25% (w/v) PEG 3350	分辨率 2.90 Å R-free 0.288
5Y3A Crystal structure of Ragulator complex (p18 49-161) 提交 2017-07-28	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 H 1–124（124 aa）片段：Roadblock domain	未记录	SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；289 K；0.1 M Bis-Tris (pH 5.5), and 25% (w/v) PEG 3350	分辨率 2.90 Å R-free 0.288
5YK3 human Ragulator complex 提交 2017-10-12	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 m 1–124（124 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；0.1M CHES, pH 9.5, 0.56 M sodium citrate tribasic, and 1.4 M sodium chloride	分辨率 3.01 Å R-free 0.285
5YK3 human Ragulator complex 提交 2017-10-12	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 C 2–123（122 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；0.1M CHES, pH 9.5, 0.56 M sodium citrate tribasic, and 1.4 M sodium chloride	分辨率 3.01 Å R-free 0.285
5YK3 human Ragulator complex 提交 2017-10-12	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 H 1–124（124 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；0.1M CHES, pH 9.5, 0.56 M sodium citrate tribasic, and 1.4 M sodium chloride	分辨率 3.01 Å R-free 0.285
6B9X Crystal structure of Ragulator 提交 2017-10-11	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 C 1–124（124 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；292 K；0.1 M CHES pH 9.0, 40% PEG 600	分辨率 1.42 Å R-free 0.237
6EHP The crystal structure of the human LAMTOR complex 提交 2017-09-14	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 1–124（124 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；20% [w/v] PEG 3350, 0.1M Tris/HCl pH8.5, 0.2M MgCl2, 3% 2-Methyl-2-propanol	分辨率 2.30 Å R-free 0.228
6EHR The crystal structure of the human LAMTOR-RagA CTD-RagC CTD complex 提交 2017-09-14	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 A 1–124（124 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10% [w/v] PEG 4000, 0.1M tri-sodium-citrate pH5.5, 5% [v/v] isopropanol	分辨率 2.90 Å R-free 0.263
6NZD Cryo-EM Structure of the Lysosomal Folliculin Complex (FLCN-FNIP2-RagA-RagC-Ragulator) 提交 2019-02-13	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 C 1–124（124 aa）	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 L8S 9-{5-O-[(S)-hydroxy{[(R)-hydroxy(thiophosphonooxy)phosphoryl]oxy}phosphoryl]-alpha-L-arabinofuranosyl}-3,9-dihydro-1H-purine-2,6-dione × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Whatman 597	分辨率 3.60 Å
6U62 Raptor-Rag-Ragulator complex 提交 2019-08-29	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 F 1–124（124 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.18 Å
6ULG Cryo-EM structure of the FLCN-FNIP2-Rag-Ragulator complex 提交 2019-10-08	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 A 1–124（124 aa）	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.31 Å
6WJ2 CryoEM structure of the SLC38A9-RagA-RagC-Ragulator complex in the pre-GAP state 提交 2020-04-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 C 1–124（124 aa）	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 L8S 9-{5-O-[(S)-hydroxy{[(R)-hydroxy(thiophosphonooxy)phosphoryl]oxy}phosphoryl]-alpha-L-arabinofuranosyl}-3,9-dihydro-1H-purine-2,6-dione × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
6WJ3 CryoEM structure of the SLC38A9-RagA-RagC-Ragulator complex in the post-GAP state 提交 2020-04-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 C 1–124（124 aa）	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 U3J xanthosine diphosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
7T3A GATOR1-RAG-RAGULATOR - Inhibitory Complex 提交 2021-12-07	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 O 1–124（124 aa）	未记录	GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
7T3B GATOR1-RAG-RAGULATOR - GAP Complex 提交 2021-12-07	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 H 1–124（124 aa）	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
7T3C GATOR1-RAG-RAGULATOR - Dual Complex 提交 2021-12-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric	链 H 1–124（124 aa）链 O 1–124（124 aa）	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
7UX2 cryo-EM structure of the Raptor-TFEB-Rag-Ragulator complex 提交 2022-05-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric	链 F 1–124（124 aa）链 M 1–124（124 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
7UXC cryo-EM structure of the mTORC1-TFEB-Rag-Ragulator complex with symmetry expansion 提交 2022-05-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric	链 H 1–124（124 aa）链 O 1–124（124 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
7UXH cryo-EM structure of the mTORC1-TFEB-Rag-Ragulator complex 提交 2022-05-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric	链 J 1–124（124 aa）链 Q 1–124（124 aa）链 Z 1–124（124 aa）链 g 1–124（124 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8DHB Active FLCN GAP complex 提交 2022-06-25	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 E 1–124（124 aa）	未记录	CZC [(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-[2,6-bis(oxidanylidene)-3~{H}-purin-9-yl]-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl phosphono hydrogen phosphate × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.53 Å
9ED4 A composite map of mTORC1-Rag-Ragultor-4EBP1 on membrane 提交 2024-11-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric	链 H 1–124（124 aa）链 R 1–124（124 aa）	未记录	GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 8 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.23 Å
9ED6 CryoEM map of the mLST8-Rag-Ragultor subcomplex 提交 2024-11-15	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 F 1–124（124 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.98 Å

共 24 个其他 PDB 条目、28 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	LTOR3_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 5–127； UniProt 2–124

Ragulator complex protein LAMTOR2

Homo sapiens

UniProt Q9Y2Q5

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 1–125	未记录	Ragulator complex protein LAMTOR3 × 1 （Q9UHA4） Ragulator complex protein LAMTOR5 × 1 （O43504） Ragulator complex protein LAMTOR4 × 1 （Q0VGL1） Ragulator complex protein LAMTOR1 × 1 （Q6IAA8）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；Tris-HCl, 2-propanol, 1,6-hexandiol, 1,4-butandiol, 1-butanol, 1,3-propanediol, PEG 100, PEG 3350, 2-Methyl-2,4-pentanediol	分辨率 2.40 Å R-free 0.232

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 5X6U	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
5X6V Crystal structure of human heteroheptameric complex 提交 2017-02-23	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 B 1–125（125 aa）	未记录	NA SODIUM ION × 1 ACT ACETATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；sodium citrate, ammonium acetate, PEG 4000	分辨率 2.02 Å R-free 0.243
5Y39 Crystal structure of Ragulator complex (p18 76-145) 提交 2017-07-28	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 B 1–125（125 aa）片段：Roadblock domain	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；289 K；0.1 M Bis-Tris (pH 5.5), and 25% (w/v) PEG 3350	分辨率 2.65 Å R-free 0.263
5Y39 Crystal structure of Ragulator complex (p18 76-145) 提交 2017-07-28	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 G 1–125（125 aa）片段：Roadblock domain	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；289 K；0.1 M Bis-Tris (pH 5.5), and 25% (w/v) PEG 3350	分辨率 2.65 Å R-free 0.263
5Y3A Crystal structure of Ragulator complex (p18 49-161) 提交 2017-07-28	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 B 1–125（125 aa）片段：Roadblock domain	未记录	SO4 SULFATE ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；289 K；0.1 M Bis-Tris (pH 5.5), and 25% (w/v) PEG 3350	分辨率 2.90 Å R-free 0.288
5Y3A Crystal structure of Ragulator complex (p18 49-161) 提交 2017-07-28	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 G 1–125（125 aa）片段：Roadblock domain	未记录	SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；289 K；0.1 M Bis-Tris (pH 5.5), and 25% (w/v) PEG 3350	分辨率 2.90 Å R-free 0.288
5YK3 human Ragulator complex 提交 2017-10-12	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 l 1–125（125 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；0.1M CHES, pH 9.5, 0.56 M sodium citrate tribasic, and 1.4 M sodium chloride	分辨率 3.01 Å R-free 0.285
5YK3 human Ragulator complex 提交 2017-10-12	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 B 4–125（122 aa）	突变：V122A, S125A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；0.1M CHES, pH 9.5, 0.56 M sodium citrate tribasic, and 1.4 M sodium chloride	分辨率 3.01 Å R-free 0.285
5YK3 human Ragulator complex 提交 2017-10-12	实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 G 1–125（125 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；0.1M CHES, pH 9.5, 0.56 M sodium citrate tribasic, and 1.4 M sodium chloride	分辨率 3.01 Å R-free 0.285
6B9X Crystal structure of Ragulator 提交 2017-10-11	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 B 1–125（125 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；292 K；0.1 M CHES pH 9.0, 40% PEG 600	分辨率 1.42 Å R-free 0.237
6EHP The crystal structure of the human LAMTOR complex 提交 2017-09-14	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 B 2–125（124 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；20% [w/v] PEG 3350, 0.1M Tris/HCl pH8.5, 0.2M MgCl2, 3% 2-Methyl-2-propanol	分辨率 2.30 Å R-free 0.228
6EHR The crystal structure of the human LAMTOR-RagA CTD-RagC CTD complex 提交 2017-09-14	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 B 2–125（124 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10% [w/v] PEG 4000, 0.1M tri-sodium-citrate pH5.5, 5% [v/v] isopropanol	分辨率 2.90 Å R-free 0.263
6NZD Cryo-EM Structure of the Lysosomal Folliculin Complex (FLCN-FNIP2-RagA-RagC-Ragulator) 提交 2019-02-13	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 B 1–125（125 aa）	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 L8S 9-{5-O-[(S)-hydroxy{[(R)-hydroxy(thiophosphonooxy)phosphoryl]oxy}phosphoryl]-alpha-L-arabinofuranosyl}-3,9-dihydro-1H-purine-2,6-dione × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Whatman 597	分辨率 3.60 Å
6U62 Raptor-Rag-Ragulator complex 提交 2019-08-29	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 E 1–125（125 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.18 Å
6ULG Cryo-EM structure of the FLCN-FNIP2-Rag-Ragulator complex 提交 2019-10-08	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 B 1–125（125 aa）	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.31 Å
6WJ2 CryoEM structure of the SLC38A9-RagA-RagC-Ragulator complex in the pre-GAP state 提交 2020-04-11	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 B 1–125（125 aa）	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 L8S 9-{5-O-[(S)-hydroxy{[(R)-hydroxy(thiophosphonooxy)phosphoryl]oxy}phosphoryl]-alpha-L-arabinofuranosyl}-3,9-dihydro-1H-purine-2,6-dione × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
6WJ3 CryoEM structure of the SLC38A9-RagA-RagC-Ragulator complex in the post-GAP state 提交 2020-04-11	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 B 1–125（125 aa）	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 U3J xanthosine diphosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
7T3A GATOR1-RAG-RAGULATOR - Inhibitory Complex 提交 2021-12-07	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 N 1–125（125 aa）	未记录	GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
7T3B GATOR1-RAG-RAGULATOR - GAP Complex 提交 2021-12-07	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 G 1–125（125 aa）	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
7T3C GATOR1-RAG-RAGULATOR - Dual Complex 提交 2021-12-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric	链 G 1–125（125 aa）链 N 1–125（125 aa）	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
7UX2 cryo-EM structure of the Raptor-TFEB-Rag-Ragulator complex 提交 2022-05-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric	链 E 1–125（125 aa）链 L 1–125（125 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
7UXC cryo-EM structure of the mTORC1-TFEB-Rag-Ragulator complex with symmetry expansion 提交 2022-05-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric	链 G 1–125（125 aa）链 N 1–125（125 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
7UXH cryo-EM structure of the mTORC1-TFEB-Rag-Ragulator complex 提交 2022-05-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric	链 I 1–125（125 aa）链 P 1–125（125 aa）链 Y 1–125（125 aa）链 f 1–125（125 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8DHB Active FLCN GAP complex 提交 2022-06-25	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 D 1–125（125 aa）	未记录	CZC [(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-[2,6-bis(oxidanylidene)-3~{H}-purin-9-yl]-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl phosphono hydrogen phosphate × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.53 Å
9ED4 A composite map of mTORC1-Rag-Ragultor-4EBP1 on membrane 提交 2024-11-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric	链 G 1–125（125 aa）链 Q 1–125（125 aa）	未记录	GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 8 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.23 Å
9ED6 CryoEM map of the mLST8-Rag-Ragultor subcomplex 提交 2024-11-15	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 E 1–125（125 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.98 Å

共 21 个其他 PDB 条目、25 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	LTOR2_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–125； UniProt 1–125

Ragulator complex protein LAMTOR5

Homo sapiens

UniProt O43504

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 1–91	未记录	Ragulator complex protein LAMTOR3 × 1 （Q9UHA4） Ragulator complex protein LAMTOR2 × 1 （Q9Y2Q5） Ragulator complex protein LAMTOR4 × 1 （Q0VGL1） Ragulator complex protein LAMTOR1 × 1 （Q6IAA8）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；Tris-HCl, 2-propanol, 1,6-hexandiol, 1,4-butandiol, 1-butanol, 1,3-propanediol, PEG 100, PEG 3350, 2-Methyl-2,4-pentanediol	分辨率 2.40 Å R-free 0.232

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 5X6U	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
3MS6 Crystal structure of Hepatitis B X-Interacting Protein (HBXIP) 提交 2010-04-29	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–91（91 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 4 GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；292 K；20-24% PEG3350, 20% isopropanol, 0.1M tri-sodium citrate dihydrate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 2.08 Å R-free 0.228
3MSH Crystal structure of Hepatitis B X-Interacting Protein at high resolution 提交 2010-04-29	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–91（91 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 2 IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 6 PO4 PHOSPHATE ION × 2 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；292 K；20-24% PEG3350, 20% isopropanol, 0.1M tri-sodium citrate dihydrate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 1.51 Å R-free 0.212
5VOK Crystal structure of the C7orf59-HBXIP dimer 提交 2017-05-03	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–91（91 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291.15 K；4M sodium formate, 5%(v/v) glycerol and 0.01M barium chloride (as additive).	分辨率 2.89 Å R-free 0.312
5VOK Crystal structure of the C7orf59-HBXIP dimer 提交 2017-05-03	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–91（91 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291.15 K；4M sodium formate, 5%(v/v) glycerol and 0.01M barium chloride (as additive).	分辨率 2.89 Å R-free 0.312
5VOK Crystal structure of the C7orf59-HBXIP dimer 提交 2017-05-03	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 1–91（91 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291.15 K；4M sodium formate, 5%(v/v) glycerol and 0.01M barium chloride (as additive).	分辨率 2.89 Å R-free 0.312
5VOK Crystal structure of the C7orf59-HBXIP dimer 提交 2017-05-03	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 G 1–91（91 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291.15 K；4M sodium formate, 5%(v/v) glycerol and 0.01M barium chloride (as additive).	分辨率 2.89 Å R-free 0.312
5VOK Crystal structure of the C7orf59-HBXIP dimer 提交 2017-05-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–91（91 aa）链 C 1–91（91 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291.15 K；4M sodium formate, 5%(v/v) glycerol and 0.01M barium chloride (as additive).	分辨率 2.89 Å R-free 0.312
5VOK Crystal structure of the C7orf59-HBXIP dimer 提交 2017-05-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 E 1–91（91 aa）链 G 1–91（91 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291.15 K；4M sodium formate, 5%(v/v) glycerol and 0.01M barium chloride (as additive).	分辨率 2.89 Å R-free 0.312
5X6V Crystal structure of human heteroheptameric complex 提交 2017-02-23	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 C 1–91（91 aa）	未记录	NA SODIUM ION × 1 ACT ACETATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；sodium citrate, ammonium acetate, PEG 4000	分辨率 2.02 Å R-free 0.243
5Y38 Crystal structure of C7orf59-HBXIP complex 提交 2017-07-28	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–91（91 aa）片段：Roadblock domain	未记录	SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；289 K；0.16 M ammonium sulfate, 0.08 M sodium acetate trihydrate (pH 4.6), and 20% (w/v) PEG 4000	分辨率 2.80 Å R-free 0.256
5Y39 Crystal structure of Ragulator complex (p18 76-145) 提交 2017-07-28	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 E 1–90（90 aa）片段：Roadblock domain, UNP residues 1-90	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；289 K；0.1 M Bis-Tris (pH 5.5), and 25% (w/v) PEG 3350	分辨率 2.65 Å R-free 0.263
5Y39 Crystal structure of Ragulator complex (p18 76-145) 提交 2017-07-28	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 J 1–90（90 aa）片段：Roadblock domain, UNP residues 1-90	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；289 K；0.1 M Bis-Tris (pH 5.5), and 25% (w/v) PEG 3350	分辨率 2.65 Å R-free 0.263
5Y3A Crystal structure of Ragulator complex (p18 49-161) 提交 2017-07-28	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 E 1–91（91 aa）片段：Roadblock domain	未记录	SO4 SULFATE ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；289 K；0.1 M Bis-Tris (pH 5.5), and 25% (w/v) PEG 3350	分辨率 2.90 Å R-free 0.288
5Y3A Crystal structure of Ragulator complex (p18 49-161) 提交 2017-07-28	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 J 1–91（91 aa）片段：Roadblock domain	未记录	SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；289 K；0.1 M Bis-Tris (pH 5.5), and 25% (w/v) PEG 3350	分辨率 2.90 Å R-free 0.288
5YK3 human Ragulator complex 提交 2017-10-12	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 o 1–90（90 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；0.1M CHES, pH 9.5, 0.56 M sodium citrate tribasic, and 1.4 M sodium chloride	分辨率 3.01 Å R-free 0.285
5YK3 human Ragulator complex 提交 2017-10-12	实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 E 1–91（91 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；0.1M CHES, pH 9.5, 0.56 M sodium citrate tribasic, and 1.4 M sodium chloride	分辨率 3.01 Å R-free 0.285
5YK3 human Ragulator complex 提交 2017-10-12	实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 J 1–91（91 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；0.1M CHES, pH 9.5, 0.56 M sodium citrate tribasic, and 1.4 M sodium chloride	分辨率 3.01 Å R-free 0.285
5YK5 structure of the human Lamtor4-Lamtor5 complex 提交 2017-10-12	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 3–90（88 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；0.1M Tris-HCl, pH 8.0, 3.5M sodium formate	分辨率 2.03 Å R-free 0.294
5YK5 structure of the human Lamtor4-Lamtor5 complex 提交 2017-10-12	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 4–89（86 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；0.1M Tris-HCl, pH 8.0, 3.5M sodium formate	分辨率 2.03 Å R-free 0.294
6EHP The crystal structure of the human LAMTOR complex 提交 2017-09-14	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 C 1–91（91 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；20% [w/v] PEG 3350, 0.1M Tris/HCl pH8.5, 0.2M MgCl2, 3% 2-Methyl-2-propanol	分辨率 2.30 Å R-free 0.228
6EHR The crystal structure of the human LAMTOR-RagA CTD-RagC CTD complex 提交 2017-09-14	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 C 1–91（91 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10% [w/v] PEG 4000, 0.1M tri-sodium-citrate pH5.5, 5% [v/v] isopropanol	分辨率 2.90 Å R-free 0.263
6U62 Raptor-Rag-Ragulator complex 提交 2019-08-29	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 H 1–91（91 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.18 Å
6ULG Cryo-EM structure of the FLCN-FNIP2-Rag-Ragulator complex 提交 2019-10-08	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 C 1–91（91 aa）	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.31 Å
7T3A GATOR1-RAG-RAGULATOR - Inhibitory Complex 提交 2021-12-07	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 Q 1–91（91 aa）	未记录	GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
7T3B GATOR1-RAG-RAGULATOR - GAP Complex 提交 2021-12-07	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 J 1–91（91 aa）	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
7T3C GATOR1-RAG-RAGULATOR - Dual Complex 提交 2021-12-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric	链 J 1–91（91 aa）链 Q 1–91（91 aa）	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
7UX2 cryo-EM structure of the Raptor-TFEB-Rag-Ragulator complex 提交 2022-05-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric	链 H 1–91（91 aa）链 O 1–91（91 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
7UXC cryo-EM structure of the mTORC1-TFEB-Rag-Ragulator complex with symmetry expansion 提交 2022-05-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric	链 J 1–91（91 aa）链 Q 1–91（91 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
7UXH cryo-EM structure of the mTORC1-TFEB-Rag-Ragulator complex 提交 2022-05-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric	链 L 1–91（91 aa）链 S 1–91（91 aa）链 b 1–91（91 aa）链 i 1–91（91 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
9ED4 A composite map of mTORC1-Rag-Ragultor-4EBP1 on membrane 提交 2024-11-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric	链 J 1–91（91 aa）链 S 1–91（91 aa）	未记录	GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 8 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.23 Å
9ED6 CryoEM map of the mLST8-Rag-Ragultor subcomplex 提交 2024-11-15	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 H 1–91（91 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.98 Å

共 21 个其他 PDB 条目、31 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	LTOR5_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–91； UniProt 1–91

Ragulator complex protein LAMTOR4

Homo sapiens

UniProt Q0VGL1

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5）与蛋白拷贝数一致	链 D； UniProt 1–99	未记录	Ragulator complex protein LAMTOR3 × 1 （Q9UHA4） Ragulator complex protein LAMTOR2 × 1 （Q9Y2Q5） Ragulator complex protein LAMTOR5 × 1 （O43504） Ragulator complex protein LAMTOR1 × 1 （Q6IAA8）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；Tris-HCl, 2-propanol, 1,6-hexandiol, 1,4-butandiol, 1-butanol, 1,3-propanediol, PEG 100, PEG 3350, 2-Methyl-2,4-pentanediol	分辨率 2.40 Å R-free 0.232

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 5X6U	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
5VOK Crystal structure of the C7orf59-HBXIP dimer 提交 2017-05-03	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–99（99 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291.15 K；4M sodium formate, 5%(v/v) glycerol and 0.01M barium chloride (as additive).	分辨率 2.89 Å R-free 0.312
5VOK Crystal structure of the C7orf59-HBXIP dimer 提交 2017-05-03	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1–99（99 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291.15 K；4M sodium formate, 5%(v/v) glycerol and 0.01M barium chloride (as additive).	分辨率 2.89 Å R-free 0.312
5VOK Crystal structure of the C7orf59-HBXIP dimer 提交 2017-05-03	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 1–99（99 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291.15 K；4M sodium formate, 5%(v/v) glycerol and 0.01M barium chloride (as additive).	分辨率 2.89 Å R-free 0.312
5VOK Crystal structure of the C7orf59-HBXIP dimer 提交 2017-05-03	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 1–99（99 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291.15 K；4M sodium formate, 5%(v/v) glycerol and 0.01M barium chloride (as additive).	分辨率 2.89 Å R-free 0.312
5VOK Crystal structure of the C7orf59-HBXIP dimer 提交 2017-05-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–99（99 aa）链 D 1–99（99 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291.15 K；4M sodium formate, 5%(v/v) glycerol and 0.01M barium chloride (as additive).	分辨率 2.89 Å R-free 0.312
5VOK Crystal structure of the C7orf59-HBXIP dimer 提交 2017-05-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 F 1–99（99 aa）链 H 1–99（99 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291.15 K；4M sodium formate, 5%(v/v) glycerol and 0.01M barium chloride (as additive).	分辨率 2.89 Å R-free 0.312
5X6V Crystal structure of human heteroheptameric complex 提交 2017-02-23	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 D 1–99（99 aa）	未记录	NA SODIUM ION × 1 ACT ACETATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；sodium citrate, ammonium acetate, PEG 4000	分辨率 2.02 Å R-free 0.243
5Y38 Crystal structure of C7orf59-HBXIP complex 提交 2017-07-28	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–99（99 aa）片段：Roadblock domain	未记录	SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；289 K；0.16 M ammonium sulfate, 0.08 M sodium acetate trihydrate (pH 4.6), and 20% (w/v) PEG 4000	分辨率 2.80 Å R-free 0.256
5Y39 Crystal structure of Ragulator complex (p18 76-145) 提交 2017-07-28	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 D 1–99（99 aa）片段：Roadblock domain	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；289 K；0.1 M Bis-Tris (pH 5.5), and 25% (w/v) PEG 3350	分辨率 2.65 Å R-free 0.263
5Y39 Crystal structure of Ragulator complex (p18 76-145) 提交 2017-07-28	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 I 1–99（99 aa）片段：Roadblock domain	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；289 K；0.1 M Bis-Tris (pH 5.5), and 25% (w/v) PEG 3350	分辨率 2.65 Å R-free 0.263
5Y3A Crystal structure of Ragulator complex (p18 49-161) 提交 2017-07-28	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 D 1–99（99 aa）片段：Roadblock domain	未记录	SO4 SULFATE ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；289 K；0.1 M Bis-Tris (pH 5.5), and 25% (w/v) PEG 3350	分辨率 2.90 Å R-free 0.288
5Y3A Crystal structure of Ragulator complex (p18 49-161) 提交 2017-07-28	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 I 1–99（99 aa）片段：Roadblock domain	未记录	SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；289 K；0.1 M Bis-Tris (pH 5.5), and 25% (w/v) PEG 3350	分辨率 2.90 Å R-free 0.288
5YK3 human Ragulator complex 提交 2017-10-12	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 n 6–92（87 aa）	突变：Q7A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；0.1M CHES, pH 9.5, 0.56 M sodium citrate tribasic, and 1.4 M sodium chloride	分辨率 3.01 Å R-free 0.285
5YK3 human Ragulator complex 提交 2017-10-12	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 D 4–97（94 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；0.1M CHES, pH 9.5, 0.56 M sodium citrate tribasic, and 1.4 M sodium chloride	分辨率 3.01 Å R-free 0.285
5YK3 human Ragulator complex 提交 2017-10-12	实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 I 1–99（99 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；0.1M CHES, pH 9.5, 0.56 M sodium citrate tribasic, and 1.4 M sodium chloride	分辨率 3.01 Å R-free 0.285
5YK5 structure of the human Lamtor4-Lamtor5 complex 提交 2017-10-12	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 9–92（84 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；0.1M Tris-HCl, pH 8.0, 3.5M sodium formate	分辨率 2.03 Å R-free 0.294
5YK5 structure of the human Lamtor4-Lamtor5 complex 提交 2017-10-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 9–91（83 aa）	突变：E10A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；0.1M Tris-HCl, pH 8.0, 3.5M sodium formate	分辨率 2.03 Å R-free 0.294
6B9X Crystal structure of Ragulator 提交 2017-10-11	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 D 1–99（99 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；292 K；0.1 M CHES pH 9.0, 40% PEG 600	分辨率 1.42 Å R-free 0.237
6EHP The crystal structure of the human LAMTOR complex 提交 2017-09-14	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 D 1–99（99 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；20% [w/v] PEG 3350, 0.1M Tris/HCl pH8.5, 0.2M MgCl2, 3% 2-Methyl-2-propanol	分辨率 2.30 Å R-free 0.228
6EHR The crystal structure of the human LAMTOR-RagA CTD-RagC CTD complex 提交 2017-09-14	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 D 1–99（99 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10% [w/v] PEG 4000, 0.1M tri-sodium-citrate pH5.5, 5% [v/v] isopropanol	分辨率 2.90 Å R-free 0.263
6NZD Cryo-EM Structure of the Lysosomal Folliculin Complex (FLCN-FNIP2-RagA-RagC-Ragulator) 提交 2019-02-13	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 D 1–99（99 aa）	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 L8S 9-{5-O-[(S)-hydroxy{[(R)-hydroxy(thiophosphonooxy)phosphoryl]oxy}phosphoryl]-alpha-L-arabinofuranosyl}-3,9-dihydro-1H-purine-2,6-dione × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Whatman 597	分辨率 3.60 Å
6U62 Raptor-Rag-Ragulator complex 提交 2019-08-29	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 G 2–99（98 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.18 Å
6ULG Cryo-EM structure of the FLCN-FNIP2-Rag-Ragulator complex 提交 2019-10-08	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 D 1–99（99 aa）	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.31 Å
6WJ2 CryoEM structure of the SLC38A9-RagA-RagC-Ragulator complex in the pre-GAP state 提交 2020-04-11	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 D 1–99（99 aa）	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 L8S 9-{5-O-[(S)-hydroxy{[(R)-hydroxy(thiophosphonooxy)phosphoryl]oxy}phosphoryl]-alpha-L-arabinofuranosyl}-3,9-dihydro-1H-purine-2,6-dione × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
6WJ3 CryoEM structure of the SLC38A9-RagA-RagC-Ragulator complex in the post-GAP state 提交 2020-04-11	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 D 1–99（99 aa）	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 U3J xanthosine diphosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
7T3A GATOR1-RAG-RAGULATOR - Inhibitory Complex 提交 2021-12-07	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 P 1–99（99 aa）	未记录	GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
7T3B GATOR1-RAG-RAGULATOR - GAP Complex 提交 2021-12-07	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 I 1–99（99 aa）	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
7T3C GATOR1-RAG-RAGULATOR - Dual Complex 提交 2021-12-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric	链 I 1–99（99 aa）链 P 1–99（99 aa）	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
7UX2 cryo-EM structure of the Raptor-TFEB-Rag-Ragulator complex 提交 2022-05-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric	链 G 1–99（99 aa）链 N 1–99（99 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
7UXC cryo-EM structure of the mTORC1-TFEB-Rag-Ragulator complex with symmetry expansion 提交 2022-05-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric	链 I 1–99（99 aa）链 P 1–99（99 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
7UXH cryo-EM structure of the mTORC1-TFEB-Rag-Ragulator complex 提交 2022-05-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric	链 K 1–99（99 aa）链 R 1–99（99 aa）链 a 1–99（99 aa）链 h 1–99（99 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8DHB Active FLCN GAP complex 提交 2022-06-25	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 F 1–99（99 aa）	未记录	CZC [(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-[2,6-bis(oxidanylidene)-3~{H}-purin-9-yl]-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl phosphono hydrogen phosphate × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.53 Å
9ED4 A composite map of mTORC1-Rag-Ragultor-4EBP1 on membrane 提交 2024-11-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric	链 I 1–99（99 aa）链 X 1–99（99 aa）	未记录	GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 8 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.23 Å
9ED6 CryoEM map of the mLST8-Rag-Ragultor subcomplex 提交 2024-11-15	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 G 1–99（99 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.98 Å

共 24 个其他 PDB 条目、34 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	LTOR4_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–99； UniProt 1–99

Ragulator complex protein LAMTOR1

Homo sapiens

UniProt Q6IAA8

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5）与蛋白拷贝数一致	链 E； UniProt 42–161	片段：UNP RESIDUES 42-161 突变：S98D	Ragulator complex protein LAMTOR3 × 1 （Q9UHA4） Ragulator complex protein LAMTOR2 × 1 （Q9Y2Q5） Ragulator complex protein LAMTOR5 × 1 （O43504） Ragulator complex protein LAMTOR4 × 1 （Q0VGL1）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；Tris-HCl, 2-propanol, 1,6-hexandiol, 1,4-butandiol, 1-butanol, 1,3-propanediol, PEG 100, PEG 3350, 2-Methyl-2,4-pentanediol	分辨率 2.40 Å R-free 0.232

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 5X6U	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
5X6V Crystal structure of human heteroheptameric complex 提交 2017-02-23	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 E 42–161（120 aa）片段：UNP RESIDUES 42-161	突变：S98E	NA SODIUM ION × 1 ACT ACETATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；sodium citrate, ammonium acetate, PEG 4000	分辨率 2.02 Å R-free 0.243
5Y39 Crystal structure of Ragulator complex (p18 76-145) 提交 2017-07-28	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 76–145（70 aa）片段：coiled coil, UNP residues 76-145	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；289 K；0.1 M Bis-Tris (pH 5.5), and 25% (w/v) PEG 3350	分辨率 2.65 Å R-free 0.263
5Y39 Crystal structure of Ragulator complex (p18 76-145) 提交 2017-07-28	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 F 76–145（70 aa）片段：coiled coil, UNP residues 76-145	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；289 K；0.1 M Bis-Tris (pH 5.5), and 25% (w/v) PEG 3350	分辨率 2.65 Å R-free 0.263
5Y3A Crystal structure of Ragulator complex (p18 49-161) 提交 2017-07-28	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 50–161（112 aa）片段：coiled coil, UNP residues 50-161	未记录	SO4 SULFATE ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；289 K；0.1 M Bis-Tris (pH 5.5), and 25% (w/v) PEG 3350	分辨率 2.90 Å R-free 0.288
5Y3A Crystal structure of Ragulator complex (p18 49-161) 提交 2017-07-28	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 F 50–161（112 aa）片段：coiled coil, UNP residues 50-161	未记录	SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；289 K；0.1 M Bis-Tris (pH 5.5), and 25% (w/v) PEG 3350	分辨率 2.90 Å R-free 0.288
5YK3 human Ragulator complex 提交 2017-10-12	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 k 79–161（83 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；0.1M CHES, pH 9.5, 0.56 M sodium citrate tribasic, and 1.4 M sodium chloride	分辨率 3.01 Å R-free 0.285
5YK3 human Ragulator complex 提交 2017-10-12	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 78–161（84 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；0.1M CHES, pH 9.5, 0.56 M sodium citrate tribasic, and 1.4 M sodium chloride	分辨率 3.01 Å R-free 0.285
5YK3 human Ragulator complex 提交 2017-10-12	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 F 78–161（84 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；0.1M CHES, pH 9.5, 0.56 M sodium citrate tribasic, and 1.4 M sodium chloride	分辨率 3.01 Å R-free 0.285
6B9X Crystal structure of Ragulator 提交 2017-10-11	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 1–161（161 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；292 K；0.1 M CHES pH 9.0, 40% PEG 600	分辨率 1.42 Å R-free 0.237
6EHP The crystal structure of the human LAMTOR complex 提交 2017-09-14	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 E 21–161（141 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；20% [w/v] PEG 3350, 0.1M Tris/HCl pH8.5, 0.2M MgCl2, 3% 2-Methyl-2-propanol	分辨率 2.30 Å R-free 0.228
6EHR The crystal structure of the human LAMTOR-RagA CTD-RagC CTD complex 提交 2017-09-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 E 21–161（141 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10% [w/v] PEG 4000, 0.1M tri-sodium-citrate pH5.5, 5% [v/v] isopropanol	分辨率 2.90 Å R-free 0.263
6NZD Cryo-EM Structure of the Lysosomal Folliculin Complex (FLCN-FNIP2-RagA-RagC-Ragulator) 提交 2019-02-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 A 5–161（157 aa）	突变：G2A	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 L8S 9-{5-O-[(S)-hydroxy{[(R)-hydroxy(thiophosphonooxy)phosphoryl]oxy}phosphoryl]-alpha-L-arabinofuranosyl}-3,9-dihydro-1H-purine-2,6-dione × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Whatman 597	分辨率 3.60 Å
6U62 Raptor-Rag-Ragulator complex 提交 2019-08-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 D 6–161（156 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.18 Å
6ULG Cryo-EM structure of the FLCN-FNIP2-Rag-Ragulator complex 提交 2019-10-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 E 1–161（161 aa）	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.31 Å
6WJ2 CryoEM structure of the SLC38A9-RagA-RagC-Ragulator complex in the pre-GAP state 提交 2020-04-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 1–161（161 aa）	突变：G2A	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 L8S 9-{5-O-[(S)-hydroxy{[(R)-hydroxy(thiophosphonooxy)phosphoryl]oxy}phosphoryl]-alpha-L-arabinofuranosyl}-3,9-dihydro-1H-purine-2,6-dione × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
6WJ3 CryoEM structure of the SLC38A9-RagA-RagC-Ragulator complex in the post-GAP state 提交 2020-04-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 1–161（161 aa）	突变：G2A	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 U3J xanthosine diphosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
7T3A GATOR1-RAG-RAGULATOR - Inhibitory Complex 提交 2021-12-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 M 1–161（161 aa）	未记录	GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
7T3B GATOR1-RAG-RAGULATOR - GAP Complex 提交 2021-12-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 F 1–161（161 aa）	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
7T3C GATOR1-RAG-RAGULATOR - Dual Complex 提交 2021-12-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric	链 F 1–161（161 aa）链 M 1–161（161 aa）	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
7UX2 cryo-EM structure of the Raptor-TFEB-Rag-Ragulator complex 提交 2022-05-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric	链 D 1–161（161 aa）链 K 1–161（161 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
7UXC cryo-EM structure of the mTORC1-TFEB-Rag-Ragulator complex with symmetry expansion 提交 2022-05-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric	链 F 1–161（161 aa）链 M 1–161（161 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
7UXH cryo-EM structure of the mTORC1-TFEB-Rag-Ragulator complex 提交 2022-05-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric	链 H 1–161（161 aa）链 O 1–161（161 aa）链 X 1–161（161 aa）链 e 1–161（161 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8DHB Active FLCN GAP complex 提交 2022-06-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 C 1–161（161 aa）	未记录	CZC [(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-[2,6-bis(oxidanylidene)-3~{H}-purin-9-yl]-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl phosphono hydrogen phosphate × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.53 Å
9ED4 A composite map of mTORC1-Rag-Ragultor-4EBP1 on membrane 提交 2024-11-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric	链 F 1–161（161 aa）链 W 1–161（161 aa）	未记录	GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 8 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.23 Å
9ED6 CryoEM map of the mLST8-Rag-Ragultor subcomplex 提交 2024-11-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 D 1–161（161 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.98 Å

共 21 个其他 PDB 条目、25 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	LTOR1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 4–123； UniProt 42–161

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	5x6u
沉积日期 deposition_date	2017-02-23
结构标题 title	Crystal structure of human heteropentameric complex
关键词 keywords	Ragulator complex, scaffold, roadblock, lysosome, mTOR signaling, cell growth, PROTEIN BINDING; PROTEIN BINDING
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	25.81 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	24.57 Å
零角强度 I(0) i0	49316000.00
分子量 molecular_weight	54097.0 kDa
排除体积 excluded_volume	67779 Å³
包络体积 envelope_volume	83500 Å³
水化壳体积 shell_volume	28201 Å³
包络直径 envelope_diameter	86.2 Å
壳层 Rg shell_rg	31.90 Å
包络 Rg envelope_rg	24.78 Å
形状 Rg shape_rg	24.57 Å
总 Rg total_rg	25.42 Å
总原子数 total_atoms	3799
残基数 n_residues	499
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	82.5 Å
Rg (实空间) rg_real	25.75 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.44 Å
I(0) (实空间) i0_real	4.9320e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	7.2210e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal	25.77 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	49320000.0000
解质量估计 total_estimate	0.9045
解质量评级 solution_quality	EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	28.4 Å
偏度 Skewness skewness	0.247
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.513
角度范围 angular_range	— – 0.3050 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	12980000.0000
实空间数据点数 n_real_points	62
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.920; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.999; Smooth: 0.994

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Ragulator complex protein LAMTOR3
分子量 formula_weight	13868.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	3929

MGSSADDLKRFLYKKLPSVEGLHAIVVSDRDGVPVIKVANDNAPEHALRPGFLSTFALATDQGSKLGLSKNKSIICYYNTYQVVQFNRLPLVVSFIASSSANTGLIVSLEKELAPLFEELRQVVEVS

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Ragulator complex protein LAMTOR2
分子量 formula_weight	13517.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

MLRPKALTQVLSQANTGGVQSTLLLNNEGSLLAYSGYGDTDARVTAAIASNIWAAYDRNGNQAFNEDNLKFILMDCMEGRVAITRVANLLLCMYAKETVGFGMLKAKAQALVQYLEEPLTQVAAS

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Ragulator complex protein LAMTOR5
分子量 formula_weight	9622.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

MEATLEQHLEDTMKNPSIVGVLCTDSQGLNLGCRGTLSDEHAGVISVLAQQAAKLTSDPTDIPVVCLESDNGNIMIQKHDGITVAVHKMAS

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Ragulator complex protein LAMTOR4
分子量 formula_weight	10753.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

MTSALTQGLERIPDQLGYLVLSEGAVLASSGDLENDEQAASAISELVSTACGFRLHRGMNVPFKRLSVVFGEHTLLVTVSGQRVFVVKRQNRGREPIDV

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	Ragulator complex protein LAMTOR1
分子量 formula_weight	13405.1 kDa
突变 mutation	S98D
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E

GAASLPSARTDEQALLSSILAKTASNIIDVSAADSQGMEQHEYMDRARQYSTRLAVLSSDLTHWKKLPPLPSLTSQPHQVLASEPIPFSDLQQVSRIAAYAYSALSQIRVDAKEELVVQFGIP

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 6 Entity 6 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	130

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (3 domains)

结构域编号 domain_id	d5x6ua1
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.110 — Profilin-like
超家族 Superfamily superfamily	d.110.7 — Roadblock/LC7 domain
家族 Family family	d.110.7.1 — Roadblock/LC7 domain

结构域编号 domain_id	d5x6ua2
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d5x6ub_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.110 — Profilin-like
超家族 Superfamily superfamily	d.110.7 — Roadblock/LC7 domain
家族 Family family	d.110.7.1 — Roadblock/LC7 domain

CATH v4.4 (3 domains)

结构域编号 domain_id	5x6uA00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	450 — Beta-Lactamase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	30 — Dynein light chain 2a, cytoplasmic

结构域编号 domain_id	5x6uB00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	450 — Beta-Lactamase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	30 — Dynein light chain 2a, cytoplasmic

结构域编号 domain_id	5x6uC00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	450 — Beta-Lactamase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	30 — Dynein light chain 2a, cytoplasmic

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	133.038 Å
晶胞边长 b length_b	133.038 Å
晶胞边长 c length_c	75.147 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 41 2 2
空间群编号 int_tables_number	91
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.400 Å
最低分辨率 resolution_low	133.040 Å
R 因子 r_factor	0.1880
R_work r_work	0.1860
R_free r_free	0.2320

fit	/app/data/saxs_computation/x6/5x6u/5x6u.fit
pddf	/app/data/pr_computation/x6/5x6u/5x6u.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/x6/5x6u/5x6u.dat

Crystal structure of human heteropentameric complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Ragulator complex protein LAMTOR3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Ragulator complex protein LAMTOR2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Ragulator complex protein LAMTOR5

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Ragulator complex protein LAMTOR4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Ragulator complex protein LAMTOR1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 6 Entity 6 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (3 domains)

CATH v4.4 (3 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)