SAXSdb — 5xlp

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

CRISPR-associated protein Csy3

Pseudomonas aeruginosa (strain UCBPP-PA14)

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 5 RNA 1	crRNA with 20nt spacer sequence × 1 Uncharacterized protein AcrF1 × 1 （L7P7M1）	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CSY3_PSEAB
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–342； UniProt 1–342 作者链 D； PDB构建体 1–342； UniProt 1–342 作者链 E； PDB构建体 1–342； UniProt 1–342 作者链 F； PDB构建体 1–342； UniProt 1–342

Uncharacterized protein AcrF1

Pseudomonas phage JBD30

UniProt L7P7M1

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 5 RNA 1	CRISPR-associated protein Csy3 × 4 （Q02MM1） crRNA with 20nt spacer sequence × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	L7P7M1_9CAUD
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 M； PDB构建体 1–78； UniProt 1–78

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	5xlp
沉积日期 deposition_date	2017-05-11
结构标题 title	Anti-CRISPR proteins AcrF1/2 bound to Csy surveillance complex with a 20nt spacer crRNA backbone region
关键词 keywords	anti-CRISPR proteins, Csy complex, Type I-F CRISPR/Cas system, IMMUNE SYSTEM-RNA complex; IMMUNE SYSTEM/RNA
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

5xlp__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

5xlp__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

5xlp__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	38.71 Å
Rg（电子密度）	39.26 Å
总 Rg	39.45 Å
原子数	9952
残基数	1367
排除体积	172600 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`5xlp__assembly_1__model_1`	hexameric （6）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	CRISPR-associated protein Csy3
分子量 formula_weight	37579.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,D,E,F
原子数 atom_count	9952

MSKPILSTASVLAFERKLDPSDALMSAGAWAQRDASQEWPAVTVREKSVRGTISNRLKTKDRDPAKLDASIQSPNLQTVDVANLPSDADTLKVRFTLRVLGGAGTPSACNDAAYRDKLLQTVATYVNDQGFAELARRYAHNLANARFLWRNRVGAEAVEVRINHIRQGEVARAWRFDALAIGLRDFKADAELDALAELIASGLSGSGHVLLEVVAFARIGDGQEVFPSQELILDKGDKKGQKSKTLYSVRDAAAIHSQKIGNALRTIDTWYPDEDGLGPIAVEPYGSVTSQGKAYRQPKQKLDFYTLLDNWVLRDEAPAVEQQHYVIANLIRGGVFGEAEEK

来源 Source

来源生物 organism	Pseudomonas aeruginosa (strain UCBPP-PA14)
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	208963
宿主生物 host_organism	;Escherichia coli 'BL21-Gold(DE3)pLysS AG' ;

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	crRNA with 20nt spacer sequence
分子量 formula_weight	15456.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polyribonucleotide
链编号 strand_id	K

CUAAGAAAUUCACGGCGGGCUUGAUGUCGUUCACUGCCGUGUAGGCAG

来源 Source

来源生物 organism	Pseudomonas aeruginosa
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	287
宿主生物 host_organism	;Escherichia coli 'BL21-Gold(DE3)pLysS AG' ;

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Uncharacterized protein AcrF1
分子量 formula_weight	8824.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	M

MKFIKYLSTAHLNYMNIAVYENGSKIKARVENVVNGKSVGARDFDSTEQLESWFYGLPGSGLGRIENAMNEISRRENP

来源 Source

来源生物 organism	Pseudomonas phage JBD30
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	1223260
宿主生物 host_organism	;Escherichia coli 'BL21-Gold(DE3)pLysS AG' ;

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	1

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	4.20 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	154095

Anti-CRISPR proteins AcrF1/2 bound to Csy surveillance complex with a 20nt spacer crRNA backbone region

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

CRISPR-associated protein Csy3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Uncharacterized protein AcrF1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

5xlp__assembly_1__model_1

5xlp__assembly_1__model_1 | I(q)

5xlp__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 引用文献 (1)

Anti-CRISPR proteins AcrF1/2 bound to Csy surveillance complex with a 20nt spacer crRNA backbone region

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

CRISPR-associated protein Csy3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Uncharacterized protein AcrF1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

5xlp__assembly_1__model_1

5xlp__assembly_1__model_1 | I(q)

5xlp__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 引用文献 (1)