5xnm

Structure of unstacked C2S2M2-type PSII-LHCII supercomplex from Pisum sativum

Method: ELECTRON MICROSCOPY

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Chlorophyll a-b binding protein 8, chloroplastic

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 54	Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 2 （Q04918） Light harvesting chlorophyll a/b-binding protein Lhcb6, CP24 × 2 Photosystem II protein D1 × 2 （P06585） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （Q9XQR6） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （P06004） Photosystem II D2 protein × 2 （P06006） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （P13554） Cytochrome b559 subunit beta, PsbF × 2 Photosystem II reaction center protein H × 2 （Q9XQR3） Photosystem II reaction center protein I, PsbI × 2 Photosystem II reaction center protein J × 2 （P13555） Photosystem II reaction center protein K × 2 （D5MAJ8） Photosystem II reaction center protein L × 2 （P60147） Photosystem II reaction center protein M × 2 （P69529） Oxygen-evolving enhancer protein 1, chloroplastic × 2 （P14226） Light harvesting chlorophyll a/b-binding protein Lhcb4, CP29 × 2 Light harvesting chlorophyll a/b-binding protein Lhcb5, CP26 × 2 Photosystem II reaction center protein T × 2 （Q8HS25） Photosystem II luminal extrinsic protein Tn, PsbTn × 2 Photosystem II reaction center protein W, PSBW × 2 Photosystem II reaction center protein X × 2 （Q8VYY1） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （Q32902） CHLOROPHYLL B × 98 CHLOROPHYLL A × 216 (3R,3'R,6S)-4,5-DIDEHYDRO-5,6-DIHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL × 32 ;(3S,5R,6S,3'S,5'R,6'S)-5,6,5',6'-DIEPOXY-5,6,5',6'- TETRAHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL ; × 16 ;(1R,3R)-6-{(3E,5E,7E,9E,11E,13E,15E,17E)-18-[(1S,4R,6R)-4-HYDROXY-2,2,6-TRIMETHYL-7-OXABICYCLO[4.1.0]HEPT-1-YL]-3,7,12,16-TETRAMETHYLOCTADECA-1,3,5,7,9,11,13,15,17-NONAENYLIDENE}-1,5,5-TRIMETHYLCYCLOHEXANE-1,3-DIOL ; × 16 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 36 BETA-CAROTENE × 24 CA-MN4-O5 CLUSTER × 2 FE (II) ION × 2 PHEOPHYTIN A × 4 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 8 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 14 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 4 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 10 BICARBONATE ION × 2 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	CB28_PEA
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 1； PDB构建体 1–232； UniProt 37–268 作者链 2； PDB构建体 1–232； UniProt 37–268 作者链 5； PDB构建体 1–232； UniProt 37–268 作者链 6； PDB构建体 1–232； UniProt 37–268 作者链 G； PDB构建体 1–232； UniProt 37–268 作者链 N； PDB构建体 1–232； UniProt 37–268 作者链 Y； PDB构建体 1–232； UniProt 37–268 作者链 g； PDB构建体 1–232； UniProt 37–268 作者链 n； PDB构建体 1–232； UniProt 37–268 作者链 y； PDB构建体 1–232； UniProt 37–268

Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic

物种未注明

UniProt Q04918

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 54	Chlorophyll a-b binding protein 8, chloroplastic × 10 （P27490） Light harvesting chlorophyll a/b-binding protein Lhcb6, CP24 × 2 Photosystem II protein D1 × 2 （P06585） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （Q9XQR6） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （P06004） Photosystem II D2 protein × 2 （P06006） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （P13554） Cytochrome b559 subunit beta, PsbF × 2 Photosystem II reaction center protein H × 2 （Q9XQR3） Photosystem II reaction center protein I, PsbI × 2 Photosystem II reaction center protein J × 2 （P13555） Photosystem II reaction center protein K × 2 （D5MAJ8） Photosystem II reaction center protein L × 2 （P60147） Photosystem II reaction center protein M × 2 （P69529） Oxygen-evolving enhancer protein 1, chloroplastic × 2 （P14226） Light harvesting chlorophyll a/b-binding protein Lhcb4, CP29 × 2 Light harvesting chlorophyll a/b-binding protein Lhcb5, CP26 × 2 Photosystem II reaction center protein T × 2 （Q8HS25） Photosystem II luminal extrinsic protein Tn, PsbTn × 2 Photosystem II reaction center protein W, PSBW × 2 Photosystem II reaction center protein X × 2 （Q8VYY1） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （Q32902） CHLOROPHYLL B × 98 CHLOROPHYLL A × 216 (3R,3'R,6S)-4,5-DIDEHYDRO-5,6-DIHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL × 32 ;(3S,5R,6S,3'S,5'R,6'S)-5,6,5',6'-DIEPOXY-5,6,5',6'- TETRAHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL ; × 16 ;(1R,3R)-6-{(3E,5E,7E,9E,11E,13E,15E,17E)-18-[(1S,4R,6R)-4-HYDROXY-2,2,6-TRIMETHYL-7-OXABICYCLO[4.1.0]HEPT-1-YL]-3,7,12,16-TETRAMETHYLOCTADECA-1,3,5,7,9,11,13,15,17-NONAENYLIDENE}-1,5,5-TRIMETHYLCYCLOHEXANE-1,3-DIOL ; × 16 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 36 BETA-CAROTENE × 24 CA-MN4-O5 CLUSTER × 2 FE (II) ION × 2 PHEOPHYTIN A × 4 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 8 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 14 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 4 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 10 BICARBONATE ION × 2 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	Q04918_PEA
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 3； PDB构建体 1–243； UniProt 23–265 作者链 7； PDB构建体 1–243； UniProt 23–265

Photosystem II protein D1

物种未注明

UniProt P06585

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 54	Chlorophyll a-b binding protein 8, chloroplastic × 10 （P27490） Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 2 （Q04918） Light harvesting chlorophyll a/b-binding protein Lhcb6, CP24 × 2 Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （Q9XQR6） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （P06004） Photosystem II D2 protein × 2 （P06006） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （P13554） Cytochrome b559 subunit beta, PsbF × 2 Photosystem II reaction center protein H × 2 （Q9XQR3） Photosystem II reaction center protein I, PsbI × 2 Photosystem II reaction center protein J × 2 （P13555） Photosystem II reaction center protein K × 2 （D5MAJ8） Photosystem II reaction center protein L × 2 （P60147） Photosystem II reaction center protein M × 2 （P69529） Oxygen-evolving enhancer protein 1, chloroplastic × 2 （P14226） Light harvesting chlorophyll a/b-binding protein Lhcb4, CP29 × 2 Light harvesting chlorophyll a/b-binding protein Lhcb5, CP26 × 2 Photosystem II reaction center protein T × 2 （Q8HS25） Photosystem II luminal extrinsic protein Tn, PsbTn × 2 Photosystem II reaction center protein W, PSBW × 2 Photosystem II reaction center protein X × 2 （Q8VYY1） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （Q32902） CHLOROPHYLL B × 98 CHLOROPHYLL A × 216 (3R,3'R,6S)-4,5-DIDEHYDRO-5,6-DIHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL × 32 ;(3S,5R,6S,3'S,5'R,6'S)-5,6,5',6'-DIEPOXY-5,6,5',6'- TETRAHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL ; × 16 ;(1R,3R)-6-{(3E,5E,7E,9E,11E,13E,15E,17E)-18-[(1S,4R,6R)-4-HYDROXY-2,2,6-TRIMETHYL-7-OXABICYCLO[4.1.0]HEPT-1-YL]-3,7,12,16-TETRAMETHYLOCTADECA-1,3,5,7,9,11,13,15,17-NONAENYLIDENE}-1,5,5-TRIMETHYLCYCLOHEXANE-1,3-DIOL ; × 16 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 36 BETA-CAROTENE × 24 CA-MN4-O5 CLUSTER × 2 FE (II) ION × 2 PHEOPHYTIN A × 4 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 8 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 14 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 4 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 10 BICARBONATE ION × 2 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSBA_PEA
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–344； UniProt 1–344 作者链 a； PDB构建体 1–344； UniProt 1–344

Photosystem II CP47 reaction center protein

物种未注明

UniProt Q9XQR6

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 54	Chlorophyll a-b binding protein 8, chloroplastic × 10 （P27490） Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 2 （Q04918） Light harvesting chlorophyll a/b-binding protein Lhcb6, CP24 × 2 Photosystem II protein D1 × 2 （P06585） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （P06004） Photosystem II D2 protein × 2 （P06006） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （P13554） Cytochrome b559 subunit beta, PsbF × 2 Photosystem II reaction center protein H × 2 （Q9XQR3） Photosystem II reaction center protein I, PsbI × 2 Photosystem II reaction center protein J × 2 （P13555） Photosystem II reaction center protein K × 2 （D5MAJ8） Photosystem II reaction center protein L × 2 （P60147） Photosystem II reaction center protein M × 2 （P69529） Oxygen-evolving enhancer protein 1, chloroplastic × 2 （P14226） Light harvesting chlorophyll a/b-binding protein Lhcb4, CP29 × 2 Light harvesting chlorophyll a/b-binding protein Lhcb5, CP26 × 2 Photosystem II reaction center protein T × 2 （Q8HS25） Photosystem II luminal extrinsic protein Tn, PsbTn × 2 Photosystem II reaction center protein W, PSBW × 2 Photosystem II reaction center protein X × 2 （Q8VYY1） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （Q32902） CHLOROPHYLL B × 98 CHLOROPHYLL A × 216 (3R,3'R,6S)-4,5-DIDEHYDRO-5,6-DIHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL × 32 ;(3S,5R,6S,3'S,5'R,6'S)-5,6,5',6'-DIEPOXY-5,6,5',6'- TETRAHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL ; × 16 ;(1R,3R)-6-{(3E,5E,7E,9E,11E,13E,15E,17E)-18-[(1S,4R,6R)-4-HYDROXY-2,2,6-TRIMETHYL-7-OXABICYCLO[4.1.0]HEPT-1-YL]-3,7,12,16-TETRAMETHYLOCTADECA-1,3,5,7,9,11,13,15,17-NONAENYLIDENE}-1,5,5-TRIMETHYLCYCLOHEXANE-1,3-DIOL ; × 16 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 36 BETA-CAROTENE × 24 CA-MN4-O5 CLUSTER × 2 FE (II) ION × 2 PHEOPHYTIN A × 4 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 8 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 14 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 4 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 10 BICARBONATE ION × 2 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	Q9XQR6_PEA
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–507； UniProt 1–507 作者链 b； PDB构建体 1–507； UniProt 1–507

Photosystem II CP43 reaction center protein

物种未注明

UniProt P06004

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 54	Chlorophyll a-b binding protein 8, chloroplastic × 10 （P27490） Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 2 （Q04918） Light harvesting chlorophyll a/b-binding protein Lhcb6, CP24 × 2 Photosystem II protein D1 × 2 （P06585） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （Q9XQR6） Photosystem II D2 protein × 2 （P06006） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （P13554） Cytochrome b559 subunit beta, PsbF × 2 Photosystem II reaction center protein H × 2 （Q9XQR3） Photosystem II reaction center protein I, PsbI × 2 Photosystem II reaction center protein J × 2 （P13555） Photosystem II reaction center protein K × 2 （D5MAJ8） Photosystem II reaction center protein L × 2 （P60147） Photosystem II reaction center protein M × 2 （P69529） Oxygen-evolving enhancer protein 1, chloroplastic × 2 （P14226） Light harvesting chlorophyll a/b-binding protein Lhcb4, CP29 × 2 Light harvesting chlorophyll a/b-binding protein Lhcb5, CP26 × 2 Photosystem II reaction center protein T × 2 （Q8HS25） Photosystem II luminal extrinsic protein Tn, PsbTn × 2 Photosystem II reaction center protein W, PSBW × 2 Photosystem II reaction center protein X × 2 （Q8VYY1） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （Q32902） CHLOROPHYLL B × 98 CHLOROPHYLL A × 216 (3R,3'R,6S)-4,5-DIDEHYDRO-5,6-DIHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL × 32 ;(3S,5R,6S,3'S,5'R,6'S)-5,6,5',6'-DIEPOXY-5,6,5',6'- TETRAHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL ; × 16 ;(1R,3R)-6-{(3E,5E,7E,9E,11E,13E,15E,17E)-18-[(1S,4R,6R)-4-HYDROXY-2,2,6-TRIMETHYL-7-OXABICYCLO[4.1.0]HEPT-1-YL]-3,7,12,16-TETRAMETHYLOCTADECA-1,3,5,7,9,11,13,15,17-NONAENYLIDENE}-1,5,5-TRIMETHYLCYCLOHEXANE-1,3-DIOL ; × 16 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 36 BETA-CAROTENE × 24 CA-MN4-O5 CLUSTER × 2 FE (II) ION × 2 PHEOPHYTIN A × 4 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 8 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 14 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 4 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 10 BICARBONATE ION × 2 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSBC_PEA
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–473； UniProt 1–473 作者链 c； PDB构建体 1–473； UniProt 1–473

Photosystem II D2 protein

物种未注明

UniProt P06006

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 54	Chlorophyll a-b binding protein 8, chloroplastic × 10 （P27490） Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 2 （Q04918） Light harvesting chlorophyll a/b-binding protein Lhcb6, CP24 × 2 Photosystem II protein D1 × 2 （P06585） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （Q9XQR6） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （P06004） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （P13554） Cytochrome b559 subunit beta, PsbF × 2 Photosystem II reaction center protein H × 2 （Q9XQR3） Photosystem II reaction center protein I, PsbI × 2 Photosystem II reaction center protein J × 2 （P13555） Photosystem II reaction center protein K × 2 （D5MAJ8） Photosystem II reaction center protein L × 2 （P60147） Photosystem II reaction center protein M × 2 （P69529） Oxygen-evolving enhancer protein 1, chloroplastic × 2 （P14226） Light harvesting chlorophyll a/b-binding protein Lhcb4, CP29 × 2 Light harvesting chlorophyll a/b-binding protein Lhcb5, CP26 × 2 Photosystem II reaction center protein T × 2 （Q8HS25） Photosystem II luminal extrinsic protein Tn, PsbTn × 2 Photosystem II reaction center protein W, PSBW × 2 Photosystem II reaction center protein X × 2 （Q8VYY1） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （Q32902） CHLOROPHYLL B × 98 CHLOROPHYLL A × 216 (3R,3'R,6S)-4,5-DIDEHYDRO-5,6-DIHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL × 32 ;(3S,5R,6S,3'S,5'R,6'S)-5,6,5',6'-DIEPOXY-5,6,5',6'- TETRAHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL ; × 16 ;(1R,3R)-6-{(3E,5E,7E,9E,11E,13E,15E,17E)-18-[(1S,4R,6R)-4-HYDROXY-2,2,6-TRIMETHYL-7-OXABICYCLO[4.1.0]HEPT-1-YL]-3,7,12,16-TETRAMETHYLOCTADECA-1,3,5,7,9,11,13,15,17-NONAENYLIDENE}-1,5,5-TRIMETHYLCYCLOHEXANE-1,3-DIOL ; × 16 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 36 BETA-CAROTENE × 24 CA-MN4-O5 CLUSTER × 2 FE (II) ION × 2 PHEOPHYTIN A × 4 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 8 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 14 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 4 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 10 BICARBONATE ION × 2 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSBD_PEA
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–353； UniProt 1–353 作者链 d； PDB构建体 1–353； UniProt 1–353

Cytochrome b559 subunit alpha

物种未注明

UniProt P13554

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 54	Chlorophyll a-b binding protein 8, chloroplastic × 10 （P27490） Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 2 （Q04918） Light harvesting chlorophyll a/b-binding protein Lhcb6, CP24 × 2 Photosystem II protein D1 × 2 （P06585） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （Q9XQR6） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （P06004） Photosystem II D2 protein × 2 （P06006） Cytochrome b559 subunit beta, PsbF × 2 Photosystem II reaction center protein H × 2 （Q9XQR3） Photosystem II reaction center protein I, PsbI × 2 Photosystem II reaction center protein J × 2 （P13555） Photosystem II reaction center protein K × 2 （D5MAJ8） Photosystem II reaction center protein L × 2 （P60147） Photosystem II reaction center protein M × 2 （P69529） Oxygen-evolving enhancer protein 1, chloroplastic × 2 （P14226） Light harvesting chlorophyll a/b-binding protein Lhcb4, CP29 × 2 Light harvesting chlorophyll a/b-binding protein Lhcb5, CP26 × 2 Photosystem II reaction center protein T × 2 （Q8HS25） Photosystem II luminal extrinsic protein Tn, PsbTn × 2 Photosystem II reaction center protein W, PSBW × 2 Photosystem II reaction center protein X × 2 （Q8VYY1） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （Q32902） CHLOROPHYLL B × 98 CHLOROPHYLL A × 216 (3R,3'R,6S)-4,5-DIDEHYDRO-5,6-DIHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL × 32 ;(3S,5R,6S,3'S,5'R,6'S)-5,6,5',6'-DIEPOXY-5,6,5',6'- TETRAHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL ; × 16 ;(1R,3R)-6-{(3E,5E,7E,9E,11E,13E,15E,17E)-18-[(1S,4R,6R)-4-HYDROXY-2,2,6-TRIMETHYL-7-OXABICYCLO[4.1.0]HEPT-1-YL]-3,7,12,16-TETRAMETHYLOCTADECA-1,3,5,7,9,11,13,15,17-NONAENYLIDENE}-1,5,5-TRIMETHYLCYCLOHEXANE-1,3-DIOL ; × 16 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 36 BETA-CAROTENE × 24 CA-MN4-O5 CLUSTER × 2 FE (II) ION × 2 PHEOPHYTIN A × 4 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 8 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 14 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 4 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 10 BICARBONATE ION × 2 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSBE_PEA
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–83； UniProt 1–83 作者链 e； PDB构建体 1–83； UniProt 1–83

Photosystem II reaction center protein H

物种未注明

UniProt Q9XQR3

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 54	Chlorophyll a-b binding protein 8, chloroplastic × 10 （P27490） Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 2 （Q04918） Light harvesting chlorophyll a/b-binding protein Lhcb6, CP24 × 2 Photosystem II protein D1 × 2 （P06585） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （Q9XQR6） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （P06004） Photosystem II D2 protein × 2 （P06006） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （P13554） Cytochrome b559 subunit beta, PsbF × 2 Photosystem II reaction center protein I, PsbI × 2 Photosystem II reaction center protein J × 2 （P13555） Photosystem II reaction center protein K × 2 （D5MAJ8） Photosystem II reaction center protein L × 2 （P60147） Photosystem II reaction center protein M × 2 （P69529） Oxygen-evolving enhancer protein 1, chloroplastic × 2 （P14226） Light harvesting chlorophyll a/b-binding protein Lhcb4, CP29 × 2 Light harvesting chlorophyll a/b-binding protein Lhcb5, CP26 × 2 Photosystem II reaction center protein T × 2 （Q8HS25） Photosystem II luminal extrinsic protein Tn, PsbTn × 2 Photosystem II reaction center protein W, PSBW × 2 Photosystem II reaction center protein X × 2 （Q8VYY1） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （Q32902） CHLOROPHYLL B × 98 CHLOROPHYLL A × 216 (3R,3'R,6S)-4,5-DIDEHYDRO-5,6-DIHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL × 32 ;(3S,5R,6S,3'S,5'R,6'S)-5,6,5',6'-DIEPOXY-5,6,5',6'- TETRAHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL ; × 16 ;(1R,3R)-6-{(3E,5E,7E,9E,11E,13E,15E,17E)-18-[(1S,4R,6R)-4-HYDROXY-2,2,6-TRIMETHYL-7-OXABICYCLO[4.1.0]HEPT-1-YL]-3,7,12,16-TETRAMETHYLOCTADECA-1,3,5,7,9,11,13,15,17-NONAENYLIDENE}-1,5,5-TRIMETHYLCYCLOHEXANE-1,3-DIOL ; × 16 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 36 BETA-CAROTENE × 24 CA-MN4-O5 CLUSTER × 2 FE (II) ION × 2 PHEOPHYTIN A × 4 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 8 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 14 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 4 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 10 BICARBONATE ION × 2 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSBH_PEA
Isoform	—
PDB实体	10
链与序列区间	作者链 H； PDB构建体 1–73； UniProt 1–73 作者链 h； PDB构建体 1–73； UniProt 1–73

Photosystem II reaction center protein J

物种未注明

UniProt P13555

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 54	Chlorophyll a-b binding protein 8, chloroplastic × 10 （P27490） Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 2 （Q04918） Light harvesting chlorophyll a/b-binding protein Lhcb6, CP24 × 2 Photosystem II protein D1 × 2 （P06585） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （Q9XQR6） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （P06004） Photosystem II D2 protein × 2 （P06006） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （P13554） Cytochrome b559 subunit beta, PsbF × 2 Photosystem II reaction center protein H × 2 （Q9XQR3） Photosystem II reaction center protein I, PsbI × 2 Photosystem II reaction center protein K × 2 （D5MAJ8） Photosystem II reaction center protein L × 2 （P60147） Photosystem II reaction center protein M × 2 （P69529） Oxygen-evolving enhancer protein 1, chloroplastic × 2 （P14226） Light harvesting chlorophyll a/b-binding protein Lhcb4, CP29 × 2 Light harvesting chlorophyll a/b-binding protein Lhcb5, CP26 × 2 Photosystem II reaction center protein T × 2 （Q8HS25） Photosystem II luminal extrinsic protein Tn, PsbTn × 2 Photosystem II reaction center protein W, PSBW × 2 Photosystem II reaction center protein X × 2 （Q8VYY1） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （Q32902） CHLOROPHYLL B × 98 CHLOROPHYLL A × 216 (3R,3'R,6S)-4,5-DIDEHYDRO-5,6-DIHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL × 32 ;(3S,5R,6S,3'S,5'R,6'S)-5,6,5',6'-DIEPOXY-5,6,5',6'- TETRAHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL ; × 16 ;(1R,3R)-6-{(3E,5E,7E,9E,11E,13E,15E,17E)-18-[(1S,4R,6R)-4-HYDROXY-2,2,6-TRIMETHYL-7-OXABICYCLO[4.1.0]HEPT-1-YL]-3,7,12,16-TETRAMETHYLOCTADECA-1,3,5,7,9,11,13,15,17-NONAENYLIDENE}-1,5,5-TRIMETHYLCYCLOHEXANE-1,3-DIOL ; × 16 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 36 BETA-CAROTENE × 24 CA-MN4-O5 CLUSTER × 2 FE (II) ION × 2 PHEOPHYTIN A × 4 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 8 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 14 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 4 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 10 BICARBONATE ION × 2 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSBJ_PEA
Isoform	—
PDB实体	12
链与序列区间	作者链 J； PDB构建体 1–40； UniProt 1–40 作者链 j； PDB构建体 1–40； UniProt 1–40

Photosystem II reaction center protein K

物种未注明

UniProt D5MAJ8

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 54	Chlorophyll a-b binding protein 8, chloroplastic × 10 （P27490） Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 2 （Q04918） Light harvesting chlorophyll a/b-binding protein Lhcb6, CP24 × 2 Photosystem II protein D1 × 2 （P06585） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （Q9XQR6） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （P06004） Photosystem II D2 protein × 2 （P06006） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （P13554） Cytochrome b559 subunit beta, PsbF × 2 Photosystem II reaction center protein H × 2 （Q9XQR3） Photosystem II reaction center protein I, PsbI × 2 Photosystem II reaction center protein J × 2 （P13555） Photosystem II reaction center protein L × 2 （P60147） Photosystem II reaction center protein M × 2 （P69529） Oxygen-evolving enhancer protein 1, chloroplastic × 2 （P14226） Light harvesting chlorophyll a/b-binding protein Lhcb4, CP29 × 2 Light harvesting chlorophyll a/b-binding protein Lhcb5, CP26 × 2 Photosystem II reaction center protein T × 2 （Q8HS25） Photosystem II luminal extrinsic protein Tn, PsbTn × 2 Photosystem II reaction center protein W, PSBW × 2 Photosystem II reaction center protein X × 2 （Q8VYY1） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （Q32902） CHLOROPHYLL B × 98 CHLOROPHYLL A × 216 (3R,3'R,6S)-4,5-DIDEHYDRO-5,6-DIHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL × 32 ;(3S,5R,6S,3'S,5'R,6'S)-5,6,5',6'-DIEPOXY-5,6,5',6'- TETRAHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL ; × 16 ;(1R,3R)-6-{(3E,5E,7E,9E,11E,13E,15E,17E)-18-[(1S,4R,6R)-4-HYDROXY-2,2,6-TRIMETHYL-7-OXABICYCLO[4.1.0]HEPT-1-YL]-3,7,12,16-TETRAMETHYLOCTADECA-1,3,5,7,9,11,13,15,17-NONAENYLIDENE}-1,5,5-TRIMETHYLCYCLOHEXANE-1,3-DIOL ; × 16 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 36 BETA-CAROTENE × 24 CA-MN4-O5 CLUSTER × 2 FE (II) ION × 2 PHEOPHYTIN A × 4 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 8 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 14 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 4 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 10 BICARBONATE ION × 2 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	D5MAJ8_PEA
Isoform	—
PDB实体	13
链与序列区间	作者链 K； PDB构建体 1–61； UniProt 1–61 作者链 k； PDB构建体 1–61； UniProt 1–61

Photosystem II reaction center protein L

物种未注明

UniProt P60147

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 54	Chlorophyll a-b binding protein 8, chloroplastic × 10 （P27490） Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 2 （Q04918） Light harvesting chlorophyll a/b-binding protein Lhcb6, CP24 × 2 Photosystem II protein D1 × 2 （P06585） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （Q9XQR6） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （P06004） Photosystem II D2 protein × 2 （P06006） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （P13554） Cytochrome b559 subunit beta, PsbF × 2 Photosystem II reaction center protein H × 2 （Q9XQR3） Photosystem II reaction center protein I, PsbI × 2 Photosystem II reaction center protein J × 2 （P13555） Photosystem II reaction center protein K × 2 （D5MAJ8） Photosystem II reaction center protein M × 2 （P69529） Oxygen-evolving enhancer protein 1, chloroplastic × 2 （P14226） Light harvesting chlorophyll a/b-binding protein Lhcb4, CP29 × 2 Light harvesting chlorophyll a/b-binding protein Lhcb5, CP26 × 2 Photosystem II reaction center protein T × 2 （Q8HS25） Photosystem II luminal extrinsic protein Tn, PsbTn × 2 Photosystem II reaction center protein W, PSBW × 2 Photosystem II reaction center protein X × 2 （Q8VYY1） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （Q32902） CHLOROPHYLL B × 98 CHLOROPHYLL A × 216 (3R,3'R,6S)-4,5-DIDEHYDRO-5,6-DIHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL × 32 ;(3S,5R,6S,3'S,5'R,6'S)-5,6,5',6'-DIEPOXY-5,6,5',6'- TETRAHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL ; × 16 ;(1R,3R)-6-{(3E,5E,7E,9E,11E,13E,15E,17E)-18-[(1S,4R,6R)-4-HYDROXY-2,2,6-TRIMETHYL-7-OXABICYCLO[4.1.0]HEPT-1-YL]-3,7,12,16-TETRAMETHYLOCTADECA-1,3,5,7,9,11,13,15,17-NONAENYLIDENE}-1,5,5-TRIMETHYLCYCLOHEXANE-1,3-DIOL ; × 16 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 36 BETA-CAROTENE × 24 CA-MN4-O5 CLUSTER × 2 FE (II) ION × 2 PHEOPHYTIN A × 4 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 8 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 14 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 4 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 10 BICARBONATE ION × 2 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSBL_PEA
Isoform	—
PDB实体	14
链与序列区间	作者链 L； PDB构建体 1–38； UniProt 1–38 作者链 l； PDB构建体 1–38； UniProt 1–38

Photosystem II reaction center protein M

物种未注明

UniProt P69529

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 54	Chlorophyll a-b binding protein 8, chloroplastic × 10 （P27490） Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 2 （Q04918） Light harvesting chlorophyll a/b-binding protein Lhcb6, CP24 × 2 Photosystem II protein D1 × 2 （P06585） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （Q9XQR6） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （P06004） Photosystem II D2 protein × 2 （P06006） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （P13554） Cytochrome b559 subunit beta, PsbF × 2 Photosystem II reaction center protein H × 2 （Q9XQR3） Photosystem II reaction center protein I, PsbI × 2 Photosystem II reaction center protein J × 2 （P13555） Photosystem II reaction center protein K × 2 （D5MAJ8） Photosystem II reaction center protein L × 2 （P60147） Oxygen-evolving enhancer protein 1, chloroplastic × 2 （P14226） Light harvesting chlorophyll a/b-binding protein Lhcb4, CP29 × 2 Light harvesting chlorophyll a/b-binding protein Lhcb5, CP26 × 2 Photosystem II reaction center protein T × 2 （Q8HS25） Photosystem II luminal extrinsic protein Tn, PsbTn × 2 Photosystem II reaction center protein W, PSBW × 2 Photosystem II reaction center protein X × 2 （Q8VYY1） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （Q32902） CHLOROPHYLL B × 98 CHLOROPHYLL A × 216 (3R,3'R,6S)-4,5-DIDEHYDRO-5,6-DIHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL × 32 ;(3S,5R,6S,3'S,5'R,6'S)-5,6,5',6'-DIEPOXY-5,6,5',6'- TETRAHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL ; × 16 ;(1R,3R)-6-{(3E,5E,7E,9E,11E,13E,15E,17E)-18-[(1S,4R,6R)-4-HYDROXY-2,2,6-TRIMETHYL-7-OXABICYCLO[4.1.0]HEPT-1-YL]-3,7,12,16-TETRAMETHYLOCTADECA-1,3,5,7,9,11,13,15,17-NONAENYLIDENE}-1,5,5-TRIMETHYLCYCLOHEXANE-1,3-DIOL ; × 16 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 36 BETA-CAROTENE × 24 CA-MN4-O5 CLUSTER × 2 FE (II) ION × 2 PHEOPHYTIN A × 4 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 8 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 14 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 4 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 10 BICARBONATE ION × 2 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSBM_PEA
Isoform	—
PDB实体	15
链与序列区间	作者链 M； PDB构建体 1–34； UniProt 1–34 作者链 m； PDB构建体 1–34； UniProt 1–34

Oxygen-evolving enhancer protein 1, chloroplastic

物种未注明

UniProt P14226

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 54	Chlorophyll a-b binding protein 8, chloroplastic × 10 （P27490） Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 2 （Q04918） Light harvesting chlorophyll a/b-binding protein Lhcb6, CP24 × 2 Photosystem II protein D1 × 2 （P06585） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （Q9XQR6） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （P06004） Photosystem II D2 protein × 2 （P06006） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （P13554） Cytochrome b559 subunit beta, PsbF × 2 Photosystem II reaction center protein H × 2 （Q9XQR3） Photosystem II reaction center protein I, PsbI × 2 Photosystem II reaction center protein J × 2 （P13555） Photosystem II reaction center protein K × 2 （D5MAJ8） Photosystem II reaction center protein L × 2 （P60147） Photosystem II reaction center protein M × 2 （P69529） Light harvesting chlorophyll a/b-binding protein Lhcb4, CP29 × 2 Light harvesting chlorophyll a/b-binding protein Lhcb5, CP26 × 2 Photosystem II reaction center protein T × 2 （Q8HS25） Photosystem II luminal extrinsic protein Tn, PsbTn × 2 Photosystem II reaction center protein W, PSBW × 2 Photosystem II reaction center protein X × 2 （Q8VYY1） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （Q32902） CHLOROPHYLL B × 98 CHLOROPHYLL A × 216 (3R,3'R,6S)-4,5-DIDEHYDRO-5,6-DIHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL × 32 ;(3S,5R,6S,3'S,5'R,6'S)-5,6,5',6'-DIEPOXY-5,6,5',6'- TETRAHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL ; × 16 ;(1R,3R)-6-{(3E,5E,7E,9E,11E,13E,15E,17E)-18-[(1S,4R,6R)-4-HYDROXY-2,2,6-TRIMETHYL-7-OXABICYCLO[4.1.0]HEPT-1-YL]-3,7,12,16-TETRAMETHYLOCTADECA-1,3,5,7,9,11,13,15,17-NONAENYLIDENE}-1,5,5-TRIMETHYLCYCLOHEXANE-1,3-DIOL ; × 16 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 36 BETA-CAROTENE × 24 CA-MN4-O5 CLUSTER × 2 FE (II) ION × 2 PHEOPHYTIN A × 4 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 8 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 14 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 4 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 10 BICARBONATE ION × 2 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSBO_PEA
Isoform	—
PDB实体	16
链与序列区间	作者链 O； PDB构建体 1–248； UniProt 82–329 作者链 o； PDB构建体 1–248； UniProt 82–329

Photosystem II reaction center protein T

物种未注明

UniProt Q8HS25

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 54	Chlorophyll a-b binding protein 8, chloroplastic × 10 （P27490） Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 2 （Q04918） Light harvesting chlorophyll a/b-binding protein Lhcb6, CP24 × 2 Photosystem II protein D1 × 2 （P06585） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （Q9XQR6） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （P06004） Photosystem II D2 protein × 2 （P06006） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （P13554） Cytochrome b559 subunit beta, PsbF × 2 Photosystem II reaction center protein H × 2 （Q9XQR3） Photosystem II reaction center protein I, PsbI × 2 Photosystem II reaction center protein J × 2 （P13555） Photosystem II reaction center protein K × 2 （D5MAJ8） Photosystem II reaction center protein L × 2 （P60147） Photosystem II reaction center protein M × 2 （P69529） Oxygen-evolving enhancer protein 1, chloroplastic × 2 （P14226） Light harvesting chlorophyll a/b-binding protein Lhcb4, CP29 × 2 Light harvesting chlorophyll a/b-binding protein Lhcb5, CP26 × 2 Photosystem II luminal extrinsic protein Tn, PsbTn × 2 Photosystem II reaction center protein W, PSBW × 2 Photosystem II reaction center protein X × 2 （Q8VYY1） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （Q32902） CHLOROPHYLL B × 98 CHLOROPHYLL A × 216 (3R,3'R,6S)-4,5-DIDEHYDRO-5,6-DIHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL × 32 ;(3S,5R,6S,3'S,5'R,6'S)-5,6,5',6'-DIEPOXY-5,6,5',6'- TETRAHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL ; × 16 ;(1R,3R)-6-{(3E,5E,7E,9E,11E,13E,15E,17E)-18-[(1S,4R,6R)-4-HYDROXY-2,2,6-TRIMETHYL-7-OXABICYCLO[4.1.0]HEPT-1-YL]-3,7,12,16-TETRAMETHYLOCTADECA-1,3,5,7,9,11,13,15,17-NONAENYLIDENE}-1,5,5-TRIMETHYLCYCLOHEXANE-1,3-DIOL ; × 16 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 36 BETA-CAROTENE × 24 CA-MN4-O5 CLUSTER × 2 FE (II) ION × 2 PHEOPHYTIN A × 4 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 8 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 14 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 4 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 10 BICARBONATE ION × 2 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PSBT_PEA
Isoform	—
PDB实体	19
链与序列区间	作者链 T； PDB构建体 1–35； UniProt 1–35 作者链 t； PDB构建体 1–35； UniProt 1–35

Photosystem II reaction center protein X

物种未注明

UniProt Q8VYY1

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 54	Chlorophyll a-b binding protein 8, chloroplastic × 10 （P27490） Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 2 （Q04918） Light harvesting chlorophyll a/b-binding protein Lhcb6, CP24 × 2 Photosystem II protein D1 × 2 （P06585） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （Q9XQR6） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （P06004） Photosystem II D2 protein × 2 （P06006） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （P13554） Cytochrome b559 subunit beta, PsbF × 2 Photosystem II reaction center protein H × 2 （Q9XQR3） Photosystem II reaction center protein I, PsbI × 2 Photosystem II reaction center protein J × 2 （P13555） Photosystem II reaction center protein K × 2 （D5MAJ8） Photosystem II reaction center protein L × 2 （P60147） Photosystem II reaction center protein M × 2 （P69529） Oxygen-evolving enhancer protein 1, chloroplastic × 2 （P14226） Light harvesting chlorophyll a/b-binding protein Lhcb4, CP29 × 2 Light harvesting chlorophyll a/b-binding protein Lhcb5, CP26 × 2 Photosystem II reaction center protein T × 2 （Q8HS25） Photosystem II luminal extrinsic protein Tn, PsbTn × 2 Photosystem II reaction center protein W, PSBW × 2 Photosystem II reaction center protein Z × 2 （Q32902） CHLOROPHYLL B × 98 CHLOROPHYLL A × 216 (3R,3'R,6S)-4,5-DIDEHYDRO-5,6-DIHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL × 32 ;(3S,5R,6S,3'S,5'R,6'S)-5,6,5',6'-DIEPOXY-5,6,5',6'- TETRAHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL ; × 16 ;(1R,3R)-6-{(3E,5E,7E,9E,11E,13E,15E,17E)-18-[(1S,4R,6R)-4-HYDROXY-2,2,6-TRIMETHYL-7-OXABICYCLO[4.1.0]HEPT-1-YL]-3,7,12,16-TETRAMETHYLOCTADECA-1,3,5,7,9,11,13,15,17-NONAENYLIDENE}-1,5,5-TRIMETHYLCYCLOHEXANE-1,3-DIOL ; × 16 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 36 BETA-CAROTENE × 24 CA-MN4-O5 CLUSTER × 2 FE (II) ION × 2 PHEOPHYTIN A × 4 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 8 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 14 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 4 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 10 BICARBONATE ION × 2 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q8VYY1_PEA
Isoform	—
PDB实体	22
链与序列区间	作者链 X； PDB构建体 1–86； UniProt 1–86 作者链 x； PDB构建体 1–86； UniProt 1–86

Photosystem II reaction center protein Z

物种未注明

UniProt Q32902

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 54	Chlorophyll a-b binding protein 8, chloroplastic × 10 （P27490） Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 2 （Q04918） Light harvesting chlorophyll a/b-binding protein Lhcb6, CP24 × 2 Photosystem II protein D1 × 2 （P06585） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （Q9XQR6） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （P06004） Photosystem II D2 protein × 2 （P06006） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （P13554） Cytochrome b559 subunit beta, PsbF × 2 Photosystem II reaction center protein H × 2 （Q9XQR3） Photosystem II reaction center protein I, PsbI × 2 Photosystem II reaction center protein J × 2 （P13555） Photosystem II reaction center protein K × 2 （D5MAJ8） Photosystem II reaction center protein L × 2 （P60147） Photosystem II reaction center protein M × 2 （P69529） Oxygen-evolving enhancer protein 1, chloroplastic × 2 （P14226） Light harvesting chlorophyll a/b-binding protein Lhcb4, CP29 × 2 Light harvesting chlorophyll a/b-binding protein Lhcb5, CP26 × 2 Photosystem II reaction center protein T × 2 （Q8HS25） Photosystem II luminal extrinsic protein Tn, PsbTn × 2 Photosystem II reaction center protein W, PSBW × 2 Photosystem II reaction center protein X × 2 （Q8VYY1） CHLOROPHYLL B × 98 CHLOROPHYLL A × 216 (3R,3'R,6S)-4,5-DIDEHYDRO-5,6-DIHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL × 32 ;(3S,5R,6S,3'S,5'R,6'S)-5,6,5',6'-DIEPOXY-5,6,5',6'- TETRAHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL ; × 16 ;(1R,3R)-6-{(3E,5E,7E,9E,11E,13E,15E,17E)-18-[(1S,4R,6R)-4-HYDROXY-2,2,6-TRIMETHYL-7-OXABICYCLO[4.1.0]HEPT-1-YL]-3,7,12,16-TETRAMETHYLOCTADECA-1,3,5,7,9,11,13,15,17-NONAENYLIDENE}-1,5,5-TRIMETHYLCYCLOHEXANE-1,3-DIOL ; × 16 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 36 BETA-CAROTENE × 24 CA-MN4-O5 CLUSTER × 2 FE (II) ION × 2 PHEOPHYTIN A × 4 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 8 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 14 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 4 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 10 BICARBONATE ION × 2 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PSBZ_PEA
Isoform	—
PDB实体	23
链与序列区间	作者链 Z； PDB构建体 1–62； UniProt 1–62 作者链 z； PDB构建体 1–62； UniProt 1–62

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	5xnm
沉积日期 deposition_date	2017-05-23
结构标题 title	Structure of unstacked C2S2M2-type PSII-LHCII supercomplex from Pisum sativum
关键词 keywords	Photosystem II, PSII-LHCII, C2S2M2, Supercomplex, MEMBRANE PROTEIN; MEMBRANE PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

5xnm__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

5xnm__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

5xnm__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	84.77 Å
Rg（电子密度）	85.65 Å
总 Rg	84.85 Å
原子数	92842
残基数	8712
排除体积	1730200 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`5xnm__assembly_1__model_1`	54-meric （54）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (39)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Chlorophyll a-b binding protein 8, chloroplastic
分子量 formula_weight	24952.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	10

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	1,2,G,N,Y,5,6,g,n,y
原子数 atom_count	92842

RKSATTKKVASSGSPWYGPDRVKYLGPFSGESPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFSKNRELEVIHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLVHAQSILAIWATQVILMGAVEGYRIAGGPLGEVVDPLYPGGSFDPLGLADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLSDPVNNNAWSYATNFVPGK

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic
分子量 formula_weight	26545.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	3,7

RKSANPLRDVVAMGTSKFTMGNDLWYGPDRVKYLGPFSAQTPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPEAFAKNRALEVIHGRWAMLGALGCITPEVLQKWVRVDFKEPVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPNLVHAQSILAVLGFQIVLMGLVEGFRINGLPDVGEGNDLYPGGQYFDPLGLADDPVTFAELKVKEIKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLLDHLDNPVANNAWVYATKFVPGA

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Light harvesting chlorophyll a/b-binding protein Lhcb6, CP24
分子量 formula_weight	22859.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	4,8

AASAPKKSWIPGVSFGGNLVDPEWLDGSLPGDFGFDPLGLGKDPAFLKWYREAELIHGRWAMAAVLGIFVGQAWSGVPWFEAGADPNAIAPFSFGTLLGTQLILMGWVESKRWVDFFNPDSQSVEWATPWSKTAENFVNSTGEQGYPGGKFFDPLSLAGTIENGVYIPDTDKLERLKLAEIKHARLAMLAMLIFYFEAGQGKTPLGALGL

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Photosystem II protein D1
分子量 formula_weight	38147.4 kDa
EC 编号 ec_number	1.10.3.9
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,a

MTAILERRDSENLWGRFCNWITSTENRLYIGWFGVLMIPTLLTATSVFIIAFIAAPPVDIDGIREPVSGSLLYGNNIISGAIIPTSAAIGLHFYPIWEAASVDEWLYNGGPYELIVLHFLLGVACYMGREWELSFRLGMRPWIAVAYSAPVAAATAVFLIYPIGQGSFSDGMPLGISGTFNFMIVFQAEHNILMHPFHMLGVAGVFGGSLFSAMHGSLVTSSLIRETTENESANEGYRFGQEEETYNIVAAHGYFGRLIFQYASFNNSRSLHFFLAAWPVVGIWFTALGISTMAFNLNGFNFNQSVVDSQGRVINTWADIINRANLGMEVMHERNAHNFPLDLA

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	Photosystem II CP47 reaction center protein
分子量 formula_weight	56117.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,b

MGLPWYRVHTVVLNDPGRLLSVHIMHTALVAGWAGSMALYELAVFDPSDPVLDPMWRQGMFVIPFMTRLGITNSWGGWNITGGTITNPGIWSYEGVAAAHIVFSGLCFLAAIWHWLYWDLEIFCDERTGKPSLDLPKIFGIHLFLAGVACFGFGAFHVTGLFGPGIWVSDPYGLTGRVQSVNPAWGVDGFDPFVPGGIASHHIAAGTLGILAGLFHLSVRPPQRLYKGLRMGNIETVLSSSIAAVFFAAFVVAGTMWYGSATTPIELFGPTRYQWDQGYFQQEIYRRVSAGHVENQSLSEAWSKIPEKLAFYDYIGNNPAKGGLFRAGSMDNGDGIAVGWLGHPIFRDKEGRELFVRRMPTFFETFPVVLVDGDGIVRGDVPFRRAESKYSVEQVGVIVEFYGGELNGVTYSDPATVKKYARRAQLGEIFELDRATLKSDGVFRSSPRGWFTFGHASFALLFFFGHIWHGARTLFRDLFAGIDPDLDAQVEFGAFQKLGDPTTRRGL

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	Photosystem II CP43 reaction center protein
分子量 formula_weight	52035.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,c

MKTLYSLRRFYHVETLFNGTLALTGRDQETTGFAWWAGNARLINLSGKLLGAHVAHAGLIVFWAGAMNLFEVAHFVPEKPMYEQGLILLPHLATLGWGVGPGGEVIDTFPYFVSGVLHLISSAVLGFGGIYHALLGPETLEESFPFFGYVWKDRNKMTTILGIHLILLGIGSFLLVFKAFYFGGIYDTWAPGGGDVRKITNFTLSPSILFGYLLKSPFGGEGWIVSVDDLEDIIGGHVWLGSICILGGIWHILTKPFAWARRALVWSGEAYLSYSLGALAVFGFIACCFVWFNNTAYPSEFYGPTGPEASQAQAFTFLVRDQRLGANVGSAQGPTGLGKYLMRSPTGEVIFGGETMRFWDLRAPWLEPLRGPNGLDLSRLKKDIQPWQERRSAEYMTHAPLGSLNSVGGVATEINAVNYVSPRSWLATSHFVLGFFLFVGHLWHAGRARAAAAGFEKGIDRDFEPVLSMTPLN

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	Photosystem II D2 protein
分子量 formula_weight	39557.2 kDa
EC 编号 ec_number	1.10.3.9
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D,d

MTIALGKFTKDQNDLFDIMDDWLRRDRFVFVGWSGLLLFPCAYFAVGGWFTGTTFVTSWYTHGLASSYLEGCNFLTAAVSTPANSLAHSLLLLWGPEAQGDLTRWCQLGGLWTFVALHGAFGLIGFMLRQFELARSVQLRPYNAIAFSGPIAVFVSVFLIYPLGQSGWFFAPSFGVAAIFRFILFFQGFHNWTLNPFHMMGVAGVLGAALLCAIHGATVENTLFEDGDGANTFRAFNPTQAEETYSMVTANRFWSQIFGVAFSNKRWLHFFMLFVPVTGLWMSALGVVGLALNLRAYDFVSQEIRAAEDPEFETFYTKNILLNEGIRAWMATQDQPHENLIFPEEVLPRGNAL

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	Cytochrome b559 subunit alpha
分子量 formula_weight	9421.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E,e

MSGSTGERSFADIITSIRYWIIHSITIPSLFIAGWLFVSTGLAYDVFGSPRPNEYFTETRQGIPLITGRFDSLEQLDEFSRSF

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	Cytochrome b559 subunit beta, PsbF
分子量 formula_weight	4488.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F,f

MTIDRTYPIFTVRWLAVHGLAVPTVFFLGSISAMQFIQR

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	Photosystem II reaction center protein H
分子量 formula_weight	7863.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H,h

MATQTVENSSRSGPRRTAVGDLLKPLNSEYGKVAPGWGTTPLMGIAMALFAVFLSIILEIYNSSLLLDQISMN

实体 11 Entity 11 polymer

描述 description	Photosystem II reaction center protein I, PsbI
分子量 formula_weight	4184.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I,i

MLTLKLFVYTIVIFFVSLFIFGFLSNDPGRNPGREE

实体 12 Entity 12 polymer

描述 description	Photosystem II reaction center protein J
分子量 formula_weight	4116.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	J,j

MANTTGRIPLWIIGTVAGIVVIGLIGLFFYGSYSGLGSSL

实体 13 Entity 13 polymer

描述 description	Photosystem II reaction center protein K
分子量 formula_weight	6912.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	K,k

MLNIFSLVCICINSALYSSSFFLGKLPEAYAFLNPIVDFMPVIPLLFFLLAFVWQAAVSFR

实体 14 Entity 14 polymer

描述 description	Photosystem II reaction center protein L
分子量 formula_weight	4498.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L,l

MTQSNPNEQNVELNRTSLYWGLLLIFVLAVLFSNYFFN

实体 15 Entity 15 polymer

描述 description	Photosystem II reaction center protein M
分子量 formula_weight	3756.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	M,m

MEVNILAFIATALFILVPTAFLLIIYVKTVSQSD

实体 16 Entity 16 polymer

描述 description	Oxygen-evolving enhancer protein 1, chloroplastic
分子量 formula_weight	26554.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	O,o

EGAPKRLTFDEIQSKTYLEVKGTGTANQCPTIDGGVDSFSFKPGKYNAKKLCLEPTSFTVKSEGVTKNTPLAFQNTKLMTRLTYTLDEIEGPFEVSADGSVKFEEKDGIDYAAVTVQLPGGERVPFLFTIKQLVASGKPDSFSGEFLVPSYRGSSFLDPKGRGASTGYDNAVALPAGGRGDEEELGKENNKSAASSKGKITLSVTQTKPETGEVIGVFESIQPSDTDLGAKAPKDVKIQGVWYAQLES

实体 17 Entity 17 polymer

描述 description	Light harvesting chlorophyll a/b-binding protein Lhcb4, CP29
分子量 formula_weight	27138.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	R,r

KPSRSAPTTDRPLWFPGAKSPEYLDGSLVGDYGFDPFGLGKPAEYLQFDLDSLDQNLAKNLAGDVIGTRTEFEDVKSTPFQPYTEVFGLQRFRECELIHGRWAMLATLGALTVEWLTGVTWQDAGKVELVEGSTYLGQPLPFSITTLIWIEVLVIGYIEFQRNAELDSEKRLYPGGKFFDPLGLAADPEKKATLQLAEIKHARLAMVAFLGFAVQAAATGKGPLNNWATHLSDPLHTTIIDTFSSS

实体 18 Entity 18 polymer

描述 description	Light harvesting chlorophyll a/b-binding protein Lhcb5, CP26
分子量 formula_weight	26541.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	S,s

ALFSKKKAAPPKKAVVSPVDDELAKWYGPDRRIFLPEGLLDRSEIPAYLTGEVPGDYGYDPFGLSKKPDDFAKYQAYELIHGRWAMLGAAGFIIPEAFNKFGANCGPEAVWFKTGALLLDGNTLNYFGKNIPINLIFAVIAEVVLVGGAEYYRIINGLNLEDKLHPGGPFDPLGLAKDPDQAAILKVKEIKNGRLAMFAMLGFFIQAYVTGEGPVENLAKHLSDPFANNLLTVLAGSAERAPTL

实体 19 Entity 19 polymer

描述 description	Photosystem II reaction center protein T
分子量 formula_weight	4036.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	T,t

MEALVYTFLLVSTLGIIFFAIFFREPPKVPTKNTK

实体 20 Entity 20 polymer

描述 description	Photosystem II luminal extrinsic protein Tn, PsbTn
分子量 formula_weight	10676.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	U,u

MASITMTASFLGTTVSKQPPTHHLRRGVVMAKAMPETTTTTKEETSSKRRDLVFAVAAAAACSVARIAMAEEPKRGTPEAKKKYAPVCVTMPSARICYK

实体 21 Entity 21 polymer

描述 description	Photosystem II reaction center protein W, PSBW
分子量 formula_weight	5914.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	W,w

LVDDRMSTEGTGLPFGLSNNLLGWILFGVFGLIWALYFIYASGLDEDEESGLSL

实体 22 Entity 22 polymer

描述 description	Photosystem II reaction center protein X
分子量 formula_weight	8692.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	X,x

SIGRASSKSNGRFQVKASLKEKVVTGLTAAALTAQMVIPDVAEAATVSPSLKNFLLSIVSGGVVVTAILGAVIGVSNFDPVKRGSQ

实体 23 Entity 23 polymer

描述 description	Photosystem II reaction center protein Z
分子量 formula_weight	6555.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Z,z

MTIAFQLAVFALIVTSSILLISVPVVFASPDGWSSNKNVVFSGTSLWIGLVFLVGILNSLIS

实体 24 Entity 24 non-polymer

描述 description	CHLOROPHYLL B
分子量 formula_weight	907.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	98

实体 25 Entity 25 non-polymer

描述 description	CHLOROPHYLL A
分子量 formula_weight	893.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	216

实体 26 Entity 26 non-polymer

描述 description	(3R,3'R,6S)-4,5-DIDEHYDRO-5,6-DIHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL
分子量 formula_weight	568.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	32

实体 27 Entity 27 non-polymer

描述 description	;(3S,5R,6S,3'S,5'R,6'S)-5,6,5',6'-DIEPOXY-5,6,5',6'- TETRAHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL ;
分子量 formula_weight	600.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	16

实体 28 Entity 28 non-polymer

描述 description	;(1R,3R)-6-{(3E,5E,7E,9E,11E,13E,15E,17E)-18-[(1S,4R,6R)-4-HYDROXY-2,2,6-TRIMETHYL-7-OXABICYCLO[4.1.0]HEPT-1-YL]-3,7,12,16-TETRAMETHYLOCTADECA-1,3,5,7,9,11,13,15,17-NONAENYLIDENE}-1,5,5-TRIMETHYLCYCLOHEXANE-1,3-DIOL ;
分子量 formula_weight	600.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	16

实体 29 Entity 29 non-polymer

描述 description	1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE
分子量 formula_weight	723.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	36

实体 30 Entity 30 non-polymer

描述 description	BETA-CAROTENE
分子量 formula_weight	536.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	24

实体 31 Entity 31 non-polymer

描述 description	CA-MN4-O5 CLUSTER
分子量 formula_weight	339.8 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 32 Entity 32 non-polymer

描述 description	FE (II) ION
分子量 formula_weight	55.8 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 33 Entity 33 non-polymer

描述 description	PHEOPHYTIN A
分子量 formula_weight	871.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 34 Entity 34 non-polymer

描述 description	1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL
分子量 formula_weight	795.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	8

实体 35 Entity 35 non-polymer

描述 description	1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE
分子量 formula_weight	787.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	14

实体 36 Entity 36 non-polymer

描述 description	;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ;
分子量 formula_weight	749.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 37 Entity 37 non-polymer

描述 description	DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG)
分子量 formula_weight	949.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	10

实体 38 Entity 38 non-polymer

描述 description	BICARBONATE ION
分子量 formula_weight	61.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 39 Entity 39 non-polymer

描述 description	PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE
分子量 formula_weight	616.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 14 domains

CATH v4.4 (14 domains)

结构域编号 domain_id	5xnm301
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	3460 — Chlorophyll a-b binding protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Chlorophyll a/b binding protein domain

结构域编号 domain_id	5xnm701
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	3460 — Chlorophyll a-b binding protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Chlorophyll a/b binding protein domain

结构域编号 domain_id	5xnmB02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	10 — Roll
拓扑 Topology topology	680 — Photosystem II CP47 reaction center protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Photosystem II CP47 reaction center protein

结构域编号 domain_id	5xnmC02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	10 — Arc Repressor Mutant, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	670 — photosystem ii from thermosynechococcus elongatus

结构域编号 domain_id	5xnmE00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	860 — Photosystem II cytochrome b559, alpha subunit

结构域编号 domain_id	5xnmH01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	880 — Photosystem II reaction center protein H

结构域编号 domain_id	5xnmS01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	3460 — Chlorophyll a-b binding protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Chlorophyll a/b binding protein domain

结构域编号 domain_id	5xnmZ00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	287 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	740 — Photosystem II PsbZ, reaction centre

结构域编号 domain_id	5xnmb02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	10 — Roll
拓扑 Topology topology	680 — Photosystem II CP47 reaction center protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Photosystem II CP47 reaction center protein

结构域编号 domain_id	5xnmc02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	10 — Arc Repressor Mutant, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	670 — photosystem ii from thermosynechococcus elongatus

结构域编号 domain_id	5xnme00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	860 — Photosystem II cytochrome b559, alpha subunit

结构域编号 domain_id	5xnmh01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	880 — Photosystem II reaction center protein H

结构域编号 domain_id	5xnms01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	3460 — Chlorophyll a-b binding protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Chlorophyll a/b binding protein domain

结构域编号 domain_id	5xnmz00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	287 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	740 — Photosystem II PsbZ, reaction centre

▶

晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	1

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.20 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	50237

Structure of unstacked C2S2M2-type PSII-LHCII supercomplex from Pisum sativum

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Chlorophyll a-b binding protein 8, chloroplastic

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem II protein D1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem II CP47 reaction center protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem II CP43 reaction center protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem II D2 protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Cytochrome b559 subunit alpha

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem II reaction center protein H

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem II reaction center protein J

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem II reaction center protein K

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体