9ifm

STRUCTURE OF UNSTACKED C2S2-TYPE PSII-LHCII SUPERCOMPLEX FROM PISUM SATIVUM

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 232.3 Å Quality: GOOD

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 9ifm

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 9ifm
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1. 结构基本信息 1. Structure Basics

条目编号 entry_id9ifm
沉积日期 deposition_date2025-02-18
结构标题 titleSTRUCTURE OF UNSTACKED C2S2-TYPE PSII-LHCII SUPERCOMPLEX FROM PISUM SATIVUM
关键词 keywordsPlant, PSII, Pisum sativum, membrane protein, Cryo-EM, PHOTOSYNTHESIS; PHOTOSYNTHESIS
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

2. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 2. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier74.14
回转半径 Rg (电子) rg_electron74.96
零角强度 I(0) i010809000000.00
分子量 molecular_weight1091900.0 kDa
排除体积 excluded_volume1442500 ų
包络体积 envelope_volume1784900 ų
水化壳体积 shell_volume197220 ų
包络直径 envelope_diameter284.9
壳层 Rg shell_rg74.37
包络 Rg envelope_rg75.50
形状 Rg shape_rg75.07
总 Rg total_rg74.42
总原子数 total_atoms77705
残基数 n_residues7734
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

3. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 3. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax232.3
Rg (实空间) rg_real73.27
Rg 误差 (实空间) rg_real_error1.13
I(0) (实空间) i0_real1.0690e+10
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error2.1150e+08
Rg (倒空间) rg_reciprocal73.11
I(0) (倒空间) i0_reciprocal10780000000.0000
解质量估计 total_estimate0.8446
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary77.4
偏度 Skewness skewness0.505
峰度 Kurtosis kurtosis-0.088
角度范围 angular_range— – 0.1050 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.3115
最高正则化参数 α highest_alpha1141000000.0000
实空间数据点数 n_real_points22
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.892; Stabil: 0.996; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.968; Smooth: 0.252

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合体信息 (42)

7. 引用文献 (1)

8. 文件与曲线 (10)