5yfp

Cryo-EM Structure of the Exocyst Complex

Method: ELECTRON MICROSCOPY

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Exocyst complex component SEC3

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 8	Exocyst complex component SEC5 × 1 （P89102） Exocyst complex component SEC6 × 1 （P32844） Exocyst complex component SEC8 × 1 （P32855） Exocyst complex component SEC10 × 1 （Q06245） Exocyst complex component SEC15 × 1 （P22224） Exocyst complex component EXO70 × 1 （P19658） Exocyst complex component EXO84 × 1 （P38261）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	SEC3_YEAST
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–1336； UniProt 1–1336

Exocyst complex component SEC5

物种未注明

UniProt P89102

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 8	Exocyst complex component SEC3 × 1 （P33332） Exocyst complex component SEC6 × 1 （P32844） Exocyst complex component SEC8 × 1 （P32855） Exocyst complex component SEC10 × 1 （Q06245） Exocyst complex component SEC15 × 1 （P22224） Exocyst complex component EXO70 × 1 （P19658） Exocyst complex component EXO84 × 1 （P38261）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	SEC5_YEAST
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–971； UniProt 1–971

Exocyst complex component SEC6

物种未注明

UniProt P32844

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 8	Exocyst complex component SEC3 × 1 （P33332） Exocyst complex component SEC5 × 1 （P89102） Exocyst complex component SEC8 × 1 （P32855） Exocyst complex component SEC10 × 1 （Q06245） Exocyst complex component SEC15 × 1 （P22224） Exocyst complex component EXO70 × 1 （P19658） Exocyst complex component EXO84 × 1 （P38261）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	SEC6_YEAST
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–805； UniProt 1–805

Exocyst complex component SEC8

物种未注明

UniProt P32855

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 8	Exocyst complex component SEC3 × 1 （P33332） Exocyst complex component SEC5 × 1 （P89102） Exocyst complex component SEC6 × 1 （P32844） Exocyst complex component SEC10 × 1 （Q06245） Exocyst complex component SEC15 × 1 （P22224） Exocyst complex component EXO70 × 1 （P19658） Exocyst complex component EXO84 × 1 （P38261）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	SEC8_YEAST
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–1065； UniProt 1–1065

Exocyst complex component SEC10

物种未注明

UniProt Q06245

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 8	Exocyst complex component SEC3 × 1 （P33332） Exocyst complex component SEC5 × 1 （P89102） Exocyst complex component SEC6 × 1 （P32844） Exocyst complex component SEC8 × 1 （P32855） Exocyst complex component SEC15 × 1 （P22224） Exocyst complex component EXO70 × 1 （P19658） Exocyst complex component EXO84 × 1 （P38261）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	SEC10_YEAST
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–871； UniProt 1–871

Exocyst complex component SEC15

物种未注明

UniProt P22224

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 8	Exocyst complex component SEC3 × 1 （P33332） Exocyst complex component SEC5 × 1 （P89102） Exocyst complex component SEC6 × 1 （P32844） Exocyst complex component SEC8 × 1 （P32855） Exocyst complex component SEC10 × 1 （Q06245） Exocyst complex component EXO70 × 1 （P19658） Exocyst complex component EXO84 × 1 （P38261）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	SEC15_YEAST
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 F； PDB构建体 1–910； UniProt 1–910

Exocyst complex component EXO70

物种未注明

UniProt P19658

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 8	Exocyst complex component SEC3 × 1 （P33332） Exocyst complex component SEC5 × 1 （P89102） Exocyst complex component SEC6 × 1 （P32844） Exocyst complex component SEC8 × 1 （P32855） Exocyst complex component SEC10 × 1 （Q06245） Exocyst complex component SEC15 × 1 （P22224） Exocyst complex component EXO84 × 1 （P38261）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	EXO70_YEAST
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 G； PDB构建体 1–623； UniProt 1–623

Exocyst complex component EXO84

物种未注明

UniProt P38261

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 8	Exocyst complex component SEC3 × 1 （P33332） Exocyst complex component SEC5 × 1 （P89102） Exocyst complex component SEC6 × 1 （P32844） Exocyst complex component SEC8 × 1 （P32855） Exocyst complex component SEC10 × 1 （Q06245） Exocyst complex component SEC15 × 1 （P22224） Exocyst complex component EXO70 × 1 （P19658）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	EXO84_YEAST
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 H； PDB构建体 1–753； UniProt 1–753

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	5yfp
沉积日期 deposition_date	2017-09-21
结构标题 title	Cryo-EM Structure of the Exocyst Complex
关键词 keywords	exocyst, coiled-coil, EXOCYTOSIS; EXOCYTOSIS
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

5yfp__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

5yfp__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

5yfp__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	82.40 Å
Rg（电子密度）	83.62 Å
总 Rg	83.40 Å
原子数	33095
残基数	5981
排除体积	548810 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`5yfp__assembly_1__model_1`	octameric （8）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (8)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Exocyst complex component SEC3
分子量 formula_weight	154889.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	33096

MRSSKSPFKRKSHSRETSHDENTSFFHKRTISGSSAHHSRNVSQGAVPSSAPPVSGGNYSHKRNVSRASNSSQTSNFLAEQYERDRKAIINCCFSRPDHKTGEPPNNYITHVRIIEDSKFPSSRPPPDSKLENKKKRLLILSAKPNNAKLIQIHKARENSDGSFQIGRTWQLTELVRVEKDLEISEGFILTMSKKYYWETNSAKERTVFIKSLITLYIQTFEGHVPELVNWDLSLFYLDERSYQRAVITNRPGSVSPIKSPTSNFTTNTTQSVGSVPFSAPTERTRRSETESVNPVSTPASVEYHAGMKSLNKAPYSSNSTLNEVNKRYELEQQQQQEEAELRRLEEQKRLQLQKENEMKRLEEERRIKQEERKRQMELEHQRQLEEEERKRQMELEAKKQMELKRQRQFEEEQRLKKERELLEIQRKQREQETAERLKKEEQEALAKKEEEEKSKRNKVDNESYTQEINGKVDNLLEDLNAVLAEETETTPTMQNGTYVPERSTARAHDQLKKPLNIAKVESLGGSDLNDSISLSDEIAGLNTSNLSGEDQDEKNDLSFEKGDEVRYSNNFEGEAPHVYHEVSIIQEEAPAVSQKLILPEENNESEALIESKEEIKTMENIDDEVLLEILTDINWSIEDDADSMIERIDLRLAETEYLFNQNLLSLQKIGPNIRPYEDKVNDECHRIIPTLSLFLMEMSNFSNDIENVESQDNGLQVESANKKLLWNTLDELLKTVSLDEISLNQLLECPIREKNLPWMENQLNLLLKAFQAIGSDGNEVEYNLREISGLKQRLQFYEKVTKIFLNRIVEEMQKKFSNIRGQDISHDQMIRILTTLLIFSPLILFCKEISQKSYQAIVENWNVSIQPVYMELWTKKISQLQGIDTNDEKMNELSLSQLLNEWDTFRKERKTNDINPVFKNSFSLLTECLQTMRQECIVYQNFVEVFFHISSKHNFEEYIKHFNDPDAPPILLDTVKVMQSDREAAVIETQLVSRIFQPIVTRLSSYFVELVKAEPTVAPALTFYLENEIKSLESSNHEFLLSAVTRMYTQIKQVWSDNVEEQVLHFERISNATTNGEILPGILDLPVGLKNSEDLFQFAKRSMDIKDTDEGYESIELMNSSFRKLSIAATRSITHKEVNSSINPNLSDTAALNNDYMETISLLVNSNWLTEMLSMLNFNKDGIFDTSLQNVKKVFDVEKESYASFLLRDTMPKLTAFVYGVSNIIENTNNVNMTNPSRWAAYSRQNLENILLAYTSHEIETLVKRLHTHMVNDFGYHQENAINNVLCDKLWSCIQGQTVSLYLKLYTVIDKHYRGTNIRFTKNDIISAFEEYKNA

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Exocyst complex component SEC5
分子量 formula_weight	112236.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

MDRFQIGDEQLLRFYQLKTINPTHSWAQDSSKLNNEEATSNELGVETSFDILKDFKYGNQISIDKESRAYLNDESLSYIRDPLNGQEMSKELQHLPNDSMRLNYLVNSKQFNVKAFLRDMHKQDSFNDLNNSLDRLDSDIQDQSIHLKQLVGKNFTKYVKIKNKLDQIYKEFDEKTNEKNQCDSPKENQINVESLNKKVDEVIRTTTFKLKPLMDNYQKILNYQATKKFIELNKFYFNLPKSLKRCLTNNDFNEFIIEYSKGLTLRRRFNQSSDASQSLVIKRIWTQIENLLVTYKDLIWNSLINSNFNIDQPQETILSLFSKLLNLENFINNNQRESESGNKNTTSSSNENPILRWMSIKMNGFQNELNELSGHMISKIIHSQRLILQNNTNQDKSQGCVELSYYLKINQLFQIISDTGKDSEGLKSTVEPNKVNTISGTSYLNLNCQPSSQGLTDSPTIIEMWLLILKYINDLWKICDQFIEFWEHIEKFLDGTYQNSIINEKRKENILIGDSNIIESYQKSLILKEEQINEVRLKGEEFITSVSQNLISFFTSSQSSLPSSLKDSTGDITRSNKDSGSPLDYGFIPPNCNGLSCLRYLPKIVEPILKFSTELAQLNITTNGITICRNTLSTIINRCVGAISSTKLRDISNFYQLENWQVYETVTFSSKSQDSSKNLTFEYGVTQFPEIVTSFQEVSIKTTRDLLFAYEKLPIINGISVVSYPSKQLLTGIEIQQIISMEAVLEAILKNAAKDKDNPRNSHTILTLTNLQYFRECAFPNILQYFDDAFEWNLASKNLELFSLLSKMESSIFGNYLSDLKINLRDTLEEKFHEINWPMYTSNSFRVGDYIIEALMILIVVHSECFRIGPQLIHKILIETQIFIARYLFEAFKPYVGNLSNDGSLQIIVDLEFFQKVMGPLLEKDTEATLRACLQNCFQNDTNRLQKCINEINPIVSANLKRTAIQFAAFS

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Exocyst complex component SEC6
分子量 formula_weight	93539.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

MSSDPLQQVCDLIKGDLSLERVRDIKEQLLKEKSVVEYQLNKESDKYYGEVEESLKLLNLSKNSVTSIKQQINEVNKLGNDNRFAINRYDILFRATKLYETVNTTSSIYDRIYNFVALMEHIERLLVAELAEDALETGCPHLLEIHFLLTSARDFQEQVVVMAKEATEDAQRTVMKLFSRLSGIISKFDKLLDGLTYDIVEMARAEQISLAIRLFKIYDLEEREDLRIEAIRNIIKKKEIEIEKSSIKKLPNSKNTARLQDETPKVIEYPTNKGLYQEIMSGTISTRTAPRGYKHFLINGINNSISEMFGEMREKYVGDQKFDVLDNMDWIFNELIIVKEHIANCCPPHWNIFEVYFDQYYKELHSLITDLVESEPETIIILDILAFDKTFQDTLKQDFGFTKSEVKSVIGDKEKETLFKDYLNLIVVKMTEWIGNLEKAEFDVFLERSTPPHSDSDGLLFLDGTKTCFQMFTQQVEVAAGTNQAKILVGVVERFSDLLTKRQKNWISKISEEIKKQINYNHKYDIDPESITPEDECPGGLVEYLIAVSNDQMKAADYAVAISSKYGKLVSKVYEKQITNHLEGTLDGFAEVAQCSSLGLITLMFDDLRKPYQEIFSKTWYMGSQAQQIADTLDEYLLDIKPQMNSVLFVNFIDNVIGETIIKFLTALSFEHSFKNKNNKFLEAMKRDFEIFYQLFVKVLDGNESKDTLITQNFTVMEFFMDLSCEPIDSILDIWQKYLEVYWDSRIDLLVGILKCRKDVSSSERKKIVQQATEMLHEYRRNMEANGVDREPTLMRRFVLEFEKQ

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Exocyst complex component SEC8
分子量 formula_weight	122367.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

MDYLKPAQKGRRRGLSINSLSETQQSAMNSSLDHLQNDLNRINLQWNRILSDNTNPLELALAFLDDTSVGLGHRYEEFNQLKSQIGSHLQDVVNEHSQVFNTNVASYGKAVSSIMQAQEQTLNLKNCLKEANEKITTDKGSLQELNDNNLKYTKMIDVLVNIEELLQIPEKIEENIRKENFHQVQILLERGFILMNNKSLKTVEILKPINQQLELQEHLLFNNLIEEIHDIMYSKSNKTNFTRVTNNDIFKIISISHNGFTSLENYLYNIVNIDIMEHSKTINKNLEQFIHDQSLNKGNIMLQENAATQAPLAPSRNQENEGFNRIGFLLKTINNINKLPVAFNIITERAKEEIHNIIVKSTESIRSKHPSLLKMATSLKNDNHFGLPVQDILSIILRECFWEIFLKLLYAIQCHRAIFEMSNILQPTSSAKPAFKFNKIWGKLLDEIELLLVRYINDPELISSNNGSIKPINGATNNAPTLPKRKNPKIFSLEYNIEDNSSVKDQAFELKALLKDIFPGFSVSSNMDLDSIYVKDESFEQDEPLVPPSVFNMKVILDPFLLFTQSTSTIVPSVLTQNTISSLTFFDDYMNKSFLPKIQMTMDYLFTVEVESNNPYALELSDENHNIFKTALDFQRLFYNLLNVFNTANTFREKISYCILDLLNHFYNYYLGLFNSLIGTSDRHLTRKIITAWLQNGILMDQEQKILNGDETLFHEESIELFKEIPHFYQAGKGLSKSDLFNNLTLDTILQFSASVLWILNWLPGLKKAINIDEVSQEPMLDADRLRSSWTFSESMDLNYSNPSSSPNSLGNLKILLDDKASKKFDETIDGFKTLKFKLITILRFNIRALCIYDIGSFFQNTKIWNMDVGSIELDQNIASLISELRRTESKLKQQLPEKEKNSIFIGLDIVNNYALIKGAKSIKVLNHNGIKKMLRNVNVLQHAYRNLSSEPSKINMNVTMNFYSLCGSSEAELFEYIKDNELPHCSVEDLKTILRLQFSEEMHRQLKRQSTSSTKGSIKPSNKRYTEALEKLSNLEKEQSKEGARTKIGKLKSKLNAVHTANEK

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	Exocyst complex component SEC10
分子量 formula_weight	100459.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E

MNSLYELDPKWKKLLKTDNFLGGLTVNEFVQELSKDHRNDVLIDANTKNLPTNEKDQDAIREAIWKQLDPKPYIRTFESTLKELKNLNEETLNKRQYFSEQVATQEVIHSENVIKLSKDLHTTLLTFDKLDDRLTNVTQVVSPLGDKLETAIKKKQNYIQSVELIRRYNDFYSMGKSDIVEQLRLSKNWKLNLKSVKLMKNLLILSSKLETSSIPKTINTKLVIEKYSEMMENELLENFNSAYRENNFTKLNEIAIILNNFNGGVNVIQSFINQHDYFIDTKQIDLENEFENVFIKNVKFKEQLIDFENHSVIIETSMQNLINDVETVIKNESKIVKRVFEEKATHVIQLFIQRVFAQKIEPRFEVLLRNSLSISNLAYVRILHGLFTLFGKFTKSLIDYFQLLEIDDSNQILSTTLEQCFADLFSHYLYDRSKYFGIEKRSLEAILVDMTSKFTVNYDKEINKRVLLDKYKEKLSTNVDAFMHSPRGNTHSRQDSTSRSKLSQFNSFLKTHLDKDHLSLNRTNTLSDSFNNSSSSTQYDVANNSSSLVNSSFTASDIDNSPNSPANYSLNDVDSMLKCVVESTARVMELIPNKAHLYILEILKIMFLGIVDSYMEIALEVAYWKICKVDINKTAGVVNLNFLKFISMSTEILDLLSISIKSIFLPLLNNSPEIKAQIIEMTNSQIQKMEILINIILQETITVISTKFSAILCKQKKKDFVPKSQELLDQDTLPAIEIVNILNLIFEQSSKFLKGKNLQTFLTLIGEELYGLLLSHYSHFQVNSIGGVVVTKDIIGYQTAIEDWGVASLIDKFATLRELANLFTVQPELLESLTKEGHLADIGRDIIQSYISNREDFNHDNFINSVKLNFR

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	Exocyst complex component SEC15
分子量 formula_weight	105166.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F

MDQEGQPLLSKDFQQVLLATASGNNSSWTERAVLNNESTDAVKHEPALGQNDVFDLDPLSFDKWVPFLRRALDKNQLDPVIDELENSIEDNFQGLELQLLQDSQMNDKLETSIDEIANIQGMVQDTLSSEISKFQIRLSESANELIVKKQMYVNNKKISLKISEATILITKVVRILELSSKCQELITERKFFKVLQNLDSLEKLYLQEFKNYNFQFLIEIYNSIPFLQKVTKDECINLIRNSLNLNLGKNLIKVGQEFVAIYENELLPQWLETRSKMKLTNFKFNSPIEISMRDESFLAKLNLGEFFQLDDFHDSIMIFQNLNELSVLSGEFNKEYELRKTKLMYPLIWKKNKTAAYQMDSLLRGTGTTPGSTAHDVSTDDPFTQSLSLHFLQDYFLKILGFLLYDINLNKATEFILVDNNYNSTNEFWDGLMDRLSPYLSYFIDEKLKTEEDMIKLKDFLCIYVAILENFKLNIEPLYKILVSIFEKFCSVSLRAFDDEFQILLNDDDFMPLSINDKTLYEKVLKICWMKEGEHLSLPDPTNGEPFAVTLPFSPLYPMTCTLAKKTYSKITAFLSIFYRHELHTLNNILVKTMDDIFNDIVNKKIRSKLESTSREEIAQILVNLDYFIIAAKEFSNFMTRENILQNPDMEIRLSSIKYLAESRKLAETKLIELIDSKISDILETIEIDWQITEVRQDPDISIIDLAQFLEMMFASTLQNLPYSVQTLLIFREFDSLTRQFMGLLLHDTPSTITHESIMNFEVDVNYLESIIPRIFPSTPGTIDSNGYQSPMTPSTPTFPNANGVDAPTLFENNIKSLEATFMELKQCIELLKTQGKDYNEPEIRLRKYSRIRQEDAALLLSKIQHFVSSVEGANGDDTSVMDSSSIFNSESASVIDSNTSRIAKFFNRR

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	Exocyst complex component EXO70
分子量 formula_weight	71382.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G

MPAEIDIDEADVLVLSQELQKTSKLTFEINKSLKKIAATSNQSSQLFTPILARNNVLTTLQRNIESTLNSVASVKDLANEASKYEIILQKGINQVGLKQYTQVVHKLDDMLEDIQSGQANREENSEFHGILTHLEQLIKRSEAQLRVYFISILNSIKPFDPQINITKKMPFPYYEDQQLGALSWILDYFHGNSEGSIIQDILVGERSKLILKCMAFLEPFAKEISTAKNAPYEKGSSGMNSYTEALLGFIANEKSLVDDLYSQYTESKPHVLSQILSPLISAYAKLFGANLKIVRSNLENFGFFSFELVESINDVKKSLRGKELQNYNLLQDCTQEVRQVTQSLFRDAIDRIIKKANSISTIPSNNGVTEATVDTMSRLRKFSEYKNGCLGAMDNITRENWLPSNYKEKEYTLQNEALNWEDHNVLLSCFISDCIDTLAVNLERKAQIALMPNQEPDVANPNSSKNKHKQRIGFFILMNLTLVEQIVEKSELNLMLAGEGHSRLERLKKRYISYMVSDWRDLTANLMDSVFIDSSGKKSKDKEQIKEKFRKFNEGFEDLVSKTKQYKLSDPSLKVTLKSEIISLVMPMYERFYSRYKDSFKNPRKHIKYTPDELTTVLNQLVR

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	Exocyst complex component EXO84
分子量 formula_weight	85649.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H

MVEFSLKKARNNWKHVKKSASSPAKQKTPPSPAKPKQKTKKNPYSDLKDPATSYTLPTINARERSRVATSMQRRLSIHNTNYAPPTLDYSMPLPDMPNMIVPNDNVDSSHNNSSFTTENESVSSKGPSNSLNLSTADLSLNDSSYNKVPARSAMRNTVNPSGSNDPFNNSTSLRKMLANPHFNAKDFVHDKLGNASAITIDKFTSNLTDLSIQVQEEVKLNINKSYNEIMTVNNDLNVAMLELKRVRANINDLNEVLDQCTKIAEKRLQLQDQIDQERQGNFNNVESHSNSPALLPPLKAGQNGNLMRRDRSSVLILEKFWDTELDQLFKNVEGAQKFINSTKGRHILMNSANWMELNTTTGKPLQMVQIFILNDLVLIADKSRDKQNDFIVSQCYPLKDVTVTQEEFSTKRLLFKFSNSNSSLYECRDADECSRLLDVIRKAKDDLCDIFHVEEENSKRIRESFRYLQSTQQTPGRENNRSPNKNKRRSMGGSITPGRNVTGAMDQYLLQNLTLSMHSRPRSRDMSSTAQRLKFLDEGVEEIDIELARLRFESAVETLLDIESQLEDLSERISDEELMLLNLISLKIEQRREAISSKLSQSILSSNEIVHLKSGTENMIKLGLPEQALDLFLQNRSNFIQDLILQIGSVDNPTNYLTQLAVIRFQTIKKTVEDFQDIFKELGAKISSILVDWCSDEVDNHFKLIDKQLLNDEMLSPGSIKSSRKQIDGLKAVGLDFVYKLDEFIKKNSDKIR

▶

晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	1

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	4.400 Å
最低分辨率 resolution_low	— Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	—
R_free r_free	—

分辨率 resolution	4.40 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	343342

Cryo-EM Structure of the Exocyst Complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Exocyst complex component SEC3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Exocyst complex component SEC5

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Exocyst complex component SEC6

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Exocyst complex component SEC8

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Exocyst complex component SEC10

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Exocyst complex component SEC15

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Exocyst complex component EXO70

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Exocyst complex component EXO84

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

5yfp__assembly_1__model_1

5yfp__assembly_1__model_1 | I(q)

5yfp__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (8)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer