SAXSdb — 6a94

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

5-hydroxytryptamine receptor 2A,Soluble cytochrome b562

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	单体	蛋白 1	2-(3-chloranylbenzo[b][1]benzothiepin-5-yl)oxy-N,N-dimethyl-ethanamine × 1 CHOLESTEROL × 1 PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 ZINC ION × 1	与蛋白数一致
2	信息不足	单体	蛋白 1	2-(3-chloranylbenzo[b][1]benzothiepin-5-yl)oxy-N,N-dimethyl-ethanamine × 1 CHOLESTEROL × 1 PALMITIC ACID × 1 2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	C562_ECOLX
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 200–239； UniProt 23–62 作者链 A； PDB构建体 245–285； UniProt 88–128 作者链 B； PDB构建体 200–239； UniProt 23–62 作者链 B； PDB构建体 245–285； UniProt 88–128

5-hydroxytryptamine receptor 2A,Soluble cytochrome b562

Homo sapiens

UniProt P28223

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	单体	蛋白 1	2-(3-chloranylbenzo[b][1]benzothiepin-5-yl)oxy-N,N-dimethyl-ethanamine × 1 CHOLESTEROL × 1 PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 ZINC ION × 1	与蛋白数一致
2	信息不足	单体	蛋白 1	2-(3-chloranylbenzo[b][1]benzothiepin-5-yl)oxy-N,N-dimethyl-ethanamine × 1 CHOLESTEROL × 1 PALMITIC ACID × 1 2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	5HT2A_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 4–199； UniProt 70–265 作者链 A； PDB构建体 286–376； UniProt 313–403 作者链 B； PDB构建体 4–199； UniProt 70–265 作者链 B； PDB构建体 286–376； UniProt 313–403

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6a94
沉积日期 deposition_date	2018-07-11
结构标题 title	Crystal structure of 5-HT2AR in complex with zotepine
关键词 keywords	receptor, MEMBRANE PROTEIN; MEMBRANE PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6a94__assembly_2__model_1

Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6a94__assembly_2__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

6a94__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	28.42 Å
Rg（电子密度）	27.97 Å
总 Rg	28.47 Å
原子数	2898
残基数	359
排除体积	53428 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`6a94__assembly_1__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`6a94__assembly_2__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	5-hydroxytryptamine receptor 2A,Soluble cytochrome b562
分子量 formula_weight	41931.1 kDa
突变 mutation	S162K, M164W,R120I, H124I, R128G, M29W
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	5870

GGTHLQEKNWSALLTAVVIILTIAGNILVIMAVSLEKKLQNATNYFLMSLAIADMLLGFLVMPVSMLTILYGYRWPLPSKLCAVWIYLDVLFSTAKIWHLCAISLDRYVAIQNPIHHSRFNSRTKAFLKIIAVWTISVGISMPIPVFGLQDDSKVFKEGSCLLADDNFVLIGSFVSFFIPLTIMVITYFLTIKSLQKEAADLEDNWETLNDNLKVIEKADNAAQVKDALTKMRAAALDAGSGSGDILVGQIDDALKLANEGKVKEAQAAAEQLKTTINAYIQKYGQSISNEQKACKVLGIVFFLFVVMWCPFFITNIMAVICKESCNEDVIGALLNVFVWIGYLSSAVNPLVYTLFNKTYRSAFSRYIQCQYKENK

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	2-(3-chloranylbenzo[b][1]benzothiepin-5-yl)oxy-N,N-dimethyl-ethanamine
分子量 formula_weight	331.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	CHOLESTEROL
分子量 formula_weight	386.7 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	PENTAETHYLENE GLYCOL
分子量 formula_weight	238.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	PALMITIC ACID
分子量 formula_weight	256.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 7 Entity 7 non-polymer

描述 description	2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate
分子量 formula_weight	356.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id	6a94A01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	120 — Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Cytochrome c/b562

结构域编号 domain_id	6a94B01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	120 — Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Cytochrome c/b562

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晶胞边长 a length_a	279.180 Å
晶胞边长 b length_b	42.220 Å
晶胞边长 c length_c	91.710 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	92.16 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	C 1 2 1
空间群编号 int_tables_number	5
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.900 Å
最低分辨率 resolution_low	45.822 Å
R 因子 r_factor	0.2378
R_work r_work	0.2360
R_free r_free	0.2690

Crystal structure of 5-HT2AR in complex with zotepine

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

5-hydroxytryptamine receptor 2A,Soluble cytochrome b562

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

5-hydroxytryptamine receptor 2A,Soluble cytochrome b562

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6a94__assembly_2__model_1

6a94__assembly_2__model_1 | I(q)

6a94__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

7. 引用文献 (1)

Crystal structure of 5-HT2AR in complex with zotepine

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

5-hydroxytryptamine receptor 2A,Soluble cytochrome b562

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

5-hydroxytryptamine receptor 2A,Soluble cytochrome b562

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6a94__assembly_2__model_1

6a94__assembly_2__model_1 | I(q)

6a94__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

7. 引用文献 (1)