SAXSdb — 6ajh

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Drug exporters of the RND superfamily-like protein,Endolysin

Enterobacteria phage T4

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	单体	蛋白 1	1-(2-adamantyl)-3-[2,3,4-tris(fluoranyl)phenyl]urea × 1 alpha-D-glucopyranosyl 6-O-dodecyl-alpha-D-glucopyranoside × 5 (CARBAMOYLMETHYL-CARBOXYMETHYL-AMINO)-ACETIC ACID × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	D9IEF7_BPT4
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 764–923； UniProt 2–161

Drug exporters of the RND superfamily-like protein,Endolysin

Enterobacteria phage T4

UniProt I7G2R2

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	单体	蛋白 1	1-(2-adamantyl)-3-[2,3,4-tris(fluoranyl)phenyl]urea × 1 alpha-D-glucopyranosyl 6-O-dodecyl-alpha-D-glucopyranoside × 5 (CARBAMOYLMETHYL-CARBOXYMETHYL-AMINO)-ACETIC ACID × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	I7G2R2_MYCS2
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 14–761； UniProt 1–748

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6ajh
沉积日期 deposition_date	2018-08-27
结构标题 title	Crystal structure of mycolic acid transporter MmpL3 from Mycobacterium smegmatis complexed with AU1235
关键词 keywords	membrane protein, transporter, RND family, cell wall biosynthesis, drug target, HYDROLASE; MEMBRANE PROTEIN, HYDROLASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6ajh__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6ajh__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

6ajh__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	38.53 Å
Rg（电子密度）	37.95 Å
总 Rg	37.88 Å
原子数	7189
残基数	900
排除体积	130170 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`6ajh__assembly_1__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Drug exporters of the RND superfamily-like protein,Endolysin
分子量 formula_weight	104007.6 kDa
EC 编号 ec_number	3.2.1.17
突变 mutation	C54T, C97A
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	7189

MPEVVGSYFQSNAMFAWWGRTVYQFRYIVIGVMVALCLGGGVYGISLGNHVTQSGFYDEGSQSVAASLIGDEVYGRDRTSHVVAILTPPDDKKVTDKAWQKKVTEELDQVVKDHEDQIVGWVGWLKAPDTTDPTVSAMKTQDLRHTFISIPLQGDDDDEILKNYQVVEPELQQVNGGDIRLAGLNPLASELTGTIGEDQKRAEVAAIPLVAVVLFFVFGTVIAAALPAIIGGLAIAGALGIMRLVAEFTPVHFFAQPVVTLIGLGIAIDYGLFIVSRFREEIAEGYDTEAAVRRTVMTSGRTVVFSAVIIVASSVPLLLFPQGFLKSITYAIIASVMLAAILSITVLAAALAILGPRVDALGVTTLLKIPFLANWQFSRRIIDWFAEKTQKTKTREEVERGFWGRLVNVVMKRPIAFAAPILVVMVLLIIPLGQLSLGGISEKYLPPDNAVRQSQEQFDKLFPGFRTEPLTLVMKREDGEPITDAQIADMRAKALTVSGFTDPDNDPEKMWKERPANDSGSKDPSVRVIQNGLENRNDAAKKIDELRALQPPHGIEVFVGGTPALEQDSIHSLFDKLPLMALILIVTTTVLMFLAFGSVVLPIKAALMSALTLGSTMGILTWMFVDGHGSGLMNYTPQPLMAPMIGLIIAVIWGLSTDYEVFLVSRMVEARERGMSTAEAIRIGTATTGRLITGAALILAVVAGAFVFSDLVMMKYLAFGLLIALLLDATIIRMFLVPAVMKLLGDDCWWAPRWMKRVQEKEFNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYEFHLGGIKAFHHHHHHHHHH

来源 Source

来源生物 organism	Enterobacteria phage T4
通用名 common_name	Bacteriophage T4
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10665
宿主生物 host_organism	Mycobacterium smegmatis str. MC2 155

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	1-(2-adamantyl)-3-[2,3,4-tris(fluoranyl)phenyl]urea
分子量 formula_weight	324.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	alpha-D-glucopyranosyl 6-O-dodecyl-alpha-D-glucopyranoside
分子量 formula_weight	510.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	5

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	(CARBAMOYLMETHYL-CARBOXYMETHYL-AMINO)-ACETIC ACID
分子量 formula_weight	190.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

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晶胞边长 a length_a	86.967 Å
晶胞边长 b length_b	141.167 Å
晶胞边长 c length_c	144.214 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	P 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	19
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.818 Å
最低分辨率 resolution_low	43.484 Å
R 因子 r_factor	0.2205
R_work r_work	0.2192
R_free r_free	0.2471

Crystal structure of mycolic acid transporter MmpL3 from Mycobacterium smegmatis complexed with AU1235

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Drug exporters of the RND superfamily-like protein,Endolysin

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Drug exporters of the RND superfamily-like protein,Endolysin

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6ajh__assembly_1__model_1

6ajh__assembly_1__model_1 | I(q)

6ajh__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

7. 引用文献 (1)

Crystal structure of mycolic acid transporter MmpL3 from Mycobacterium smegmatis complexed with AU1235

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Drug exporters of the RND superfamily-like protein,Endolysin

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Drug exporters of the RND superfamily-like protein,Endolysin

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6ajh__assembly_1__model_1

6ajh__assembly_1__model_1 | I(q)

6ajh__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

7. 引用文献 (1)