6d6v

CryoEM structure of Tetrahymena telomerase with telomeric DNA at 4.8 Angstrom resolution

Method: ELECTRON MICROSCOPY

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Telomerase-associated protein 82

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 6 DNA 1 RNA 1	Telomerase reverse transcriptase × 1 （O77448） Telomerase holoenzyme TEB heterotrimer Teb3 subunit × 1 （A0A0U8UFF4） Telomerase holoenzyme Teb2 subunit × 1 （A0A0U8TRG9） RNA (159-MER) × 1 Telomerase-associated protein 50 × 1 Telomerase La-related protein p65 × 1 （W7X6T2） ;DNA (5'-D(PGPTPTPGPGPGPGPTPTPGPGPGPGPTPTPGPGPGP*G)-3') ; × 1 ZINC ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	D2CVN6_TETTH
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–701； UniProt 1–701

Telomerase reverse transcriptase

物种未注明

UniProt O77448

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 6 DNA 1 RNA 1	Telomerase-associated protein 82 × 1 （D2CVN6） Telomerase holoenzyme TEB heterotrimer Teb3 subunit × 1 （A0A0U8UFF4） Telomerase holoenzyme Teb2 subunit × 1 （A0A0U8TRG9） RNA (159-MER) × 1 Telomerase-associated protein 50 × 1 Telomerase La-related protein p65 × 1 （W7X6T2） ;DNA (5'-D(PGPTPTPGPGPGPGPTPTPGPGPGPGPTPTPGPGPGP*G)-3') ; × 1 ZINC ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TERT_TETTH
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–1117； UniProt 1–1117

Telomerase holoenzyme TEB heterotrimer Teb3 subunit

物种未注明

UniProt A0A0U8UFF4

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 6 DNA 1 RNA 1	Telomerase-associated protein 82 × 1 （D2CVN6） Telomerase reverse transcriptase × 1 （O77448） Telomerase holoenzyme Teb2 subunit × 1 （A0A0U8TRG9） RNA (159-MER) × 1 Telomerase-associated protein 50 × 1 Telomerase La-related protein p65 × 1 （W7X6T2） ;DNA (5'-D(PGPTPTPGPGPGPGPTPTPGPGPGPGPTPTPGPGPGP*G)-3') ; × 1 ZINC ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A0U8UFF4_TETTH
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 F； PDB构建体 1–121； UniProt 1–121

Telomerase holoenzyme Teb2 subunit

物种未注明

UniProt A0A0U8TRG9

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 6 DNA 1 RNA 1	Telomerase-associated protein 82 × 1 （D2CVN6） Telomerase reverse transcriptase × 1 （O77448） Telomerase holoenzyme TEB heterotrimer Teb3 subunit × 1 （A0A0U8UFF4） RNA (159-MER) × 1 Telomerase-associated protein 50 × 1 Telomerase La-related protein p65 × 1 （W7X6T2） ;DNA (5'-D(PGPTPTPGPGPGPGPTPTPGPGPGPGPTPTPGPGPGP*G)-3') ; × 1 ZINC ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A0U8TRG9_TETTH
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–269； UniProt 1–269

Telomerase La-related protein p65

物种未注明

UniProt W7X6T2

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 6 DNA 1 RNA 1	Telomerase-associated protein 82 × 1 （D2CVN6） Telomerase reverse transcriptase × 1 （O77448） Telomerase holoenzyme TEB heterotrimer Teb3 subunit × 1 （A0A0U8UFF4） Telomerase holoenzyme Teb2 subunit × 1 （A0A0U8TRG9） RNA (159-MER) × 1 Telomerase-associated protein 50 × 1 ;DNA (5'-D(PGPTPTPGPGPGPGPTPTPGPGPGPGPTPTPGPGPGP*G)-3') ; × 1 ZINC ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	LARP7_TETTS
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 H； PDB构建体 1–542； UniProt 1–542

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6d6v
沉积日期 deposition_date	2018-04-22
结构标题 title	CryoEM structure of Tetrahymena telomerase with telomeric DNA at 4.8 Angstrom resolution
关键词 keywords	Telomerase, telomere, REPLICATION; REPLICATION
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6d6v__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6d6v__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

6d6v__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	46.21 Å
Rg（电子密度）	45.31 Å
总 Rg	45.59 Å
原子数	17249
残基数	1868
排除体积	294920 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`6d6v__assembly_1__model_1`	octameric （8）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (9)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Telomerase-associated protein 82
分子量 formula_weight	82040.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D
原子数 atom_count	17249

MKLTKGGSYILKKVDRKQFYQDEEIVMQIKKILGQKTTDCKQYIKCECIDGLGDEALIYFEMLANQNQHLQKNDVIMIQDYLNDKTQNDKIVVLVTRFQFCKASHVQPKTAQKESIQLLNTEKTIIQKSKITKNPAEEVLKFIEVNEKDNSSNSEDMIIEQQKQEIKNNQKEKQSINGFNLEDSYSNISDITNFGGKSNFNIGSLSDQLSKQTLLISQLQVGKNRFSFKFEGRVVYKSSTFQNQQDSKYFFITAQDANNQEINLSFWQKVDQSYQTLKVGQYYYFIGGEVKQFKNNLELKFKFGDYQIIPKETLSANYVQPLALQPSKQFGNDSIGDSDYSIHNLIEKEESIAQKGYNGQKNNKYRQNNNNSKHTLLISEVLKTSKQYLSVLAQVVDIQSSDKNIRLKICDNSCNQELKVVIFPDLCYEWRDKFSINKWYYFNEFVRQIYNDEVQLKNNIHSSIKESDDQRKVITYNQEQGVFKKSISINSNDSFEIKPKISYKNNSNQEQRIYSSIEEIIQQAQASEIGQKKEFYVYGNLVSIQMKNKLYYYRCTCQGKSVLKYHGDSFFCESCQQFINPQVHLMLRAFVQDSTGTIPVMIFDQQSSQLINQIDPSIHVQEAGQYVKNCIENGQEEIIRQLFSKLDFARFIFEIQFENKEFNNEQEIAYKVLKIEKENIKEESKYLLKKLEHLINNNQNN

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Telomerase reverse transcriptase
分子量 formula_weight	133486.9 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.7.49
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A

MQKINNINNNKQMLTRKEDLLTVLKQISALKYVSNLYEFLLATEKIVQTSELDTQFQEFLTTTIIASEQNLVENYKQKYNQPNFSQLTIKQVIDDSIILLGNKQNYVQQIGTTTIGFYVEYENINLSRQTLYSSNFRNLLNIFGEEDFKYFLIDFLVFTKVEQNGYLQVAGVCLNQYFSVQVKQKKWYKNNFNMNGKATSNNNQNNANLSNEKKQENQYIYPEIQRSQIFYCNHMGREPGVFKSSFFNYSEIKKGFQFKVIQEKLQGRQFINSDKIKPDHPQTIIKKTLLKEYQSKNFSCQEERDLFLEFTEKIVQNFHNINFNYLLKKFCKLPENYQSLKSQVKQIVQSENKANQQSCENLFNSLYDTEISYKQITNFLRQIIQNCVPNQLLGKKNFKVFLEKLYEFVQMKRFENQKVLDYICFMDVFDVEWFVDLKNQKFTQKRKYISDKRKILGDLIVFIINKIVIPVLRYNFYITEKHKEGSQIFYYRKPIWKLVSKLTIVKLEEENLEKVEEKLIPEDSFQKYPQGKLRIIPKKGSFRPIMTFLRKDKQKNIKLNLNQILMDSQLVFRNLKDMLGQKIGYSVFDNKQISEKFAQFIEKWKNKGRPQLYYVTLDIKKCYDSIDQMKLLNFFNQSDLIQDTYFINKYLLFQRNKRPLLQIQQTNNLNSAMEIEEEKINKKPFKMDNINFPYYFNLKERQIAYSLYDDDDQILQKGFKEIQSDDRPFIVINQDKPRCITKDIIHNHLKHISQYNVISFNKVKFRQKRGIPQGLNISGVLCSFYFGKLEEEYTQFLKNAEQVNGSINLLMRLTDDYLFISDSQQNALNLIVQLQNCANNNGFMFNDQKITTNFQFPQEDYNLEHFKISVQNECQWIGKSIDMNTLEIKSIQKQTQQEINQTINVAISIKNLKSQLKNKLRSLFLNQLIDYFNPNINSFEGLCRQLYHHSKATVMKFYPFMTKLFQIDLKKSKQYSVQYGKENTNENFLKDILYYTVEDVCKILCYLQFEDEINSNIKEIFKNLYSWIMWDIIVSYLKKKKQFKGYLNKLLQKIRKSRFFYLKEGCKSLQLILSQQKYQLNKKELEAIEFIDLNNLIQDIKTLIPKISAKSNQQNTN

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Telomerase holoenzyme TEB heterotrimer Teb3 subunit
分子量 formula_weight	14007.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F

MDAEQEQVMYPRILFEQMAQFRGKKVTVVGNVCNEDQNDSLVIEFGPTGLNQHVVIDNYRRVDLNNTTKFVEIRGVVLNQNIVSCEELTEFEQKDPFDFDTYSKLIHLSQSDKLSSLFTDQ

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Telomerase holoenzyme Teb2 subunit
分子量 formula_weight	30993.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E

MSNRVQGGFDNNSGNNQSAQKQQAEKIPQITVPLNCFMINQIVKAAKENPQAHSGNHYEWYGAFENAIITAKFEFLQSINDSPKIMGKLSDSTGCIEVVIQKSKMSDELPEFVQAYEIELQNNGNRHKYVRAMLKMRKNAQIQLLYFSIVNDANEISRHGLDLCLRYLQRKHGIEDFMHMTNDKAHNNHNASAQKVHYQIDRNQQPKEQVLELMRQILKHNPNDQIPKSKIIEFFQSQLNQVQINQILQQLVSANEIFSVGSDNYLLNV

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	RNA (159-MER)
分子量 formula_weight	50747.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polyribonucleotide
链编号 strand_id	B

AUACCCGCUUAAUUCAUUCAGAUCUGUAAUAGAACUGUCAUUCAACCCCAAAAAUCUAGUGCUGAUAUAACCUUCACCAAUUAGGUUCAAAUAAGUGGUAAUGCGGGACAAAAGACUAUCGACAUUUGAUACACUAUUUAUCAAUGGAUGUCUUAUUUU

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	Telomerase-associated protein 50
分子量 formula_weight	13379.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G

XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	Telomerase La-related protein p65
分子量 formula_weight	64207.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H

MDEYLENTNLEELEQECFMEDYQHEDVVEQENHQVDANDIYENQQMNDESQLNQDVKISQQKEQAVEMIEEQQQNNQDKFKQFQDCMAHITELNFKRNYQNLTEQSSSNNVVAEELDIKESLKLQMEYYFCDTNLTHDSYLRGIISKSPKNCVDIKVFLKFNKIQQILKQIQDKQIVSTYGIENQSQKKNHKNYKNQNATFSKKDLIHLIRDSLKESKILKVKMDSLKVKRRFPFNLEQALKNSKQRTLYIDFLPPKCSKQTLVSIFGNFRIININLPLQKNSQLCQGFAFIEFFSEEEANQALITKNSSIPKELILLTEKKIGQGSIRIITYKKWQEEKQSFKELSKNQNEQKNKNMNQSRKASDEFVSIDVEIKQNCLIKIINIPQGTLKAEVVLAVRHLGYEFYCDYIDENSNQINSNKISLSTQQQNTAQCSNIQIENNLIQQDQHPQLNDLLKEGQAMIRFQNSDEQRLAIQKLLNHNNNKLQIEIRGQICDVISTIPEDEEKNYWNYIKFKKNEFRKFFFMKKQQKKQNITQNYNK

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	;DNA (5'-D(PGPTPTPGPGPGPGPTPTPGPGPGPGPTPTPGPGPGP*G)-3') ;
分子量 formula_weight	6059.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide
链编号 strand_id	C

GTTGGGGTTGGGGTTGGGG

实体 9 Entity 9 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

▶

晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	1

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	4.800 Å
最低分辨率 resolution_low	— Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	—
R_free r_free	—

分辨率 resolution	4.80 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	52506

CryoEM structure of Tetrahymena telomerase with telomeric DNA at 4.8 Angstrom resolution

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Telomerase-associated protein 82

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Telomerase reverse transcriptase

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Telomerase holoenzyme TEB heterotrimer Teb3 subunit

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Telomerase holoenzyme Teb2 subunit

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Telomerase La-related protein p65

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6d6v__assembly_1__model_1

6d6v__assembly_1__model_1 | I(q)

6d6v__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (9)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

实体 6 Entity 6 polymer

聚合物 Polymer

实体 7 Entity 7 polymer

聚合物 Polymer

实体 8 Entity 8 polymer

聚合物 Polymer

实体 9 Entity 9 non-polymer

7. 引用文献 (1)