SAXSdb — 6dmx

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

BZIP factor

Human T-lymphotropic virus 1

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5）与蛋白拷贝数一致	链 E； UniProt 3–56	片段：residues 3-56 突变：C9A, C14A	Transcriptional activator Myb × 2 （P06876） CREB-binding protein × 2 （P45481）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG 3350, ammonium iodide	分辨率 2.80 Å R-free 0.301
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5）与蛋白拷贝数一致	链 J； UniProt 3–56	片段：residues 3-56 突变：C9A, C14A	Transcriptional activator Myb × 2 （P06876） CREB-binding protein × 2 （P45481）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG 3350, ammonium iodide	分辨率 2.80 Å R-free 0.301

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 6DMX	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
6DNQ HBZ77 in complex with KIX and c-Myb 提交 2018-06-07	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 E 3–77（75 aa）片段：residues 3-77	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG 3350, calcium chloride	分辨率 2.35 Å R-free 0.229

共 1 个其他 PDB 条目、1 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q2Q067_9DELA
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 5–58； UniProt 3–56 作者链 J； PDB构建体 5–58； UniProt 3–56

Transcriptional activator Myb

Mus musculus

UniProt P06876

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 284–315 链 C； UniProt 284–315	片段：residues 284-315	BZIP factor × 1 （Q2Q067） CREB-binding protein × 2 （P45481）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG 3350, ammonium iodide	分辨率 2.80 Å R-free 0.301
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5）与蛋白拷贝数一致	链 F； UniProt 284–315 链 H； UniProt 284–315	片段：residues 284-315	BZIP factor × 1 （Q2Q067） CREB-binding protein × 2 （P45481）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG 3350, ammonium iodide	分辨率 2.80 Å R-free 0.301

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 6DMX	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1GUU CRYSTAL STRUCTURE OF C-MYB R1 提交 2002-01-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 38–89（52 aa）片段：R1, RESIDUES 38-89	未记录	NA SODIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.8；1.6-1.7 M SODIUM CITRATE PH 6.8, PROTEIN CONCENTRATION 15 MG/ML, CRYSTAL WAS TRANSFORMED TO LOW HUMIDITY FORM AND FLASH COOLED, 1-2% V/V OF GLYCEROL WAS ADDED TO PREVENT THE CRYSTAL CRACKING DURING THE FLASH COOLING	分辨率 1.60 Å R-free 0.223
1GV2 CRYSTAL STRUCTURE OF C-MYB R2R3 提交 2002-02-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 89–193（105 aa）片段：R2R3, RESIDUES 89-193	未记录	NA SODIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.8；1.6-1.7 M SODIUM CITRATE PH 6.8, PROTEIN CONCENTRATION 15 MG/ML, CRYSTAL WAS GROWN BY REPEATED MACROSEEDING, TRANSFORMED TO LOW HUMIDITY FORM AND FLASH COOLED, 1-2% V/V OF GLYCEROL WAS ADDED TO SODIUM CITRATE TO PREVENT THE CRYSTAL CRACKING DURING THE FLASH COOLING	分辨率 1.68 Å R-free 0.210
1GV5 CRYSTAL STRUCTURE OF C-MYB R2 提交 2002-02-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 90–141（52 aa）片段：R2, RESIDUES 90-141	未记录	NA SODIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.8；297 K；1.65 M SODIUM CITRATE PH 6.8, PROTEIN CONCENTRATION 10 MG/ML PLUS 10 MM DTT, TEMPERATURE 297 K	分辨率 1.58 Å R-free 0.190
1GVD CRYSTAL STRUCTURE OF C-MYB R2 V103L MUTANT 提交 2002-02-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 90–141（52 aa）片段：R2, RESIDUES 90-141	突变：YES	NH4 AMMONIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.8；297 K；3.15 M AMMONIUM SULFATE IN 0.05 M MES BUFFER AT PH 6.8, PROTEIN CONCENTRATION 10 MG/ML PLUS 10 MM DTT, TEMPERATURE 297 K	分辨率 1.45 Å R-free 0.195
1H88 CRYSTAL STRUCTURE OF TERNARY PROTEIN-DNA COMPLEX1 提交 2001-01-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：pentameric	链 C 35–193（159 aa）片段：RESIDUES 35-193	突变：YES	NH4 AMMONIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；297 K；0.05 M AMMONIUM ACETATE, 0.01 M MAGNESIUM CHLORIDE, 10% V/V MPD, 6% V/V GLYCEROL, 0.05 M TRIS HCL BUFFER PH 7.5 AT 24 DEGREES C	分辨率 2.80 Å R-free 0.277
1IDY STRUCTURE OF MYB TRANSFORMING PROTEIN, NMR, MINIMIZED AVERAGE STRUCTURE 提交 1996-08-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 141–193（53 aa）	突变：P140M, I155L	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5；283 K	分辨率未提供
1IDZ STRUCTURE OF MYB TRANSFORMING PROTEIN, NMR, 20 STRUCTURES 提交 1996-08-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 141–193（53 aa）	突变：P140M, I155L	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5；283 K	分辨率未提供
1MBE MOUSE C-MYB DNA-BINDING DOMAIN REPEAT 1 提交 1995-05-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 38–89（52 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.8；290 K NMR测量条件 pH 6.8；300 K	分辨率未提供
1MBF MOUSE C-MYB DNA-BINDING DOMAIN REPEAT 1 提交 1995-05-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 38–89（52 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.8；290 K NMR测量条件 pH 6.8；300 K	分辨率未提供
1MBG MOUSE C-MYB DNA-BINDING DOMAIN REPEAT 2 提交 1995-05-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 90–141（52 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.8；290 K	分辨率未提供
1MBH MOUSE C-MYB DNA-BINDING DOMAIN REPEAT 2 提交 1995-05-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 90–141（52 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.8；290 K	分辨率未提供
1MBJ MOUSE C-MYB DNA-BINDING DOMAIN REPEAT 3 提交 1995-05-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 142–193（52 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.8；290 K NMR测量条件 pH 6.8；300 K	分辨率未提供
1MBK MOUSE C-MYB DNA-BINDING DOMAIN REPEAT 3 提交 1995-05-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 142–193（52 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.8；290 K NMR测量条件 pH 6.8；300 K	分辨率未提供
1MSE SOLUTION STRUCTURE OF A SPECIFIC DNA COMPLEX OF THE MYB DNA-BINDING DOMAIN WITH COOPERATIVE RECOGNITION HELICES 提交 1995-01-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric	链 C 90–193（104 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.8；310 K	分辨率未提供
1MSF SOLUTION STRUCTURE OF A SPECIFIC DNA COMPLEX OF THE MYB DNA-BINDING DOMAIN WITH COOPERATIVE RECOGNITION HELICES 提交 1995-01-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric	链 C 90–193（104 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件	分辨率未提供
1SB0 Solution structure of the KIX domain of CBP bound to the transactivation domain of c-Myb 提交 2004-02-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 291–315（25 aa）片段：transcriptional activation domain	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5.5；27 K；离子强度（mmCIF原始值）50 mM；压力 ambient NMR样品组成 20 mM Tris d11 acetate d4; 50 mM NaCl; 2 mM NaN3; pH 5.5 \| 90% H20; 10% D2O	分辨率未提供
2AGH Structural basis for cooperative transcription factor binding to the CBP coactivator 提交 2005-07-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 291–315（25 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5.5；298 K；压力 1 NMR样品组成 0.5-0.8 mM 15N,13C-labeled protein (e.g. CBP) + 3 fold excess of unlabeled binding partners (MYB + MLL), 20 mM Tris-d3-acetate, 50 mM NaCl, 0.2% sodium azide, 10% D2O \| 20 mM Tris-d3-acetate, 50 mM NaCl, 0.2% sodium azide, 10% D2O NMR样品组成 13C,15N-MYB + UNLABELED CBP & MYB, 20 mM Tris-d3-acetate, 50 mM NaCl, 0.2% sodium azide, 10% D2O \| 20 mM Tris-d3-acetate, 50 mM NaCl, 0.2% sodium azide, 10% D2O NMR样品组成 13C,15N-MLL + UNLABELED CBP & MLL, 20 mM Tris-d3-acetate, 50 mM NaCl, 0.2% sodium azide, 10% D2O \| 20 mM Tris-d3-acetate, 50 mM NaCl, 0.2% sodium azide, 10% D2O	分辨率未提供
6DNQ HBZ77 in complex with KIX and c-Myb 提交 2018-06-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 284–315（32 aa）片段：residues 284-315 链 C 284–315（32 aa）片段：residues 284-315	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG 3350, calcium chloride	分辨率 2.35 Å R-free 0.229

共 18 个其他 PDB 条目、18 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	MYB_MOUSE
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–32； UniProt 284–315 作者链 C； PDB构建体 1–32； UniProt 284–315 作者链 F； PDB构建体 1–32； UniProt 284–315 作者链 H； PDB构建体 1–32； UniProt 284–315

CREB-binding protein

Mus musculus

UniProt P45481

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 586–672 链 D； UniProt 586–672	片段：residues 284-315	BZIP factor × 1 （Q2Q067） Transcriptional activator Myb × 2 （P06876）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG 3350, ammonium iodide	分辨率 2.80 Å R-free 0.301
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5）与蛋白拷贝数一致	链 G； UniProt 586–672 链 I； UniProt 586–672	片段：residues 284-315	BZIP factor × 1 （Q2Q067） Transcriptional activator Myb × 2 （P06876）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG 3350, ammonium iodide	分辨率 2.80 Å R-free 0.301

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 6DMX	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1F81 SOLUTION STRUCTURE OF THE TAZ2 DOMAIN OF THE TRANSCRIPTIONAL ADAPTOR PROTEIN CBP 提交 2000-06-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1764–1850（87 aa）片段：TAZ2 DOMAIN (1764-1850)	未记录	ZN ZINC ION × 3	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5.9；298 K；离子强度（mmCIF原始值）25 mM；压力 1 NMR样品组成 1.5 mM Taz2 \| 25 mM deuterated acetate 0.1 mM ZnCl2 0.1 mM DTT pH 5.9	分辨率未提供
1JJS NMR Structure of IBiD, A Domain of CBP/p300 提交 2001-07-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2067–2112（46 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.5；298 K	分辨率未提供
1KBH Mutual Synergistic Folding in the Interaction Between Nuclear Receptor Coactivators CBP and ACTR 提交 2001-11-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 2059–2117（59 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.6；31 K；离子强度（mmCIF原始值）60 mM；压力 ambient NMR测量条件 pH 6.6；31 K；离子强度（mmCIF原始值）60 mM；压力 ambient NMR测量条件 pH 6.6；31 K；离子强度（mmCIF原始值）60 mM；压力 ambient NMR测量条件 pH 6.6；31 K；离子强度（mmCIF原始值）60 mM；压力 ambient NMR测量条件 pH 6.6；31 K；离子强度（mmCIF原始值）60 mM；压力 ambient NMR测量条件 pH 6.6；31 K；离子强度（mmCIF原始值）60 mM；压力 ambient NMR样品组成 3mM U-15N,13C-CBP:2059-2117 6mM 14N,12C-ACTR:1018-1088 \| 10 mM Tris, 50 mM NaCl 95%H2O,5%D2O NMR样品组成 3mM U-15N,12C-CBP:2059-2117 6mM 14N,12C-ACTR:1018-1088 \| 10 mM Tris, 50 mM NaCl 95%H2O,5%D2O NMR样品组成 3mM U-15N,13C-CBP:2059-2117 6mM 14N,12C-ACTR:1018-1088 \| 10 mM Tris, 50 mM NaCl 100%D2O NMR样品组成 2mM U-15N,13C-ACTR:1018-1088 4mM 14N,12C-CBP:2059-2117 \| 10 mM Tris, 50 mM NaCl 95%H2O,5%D2O NMR样品组成 2mM U-15N,12C-ACTR:1018-1088 4mM 14N,12C-CBP:2059-2117 \| 10 mM Tris, 50 mM NaCl 95%H2O,5%D2O NMR样品组成 2mM U-15N,13C-ACTR:1018-1088 4mM 14N,12C-CBP:2059-2117 \| 10 mM Tris, 50 mM NaCl 100%D2O	分辨率未提供
1KDX KIX DOMAIN OF MOUSE CBP (CREB BINDING PROTEIN) IN COMPLEX WITH PHOSPHORYLATED KINASE INDUCIBLE DOMAIN (PKID) OF RAT CREB (CYCLIC AMP RESPONSE ELEMENT BINDING PROTEIN), NMR 17 STRUCTURES 提交 1997-09-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 586–666（81 aa）片段：KIX, RESIDUES 586-666	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5.5；315 K；离子强度（mmCIF原始值）0.07；压力 1 NMR样品组成 H2O OR D2O	分辨率未提供
1L8C STRUCTURAL BASIS FOR HIF-1ALPHA/CBP RECOGNITION IN THE CELLULAR HYPOXIC RESPONSE 提交 2002-03-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 345–439（95 aa）片段：TAZ1 (Transcription activation zinc finger) domain, Residues 345-439	未记录	ZN ZINC ION × 3	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.1；298 K；离子强度（mmCIF原始值）2.0 Millimolar；压力 Ambient NMR样品组成 1MM 13C, 15N-TAZ1, 2MM HIF-1a NMR样品组成 1MM 13C, 15N-HIF-1a, 2MM TAZ1 NMR样品组成 10MM D-TRIS, 10MM D-DTT, 0.02% NAN3, 0.5MM ZnSO4	分辨率未提供
1SB0 Solution structure of the KIX domain of CBP bound to the transactivation domain of c-Myb 提交 2004-02-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 580–666（87 aa）片段：KIX domain	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5.5；27 K；离子强度（mmCIF原始值）50 mM；压力 ambient NMR样品组成 20 mM Tris d11 acetate d4; 50 mM NaCl; 2 mM NaN3; pH 5.5 \| 90% H20; 10% D2O	分辨率未提供
1TOT ZZ Domain of CBP- a Novel Fold for a Protein Interaction Module 提交 2004-06-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1700–1751（52 aa）片段：ZZ domain of murine CBP (residues 1700-1751)	未记录	ZN ZINC ION × 2	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.8；298 K；离子强度（mmCIF原始值）10 mM；压力 ambient NMR样品组成 2.3 mM solutions in degassed 10 mM Tris-d11 pH 6.8, 200 M ZnCl2, 10 mM DTT-d10, 0.05% w/v sodium azide, 94 % H2O, 6 % D2O \| 94 % H2O, 6 % D2O	分辨率未提供
1U2N Structure CBP TAZ1 Domain 提交 2004-07-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 340–439（100 aa）片段：CBP TAZ1 Domain	未记录	ZN ZINC ION × 3	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.9；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50mM；压力 ambient NMR样品组成 1mM N15 TAZ1; 10mM Tris-d11 pH 6.9; 50mM NaCl; 2mM DTT \| 90% H2O, 10% 2H2O NMR样品组成 1mM C13,N15 TAZ1; 10mM Tris-d11 pH 6.9; 50mM NaCl; 2mM DTT \| 100% 2H2O NMR样品组成 1mM C13,N15 TAZ1; 10mM Tris-d11 pH 6.9; 50mM NaCl; 2mM DTT \| 90% H2O, 10% 2H2O	分辨率未提供
2AGH Structural basis for cooperative transcription factor binding to the CBP coactivator 提交 2005-07-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 586–672（87 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5.5；298 K；压力 1 NMR样品组成 0.5-0.8 mM 15N,13C-labeled protein (e.g. CBP) + 3 fold excess of unlabeled binding partners (MYB + MLL), 20 mM Tris-d3-acetate, 50 mM NaCl, 0.2% sodium azide, 10% D2O \| 20 mM Tris-d3-acetate, 50 mM NaCl, 0.2% sodium azide, 10% D2O NMR样品组成 13C,15N-MYB + UNLABELED CBP & MYB, 20 mM Tris-d3-acetate, 50 mM NaCl, 0.2% sodium azide, 10% D2O \| 20 mM Tris-d3-acetate, 50 mM NaCl, 0.2% sodium azide, 10% D2O NMR样品组成 13C,15N-MLL + UNLABELED CBP & MLL, 20 mM Tris-d3-acetate, 50 mM NaCl, 0.2% sodium azide, 10% D2O \| 20 mM Tris-d3-acetate, 50 mM NaCl, 0.2% sodium azide, 10% D2O	分辨率未提供
2C52 Structural diversity in CBP p160 complexes 提交 2005-10-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2059–2117（59 aa）片段：SID, RESIDUES 2059-2117	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）100 NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）100 NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）100 NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）100 NMR样品组成 90% WATER/10% D2O NMR样品组成 90% WATER/10% D2O NMR样品组成 100% D2O NMR样品组成 100% D2O	分辨率未提供
2KA6 NMR structure of the CBP-TAZ2/STAT1-TAD complex 提交 2008-10-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1764–1855（92 aa）片段：UNP residues 1764 to 1855	未记录	ZN ZINC ION × 3	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.8；290 K；离子强度（mmCIF原始值）0.05；压力 ambient NMR样品组成 1 mM [U-100% 15N] TAZ2, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
2KKJ Solution structure of the Nuclear coactivator binding domain of CBP 提交 2009-06-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2059–2117（59 aa）片段：Nuclear coactivator binding domain, UNP residues 2059-2441	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.5；31 K；离子强度（mmCIF原始值）0.1；压力 ambient NMR样品组成 10 % D2O-1, 20 mM sodium chloride-2, 20 mM sodium phosphate-3, 2 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] protein-4, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
2L14 Structure of CBP nuclear coactivator binding domain in complex with p53 TAD 提交 2010-07-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2059–2117（59 aa）片段：CBP nuclear coactivator binding domain	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.05；压力 ambient NMR样品组成 0.5 mM [U-99% 15N] CBP nuclear coactivator binding domain, 0.5 mM [U-99% 15N] p53 TAD, 0.5 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] CBP nuclear coactivator binding domain, 0.5 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] p53 TAD, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
2LQH NMR structure of FOXO3a transactivation domains (CR2C-CR3) in complex with CBP KIX domain (2b3l conformation) 提交 2012-03-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 586–672（87 aa）片段：KIX domain	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6；303 K；离子强度（mmCIF原始值）0.05；压力 ambient NMR样品组成 0.6 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] KIX, 0.6 mM CR2C-CR3, 20 mM MES, 50 mM sodium chloride, 1 mM DTT, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.6 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] KIX, 0.6 mM CR2C-CR3, 20 mM MES, 50 mM sodium chloride, 1 mM DTT, 100% D2O \| 100% D2O NMR样品组成 0.6 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] CR2C-CR3, 0.6 mM KIX, 20 mM MES, 50 mM sodium chloride, 1 mM DTT, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.6 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] CR2C-CR3, 0.6 mM KIX, 20 mM MES, 50 mM sodium chloride, 1 mM DTT, 100% D2O \| 100% D2O	分辨率未提供
2LQI NMR structure of FOXO3a transactivation domains (CR2C-CR3) in complex with CBP KIX domain (2l3b conformation) 提交 2012-03-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 586–672（87 aa）片段：KIX DOMAIN	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6；303 K；离子强度（mmCIF原始值）0.05；压力 ambient NMR样品组成 0.6 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] KIX, 0.6 mM CR2C-CR3, 20 mM MES, 50 mM sodium chloride, 1 mM DTT, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.6 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] KIX, 0.6 mM CR2C-CR3, 20 mM MES, 50 mM sodium chloride, 1 mM DTT, 100% D2O \| 100% D2O NMR样品组成 0.6 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] CR2C-CR3, 0.6 mM KIX, 20 mM MES, 50 mM sodium chloride, 1 mM DTT, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.6 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] CR2C-CR3, 0.6 mM KIX, 20 mM MES, 50 mM sodium chloride, 1 mM DTT, 100% D2O \| 100% D2O	分辨率未提供
2LWW NMR structure of RelA-TAD/CBP-TAZ1 complex 提交 2012-08-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 340–439（100 aa）片段：TAZ-type 1 zinc finger residues 340-439	未记录	ZN ZINC ION × 3	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）40；压力 ambient NMR样品组成 0.8-1.1 mM [U-13C; U-15N] TAZ1, 1.2-1.5 mM RelA-TA2, 2 mM DTT, 20 mM TRIS, 40 mM sodium chloride, 5 % [U-2H] D2O, 95% H2O/5% D2O \| 95% H2O/5% D2O NMR样品组成 0.8-1.1 mM [U-13C] TAZ1, 1.2-1.5 mM RelA-TA2, 2 mM [U-2H] DTT, 20 mM [U-2H] TRIS, 40 mM sodium chloride, 99.8 % [U-2H] D2O, 100% D2O \| 100% D2O NMR样品组成 0.7-0.9 mM [U-13C] RelA-TA2, 1.5-1.8 mM TAZ1, 2 mM [U-2H] DTT, 20 mM [U-2H] TRIS, 40 mM sodium chloride, 99.8 % [U-2H] D2O, 100% D2O \| 100% D2O NMR样品组成 0.7-0.9 mM [U-13C; U-15N] RelA-TA2, 1.5-1.8 mM TAZ1, 2 mM DTT, 20 mM TRIS, 40 mM sodium chloride, 5 % [U-2H] D2O, 95% H2O/5% D2O \| 95% H2O/5% D2O NMR样品组成 0.8-1.1 mM [U-15N] TAZ1, 1.2-1.5 mM RelA-TA2, 2 mM DTT, 20 mM TRIS, 40 mM sodium chloride, 5 % [U-2H] D2O, 95% H2O/5% D2O \| 95% H2O/5% D2O NMR样品组成 0.7-0.9 mM [U-15N] RelA-TA2, 1.5-1.8 mM TAZ1, 2 mM DTT, 20 mM TRIS, 40 mM sodium chloride, 5 % [U-2H] D2O, 95% H2O/5% D2O \| 95% H2O/5% D2O	分辨率未提供
4I9O Crystal Structure of GACKIX L664C Tethered to 1-10 提交 2012-12-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 586–672（87 aa）片段：UNP residues 562-672, GACKIX domain	突变：L664C 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	KI1 1-{4-[4-chloro-3-(trifluoromethyl)phenyl]-4-hydroxypiperidin-1-yl}-3-sulfanylpropan-1-one × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；1.8 M (NH4)2SO4, 0.1 M Tris-HCl, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.00 Å R-free 0.233
4I9O Crystal Structure of GACKIX L664C Tethered to 1-10 提交 2012-12-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 586–672（87 aa）片段：UNP residues 562-672, GACKIX domain	突变：L664C 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	KI1 1-{4-[4-chloro-3-(trifluoromethyl)phenyl]-4-hydroxypiperidin-1-yl}-3-sulfanylpropan-1-one × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；1.8 M (NH4)2SO4, 0.1 M Tris-HCl, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.00 Å R-free 0.233
5HOU Solution Structure of p53TAD-TAZ1 提交 2016-01-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 340–439（100 aa）片段：p53TAD, TAZ1 domain of CBP	未记录	ZN ZINC ION × 3	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.8；308 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 1 NMR测量条件 pH 6.4；308 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 1 NMR样品组成 1.0 mM [U-15N] p53TAD - [NA] TAZ1 p53TAD-TAZ1 fusion protein, 20 mM TRIS, 50 mM sodium chloride, 2 mM DTT, 5 % [U-2H] D2O, 95% H2O, 5% D2O \| 95% H2O/5% D2O NMR样品组成 1.0 mM [U-15N][U-13C] p53TAD - [NA] TAZ1 p53TAD-TAZ1 fusion protein, 20 mM [U-2H] TRIS, 50 mM sodium chloride, 2 mM [U-2H] DTT, 99 % [U-2H] D2O, 99% D2O, 1% H2O \| 99% D2O, 1% H2O NMR样品组成 1.0 mM [NA] p53TAD - [U-15N] TAZ1 p53TAD-TAZ1 fusion protein, 20 mM TRIS, 50 mM sodium chloride, 2 mM DTT, 5 % [U-2H] D2O, 95% H2O/5% D2O \| 95% H2O/5% D2O NMR样品组成 1.0 mM [NA] p53TAD - [U-15N][U-13C] TAZ1 p53TAD-TAZ1 fusion protein, 20 mM [U-2H] TRIS, 50 mM sodium chloride, 2 mM [U-2H] DTT, 99 % [U-2H] D2O, 99% D2O, 1% H2O \| 99% D2O, 1% H2O NMR样品组成 1.0 mM [U-15N][U-13C] p53TAD - [NA] TAZ1 p53TAD-TAZ1 fusion protein, 20 mM TRIS, 50 mM sodium chloride, 2 mM DTT, 5 % [U-2H] D2O, 95% H2O/5% D2O \| 95% H2O/5% D2O NMR样品组成 1 mM [NA] p53TAD - [U-15N][U-13C] TAZ1 p53TAD-TAZ1 fusion protein, 20 mM TRIS, 50 mM sodium chloride, 2 mM DTT, 5 % [U-2H] D2O, 95% H2O/5% D2O \| 95% H2O/5% D2O	分辨率未提供
5HP0 Solution Structure of TAZ2-p53AD2 提交 2016-01-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1764–1855（92 aa）片段：p53AD2, TAZ2 domain of CBP	未记录	ZN ZINC ION × 3	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.8；305 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 1 NMR测量条件 pH 6.4；305 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 1 NMR样品组成 1 mM [U-13C; U-15N] TAZ2-p53AD2, 20 mM TRIS, 50 mM sodium chloride, 2 mM DTT, 10 % [U-2H] D2O, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1 mM [U-13C; U-15N] TAZ2-p53AD2, 20 mM [U-2H] TRIS, 50 mM sodium chloride, 2 mM [U-2H] DTT, 99 % [U-2H] D2O, 99% D2O, 1% H2O \| 99% D2O, 1% H2O NMR样品组成 1 mM [U-13C; U-15N] TAZ2-p53AD2, 20 mM TRIS, 50 mM sodium chloride, 2 mM DTT, 5 % [U-2H] D2O, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1 mM [U-13C] TAZ2, 1 mM p53AD2(38-61), 20 mM [U-2H] TRIS, 50 mM sodium chloride, 2 mM [U-2H] DTT, 5 % [U-2H] D2O, 99% D2O, 1% H2O \| 99% D2O, 1% H2O NMR样品组成 1 mM [U-13C] p53AD2, 1 mM TAZ2, 20 mM [U-2H] TRIS, 50 mM sodium chloride, 2 mM [U-2H] DTT, 99 % [U-2H] D2O, 99% D2O, 1% H2O \| 99% D2O, 1% H2O	分辨率未提供
5HPD Solution Structure of TAZ2-p53TAD 提交 2016-01-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1764–1855（92 aa）片段：p53TAD, TAZ2 domain of CBP	未记录	ZN ZINC ION × 3	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.8；305 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 1 NMR测量条件 pH 6.4；305 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 1 NMR样品组成 1.75 mM [U-13C; U-15N] TAZ2-p53TAD, 20 mM TRIS, 50 mM sodium chloride, 1 mM DTT, 10 % [U-2H] D2O, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1.75 mM [U-13C; U-15N] TAZ2-p53TAD, 20 mM [U-2H] TRIS, 50 mM sodium chloride, 1 mM [U-2H] DTT, 99 % [U-2H] D2O, 99% D2O, 1% H2O \| 99% D2O, 1% H2O NMR样品组成 1 mM [U-13C] TAZ2, 1 mM p53(13-37, 1 mM p53(38-61), 50 mM sodium chloride, 2 mM [U-2H] DTT, 99 % [U-2H] D2O, 20 mM [U-2H] TRIS, 99% D2O, 1% H2O \| 99% D2O, 1% H2O NMR样品组成 1 mM TAZ2, 1 mM [U-13C] p53(13-37), 1 mM [U-13C] p53(38-61), 20 mM [U-2H] TRIS, 50 mM sodium chloride, 2 mM [U-2H] DTT, 99 % [U-2H] D2O, 99% D2O, 1% H2O \| 99% D2O, 1% H2O NMR样品组成 1 mM TAZ2, 1 mM [U-15N] p53(13-61), 20 mM TRIS, 50 mM sodium chloride, 2 mM DTT, 10 % [U-2H] D2O, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1 mM [U-15N] TAZ2, 1 mM p53(13-61), 20 mM TRIS, 50 mM sodium chloride, 2 mM DTT, 10 % [U-2H] D2O, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1 mM TAZ2, 1 mM [U-13C] p53(13-61), 20 mM [U-2H] TRIS, 50 mM sodium chloride, 2 mM [U-2H] DTT, 99 % [U-2H] D2O, 99% D2O, 1% H2O \| 99% D2O, 1% H2O NMR样品组成 1 mM [U-13C] TAZ2, 1 mM p53(13-61), 20 mM [U-2H] TRIS, 50 mM sodium chloride, 2 mM [U-2H] DTT, 99 % [U-2H] D2O, 99% D2O, 1% H2O \| 99% D2O, 1% H2O	分辨率未提供
5W0I CREBBP Bromodomain in complex with Cpd8 (1-(3-(7-(difluoromethyl)-6-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)-3,4-dihydroquinolin-1(2H)-yl)-1-(tetrahydrofuran-3-yl)-1,4,6,7-tetrahydro-5H-pyrazolo[4,3-c]pyridin-5-yl)ethan-1-one) 提交 2017-05-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1083–1198（116 aa）片段：Bromodomain, UNP residues 1083-1198	未记录	9UA 1-{3-[7-(difluoromethyl)-6-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)-3,4-dihydroquinolin-1(2H)-yl]-1-[(3S)-oxolan-3-yl]-1,4,6,7-tetrahydro-5H-pyrazolo[4,3-c]pyridin-5-yl}ethan-1-one × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；277 K；0.2 M Li2SO4, 0.1M Bis-Tris pH 6.5, 23% PEG33500	分辨率 1.43 Å R-free 0.192
6DNQ HBZ77 in complex with KIX and c-Myb 提交 2018-06-07	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 B 586–672（87 aa）片段：residues 586-672 链 D 586–672（87 aa）片段：residues 586-672	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG 3350, calcium chloride	分辨率 2.35 Å R-free 0.229
7LVS The CBP TAZ1 Domain in Complex with a CITED2-HIF-1-Alpha Fusion Peptide 提交 2021-02-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 340–439（100 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M HEPES pH 6.87, 28% PEG 4000	分辨率 2.02 Å R-free 0.241

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UniProt名称	CBP_MOUSE
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 2–88； UniProt 586–672 作者链 D； PDB构建体 2–88； UniProt 586–672 作者链 G； PDB构建体 2–88； UniProt 586–672 作者链 I； PDB构建体 2–88； UniProt 586–672

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6dmx
沉积日期 deposition_date	2018-06-05
结构标题 title	HBZ56 in complex with KIX and c-Myb
关键词 keywords	transcription coactivator, transcription factor, viral, eukaryotic, complex, TRANSCRIPTION; TRANSCRIPTION
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	31.12 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	30.58 Å
零角强度 I(0) i0	58500300.00
分子量 molecular_weight	59490.0 kDa
排除体积 excluded_volume	74425 Å³
包络体积 envelope_volume	102500 Å³
水化壳体积 shell_volume	29833 Å³
包络直径 envelope_diameter	117.6 Å
壳层 Rg shell_rg	35.13 Å
包络 Rg envelope_rg	30.45 Å
形状 Rg shape_rg	30.60 Å
总 Rg total_rg	30.94 Å
总原子数 total_atoms	4187
残基数 n_residues	506
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	110.2 Å
Rg (实空间) rg_real	31.24 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	1.04 Å
I(0) (实空间) i0_real	5.8500e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	8.6920e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal	31.19 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	58500000.0000
解质量估计 total_estimate	0.6586
解质量评级 solution_quality	REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	34.6 Å
偏度 Skewness skewness	0.428
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.160
角度范围 angular_range	— – 0.2550 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	7298000.0000
实空间数据点数 n_real_points	52
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.804; Stabil: 1.000; Sysdev: 0.115; Positv: 1.000; Valcen: 0.829; Smooth: 0.971

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	BZIP factor
分子量 formula_weight	6300.0 kDa
突变 mutation	C9A, C14A
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E,J
原子数 atom_count	4187

GSHMASGLFRALPVSAPEDLLVEELVDGLLSLEEELKDKEEEKAVLDGLLSLEEESRG

来源 Source

来源生物 organism	Human T-lymphotropic virus 1
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	11908
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Transcriptional activator Myb
分子量 formula_weight	3810.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,A,H,F

YNDEDPEKEKRIKELELLLMSTENELKGQQAL

来源 Source

来源生物 organism	Mus musculus
通用名 common_name	Mouse
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10090
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	CREB-binding protein
分子量 formula_weight	10485.1 kDa
EC 编号 ec_number	2.3.1.48
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D,B,I,G

MGVRKGWHEHVTQDLRSHLVHKLVQAIFPTPDPAALKDRRMENLVAYAKKVEGDMYESANSRDEYYHLLAEKIYKIQKELEEKRRSRL

来源 Source

来源生物 organism	Mus musculus
通用名 common_name	Mouse
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10090
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_id	d6dmxb_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.12 — Kix domain of CBP (creb binding protein)
超家族 Superfamily superfamily	a.12.1 — Kix domain of CBP (creb binding protein)
家族 Family family	a.12.1.1 — Kix domain of CBP (creb binding protein)

结构域编号 domain_id	d6dmxd_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.12 — Kix domain of CBP (creb binding protein)
超家族 Superfamily superfamily	a.12.1 — Kix domain of CBP (creb binding protein)
家族 Family family	a.12.1.1 — Kix domain of CBP (creb binding protein)

结构域编号 domain_id	d6dmxg_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.12 — Kix domain of CBP (creb binding protein)
超家族 Superfamily superfamily	a.12.1 — Kix domain of CBP (creb binding protein)
家族 Family family	a.12.1.1 — Kix domain of CBP (creb binding protein)

结构域编号 domain_id	d6dmxi_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.12 — Kix domain of CBP (creb binding protein)
超家族 Superfamily superfamily	a.12.1 — Kix domain of CBP (creb binding protein)
家族 Family family	a.12.1.1 — Kix domain of CBP (creb binding protein)

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id	6dmxB00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	246 — Serum Albumin; Chain A, Domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Coactivator CBP, KIX domain

结构域编号 domain_id	6dmxD00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	246 — Serum Albumin; Chain A, Domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Coactivator CBP, KIX domain

结构域编号 domain_id	6dmxG00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	246 — Serum Albumin; Chain A, Domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Coactivator CBP, KIX domain

结构域编号 domain_id	6dmxI00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	246 — Serum Albumin; Chain A, Domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Coactivator CBP, KIX domain

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	54.997 Å
晶胞边长 b length_b	80.311 Å
晶胞边长 c length_c	64.641 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	92.60 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.800 Å
最低分辨率 resolution_low	40.970 Å
R 因子 r_factor	0.2420
R_work r_work	0.2387
R_free r_free	0.3008

fit	/app/data/saxs_computation/dm/6dmx/6dmx.fit
pddf	/app/data/pr_computation/dm/6dmx/6dmx.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/dm/6dmx/6dmx.dat

HBZ56 in complex with KIX and c-Myb

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

BZIP factor

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Transcriptional activator Myb

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

CREB-binding protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

CATH v4.4 (4 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)